1EQCA

Exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans in complex with castanospermine at 1.85 a
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Candida albicans
publication title The structure of the exo-beta-(1,3)-glucanase from Candida albicans in native and bound forms: relationship between a pocket and groove in family 5 glycosyl hydrolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords EXO-(B)-(1,3)-GLUCANASE
total genus 151
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2000-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1eqcA00
3VMPA 1M7XA 3A3HA 2JF6A 2E9MA 1JF5A 1QNPA 2Y2WA 1JD9A 3WDRA 5CSYA 5D9OA 1B30A 1CGVA 4EKJA 5D9MA 2J62A 4J3TA 1SFSA 4TVCA 2CIPA 2CCRA 1PX4A 3SCSA 2JE8A 1QI3A 1EQPA 3PHAA 3WNLA 1X6LA 1MQQA 2BHYA 1JZ5A 2WVTA 4HMDA 1OB0A 3BSHA 4XX6A 1HKMA 4ACYA 3WL1A 3MMUA 5ABHA 1Q6CA 4JKLA 3U5YA 4KRTA 2J7GA 3WDJA 5A3HA 2ZE0A 3WUGA 2E9BA 5JBEA 3UEQA 1AMYA 1IV8A 1EOKA 1C93A 2DH3A 4ACZA 1CLVA 3ZMRA 3FNDA 4TOQA 4TTUA 3WQ4A 5DEZA 3W28A 3K1DA 2PWEA 5A2AA 1JDAA 1LJYA 1YQ2A 2CBUA 2VUYA 4FMVA 2DH2A 2FHFA 2ZX6A 4UOQA 5I24A 2V3GA 4UQ9A 3AS3A 1UHVA 2W63A 2AOSA 4FK9A 2D3NA 4CKQA 5E0CA 5CLWA 1CGXA 1OT2A 1W1PA 3VDAA 1MW2A 2EPNA 1BHGA 4OBSA 3GH7A 4AIOA 4CU6A 5E6ZA 3UG3A 2UY5A 4HMEA 4XV0A 2VRQA 5E6YA 3QOMA 3PZQA 1GHRA 3GZAA 4F9JA 2WWDA 3VGBA 1E6ZA 3MUIA 3TTOA 1DWHM 2W61A 1VAHA 4ATLA 1E6QM 5IHRA 1OD0A 1KQYA 4W5UA 1OIFA 4JKMA 5E70A 2XVNA 4UFLA 2NW0A 1ODZA 4FF5A 5A8OA 1H41A 3G6LA 3PZGA 1CECA 1J0JA 1TA3A 3DYMA 1ODUA 2XVGA 2EEXA 1EHNA 4GO9A 4LGXA 4MNKA 3SCTA 3OLEA 2J47A 4HZ7A 1ITXA 4UFIA 1KCLA 3LPGA 2X1IA 1E4MM 1AQMA 1HNYA 1C8QA 1V0LA 2WM0A 2A3BA 1WCGA 2CXGA 1RH9A 1F4HA 3VIMA 1W9XA 4OBRA 2G3JA 1OT1A 3AMGA 4DWSC 4OUEA 2ZXQA 4FLOA 3VIOA 4P7NA 3N1AA 2C0HA 1WNOA 2DSVA 1V0MA 2QMJA 3WQ5A 1MVYA 1E43A 4KRUA 1ZB5A 3ALGA 5IFTA 3CMJA 3PTKA 4PMDA 2AAAA 1UD8A 5CG0A 2BY2A 3WQ6A 1QI0A 4JL2A 3MUY1 3BGAA 1J0IA 1EXPA 4J27A 2YLAA 4PMOA 4LX4A 4GI8A 3L4UA 1WDQA 5CLTA 1KGWA 2Q8XA 2VX4A 4AISA 1GOQA 3AYSA 4H8UA 3GXMA 1CTNA 1WZKA 1E6NA 3CUJA 2VR4A 1ZBVA 1TFVA 5GNXA 1E15A 3WD0A 1H5VA 3ZT6A 2E4TA 1E6PA 4ZE4A 1PAMA 2QPUA 4M8UA 3SCQA 4U33A 4P8WA 1V03A 3QR3A 4ZXLA 6TAAA 3I3DA 5ECUA 2DT3A 1ZBWA 4X9YA 5A6BD 1US2A 1NOUA 4IISA 1HXJA 2VX6A 4HPGA 4QLKA 1UZ4A 2F2HA 3N13A 4R5EA 1JZ3A 5I78A 2YA2A 3CIVA 1UR1A 5A6KA 4CN1A 1NOFA 2J8GA 5ABFA 1DWGM 4FLSA 3I3BA 5AYBA 3O6AA 5DMYA 3TONA 4ATWA 3UG5A 3CUIA 1BGAA 4Z2KA 3SUUA 2J8FA 5BXSA 3EDEA 3SCVA 4W88A 4YHEA 1UWQA 1M53A 4UNIA 3OLIA 2AMGA 1GW1A 3WFZA 1Q6FA 2JF7A 1HVQA 1OIMA 4U2ZA 1QOXA 1QHOA 1Y7VA 1HKIA 3AS0A 3OGRA 2J7CA 3AMKA 3SUSA 1JFHA 4DUWA 1J0HA 2NSXA 1JYXA 3QHNA 3CHEA 3W26A 3TP4A 3OIHA 1MQRA 4BZYA 3K4DA 1EH9A 1WB0A 3J7HA 1AQ0A 4YHGA 4BA0A 3B8SA 1W9VA 3N17A 1H4PA 5I6SA 3ECQA 5BXPA 3CZ8A 5A6SA 2A3EA 1FH9A 4JHZA 1JD7A 4QLJA 4W7WA 4TVUA 2EQDA 4WLCA 3CZGA 2BFGA 4PTWA 3BAIA 2YDSA 2QF8A 1QHPA 4JFSA 4CN6A 4TUFA 2VC9A 1B3WA 3AISA 3M07A 1BG4A 1XCWA 5BCAA 2DIJA 1I1XA 3TA9A 3CZLA 3SIMA 4PTMA 4ZEPA 4TVDA 5CPTA 4PUDA 3A4XA 2Y24A 3PBGA 3WMCA 1J0ZA 1OINA 5BXRA 1V02E 3UR8A 3B9EA 3MUZ1 1VBRA 4HA1A 4AMCA 3EMCA 1DEDA 1KCKA 1W1TA 4U2YA 3WEZA 1JI2A 1E72M 3ARVA 1EQCA 2J74A 1E71M 2RGLA 1KGXA 3AHVA 4AC1X 5I3DA 3BAYA 3KL3A 4ZFMA 2F8QA 2VCCA 3DYPA 4V2XA 3WUFA 2VO5A 2W66A 2G3IA 3OZPA 1UD6A 4U31A 3VKKA 2QHAA 4NRRA 1HF6A 2ZUNA 3CH9A 1DWJM 5A8NA 1EA9C 1SR0A 4Z2JA 4HU8A 1C3FA 4ZXOA 4UQBA 5EMYA 2X05A 3TTYA 3W82A 5LYRA 4IM4A 3VOCA 2O9OA 4BCEA 2UY3A 3AZSA 3AICA 1E6SM 1V6XA 3OA5A 2VCBA 1W9DM 3W81A 2ZX7A 3RJYA 2GJXB 2J4GA 3L2LA 3W38A 4LQ1A 4D6HA 3VD3A 1C7SA 3QHOA 3IK2A 5JBFA 1KXHA 3W0KA 4GPNA 1V6YA 3WBEA 9CGTA 3F5KA 1EDGA 1UOKA 2FGLA 5A1AA 3OZOA 2PWDA 1GHSA 1R7AA 1NWTA 4A3HA 5ABFB 3L4YA 1BFNA 1JF6A 3T08A 1B3YA 4Z2LA 3FY1A 4BF7A 2VQTA 4YN5A 3DECA 2ZXBA 3G6MA 4MTVA 3ARSA 1EOMA 2DT1A 4AY1A 2J7DA 4PTXA 1WO2A 1KB3A 2VRKA 3MV01 4UZSA 1G9HA 1BYBA 3N15A 5C8BB 2VRJA 4D6DA 4MNLA 1BVZA 3I3EA 4E8CA 3F4VA 1ISVA 1JZ8A 2WMIA 4QP0A 3PZIA 3EMZA 1ISWA 1GORA 2PWFA 2VR5A 1KR1A 3S6TA 2Y5EA 1VJSA 4AEEA 3AFBA 3AIWA 4DWSD 1M03A 4Q22A 2J7FA 4PMXA 4AD0A 3WDPP 3GH5A 2PC8A 2VQUA 4DUXA 2BHZA 2V5DA 1A47A 2VOTA 3GTNA 5CQ1A 3EDJA 3CZEA 3PZUA 1CGWA 3PZ9A 3K8MA 4J3VA 1WPCA 3U57A 3CBWA 4AYSA 4CD6A 1CWYA 4E4PA 3CPUA 1W3KA 1VEOA 3VUPA 2V3FA 4F9DA 5D9NA 1B31A 1K6AA 4NF7A 4HA3A 1C7TA 1E5JA 4MDOA 4NI3A 2WANA 3BLPX 1NWSA 1QNOA 3L4VA 1TMQA 2O9RA 4UQCA 1J18A 5IDIA 2HISA 2QMKA 1TZ7A 3GXFA 2A3AA 2OWCA 1CXLA 1VF8A 3II1A 4E2OA 1H2JA 4MNMA 5JIPA 4NRSA 1XC6A 2WHLA 3EDDA 5HOSA 1E0VA 3VIFA 2OWWA 1HJSA 1KXVA 5D4YA 3MV11 1Z32X 3GXDA 4AWEA 1S46A 4KMQA 2C8NA 3AHTA 2WCSA 1TE1A 4TX8A 1PIGA 2Z1KA 4MB4A 3VU2A 1G5AA 2XGBA 4QAWA 1VFFA 2D20A 3ZOAA 1BYAA 3WDHA 3AIUA 1V02A 1E4LA 1GVIA 1KXQA 3LPOA 1JI1A 1E5NA 2GJRA 2OWXA 5DT5A 1LF1A 4GKLA 2BHUA 3AZRA 4B9ZA 1W1VA 5GPRA 1UWTA 4AW7A 1W3HA 1R87A 1XD0A 2WLZA 1K9EA 1PBGA 4XB3A 3W37A 4D6JA 1HJXA 4GQQA 2BNJA 1MXGA 1E0XA 6A3HA 4D6CA 1W1YA 1OGSA 1CIUA 2PWHA 2WVVB 1FHLA 4CCEA 2XSBA 4CUCA 4WF7A 3ZSSA 4UCFA 4LYQA 3THCA 2D22A 3RM4A 3CTTA 1K9FA 4W8BA 3WN6A 1KFWA 4PSRA 1E56A 2G4FA 4AIEA 1CNVA 2WB5A 2ZX9A 2WZIA 3AMLA 3VD7A 2D23A 2XUCA 1CPUA 4YPJA 1BTCA 2E40A 3CUGA 7TAAA 2ZXAA 4A4AA 3AZTA 3VGEA 1E6RA 4KH2A 1VENA 3M46A 4JCMA 2GDVA 3SCUA 2WLYA 3VPLA 4UFKA 2BY0A 3VD9A 5KZ6A 3VVGA 1RP8A 1G0CA 3WH5A 4W5ZA 2UY4A 1TCMA 4B15A 3BMVA 2WMIB 3SCNA 5A94A 2Z1SA 1B3ZA 1SMAA 1GQLA 2DSWA 1UUQA 1FOBA 1BAGA 3VGFA 1HP4A 3W29A 2CPUA 1RD6A 1UZ1A 2QV4A 1KBKA 3PZTA 4PUEA 1D3CA 2G41A 3W27A 1L8NA 2FH8A 3GYCA 3BCDA 2BY3A 2O9PA 1WDPA 2X0YA 4WJXA 1TUXA 4JHOA 1GOMA 2ZUUA 2VTFA 1QI2A 3WH8A 4MJ2A 1XGZA 2EXOA 2VZUA 2X09A 4F8XA 2XVLA 3A4AA 4S3JA 4XUYA 4AD5A 4HOXA 1OSEA 4ML4A 4PEEA 3RMEA 1JZ7A 2GK1A 1J9YA 1QVBA 4MB1A 4C7GA 2GSJA 3HU7A 3AYRA 3AIRA 5I23A 3VNZA 3AXHA 5C70A 5CZKA 1NQ6A 4TTGA 3N18A 5GNYA 3OGVA 3VTRA 4B16A 1U33A 3WSUA 2ZWYA 1QI4A 3M6DA 4IPLA 5BROA 2PWGA 4D6IA 2YL5A 2WBKA 4UFHA 3W6MA 1M04A 1VEPA 4CCDA 3WF3A 5I2UA 3AHZA 5FKYA 3ARPA 3E1F1 3A6OA 1HJUA 1A3HA 5A95A 5I77A 4L4OA 4H7VA 1NH6A 1XCXA 1UWUA 4XZWA 1QBBA 4W8LA 3VDBA 3EDFA 1C90A 3NSMA 2FDMA 1JDDA 3UR7A 2CYGA 5JIWA 4MAZA 2GJXA 4IPNB 3QGVA 4UOJA 4GZEA 3A47A 3WEOA 3PZMA 4QCEA 1JG9A 4HZ8A 3F5JA 4U5KA 4M80A 3PZNA 1ITCA 2GDUA 2JIEA 3PN8A 3WNKA 3RCNA 4A3YA 1C8XA 5EB8A 3BAKA 1CDGA 3VIGA 2PI6A 1B3XA 1XH2A 2VJXA 1MW3A 1MW1A 3AMCA 1HIZA 2OLHA 3MMWA 2UY2A 3ARXA 3ZJKA 4AIUA 4HPHA 2YBUA 3AOFA 2E8YA 1UKQA 2ZUSA 4B3LA 3CLWA 4H04A 4D71A 3WD4A 3SUTA 2V3DA 3WH7A 4HP5A 4MB3A 8A3HA 3WY1A 5CGMA 3WELA 5C71A 4AXNA 4HTYA 1B3VA 4DM2A 1NWRA 1JL8A 3EMQA 2CEQA 5BXTA 3VILA 1I1WA 3VDHA 2X8RA 1V0NA 3EYPA 1HL8A 2XFYA 4PMUA 2JEQA 4D1IA 1HX0A 1W32A 1JZ6A 2WHKA 3RJXA 1YHTA 1HKKA 1ZBCA 3WNNA 1PX3A 3NUKA 2CNCA 2XFFA 2ESCA 3MUAA 3U5UA 3OG2A 3L4WA 2V38A 4JFTA 1LG2A 3POHA 2G3MA 1B2YA 2CHOA 2RGMA 4PCTA 1KBBA 1W3LA 4Y7EA 4J3SA 1SYTA 2CBJA 1RPKA 2EO7A 2XPKA 1OWQA 5A69A 1W91A 2Y8KA 3ARYA 3BAWA 2VVSA 3SCWA 4D6GA 3NSNA 1AVAA 4GINA 3NJ3A 3ZT7A 4AD4A 2PF0A 1XV8A 2OYLA 3K8KA 3EDKA 5FL1A 5A6JA 2GFTA 1HJWA 1UYQA 1UR2A 5HNNA 2WAGA 5CGTA 2ZWZA 2WZEA 3SURA 2D0FA 3VIJA 1VFOA 3KL5A 2WC3A 1J0YA 2XG9A 1V3JA 4P7RA 2BY1A 1O6IA 4DUVA 2GK1B 4GI6A 4PMZA 2CKRA 2Y8VA 5A6LA 2WSPA 5A6BA 3CMGA 5D8ZA 3ZR5A 4M82A 3NIYA 1R86A 5KEZA 1GJUA 4QCFA 5GQBA 5ABGA 2DDXA 4AZCB 3VIKA 1JIBA 1UH3A 1CGTA 2IXVA 3MO4A 3W24A 3L4ZA 1W9PA 4NZCA 3PZOA 4IUGA 4WKFA 4W87A 1XSKA 1BQCA 4WK9A 4CU7A 4KWUA 1HP5A 2XFRA 4OJYA 1X1NA 2O92A 1E3XA 2DT0A 4W7UA 5FIPA 1EHAA 1XHGA 3GDBA 1QPKA 3JUGA 3T2PA 2WCGA 2WC4A 2XM2A 4EK7A 3WH6A 1ISYA 2VMFA 4PN2A 5A2CA 2NT0A 1V6UA 1CENA 3BCFA 3AXIA 1E1EA 2PBOA 1AQHA 3VIIA 1MYRA 1BYCA 2WVVA 4M56A 2VZVA 3IANA 1BYDA 3CUFA 5HDRA 3NCOA 2WW5A 2XHYA 3KWXA 2WZHA 1NP0A 2YDQA 3NDYA 3VINA 3OBAA 1HVXA 5I5RA 4V28A 2G3NA 4W85A 3AIBA 4HU0A 4AZGA 4UFJA 5GNZA 1B90A 2DT2A 4D1JA 3GBDA 3WNOA 1WE5A 1VJZA 4UR9A 2ZIDA 3O2LA 1D7FA 4CD8A 3AIQA 3VM5A 3SUVA 4L4PA 2DQXA 1H3GA 4PMQA 2F61A 3AXXA 7A3HA 3WBAA 1LLOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VMP A;  1M7X A;  3A3H A;  2JF6 A;  2E9M A;  1JF5 A;  1QNP A;  2Y2W A;  1JD9 A;  3WDR A;  5CSY A;  5D9O A;  1B30 A;  1CGV A;  4EKJ A;  5D9M A;  2J62 A;  4J3T A;  1SFS A;  4TVC A;  2CIP A;  2CCR A;  1PX4 A;  3SCS A;  2JE8 A;  1QI3 A;  1EQP A;  3PHA A;  3WNL A;  1X6L A;  1MQQ A;  2BHY A;  1JZ5 A;  2WVT A;  4HMD A;  1OB0 A;  3BSH A;  4XX6 A;  1HKM A;  4ACY A;  3WL1 A;  3MMU A;  5ABH A;  1Q6C A;  4JKL A;  3U5Y A;  4KRT A;  2J7G A;  3WDJ A;  5A3H A;  2ZE0 A;  3WUG A;  2E9B A;  5JBE A;  3UEQ A;  1AMY A;  1IV8 A;  1EOK A;  1C93 A;  2DH3 A;  4ACZ A;  1CLV A;  3ZMR A;  3FND A;  4TOQ A;  4TTU A;  3WQ4 A;  5DEZ A;  3W28 A;  3K1D A;  2PWE A;  5A2A A;  1JDA A;  1LJY A;  1YQ2 A;  2CBU A;  2VUY A;  4FMV A;  2DH2 A;  2FHF A;  2ZX6 A;  4UOQ A;  5I24 A;  2V3G A;  4UQ9 A;  3AS3 A;  1UHV A;  2W63 A;  2AOS A;  4FK9 A;  2D3N A;  4CKQ A;  5E0C A;  5CLW A;  1CGX A;  1OT2 A;  1W1P A;  3VDA A;  1MW2 A;  2EPN A;  1BHG A;  4OBS A;  3GH7 A;  4AIO A;  4CU6 A;  5E6Z A;  3UG3 A;  2UY5 A;  4HME A;  4XV0 A;  2VRQ A;  5E6Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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