3NM3A

The crystal structure of candida glabrata thi6, a bifunctional enzyme involved in thiamin biosyhthesis of eukaryotes
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
539
structure length
510
Chain Sequence
KFSKEQFDYSLYLVTDSGMIPEGKTLYGQVEAGLQNGVTLVQIREKDADTKFFIEEALQIKELCHAHNVPLIINDRIDVAMAIGADGIHVGQDDMPIPMIRKLVGPDMVIGWSVGFPEEVDELSKMGPDMVDYIGVGTLFPTLTKKNPMGTAGAIRVLDALERNNAHWCRTVGIGGLHPDNIERVLYQCVSSNGKRSLDGICVVSDIIASLDAAKSTKILRGLIDKTDYKFVNIGLSTKNSLTTTDEIQSIISNTLKARPLVQHITNKVHQNFGANVTLALGSSPIMSEIQSEVNDLAAIPHATLLLNTGSVAPPEMLKAAIRAYNDVKRPIVFDPVGATETRLLLNNKLLTFGQFSCIKGNSSEILGLAELSNELLIQATKIVAFKYKTVAVCTGEFDFIADGTIEGKYSLSKGTNGTSVEDIPCVAVEAGPIGCSLGSTIACMIGGQPSEGNLFHAVVAGVMLYKAAGKIASEKCNGSGSFQVELIDALYRLTRENTPVTWAPKLTHT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme
publication title Domain Organization in Candida glabrata THI6, a Bifunctional Enzyme Required for Thiamin Biosynthesis in Eukaryotes .
pubmed doi rcsb
source organism Candida glabrata
total genus 161
structure length 510
sequence length 539
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2010-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02110 HK Hydroxyethylthiazole kinase family
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3nm3A01
3.40.1190.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine:D-glutamate ligase 3nm3A02
1TTQA 2HS8A 4BI6A 4TMBA 4S1MA 3BARA 1SO5A 3GDRA 1OJXA 2YDAA 1SZEA 4R53A 5D30A 3QQ0A 3AJXA 4MIMA 2VEMA 4MVAA 3SZ8A 4LNYA 5AHIA 5FEWA 4S1IA 3S8HA 5FF2A 5GVJA 2Y7GA 3W7CA 5K4XA 3G3MA 3G1DA 4MYXA 4BI7A 2ZRWA 1XBZA 1W3TA 2A7NA 1R2SA 3CU2A 3V75A 3THQA 5EYNA 1WDWA 3FA5A 3UWYA 3W7GA 1DHPA 3UQEA 3UNDA 4A29A 5HMSA 4NU7A 5AN7A 3GZ3A 3TSBA 1TPFA 1YLVA 4DF0A 3M9YA 3R12A 1EPXA 1I2OA 3S1UA 3W2KA 1FCBA 3KX6A 3G1AA 4GE8A 1F73A 1S5WA 3SFKA 5BYDA 2VFGA 3MO7A 3Q1YA 1B57A 3CM4A 3UPBA 3B0VC 5HR6A 4UTLA 4BK9A 2G96A 2GPTA 3QW3A 3IE7A 3G1VA 2YGYA 3RPZA 3VASA 1TZ6A 3TDFA 3HGRA 4JTKA 1EKQA 3DKLA 1R47A 1BWKA 4HNNA 4WJMA 2J24A 4M19A 1JCXA 3MW7A 3W74A 5AHLA 4NNBA 4C5LA 1LBMA 1H61A 4EWND 2YW3A 3LCXA 3LCGA 3SY5A 5I3IA 2ZRYA 3OIXA 3BPWA 3W86A 4UTWA 2C3ZA 2R94A 4O14A 4HNTA 3IBQA 5EBUA 5G4EA 4NJKA 3TH6A 3VAQA 4EF8A 1VHCA 4LS2A 1KM2A 2C6QA 3MHUA 5D38A 5IBXC 3PB2A 1QWGA 3N1CA 2GQAA 2NLIA 3UZJA 2ZQ0A 4NQ1A 1H7PA 5I3JA 5AYYA 1TPDA 1I45A 4JNMA 5BRBA 3SW6A 3EWUA 5CGQA 5C3YA 4QJ1A 1GVQA 3NVTA 1JJKA 3GXTA 3SR7A 2BX7A 3C3NA 3W87A 2KZHA 2E6FA 4UMBA 3QEZA 1C3QA 3HGJA 3TROA 3RM5A 4UTTA 5CM5A 2QDHA 4CCDA 5G1YA 2VXNA 4MFEA 5BOOA 1QPRA 1DQXA 2ATMA 3MP5A 1ZALA 3NL5A 5G2IA 4WOQA 4JIPA 4E0CA 3R89A 3KVKA 1G4EA 3KRUA 4ZVJA 3UXDA 1TQJA 1OF6A 5DCBA 4JGDA 5D09A 5HR7A 4FB7A 3QSTA 2FFCA 1ZAHA 5D04C 3EXSA 2ZZ7A 2YZRA 5G5IA 4OU1A 4O0KA 3LHWA 4N02A 1HL2A 1SZGA 1HUVA 4LY8A 4QNEA 5DXYA 1G7VA 4Q4KA 3ATYA 3QRHA 1D3HA 2Y61A 4A22A 4Y96A 4ORIA 4N6FA 1K8YA 3W7PA 5HWJA 1F6PA 3MI6A 4MLRA 4X3ZA 1VGAA 4TX9A 4MLJA 1M7OA 5AB3A 1VH7A 2NWHA 3DI1A 1HG3A 2QR6A 3IV3A 3RRJA 4HSOA 3BO9A 4XBKA 1T96A 2DZVA 4LUIA 5A8GA 2V2HA 5HJLA 2YW4A 3ANYA 3TJXA 3W2UA 1DJNA 4O4WA 4ONVA 2I5BA 3L2IA 4P2VA 4O10A 1B9BA 1TIMA 1OX4A 4NXKA 3A24A 3R8RA 3RS8A 3LLFA 1G4TA 1OFDA 3LCHA 4WY0A 5K2ZA 4K39A 2ISVA 1ICQA 3FLUA 2JG1A 3KRZA 4LBGA 2QUVA 4JS3A 1L2LA 1LLZA 5LNWA 3IIVA 5EA9A 4DBEA 2W79A 3EX6A 3I7QA 3PBYA 3C8FA 2JKPA 3TAOA 1RQBA 5C6MA 3W7JA 2ABAA 3WJWA 4EVZA 4TIMA 2CZEA 3HGOA 3EXTA 5LHFA 1JRCA 1RD5A 2DORA 4UTHA 3TFXA 3M5YA 4YCPA 3MI3A 1K03A 4Y90A 1LTDA 3T78A 3O6CA 4QSHA 5AFDA 3GX9A 1DOSA 5CSSA 4UTKA 1JCMP 3HO8A 2CLKA 3LHVA 4GFSA 1DV7A 4E84A 5AHNA 1V1SA 4N08A 3TA6A 4HT3A 4CQ8A 2V9DA 5CPLA 4LTSA 4KADA 3N19B 4Z1BA 1W8SA 3G0UA 4FNTA 3OEXA 3MJYA 1RKDA 3VI2A 3RREA 4QNWA 1FXPA 1Z48A 1FCUA 4M6VA 3KHJA 3KFTA 3PWAA 1EP2A 4N9DA 3O8AA 3NZ1A 2NWSA 1FDZA 1KBJA 4WQ6A 5FF4A 5F2LA 3S1XA 3S9YA 2OT1A 1LBFA 4IX0A 1TPUA 3INPA 4K8EA 4UR8A 4PEKA 2JGQA 4ICNA 3DXIA 3KRSA 5DXXA 1W56A 4PC8A 4MY1A 5CKSA 1DL3A 2WNQA 4IWWA 2J9ZA 1BEUA 4BI5A 1L9WA 3NPUA 4UR7A 1P4CA 1TQXA 3W22A 5EMUA 1JUEA 1WOAA 1S3HA 1OG0A 5AYZA 2ZZ5A 3EX3A 2AQWA 3C2OA 3QM3A 1NF0A 2AGKA 2NX3A 3A21A 3VE9A 5I3HA 1I2RA 4DQWA 3RQ2A 1OHLA 1H7NA 1PCWA 2Y7DA 4UFIA 4A2RA 1XL9A 2ATSA 3TFCA 4ZQRA 3RMJA 4A21A 1HFBA 1JXHA 4N6EA 1D3GA 1SUXA 2A7RA 2I6AA 3HG2A 3O07A 3W1UA 1TPH1 4BR1A 1H60A 4JTSA 1G4PA 4O1DA 3NGJA 1KA9F 4ZMGA 4CQAA 1Y0EA 2BWGA 2G5WA 1QMLA 4XTIA 1WXJA 2ZZ6A 1XC4A 3EWZA 3IIZA 2A9YA 2QAPA 4LU0A 5H2ZA 5SWUA 4FNQA 4K7YA 2GVLA 4AF0B 1O60A 1VLWA 4JTIA 4LT9A 3SGUA 4UCGA 2EAWA 1O95A 1FUYA 3RLUA 3E49A 3CHVA 2V2DA 4IXXA 1RV8A 1IXNA 1LCOA 1LIKA 3P61A 2QAFA 4UNLA 2C18A 3UQNA 2A0NA 1S5VA 1R2TA 4CCEA 1TYYA 2QCDA 4LC8A 4LW7A 5FF3A 1V1AA 3MBDA 1L2UA 2NWRA 4MZ8A 2VFHA 3RNDA 3BLIA 1OK6A 3PVFA 1FX6A 3NQFA 4FNPA 4RLIA 1F05A 4WD0A 4ADTA 2AX3A 3NC9A 1O4UA 1LRNA 3RTCA 1OFEA 2QCMA 2Z1BA 2D73A 1O5KA 3G1YA 3STFA 4N09A 2FPVA 4N9EA 3NOEA 1DBTA 3S5OA 3BK0A 3TK7A 3LLDA 1NVMA 3DH7A 2X2GA 4QITA 2NUXA 4HHPA 3OA3A 4ZQPA 5AHFA 5H91A 3UYCA 3TW7A 2R14A 1W5PA 5COJA 4E38A 3E96A 1LHPA 1ICPA 2CFFA 4E8ZA 3F1QA 2V0TA 3BW2A 1FWWA 4R33A 4Z1CA 1XI3A 4FIQA 1RFTA 5C55A 4CCCA 3QF0A 2Y63A 3GNNA 4JX5A 3RQXA 4XDAA 2VFDA 3JS3A 4ZQNA 4OGZA 5C5YA 3M43A 3IVUA 3B4UA 3LBCA 5F2IA 3G0SA 3LI0A 5EL1A 1LIOA 1OYCA 2V8ZA 1KM3A 5CSRA 1LOLA 3GXPA 3NPVA 4K7VA 2VELA 2GUUA 3L5LA 1N8FA 4HSNA 5I3FA 4O8RA 2ZZ1A 5G4WA 3E0IA 1A5AA 3IGSA 2DP3A 1TV7A 3TJLA 3Q94A 4O0ZA 4O1AA 4GJ1A 2ABSA 3Q2DA 3TSMA 4AAJA 3C4UA 2FPTA 2X1SA 1VCFA 3ZFHA 3I68A 3A23A 4JTLA 3S42A 3GVGA 1WBJA 3VFLA 4NX5A 4KFPA 3OVQA 3DENA 2V30A 5FEPA 1B3OA 5D32A 4Y9AA 3W71A 4RZ6A 3BF5A 3W7RA 4E2BA 1VYPX 2A2IA 2GVJA 3S5NA 4TU1A 1LZOA 1W31A 4WY0F 1UB0A 2EPHA 3CEPA 1GOXA 2B7OA 5KMYA 3M6YA 1YXDA 2GJNA 3IVSA 3LERA 4JN6A 2W6RA 3RT7A 3PUOA 1K8ZA 2E68A 1LIJA 3DFNA 2NXGA 4RKAA 2NV2A 3MWAA 4M7TA 4UNKA 1CW2A 3UZ5A 4BF9A 4GNJA 4IMCA 3ZWTA 4XTDA 3IGXA 1PVNA 2BSLA 4E8WA 1LBLA 2XN0A 1G69A 1GQNA 4JJPA 4AB4A 3UD6A 4PL2A 3LXAA 3W1NA 3I7SA 3KAOA 1G67A 2A85A 1XBVA 1EIXA 3TE9A 1GQTA 4I7VA 4IMDA 3NM3A 2XN1A 4LWWA 4FIRA 3OVPA 1JUBA 1V5XA 3B1OA 3LOOA 3NQEA 5KZMA 3O63A 4M6QA 4B8RA 3W9ZA 3M41A 4K9IA 3VKJA 5TBOA 1EP1A 4UTUA 1TTJA 4R7JA 1AW5A 3UPWA 2R3EA 4GUIA 4MUZA 2TRSA 2E5BA 1TV5A 1K7XA 2OJPA 2QJIA 1PE1A 3B3LA 5F4WA 1JCJA 1KFJA 2DDOA 5D05A 2PRMA 3N2XA 4IOTA 3WJSA 3DBPA 1GPWA 1WYEA 3PUEA 1P1XA 2WKJA 2X30A 3G8RA 3K30A 3F03K 3MHFA 4KWWA 3RSQA 4CNOA 1SQ7A 4ZQOA 3N73A 2G95A 2TYSA 4O1GA 2J6XA 2PE4A 3BG5A 1YYAA 4KFOA 2YCEA 3STCA 3RTAA 3BW4A 3U8GA 2A6NA 2Q3RA 3W7MA 6ALDA 3R13A 3DFTA 1I8JA 4DO5A 2QCEA 1RZMA 1I2NA 3RFAA 4HIBA 3HICA 3MYOA 3B05A 3JULA 4KWVA 5KZEA 1QPQA 3THAA 4QIUA 3HIJA 3JRKA 3CEUA 2YXGA 4PODA 1UB3A 1L6WA 2ZRVA 3OG3A 1ML1A 3GIYA 4JICA 3P5ZA 1FY6A 4JKSA 1TRDA 1ZFJA 3C2FA 2DZUA 1O94A 4AH7A 1IF2A 2YPIA 4UFJA 2NV1A 1H7XA 3W7HA 1ZNNA 3EKLA 1XKYA 2J27A 3ZS4A 1TSIA 4UTWC 2PCQA 5L9FA 1QCWA 5LNSA 3L0KA 3WJZA 3CIWA 1UUOA 3QMTA 3QMSA 5CZ0A 3GAYA 1WAUA 4GUGA 1VPXA 4LRTA 3P74A 4O52A 3W75A 3KOFA 4U4MA 4OT7A 1LORA 5DY3A 1ESJA 4AXKA 3MBJA 3IQ0A 1UA4A 4U7XA 3SGZA 1OX6A 1OVDA 3CTLA 2Q5RA 4IJBA 3L66A 3FYOA 1YHJA 3B1QA 3NDOA 3B0PA 1YXCA 1H51A 2RDTA 3GB6A 4UUIA 2X16A 1DVJA 3L5AA 1TPEA 3HBLA 4IQLA 3HGSA 3M47A 4NNAA 1BX4A 4EIVA 3M16A 5CGEA 4X2RA 2GQ8A 1OFBA 2E77A 2QUTA 4NVTA 3W7EA 1PCKA 4MFDA 1P0KA 3W1LA 4N9BA 4LVAA 4LUJA 3S0CA 4FX6M 3HG3A 4FX7A 2VFIA 4UMCA 3RY7A 5K3VA 1SW7A 1WV2A 5D2VA 3W07A 4LC4A 1LIIA 2C4EA 2Y7FA 2Y7EA 3U2OA 2ZA3A 3NQ6A 3QMRA 5K9XA 4GC4A 4O57A 1OFPA 4K37A 2WQPA 4TMCA 1ALDA 1P5BA 4AF0A 2Y89A 5LGZA 3QFEA 1A50A 4Z0SA 2DZTA 3VNDA 3L0NA 5BYEA 1Z44A 3W70A 1EWDA 3C52A 3ZR4A 1YPFA 3CLMA 1MEWA 3MP4A 3W83A 3L5MA 1SO3A 4X9SA 4M5PA 1T8XA 1RKSA 3S1VA 1QAPA 2CWNA 3GKFA 1EP3A 4POCA 3S1WA 2A5HA 1FDJA 4O50A 3RQ6A 3RRBA 1V1BA 1WBHA 2DJXA 3ABOA 1AG1O 3LKIA 4MY8A 5D02A 1J2WA 4UTJA 4XBSA 2CZ5A 2F7FA 1YADA 3P60A 5CPMA 1T0OA 4X22A 2CZFA 5KSWA 2QJHA 3B1PA 3EX4A 2E1DA 4CNPA 3RO4A 1E51A 4K8KA 7TIMA 2F02A 3MBHA 2A7PA 3DFSA 3HJZA 4JTEA 5D37A 2JK2A 4RZ5A 1X7FA 1C9DA 1RPXA 2RDUA 3K5WA 4EBUA 1CX9A 1KLYA 1LOSA 2AJPA 3RTDA 1K3UA 3CC1A 3QPYA 5FF0A 1HO1A 2DCNA 3CQ0A 5G2HA 3IH0A 2E5CA 1KFKA 3TXVA 2YFOA 3GDLA 3W85A 5FF7A 2VARA 2C49A 5EY7A 3H54A 2V5LA 1OF8A 1A5BA 4Z1AA 3W2MA 4OWGA 4O13A 2RKXA 5EPDA 4AEOA 3KXQA 3GO6A 2AWDA 2A4AA 4KAHA 3S5YA 1A5SA 2TSYA 5CZTA 3MMTA 4IXHA 4S1HA 3QA2A 2CZDA 4X8FA 1F6KA 1KV8A 2VC6A 3YPIA 3LB0A 3UMPA 1KFEA 3UWUA 3G1FA 1SSGA 3O1NA 4Q32A 2HTMA 2F7KA 2OZ0A 3WK2A 2FPYA 3CPRA 4DO4A 2WNZA 2YSWA 1IXQA 1NFBA 2EKCA 5G2WA 2QJGA 3W7LA 3GNDA 2H8ZA 5BMXA 3U6WA 4EOUA 3RPHA 3EXRA 4NXSA 3W88A 2ZA2A 5EKYA 4S1IB 1LM1A 5KINA 4YL5A 2RHGA 4PFMA 2DZWA 5BYFA 2Y6ZA 1GYLA 1XUUA 4TO8A 3I6RA 2NXHA 1XM3A 1DJQA 3GDTA 3LRLA 2Q8LA 3SSJA 1H7RA 3P8JA 4FX8A 2HLZA 3HPZA 2C0AA 1Z41A 3N14A 4LS0A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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