4JTSA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with 072
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with 057
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 136
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4jtsA00
1S3HA 4WXZA 1ZNNA 1G4TA 2ISVA 3NL2A 3IGSA 4HKPA 1VPXA 3MJYA 4PEKA 3HOJA 4NVTA 1I2PA 1TIMA 2VEKA 1GWJA 3QMSA 2J9YA 4AAJA 2BSLA 3GKFA 3G18A 1QOPA 1TV5A 3KHJA 4JY9A 3TW6A 1IXOA 3HG3A 4GC4A 1A53A 4KWVA 4JX6A 3W76A 5DCEA 1K8ZA 1EX5A 1RQEA 3KAOA 3L67A 5I3JA 2QJIA 2XN0A 4M5PA 1AK5A 1TTQA 1X8FA 3S5YA 3IIOA 3W85A 4NZFA 4JN6A 1OFEA 2A7RA 3W1PA 4WOQA 2BTMA 1TCDA 2GQ9A 5FF2A 2CU0A 3LCWA 3ABSA 2Q8ZA 3WK2A 1R2RA 1BWLA 2QCNA 3QM3A 4RXGA 8TIMA 4YCOA 1YYAA 4ORIA 4K8EA 3TIMA 2PRLA 1KLZA 4JTJA 3LCIA 3R8RA 2E1DA 5D2VA 1NAL1 1WBJA 2Y63A 4KFPA 3TDFA 3IIPA 4NNBA 4IQLA 3UYCA 5HUOA 3DFPA 4NQ1A 3LX9A 3MP4A 5EY5A 5TBOA 5DY2A 3HG5A 1XL9A 3VKJA 4LT9A 1VZWA 4AXKA 3GXTA 2X2GA 4GNJA 4Y96A 3W83A 2Q3OA 3C2EA 2WV8A 3NM1A 1OFPA 1FX6A 3M16A 1TV7A 3I7QA 3DENA 1KV5A 3P7YA 5LHFA 2DORA 3ABQA 3FKRA 2Y7FA 4UR8A 1EIXA 1IXQA 4DEFA 1U83A 4UC5A 3T44A 5D02A 5LSMA 1SZGA 3PS7A 3IVTA 1QCWA 1ONRA 3V75A 2C16A 1SZFA 5TQLA 2OMAA 3QPYA 4GRSA 2YX0A 3L65A 1F6PA 2NX1A 3NL6A 1TMHA 3F03K 3OVQA 3E9AA 1C29A 5G1YA 4N9DA 4I7UA 2V0TA 1XBXA 3GDRA 2CWNA 3CT7A 3RLVA 3TV8A 2I14A 2PRHA 4O19A 4DO6A 5CKSA 4MKNA 3ABRA 4HNUA 3BW3A 4AHOA 2ZA3A 3BV4A 3HPXA 3LOTA 3R12A 2QUVA 5EKYA 3EXSA 5DBTA 1AW2A 3WJWA 3BLEA 1PIIA 1KTNA 3PF3A 2PE4A 2DZVA 1C9DA 4UFMA 3EWWA 3W07A 4EWND 1U5JA 3SFKA 2NXIA 5F4XA 3QRHA 1S5TA 1XBYA 4WX2A 3SGZA 1A5CA 3P62A 2DJXA 5KITA 3B0VC 4DPPA 3DFSA 2TPSA 5EA9A 2Y88A 4TX9A 3GLCA 4A2RA 1J5TA 3KVMA 5LNRA 1ZAJA 2QAPA 1W8SA 1RQBA 5LNVA 1KW1A 4O17A 1H7PA 4CNPA 4OBTA 2NV1A 1TRIA 1OHLA 1OYAA 3LTYA 3M5YA 4XKYB 5AYZA 4FF7A 2YFNA 3W7QA 5FF7A 3W7JA 3PM6A 4LVGA 3LLDA 1LZOA 5CG7A 2IQTA 1W56A 3PSVA 3QQ1A 4N9EA 3EXRA 1HO4A 3O05A 3MYOA 2C13A 5LNUA 5DELA 1SW0A 1GYLA 3QW3A 3QYQA 3UWYA 1LBLA 3G8RA 2R14A 4YLWA 4UTJA 4N9BA 4JTHA 1GTEA 2R94A 3GNNA 2CLFA 5HJLA 4NXKA 1J2WA 4MOZA 1QAPA 2Y61A 5K7JA 3S6DA 3N73A 3FYOA 2X1TA 2WQPA 3CLMA 4M7TA 1K3UA 5E0KA 4PA8A 2B7PA 2QJHA 1LCOA 2VC6A 3HPSA 3UXAA 4JX4A 2QAFA 4TR9A 3BK0A 1KBJA 5HR6A 1GZGA 2ALDA 3EX6A 4X22A 3O1NA 3CQ0A 1TO3A 2QCMA 2GVGA 2QUUA 2VKZG 4JX5A 1P0NA 4Q32A 3DHDA 2WSYA 4UUIA 3VNDA 3O16A 3M0ZA 4UNKA 3R89A 3NQ6A 2G96A 3M5VA 2YZRA 1JRBA 1YDOA 6ALDA 1FQ0A 3FOKA 4ALDA 1I45A 2Z0IA 1A50A 2RKXA 3VE7A 1IF2A 5KTLA 4CQAA 1RVGA 2VFGA 1W37A 4LS0A 4TMBA 3NVTA 3UWWA 3CEPA 3CM4A 3M1ZA 3EEGA 4N9CA 3G0XA 1JRCA 1JVNA 2HTMA 3B06A 4AVFA 1OX4B 2BLEA 2QEZA 3W2UA 3PBWA 3CPRA 3DI0A 4I9AA 1R46A 4IMFA 2A0NA 4PTNA 5BW6A 4LV4A 5FF0A 3NPXA 4JYFA 1R2TA 4O50A 5D37A 5BOOA 5BNKA 4JDBA 3NQEA 4HNTA 1JCMP 3M5ZA 4NJKA 3G1SA 4MZ1A 1H7WA 5E93A 1GVSA 3NDOA 4BF9A 1AL7A 5U4NA 4O16A 5D09A 1KTCA 4Z1AA 3DXIA 3W9ZA 3BLFA 4PCFA 5EL1A 1B57A 3STEA 4CQ9A 1L6WA 2VFEA 4N2YA 2DZSA 2NXGA 5LHEA 4MFEA 5A5WA 1O4UA 4JTIA 3W73A 1HFBA 1ME8A 2GUUA 2V2CA 4UNLA 1GVOA 2DZTA 4ZQRA 2YSWA 1EP1A 2QCDA 3MBFA 1EEPA 1I8JA 1ZY9A 4NT0A 2ABAA 3LCGA 2V5BA 1KTBA 3C3NA 4XZ9A 3N2MA 1WYIA 1HTIA 1RD5A 1GPWA 2ZRVA 3L2IA 3G1VA 3OHIA 3HGOA 1PV8A 5K4ZA 1OF6A 3PB0A 2TMDA 4BI7A 4H4IA 3TJLA 5HMSA 3UY8A 2ATMA 1PCWA 1VQTA 1GG0A 5F2LA 5H91A 3NL5A 3TCEA 3AO0A 4HPXA 2A7PA 4G1KA 1ZENA 1QWGA 3LHVA 3MUXA 4CLMA 1CX9A 4QISA 2VOMA 3LI0A 2A5HA 2CFFA 5D05A 4OHQA 1XCFA 4RCXA 1K8YA 2WSQA 1FDJA 2NX9A 1NFBA 1AL8A 4LNYA 1M7PA 3P74A 4AF0A 4JEQA 3GZ3A 4EF8A 5BRBA 4E38A 5CPMA 3EKLA 4M19A 4Q33A 4DBEA 3L5AA 3E02A 3NQVA 3TJXA 3PG8A 2G97A 3UD6A 2X16A 1KA9F 3KFTA 1PS9A 4CCCA 3W72A 4M7SA 4MLJA 1G67A 2QF7A 3IIXA 4O4WA 1WBHA 1W3IA 5J5DA 1T0OA 1QO5A 3LV5A 4DBDA 4HN4A 3STFA 1VH7A 3VE9A 3W2LA 3O8AA 2ZRYA 1W54A 3O6CA 4HNVA 1EWEA 3IVSA 1KM2A 4LTSA 3UPWA 5AN7A 3T7VA 1TPB1 3NPWA 3PUOA 3OEXA 1QPRA 1S5WA 3C2VA 1H63A 1DJQA 2E5BA 4LV9A 4NNCA 1LRQA 1VC4A 4H6KA 3WK3A 2ZA2A 2CLKA 3TAKA 1OF8A 4UFJA 4XKYA 4JICA 4H3DA 1OABA 2ZQ0A 5D2WA 2NUWA 4LS2A 3W86A 1SQ7A 4QIUA 5HINA 3NR0A 5D38A 4K7VA 2A85A 4Z1DA 4O57A 4O0ZA 3TMLA 4CNOA 1DQXA 1K7FA 1XFBA 2ZZ2A 1QMLA 1FWWA 2QCFA 4HT3A 3W1AA 4FNUA 2Y70A 2DP3A 4ORMA 4RZ5A 4O11A 3TE9A 2Y85A 4FB7A 5D04C 5AC7A 4JNMA 1ICSA 2PRMA 2C0AA 4MZ8A 4ZQPA 3DFTA 4AWUA 4MJMA 4KWWA 2W0UA 4UTMA 1W5QA 2DZXA 1LTDA 1LLWA 4FNRA 4MYXA 1F2JA 1ME7A 1GEQA 1K8XA 1EP2A 4XWUA 1VYSX 2D73A 1MEIA 1KFCA 2NWSA 2A1YA 5G4WA 2QCGA 3HGJA 2VFHA 1FCBA 2ZZ7A 3QJAA 4AB4A 3G8EA 4Y8FA 3BVJA 2I1OA 4TIMA 2GJNA 3FJ6A 1LOSA 2X30A 3IRDA 4JXCA 1F5ZA 3FLUA 5LGXA 2CLOA 1O5KA 5D2TA 1ICQA 4R7JA 2CLHA 1Q45A 1W5PA 4OV9A 4WOZA 1XDMA 1LBFA 1Q6QA 1YADA 3O63A 3NG3A 5H2ZA 4KKXA 3W22A 4S2CA 2A6LA 3TQKA 1XXXA 3H54A 1QDSA 3A24A 4AWSA 4MZYA 4ZMGA 4RV8A 1I2QA 3S5NA 4FXSA 3TROA 4LUIA 4A22A 3LHUA 3G3DA 4N4QA 3PG9A 5FEWA 4UTWC 3RNDA 3HIJA 5F2IA 3G1XA 4GUGA 1SO5A 1L9WA 3W71A 1QPQA 4R53A 4RZ6A 1TPEA 1W1ZA 4QJ1A 5F2MA 3STCA 1DVJA 3A5VA 2NXHA 3TSDA 4MY9A 1LLZA 3S9YA 4YWIA 1BTMA 5KMYA 2F84A 2VEMA 4MFDA 3LRLA 1LP6A 3SW6A 3UWZA 3MI2A 3ZWTA 1Q6OA 3T55A 1TJRA 1G4EA 4NX0A 3W1TA 4CNNA 1FXQA 3QC3A 1JCXA 1G7VA 3W7NA 4UFHA 3E12A 4DELA 3PAJA 1GVFA 5LNSA 3ATZA 4M6QA 1VCGA 3G3MA 4IGHA 4MYAA 5BMWA 4WD0A 5EPDA 2Y6ZA 3HF3A 3LXAA 3C2RA 4Z08A 4YCPA 3LTPA 3LI1A 3M41A 3TQVA 3B8DA 3W7IA 2E5DA 2BWGA 2YW4A 3FJLA 3WK1A 3NPUA 2AQWA 1K03A 3W7CA 1RPXA 1WA3A 5AYYA 1W5MA 5CSSA 3OA3A 3W1MA 2XFWA 4NJHA 1VYPX 1AMKA 4L4LA 4UR7A 4WY0B 4IMGA 1HL2A 4UTWA 5G2IA 3B03A 1KFKA 1IXPA 3CWNA 4UTTC 4ADTA 2CLLA 3DFNA 1H7NA 2YW3A 3KVJA 1B3OA 3W70A 3LLFA 2O7QA 3BLIA 3EWBX 5HNRA 5LKYA 3W7LA 1PVNA 1QPOA 2YGYA 3UY7A 4OU1A 3W7RA 2X1RA 3C0JA 3G1HA 4O8RA 1HG3A 4BI6A 3DGRA 5CPLA 1T8XA 3ELFA 1K7XA 1WDWA 3M7WA 3GAYA 1QFEA 4O1CA 2GOUA 3L68A 5CPNA 4QAIA 3L0NA 2V2DA 4NUWA 4OWGA 1TREA 3MP3A 3DFOA 3HB9A 3S1UA 3C61A 4DXVA 1TTPA 5I3GA 3NQGA 2EKCA 3G1DA 1H1ZA 1OFQA 3B04A 4JTLA 2Q3RA 1XC4A 3CB8A 3GNDA 4HSOA 1N7KA 1YLVA 2ZZ5A 1H51A 1FDZA 1XI3A 1KFBA 4JIPA 4Q4KA 1XDLA 1R30A 2QKFA 1DOSA 2R8WA 3EXTA 4HHPA 3P8JA 2XN2A 4NXSA 4MLRA 2FTPA 1I2NA 2V81A 3HG2A 3EX1A 3LBMA 3ZS4A 3W1RA 3SJ3A 1J4EA 5D2YA 3S5OA 3QFEA 1FWNA 3M47A 4LVFA 1DL3A 1VLWA 3PSWA 5LZLA 2OT0A 4DO4A 4O15A 4UTTA 3B4UA 1O95A 5F1UA 2RFGA 1NSJA 5AHIA 3F4WA 3QMTA 1NF7A 3TC6A 2GVJA 3E0IA 1PCKA 1FWTA 3UWUA 4QSHA 2ZBTA 3CU2A 4LUJA 1F73A 1AG1O 1LROA 3S8HA 3HPZA 3LGEA 1I2OA 2H6RA 2Z6IA 2ZRXA 4WQ6A 3INPA 2QUTA 1VCVA 5FF3A 4GFSA 4X3ZA 4XUGA 3R2GA 2V5LA 3C4UA 3DZ1A 4RJEA 3RF9A 3DU0A 3UWVA 1SZNA 4CCDA 3O6YX 3A9IA 4JS3A 4NJIA 5FEPA 3LHYA 3N9RA 3LRMA 2AGKA 1TPUA 3EX3A 4YMZA 1FUYA 4HPJA 4O0KA 5K9DA 3AJXA 3PY2A 3GYEA 2FPTA 3LCXA 3W7OA 3SECA 3GX9A 1HO1A 5CZTA 3THAA 1MEHA 4OE7A 4IPJA 5HWMA 1KFJA 1KLYA 2C19A 3HGSA 1BEUA 2G95A 2VENA 3P82A 4A3UA 3LRKA 3BARA 5DXYA 2H3DA 3L66A 4UCGA 4UTUA 1D9EA 3LCLA 1RQHA 5I3IA 4Z0JA 5EYWA 2DZWA 4JYDA 2XN1A 3NQ7A 3I7RA 2JGQA 3I65A 4LY8A 5KINA 3LCHA 3G1AA 2E09A 3I68A 3F1QA 3EKZA 4HIBA 1FCQA 1SO4A 4O53A 2VFFA 1VR6A 2YPIA 4X9SA 2ZFAA 2CLMA 3I7SA 5K4XA 1H1YA 2Y7DA 3P61A 3NL3A 2C15A 2EGZA 1SFJA 2JKAA 4X2RA 2B7QA 1O94A 3E96A 1MEWA 2A2IA 3KX6A 3Q58A 1H7OA 2PURA 4RK8A 1DHPA 4CCEA 1M6JA 2HS6A 2ZZ3A 4UFIA 2VXNA 1OFBA 2F7FA 4WXYA 2J9XA 3GK0A 2WNZA 5FI8A 4E0CA 3GKAA 2NUYA 3EWYA 2FIQA 1SPQA 5FEZA 1SSGA 5T26A 3M44A 2ZYFA 3NQ2A 3TFXA 4AHPA 3KRZA 4JTSA 1N55A 4O1AA 2P1FA 2UV8G 3JR2A 4GUFA 1D3GA 1H61A 4JTGA 1FCUA 3GXPA 3DKJA 4PH6A 3TH6A 4K7YA 3Q2DA 4O52A 3W1LA 1H50A 1TPDA 5AYXA 3FYPA 1X1ZA 3P5ZA 1TQXA 1FXPA 3YPIA 4W9TA 2ABBA 4LOCA 2OZ0A 1YTDA 3C2OA 3V1PA 1K7EA 3OVPA 1UUOA 3W3OA 3NQFA 4DQWA 1H7RA 3M43A 1NVMA 4ZZ9A 3TXVA 1EB3A 1W31A 4R33A 3FKKA 3TR2A 3KRUA 2ZZ6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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