1ECE | Genus

Total Genus 136

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	136
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	AGGGYWHTSGREILDANNVPVRIAGINWFGFETCNYVVHGLWSRDYRSMLDQIKSLGYNTIRLPYSDDILKPGTMPNSINFYQMNQDLQGLTSLQVMDKIVAYAGQIGLRIILDRHRPDCSGQSALWYTSSVSEATWISDLQALAQRYKGNPTVVGFDLHNEPHDPACWGCGDPSIDWRLAAERAGNAVLSVNPNLLIFVEGVQSYNGDSYWWGGNLQGAGQYPVVLNVPNRLVYSAHDYATSVYPQTWFSDPTFPNNMPGIWNKNWGYLFNQNIAPVWLGEFGTTLQSTTDQTWLKTLVQYLRPTAQYGADSFQWTFWSWNPDSGDTGGILKDDWQTVDTVKDGYLAPIKSSIFDPV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Glycosyl hydrolase
source organism	Acidothermus cellulolyticus
publication title	Crystal structure of thermostable family 5 endocellulase E1 from Acidothermus cellulolyticus in complex with cellotetraose. pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDOCELLULASE E1
total genus	136
structure length	358
sequence length	358
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1996-04-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1eceA00

3N04A 5ABEA 3N17A 2NSXA 2ZUTA 3CUFA 3VGDA 4ML4A 3UETA 3FHAA 4TX6A 3KWXA 1CXHA 2DSVA 3II1A 1VAHA 4HZ6A 1D3CA 1TVPA 4XB3A 1LJYA 5CPSA 5A6LA 4KMQA 4QLJA 3FHQA 3T0BA 4J3TA 4JFSA 2W66A 3T0AA 2CETA 4W89A 1UA7A 4HPGA 1UHVA 1UR9A 4AMCA 5E0FA 2XGBA 1KB3A 2IXVA 2EPNA 3CBWA 2WVTA 2XPKA 4PRWA 3WQ8A 1EDTA 3A6OA 1X6NA 1JFHA 4RE3A 3ZJ7A 2GSJA 3CUHA 4OBRA 4AD3A 2DQXA 1XH1A 4AXNA 3TOPA 3BAYA 2WANA 1UWIA 5A2BA 1M01A 1VFMA 5KEZA 2DPEA 3N12A 1B3YA 4HA3A 3WDJA 4AZCB 3AIQA 3FAXA 1C93A 1U2YA 2JFEX 3TP4A 2IXUA 4QCEA 3L4YA 1ZBVA 2ZICA 1E1FA 2VX4A 1LG1A 2E3ZA 2O9OA 5EFFA 3WUGA 2DSKA 3WH7A 2CNCA 1EO7A 2G3NA 4MADA 3NSXA 1G9HA 4HTYA 4GQQA 4TXEA 4ZE5A 4CN1A 2UY3A 4FMVA 2YKKA 5TD4A 4PTWA 2D0GA 4UQBA 5IDIA 1MW1A 2WVSA 4A3YA 5A8PA 5HBFA 3BGAA 1WDPA 3VGEA 2WMFA 1CGYA 5I78A 1ESWA 4M8UA 1WO2A 1GQJA 1E3ZA 2JIEA 2G4FA 1E6XM 4MB3A 2WHLA 4AZ6A 3ZSSA 1QI3A 1EOKA 1PZ2A 3PZVA 3TTOA 3W81A 3CZJA 1JZ5A 1CGWA 5DFAA 3WDHA 3PBGA 2VVNA 4UCFA 3WD2A 4W86A 2CCRA 2W67A 2WC3A 3W25A 3O6AA 3WQ6A 3ZT5A 5D8WA 2Y8VA 4PUDA 3POCA 3ZO9A 4AZCA 1QOXA 4PYSA 7TAAA 2DSWA 3AOFA 3AS2A 2VX7A 1MXGA 2WCSA 3W37A 1Y7VA 1E4LA 4BQ5A 4DWSC 3CHFA 3VGHA 1UR0A 1FFQA 2J79A 2GK1A 1ZB5A 3BXWA 3F5LA 3G6MA 1W91A 2OWWA 3ZIZA 4GO9A 2OSYA 1UUQA 3AYRA 5HNNA 2EPKX 4MJ2A 3OZPA 4CD4A 1VEMA 2VQUA 2F8QA 4PMQA 3WL1A 4D6IA 4GPNA 5A6JA 4H7VA 2Q8XA 1OM0A 1J0IA 1CNVA 1ISWA 5A8OA 3W26A 3A3HA 1K9TA 2XM2A 3WMSA 2E40A 4F79A 1W3LA 5A6BA 2CBJA 3N13A 3FW6A 4ZE4A 1OCQA 1B1YA 4K68A 5A6MA 1HP4A 1BTCA 5C70A 2J7HA 2D0HA 5A1AA 4AYSA 4PMUA 3AICA 4MPKA 2J62A 1E0WA 1JYNA 1HKJA 1GOMA 3VD3A 3CZGA 3AHXA 2YJQA 4TVDA 3CZKA 4Z2IA 1W3JA 1E4IA 1JI1A 4GZJA 4MJ4A 3BAIA 3ZQ9A 2CEQA 5GNYA 3FAWA 4BF7A 5A8QA 2XVKA 3U7BA 3SCOA 1W9XA 4H04A 4QLKA 1EDQA 4E4PA 3UG3A 2E4TA 1V0KA 1K9EA 5D4YA 1HT6A 3VGBA 2CBUA 3PZGA 1XC6A 4M29A 5A3HA 3AIWA 1GORA 4EE9A 1G0CA 4L4PA 2XJ7A 2XWEA 5BROA 1SMAA 3W53A 2EPLX 1TA3B 3IAQA 1WAWA 5D9NA 3MSGA 1A47A 1F4AA 1D2KA 1US3A 1Z32X 4J3WA 1XD0A 5C8BB 2BS9A 3U57A 3QR3A 1HKIA 2G3MA 4JFVA 4WIWA 3CHCA 2XSBA 2ZXQA 5JBFA 3BMVA 2OYLA 3NDZA 2Y24A 5CSYA 1XSIA 2FGLA 3PHAA 1JDCA 3PZUA 3ZJ8A 4PMRA 4Z2GA 3VKKA 1C8XA 2D22A 4JAWA 3F5KA 3BLPX 1ZBCA 5CLTA 4U33A 3QOKA 1JG9A 2X1IA 2XIBA 1E6RA 2CPUA 4YN5A 1Q6FA 2V3EA 5CPQA 3VM5A 3GXMA 4TUFA 1H4PA 4UR9A 4GINA 2A3EA 2WHKA 5CZKA 3GXIA 2YL6A 4W85A 1EHNA 2BNJA 2V3GA 3FXYA 3OLIA 5CXPA 1MQRA 1KXHA 4TTGA 4BQ2A 1FHDA 1XH2A 1TA3A 3EDEA 1KGUA 2PWGA 1UH3A 4ATDA 3WQ4A 3VOCA 1K6AA 1GNXA 1WZAA 3K8MA 4JZ5A 1E71M 2JE8A 4BQ3A 3ARZA 3VIGA 2W4XA 2ZWYA 1HKMA 4H8UA 4UQCA 4E8DA 3OLGA 3WDRA 4TTUA 2O9RA 1NP0A 1I1XA 3F4VA 2J78A 4IM4A 1DWHM 1GONA 2CBIA 2A3BA 2YL9A 3QGVA 3EDDA 1SMDA 1CGXA 2E8ZA 1G01A 3ARQA 3EMCA 1U33A 3I3DA 1I1WA 1BYAA 5I23A 1H1NA 2VZSA 2EQDA 3WQ5A 2ZE0A 1KCLA 3AYSA 1UR4A 2F61A 4CKQA 4LYPA 3ARPA 1KWGA 1DWJM 3DC0A 3CTTA 4AD2A 1JL8A 2CHNA 2VX6A 2WPGA 2CKRA 1J11A 2XIIA 1JAEA 3PZQA 4EANA 2XVGA 4AZ7A 2ZX5A 1JI2A 2FHCA 3SCUA 4ATWA 5JIWA 1LWJA 3PTKA 5HOSA 3AZTA 4OOZA 4EAMA 2YDRA 3L4XA 2CBVA 2J47A 3UR7A 1KXQA 1RP8A 2V3FA 4Z2JA 1RH9A 4PTMA 1W1VA 3MMUA 3OGRA 3AISA 4UQDA 3IANA 1V0NA 4S3JA 2UY4A 1XCWA 1JZ2A 4JCMA 1NP2A 4JKLA 4WLCA 2VTFA 4PTVA 2DGAA 3MMDA 1MQPA 2WMIA 1G5AA 1BHGA 1BAGA 1CLVA 4XZWA 4ZEPA 3SUWA 1ISVA 1NARA 4UOQA 1SYTA 1Q4NX 1US2A 1JYVA 1WCGA 3HU7A 4RE2A 4MB5A 1JXKA 3WQVA 4NRRA 4UFHA 3WENA 2VUYA 1X1NA 2J7DA 4M80A 2W63A 3ZJ6A 1UZ1A 1VJZA 2ZX8A 4QCFA 4HOXA 5IHSA 2E9BA 1VB9A 2WKGA 1W3KA 3EMQA 2FH6A 4CU6A 1LL6A 1WDQA 1UWSA 4MAZA 3VD7A 4J27A 1AQHA 4Z2LA 2XVLA 4JHOA 5BXTA 5GQBA 4ACZB 1CXFA 2BXZA 4OJYA 3S2CA 1JD7A 1V03A 4U5IA 3VU2A 3VIMA 1BSIA 3WBAA 1E0VA 1UD5A 1XSKA 2QLYA 3ARWA 1JNEA 1ZBKA 3AIBA 1L0PA 1KXVA 5A95A 1J9YA 5I0DA 4X0NA 1B9ZA 4AIUA 5FIPA 2XFYA 2GJXB 1FP9A 1KGXA 5I24A 1VFOA 1P6WA 3VILA 3ARXA 3WBEA 1NQ6A 1KQYA 1S46A 3CUJA 1GQIA 4R5EA 5EB8A 4CVUA 3RPMA 4P7QA 2Y2WA 2VR5A 1JF5A 2XTKA 2OYKA 1MW2A 1CBGA 4MB4A 1QI0A 2J77A 6CGTA 3THCA 2PWHA 3PN8A 1ZU8A 4HOWA 1DEDA 3GNRA 5DO8A 1IT0A 1ODZA 3FN9A 2QV4A 5CQ1A 1TZ7A 1JNDA 4U5KA 3WF4A 1PIGA 4CUCA 3S6TA 5BYWA 2FDMA 1VFFA 1WZMA 2WCGA 2WLZA 2W5FA 3RMEA 4HMDA 3THDA 4ACZA 3IK2A 1HJSA 4CD7A 2J7GA 4B3LA 1GPFA 1V0LA 4UZSA 1W1PA 1PEZA 2VVSA 3VDHA 1GOOA 2WSPA 4LYQA 3N15A 1EDGA 2VCAA 2GJXA 3RJXA 1RD6A 5A2CA 3OIHA 2B31A 3PZOA 2WKLA 2BY2A 5ABFA 1KR1A 3VM7A 1CGVA 1CLXA 3NSNA 2D20A 3WSUA 4NI3A 3KEHA 1E0XA 4UNIA 3UERA 3BSHA 5KZ6A 1XRVA 1E6ZA 2C0HA 4V28A 3WD0A 4JFWA 4PMVA 1N82A 1JF6A 4PSPA 3EDJA 1FA2A 4AD1A 2BY1A 3NUKA 3PTMA 1W32A 1WDRA 3AS0A 3NCOA 2WMHA 3CPUA 4YPJA 2ZIDA 3WY1A 1B90A 1PIFA 4CCDA 3QOMA 3PZMA 4BZYA 1W3HA 1GJUA 2DDXA 4H41A 1TG7A 4DUVA 1ZL1A 1CPUA 1E40A 1M03A 3AHZA 4IPNB 5BWFA 4OUEA 4UOJA 4UZUA 1TMQA 1Q6EA 1HJWA 2EBNA 3SCRA 1QNQA 1NOFA 2GVYA 4UFJA 1MFVA 2OSWA 1JYXA 3BAWA 2GK1B 2JEPA 3ARVA 4F9DA 3VMOA 3BLKA 2VCBA 1VBUA 4HU8A 3WH8A 5BXPA 3WD3A 4CCEA 1JZ8A 4CD5A 1FH7A 3AMCA 3VIHA 3AJ7A 1UWRA 4LPCA 2WNWA 1UH2A 3T2QA 1R8LA 3B9EA 3AS1A 1CXLA 1HL8A 3W6LA 1VEOA 1UD6A 4BA0A 4DM1A 5IFTA 1JZ6A 3FY1A 3BAXA 3HN3A 1BVNP 5FD0A 1JXJA 1OWQA 5JBDA 4WF7A 3ZR5A 3ZM8A 2GJRA 3UCQA 1BG9A 2W91A 1V6VA 1UWQA 1WPCA 2BHYA 4LYRA 3IJ9A 1QHOA 5ABGA 8CGTA 2AAAA 2VQTA 1EO5A 2WWCA 3OLDA 3TA9A 3QHNA 3O2LA 3A4XA 3SCQA 2WZIA 1J0KA 4PMYA 3APGA 3VIPA 1XYZA 1YHTA 3ARYA 4AIEA 1U30A 1UQYA 4B9ZA 4PCSA 4CN6A 1NWTA 3K4AA 3VINA 3A4AA 1L8NA 4DWSB 1NWUA 4M1RA 3GH5A 5BXSA 4CD6A 1UKSA 3K4DA 1OSEA 3CLWA 5AC4A 4P8WA 4HP5A 2F2HA 4MTVA 2XFRA 1G94A 1Q6CA 2J7CA 3SUSA 1OGSA 2G3JA 1QBAA 1TR1A 4ZFMA 5IXEA 2WW5A 5M5DA 3VX0A 3SCWA 4AIOA 1GQLA 1W9VA 4L4OA 1XHGA 4AY1A 5A6AA 3WEMA 3WDPP 3WNNA 3MMWA 1NWSA 2JALA 1PJ9A 4CGTA 3WD4A 1WP6A 1XD1A 4PEEA 5CPTA 2PBGA 3POHA 2Z1KA 1VENA 4N42A 5M03A 3VGGA 1C90A 2BY0A 3VUPA 1Q6DA 2XVPA 2ZXAA 5BRQA 2GDUA 2VRKA 4RE4A 1V0MA 1KQZA 4M81A 1B0IA 3ZT7A 1UZ4A 1GHRA 2PC8A 3AQUA 4A4AA 2C7FA 3TONA 4DWSA 3KL3A 3T09A 1HX0A 3WNKA 3VIJA 2V5DA 4J3SA 1HJUA 5D9OA 1UOKA 1V3HA 1C8YA 2D23A 1AVAA 3VIIA 3T0DA 3GNPA 2VI0A 2WBGA 1XSJA 2Y5EA 4PBGA 1GQKA 2J8FA 1NH6A 1R7OA 3AHYA 4QLLA 1E15A 2J7BA 4WSKA 3SEPA 4W88A 1XGZA 3GBEA 4P7OA 1PX3A 5A94A 4AD5A 3GH4A 2J74A 3GTNA 2DT3A 2IUZA 3CHDA 1M7XA 4KRUA 2ESCA 3LPPA 2DIJA 1W9BM 4UQ9A 4R27A 3K8KA 5CGMA 1A3HA 3WD1A 5A69A 2ZUNA 2E8YA 4MNMA 1NOUA 3L4ZA 2CYGA 3AZSA 1K9DA 3SCPA 1GHSA 4URIA 1KWKA 2J75A 4D1JA 4U2ZA 2VZUA 1SR0A 3OZOA 5GPRA 3LPGA 1CZ1A 1UR2A 3DYPA 3B9AA 1PAMA 4NRSA 1V6YA 2ZUSA 2W62A 3MU7A 3M6DA 5GNZA 1PBGA 2WVVB 4BQ4A 3ZOAA 2ZWZA 3OGVA 5FKYA 3CIVA 1VJSA 2EPMX 4HOZA 1FHLA 1HF6A 4PCTA 2VO5A 1UD8A 2BVTA 2NT1A 1GVIA 1H2JA 4NF7A 4AZGA 2CIPA 4HZ8A 2DSUA 5M17A 1GZJA 1W9DM 2YA1A 4DUXA 1TE1A 2YA0A 4LQ1A 3RO8A 4W8LA 2WMJA 3MO4A 4Z2KA 3FNDA 4HMCA 4AD4A 4OOUA 1UWTA 1H3GA 3WUEA 1V6UA 2BV9A 3ARTA 1JD9A 1KFWA 1AQMA 4PMDA 4JL2A 2WMIB 2QMKA 3EYPA 2VZTA 1FFRA 7CGTA 1VRXA 4IUGA 3VVGA 1B3VA 1ITCA 3AXXA 3I3BA 3VMNA 3EMZA 3ZR6A 1V02E 2WVVA 5HPCA 5I6SA 5AYBA 5AYIA 1EOMA 1CENA 2G41A 3AROA 4OZOA 3GXFA 4W7UA 2GDVA 1GJWA 3WNOA 2PBOA 3GXDA 2Y8KA 4W87A 5GNXA 3QHMA 1EH9A 1E9LA 1UWUA 1MW0A 4W8BA 4FK9A 3IAPA 1ISXA 4KWUA 3BMWA 1B30A 3L2MA 3WF0A 1GOKA 5E70A 4PSRA 4H2CA 4OBSA 4WKFA 1W9UA 4WKHA 3MUZ1 4CU7A 5LA2A 2JF6A 1BGAA 4FLSA 4P8XA 3N9KA 2DSZA 4MNJA 2FGZA 2DH3A 4NSBA 1R86A 2WYSA 1CECA 3JUGA 4J7RA 4GZIA 1HNYA 4J3UA 1G1YA 4UTFA 3WNMA 2ZX6A 4AWEA 2MANA 4XX6A 2VNCA 3VDBA 5E09A 1CXIA 1UKOA 3HMCA 4TVUA 1TVNA 3WDIA 3W82A 3ALGA 4BS0A 3QHOA 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4XZBA 6A3HA 3T2OA 3NSMA 4EK7A 5DT7A 2WZEA 1E6NA 2WVUA 2O9PA 4CVWA 1WNOA 1BLIA 2A3HA 1BVZA 3ECQA 1B3XA 1PX8A 4PUEA 3OB8A 1FOBA 2E0PA 2XM1A 1UKQA 2WLYA 1B31A 4UFMA 3LMYA 1J12A 3T2PA 1TUXA 3WDQA 3NIYA 1QI2A 1JZ7A 4A3HA 1AQ0A 4YHGA 1KBKA 1B3WA 2A3AA 4UFLA 3KL0A 3W38A 4OIFA 1EA9C 2RGMA 1OBAA 3AFBA 4P8UA 5DMYA 3OLEA 3WIJA 2ZX7A 1QNPA 2D1ZA 3AIRA 1TFVA 2OSXA 1EQPA 1E3XA 2VJXA 4LGXA 1NM9A 4M82A 5EBAA 2YL5A 1GUVA 1GCYA 4MNLA 4D6DA 3ZT6A 3SUVA 1FH9A 3CMJA 1DWFM 3MV01 2X8RA 1E6PA 1VF8A 1VEPA 1ZS2A 1O7AA 2J7EA 1UH4A 1OINA 2BY3A 3SCNA 2EPOA 4C7DA 3RCNA 2PB1A 1E55A 2RGLA 5BRPA 3WH5A 4FLRA 4CCCA 3EBVA 4EKJA 5F7UA 1JDDA 1MVYA 4HMEA 2HVMA 2G8ZA 2VZOA 1ITXA 2WK2A 3AS3A 4AZBA 2WXDM 1CWYA 4S3KA 3F5JA 1EQCA 3NJ3A 2PI6A 4MDPA 1I75A 5CGTA 1HL9A 4IPLA 2XWDA 3N1AA 3L2LA 2D3NA 1UD2A 3WNPA 4P7LA 4PN2A 2PF0A 3E1F1 1WE5A 3UG4A 5CJ5A 5A6KA 4C7FA 4LX4A 1NWRA 4E8CA 3PZNA 3WF2A 2WCAA 1TCMA 1OB0A 3AMKA 2QMJA 1PZ3A 3VD5A 3MSDA 2YDSA 1V02A 4HA4A 2X09A 3AHTA 4LXFA 4WSJA 1JGIA 4HPHA 2AOSA 1HIZA 1KXTA 2NT0A 4XUYA 2UWFA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1ECEA

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