1ECE | Genus

Total Genus 136

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	136
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	AGGGYWHTSGREILDANNVPVRIAGINWFGFETCNYVVHGLWSRDYRSMLDQIKSLGYNTIRLPYSDDILKPGTMPNSINFYQMNQDLQGLTSLQVMDKIVAYAGQIGLRIILDRHRPDCSGQSALWYTSSVSEATWISDLQALAQRYKGNPTVVGFDLHNEPHDPACWGCGDPSIDWRLAAERAGNAVLSVNPNLLIFVEGVQSYNGDSYWWGGNLQGAGQYPVVLNVPNRLVYSAHDYATSVYPQTWFSDPTFPNNMPGIWNKNWGYLFNQNIAPVWLGEFGTTLQSTTDQTWLKTLVQYLRPTAQYGADSFQWTFWSWNPDSGDTGGILKDDWQTVDTVKDGYLAPIKSSIFDPV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structure of thermostable family 5 endocellulase E1 from Acidothermus cellulolyticus in complex with cellotetraose. pubmed doi rcsb
molecule keywords	ENDOCELLULASE E1
molecule tags	Glycosyl hydrolase
source organism	Acidothermus cellulolyticus
total genus	136
structure length	358
sequence length	358
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1996-04-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1eceA00

3PZTA 4D1JA 2TAAA 3EYPA 4WJXA 4AW7A 4P7QA 1WZMA 1JAKA 2ZX7A 1HKKA 2XPKA 4ZXOA 5A8PA 3W6MA 3WQ6A 3W53A 2WBGA 3FN9A 1CPUA 5CPSA 1BLIA 3B8SA 3VUPA 2BHZA 2E0PA 2WXDM 3KEHA 3NJ3A 4DUXA 3FHQA 2EBNA 1I1WA 5I3DA 3BAXA 1NOUA 1FOBA 1CGVA 2D23A 1B90A 3U7VA 3RM4A 3AIWA 2V3DA 2WZIA 3PTKA 3MUY1 3ZJKA 5TD4A 3OLDA 1JFXA 1MW3A 3WD4A 3WNNA 3M7SA 5D8ZA 5IFPA 1C8XA 3WUEA 1WPCA 2WMIB 4UQEA 3VD3A 4OIFA 3FAXA 5ECUA 2FGLA 3ARTA 4HA4A 1JF6A 2ZUTA 1C3FA 5HPOA 1QNRA 1W9PA 1MQRA 3VGHA 1KGXA 4W7UA 1EDGA 1JZ7A 3BCFA 4UQ9A 4Z2HA 4XZBA 3VM7A 3W24A 4JFWA 1X6LA 2WSKA 3OGSA 2EEXA 3KL3A 2WKGA 1UH4A 5CSUA 4EK7A 1TMQA 3CMJA 3AIQA 4TX6A 3VDAA 2DSVA 3AXIA 1NQ6A 3T0BA 3D3AA 4AISA 3AIVA 4AZCB 1EOMA 3CGTA 2ZOXA 4U2YA 4U3AA 1VENA 5CXPA 4CCEA 3NSXA 1ZBVA 5E6ZA 5A6BD 1JXKA 2WBKA 4PCTA 3SCTA 3CUGA 1JL8A 3IANA 1V08A 1VBRA 1KB3A 3ZO9A 3ZSSA 2FHFA 3OIHA 3VINA 3UERA 1KWKA 1BYBA 1VFMA 3ZQ9A 1FP8A 3A6OA 1K9FA 4K68A 4EKJA 3ARZA 5LA1A 1K9EA 3DYMA 1GPFA 1L0PA 5CLWA 3GXMA 3DYOA 4PTMA 1QNOA 5A8OA 3OB8A 1LJYA 2WCAA 1W9XA 4XV0A 2XHYA 1V0MA 5JBDA 3UG3A 4HTYA 3QOKA 3WDHA 2ZX6A 3SUWA 3OA5A 5ABEA 2BVTA 1NWTA 1CENA 2ZXBA 1TR1A 1UD8A 3DECA 1BF2A 3WQ5A 3UETA 1TZ7A 4D6HA 4Z2KA 4C7GA 1VJZA 4W8AA 1GOWA 4YN5A 4FLOA 2E9LA 3AXHA 3POHA 3VMNA 1UR2A 2BY3A 1V6WA 3AOFA 3GTNA 2CEQA 3UR7A 3AMLA 1HJSA 3ZMRA 2WLYA 1WKYA 2V5DA 4KMQA 4UQDA 3WENA 3L4ZA 1TG7A 2J75A 1KXQA 1OIMA 3ZJ7A 4NZCA 4LPCA 2A3EA 1H5VA 4J28A 1C7SA 3ARUA 4HA3A 4AD2A 1M53A 3SEPA 2CNCA 4MDOA 4M82A 4DUWA 1OINA 1E55A 4WK9A 1EQCA 4P8VA 5ABGA 2X8RA 4DWSA 4TVCA 1G5AA 4D6EA 1EGZA 1E1FA 1ZBWA 3SUUA 4A3YA 1J0ZA 1VFUA 2JE8A 5C71A 1U33A 4IPLA 2V3EA 4ZEPA 3VD5A 4A4AA 2D3LA 4WF7A 5AC4A 4X0VA 3OG2A 4MAZA 1CBGA 1QI3A 2AMGA 2OYMA 1U30A 4FK9A 1W3LA 5GNXA 2DT1A 2OLHA 4OZOA 5BWFA 2RGMA 1B30A 1FFRA 2FH6A 1W1PA 1W1YA 1ZS2A 3EDKA 2DQXA 1UD6A 2ZXDA 1UUQA 4MNMA 4W5UA 3F4VA 2FGZA 3VD9A 2UY2A 1BG9A 2CKRA 3RCNA 4Q7NA 2J7CA 3GYCA 3HN3A 2VR4A 1MFUA 1FP9A 5DEZA 5DF0A 4M24A 4XX6A 1E40A 2VX6A 3N18A 1XH0A 3RPMA 3I3BA 5D8WA 4Z2IA 4W85A 2D2OA 4AZ5A 4JFVA 1J18A 3WBEA 3W82A 7CGTA 5A2BA 3AICA 2A3HA 4GI6A 2XWEA 4Q22A 4WSJA 3VIKA 4GKLA 5EFDA 4ATLA 1JI2A 4H8HA 4GZIA 4GINA 3M6DA 2A3AA 3NYDA 2GK1A 1RP9A 4D6CA 1R86A 3AHZA 2DSZA 4RE3A 3WH6A 4U5IA 2EXOA 3WH5A 5M03A 5CZKA 1H0IA 3SURA 1UOKA 1HKJA 1GJUA 1E73M 4DM1A 2CETA 1V3IA 2XSAA 2HISA 4W7WA 2QMJA 5I0DA 4PSRA 1Q6FA 4UFHA 1E3XA 3A3HA 3IJ8A 4LQ1A 4UQAA 1ISZA 4DWSB 4GQQA 3LMYA 2WHKA 3VU2A 3MKKA 2J74A 1JDAA 5FIPA 3WMCA 1GHRA 4JFTA 4BF7A 1AQMA 1V0LA 2UY3A 3BMWA 1BAGA 1JDCA 1VBUA 3PZGA 1J0YA 2O9PA 4BCEA 4V28A 1QNQA 3VD4A 4B16A 3VIOA 1WAWA 2XJ7A 1J0KA 1OGGA 5KZ6A 1WE5A 3A47A 5ABFA 3E1F1 4IISA 3VIHA 2CCRA 4JCMA 4WKHA 1J0HA 3VGEA 1HVXA 2NSXA 3O9NA 1OT1A 4MB3A 1KBBA 2WZEA 5GNYA 3AFBA 2UY4A 3KL5A 4GI8A 5CJ5A 1HN1A 2VMFA 1EOKA 1UQYA 5A8MA 1ZJBA 4B9ZA 3AHTA 4FLSA 2UWFA 2EPKX 5E70A 1BQCA 2F61A 3CH9A 5A6LA 5IXEA 4U3CA 1OM0A 3SCUA 1HJXA 3PZQA 1JZ5A 1CGWA 5M5DA 2DDXA 3CHDA 3SCPA 3FXYA 3DHPA 5A6JA 1VJSA 1BGGA 1B31A 1IZKA 3PZUA 1W2VA 1CEOA 1HP4A 2IXUA 2GJPA 3SCQA 1UR8A 3TP4A 3WQWA 2VCAA 3VIIA 2BHUA 1V6YA 1M04A 3W4RA 5A6AA 5JBFA 1XYFA 3VMPA 4GO9A 2Y5EA 3T2OA 1LG1A 1J12A 4Z2GA 3AZSA 2GK1B 3O6AA 5DO8A 4TVUA 1C93A 3IAQA 1O6IA 1CGUA 2A3CA 4U33A 2XUCA 1E5NA 4F8XA 2CYGA 3QR3A 2BY0A 3CZLA 3K8KA 1KXTA 1R7AA 3VX0A 1HKIA 4MJ4A 5IFTA 3MV01 4TTGA 3U7BA 1W9DM 1I1XA 1B9ZA 4QLKA 2BY1A 1D3CA 2W4XA 1CIUA 3PTMA 1VF8A 1OBAA 5A6KA 2O9RA 5BXTA 3ARQA 3N15A 2C7FA 1NOWA 1VRXA 3UR8A 2C8NA 4CD8A 3WEZA 3N13A 4XB3A 1JI1A 1XD1A 4D71A 4ATDA 2XFYA 5A6MA 2GDUA 1FFQA 4GZEA 3AS1A 2GJRA 3RILA 3OZPA 1JZ2A 1FA2A 1PJ9A 3AXXA 3WNPA 1GQIA 5ABFB 1UKPA 2A3BA 4WLCA 2GJXA 4FMVA 1AQHA 5BXSA 3RJYA 1MXDA 1MQQA 3CZKA 2O92A 4P7NA 1W91A 3AIRA 4MNKA 4LGXA 5A69A 1BGAA 2J25A 1FH9A 6TAAA 3ZJ8A 4ZENA 3U57A 2WYSA 3WDIA 2D20A 3QHMA 3ALFA 2Q8XA 3CUFA 3ARSA 3RJXA 1NARA 2YL6A 4PMYA 3ZSTA 4BA0A 2VI0A 3W28A 3L4XA 4CD7A 2ZIDA 4L4OA 1DTUA 2VO5A 4AZ7A 1HIZA 5AYBA 5JUVA 1E43A 2VQUA 2WAGA 3K4DA 1R85A 1OB0A 1UG6A 1E4LA 3WUFA 3QOMA 3KE0A 1UZ1A 4IM4A 1CDGA 1MVYA 4DUVA 1OGBA 3SIMA 3WMSA 4H04A 3THCA 3BLKA 4X9YA 3AIBA 1UD2A 2XGIA 1EO7A 1JIBA 1CTNA 3SCWA 5AYIA 2J7DA 2V38A 1EHAA 4UOQA 1F4HA 4ZXLA 1PX8A 2ZX5A 5FCZA 1XSKA 2QHAA 3WNLA 4CU8A 1JZ3A 1D7FA 4W5ZA 3WFZA 1FH7A 3WH7A 1AQ0A 2XSBA 3WELA 3RMEA 2CITA 4ZE4A 5I77A 1JFHA 4D6JA 2G41A 4F9DA 4M81A 1ISXA 1NWRA 2AAAA 3N9KA 1E0WA 1MFVA 2CXGA 4QCFA 2DIEA 2FHCA 3AISA 4R27A 2HVMA 1B3ZA 2CBIA 1V0NA 4MPKA 1D2KA 1ISVA 4TXEA 4JL1A 1JD9A 4HMDA 2GJXB 3VIJA 1NOFA 1ISYA 1WNOA 2OWXA 4YHGA 2VX5A 1E6ZA 4W86A 4S3KA 1H11A 4MTVA 1MYRA 1F4AA 3SCVA 3VDBA 1OGSA 5JIWA 1E6QM 3VIMA 3L4UA 3MSGA 1KXHA 4YPJA 4JCLA 3ALGA 2XFRA 3OGRA 4CD5A 1E4IA 4PBGA 2PI6A 2D22A 2PWEA 3LPOA 1Q6GA 5A1AA 4UR9A 2J7BA 4TOQA 3MU7A 4RE2A 2WCSA 2DIJA 2D0FA 4AZGA 1HJWA 1OD0A 2XIIA 1J01A 3MANA 1UYQA 3QHOA 1MW2A 4KH2A 3NCOA 1FHDA 5C70A 3U5UA 2ZXAA 4B3LA 1ODUA 3WUBA 4E8CA 1J0JA 1E6PA 5A2AA 2VZSA 3CZGA 2W5FA 4WKAA 2BXYA 3AYSA 1VEMA 4AD0A 1K6AA 1GOOA 4OOZA 3WEOA 1E4MM 2WANA 3IJ9A 1PX3A 1GNXA 1Q4NX 3WF2A 1WO2A 3VVGA 5A95A 4PEEA 5ABHA 4D72A 3ARXA 2VVNA 3FY1A 3ZJ6A 4AZ6A 4AY1A 2XG9A 2ZWZA 1E9LA 3F5LA 2RGLA 3S2CA 3NSNA 1ESWA 4NRSA 1DWFM 3VMOA 1W9VA 4HZ6A 3U5YA 4UOZA 1J9YA 1OWQA 3MSDA 4CN1A 3BH4A 4ZFMA 1HL8A 1WDQA 2W62A 2G3NA 3WD0A 1GUVA 1KCLA 2XVPA 4P7LA 4DWSD 1UKTA 1ODZA 1LL6A 4AMCA 5EMYA 2PBOA 5I23A 2ZWYA 2Z1KA 4QLLA 3L2LA 3WH9A 3DYPA 4AEFA 1QHPA 1LF1A 4PMVA 3AHXA 4M8UA 3M07A 3VM5A 3EDEA 4U2ZA 3WSUA 5A3HA 5HDRA 3W38A 1KR1A 1TE1A 3SUTA 1HXJA 3PZ9A 1UA7A 5A94A 3K4AA 1BHGA 2OYLA 3FAWA 3AIUA 1XSIA 2OYKA 4J3UA 2E40A 3CZEA 1W1TA 3MMDA 3WD1A 1K9DA 3L4WA 4PMZA 4H2CA 2V5CA 4UQCA 2YOCA 5I24A 4MB5A 4F9JA 3WF3A 3PN8A 2MANA 3AYRA 1V3MA 4UQBA 4C7FA 5KEZA 3ARYA 3B9AA 5LYRA 3CHEA 1H09A 2BVDA 3AS0A 5EFFA 1C8YA 3ZM8A 1BG4A 2WPGA 2X09A 3VIGA 2CKSA 3WF4A 2F8QA 1PZ3A 3BLPX 4J3SA 4UFJA 5A8QA 1GOIA 1KGUA 2WVUA 1FHLA 2GSJA 1CXLA 1J10A 3TOPA 3OLGA 3WL1A 4J27A 3POCA 1WB0A 3AHVA 4OBSA 5EBAA 1UR0A 4N0RA 2W67A 1GCYA 4JZ5A 4AIOA 1QI4A 4UOJA 3PZIA 4AD4A 2XM2A 1MW1A 1KQZA 1WDPA 2QPSA 1DWJM 4JIEA 2XIBA 2YDSA 2W92A 3PZOA 3MUAA 5E6YA 2W63A 1JAEA 3VDCA 1E4NA 4BQ3A 4CGTA 3WNOA 4J7RA 4DWSC 5HPCA 3N12A 3MMUA 4M80A 3RO8A 3WDRA 3WQVA 4JFSA 2QMKA 1W2PA 4N42A 2WVTA 1UWIA 1VB9A 2GVYA 1LLOA 2UY5A 1G01A 4ZE5A 3WY1A 2BNJA 4B3KA 1R7OA 5CGMA 3QGVA 4D6GA 3HU7A 3VX1A 1R8LA 1OCQA 4A3HA 3TA9A 1CXHA 1OT2A 4HU0A 1GQJA 1WDSA 1QVBA 1SMDA 3W27A 1XH1A 2QPUA 4EE9A 1ISWA 5E0FA 2V3GA 4P8WA 5LA0A 3VPLA 5BRQA 3VILA 4PMNA 2VZOA 4CN6A 2YDQA 2YKKA 3B9DA 4JL2A 2PB1A 3BXWA 4MDPA 2YL5A 4OOUA 4UZSA 2EPNA 6A3HA 3EDDA 4AZHA 1BSIA 5F7UA 1ZBKA 1JD7A 1UR9A 4JHOA 1UD5A 2V3FA 5JIPA 4QFUA 3PZMA 4Z2JA 1CWYA 2YDRA 3EMZA 3N11A 3MMWA 2JEQA 1EDTA 3J7HA 1QBAA 2D0GA 1JXJA 3MS8A 1V02E 4M1RA 2ZUUA 2VR5A 4CUCA 8A3HA 3ZR5A 2OSXA 4OKDA 1KWGA 3II1A 4AC1X 1JYWA 2PWDA 1EQPA 4PTXA 4Z2LA 3GXDA 1V3KA 4PTWA 2QF8A 2G3MA 3AROA 1H3GA 1VEPA 3ARWA 1CGYA 1B3XA 2OWWA 2FDMA 2JALA 2PWHA 3WFLA 1W3KA 3MO4A 1DHKA 1JGIA 4JFUA 3G6LA 5D4YA 2VVSA 5A2CA 2YLLA 4CVUA 4CU7A 3AI0A 4E4PA 2VX4A 2YIHA 1E6RA 1NM9A 2CERA 5DMYA 5BROA 3KWXA 2O9TA 3T09A 3GBDA 1AMYA 2X0HA 1R87A 4OUEA 1HL9A 4PTVA 4W84A 3KZSA 2ZICA 4D1IA 4UFLA 1XC6A 5CSYA 4H8UA 2DT2A 1LL4A 3GH5A 1X1NA 2QV4A 4ACZA 1L8NA 3L4YA 2IXVA 2ZXQA 1QI5A 3FNDA 4UFKA 4BQ5A 1HF6A 4J3VA 4GI9A 4V2XA 1QBBA 1QI2A 3WEMA 3WUGA 4HZ7A 4PMQA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1ECEA

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