5FOOA

6-phospho-beta-glucosidase
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
463
structure length
463
Chain Sequence
MLAFPKEFWWGGATSGPQSEGRFAKQHRNLFDYWYEEEPDLFYDYVGPDTASDAYHQIESDLTLLASLGHNSYRTSIQWTRLIDDFEQATINPDGLAYYNRVIDACLANGIRPVINLHHFDLPIALYQAYGGWESKHVVDLFVAFSKVCFEQFGDRVKDWFVHNEPMVVVEGSYLMQFHYPAIVDGKKAVQVAYNLALATAKVIQAYRRGPAELSDGRIGTILNLTPAYPASQSEADMAAAHFAELWNNDLFMEAAVHGKFPEELVAVLKKDGVLWQSTPEELALIAENRVDYLGLNFYHPKRVKAPDAIPVISPSWSPEWYYDPYLMPGHRMNVDKGWEIYPEAVYDIAIKMRDHYDNIPWFLSENGVGISGEDRYRDETGQIQDDYRIQFLKEHLTYLHKGIEAGSNCFGYHVWTPIDGWSWLNAYKNRYGLVENNIHTQVRRPKASAYWFKKVATHNRLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Chemoenzymatic Synthesis of 6-Phospho-Cyclophellitol as a Novel Probe of 6-Phospho-Beta-Glucosidases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 6-PHOSPHO-BETA-D GLYCOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pyogenes
total genus 194
structure length 463
sequence length 463
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2015-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fooA00
1GQJA 3TTYA 5M17A 4E8CA 1NOUA 2CHOA 5I23A 2VX4A 1CXHA 1WE5A 2G3JA 1VFMA 4D6EA 1IT0A 1K9TA 4OOZA 2VVSA 4RE2A 1OCQA 3AJ7A 5FKYA 4E4PA 2YDQA 4EE9A 1V0LA 3B8SA 5ABGA 1BYDA 5D9OA 3ZT5A 1G01A 3A4AA 1E6SM 4JKKA 2HVMA 1ZJAA 2V38A 3BH4A 4IPNB 1JI2A 5I24A 2Y8KA 5EFDA 4W8LA 2DT1A 5GNXA 5BRPA 2QF8A 3T09A 3L4TA 2J7FA 4JFUA 3VIHA 4HOWA 4PMOA 2ZUMA 1F4AA 1G1YA 2A3BA 2XWEA 2YLLA 4E2OA 4QDMA 5HXMA 4AD3A 2FGZA 4YHGA 2XFFA 2HISA 4JHZA 1PIFA 2YL8A 3T0AA 5D8ZA 3W25A 4MADA 2CESA 4UFKA 4Y7EA 2QV4A 4BCEA 4W85A 2BVYA 3MU7A 1UA3A 4BQ2A 3DHUA 3FAWA 4J3TA 3N1AA 1W1TA 3ZT6A 4BQ5A 4W5ZA 4F9DA 1JZ7A 1GJUA 4OJYA 1FHDA 1FOBA 4AZIA 4H41A 3SURA 2EPMX 3POCA 1BAGA 4AIUA 2W4XA 4UOJA 1UD2A 2VC9A 4MNMA 5KEZA 1AMYA 4XZBA 3VGDA 1B3XA 1C3FA 5GNYA 3PZVA 4PRWA 1GOWA 1GZJA 3PZGA 4PTMA 4BF7A 1BG4A 3WN6A 2J8GA 1TR1A 3ARXA 1BPLB 3UR8A 5FIPA 1XSIA 5A6BA 4J3VA 1XRVA 2OYLA 3MUAA 1UKOA 4AD2A 1UH3A 4PMUA 3BAIA 1B2YA 1LJYA 3WH7A 2WMHA 1OT2A 4D71A 2EPLX 1ESWA 1UWSA 3T0BA 3DYOA 2BNJA 2PWHA 1TA3B 2VOTA 3HU7A 2ZXDA 1JZ6A 3RJYA 1P6WA 4UOQA 4K68A 1C8YA 3WSUA 1VF8A 3VDAA 1S46A 3VIMA 2CXGA 1V0MA 1V3IA 1VEPA 3W27A 2VZVA 5EFFA 3WD4A 2XGBA 2XVPA 2RGMA 5CSYA 3SUWA 1W91A 4D1IA 1KXHA 5JUVA 3U7BA 3CZGA 3T0DA 1WPCA 4JIEA 1BFNA 1BYCA 4ML4A 5IXEA 3EDDA 1JZ3A 1WZAA 1W1VA 1JYWA 3BAKA 5BYWA 4CU8A 1UD3A 1W3KA 2XM2A 3E1F1 1PX4A 3WDPP 2DSVA 1QI4A 2YL9A 4Q22A 1UR2A 4J28A 2WMGA 5A94A 4Z2HA 1E3XA 3LPFA 1H4PA 2WC3A 1V08A 3WMCA 2ZUSA 3ECQA 2WBKA 2XVKA 4LXFA 1HJWA 1EOKA 4KGJA 2D3LA 3BLKA 3VIPA 5ECUA 3FHAA 2YLAA 1QPKA 4HP5A 4UCFA 2W61A 1V3JA 1E0XA 3GXDA 4DWSB 1VFOA 1FP8A 1ZU8A 2XVNA 2XFRA 4AISA 5JBEA 4GZIA 4FK9A 3BAXA 1QHOA 1NH6A 1V3HA 5D9MA 2J62A 5BRQA 4PCTA 4AZ7A 1U33A 1PIGA 4HZ6A 5LA1A 3UEQA 3WNPA 4AZ5A 1HKMA 4RL3A 3OZPA 1M7XA 1HKIA 4KMQA 1CGTA 3BAYA 1JDAA 4DWSD 1CZ1A 2VQTA 4WSKA 3T08A 2WKLA 3PHAA 4NSBA 4Z2IA 2X8RA 1W3HA 3A3HA 4A3YA 1J10A 2QLYA 1CIUA 4P7OA 1TVPA 5GQBA 1LL4A 1WAWA 1QI0A 3ARWA 3THCA 2BFGA 2BVDA 5DEZA 3WH9A 2YDRA 2BV9A 2Y8VA 2V3DA 3LPGA 3ZJKA 3A47A 2BXZA 1DTUA 5FL1A 3BAJA 5BXPA 2XWDA 4CKQA 2C0HA 1AVAA 1ZJBA 3AMDA 3FXYA 4QCEA 1FH8A 4E8DA 1B30A 4M56A 5IHSA 2ZUVA 1JYVA 2F8QA 4HA3A 3ARTA 1J0YA 3OLDA 4ATLA 1GOMA 4H8HA 2UY3A 1W9XA 4C7GA 2PWFA 1VFUA 4AEEA 1ZS2A 4Z2KA 1DWIM 2DT3A 5I6SA 3OA5A 3GXIA 5BCAA 2QHAA 4DWSC 3VD5A 3MUY1 1GVIA 5CJ5A 1KQYA 1QI5A 1FP9A 3WH5A 2J74A 1XH2A 4U33A 4HOXA 1W2PA 4TVUA 4YHEA 1MQQA 1UH2A 1HF6A 3EDFA 4KGLA 1ECEA 1HXJA 3WNMA 1J11A 1PBGA 3PZUA 2D3NA 4AD4A 4HOZA 1WZMA 1UR9A 1H09A 5DFAA 4CD4A 3CHDA 3NDYA 4JKLA 4ZXOA 1BYAA 1JYNA 1MWOA 2JF7A 3L4VA 1H41A 2VNCA 4HMCA 2O9RA 4ATWA 2TAAA 1QNOA 2EBNA 1VBUA 1KXTA 1V3MA 2CERA 2X0YA 4MNJA 3UG3A 1KQZA 2J7GA 3SUUA 1KGXA 1ZL1A 1BVNP 3OB8A 2WC7A 1E73M 1BQCA 1XCWA 2DIEA 1JAKA 3POHA 3WDHA 3BCFA 2VZSA 1XC6A 3VGFA 1HKKA 1NWSA 3SEPA 4JFWA 1KGWA 3BC9A 4D72A 1FH7A 1GQLA 2F2HA 3RM4A 1OM0A 1OIFA 3W28A 3MV01 3GBEA 1US3A 1QW8A 1NWRA 4D6FA 4ZENA 3GXMA 1QW9A 4GI8A 4RE4A 2OWWA 3VM5A 4PYSA 4FMVA 4LYPA 2J7CA 1HX0A 1H3GA 1KCKA 2GVYA 3RILA 4B9YA 2PWEA 1UWIA 3CMJA 3CMGA 1ISWA 3OLGA 5BXRA 4HZ8A 1E5JA 2G8ZA 4B3LA 2W62A 4JZ5A 1LG2A 3ALGA 3IJ9A 3QHNA 3NYDA 3VGEA 4V2XA 4EK7A 5ABHA 4AZBA 4D6DA 2ZX5A 3DHPA 2YBTA 1GOKA 2WCGA 4CN4A 1EHAA 1U30A 5CQ1A 2BS9A 1JG9A 3IJ8A 1J0IA 1YQ2A 5A2AA 2XFYA 1KBKA 3TTOA 4UQCA 3AMGA 4QLLA 2WZEA 3VDCA 3OG2A 2GK1A 4LQ1A 1QHPA 3F5JA 3BMWA 3VVGA 3VTRA 4CD8A 3AIQA 1JAEA 4CVWA 4V28A 5EBAA 3CO4A 1FHLA 4DM2A 5CXPA 2FGLA 4PN2A 3VDBA 2VURA 4AMCA 4MB1A 2E4TA 3AZTA 1G94A 3ZJ7A 1SYTA 3OIHA 3F4VA 2W91A 4M24A 1GOQA 4GZEA 1E3ZA 1US2A 3CH9A 4CN1A 2GFTA 4FLQA 1GONA 2YIHA 3CUGA 4AWEA 2AOSA 1C8XA 4D6IA 4U3AA 5DT7A 1EA9C 1B31A 3CGTA 3GM8A 3GXFA 3N11A 2JF6A 2DEPA 3ARRA 5A69A 3K8MA 1XH1A 1OGBA 4U3CA 2EQDA 1MFVA 2JALA 1MW3A 3GH5A 2WKGA 1J12A 3PZIA 2GJXA 1HN1A 2EXOA 1VIWA 3WQ5A 3WEZA 3WNKA 5BXSA 3N15A 1E4MM 1CNVA 1J9YA 4X0VA 3A4WA 1ZBVA 1QOXA 2D2OA 3FHQA 2E9MA 3CUJA 2G4FA 4JL2A 3SCTA 1JZ2A 1EQPA 3UG4A 3PZOA 5HBFA 1JI1A 1QBBA 4PSPA 1E6ZA 2W63A 3ARUA 3L2LA 1WCGA 4HU0A 1UD5A 1ZBWA 1O7AA 3ARVA 3QHOA 4WKAA 2ZUNA 1DWAM 3ZOAA 3GNRA 3WUEA 3WUBA 2WZHA 4U2YA 1U2YA 1ZB5A 1E6XM 1EDGA 1BHGA 4L4PA 1SR0A 1TMQA 4GIAA 4DUVA 3AHYA 1CWYA 3CZ8A 4CU7A 3M7SA 1EO7A 1E55A 2ZXBA 2A3AA 2J47A 1OD0A 4W7VA 2VO5A 2J77A 1LWJA 2YA2A 2X2YA 4M29A 5A1AA 3S6TA 1OD8A 2QPSA 1M53A 2PI6A 2ZE0A 3M07A 4AZGA 1TZ7A 1WNOA 1QNPA 2OSWA 3ZJ8A 4XV0A 1AQMA 5AYIA 2VX5A 3VMPA 2D22A 3O2LA 5AY7A 4W84A 2GDUA 1ISZA 2CPUA 1ISXA 1KCLA 3W26A 1JD7A 2FH6A 3WH8A 1CGWA 1WDPA 1CGVA 5ABFA 1EQCA 2CKRA 3T2PA 2VX6A 3O9NA 4ZXLA 1JXJA 4ACZA 3N18A 4AW7A 1C7SA 6TAAA 2BY2A 3RPMA 3WQ4A 2DIJA 2VZUA 5I77A 2PC8A 2ZUTA 4CCCA 3UR7A 3GH4A 4Z2LA 3TTSA 1XYZA 4DM1A 2D23A 2GJPA 5CZKA 5E70A 2AAAA 3VGBA 2BHYA 1JDDA 5C70A 5D8WA 2FHBA 1E56A 1VRXA 3AZSA 2YBUA 4BS0A 3K46A 4LPCA 3WENA 2C7FA 1UWRA 1RP9A 2XG9A 1Q6CA 3N17A 4WSJA 4ACYA 2J75A 2EJ1A 2ZOXA 1BVZA 2XVGA 3VPLA 4PMDA 1R7OA 4AZCA 1VAHA 3W0KA 5CLWA 3MSDA 2YA1A 3WDIA 1HL9A 1WKYA 4GO9A 2WK2A 3KZSA 5E0CA 5JBFA 2W67A 5EMYA 1NWUA 1PJ9A 3KE0A 2J79A 1MXDA 1R86A 3FAXA 3K8KA 1HKJA 4H7VA 3WFZA 1KR0A 2ZX8A 3DECA 4L4OA 4PUEA 3AXXA 3VD4A 1ZBCA 4TX8A 2DQXA 2YKKA 2XIBA 7A3HA 1C90A 1J0JA 1GVYA 4PBGA 2X05A 1H0GA 5EB8A 2PWDA 1RP8A 4QFUA 4FLSA 1D3CA 3VIIA 1J01A 1D7FA 3WL1A 3MMUA 2V3GA 1AQHA 2W92A 3WBEA 3WQ6A 4HA4A 1OWQA 1RD6A 6CGTA 4W7UA 4MJ2A 1WDQA 5A6AA 1R87A 3AHVA 1DHKA 2UY2A 1QNSA 4UFLA 5BXTA 2XVLA 4EKJA 4M8UA 3AMLA 3EYPA 1WDRA 3BXWA 1Y7VA 2WXDM 3TOPA 3BMVA 4OBSA 3SCPA 1JF5A 4C7FA 2BY0A 3L4ZA 5BROA 2WWCA 1UD4A 1E0VA 2GSJA 3VD7A 1CBGA 2C8NA 1E6NA 2YA0A 1CENA 1I1WA 4H8UA 1UR1A 3K8LA 3EDJA 1VJSA 4MTVA 1UG6A 2WAGA 4CUCA 1NP2A 3MV11 4IM4A 1QNRA 5DO8A 4XZWA 3BAWA 4PMZA 1NM9A 2WVVA 1CYGA 4D6GA 2E9BA 7CGTA 4UR9A 3W4RA 2BY1A 4JCLA 4EAMA 3GZAA 4U2ZA 4RE3A 1OBAA 1RH9A 1NOFA 1GCYA 4BQ3A 1JYXA 1CPUA 1W1YA 3L4UA 2ZUUA 3WNLA 3WQVA 4WK9A 2E8ZA 4IUGA 1JNDA 1W1PA 1MFUA 3CZJA 3S2CA 1LF1A 5I79A 5FL0A 4S3JA 1JZ5A 1G9HA 4TX6A 1GHRA 2PWGA 1UKTA 3APGA 1M03A 2JEPA 3KEHA 1XHGA 3VD9A 1B3VA 3SCOA 1QVBA 3TONA 1PX8A 1ITCA 1MXGA 1D2KA 4MB4A 3IANA 1EOMA 4U5KA 5E9AA 4CU6A 3SCRA 3SCVA 3ARZA 2WANA 1B1YA 3DYPA 4D1JA 5ABEA 3OGSA 1UR8A 2WBGA 4C7DA 1CXEA 3SUSA 3CZEA 4ZE5A 2X1IA 5E6ZA 1V6VA 1KWKA 2D0FA 4HPHA 3AIVA 2VCBA 4F66A 4AC1X 3QHMA 2DH2A 1V6UA 3NSXA 2WHKA 2VZOA 1CXIA 1E40A 4XX6A 2WSPA 2NT1A 3QOKA 5DMYA 3L2MA 1E71M 2DH3A 2JE8A 2V5CA 2ZX7A 2YL6A 4ZE4A 4CVUA 1FA2A 3GYCA 5JIWA 2E8YA 3ZSSA 1O6IA 4H8VA 1E5NA 5BWFA 3AMCA 3EBVA 3JUGA 3EDEA 3MANA 1C7TA 1V3KA 2O92A 2NW0A 3G6LA 3AYSA 1LWHA 2IUZA 3PZNA 3NCOA 4UQBA 3VKKA 1JZ4A 2CEQA 1E6QM 2XTKA 4TVCA 4AD1A 1JXKA 2PBGA 4MDOA 1KGUA 4Q7NA 1PZ3A 5JIPA 1LLOA 5IFTA 1OB0A 2EPKX 4TTUA 2E9LA 3WF0A 3RIKA 3VX1A 1W9DM 5FOOA 2A3CA 4B16A 1ISVA 3FNDA 1XD1A 2WLYA 3EMCA 2E3ZA 5A6SA 5A3HA 4P7RA 3MS8A 4LX4A 1BTCA 3VNYA 1EO5A 3VU2A 5I0DA 3KL0A 5CGMA 1NWTA 1XCXA 3FN9A 1JGIA 2WMIA 3RCNA 3RJXA 3AICA 1W3JA 1CGYA 4J3SA 4D6CA 4QP0A 2XJ7A 3CHEA 5JBDA 3UERA 1JFHA 3MUIA 4M1RA 4QLKA 1J0ZA 1OINA 1G5AA 2V5DA 1E1FA 4AIEA 2AMGA 3LMYA 5GNZA 5AYBA 5A2CA 2D0GA 4MDPA 1WB0A 4TXEA 4CD5A 2D1ZA 3WNOA 4QAWA 4PMXA 4BQ4A 5A6BD 3N12A 5D4YA 4TVDA 5E09A 1W2VA 1C91A 3WBAA 4JAWA 4PSRA 5A8OA 2RGLA 5M3WA 3CUIA 2CYGA 2X09A 3SCNA 5CPSA 4OOUA 2EPNA 1NARA 2UY4A 1M01A 3K4AA 3WMSA 5CPTA 3VUPA 4WKHA 3QR3A 1BLIA 1J18A 1BYBA 3WFLA 1XYFA 2JEQA 1E72M 2EPOA 3RO8A 2YL5A 1UUQA 9CGTA 2CBUA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GQJ A;  3TTY A;  5M17 A;  4E8C A;  1NOU A;  2CHO A;  5I23 A;  2VX4 A;  1CXH A;  1WE5 A;  2G3J A;  1VFM A;  4D6E A;  1IT0 A;  1K9T A;  4OOZ A;  2VVS A;  4RE2 A;  1OCQ A;  3AJ7 A;  5FKY A;  4E4P A;  2YDQ A;  4EE9 A;  1V0L A;  3B8S A;  5ABG A;  1BYD A;  5D9O A;  3ZT5 A;  1G01 A;  3A4A A;  1E6S M;  4JKK A;  2HVM A;  1ZJA A;  2V38 A;  3BH4 A;  4IPN B;  1JI2 A;  5I24 A;  2Y8K A;  5EFD A;  4W8L A;  2DT1 A;  5GNX A;  5BRP A;  2QF8 A;  3T09 A;  3L4T A;  2J7F A;  4JFU A;  3VIH A;  4HOW A;  4PMO A;  2ZUM A;  1F4A A;  1G1Y A;  2A3B A;  2XWE A;  2YLL A;  4E2O A;  4QDM A;  5HXM A;  4AD3 A;  2FGZ A;  4YHG A;  2XFF A;  2HIS A;  4JHZ A;  1PIF A;  2YL8 A;  3T0A A;  5D8Z A;  3W25 A;  4MAD A;  2CES A;  4UFK A;  4Y7E A;  2QV4 A;  4BCE A;  4W85 A;  2BVY A;  3MU7 A;  1UA3 A;  4BQ2 A;  3DHU A;  3FAW A;  4J3T A;  3N1A A;  1W1T A;  3ZT6 A;  4BQ5 A;  4W5Z A;  4F9D A;  1JZ7 A;  1GJU A;  4OJY A;  1FHD A;  1FOB A;  4AZI A;  4H41 A;  3SUR A;  2EPM X;  3POC A;  1BAG A;  4AIU A;  2W4X A;  4UOJ A;  1UD2 A;  2VC9 A;  4MNM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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