1JR1A

Crystal structure of inosine monophosphate dehydrogenase in complex with mycophenolic acid
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
498
structure length
436
Chain Sequence
GLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKKITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKKYEQGFITDPVVDRVRFEAKMGSRLVIMTKREDLVVAPAGITLKEANEILQRSKLPIVNENDELVAIIARTDLKKNRDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLALAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYMKEKYPNLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGCGSICITQEVLACGRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEYFFSDGIRLKKYRGMGSLDAMIKVAQGVSGAVQDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQVRAMMYSGELKFEKRTSSAQVEGGVHSLHSYEKRLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Cricetulus griseus
publication title Structure and mechanism of inosine monophosphate dehydrogenase in complex with the immunosuppressant mycophenolic acid.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inosine-5'-Monophosphate Dehydrogenase 2
total genus 125
structure length 436
sequence length 498
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2001-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1jr1A00
1FCBA 2X1RA 2VFFA 1BWLA 1J2WA 3FKKA 5LSMA 2VXNA 3G0SA 3QQ0A 4LV9A 1OFQA 1WQ5A 4D2JA 5E0KA 4PL2A 3W9ZA 2BXVA 5LZLA 4AHQA 4RZ6A 1WV2A 1KFEA 2GUUA 4O57A 4GUFA 3TW7A 2DP3A 3G22A 4OE7A 2YFNA 3W2NA 3HIJA 1W3NA 4UMAA 3KRUA 4FX6M 4O16A 1R2RA 1DJNA 5DELA 3GAKA 4MY8A 2RFGA 1NAL1 4GFSA 3PR2A 3L67A 3INPA 5CZTA 1RVGA 3MMTA 3FJ6A 5AB3A 3NQ8A 2Y62A 3BO9A 4LY8A 3Q58A 4CLMA 2Y89A 3M43A 5BMWA 1TO3A 2E6YA 3E49A 3BPWA 3ABRA 2ZZ7A 3CU2A 3OEXA 1VCVA 4RJEA 5K7JA 5KZDA 3WFAA 2E77A 3NQVA 4M6QA 4FHAA 1ZENA 4YCPA 3HJZA 1R2SA 4FX8A 3O15A 3CLMA 3ANYA 5E93A 3P81A 5CG7A 3IV3A 1N55A 2HS6A 1TTJA 3PUDA 1H61A 2QAPA 1ZAIA 2J9YA 4W9TA 4CCCA 2ISWA 1IF2A 1F76A 1KFLA 3G0UA 4UTUA 1KM1A 4RCXA 4UR7A 2C1HA 4O52A 4FNUA 3F03K 4YWIA 1JRCA 1SUXA 4U4MA 2X1UA 3NQAA 5F2GA 1EP3A 5CPOA 3EXRA 4A2SA 2QCLA 2GQ9A 3TV8A 1UJPA 2A2IA 4O53A 1ZALA 3NM3A 2ZQ0A 5D2YA 4AXKA 3LLDA 4JYEA 2VFIA 4IWWA 1VCFA 1IXNA 3MP4A 3WJXA 3NM1A 3HGJA 1X8FA 4LVDA 1YPIA 1VLIA 3CPRA 4XKYA 1XFBA 1ZAJA 2QUVA 4DBEA 3B03A 2V5LA 3SZ8A 3CWNA 3LV6A 1LRNA 4UCGA 3ABOA 1ADOA 1TTQA 2PRMA 4IMFA 1TYGA 4AF0B 2QJIA 2C0AA 2GJNA 2NWRA 3LXBA 4LRTA 1QMLA 3LERA 3NQEA 2PRHA 1O94A 2WSRA 5F4WA 2YXGA 3O6CA 4DXVA 1VHNA 1VS1A 3EB2A 2PC4A 2WJZA 3PULA 3UWYA 2DZPA 2D73A 2Y88A 2QF7A 2Z1BA 4UTWC 3P5ZA 4HKPA 3DKLA 3IEBA 5A8GA 1FXPA 5DCEA 4WY0A 1JQXA 2NUYA 2H3DA 2ZA1A 4M7TA 1FCUA 1TPUA 1OX5A 1TB3A 3W7DA 1H7NA 3I7SA 4UTWA 4IQLA 1QOQA 3BK0A 3CT7A 5G5IA 1NF7A 1SR9A 1MZHA 5I3GA 3LI0A 4O1CA 5LNWA 3MWAA 5LNUA 2CZ5A 4HNUA 1S5WA 3QPYA 1XXXA 3P61A 4NU7A 4K7YA 1H1ZA 2X16A 2QUUA 4UMCA 2CU0A 4E0CA 4UIOA 3UXDA 2F84A 1H7RA 5G4WA 1G4PA 4Z1AA 3W86A 3FYPA 3O63A 3CEPA 2TRSA 3NQFA 4PFMA 1FWWA 2O7SA 4DQWA 2Y61A 2E6DA 1IIGA 1L6YA 1SO6A 5F2LA 3G1YA 3O16A 3UWUA 2NXHA 2BX7A 2E5CA 1A53A 1I2PA 2DJXA 3GDRA 3PB2A 3N34A 4FF7A 3NL2A 4NUWA 3NQ2A 3QSTA 3VKJA 2YCEA 2TMDA 1R2TA 3LB0A 1EX5A 1A5AA 4CQAA 3OVPA 1M6JA 3WK1A 4MPQA 3LCIA 4CNOA 3W07A 4HPJA 4FNSA 4UTLA 1SW0A 4HHPA 1JUBA 5G4EA 5HR7A 4TMCA 3W1AA 3DFPA 3QC3A 1OFBA 1PHQA 1TPVA 2H3BA 1WAUA 3R13A 2Y63A 3T78A 1T96A 2WSYA 1W5OA 3MYOA 3IGXA 4JTSA 4UFMA 4UFKA 3E0IA 3N9SA 4O15A 1TTPA 3LHZA 4DEFA 1Z44A 2VEIA 3PBYA 4XTIA 2YFOA 5IBXC 1TMHA 3DH7A 1G4TA 1RQHA 4K8EA 3I6RA 2E6FA 4XKYB 1QWGA 3LXAA 1G4EA 3HPXA 1LCOA 5D2TA 1QFEA 3BG5A 2YGYA 1VRDA 4UMBA 4K6AA 4N4QA 3H55A 4QIUA 1EEPA 4PL1A 1B3OA 1ZCOA 4XTDA 3NEVA 3R12A 1OX4A 1TPEA 4PTNA 2NX1A 3DHDA 2OX1A 1P0NA 5D2VA 3A5FA 1MO0A 5I3FA 4ORMA 1VH7A 3TDFA 3TU9A 4AH7A 1JUEA 2C19A 6ALDA 3N9RA 4RZ5A 2O7QA 1O5KA 1SFLA 2QCDA 4WY0B 4YCOA 1VZWA 2KZHA 1FWSA 4ZQRA 1ONRA 1VPXA 1XDMA 5HR6A 1TV7A 4JTUA 1O5XA 1Z48A 1OF6A 5EKYA 2WKJA 3LBCA 3NL6A 2B7PA 1SW3A 5AHFA 1X1OA 5CZSA 1H62A 1H5YA 4N9BA 4BFAA 1VGAA 2P1FA 3LRMA 3C4UA 3HPZA 5FEXA 4L4MA 1L6SA 5J5RA 1G7UA 3TR2A 1TPB1 3N19B 2ZBTA 4C1KA 3TSBA 2ZTJA 1W37A 1GEQA 3QMRA 1VYRA 4LUJA 5DBUA 3W1UA 3G0XA 1RV8A 1WOAA 1XKYA 1AL8A 5H91A 3GDMA 5D32A 4IMDA 4LS1A 3G3DA 1XCFA 4JXCA 4UFLA 2JGYA 2P0OA 1GQNA 3ABSA 5AN7A 2UV8G 4RR4A 3W6YA 4MZ8A 3DFOA 3WJSA 1OK6A 4O19A 4IJBA 4X22A 3TH6A 1G69A 4B5NA 1OVDA 2W6RA 1QPRA 3W71A 5AC7A 1MSSA 3W75A 1TJPA 2G96A 1JQVA 4QISA 3B04A 4FO4A 2ZRUA 1LZOA 2NXGA 4DO5A 3NDOA 3JRKA 3QFEA 1EP1A 1K8YA 2H90A 5HULA 3STFA 1SZEA 4HNTA 3LTSA 3OBKA 3B0VC 1JCNA 3TE9A 3HG5A 1QPNA 3MHGA 3RMJA 2GJLA 2WNZA 3QRHA 5F2MA 3BW4A 3GR8A 3C2RA 3M5ZA 1R47A 3TCEA 2QAFA 3W2MA 3WJWA 1Q3NA 3C8FA 4NXKA 3A21A 5K4ZA 3IVSA 1KA9F 1YXYA 4EF9A 1JJKA 1C29A 1ZFJA 1D9EA 1G67A 4Z08A 2A1YA 3BLIA 3G8EA 3ATYA 2B0MA 1K02A 1WA3A 5CZ0A 4WOZA 2BWGA 5BW6A 4UUIA 1OX4B 4NJIA 2CLFA 2B7OA 3UWWA 2W0UA 3ATZA 1QO5A 2JK2A 2Y7FA 5EPDA 3BW2A 3NQ6A 1PL9A 3PSWA 3FS2A 3NZRA 4RLIA 2E5DA 1R46A 2A4AA 5H2ZA 1Q6LA 4NJJA 4I9AA 3RLUA 3TQKA 2QCDB 4EOUA 5CPMA 1KBJA 3C0JA 5KTLA 3LOTA 3QMSA 4ONVA 3BGGA 3GKFA 4ALDA 4QNWA 3OA3A 4DF0A 1GYLA 2WNQA 3W7RA 3PG8A 3USBA 4GXMA 4HN4A 1JUKA 1F6KA 3S6DA 2AAMA 4BI6A 3ZS4A 2GVLA 3V1PA 1ALDA 2J9ZA 4N9DA 3CIXA 4WOQA 3W7IA 1I2RA 3IIOA 3LM7A 2Y85A 1XI3A 4R7JA 1H7PA 4JN6A 3LHVA 3WK0A 3DFQA 1B4EA 1LOLA 3IVTA 1LBMA 3CM4A 3W7JA 1KBIA 3QSRA 4JTEA 1KFCA 3HGSA 3EX3A 3NPUA 1W0MA 3L65A 2GQ8A 4JTGA 3A22A 3H53A 1SO4A 3G1FA 4X3ZA 4NZFA 2R94A 4JIQA 1OFAA 1IGSA 1D3HA 3SI9A 3L9CA 3S8HA 2CZDA 2NUWA 3N73A 3PAJA 4MFEA 5AHMA 3WJZA 5EYWA 3NQMA 5K2ZA 1OFOA 1TV5A 1MEIA 3LI1A 3PVFA 4UTKA 3PF3A 3O06A 2PE4A 1WDWA 2VFGA 3DAQA 3G1AA 3HF3A 1G6CA 4UC5A 1LBLA 5LHEA 1GG1A 4H4IA 2X1SA 1S3HA 4H6KA 3W7OA 2X2GA 1JULA 4JICA 4U28A 3O8AA 5FF0A 3MO7A 4XWUA 1KTCA 4IMEA 3P74A 3YPIA 2BTMA 2NV1A 3RF9A 2CW6A 4JNMA 1NF0A 1AW1A 2DZXA 2B4GA 1YTEA 1KFKA 3QZEA 2G5WA 4P61A 4EVZA 3EEGA 3TC7A 3QEZA 1GTEA 1TPH1 4WY0F 3W2KA 1W5NA 3W76A 4MZ1A 4TU1A 1SU5A 4E2DA 1B57A 4CNNA 3NQ7A 3THAA 5D09A 4ADTA 2V5BA 4JTLA 3UY7A 1A5SA 3P82A 4KKXA 2XN2A 2ATSA 3W72A 4MLJA 2E09A 5D37A 1Y0EA 3BVJA 3GXPA 4FB7A 3FKRA 3HG4A 5E1QA 3W87A 4O13A 2DORA 4Y9AA 2QDHA 3GDTA 4GJ1A 4DO6A 3HPSA 3R89A 1MEHA 5AHIA 1Q6RA 1GVOA 1TQXA 5HJLA 5LGZA 1ICPA 3LTPA 2WNNA 1AW5A 3I68A 2WPBA 4Z1DA 2Z6IA 3STCA 1EIXA 2ZZ2A 1Z41A 3TSMA 2P10A 1HUVA 4LS0A 3S1UA 1H50A 1YTDA 3PB0A 1EUNA 1P5BA 4O54A 4HNNA 4KFPA 3FYOA 2J9XA 3L66A 4MUZA 1OFRA 4WX2A 3TSDA 1PS9A 1W56A 3UPBA 5EY5A 1XBYA 1I8JA 5HUPA 3DI0A 4GUIA 3W23A 5AFDA 1VHCA 1OK4A 1H7XA 4I7WA 5C55A 3C2FA 4AWTA 4UXDA 3W2LA 3L0KA 4OU1A 2YZRA 3S5YA 4FXRA 1FDZA 1S5TA 4FXSA 1ML1A 2F7FA 5G1TA 4L4LA 3W7CA 3JS3A 2QCHA 5I3IA 1HTIA 3KFTA 4ZQMA 1FQ0A 3G1HA 3HB9A 2TSYA 3GYEA 1KM4A 1ME9A 4LC6A 3QW4B 4JX4A 2NZLA 5U7SA 3M16A 4NQ1A 2NXIA 3EX2A 3GDKA 1YDVA 4N02A 3SY5A 4QJ1A 1LBFA 5KZMA 1FWNA 3THQA 3NYZA 1ZAHA 1M7OA 3H54A 5AHNA 1OJXA 2FJKA 2CLHA 4NNBA 5FF4A 3DBPA 1PCKA 3KAOA 3ZWTA 1G4SA 3NL5A 5T26A 3W1LA 4EIVA 1CI1A 2Z0IA 3M47A 1DL3A 4O0KA 3W85A 4MZYA 2YYTA 5FESA 3QH2A 2JKAA 4DPPA 3KRSA 1FWRA 3QW3A 3STEA 2A0NA 1R30A 3ZR4A 1TPWA 4GWEA 1KFBA 1UASA 3B05A 3IIZA 2AGKA 1O4UA 2V2DA 3A24A 8TIMA 3W2JA 1K8ZA 5G2WA 5AC8A 3JR2A 3BLFA 1KM5A 1T0OA 5BMXA 3EWWA 2A5HA 4O1BA 2WV8A 1W5PA 3MHUA 1THFD 2YX0A 3S5OA 3DFSA 3S5NA 1L9WA 1B4KA 1YXDA 3GLCA 1DOSA 2QDGA 2C3ZA 1VLWA 4IMCA 3MUXA 4N9EA 2JBMA 2V2CA 2CLEA 4IXHA 2AQWA 4O4WA 1C9DA 4K39A 4UNLA 2I1OA 4YMZA 1OX6A 2VC6A 3TQ0A 1LOSA 1I2OA 1LRTA 1AMKA 3PBWA 3GB6A 4Z1BA 3SR7A 3P60A 3LHUA 2B7NA 5DY3A 3C61A 1QPOA 1LDCA 2QJGA 3BARA 5FI8A 4O1DA 1EA0A 2EKCA 3S1VA 4AEOA 5C2XA 4GC4A 1KLZA 3LGEA 4JTIA 1W5QA 4Z0SA 2ZYFA 3EKLA 3EXTA 5KMYA 3OHIA 2CLKA 4O14A 4ZZ9A 1F5ZA 5LGXA 4MYAA 1WOBA 2NLIA 2OZ0A 3EWYA 1EP2A 5TIMA 3CB8A 1GYNA 4QM1A 3Q37A 3C2VA 3QQ1A 4LVBA 4UTTA 2J24A 3DZ1A 4J9JA 1OHLA 4H3DA 3EX4A 4A2RA 3PC0A 2Y7DA 4R33A 1ME8A 3GAYA 3L21A 4MYXA 5KINA 1FUYA 2ZZ4A 3M5VA 4DELA 4BR1A 4OGZA 3P8IA 3M5XA 5HNRA 3G1DA 3NAVA 4RK8A 4JYDA 4O17A 1P1XA 2VKZG 3UQNA 5DXYA 3VE9A 3TIMA 1CX9A 1UUOA 2A6LA 1GPWA 3CHVA 3DENA 2JGQA 3GXNA 4OHQA 1V7YA 1W54A 3EWUA 1JRBA 2EGZA 4IPJA 2RDTA 1X6UA 3NO5A 4LNYA 3M41A 1TRIA 3M44A 3MJYA 4M19A 3NNTA 3LCHA 1GWJA 3T4CA 4I7UA 2ZDRA 4OV9A 3TXZA 3S9YA 1SFJA 2DZVA 1KFJA 3DFTA 1UBSA 1Q45A 1TCDA 4JEQA 3CC1A 4LTSA 1K8XA 3N3MA 2G95A 2BZNA 4LVAA 2HTMA 4X2RA 3IRDA 4N6FA 4E38A 4O50A 2RHGA 3DFNA 2ISSA 4CNPA 1QAPA 5J5DA 3TAOA 1LLWA 3KRZA 4KWWA 1VYPX 5HWNA 3KX6A 2J88A 4AHOA 2H8ZA 2YSWA 3L5AA 1FY6A 2TYSA 3M7WA 2RDWA 2FB2A 3AJXA 1RQEA 1QNVA 3T55A 5C54A 2JKEA 2ATMA 3T44A 3TJXA 3T40A 5FF2A 1KV5A 3DI1A 2ZZ1A 3W1XA 3O1NA 3TW6A 1YXCA 4QAIA 4QSHA 3F1QA 1FWTA 5EA9A 1SSGA 1KM2A 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 4NNC A;  5K3V A;  3VFL A;  2YR1 A;  4S1F A;  3SEC A;  5D2X A;  3NQD A;  3IIX A;  4N9C A;  2A7P A;  1OFD A;  2ZZ3 A;  4UTJ A;  3NQC A;  1LLZ A;  1UB3 A;  5HWM A;  3A9I A;  5KZE A;  1JR1 A;  3VND A;  1PE1 A;  4YL2 A;  4X9S A;  1M5W A;  5I3K A;  4GBU A;  3W1Q A;  1YPF A;  2FB3 A;  1GVQ A;  4HSO A;  2FPT A;  3TML A;  1PCW A;  3BLE A;  3C56 A;  1C8V A;  4K7V A;  1HO1 A;  1T99 A;  4N2Y A;  5HQE A;  5L9F A;  4DO4 A;  3NPW A;  1K7E A;  3G24 A;  4Y8F A;  3U6W A;  3W1T A;  1XUU A;  4UR8 A;  4ZMG A;  4FNR A;  3TQV A;  3W73 A;  5I3H A;  2YPI A;  1LM1 A;  2V2H A;  3LRL A;  4KFN A;  3UXA A;  4R34 A;  4AWU A;  1HG3 A;  1I4N A;  3BGJ A;  4UTI A;  1YDN A;  4HT3 A;  4UTH A;  4EWN D;  1U83 A;  2Y7G A;  1X7F A;  4AF0 A;  4A22 A;  3ZWS A;  1W8S A;  3FFS A;  3GDL A;  1WYI A;  1GG0 A;  2LLE A;  4JX6 A;  4FNT A;  5LHF A;  4K37 A;  1LP6 A;  2HSA A;  3TKF A;  1XM3 A;  4JS3 A;  1E51 A;  2V8Z A;  3P7Y A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2X1R A;  3QQ0 A;  4LV9 A;  1DXI A;  4A8R A;  3PPG A;  5E0K A;  4PL2 A;  1S2V A;  4AHQ A;  4S3K A;  2WVS A;  2Y0F A;  3LPP A;  4GUF A;  3UG3 A;  4OE7 A;  3T4W A;  3KRU A;  3VA8 A;  1R2R A;  2HPI A;  3WEN A;  3GAK A;  1E56 A;  2RFG A;  5E6Z A;  4DIA A;  1TWW A;  1V6T A;  3L67 A;  4LJ3 A;  2GK1 B;  5HA7 A;  4R88 A;  2FZ8 A;  3ES7 A;  3GHT A;  3MZ2 A;  5BOF A;  1GHS A;  1Z69 A;  3M43 A;  5BMW A;  3ABR A;  3UZY A;  1PZ3 A;  4J5N A;  5KZD A;  3HM7 A;  2QPX A;  3V5C A;  3PJT A;  3NQV A;  1MVY A;  4M6Q A;  4FHA A;  1PUD A;  1M9H A;  3ARX A;  3M6D A;  4DUV A;  5TD4 A;  3HJZ A;  2VC7 A;  2FZ9 A;  5GNZ A;  4FX8 A;  3O15 A;  5E93 A;  3VOG A;  3IV3 A;  1N55 A;  3EDE A;  3ID7 A;  1U5H A;  3U5U A;  1OBA A;  3QGK C;  1ISV A;  4ZOB A;  3COT A;  4Z1Y A;  3BUV A;  3AXK A;  1KFL A;  2CET A;  3WF0 A;  2WVU A;  1E6R A;  1XWY A;  3JU2 A;  4OUE A;  5F2G A;  3PBG A;  1KC7 A;  3WYZ A;  2EEX A;  4FOU A;  3W28 A;  3TV8 A;  1R9X A;  3BLL A;  3NM3 A;  4JHZ A;  1MUW A;  1V0N A;  2D69 A;  1GW1 A;  4DI9 A;  3H26 A;  1N82 A; 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