4XQ6A

Crystal structure of dihydroorotate dehydrogense from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
323
structure length
317
Chain Sequence
VAPVRRLLRRLLGPTDPVLASTVFGVRFPAPLGLAAGFDKDGTALSSWGAMGFGYAEIGTVTAHPQPLFRLADDRALLNRMGFNNHGARALAIRLARHRPEIPIGVNIGKTKKTPAGDAVNDYRASARMVGPLASYLVVNVSSPNTPGLRDLQAVESLRPILSAVRAETSTPVLVKIAPDLSDSDLDDIADLAVELDLAGIVATNTTVSRDGLTTPGVDRLGPGGISGPPLAQRAVQVLRRLYDRVGDRLALISVGGIETADDAWERITAGASLLQGYTGFIYGGERWAKDIHEGIARRLHDGGFGSLHEAVGSARR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis h37ra
publication title Crystal structure of Dihydroorotate Dehydrogenase form Mycobacterium Tuberculosis
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone)
total genus 105
structure length 317
sequence length 323
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2015-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4xq6A00
3W1TA 1LZOA 2NWSA 4JICA 5BW6A 3WFAA 2OZ0A 2DJLA 3NA8A 1F73A 5G5IA 3OG3A 4PODA 5H2ZA 1CW2A 3M5VA 1WBHA 3C2FA 4MZYA 3HG2A 2E5BA 3W1AA 4X2RA 1U5JA 3BW3A 1P4CA 2VFIA 3DFOA 3W7HA 3DI0A 3LHVA 5D09A 2H3DA 2C18A 1QOPA 4KFPA 1K7EA 3DFSA 3W7QA 1UUOA 1I8JA 1H7NA 4M7SA 2DZVA 2G95A 5K3VA 3UZ5A 3PBWA 1H7WA 3L66A 2Z6IA 3W7PA 1H1YA 3NPXA 3KXQA 4IX2A 1Q3NA 5F4WA 5KTLA 1TPFA 3QMRA 5K7JA 3RFAA 1CI1A 3PY2A 3QPYA 4O16A 3NQVA 3MHUA 3BG5A 3B05A 3P5YA 4IQLA 1UJPA 2QJHA 2ABAA 5CZ0A 1FBAA 5L6UA 4K39A 4Y6GA 2QUTA 3TSMA 1X8FA 4KFOA 1H1ZA 3KRZA 1PVNA 3QH2A 2JGQA 3NVTA 4MIMA 4D2JA 1E51A 4LVBA 3E02A 1D9EA 1SSGA 4UFKA 1AL8A 3GIYA 3HIJA 1DQWA 1PE1A 3EX3A 2DZSA 3LRLA 2ZA2A 3L5MA 4OV4A 3WJSA 1VLWA 3KX6A 1LOQA 1GOXA 4BWLA 1W3TA 2GPTA 4DEFA 3LHZA 4IUOA 1F7BA 2GQAA 2EGZA 3G1SA 2CLMA 4FNSA 5AHEA 4UTWC 5KITA 3G3DA 5CSSA 3O6YX 3UY7A 1FQ0A 3I7SA 1X7FA 3LB0A 4A21A 4RZ6A 1OJXA 2VEPA 4HHPA 3PBVA 5DBTA 5HULA 2CZEA 2WJZA 1EWDA 3LOTA 3HPXA 3UY8A 1TPWA 5AC8A 1FXPA 1XUZA 2C6QA 4JY8A 1UBSA 4NJHA 3M47A 1QPRA 3NQEA 1O5KA 4AF0B 2QCGA 2BZNA 3MWAA 5C6MA 3PM6A 2BLEA 1LTDA 2QEZA 2P10A 1GYLA 1GVOA 5FF3A 1XM3A 1S5VA 4IMFA 2DZTA 1RPXA 3MMTA 1JULA 4WD0A 3BGGA 4JTUA 3NPVA 2C13A 4WOQA 2FLIA 4MY8A 4O53A 3M5YA 3W7KA 3GAYA 4BI7A 4NT0A 3FIGA 3NM3A 5EBUA 1Q6QA 1F76A 4IMDA 5A8GA 1EWEA 3DFPA 2GOUA 3D0CA 4ZVJA 4JTGA 5G2IA 2QDGA 2ZRVA 1SZFA 3PB0A 1WV2A 3W7CA 3W7EA 3G1VA 1QPOA 2WQPA 3OVRA 4KWVA 4N9DA 4WXYA 3W2KA 4TMCA 1PCWA 3U2OA 1ZNNA 1TQXA 1EA0A 2VELA 4C1KA 4IGHA 3M5XA 1NAL1 1W5PA 3A9IA 2Y7EA 1ME8A 1SO6A 2YR1A 3EKZA 4IOTA 3W7RA 1QNVA 4XTIA 4O11A 2FB2A 1SUXA 3UXDA 2OJPA 3PG9A 2YGYA 1ME9A 3W1UA 3LRKA 5D05A 4K8HA 3LBMA 5I3KA 4WUIA 3GNNA 1KM0A 2ZZ1A 1VLIA 4LU0A 1R30A 3M1ZA 4JDBA 4G1KA 4NU7A 2HS6A 2NUXA 4WX2A 1OFBA 3FFSA 2CFFA 3TC7A 1UCWA 3W2JA 4E0CA 2FJKA 5BRBA 4LV4A 3PUDA 5CPNA 1A53A 3CU2A 1AK5A 2JBMA 3TFXA 3T4CA 1KM2A 1FDJA 3O8AA 3LXAA 3PSVA 4OE7A 1WA3A 4EF8A 4LNYA 1GVFA 2YW4A 2CZ5A 3FKRA 4HSNA 1SSDA 4DXVA 1FDYA 3M5ZA 1FCBA 2FTPA 2W0UA 3P60A 1MZHA 3V75A 1QR7A 1VR6A 1WBJA 1LROA 3OIXA 3L21A 1IXQA 4AF0A 1EP3A 2Y70A 2V0TA 1XKYA 1W3IA 1EPXA 3U8GA 4FNRA 1ICSA 4JTKA 3GNDA 1H60A 2C0AA 2RHGA 3MP4A 4WOZA 1S3HA 1M6JA 1WAUA 1Q6OA 1Z42A 1LLWA 1JCLA 4AXKA 4LS0A 3HJZA 2F84A 2TSYA 2A6NA 2ZCGA 1MXSA 4K6AA 3PF3A 2NZLA 3T7VA 5D2WA 3NQDA 2NWRA 4IJBA 4O1DA 3LCGA 3HMJG 1NFBA 2AAMA 3R13A 2QCEA 5K2ZA 3S1WA 4FO4A 1W1ZA 3EXRA 1DJNA 2BXVA 4GWEA 1CX9A 3CB8A 3TQ0A 3W7MA 3WK0A 5I3IA 1MSSA 4WY0A 4FF7A 4UTTC 3DBPA 1JCMP 1M5WA 2QCLA 1GYNA 5FF4A 3QSRA 2ZZ5A 1LM1A 3E49A 3W85A 3FEMA 4RZ4A 3GK0A 4HNUA 2QCDA 2YDAA 5LNVA 2FIQA 3BVJA 3GKAA 1IIHA 1OFQA 5CZJA 1NF7A 3WJZA 1XDMA 3W1RA 2CLEA 5A5WA 1SQ7A 2Y7FA 1DL3A 3W2UA 4HN4A 4UMBA 4R33A 4FNQA 4NXKA 5D2XA 4EWND 3THQA 1FWNA 3GDLA 3PUEA 4LS1A 1TPH1 3S0CA 4GNJA 3LTYA 4FNUA 3G22A 3S5YA 3B0PA 1KBIA 1VPXA 2WNQA 1O4UA 1X6UA 1KA9F 1ICQA 2TMDA 1EP2A 2JKEA 1NF0A 1Y0EA 1VCFA 4YMZA 4UIOA 1GVRA 1XFBA 3NQAA 2VFHA 4W9TA 1NSJA 2B7NA 3CEUA 1TMHA 5G4EA 3W72A 3R2GA 2NXIA 4JTLA 2AQWA 3DI1A 4GBUA 3RK8A 5LNSA 1B9BA 3TAOA 3IEBA 3PR2A 4RK8A 2RDUA 1TPB1 4OGZA 5CPMA 3TAKA 4ADTA 3DXIA 3V1PA 4FXSA 1JQVA 5K9CA 1WQ5A 1B57A 3EKLA 1OX4B 3W2MA 2EPHA 2A21A 4JTEA 1EX5A 2Y85A 3G1FA 2NX3A 3E12A 2ZRZA 2B7QA 3PAJA 3G0SA 2VFEA 5BNKA 4XBSA 3VE9A 2LLEA 2QCCA 1D3HA 1PCKA 1LCOA 4HT3A 3LXCA 3TUUA 4C1LA 3UZJA 1GG1A 1OF8A 1DORA 3GXTA 1N7KA 4P61A 4OHQA 2E5DA 4MYAA 3MI2A 4O14A 2OX1A 3R8RA 2ZA3A 3C6CA 4UR8A 1S5WA 1SU5A 5C5YA 2YSWA 3CHVA 4O8RA 1JJKA 2VFFA 4Z08A 4CLMA 3GLCA 3F1QA 2QCHA 5T26A 2A7PA 1N8FA 2J9ZA 4N9BA 4OU1A 4JTHA 1Q45A 3TX9A 3T78A 1P1XA 1HG3A 3O6CA 2Q3RA 3TNOA 1LBFA 3P74A 4K7YA 3LI1A 2ZRUA 3W3OA 5DCEA 5EL1A 2PRLA 4N02A 1J4EA 3RF9A 5KZMA 4LOCA 2J24A 3KVKA 4LV9A 4M19A 3UYCA 4Q33A 3MW7A 1GTEA 4FNPA 4H4IA 4UFIA 4LRSA 4U28A 4QISA 5GVJA 3KAOA 3U6WA 3NG3A 3W1NA 1XBYA 1DHPA 1SR9A 1QFEA 2A7RA 3L5LA 3C0JA 3CTLA 2Z0IA 3EX1A 3NR0A 1PHWA 4JS3A 3NGJA 3MI3A 3W6YA 3P80A 4RCXA 3TIMA 2C14A 2CLKA 4JX5A 5CZSA 3VNDA 1F05A 2C16A 3TMQA 2NV1A 2ZZ6A 3O16A 3S9YA 4TX9A 4K38A 2YYTA 3LLDA 1DOSA 2ZA1A 1W5OA 1L9WA 4ZQRA 1BWKA 2NXHA 5F4XA 3LCIA 4FX6M 1LORA 4PH6A 2E6DA 3QQ0A 1JCNA 4HNNA 3SGZA 5LHEA 4NX0A 3L2IA 3QMTA 3MO7A 1TREA 3SR7A 4CNNA 2DJXA 3NO5A 2DZPA 2VFDA 2RDTA 1ME7A 2QCMA 1F2JA 2ATSA 4MVAA 4K36A 3RNDA 4QNEA 2C3ZA 4JYEA 2A85A 5HR6A 4UTJA 4UMAA 2FPYA 3G0XA 4TU1A 5D03A 1P0NA 1FX6A 4LWWA 3C4UA 4JEQA 4UFHA 5IBXA 1EEPA 1RQEA 3N73A 3E0IA 1S5TA 4WY0F 3W75A 2PRMA 5F2LA 4UNKA 4FX7A 3UD6A 3S6DA 3W2NA 3NAVA 3MHFA 2DU2A 4UFJA 1LRNA 4GC4A 4AVFA 3TU9A 2NUWA 2OT1A 2Y89A 4NXSA 3SFKA 3S8HA 3LCLA 5TIMA 5HQEA 1ZAJA 4GUHA 3THAA 1TRIA 4PL1A 5F1VA 4WJEA 2FFCA 3KHJA 4HPJA 1MEHA 2WNNA 5AFDA 3NNTA 4AWTA 2DZXA 2CLIA 3SIZA 3C2OA 2PCQA 3QM3A 4N4QA 3FOKA 3SSJA 4AB4A 3MBDA 4UTUA 3O15A 1LRQA 1FCUA 5MHBA 3TMLA 3W86A 2H6RA 5EY5A 2ISSA 2QAPA 2YW3A 2R8WA 4ONVA 4BI5A 3N9SA 2JGYA 1O95A 5DY3A 3FJ6A 3WJYA 1ADOA 3LHYA 3IGUA 1EB3A 4I7WA 4MJMA 1KM5A 3QJAA 4O57A 5K9XA 2RH9A 1I45A 3QSTA 5CSRA 2QCNA 8TIMA 2XN1A 3VFLA 2E77A 5HUOA 5LSMA 1KV8A 4E2BA 1H7PA 3M6YA 2DZUA 1KFKA 3CQ0A 1JUBA 2V82A 3QFEA 4CNPA 3GB6A 3W74A 5L9FA 4JTJA 4YCPA 5K9DA 3BG3A 2G96A 1ZCOA 5G1TA 1BKSA 4AWUA 1GVQA 1W37A 5AYZA 3DH7A 4LUIA 5EKYA 4AHPA 5LNUA 4O0ZA 4NNCA 4QNWA 1SW3A 3C2EA 4KWWA 4A29A 2V8ZA 4JYFA 5AOUA 2WSQA 2X1UA 4RXFA 4UUIA 3FA5A 1JUEA 5AC7A 2Y88A 1F6PA 1W56A 3I68A 5D2YA 2GVJA 3CT7A 3CLMA 3QRHA 1KFBA 3G1DA 3W1LA 3USBA 5EMUA 3E9AA 2J9XA 5D33A 3A5FA 3C3NA 3TW7A 1H7RA 3N34A 2ZFAA 2I14A 3PULA 1IGSA 3H54A 3GDTA 1YXYA 3GYEA 4BR1A 1W0MA 1JVNA 4HNVA 1IXPA 2BX7A 1TTIA 1YPFA 3M44A 3L5AA 4DO5A 3TXVA 3BGJA 4HNTA 3W2LA 4JD4A 1V7YA 4ZMGA 3BARA 3HGSA 3QMSA 4QSHA 1HL2A 2V2CA 1OVDA 2VEMA 1AG1O 1RZMA 2ZRWA 3FKKA 4XWUA 2X1TA 2WNZA 4JTTA 1KBJA 4FEZA 2JK2A 3N2XA 1OK6A 5EYWA 1C29A 3TDFA 3HO8A 3STCA 3W87A 2A4AA 3P8IA 3ZWTA 4ORIA 3N14A 1OABA 2V9DA 4JDYA 4WY0B 2YFOA 3TQVA 4A3UA 2XN2A 2I1OA 4UCGA 2WKJA 3IIXA 1KM4A 2QF7A 3ANYA 3C2RA 3WK3A 3R12A 4LUJA 3NOEA 2A5HA 3C56A 2QCDB 4DO4A 6ALDA 4IMCA 4FXRA 4ZZ9A 3M7WA 4ADSA 4ML9A 3L67A 4JIPA 3W84A 3CM4A 1ZENA 1OX5A 4UTMA 3SY5A 4PCFA 4DPPA 1PHQA 1HFBA 4ZQMA 4UFMA 4E38A 2ZYFA 5SWUA 1LYXA 3HG3A 1FWWA 3PUOA 2YFNA 1SZNA 3C61A 1ML1A 4ZQNA 4O19A 1W5QA 1KM6A 1VJIA 2Z2UA 5G1YA 4LVAA 3SW6A 1YXDA 1W5NA 1W5MA 3JRKA 2Q8LA 1GWJA 2YXGA 1L6YA 1I2OA 3TXZA 1K3UA 3NQMA 4QM1A 3DAQA 5G4WA 1H5YA 2ALDA 2NV2A 3TCEA 4UMCA 4AAJA 1GJPA 1G67A 3WJWA 3ABQA 3PS7A 2O7SA 3GXNA 4UTWA 1JQXA 1ICPA 4RXGA 1ZFJA 3T55A 5LNRA 1MEWA 2VC6A 3WK2A 1JCYA 3B8DA 3FLUA 2QDHA 4LS2A 2E1DA 1QCWA 5CPLA 4O4VA 1OYAA 3LTPA 4M6VA 2NUYA 1LBLA 2EHHA 2CZFA 4JR5A 1TSIA 4K7VA 5LGXA 1KW1A 2OMAA 1XUUA 3NQ6A 1C8VA 3DKLA 4EVZA 4GRSA 4PA8A 1RVGA 2DP3A 3TE9A 3EWYA 4IMEA 1GT8A 5DELA 4MJZA 3IVSA 4Q4KA 4MLRA 2V81A 3STEA 3LCWA 3QQ1A 1TPEA 5E1QA 3NQFA 5G2HA 4I7UA 4NQ1A 4I7VA 4N6FA 4Y9AA 1RV8A 4OT7A 3OBKA 1DKWA 3IVUA 3KFTA 1LRTA 3GDRA 1QDSA 2R91A 1SO5A 1GG0A 4BF9A 4M6QA 1GVSA 4LY8A 4N2YA 4ORMA 4LC6A 1VQTA 4J9JA 1JCXA 4CCDA 3MI6A 3MYPA 1KM3A 3NQ7A 1WDWA 3KRSA 2IQTA 1XBXA 3DU0A 1VCVA 3GR7A 2TYSA 3NZ1A 2ZTKA 1Q6LA 3P82A 4DPQA 3ABOA 4ICNA 4N4PA 3QF0A 1JCJA 1I2NA 5IM51 3A21A 3BO9A 3G1XA 3KVJA 3GVGA 4NNAA 2GUUA 5AHIA 3UWZA 3W7DA 5KSWA 3B0VC 3G8RA 1TPDA 4NVTA 1IIGA 3G24A 4NUWA 4TIMA 1TRDA 3EX2A 3G18A 3EXTA 2YZRA 3NQ8A 3FJLA 1FWTA 3NXFA 3L0KA 5AYXA 4MY1A 1R2SA 3EWZA 1O60A 4DBEA 1BWLA 3BW2A 3W23A 1W3NA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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