4EVZ | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	258
structure length	254
Chain Sequence	MLAKRIIPCLDVKDGRVVKGNLRDAGDPVELAARYDEEGADELVFLDITASHEGRETMLEVVERTAEQVFIPLTVGGGIRSVEDASRLLRAGADKVSINTAAVKNPELITEAAEEFGSQAVVVAIDAKRVGGGWEVFTHGGRKPTGLDAVEWARKVVELGAGEILLTSMDRDGTKAGYDLELTRAVSEAVSVPVIASGGAGELEHFAEVFELEGADAALAASIFHFGEITIREVKAYLRERGIEVRLEHHHHHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
publication title	Evidence for the existence of elaborate enzyme complexes in the Paleoarchean era. pubmed doi rcsb
molecule keywords	HisF-LUCA
total genus	79
structure length	254
sequence length	258
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-26

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4evzA00

4FNUA 1FDYA 3G24A 2CLHA 4JTFA 4NNBA 3W3OA 3QEZA 4CQ8A 4Z0JA 3IGXA 5DCDA 3FKRA 3CWNA 3ANYA 1SO4A 5F2IA 5AN7A 3USBA 4K6AA 3V1PA 2ZZ2A 4QSHA 1H7OA 1Z44A 3DFQA 1QDSA 4AHPA 3UY8A 2WNQA 1TRDA 3GR7A 2QAPA 3EB2A 4EWND 4FHAA 3WJYA 1VRDA 1YDOA 3EEGA 4NJKA 1UCWA 4GRSA 4HNUA 4LRTA 3IRDA 3M0ZA 2PURA 1M7OA 5DY3A 4KFOA 1VQTA 3PULA 3NL3A 3NM3A 4XTDA 3FOKA 1J2WA 4O14A 4WXZA 4YWIA 4LUIA 4FNSA 1FXPA 3GKAA 2DP3A 2GQAA 2Z0IA 3CWOX 5HINA 4O52A 4X9SA 5F2LA 3P81A 3MW7A 4NT0A 4IPJA 1H63A 4ML9A 4O13A 4QNWA 5D04C 1QNVA 2O7QA 3W07A 4UR7A 4Y8FA 1FDZA 3F03K 4NZJA 2I1OA 4QIUA 4GUFA 3G22A 3L68A 3W1LA 4WUIA 5C6MA 2RKXA 2ZBTA 4K8HA 2TSYA 1W3TA 4LS1A 3GKFA 3P67A 3LHTA 5LZLA 4TMCA 3BGGA 4G1KA 3LHWA 4U4MA 2FQIA 2V2DA 3UXDA 5AHFA 3N19B 5G1TA 3LTPA 4ORMA 3M6YA 4RX0A 5D32A 3RMJA 1BWKA 2QUTA 4OV9A 3THAA 4MZYA 3MI6A 3W76A 4RLIA 2QJIA 1LROA 4X3ZA 4K39A 2RDWA 4JTTA 3FA5A 2YXGA 3SGZA 3OVPA 2Y88A 4UTIA 3GYEA 4JGDA 5LNWA 2F7FA 3LHUA 3I7SA 2A2IA 4LVDA 3B06A 4UMCA 1G6CA 4E0CA 1I2PA 1N55A 3N34A 2YZRA 4WOQA 4O17A 2I14A 4ALDA 1OYBA 5AC8A 2A1YA 4LW7A 2CLIA 4HKPA 4MJMA 3TKFA 3FLUA 3LCWA 3QYQA 3HG2A 3QMSA 4PC8A 3L0GA 4KWVA 1FX6A 4K37A 1XI3A 1TO3A 3G1HA 3S6DA 1K7FA 2QDHA 4WY0F 1BKSA 5J5RA 2NV1A 3O07A 3EWXA 4S2BA 3HB9A 5HNRA 3QH2A 3UNDA 3PBWA 3W88A 5IM51 3M47A 3IIXA 1TQXA 4YCPA 4QAIA 2OT0A 5HR7A 1V7YA 1OFPA 3NGJA 3QPZA 4GBUA 3W75A 3FKKA 2EAWA 3OVRA 4Z08A 3FFSA 2YW4A 4OGZA 3NNTA 4HNVA 1AW1A 1QWGA 1KBJA 2DZXA 3DFSA 1TPEA 3GXPA 3QW4B 4CCCA 1AG1O 1JUKA 2OCZA 3PR2A 1W5OA 3NQDA 4TIMA 4LT9A 5CPNA 1TV8A 3C2OA 4CQAA 2VC6A 3LCHA 2VKZG 1R2TA 3PS7A 3D0CA 3HGRA 4DBEA 5SWUA 4LS2A 2V2CA 5D2XA 1OHLA 4CNPA 2ZA3A 2RHGA 2NUXA 5CZ0A 1H61A 1KFEA 4UFHA 5HR6A 3ELFA 1S5WA 1SSGA 1GOXA 4NVTA 1WOAA 4JTIA 4R53A 3TFXA 5TBOA 5H2ZA 5EKYA 4N4QA 2QAFA 4MZ1A 4BWLA 3G0SA 3CIXA 3L0NA 3LXBA 1F7BA 3S5ZA 4O57A 3W1XA 3DENA 4MJZA 5F1VA 4XWUA 5D03A 5HWNA 1KFKA 2PRMA 1L6SA 1LYXA 1DL3A 2A6LA 3QMRA 2CLLA 4UTKA 2NZLA 3W1PA 2Q3RA 1K7EA 5C2XA 1KM1A 1KM0A 3WFAA 3C52A 4C1LA 1RQBA 5KMYA 4UFIA 5KZEA 3EX1A 3DU0A 4MPQA 3LRLA 3NPVA 5D09A 2Y70A 3CM4A 3M44A 4QQ3A 1EP1A 2EKCA 3WJXA 2ZYFA 2B0MA 3UD6A 4AAJA 3DKLA 2R94A 3W2JA 4BR1A 4RXFA 1KFLA 3MYOA 4O1AA 4WQ6A 5D02A 2JBMA 1KFBA 3RLUA 4YCOA 1FWWA 1DHPA 3BPWA 5FESA 3BG9A 4ZZ9A 2TMDA 4LWWA 2J88A 3B04A 1TCDA 3NQAA 3DXIA 5FEPA 1PIIA 4Q33A 1GTHA 2ZA2A 2Z6IA 3HO8A 2WOQA 1TV7A 4DO5A 1GVOA 3LV6A 3HGJA 2YDAA 3LTYA 2CU0A 4HPJA 3GX9A 3A9IA 4TO8A 1IGSA 4ONVA 1E51A 1OFOA 2XN2A 3UZ5A 5C54A 3C2VA 2QCLA 3S1UA 4UFJA 4JTLA 1P4CA 3PUEA 3KX6A 3GIYA 3W2MA 1OF8A 3UQNA 4UXDA 2E1DA 4QNEA 1VLIA 3TW7A 1I2RA 1A5AA 3GAYA 4E2BA 3LERA 4UTMA 1K3UA 4JX5A 1G4PA 3SZ8A 1YDVA 2UV8G 4MVAA 1TSIA 5TIMA 3UYCA 3MBDA 1PVNA 4CLMA 2HS8A 3L5LA 4O15A 1KTNA 1RZMA 4RKAA 2DZPA 2QKFA 1SO5A 5IBXC 3BK0A 3K30A 1W8SA 4CNOA 5LNSA 3U6WA 3LXCA 1NF7A 4H4IA 4JICA 3Q94A 4U28A 1MEIA 1LOLA 3W9ZA 3W7PA 1K7XA 3EWBX 3P7YA 3M9YA 2VFHA 1WAUA 1TYGA 3BLIA 5D2TA 3G0XA 3LCLA 1SZNA 3LXAA 4EVZA 2JK2A 1PCKA 5FEZA 3O6YX 2WSQA 1TPH1 3A5VA 3Q58A 1UASA 1JCXA 2CZDA 4E2DA 4PA8A 3W23A 4UUIA 2ZRVA 5F2GA 1P0NA 1LBLA 3QJAA 4O4WA 1KM3A 2E5BA 1ONRA 4YL2A 1EWEA 3TX9A 3MP4A 5FF0A 2B7NA 1AMKA 4DELA 4I7VA 2R91A 3G1SA 3GNDA 1QPOA 4RZ5A 1JUEA 5C55A 2VFDA 3EXSA 1HO4A 2QCFA 1T96A 2F84A 4DF0A 1K8ZA 3ABOA 1OFQA 4A22A 4UFKA 1H5YA 1DJNA 2VFEA 3KXQA 1FY6A 1OABA 3W74A 3TFCA 3GDMA 4MKNA 3NPXA 4A21A 1QPNA 3TMQA 2NLIA 1Q6QA 2DZSA 1LDCA 1K02A 1VCFA 1QFEA 4H6KA 3CEPA 2X16A 3IVSA 1FWRA 1I8JA 1JRCA 1TJRA 3LOTA 5CSRA 4NX0A 2NXIA 3WJZA 3L9CA 2V0TA 3FEMA 4ADSA 3GK0A 4JTKA 2C16A 3DZ1A 3NQGA 2X1UA 1DQXA 2G95A 4W9TA 5D37A 3W2UA 2X2GA 1PCWA 3C2EA 2Z2UA 4KFNA 3ATYA 4Y9AA 4ZMGA 3W7KA 4WOZA 2ZRXA 4P2VA 1RR2A 5CZSA 1SZEA 1HFBA 1GYLA 2ZFAA 4J9JA 1AL7A 4UFLA 5CPOA 5EA9A 1ZAHA 1KA9F 1RQEA 4TMBA 4Z1AA 5D2VA 3W83A 3DFNA 1WDWA 3FYPA 4HSOA 3G1XA 4AMAA 3STCA 1AL8A 4B5NA 1HUVA 4ZQPA 5DCBA 4D2JA 4EOUA 3TE9A 2C19A 5HUOA 1PHWA 3R13A 2QEZA 1VLWA 2E77A 3S5OA 3TCEA 4DPPA 3TSMA 3C56A 3TW6A 2V5BA 5G2HA 1ICPA 3C0JA 3NQFA 1FCVA 4C1KA 1N7KA 2WSRA 3MYPA 1SZGA 5K9DA 3W7DA 1AW5A 3F4NA 4X22A 2QJHA 3LCFA 3G3DA 4XUGA 1M6JA 3TQKA 4NJGA 4ZVJA 3LI1A 5K3VA 2V5LA 1O5XA 1SFJA 5BRBA 3PBUA 4FX7A 1TRIA 2HTMA 2J24A 5LHEA 5HWJA 2Y6ZA 2ZQ0A 2YYTA 3M5XA 1VZWA 2ZA1A 3PC0A 2CLMA 4UTLA 4R34A 1MO0A 1YTKA 3TJXA 1YTEA 3L5AA 2QCHA 3M5VA 2JKEA 4Y6GA 1IIGA 2QUUA 3EWUA 4JX6A 3EWZA 2JGYA 3TQ0A 4IXHA 1O94A 1SR9A 3MP3A 3OEXA 2XN0A 2YX0A 2Z6JA 3OIXA 4KKXA 3W72A 4A29A 3HIJA 4LV9A 4NUWA 1KLZA 4LV4A 4GE8A 4R7JA 3LBMA 4UCGA 3W7QA 2Y89A 2ISWA 5BOOA 1SSDA 4UC5A 4OU1A 3LDVA 2X30A 4N9EA 3U2OA 3M41A 1GVFA 2YYUA 4UNKA 3NL6A 3PUOA 3DH7A 4IMDA 5KZMA 2B7OA 1FCQA 5FF2A 3NDOA 4JR5A 4M6QA 1W0MA 3YPIA 3PVFA 3PG8A 1R46A 2Q3OA 2ZRWA 4O50A 1PS9A 2HS6A 5CGQA 1XUUA 1NSJA 3O05A 3M1ZA 4NXSA 1F5ZA 2ZRYA 2GPTA 3C4UA 3NR0A 1OVDA 3MJYA 2ZZ7A 1A5BA 4JY9A 2J6XA 2DORA 4I9AA 1OYCA 1LZOA 1B3OA 3DFTA 5F4WA 3LV5A 1XC4A 1VPXA 4WD0A 2PC4A 1R2RA 2OZ0A 3Q2DA 5AYYA 3STGA 1SQ7A 6TIMA 3IEBA 1YXDA 2C3ZA 3C2RA 1NVMA 3MI3A 5HQEA 3CPRA 1XBXA 3MBFA 2E6AA 4O0KA 1VYRA 1W37A 3UWQA 3G1DA 4IMFA 4JD4A 2ATSA 3JS3A 1YPFA 1EP3A 3LRKA 2H6RA 3O6CA 4LNYA 2VFGA 3DGRA 3ZFHA 1SZFA 1AW2A 1LRTA 3TU9A 2GUUA 3A22A 4K8EA 4WXYA 3GZ3A 3TR2A 4BF9A 2VEPA 5C5YA 4ADTA 1GWJA 1OF6A 4FF7A 2DZVA 3R5EA 1LBMA 3HQ1A 3NQCA 5LHFA 3RFAA 1TTQA 1WX0A 1TREA 1YXYA 1GPWA 1W5PA 1JJKA 1RVGA 5K9XA 3GNNA 2B4GA 1LM1A 4OWGA 5DLCA 3NYZA 3E02A 3P60A 1GVRA 1L2UA 2P0OA 3E0IA 3W1UA 4JIPA 3IVUA 4FB7A 1OFAA 4RZ4A 2ZZ5A 2X1TA 1G4EA 2H90A 4TR9A 3LLFA 2R8WA 4LC6A 4JNMA 3BG3A 4N02A 3TQVA 4ZL1A 5J5DA 4JN6A 2CFFA 3ZWSA 1GZGA 3NEVA 5E93A 2CZFA 4PH6A 3SY5A 4DO4A 3R2GA 2RDUA 1OX4A 4LVAA 5IBXA 2QCNA 1RD5A 3LHZA 5AHLA 1T8XA 3TDFA 2FIQA 2V8ZA 1VYPX 4MY1A 2CLOA 3B4UA 5LNUA 1LP6A 1G67A 1W56A 3L5MA 4QM1A 4RXGA 1O5KA 3NXFA 4XTIA 3SI9A 1OX4B 1ZNNA 3TMLA 5DXYA 4O10A 3W84A 1I2OA 4ZQNA 1ALDA 1QPQA 2NUWA 4GFSA 1P1XA 3GVGA 4JTUA 4DXVA 3W7JA 3W86A 2ATMA 1NEYA 3GDLA 5HWMA 1ZENA 3IGUA 1QR7A 3W1NA 3EX4A 1UJPA 3ABRA 3PB2A 4IX0A 4H3DA 3W7OA 3TJLA 4JTGA 1VYSX 3B0VC 4GWEA 3CIWA 4BI5A 5KTLA 1B4KA 2C14A 2Y7EA 4JIQA 2GVJA 3SECA 2WKJA 4QITA 4PODA 1L6YA 1ZALA 1GVSA 1VJIA 5EPDA 2ZRUA 3OG3A 3R89A 3QSTA 3TUUA 2C1HA 1YXCA 3T40A 2CLKA 3L67A 5D33A 2ZZ4A 4XBSA 1LORA 1QCWA 3BARA 1TTJA 1KM2A 2Y61A 2V2HA 3NQEA 3KRZA 1UUOA 5LKYA 3W1RA 2P1FA 1QAPA 1ZAIA 4HHPA 4FIQA 4HNNA 4AEOA 4AWTA 3BGJA 2H3DA 3LHYA 1OFRA 1XXXA 1VS1A 3QQ0A 2NWRA 4JTSA 3PSWA 4HSNA 3I6RA 4RZ6A 1YYAA 2XFWA 1KV8A 3GB6A 3O06A 4GXMA 1TPWA 1F2JA 5KINA 3T4CA 1UB3A 2V9DA 5L9FA 1LOSA 3VE9A 5K9CA 3SFKA 1T99A 1FWNA 1L9WA 4FEZA 2PRHA 3N2MA 3TXVA 2A6NA 4JYDA 1YTDA 3P8IA 1FWTA 4GUHA 4DEFA 1W5QA 4I7UA 3C61A 3NM1A 4MLRA 3UWUA 1G7VA 1PE1A 3QQ1A 3OBKA 1P0KA 5BMXA 2ISVA 3UY7A 3DHDA 2A85A 3CC1A 4GUJA 3SGUA 4O19A 3S0CA 5D2WA 2G5WA 3W7NA 3O8AA 3NQVA 3Q37A 1OK6A 1JCLA 1RQHA 3TH6A 1IIHA 2DZTA 2TYSA 3R12A 2VFFA 3BLFA 5E0KA 3OVQA 4S1FA 1Q6LA 2R14A 4O1BA 3QSRA 3HGOA 5FEWA 3EKLA 4R33A 4FNRA 1WV2A 4FX6M 5EY5A 1H51A 4O0ZA 1GEQA 1O60A 4IPIA 3RLVA 5GVJA 1TPFA 4MY9A 3LCGA 4RV8A 2AQWA 1F05A 3EXRA 4O11A 1PV8A 1EUNA 3R8RA 4JXCA 1JQXA 2B7QA 3NQ2A 3IGSA 5H91A 3LB0A 3IV3A 5KSWA 1ICSA 1CI1A 4LY8A 4M6VA 5EBUA 5F4SA 1F74A 4DF1A 4PCFA 3C8FA 2VENA 3W7EA 2CZEA 2DZUA 1GG0A 2ZZ6A 2QDGA 1UBSA 2QCDA 3EXTA 3N9SA 3NPWA 5ABTA 2RFGA 3G0UA 4IJBA 4AXKA 1W54A 4E38A 4OE7A 1OJXA 1G7UA 2GQ9A 3KVKA 3B03A 2A7PA 4JTEA 5D2YA 3E49A 1W5NA 1XCFA 1J5TA 4O53A 1M5WA 2Q8ZA 2G97A 1NF0A 3N3MA 3UZJA 1C9DA 1ME8A 3S5NA 1Y0EA 4M5PA 1SW0A 4Z1DA 3NG3A 3P8JA 4ZQCA 2QCDB 2V81A 5AC6A 4JYFA 3W1QA 1ZJIA 3WK0A 2DJXA 2CZ5A 3MP5A 2E6DA 4WY0A 1I2NA 1EPXA 2NXGA 4BFAA 3TROA 7TIMA 1ICQA 4IQLA 4MFDA 3BLEA 4CNNA 3FYOA 2NX9A 5FF4A 4NJJA 1DBTA 1C29A 1S3HA 3G1AA 5U4NA 5K4XA 1SO6A 1ZAJA 3TAKA 2P10A 4YMZA 4O54A 4AF0A 1JR1A 3W7LA 5AHMA 2GJNA 3W2LA 1J4EA 3BW3A 4WY0B 4DPQA 1WYIA 1GQNA 3RU6A 1MXSA 4LC8A 4JS3A 3RK8A 1L6WA 4EF9A 3PM6A 4MLJA 3G18A 4IMCA 3NL5A 3NQMA 5AYZA 2RDTA 3NQ6A 4FXSA 1QO2A 1DVJA 3P5YA 2AGKA 3L2IA 3HGSA 1KTBA 5CKSA 4ADUA 4ICNA 5LGXA 1YPIA 4AF0B 1XDMA 3ZS4A 4Y96A 4FX8A 3O1NA 3PY2A 3NA8A 1V5XA 2WQPA 1QOPA 2GVGA 3HG3A 3PG9A 3VNDA 5AHEA 1T0OA 5F4XA 1ZFJA 2OJPA 1DKWA 1G4SA 4NJHA 3GDKA 2EPHA 3O63A 4N6FA 1TPVA 2HSAA 4MYXA 1XBVA 1TPC1 3TAOA 3L21A 2C13A 4LVBA 2C18A 2QUVA 5DELA 3G3MA 4BI6A 1H50A 3WK1A 4OT7A 2A7RA 4PTNA 4JTJA 4YLWA 2ZZ1A 2GQ8A 1H7XA 3M5YA 1X7FA 1XM3A 4PL2A 3FJ6A 1WA3A 5KZDA 2BXVA 3GDTA 2NV2A 1M7PA 1D3GA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4EVZA

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Chord Diagram

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