2QCN | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Structures of the human orotidine-5'-monophosphate decarboxylase support a covalent mechanism and provide a framework for drug design. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Uridine 5'-monophosphate synthase
total genus	96
structure length	257
sequence length	257
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2007-06-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2qcnA00

3UWZA 1X1ZA 1W54A 2Q8ZA 2GOUA 2NUWA 5DCDA 5FI8A 3GDTA 1LRTA 2VFFA 3LBCA 3O6CA 2XN2A 3UY7A 3C2VA 5LNVA 5G5IA 1NFBA 4LNYA 5KSWA 2JKEA 4FNUA 4GUJA 3TFCA 5EPDA 5K3VA 2YR1A 3N73A 1HG3A 1H7XA 1K7FA 1FY6A 5I3JA 4YWIA 1DHPA 2OCZA 4MPQA 2YPIA 3W6YA 3MBFA 2P1FA 2GPTA 4HNTA 4RCXA 5TIMA 5EA9A 2DJLA 4IWWA 3HIJA 1TSIA 3R13A 2YYTA 3FYPA 5D33A 5BMWA 3KVJA 1M6JA 1KM0A 1VLIA 3GZ3A 4CNNA 4Q33A 3WJXA 2C0AA 2Q8LA 4RR4A 2NV1A 3N2XA 2Z6JA 4WXYA 2Y7EA 1AG1O 2Z1BA 4MYAA 3W7NA 3NQGA 1EWDA 3C3NA 1RQHA 3DZ1A 4N6EA 4O8RA 5C5YA 5G1YA 3G1FA 3EWUA 2V0TA 5A5WA 3PS7A 2AAMA 5DBTA 5LSMA 2F84A 5I3HA 3W7GA 3NQEA 5AHIA 5FEWA 3LDVA 4N9DA 3L21A 1TIMA 1WX0A 4NQ1A 3ZR4A 5K4XA 3S9YA 3QF0A 4XTIA 4NX0A 3LTPA 4IJBA 1LORA 5F4XA 3LHYA 3TU9A 2XFWA 4NJGA 5FF0A 3CLMA 5D2YA 1DBTA 5DLCA 3S42A 5G2HA 1EP1A 1QR7A 4JGDA 2QKFA 1VPXA 1H50A 3CM4A 3BW3A 4Y6GA 4M19A 3G1HA 3PB0A 3EX6A 2EKCA 3BW2A 3W7MA 3P84A 3LI1A 1PCKA 2Q3OA 3HOJA 4MZ1A 2FQIA 3CWNA 4E0CA 4QM1A 2H3BA 3IIZA 1HL2A 3S0CA 1KV8A 5BRBA 2EPHA 2X16A 4FNQA 3G3DA 3G22A 1X8FA 4JTKA 4XKYB 2V2CA 3W07A 2O7SA 3DENA 4Z1BA 2QJIA 2Y70A 3BK0A 1D3GA 1SUXA 3TSMA 3NM3A 3UWQA 3NQFA 5DY3A 2QJGA 5KMYA 4LWWA 1KW1A 4M7SA 2CLMA 1SFLA 4LVAA 3Q2DA 3S1UA 3W7DA 1Q6QA 4AHQA 1QPNA 3W83A 1Y0EA 2ISSA 3IGUA 1MXSA 5D38A 4HSNA 4HNUA 1H63A 5KTLA 5CPMA 2F7FA 4A29A 4UTJA 4QNWA 4UIOA 3FJLA 3VI2A 1KBIA 1GVRA 1H1ZA 5TQLA 2A1YA 1MZHA 1JCMP 1B9BA 3EX1A 1AL7A 4S2BA 1OYCA 2OZ0A 3L66A 4Y8FA 4LVBA 2WSQA 4W9TA 3N9RA 1TQXA 4QJ1A 3DFTA 2HSAA 3GK0A 1XKYA 1W3TA 3DKLA 4XBKA 3R5EA 3TQVA 4NNBA 5FEXA 2VOMA 4O19A 1A50A 4FNTA 1OFOA 1KFCA 3O16A 4YL2A 3SI9A 5CPOA 3TXZA 1S5WA 1SW7A 1JCNA 2QF7A 3I7RA 3PB2A 1PE1A 4GE8A 1AK5A 2BTMA 1B4EA 1RVGA 2E1DA 1OX4B 4KFOA 1KFJA 1DVJA 4E2DA 4QISA 4LUIA 2ZZ7A 3EWWA 1L6SA 3UWUA 3W7RA 2FJKA 3NPXA 1GYNA 1O94A 2W0UA 1AW1A 1F6KA 2PRLA 1P1XA 1ZALA 1R47A 1EP2A 1R2RA 1AW2A 4FNSA 4I7VA 1NSJA 2Y7FA 4DPQA 1QO5A 2A6LA 1OG0A 4NJIA 4HPXA 1GEQA 1C29A 4DO4A 1KFEA 1WOAA 3TAOA 2YX0A 3U6WA 3PSWA 3TJLA 3W2NA 1L6WA 4UCGA 4QSHA 1I2OA 4BI5A 2B7NA 3C56A 4GC4A 3EX4A 1JRBA 3BLFA 3W75A 3W7KA 1W56A 2FDSA 1GQNA 1FDYA 3F03K 5FF4A 1RPXA 4EF9A 1XBYA 3W85A 1YDNA 3MWAA 3QPYA 3RMJA 1G69A 4GJ1A 4M6QA 5IBXC 3W70A 4JTLA 3B03A 1RQEA 3EWYA 2H3DA 5F2MA 3GXNA 3OEXA 4LRSA 1G7UA 3P60A 2CLKA 1FCQA 1XCFA 1BKSA 1OX6A 3MHFA 4JYFA 3LOTA 1ZCOA 2YFNA 1NF7A 4CCDA 2NX3A 3AJXA 1IXOA 1JJKA 4K39A 1P0KA 2VXNA 3AO0A 1OF8A 5CZSA 1UUMA 2EHHA 2ZRZA 1EUAA 2W6RA 4RLIA 2R14A 1J2WA 4R53A 3R2GA 3BW4A 5DXXA 3SFKA 3TROA 4FB7A 2RHGA 4GWEA 1Q6OA 2V8ZA 4GBUA 2JK2A 4PL2A 4ML9A 1ICQA 1ZAJA 5D2WA 3BG9A 1YTKA 4O14A 3M41A 2Y63A 1VCGA 1WYIA 3KVMA 2ZZ6A 3CQ0A 2TRSA 4MJMA 4GUIA 4NNCA 4BI6A 2VENA 3A9IA 4UFJA 1PIIA 4QQ3A 1SW0A 4ZQNA 5H2ZA 1X1OA 2JGYA 3W1TA 1ICSA 1WDWA 3M44A 4ORIA 1TPH1 4O13A 4JYDA 4WZHA 5CG7A 1W5MA 4JTHA 3MP4A 3C0JA 3KHJA 4UTMA 3DH7A 4JTJA 4N9BA 1LLWA 2NX1A 1WBHA 3W7CA 1G6CA 5BW6A 3ZS4A 4GFSA 1VH7A 3EB2A 2QDHA 3TC6A 3LB0A 1DKWA 1JCYA 1TCDA 8TIMA 1SZGA 4N02A 3W7PA 5HQEA 3P8JA 3SGUA 3Q58A 5SWUA 2QEZA 3LHVA 2Z2UA 2CZFA 1GG0A 1AMKA 1EEPA 3TMQA 1KLYA 5I3FA 5F2IA 3NQ2A 4PC8A 4R7JA 4AWTA 3PC0A 4N9EA 3NEVA 1GVSA 3LGEA 4NXKA 3PSVA 1QFEA 5D05A 3GB6A 3DHFA 3P80A 3E96A 2BWGA 4KKXA 3SGZA 1BTMA 1V5XA 3NQ8A 5DELA 2C14A 3NQAA 1EP3A 1KM3A 1G4PA 3SR7A 4EWND 1GPWA 4OE7A 1GVOA 2YGYA 1KBJA 2CWNA 3L5LA 1W37A 2RH9A 3C2FA 3L65A 3TQKA 5I3GA 1SPQA 3CC1A 1T0OA 3P81A 2XN1A 2Y89A 5D32A 3U2OA 3TCEA 4B5NA 2A4AA 3WK1A 4J9JA 1LM1A 5EBUA 4FXRA 4O10A 5K9CA 3LBMA 5DBUA 3VCRA 3SIZA 4ZVJA 3W87A 1F7BA 3A24A 3HB9A 4RV8A 4LS0A 3ATYA 3NL6A 2RDTA 3IVTA 2ZBTA 1T8XA 1KV5A 3PY2A 4Q4KA 4LC6A 4L4LA 2ZRUA 4AWSA 3GR7A 3TH6A 1CX9A 3JR2A 3N9SA 3MP3A 1ONRA 2I14A 3LTYA 2Q3RA 4H3DA 1QO2A 3DFOA 1A5SA 4JIQA 1NEYA 1XM3A 4NZFA 3NM1A 4OU1A 2NXIA 5CKSA 5K2ZA 2VELA 3QPZA 5AB3A 2YW3A 5AYXA 4Y90A 5C2XA 3QQ0A 2H90A 5U7SA 2ZA1A 2HS6A 1F73A 1JQVA 1SO4A 4O15A 3M6YA 4DELA 3A23A 1FWTA 3NA8A 4OHQA 2ZZ4A 3EX3A 1C9DA 2X2GA 3RLVA 1M5WA 4JTEA 4QIUA 1H7RA 3IEBA 4O1CA 5D2TA 3F1QA 3RNDA 3JRKA 1N55A 3QQ1A 2Z6IA 1NAL1 2VFEA 1VYPX 3UQNA 5K7JA 1TREA 3TMLA 2VFHA 4LS2A 2CU0A 4XTDA 4N4PA 2ZZ2A 5C6MA 1KFBA 2BSLA 1OYAA 2LLEA 2YYUA 6ALDA 2AQWA 2B7QA 1OABA 3FFSA 4RKAA 2E5CA 4AH7A 3FLUA 1H7NA 1ME7A 4WOQA 3GNNA 1XUUA 1OJXA 1FWWA 3EKLA 4Y96A 5CZJA 3CEUA 4DF0A 4UMBA 3E9AA 4HNVA 2V2HA 3HG3A 3LCXA 3L2IA 3W1LA 1XC4A 4HNNA 1LYXA 4MKNA 4H6KA 3LXAA 2C18A 5G4WA 4Z0SA 2E6YA 3NNTA 3C8FA 1Z42A 2YFOA 2VEMA 3PG8A 3LX9A 1Z41A 3T4CA 4FHAA 3W3OA 2NLIA 1SZEA 3IIXA 4O18A 1O4UA 3KRSA 3BG3A 3KAOA 2V5LA 2OT1A 2FIQA 3FEMA 3W71A 2B4GA 1FCVA 1MO0A 3HO8A 3ABRA 1KM5A 3W1XA 4XUGA 2R94A 2DZSA 3QEZA 3PVFA 1G4TA 2GQ9A 2X1RA 4IMEA 2GVJA 3STFA 3W7HA 4H4IA 4P61A 3C2OA 4LC8A 2P10A 4FO4A 1S5TA 4MUZA 3GR8A 3PG9A 4OWGA 4JTTA 5AYYA 3E02A 4BWLA 3O6DA 3C52A 3QRHA 1XBZA 3KXQA 1H60A 1G67A 3P8IA 3WJWA 1OFRA 3TR2A 3MJYA 5D02A 3ATZA 1VYRA 3UWYA 3TX9A 5LHFA 2TSYA 3TQ0A 5HWMA 2ISWA 1UUOA 3PAJA 3W7QA 1TTJA 5HNRA 5L6UA 3FS2A 5D2VA 3N2MA 1DQWA 2ZYFA 1QPQA 3MHUA 1U83A 5K9DA 3UY8A 5CGQA 4JXCA 4UR7A 3WK3A 4JDYA 3B4UA 3P7YA 1UBSA 3TXVA 3W7EA 1THFD 3G0UA 3W1MA 1YTEA 2Y61A 2ZZ1A 3MMTA 3HMJG 3G8EA 3RU6A 3DBPA 1S5VA 1LOLA 2QCFA 3S5NA 4K8EA 3UZJA 1EB3A 1IIGA 4M7TA 4ZZ9A 1LP6A 3IGSA 4AAJA 1DL3A 1TPDA 1GG1A 5AC8A 4TR9A 3NDOA 1J4EA 2YDAA 4YCOA 3S6DA 5HUOA 5D2XA 2B7PA 4IXXA 4IGHA 4ADSA 3M5XA 4L4MA 2HMCA 1IXNA 2JKPA 3W1UA 1S3HA 2YW4A 1AL8A 2FPYA 4A22A 2C15A 2WO5A 3G24A 2PCQA 3WK2A 1B3OA 5G4EA 2FB3A 1YYAA 1PCWA 3LI0A 1KTNA 4CQ8A 5AHNA 1D9EA 2C16A 5BNKA 3KRZA 4DBEA 1RQBA 4AXKA 1LZOA 4ZQCA 3MUXA 4QITA 1GTHA 1YTDA 3GAKA 4TMCA 5D37A 4PTNA 4HHPA 1KTCA 1T96A 2QCLA 4I7WA 4RJEA 3BV4A 3M1ZA 2QCDB 3CB8A 3DU0A 4A21A 2GQAA 3P67A 3IV3A 3EXTA 4JX6A 1QCWA 4MFDA 7TIMA 4UNKA 4WY0A 2BZNA 3LCFA 4O0ZA 2WJZA 1CW2A 2QCNA 3IIOA 1RV8A 3INPA 5KINA 2TPSA 1I45A 3NR0A 4MY9A 5LGXA 5AOUA 2OMAA 5LNRA 2CLIA 1LRQA 1WQ5A 1ZJIA 3TUUA 1I2RA 1ZFJA 4UTUA 4AHOA 1F05A 4X2RA 3L68A 4EF8A 4IMFA 4WQ6A 4IPIA 2J9XA 2QCCA 5E1QA 3NPUA 1H1YA 5HMSA 1HFBA 4WUIA 3G0XA 3IIVA 4A2RA 1GTEA 1G4EA 4BR1A 1F2JA 1GVQA 1L6YA 4O17A 4ONVA 2WSYA 1AW5A 1H61A 4G1KA 4O4WA 4ZQPA 1OFPA 1QOQA 1Q45A 3ABOA 4JS3A 1Z44A 3A21A 5AHMA 1MEIA 3SECA 1U5JA 1TRIA 2AGKA 2UV8G 3UYCA 5EYWA 2VFDA 1I4NA 1KFKA 1VR6A 3MW7A 3QM3A 4NUWA 2V81A 4WD0A 3TA6A 2EF9A 4UTKA 3QMRA 4RK8A 2QCGA 3G1SA 2NWSA 1RZMA 4POCA 3BG5A 2BX7A 2JGQA 5KZDA 2FTPA 3PR2A 3BO9A 4DO5A 1O95A 2A0NA 5LZLA 2FPVA 3BARA 3DGRA 1TO3A 5HUPA 1K8XA 3TV8A 5KZEA 1GJPA 3HPXA 4NJHA 4DQWA 1TPFA 1PHWA 2TMDA 2PC4A 3NG3A 4A2SA 4O54A 3STCA 2QDGA 3I7QA 3W88A 3M47A 3W1AA 4MZYA 3QFEA 5L9FA 2NUYA 5HR6A 4TU1A 1TTIA 4K36A 1W3NA 4AMAA 5E0KA 3EWXA 4E2BA 2C13A 2V30A 3EX2A 4IX2A 1VJIA 3UWVA 1PS9A 4DF2A 2ZRVA 1GOXA 3ANYA 2DP3A 2NV2A 1I2PA 5F1VA 1OK4A 3CIXA 4U4MA 3EXSA 3P74A 5I3IA 2V2DA 4O0KA 4HN4A 1SZNA 3I7SA 4U28A 1TJRA 3EWBX 2RDWA 4MZ8A 1SU5A 3PUOA 3HPZA 1LRNA 5E93A 2C1HA 3GDRA 3W86A 3PBYA 2NX9A 4WJEA 2DZWA 1N7KA 1F76A 3TK7A 3LXCA 3DAQA 4OQVA 1YLVA 1F6PA 2E5BA 3S5OA 2VFGA 2NXGA 3FYOA 3HJZA 1D3HA 5DN1A 2FPTA 5U4NA 3HGSA 1HUVA 1LBFA 1JUBA 1FXQA 3EWZA 3EXRA 2QCMA 3TFXA 1J5TA 5KITA 3UNDA 5LNWA 2WNQA 1HO4A 3B0VC 3DFNA 1DQXA 5FEZA 4UMCA 2Z0IA 3YPIA 3E49A 3T44A 2ATMA 4S2CA 3LXBA 3RFAA 4IPJA 1FUYA 3CT7A 3QZEA 1A5BA 2FLIA 3RF9A 1OX5A 3STGA 3R12A 4LVDA 3T55A 1I2QA 1ME9A 2GQ8A 4MY1A 2NZLA 4XWUA 3FKKA 1OVDA 3OHIA 1ZY9A 4M6PA 1FWNA 2CZEA 3VFLA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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