2DGAA

Crystal structure of hexameric beta-glucosidase in wheat
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Molecular and Structural Characterization of Hexameric beta-D-Glucosidases in Wheat and Rye.
pubmed doi rcsb
source organism Triticum aestivum
total genus 182
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2006-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2dgaA00
3N12A 2EO7A 2OWCA 1B3XA 2DH2A 4BQ2A 1JI1A 2VZTA 3WMCA 1KBBA 2CESA 2PF0A 1WO2A 1WCGA 3OLEA 3RDKA 1HJVA 3TTOA 3AICA 3GDBA 1WPCA 4YHEA 1UA3A 3FN9A 1BVNP 4PMYA 2J7GA 4IPNB 1F4AA 1H1NA 4J7RA 5FD0A 2OSYA 3OG2A 4HA1A 2OYKA 2YL9A 3VD4A 1FP9A 1UQYA 2J8GA 3W27A 3A3HA 2XIIA 2GK1A 1HJUA 4LYPA 4MNKA 4HMCA 4HZ8A 3MS8A 1HP4A 1MQPA 2WMGA 4AXNA 2FH6A 1TE1A 4P7LA 4ZE5A 5IDIA 4OOUA 5A6BA 1GW1A 3IAQA 4HOXA 2D23A 3GM8A 3ZJ8A 4MDOA 1W1YA 3VIIA 1C8QA 1MW3A 5M3WA 3WFZA 2E8YA 3W82A 1V0NA 1H11A 1CXKA 3NIYA 2E0PA 1QI0A 1JXKA 1HIZA 3WF0A 4E8CA 3AIEA 4CD8A 1E70M 1V3MA 3BAWA 3CZKA 3MV11 1L0PA 3QOMA 1LL7A 3WH5A 2YA1A 4H2CA 3NJ3A 2CKSA 4GO9A 4P7QA 1BYBA 3T2QA 1VEOA 3D5HA 3WQWA 1XYZA 3IK2A 2BY1A 1Q6CA 1B3YA 1JDDA 2JE8A 1WB0A 1XGZA 2ZXDA 3GXDA 3AMKA 3WH7A 2AMGA 3MMWA 2WVUA 4JHZA 4D71A 4EE9A 3AIRA 3ZIZA 4GZJA 1CLVA 4IPLA 1B2YA 2YLAA 2EJ1A 1CDGA 3AIBA 5TD4A 1YQ2A 3AFBA 4BZYA 1UOKA 4QCFA 5M5DA 2CHOA 3MMUA 1RD6A 1BFNA 1XH1A 1TFVA 4A4AA 1HVQA 3RM8A 4PMOA 2G3IA 1B3ZA 3VMPA 4HOZA 7CGTA 1EIBA 3GXMA 3W6LA 2W61A 4GPNA 1PX8A 1KBKA 2J7HA 1KQZA 3MUZ1 3G6MA 4J27A 3WD1A 1X6NA 4P8XA 1XSIA 2DT3A 5FL0A 3W53A 1LG2A 5EB8A 4AIEA 1J12A 1LQ0A 3NSMA 3LMYA 1HKJA 2D3LA 3TTYA 3DYOA 4N0RA 1UWSA 3GNOA 4W8AA 2JIEA 2VZVA 2Z1KA 3OLDA 1XD1A 3POCA 1DWIM 3LPPA 2GJXA 3M46A 1KWGA 4QDMA 2DEPA 3ARXA 2X1IA 3O2LA 4XUYA 2YBUA 1SR0A 1JZ5A 2UY2A 5IXEA 1OM0A 1Q6GA 4TX8A 1MW2A 1C3FA 1WNOA 2FHFA 3PZMA 3BAYA 1OIFA 5A6LA 2D0HA 1WZLA 2Y8VA 1B1YA 5A6BD 2ZX7A 2RGMA 2OLHA 1Y7VA 4TUFA 2J74A 4ZE4A 1Q4NX 1W9PA 2J78A 1CTNA 1ECEA 2PWGA 3L2LA 4AZGA 1U2YA 5CQ1A 1KCLA 4AD2A 2VVSA 1WKYA 1Q6FA 3VM5A 3VILA 5A6MA 3CHEA 1WP6A 2VZUA 4AD1A 1JF5A 4DM1A 2JIWA 4B9ZA 4RE4A 1GZJA 2ZWZA 2XFRA 1CGTA 2CKRA 2WCSA 1MQQA 4AD5A 3GBDA 1TR1A 3CMGA 3SCVA 1HJSA 2W62A 2WVSA 4J3TA 4M1RA 4KMQA 2VNCA 5C71A 1E9LA 1HF6A 1CZ1A 3CMJA 4AZ5A 1E72M 3W26A 3ZR5A 1PAMA 1JI2A 4OJYA 1TVPA 2D24A 3PZQA 4Z2IA 3CZJA 1M53A 1LWHA 3OB8A 2J25A 4AD4A 3T0BA 3WDJA 2BY3A 2ZXBA 2V3EA 2E4TA 4UOQA 1PEZA 5KEZA 1E0VA 1MVYA 1O6IA 3EDKA 5IFPA 2C0HA 2WMKA 2WMIB 4H7VA 4NSBA 5BRQA 1JGIA 1MFUA 2J62A 4BCEA 1LF1A 3IANA 3UETA 1ISVA 2GDUA 3VGGA 1QI2A 1UD6A 3SCRA 3ZO9A 4PRWA 4PMVA 1E0WA 1CGWA 2VRKA 4HU0A 3WQ4A 3CHFA 4D1IA 1W2PA 2ZOXA 3EDFA 1GHRA 2CITA 1EQCA 2WSPA 4U5KA 1A47A 5E9AA 1HKKA 4YPJA 4PMQA 1CNVA 3VGDA 4RE2A 1HKMA 2EQDA 5AC5A 1B90A 1E5NA 3B9AA 5E0FA 3WUGA 3VTRA 4DWSB 4UQ9A 4PMUA 4D6EA 1ESWA 2DT0A 1VF8A 1E1EA 3WENA 2QPUA 4QCEA 4WLCA 2JF6A 3UCQA 1E6RA 3MANA 1BF2A 1RP8A 4HA4A 4A3YA 4CKQA 2EPOA 1N82A 1JXJA 3WF1A 3VGEA 4MJ2A 2WBKA 5CXPA 4FMVA 3WN6A 3VIHA 1NARA 2Y2WA 2A3CA 4DWSC 3I3EA 1E6SM 2VVNA 1FFRA 4LX4A 1JL8A 3CO4A 1BG9A 3W28A 5ABHA 3QHMA 3RM9A 4AZHA 3HMCA 1JZ7A 4Z2GA 1G1YA 1E4NA 5GPRA 3CUFA 3PZIA 4JHOA 3DYMA 1C93A 1DWJM 3AS0A 4MJ4A 3HN3A 1IZJA 1M7XA 1UD5A 2E9LA 4Q7NA 4UQCA 1H5VA 3FAXA 1ZS2A 4P8WA 4AEFA 2CYGA 1TVNA 2E40A 3PHAA 4KGJA 4XB3A 5A8NA 1D3CA 4W93A 2DT1A 4ATLA 3F5LA 4KRTA 2A3EA 1PJ9A 3AROA 4UOJA 2FH8A 1UKTA 2WMIA 1J18A 4EANA 4D6HA 1B9ZA 1UUQA 1QI5A 2QV4A 1KWKA 3THCA 1H09A 3VD3A 1BGGA 1ITCA 5IFTA 1QW9A 2J7CA 4P8VA 3AIWA 2V5CA 3MKKA 5BXRA 4FK9A 3VDAA 4HU8A 4UNIA 4MAVA 1E4IA 1NWTA 5E6ZA 1ZJBA 1H41A 1UR8A 1FOBA 1LJYA 4H04A 4D6DA 3QHNA 1HVXA 4MTVA 1RP9A 2PWFA 1XH0A 3OLGA 1CXEA 3MO4A 3VO0A 4DWSA 1AVAA 3WSUA 2CIPA 2CBVA 3HU7A 2VX6A 2YA0A 3PN8A 1ZB5A 4W7VA 1H49A 1JYNA 1V0KA 3ALFA 1J0IA 2G3NA 3PZVA 1DP0A 1UKPA 1C8XA 1TG7A 1HJWA 1E4MM 1VJZA 5I78A 3FHQA 4U2YA 4B16A 1H3GA 2Y24A 4GI9A 1US2A 2PC8A 4CN4A 2NSXA 1FFQA 1QNRA 2ZIDA 4W5ZA 1JYXA 5E09A 4BQ4A 4EAMA 2WM0A 5DEZA 2PWDA 5DFAA 3SUSA 4J3VA 1W32A 2J77A 3AMCA 4UR9A 1V3HA 2XFFA 1DWAM 4L4OA 4AISA 4C7FA 2G4FA 3VGHA 1EA9C 3CZEA 4P7OA 4ZFMA 3WDIA 4DUWA 1I1WA 5A8OA 3SCNA 1K9DA 5A1AA 2VI0A 1VBUA 4FLOA 3UERA 2ZXQA 3LPFA 2EPKX 2GK1B 1C91A 4AZIA 4CD4A 1ZBKA 2A3HA 1UKSA 4TVCA 4UFMA 3UR8A 4N42A 4CD7A 1W3KA 1PIFA 2CBUA 1TA3B 2PI6A 3ZQ9A 3POHA 3N11A 3K4AA 4Z2JA 3ARWA 3AS3A 5M17A 4YHGA 4UCFA 5LA0A 5CLWA 2VR4A 3DHPA 1W9BM 2VCAA 2V38A 2YDSA 3BSGA 1A3HA 2G3MA 4AZCA 3WF3A 5CZKA 5BYWA 5EMYA 1X6LA 5FL1A 2E3ZA 3ARPA 3PZTA 4CCCA 2QLYA 6CGTA 1EH9A 3EMZA 4FLSA 3BAIA 3VMNA 1GOIA 2ZX9A 4MPKA 4HA3A 2X2YA 2J7BA 3CH9A 3GH7A 2E9MA 3N15A 3FHAA 2XTKA 3KL0A 2EXOA 3AQUA 1EOKA 2YLLA 4FF5A 4UZUA 3AYSA 1HL8A 3CTTA 7A3HA 1VFMA 2W91A 4DWSD 2CBIA 2XM2A 3AOFA 2ZUSA 5IHRA 4MDPA 1E40A 4U3AA 1TUXA 3VM7A 4F9DA 1BQCA 2XSAA 3WD4A 3KEHA 3AYRA 5GNXA 2F8QA 1JAEA 4PTVA 4W8BA 1OT1A 4E4PA 1UHVA 3ARUA 4JCLA 4UFKA 3F4VA 4J28A 5CGTA 3THDA 5LYRA 1HN1A 2G8ZA 4M81A 3WBEA 1JYWA 3TOPA 4TVUA 5CPTA 5BWFA 1GOMA 4M29A 1KCKA 3MSGA 1W1VA 2WB5A 4JFWA 3ZT7A 1AQMA 1UA7A 3U5UA 1TA3A 1NH6A 2GJXB 1QNOA 1XCXA 3VNZA 2DSUA 1MFVA 2WK2A 1WDSA 5JIWA 2G41A 4E8DA 2D1ZA 2ZE0A 2FHBA 3KZSA 2VC9A 1GOWA 1ZBVA 2WCGA 3VPLA 4EKJA 3T2OA 2OSXA 2BNJA 3BXWA 4OBRA 3M07A 4AY1A 1W3HA 1QBAA 1EQPA 4PN2A 2CCRA 2O92A 3UG3A 4W85A 1PIGA 2YDQA 3E1F1 2D22A 2VUYA 4W5UA 4DM2A 3I3DA 2XVLA 5HPCA 1W1PA 1QOXA 2F61A 2ZUUA 3BC9A 3L4YA 4D1JA 1E3ZA 5CJ5A 3BAXA 3PTKA 1UR4A 4BA0A 4ATDA 2WC4A 3EMQA 1FHDA 3K8KA 3WUEA 1EOMA 4PCTA 1M03A 2VR5A 3SUWA 3WMBA 1E6PA 2VURA 1JD7A 1FA2A 2O9PA 1QBBA 1GORA 2VX4A 3BLPX 2BXYA 4HPGA 2JEPA 5JBEA 4HMEA 4UTFA 1TMQA 3EYPA 2DT2A 4X0VA 3VX0A 1LL6A 2V3FA 3VDBA 3GZAA 4MB5A 4D72A 3ZSSA 5A6AA 4DUXA 4P7RA 1PBGA 2WHMA 4OBSA 4MNLA 5JBFA 3SCTA 4R27A 1UWTA 1G9HA 4ATWA 1QW8A 4R5EA 5GQBA 5BROA 4PTWA 1J0YA 1R7OA 3AMLA 1E4LA 3ZJ6A 3VKKA 1WDPA 4B15A 1W3JA 4CCEA 4JL1A 1V6WA 1O7AA 3W29A 1NOWA 3WF2A 4IM4A 1B31A 1BAGA 4AD3A 3WDRA 1OINA 1WZAA 5A6SA 1C92A 3AMDA 3VIPA 1UWIA 4CVUA 4XZBA 3K46A 4Z2KA 3UESA 4GZIA 3O6AA 4OIFA 2EBNA 2VZSA 3G6LA 2WZHA 5FCZA 5KZ6A 2BV9A 3JUGA 4Z2LA 2D0FA 1M04A 3CUHA 5ECUA 1V03A 3AZSA 2B31A 1PZ2A 4PBGA 6TAAA 1WE5A 4BF7A 4QLJA 3U5YA 1ZU8A 3MMDA 1KR1A 1EDGA 4D6JA 4PSPA 2A3AA 3OA5A 4RL3A 2YL8A 3SCOA 3MU7A 1BYCA 3ZMRA 2PB1A 3BCDA 2YKKA 3L2MA 1GCYA 1XH2A 4FLQA 4TOQA 1VB9A 3VD5A 4KWUA 1OB0A 3F5KA 2F2HA 2GJPA 2J47A 1OGBA 1I75A 1SYTA 4PMDA 2FGLA 3BMWA 4ML4A 1JNDA 2WWDA 5DT7A 2YDRA 4AEEA 3BAJA 3WUFA 3WD0A 2GSJA 2X05A 3U7VA 3WEMA 1K9TA 2YOCA 5FIPA 2OWWA 1FH8A 2AAAA 2XVPA 3WEZA 5A8MA 4TX6A 3CIVA 2FDMA 3VIGA 4UQDA 1XCWA 4JFSA 1DEDA 2WC3A 5HBFA 2WHKA 2XHYA 3K8LA 1JIBA 4NF7A 4WKAA 4LXFA 4BS0A 2JALA 3T0DA 1QHOA 3W81A 1KGWA 3K8MA 1PX3A 1V6UA 1H0IA 3MUAA 1KB3A 4MAZA 2WMJA 1B3WA 3WD2A 5BXPA 3AISA 3ARSA 3GH5A 3L4ZA 1ZJAA 5A69A 3BAKA 5D9PA 1EHAA 4M56A 4AWEA 3L4TA 2HVMA 3RPMA 5A6KA 1Q6EA 1UR0A 3WY1A 5DO8A 1IV8A 1XYFA 4TXEA 2EPNA 1US3A 1D7FA 3TA9A 3A6OA 1G01A 3T0AA 3GTNA 3CHDA 3RIKA 3N9KA 2VCBA 2ZUNA 3MSDA 3QHOA 1CGXA 4HTYA 3N13A 3CHCA 1V6VA 1V3IA 1R87A 5CPSA 3VD7A 1QHZA 5FOOA 3A4WA 3TONA 1CIUA 2ZUVA 2D3NA 1CENA 1R7AA 2WLYA 3EMCA 1UR1A 5BCAA 4AIOA 2DIJA 4OOZA 4AZBA 2J4GA 2VCCA 4MNJA 4CGTA 1V3KA 1V6YA 2WC7A 3GXFA 4OZOA 1VRXA 4JFUA 3WDQA 1PX4A 4L4PA 2CPUA 2DSWA 3W38A 2WHLA 3VUPA 3M7SA 1CXIA 3WNNA 1QHPA 2WNWA 4AYSA 3VMOA 2NT0A 1BHGA 4XZWA 2JFEX 4UFIA 4UOZA 1ZL1A 4U33A 3TTQA 1QVBA 1GPFA 3UG5A 3I3BA 2QMKA 2JF7A 3QGVA 3W25A 1UWRA 3ARTA 1XRVA 5ABGA 3SCWA 1JZ2A 3KL5A 1CGYA 1VFOA 2BY2A 4PEEA 3PZGA 2QMJA 3CZLA 2HISA 3II1A 3WL0A 1DHKA 2Y8KA 4QAWA 1GOOA 1I1XA 3RO8A 1NWSA 1MXDA 2EPMX 1UKOA 2X09A 3PZNA 1HL9A 2BVDA 3WH6A 1EHNA 3W4RA 4AZCB 1K9EA 1B30A 4JCMA 4PTXA 4P8UA 5D9OA 4XX6A 2ESCA 4H41A 3ZR6A 3VIFA 4UQAA 1MWOA 1E0XA 2WZIA 5BXSA 1L8NA 4PUEA 3U57A 3CUIA 1TZ7A 1K9FA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3N12 A;  2EO7 A;  2OWC A;  1B3X A;  2DH2 A;  4BQ2 A;  1JI1 A;  2VZT A;  3WMC A;  1KBB A;  2CES A;  2PF0 A;  1WO2 A;  1WCG A;  3OLE A;  3RDK A;  1HJV A;  3TTO A;  3AIC A;  3GDB A;  1WPC A;  4YHE A;  1UA3 A;  3FN9 A;  1BVN P;  4PMY A;  2J7G A;  4IPN B;  1F4A A;  1H1N A;  4J7R A;  5FD0 A;  2OSY A;  3OG2 A;  4HA1 A;  2OYK A;  2YL9 A;  3VD4 A;  1FP9 A;  1UQY A;  2J8G A;  3W27 A;  3A3H A;  2XII A;  2GK1 A;  1HJU A;  4LYP A;  4MNK A;  4HMC A;  4HZ8 A;  3MS8 A;  1HP4 A;  1MQP A;  2WMG A;  4AXN A;  2FH6 A;  1TE1 A;  4P7L A;  4ZE5 A;  5IDI A;  4OOU A;  5A6B A;  1GW1 A;  3IAQ A;  4HOX A;  2D23 A;  3GM8 A;  3ZJ8 A;  4MDO A;  1W1Y A;  3VII A;  1C8Q A;  1MW3 A;  5M3W A;  3WFZ A;  2E8Y A;  3W82 A;  1V0N A;  1H11 A;  1CXK A;  3NIY A;  2E0P A;  1QI0 A;  1JXK A;  1HIZ A;  3WF0 A;  4E8C A;  3AIE A;  4CD8 A;  1E70 M;  1V3M A;  3BAW A;  3CZK A;  3MV1 1;  1L0P A;  3QOM A;  1LL7 A;  3WH5 A;  2YA1 A;  4H2C A;  3NJ3 A;  2CKS A;  4GO9 A;  4P7Q A;  1BYB A;  3T2Q A;  1VEO A;  3D5H A;  3WQW A;  1XYZ A;  3IK2 A;  2BY1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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