2UWFA

Crystal structure of family 10 xylanase from bacillus halodurans
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
356
structure length
356
Chain Sequence
NQPFAWQVASLSERYQEQFDIGAAVEPYQLEGRQAQILKHHYNSLVAENAMKPVSLQPREGEWNWEGADKIVEFARKHNMELRFHTLVWHSQVPEWFFIDENGNRMVDETDPEKRKANKQLLLERMENHIKTVVERYKDDVTSWDVVNEVIDDDGGLRESEWYQITGTDYIKVAFETARKYGGEEAKLYINDYNTEVPSKRDDLYNLVKDLLEQGVPIDGVGHQSHIQIGWPSIEDTRASFEKFTSLGLDNQVTELDMSLYGWPPTGAYTSYDDIPEELFQAQADRYDQLFELYEELSATISSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNNGVGVDAPFVFDHNYRVKPAYWRIIDHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An Alkaline Active Xylanase: Insights Into Mechanisms of High Ph Catalytic Adaptation
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALKALINE ACTIVE ENDOXYLANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus halodurans
total genus 135
structure length 356
sequence length 356
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2007-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2uwfA00
4M56A 2EPKX 1DEDA 2W63A 1PBGA 4PCSA 5A6JA 4V27A 4TVCA 4UOQA 3B9DA 5DEZA 3N11A 3AFBA 4M1RA 1VAHA 4PMDA 2PI6A 3WD2A 4D1IA 1JDDA 4GO9A 5JBEA 5IDIA 3B9AA 3FY1A 3SCVA 2GK1A 3VVGA 4UFHA 5A8OA 3WIJA 3N9KA 2WYSA 2WCAA 3MMWA 3QOKA 3KL0A 1HT6A 1VJZA 4PSRA 4UQAA 2UWFA 3W6MA 4UOZA 5I78A 1E6QM 1JDAA 3AISA 2DSVA 4UQDA 5DFAA 4H04A 4TVDA 3EBVA 1EXPA 3IAQA 4D72A 2VR4A 2XWDA 4FF5A 1UQZA 3ARRA 1UD3A 1NWSA 3AHXA 4W8LA 5A6LA 1BG9A 2X05A 5A3HA 3LPPA 4DWSB 1NWUA 1SYTA 3MUZ1 4LYPA 4BQ5A 1Q6CA 5FD0A 3ZM8A 4H8UA 3VGEA 3WQVA 1BYAA 1VENA 4CVUA 4EE9A 1JD9A 1TR1A 1B30A 2WKGA 4UQBA 4CD6A 3A4XA 3W53A 2G3IA 6A3HA 2WZHA 3PZ9A 4QFUA 1A3HA 3VILA 2WC3A 2RGMA 1VRXA 4Z2HA 3KE0A 2D0GA 1AQMA 3WNMA 1UD5A 2DPEA 5FOOA 1ESWA 3BLPX 1JZ5A 2VMFA 5I0DA 1QNOA 2ZX5A 1CXEA 3AIVA 4FMVA 1FHDA 3L4YA 1HF6A 3AQUA 1PX4A 2GDUA 4GQQA 1WKYA 2CPUA 3K8KA 1D7FA 3SUWA 1UWSA 1QOXA 2WHMA 1V3JA 1G9HA 5CZKA 3WQWA 1VFOA 3AIQA 1OD0A 1NP0A 1V6YA 5GQBA 2VX6A 1UR8A 2X0HA 4V2XA 1NWRA 1Y7VA 1GHSA 1CGUA 4UQCA 1CYGA 4AZIA 5IHRA 4CD5A 3SUVA 3DHPA 3GDBA 3IANA 5CQ1A 3PZGA 2E9BA 5ABHA 1W3KA 3G6LA 1GVIA 4U5IA 4TXEA 4F8XA 4W7WA 2GUYA 1BG4A 1UOKA 4HU0A 2WVUA 3SCPA 1HJSA 3OLGA 3CZKA 1KWKA 3AIWA 3VIOA 2WAGA 2EO7A 2WXDM 4PMZA 5DT5A 1B3WA 3RM4A 1VB9A 5JBDA 2EXOA 4QCEA 2VQTA 3WFLA 1EO5A 3ZT5A 2W67A 3U7BA 2DSKA 3N18A 5A1AA 5HPOA 4Y7EA 1H09A 2ZUSA 5A6BD 2WM0A 5GNXA 3O9NA 4PEEA 3KWXA 3WH7A 1LL4A 3M7SA 2XG9A 2BY1A 4J7RA 2YA1A 3MKKA 2WKLA 1BVNP 4MPKA 1W2VA 2XHYA 1WP6A 3VIFA 3VNYA 4X9YA 3CPUA 4D6JA 2ZIDA 1BTCA 2OYMA 4Z2IA 4UFKA 3WUFA 2DSZA 1F4AA 3WD3A 2PWGA 4AZBA 4GQRA 1BFNA 3PZNA 3FNDA 1ECEA 2WMGA 1J11A 4DUWA 3TA9A 1EQCA 2DT2A 4OOUA 3PTKA 1IT0A 1E71M 2D0FA 1CBGA 1CXHA 1KB3A 4W8AA 1KQZA 4UFMA 4LX4A 2YIHA 1JZ7A 2AAAA 1EO7A 2V3EA 4OZOA 1BGGA 3GTNA 4W84A 4ACZA 3FHAA 2YBTA 2VCAA 3VINA 2VRJA 2VCCA 1EA9C 1UH3A 1BPLB 2VL4A 2WCSA 4QDMA 3HJEA 4KGLA 3AS2A 1W9XA 1KBBA 5BXRA 4PMYA 4A4AA 1UWUA 1NWTA 3GBDA 3ZT7A 4B9ZA 3MUIA 3PZMA 5CJ5A 2J7FA 1BYCA 1KR1A 1WDRA 1HVXA 4U31A 3FN9A 3CUGA 3PTMA 1DP0A 1WCGA 4BS0A 1G0CA 5JUVA 1OM0A 3AMGA 1W3LA 3VKKA 1HP5A 3SCRA 4QLKA 3WEZA 1RP8A 3WN6A 5TD4A 3IJ8A 1DWFM 1MW2A 1P6WA 2VURA 1JAEA 3PZQA 1V3KA 1HXJA 3AIRA 3ALFA 4UFIA 3BGAA 4CN6A 5M3WA 4J27A 5D4YA 2GDVA 3W82A 4TOQA 2WHJA 4TTGA 2UY3A 1H2JA 4GPNA 5BYWA 3EDDA 1TVPA 3D5HA 1ISYA 5GNZA 2VCBA 3VU2A 2WSPA 3W27A 1B31A 5BXTA 3UEQA 1TG7A 1E15A 3VMPA 4P7OA 3AJ7A 3VMNA 1UWQA 2VT0A 2W5FA 3AZTA 1V3HA 3K1DA 3RDKA 1R7AA 4UQ9A 1V6UA 3UG3A 3VIJA 1GOIA 4F9JA 3AS0A 3CMGA 4UFLA 4BQ3A 1E3XA 3ZJ8A 4KH2A 5I5RA 3MMUA 5LYRA 1PIFA 4TX6A 3JUGA 3RM9A 5FIPA 3EDKA 2VC9A 1J0IA 4HZ6A 1BSIA 4N42A 3GYCA 1KWGA 1JI1A 1GPFA 3T0DA 1VEPA 5C71A 1VFUA 3N04A 4MB3A 1V0MA 5HOSA 2DIJA 3DYMA 2FGZA 2DH2A 2WWCA 3VGBA 1GCYA 3AMKA 3VGHA 5IXEA 2Y8VA 3QGVA 3WELA 1UH2A 4BF7A 1E6PA 2ZXDA 4FK9A 3BAIA 4FLOA 1DWHM 1W9BM 1G5AA 2F8QA 3WDJA 1E6RA 1H0IA 2V3GA 3GXDA 1V0LA 2WVVA 2ZWZA 3SCUA 1W32A 3LPOA 2ZXAA 3GXMA 1Q6EA 4J3TA 4RE2A 1RP9A 3T08A 1XSIA 3OLIA 1PX8A 1EOKA 1FHLA 2MANA 4D6GA 2BY3A 1QNSA 4U3AA 4DUXA 4PMVA 1JFHA 1HJXA 1ITXA 3L4ZA 1VIWA 2E8YA 4WSKA 4GINA 3OGRA 1M01A 2FGLA 2J7HA 1HKJA 3NCOA 4W5ZA 1CXKA 5BROA 1C8XA 4AXNA 1SMAA 3THCA 1E43A 2WWDA 3SCTA 3AXHA 4S3KA 2EPNA 4QP0A 3CLWA 3CUIA 4H2CA 4LGXA 3VUPA 3NDZA 2ZX9A 1KCLA 4NZCA 3WBEA 3IK2A 1CGTA 1L8NA 4R27A 1U30A 1K9TA 3ZSTA 2JIEA 2XFRA 1US2A 3UG4A 1FH8A 4UZUA 4DM1A 5GPRA 3RIKA 3ZR5A 5BRPA 4NF7A 1KXQA 3MV01 3ZQ9A 3N1AA 5HPCA 4IM4A 2TAAA 2XFYA 5FL0A 1GORA 5C8BB 3CHCA 3GXIA 1IZKA 1MFVA 1QW9A 7TAAA 4ACZB 2J77A 3WH6A 3VGFA 1J0KA 1ITCA 2CETA 2BHYA 4P8VA 5FL1A 3SURA 1XH2A 4DWSD 1E3ZA 4M24A 4WKAA 5KEZA 2E3ZA 1NOFA 1HP4A 2QHAA 5E70A 4HOWA 3ZJ7A 4B15A 1AQ0A 3RO8A 4IPLA 4URIA 3SCSA 1UR4A 4JCLA 4LYRA 2FHFA 1TVNA 4E8DA 5DO8A 1LG1A 1M03A 2G3NA 1SR0A 4PMRA 1XH0A 3MS8A 1IV8A 3WD1A 1RH9A 4BQ2A 1KCKA 3GNOA 1C3FA 3TTYA 1UUQA 2YDQA 2PBOA 4AMCA 1MW0A 2WZEA 1B3YA 1UD6A 3TONA 1UQYA 2OYLA 3ZMRA 1EHAA 2VRQA 1CECA 4P8UA 3VIIA 3DECA 3W26A 1JYNA 4HPGA 1TFVA 1UKSA 3K4AA 1GOWA 1GUVA 4AD4A 3SCNA 4OOZA 4IISA 3WFZA 4PYSA 2WPGA 3QHNA 3BMVA 3GNPA 4MNKA 4CD8A 2WANA 3CGTA 1CGXA 1KBKA 1E70M 4P8XA 3MANA 3LPFA 1OT2A 1CDGA 2BHUA 2C7FA 4NI3A 3W29A 2XJ7A 4MB4A 1YHTA 2F2HA 2J7GA 2YBUA 1JYVA 2ZUTA 4ZEPA 2J79A 4UQEA 2PF0A 4M29A 3VD9A 3THDA 3AI0A 1JGIA 2IUZA 3WENA 1KFWA 5A6MA 3ARZA 3NUKA 3MU7A 1TMQA 1FFQA 1E6NA 1W1VA 1OGSA 4CN4A 3NIYA 1WZMA 3BAJA 3IJ7A 3WH8A 3AROA 3ZJ6A 1U33A 2OLHA 3CIVA 2BVDA 2VR5A 4FLRA 3VM7A 1D3CA 9CGTA 1VFMA 2UY2A 5FCZA 1WZAA 2G3JA 1H3GA 3VGGA 4L4OA 5M5DA 3HN3A 1WAWA 4TUFA 1E73M 3VD4A 5CGMA 1E0XA 4M8UA 2EQDA 1B3ZA 2A3CA 4W85A 2ZWYA 2QMJA 3PHAA 5DF0A 4HZ7A 4W8BA 2DQXA 3CHFA 4JFTA 1O6IA 1WB0A 1V03A 1E5JA 2WVVB 1CPUA 4P7QA 3AS3A 2PWDA 5A2CA 3I3BA 3F4VA 1HJQA 2WMHA 5ABFA 2E4TA 3WQ5A 3T09A 3SEPA 3OA5A 3WF1A 3L2LA 4TX8A 2BVYA 3UCQA 4AW7A 4B3KA 2XVKA 4LYQA 2XFFA 5A6BA 2WMKA 4BQ4A 1E0VA 4UNIA 4PCTA 2VX5A 1MW3A 4MNLA 4Q22A 4B9YA 3VDHA 3W24A 3MO4A 4PBGA 2VNCA 2J75A 2O9RA 4HMEA 1UWIA 3ARPA 4AY1A 3WMSA 2CBIA 1XH1A 4GZIA 1BGAA 2BHZA 4GI9A 3CMJA 3WD0A 2D2OA 3TTSA 2EJ1A 1WZKA 5E6ZA 4U2ZA 1OCQA 1JZ3A 1GOMA 1G01A 3WSUA 3BCFA 2VZOA 4GI8A 1LL6A 3OLEA 1V02E 1C8YA 1PPIA 1DTUA 1NH6A 1K9DA 4WJXA 4P7RA 4HU8A 4W7VA 2ZUUA 1V3MA 4JHOA 1QBBA 1NARA 2XGBA 3PZVA 4WF7A 4JFUA 4MDOA 5BWFA 2EPLX 1B2YA 1BVZA 3K8MA 1SMDA 1V0NA 2G41A 5A8PA 1UA7A 1MXDA 1UH4A 2VJXA 5A2AA 3DYPA 5BXPA 1H49A 3N17A 1PJ9A 3TTQA 1D2KA 3NSNA 2A3AA 2XUCA 1EIBA 4XB3A 2DT1A 4JL1A 1Q6GA 1GZJA 2YA0A 2CERA 1XV8A 1V6XA 3MSDA 4AEEA 4YN5A 3F5KA 3W81A 4PTXA 1K6AA 4RE4A 1LLOA 2GJPA 5A2BA 2CBUA 3UR7A 5EB8A 3PZIA 1WNOA 5A8NA 3CZ8A 1W9DM 1QNPA 2E0PA 1CTNA 3WNNA 3I3DA 4Z2KA 5CG0A 3VX1A 2JALA 4Z2JA 1DWJM 4HOXA 1OGGA 1JNEA 4EAMA 3A4AA 5I3DA 2FHCA 1W3HA 2WSKA 3W37A 1GOOA 3B9EA 7CGTA 4OJYA 3EMZA 4D6CA 1W91A 1KR0A 1HJVA 3WNOA 4PMOA 1UD4A 3ZOAA 4BCEA 4GXPA 3MUAA 1EH9A 2C8NA 3PN8A 3WD4A 2IXUA 2QPSA 4GIAA 5A8MA 5AC5A 4GO8A 1J0JA 3FAWA 4AIEA 2OSWA 3DHUA 4U33A 2D20A 5I6SA 1TUXA 3QR3A 2XIBA 4K68A 2GK1B 2WC4A 1K9EA 1GQJA 4MB1A 1BYDA 3BLKA 4E2OA 2XWEA 1UA3A 2RGLA 3UG5A 5F7UA 4Q7NA 1GQLA 3AXIA 1FH7A 1JXJA 3L4TA 2V5DA 1HKIA 1L0PA 4AIUA 1OIFA 3WEMA 3AHYA 1B90A 3BSGA 4F66A 5HNNA 3E1F1 2EBNA 5CXPA 3WDRA 1H4PA 1HX0A 1E6ZA 1CLXA 1ZS2A 2OYKA 5DMYA 3VD7A 3CUFA 1CENA 3F5LA 2OWWA 4D6HA 3WUGA 1UWTA 4NSBA 3ARQA 2C0HA 3EDEA 3W4RA 5IFTA 2WLZA 3MSGA 1ZJAA 2WB5A 1QBAA 1EDQA 1X6NA 2WBGA 1V6VA 3S6TA 4ATDA 3N15A 2CITA 4XUYA 1EOMA 3AS1A 2D22A 4UCFA 4JKKA 5ABFB 2ZX8A 1W1PA 3SIMA 2GJXA 2JEPA 3U5UA 2D3NA 5AC4A 4JKMA 2D1ZA 4OUEA 2WNWA 3LPGA 5D8ZA 1NOUA 4W86A 1HKKA 4JIEA 2CNCA 3OG2A 4WSJA 3ZSSA 1JZ4A 3T0AA 1LQ0A 5BXSA 2JFEX 3KL3A 1PZ2A 5ABEA 4P8WA 2FHBA 1CXIA 4CVWA 5EFDA 4YHEA 1OB0A 1QNRA 2ZXBA 2WC7A 2DSWA 2WHLA 2ZX6A 4PRWA 5GNYA 1LG2A 4DM2A 3UESA 2PWEA 2WMIA 4HTYA 2F61A 4X0VA 1PAMA 4QAWA 5E0FA 1JF6A 1UKQA 5D8WA 1XSJA 1ZBWA 4QLLA 4ML4A 2VI0A 2CESA 1BHGA 4UOJA 4J3UA 3ARVA 1WPCA 4J3VA 5M17A 2BFGA 2PWHA 5IHSA 2WBKA 4AZHA 1H0GA 3QHMA 1R87A 2E40A 2FH8A 3OZPA 4ATLA 3A47A 1LWHA 4PN2A 2XM2A 4U5KA 2D23A 2XVLA 5EFFA 3M46A 4OBRA 3WF0A 1MYRA 3M07A 1XD1A 1CZ1A 4MADA 2O9PA 2YL6A 2Z1SA 1E5NA 5A8QA 1OINA 3WBAA 2IXVA 1QVBA 2ESCA 2Q8XA 3II1A 4JL2A 2YDRA 4DWSA 1JD7A 2CIPA 2YA2A 3AIBA 3AMDA 5AY7A 4HMDA 1E0WA 1C7TA 1GVYA 3BAYA 1B3VA 1WDQA 5A6AA 3OIHA 3WL0A 4S3JA 3GBEA 1LWJA 4AD3A 1KGXA 1S46A 2BS9A 3AICA 1TA3A 3K4DA 4W93A 4QCFA 1FA2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4M56 A;  2EPK X;  1DED A;  2W63 A;  1PBG A;  4PCS A;  5A6J A;  4V27 A;  4TVC A;  4UOQ A;  3B9D A;  5DEZ A;  3N11 A;  3AFB A;  4M1R A;  1VAH A;  4PMD A;  2PI6 A;  3WD2 A;  4D1I A;  1JDD A;  4GO9 A;  5JBE A;  5IDI A;  3B9A A;  3FY1 A;  3SCV A;  2GK1 A;  3VVG A;  4UFH A;  5A8O A;  3WIJ A;  3N9K A;  2WYS A;  2WCA A;  3MMW A;  3QOK A;  3KL0 A;  1HT6 A;  1VJZ A;  4PSR A;  4UQA A;  2UWF A;  3W6M A;  4UOZ A;  5I78 A;  1E6Q M;  1JDA A;  3AIS A;  2DSV A;  4UQD A;  5DFA A;  4H04 A;  4TVD A;  3EBV A;  1EXP A;  3IAQ A;  4D72 A;  2VR4 A;  2XWD A;  4FF5 A;  1UQZ A;  3ARR A;  1UD3 A;  1NWS A;  3AHX A;  4W8L A;  5A6L A;  1BG9 A;  2X05 A;  5A3H A;  3LPP A;  4DWS B;  1NWU A;  1SYT A;  3MUZ 1;  4LYP A;  4BQ5 A;  1Q6C A;  5FD0 A;  3ZM8 A;  4H8U A;  3VGE A;  3WQV A;  1BYA A;  1VEN A;  4CVU A;  4EE9 A;  1JD9 A;  1TR1 A;  1B30 A;  2WKG A;  4UQB A;  4CD6 A;  3A4X A;  3W53 A;  2G3I A;  6A3H A;  2WZH A;  3PZ9 A;  4QFU A;  1A3H A;  3VIL A;  2WC3 A;  2RGM A;  1VRX A;  4Z2H A;  3KE0 A;  2D0G A;  1AQM A;  3WNM A;  1UD5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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