2BWGA

Structure of human guanosine monophosphate reductase gmpr1 in complex with gmp
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
337
structure length
335
Chain Sequence
PRIDADLKLDFKDVLLRPKRSSLKSRAEVDLERTFTFRNSKQTYSGIPIIVANMDTVGTFEMAAVMSQHSMFTAIHKHYSLDDWKLFATNHPECLQNVAVSSGSGQNDLEKMTSILEAVPQVKFICLDVANGYSEHFVEFVKLVRAKFPEHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIKVGVGPGSVCTTRTKTGVGYPQLSAVIECADSAHGLKGHIISDGGCTCPGDVAKAFGAGADFVMLGGMFSGHTECAGEVIERNGRKLKLFYGMSSDTAMNKHGVAEYRASEGKTVEVPYKGDVENTILDILGGLRSTCTYVGAAKLKELSRRATFIRVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Human Guanosine Monophosphate Reductase Gmpr1 in Complex with Gmp
rcsb
molecule keywords GMP REDUCTASE I
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 114
structure length 335
sequence length 337
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.7.1.7: GMP reductase.
pdb deposition date 2005-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2bwgA00
1H7OA 2QAPA 3UYCA 2A2IA 5AYXA 4N2YA 5D37A 4QSHA 3KAOA 4WD0A 4DBDA 4JICA 1KA9F 4Z1DA 1W8SA 1ICQA 2ZDRA 3G1SA 1I2QA 2A1YA 3CLMA 3LI0A 4IWWA 5ABTA 3UWVA 4FB7A 1OFOA 1TRIA 3LHVA 1Z48A 3ABQA 5D33A 1VLWA 5LKYA 3TR2A 3DU0A 1LRQA 2DJXA 3DKLA 3PS7A 1XC4A 1A5BA 3DXIA 4MZYA 1TTIA 1S5WA 1LLZA 2X1UA 3BLEA 5LZLA 1SFJA 1OFQA 3Q2DA 1HFBA 4AEOA 3C3NA 3MI6A 4LV9A 3LHYA 4IQLA 1T99A 2GVJA 3R12A 1JQXA 3FOKA 1GWJA 4HNUA 1WXJA 4ML9A 1SSDA 2NLIA 2GQ8A 2ZZ1A 3DBPA 4HPXA 1G4PA 4EF8A 4A2SA 3ATYA 3MMTA 5A8GA 1OYAA 1ZCOA 3NO5A 4PA8A 1OK6A 1F6PA 1O60A 4JTGA 4RJEA 3HGSA 3CTLA 1VHCA 2V2HA 4Y8FA 5AHNA 4ADUA 3LV6A 1O95A 3N73A 4N9EA 3LV5A 5HJLA 3LRLA 4EIVA 4N4QA 3DAQA 4AXKA 4X2RA 4LNYA 3A21A 4O1DA 2XN2A 5D2TA 3HMJG 3B04A 4OGZA 4H6KA 4S2CA 4NZJA 3IIXA 5EA9A 3OVRA 1XUUA 5DBUA 5H91A 5AFDA 3TQVA 3QSRA 4IPIA 3DFPA 1KFEA 3GIYA 1I2PA 3F1QA 6TIMA 3O63A 1T0OA 2QUVA 3L5AA 1YPIA 4Q33A 1C29A 1EPXA 2VELA 1XCFA 4Z1CA 2YXGA 3MYOA 3KVJA 6ALDA 1H60A 5LGZA 3B05A 3ABOA 2QCEA 3L68A 1F05A 1MSSA 4ICNA 2FPTA 4MYXA 3LERA 3KFTA 1EA0A 5CZTA 5D04C 3OVPA 2Q8LA 2X1TA 1DOSA 3NL3A 2WNQA 1F76A 3L21A 2PRMA 3FFSA 3QFEA 1P5BA 3W1RA 3SFKA 1W0MA 3NQ6A 4A29A 5HUPA 4UUIA 5FF0A 2NV1A 1SUXA 5K4XA 1B57A 2ZRXA 4L4MA 1A50A 3PSWA 5CPMA 5KZDA 1KFCA 3I7RA 1SZNA 3NNTA 1P1XA 4RZ5A 2C16A 4PCFA 1V5XA 3N14A 4UXDA 5D2WA 3GR7A 5AYZA 1H50A 2GJNA 3PUEA 2FTPA 3IIZA 3BGGA 4K36A 3JS3A 4MVAA 4I7UA 2TRSA 2VFIA 4MFEA 3E9AA 4JDYA 2X16A 3H54A 1ONRA 3UPWA 4IX0A 4ONVA 2ZZ6A 3HOJA 4FIQA 1TPC1 3QZEA 4UFIA 3NQCA 2RDWA 3QMRA 1F73A 4PC8A 1X1OA 5F1UA 1YPFA 3BW3A 1FCUA 4GUHA 1KLZA 3TQ0A 1K7XA 3NQMA 3DFSA 3W84A 4ZZ9A 1KM2A 4CCEA 3H55A 2G95A 4QQ3A 5I3IA 1N8FA 3M43A 3O05A 5TIMA 3QMTA 3SECA 3LCIA 1IXOA 4M5PA 3W88A 4LVDA 3NL6A 4MY9A 2ALDA 4KKXA 3I65A 1EB3A 1FWTA 2W79A 3LOTA 4UR8A 2ZRVA 1V7YA 3I6RA 3G0UA 1HG3A 2DZPA 1G7UA 2JKEA 2CLKA 5AYYA 1VCVA 2E6AA 3EWYA 1EUNA 1O4UA 4IMEA 2YSWA 3NL5A 3RLVA 3LXBA 3PBVA 3G18A 5EL1A 4HKPA 3I7SA 4M6VA 4O52A 2O7QA 3NZ1A 2ABBA 4MKNA 4O53A 3T7VA 5G5IA 5HWMA 2W6RA 4K8HA 1SO5A 1L9WA 4GUIA 1YDOA 3SJ3A 1KTNA 1GVOA 2VEKA 4JY8A 4IXHA 3M16A 1GZGA 4NNCA 2FDSA 4AAJA 1JVNA 4AH7A 1KFJA 1SO4A 1FY6A 1VS1A 4LUIA 5BOOA 1SZEA 4E2BA 1KTCA 4C1LA 2JBMA 2OT1A 2V82A 1BWLA 3E0IA 4PEKA 5FEXA 4GXMA 3W7OA 2VEMA 3HPZA 2QJIA 4FEZA 5E93A 5D38A 3W83A 4O1CA 3A22A 5GVJA 1DJNA 3RFAA 3IVUA 1W5MA 1Q3NA 2PRLA 3EWXA 4NU7A 3C2EA 4BI7A 3LTPA 1VYRA 1ZY9A 5EMUA 2HTMA 4RXFA 3S9YA 2PURA 1QOQA 1YADA 3FKRA 1YTEA 2Y7GA 3QH2A 4RZ6A 1WV2A 4IXXA 3UXAA 3L9CA 4NXSA 3IRDA 2WV8A 3I68A 4O14A 3EXTA 1EWEA 4Q4KA 2B7NA 3LHWA 2CZFA 4LVAA 2YFNA 4HSNA 3B03A 2C3ZA 1SFLA 4TU1A 5DELA 3ATZA 1SQ7A 3E02A 5C6MA 2ZBTA 4JEQA 3ABRA 1Y0EA 1G4TA 2DZUA 4POCA 1H63A 2DZVA 2H6RA 2Q3OA 1EP2A 2WNZA 5D2VA 1VZWA 2VFHA 3UXDA 3EWZA 3PC0A 4N6EA 1JUKA 1GG1A 1RR2A 3PG9A 1W3TA 2FPYA 5KINA 4IMDA 3RK8A 4HN4A 4K38A 2RDUA 1LDCA 3GNNA 4LVBA 1CI1A 1TJRA 3EX1A 2B7OA 4QAIA 4FIRA 4G1KA 4IOTA 1J2WA 5HMSA 1XDMA 4YL2A 1JCMP 1TPUA 3MW7A 1TREA 4I9AA 3IGXA 2JGYA 1QPNA 5HR7A 2WSQA 4RV8A 1ICSA 4U28A 1RPXA 2CLIA 2RKXA 3S1XA 3QSTA 4LVGA 3QW3A 3W23A 5AB3A 4JYEA 2E6YA 5AHIA 4UIOA 4QJ1A 4S1FA 1TTJA 1VJIA 2GQAA 3GDMA 4O19A 4N9DA 3BPWA 2ZRWA 1LCOA 3P81A 2ZFAA 2R8WA 4UTMA 1JUEA 3L0KA 1QCWA 2Y63A 1TRDA 5F2MA 4QNWA 4K39A 4JIPA 3QW4B 4ZVJA 3W7EA 3NPWA 4LRTA 3W3OA 3MYPA 3C4UA 2B7PA 3HF3A 3USBA 1OHLA 2FFCA 1P4CA 3GDTA 4K7YA 2NUYA 5L9FA 4O11A 3B0PA 5G2WA 3W2NA 3P84A 5AC7A 1ME8A 4M7TA 2GPTA 1EEPA 3GR8A 4DO6A 2G97A 1B3OA 3EKLA 3G22A 2V0TA 3DI0A 1PIIA 4HNNA 1OK4A 1FCVA 2C19A 3DFTA 1QNVA 1GVSA 4WZHA 4GJ1A 1ICPA 3CIWA 3PB2A 4CQAA 5EY5A 3M41A 3GXNA 1EX5A 1GVQA 4WUIA 3HQ1A 3OVQA 4MOZA 4GUGA 3L65A 1RZMA 4FXSA 2G96A 4RKAA 3W1AA 1FBAA 3HPXA 3W2UA 1XBZA 3BG5A 4DBEA 2NX3A 2C0AA 5F4XA 3RU6A 4NX0A 1AL7A 3GLCA 3NPVA 1TSIA 1VGAA 1EP1A 4MY1A 3NZRA 4N9CA 3KVMA 4C1KA 3JR2A 3LHZA 1K7EA 2G5WA 3RMJA 4NJIA 1M7PA 3R5EA 4NXKA 3ZS4A 1E51A 3THQA 3ANYA 3W9ZA 3PF3A 3S8HA 1LTDA 4MJMA 1FDYA 1U83A 4GNJA 2QF7A 3WJWA 5HR6A 3E49A 4MZ1A 4OQVA 1LP6A 1NEYA 2OCZA 3LTYA 3P67A 3KRSA 2QKFA 2Q8ZA 3P60A 4JTUA 5E1QA 3T40A 4ZQPA 2H8XA 4NJHA 3CU2A 4N6FA 1KV8A 3P5YA 4NNAA 4M7SA 5EPDA 2A7PA 3STFA 3TJLA 5CKSA 4UMBA 1IIHA 1FWSA 3G0SA 3WFAA 2Y6ZA 4DELA 5LNRA 3A24A 1YXDA 2DP3A 2V5BA 4YWIA 1LROA 1NF7A 2ZZ5A 2QCFA 3DKJA 1T96A 3NAVA 2ZQ0A 4LU0A 4Y9AA 1AL8A 3A23A 3MHUA 2V5LA 5T26A 3QJAA 3HG5A 2C18A 1SW7A 1UB3A 1XBXA 1G4SA 4GBUA 5IM51 3CEUA 3EX3A 3N19B 4XTDA 3TSBA 3CQ0A 3N3MA 4UTWC 3TW7A 3DENA 1DV7A 4AHPA 3EX2A 4H3DA 3W7JA 3EWUA 2R91A 4JX6A 1QPOA 4TMCA 3B06A 3PUOA 1J4EA 4TX9A 4O28A 4OT7A 3SIZA 3CC1A 1L6SA 3CPRA 1H5YA 3W7QA 1TPWA 4XZ9A 1W5OA 5AN7A 1W1ZA 1WYIA 3MBDA 4JN6A 5FI8A 3PVFA 5G1YA 2QJGA 4A21A 3W1MA 4UTWA 3W2KA 4O13A 3ELFA 5F4WA 2QDGA 3DFNA 5G4WA 1LOQA 4NUWA 2TYSA 4Z08A 3D0CA 1OFBA 4WQ6A 3DH7A 2OT0A 3T4CA 1EIXA 2YDAA 2C13A 2O7SA 2YGYA 3TC7A 4O0KA 3F4NA 1GYLA 1PS9A 2C6QA 1KFKA 4FNUA 2ZZ7A 1JRBA 3MHGA 3OHIA 2E6DA 3TH6A 2RHGA 3U2OA 4BI5A 3TAOA 2LLEA 3N2MA 3IGUA 1Q6RA 2WSYA 1UCWA 3EX4A 2GQ9A 1IGSA 2BX7A 2WOQA 3KRUA 3CEPA 3HG4A 1GQNA 1GJPA 1NSJA 4ZQOA 1JRCA 1WQ5A 1QO2A 1K8YA 4KWVA 5TBOA 4S2BA 2QJHA 3O6CA 1SPQA 3W1XA 1OFEA 3S5YA 1R47A 1AW5A 2ZZ4A 2VFGA 4UFHA 1H1YA 3G1VA 3EX6A 2V8ZA 4HHPA 4KFOA 1DJQA 4FX7A 4MY8A 2J9YA 3G3MA 3UPBA 2GUUA 1JQVA 4IX2A 3QQ1A 4CLMA 1LM1A 3L2IA 5F2IA 2X30A 1RQBA 2NX9A 3B8DA 3THAA 1S3HA 5FF7A 3OA3A 3W1NA 1TPVA 5DN1A 3O07A 1D3GA 4GFSA 2B7QA 3BW2A 1ZALA 5AOUA 5F2GA 4Z1AA 1IIGA 1L6WA 1VYPX 5BMWA 3L0NA 1Q6OA 3FJLA 3CB8A 2YX0A 1DKWA 5BMXA 1OFPA 3LTSA 3M44A 4YCPA 5I3HA 3E96A 1J5TA 3IIOA 4J9JA 4IMFA 1TPEA 5I3KA 1S5TA 2J88A 3LDVA 1K3UA 5LNSA 3HGRA 1DL3A 3BV4A 4LRSA 4A22A 3GKFA 2VFFA 4M6QA 4JTIA 4HNVA 3QPZA 3HB9A 3O8AA 1SW0A 3M5XA 3NEVA 3TXZA 3FKKA 2H3DA 5MHBA 2P10A 3M1ZA 3TQKA 3W74A 3M5ZA 4JTLA 1TV8A 2ATMA 3YPIA 1FCQA 3LM7A 2TMDA 4LC8A 4E0CA 3GB6A 5HWJA 1K7FA 4ZQRA 3P7YA 4P61A 3NQGA 5KTLA 3LCGA 1KTBA 1KLYA 4UMCA 1TYGA 1ZJIA 2D73A 1KBJA 1R30A 3BK0A 3NQEA 3O1NA 3TV8A 1HO1A 2R14A 5DLCA 2YZRA 5CZJA 3BW4A 1EWDA 3UWZA 5LNUA 1YLVA 3WJXA 5C54A 3Q94A 2EAWA 4FNQA 3RLUA 2PRHA 3NGJA 1XBVA 5AHMA 4WOQA 3W7KA 3W7DA 2B0MA 4KFNA 4LWWA 1UJPA 1OVDA 1I45A 4BF9A 3A5VA 3IIPA 2E5BA 5A5WA 3QM3A 4XUGA 4DPPA 4CCDA 4OWGA 4CNNA 4FNSA 3OEXA 4AF0A 2JKAA 4MLRA 2CZEA 3S1WA 3Q37A 2I1OA 3P61A 4ADTA 4DXVA 3LCXA 3NQ8A 2C1HA 2PE4A 1RVGA 1H7PA 2Y85A 2FB2A 5E0KA 3EKZA 1VCFA 4EF9A 2UV8G 5TQLA 1OYBA 1R2RA 1OFAA 3A9IA 3P8JA 3GDRA 1FWRA 1UUMA 3TSDA 5LSMA 3NQ2A 3QQ0A 2YPIA 1S5VA 2BWGA 4N9BA 4MLJA 3EWBX 2CLFA 3FEMA 2AAMA 3GZ3A 4UC5A 1PCWA 4Y6GA 1XDLA 1PV8A 2E09A 3W2JA 4JR5A 3W85A 3UWYA 4GUJA 4RX0A 4O15A 3FLUA 3C2OA 2B4GA 1ZNNA 2P0OA 1QFEA 5LHEA 2CZDA 3QF0A 3UD6A 3TAKA 4LVFA 3HPSA 5DCDA 1YDVA 3EB2A 3W76A 1SU5A 2Y89A 4IMGA 2CLHA 1EUAA 5EBUA 5I3FA 4N4PA 3PR2A 4FNPA 2OMAA 2EPHA 3IVTA 1B9BA 1FDZA 3W7HA 5BW6A 1RD5A 1VQTA 3DHDA 3TKFA 3PSVA 3S5NA 2QUUA 3NDOA 3PBUA 3LHTA 1LOSA 1TPFA 2NWRA 5HQEA 1G6CA 1F2JA 1ZFJA 2A4AA 3GVGA 4JTFA 4CQ8A 4ZMGA 4BI6A 3SI9A 3F03K 4DF0A 4HSOA 2DU2A 2OJPA 2DZXA 3STEA 3INPA 4NJKA 1TTQA 2VEPA 3DZ1A 5F1VA 4A3UA 3IEBA 3CHVA 3WJSA 1LLWA 4CNOA 1R2TA 4UTTC 1VPXA 1TV7A 4O17A 1TJPA 3QPYA 3ZWSA 2CWNA 3SGUA 3GXTA 2QCHA 2X2GA 3M7WA 4DO5A 2C14A 1DVJA 4XWUA 4GWEA 4HT3A 4XKYA 1KM3A 3G24A 5K9CA 3HGJA 1L2UA 4LOCA 4UTTA 3O06A 3P80A 1QO5A 3HGOA 4KWWA 1BTMA 2ZRZA 4Z0JA 2WSRA 3WJYA 3M5YA 1FWWA 4O57A 4RZ4A 1ME7A 1SR9A 3DI1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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