5I2UA

Crystal structure of a novel halo-tolerant cellulase from soil metagenome
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
SIVAQNGRLQVIGTQLSNEKGEPVVLRGASLGWHNLWPRFYNKNAVQWLADDWKCTVVRAAMGLEIEDNYRENPEFALQCITPVIESAIENGIYVIIDFHAHNKYTEEAKTFFAGMAEKYGEYPNVIYEIWNEPDYFEWEEVKTYSEEVIAVIRAIDPDNIILVGSPHWDQDLHLVAEDPIRDVSNIMYTMHFYAATHEAWLRDRTDEAIAKGIPVFVSECGGSEANGDGRLGIEEWKTYVDWMESRKISWVAWSVSDKNETCSMLLPRASADGNWTEDLLKPWGKLTRNSIRNAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Soil metagenome
publication title Biochemical and structural characterization of a novel halotolerant cellulase from soil metagenome
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cellulase
total genus 119
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5i2uA00
4MNMA 1UR8A 4M1RA 1VAHA 5A6BD 2PB1A 2O92A 2V38A 2BV9A 1JZ4A 5CLTA 2CKSA 2JF7A 4AZCB 2VL4A 2Y8VA 4MB4A 1KXVA 1DP0A 2XGBA 1CDGA 1ZBKA 2XSAA 2X1IA 4JL2A 2CBUA 2VCBA 3SCQA 3EYPA 1GQLA 1HXJA 2OSYA 4KGJA 3ARWA 4PYSA 1R7OA 3VIHA 3WQVA 1JG9A 4QCEA 1BYCA 1W9UA 2VZTA 5I2UA 3WBAA 3WDRA 2PWHA 3SUUA 1BYDA 4OIFA 5CPTA 2XFYA 4MDPA 1W3HA 4IUGA 3I3EA 4QP0A 1OM0A 1BPLB 1KQZA 4MPKA 5A6MA 1GNXA 1LL4A 1W32A 3RO8A 5M5DA 3AXIA 4U5KA 2EPLX 3MSGA 3VMOA 1V03A 1WZAA 4LYPA 1E73M 1CENA 1XCXA 4W85A 1C91A 1KBKA 1O7AA 1DWIM 1BG4A 5EMYA 2EBNA 1E5NA 1R85A 5ABFA 4XUYA 1EXPA 5DO8A 3W24A 1FA2A 2JEPA 3CPUA 4HA1A 5M03A 3AIUA 2YDQA 1MFVA 2BXYA 4LGXA 4ZENA 4MB3A 1UZ1A 2EJ1A 2WBKA 2DH3A 2ZXQA 2BVTA 1NOFA 1G1YA 1QI3A 1QNSA 3VU2A 4ATWA 3DHUA 3FY1A 4PN2A 3DYPA 1VRXA 3WNNA 5A6JA 4PCSA 3T2OA 4AC1X 1PIFA 4MNJA 1QW9A 2PWGA 1JD9A 3VMPA 2F8QA 4K68A 4AD2A 3AHYA 1GHRA 1CECA 5CSYA 3AS3A 1M04A 2W61A 1VIWA 3AFBA 1CXLA 1SYTA 3GBDA 2VO5A 2YL5A 2FGLA 1CTNA 1V6XA 4AZGA 1R7AA 2WCAA 2UY5A 2ZX8A 3NDZA 2XVPA 4NI3A 1C3FA 3WQ5A 3PBGA 1VFUA 2J74A 3VINA 1D2KA 1ITXA 4M80A 3AXHA 2WW5A 4S3JA 4B3KA 4LYRA 4CVUA 1R86A 3CO4A 2YL8A 5BROA 3VDAA 1BVZA 3VD5A 1W9XA 1F4HA 2A3HA 3CUIA 3WENA 2WK2A 2E9LA 5D9MA 3RILA 5A2BA 5D9OA 1MW3A 2C0HA 1UKQA 2BY2A 3WEMA 1Q6DA 1MQPA 1U33A 2X0YA 3CUFA 4JCLA 4WSJA 5EFFA 1KGWA 4CCEA 1FOBA 3AZRA 4F66A 1AQ0A 4HMCA 4W7VA 1E56A 2YA0A 4FLSA 2IXVA 1XH2A 4AD1A 4Z2LA 4W5UA 2CEQA 4KGLA 1WCGA 1HF6A 1CPUA 4B9YA 3VD4A 2XFFA 2GFTA 1UG6A 1XYZA 3APGA 1J0IA 2FH8A 1JIBA 3D5HA 5BRPA 1EQCA 3KZSA 2GDVA 1QI2A 1JFHA 4TVDA 3KWXA 4H04A 1WO2A 1K9TA 1UWSA 1UA3A 4BF7A 4U3CA 4TVUA 3WEOA 3AYSA 4JFUA 3FHAA 5BYWA 2CXGA 4XB3A 5ABFB 3NUKA 1E0WA 3BLPX 3CHCA 1S46A 4CU8A 2JEQA 5AYBA 1RH9A 4C7GA 2JE8A 4PTXA 3T0AA 2DDXA 2QF8A 1J18A 1HNYA 3N04A 1V3MA 2QPUA 3N12A 3NCOA 4XZWA 4NF7A 1M03A 1KQYA 2VJXA 6TAAA 2XVNA 4DUXA 2E4TA 1CWYA 3U5UA 2GUYA 1KR0A 5JBFA 4W5ZA 1SMDA 2BY3A 4HP5A 1QBAA 3F5KA 1JZ2A 2DPEA 3DYOA 1W91A 2NW0A 2VX7A 4Q22A 5GNZA 1PZ2A 5CPQA 4HPHA 1OSEA 3AISA 3L4ZA 4UNIA 5A8QA 2V5DA 2VVSA 3T2PA 4AMCA 2ZWYA 1GPFA 1D3CA 2V5CA 3LPFA 2WXDM 1UR0A 3SUVA 1DWAM 4W7UA 4UFIA 3ZSTA 2UY2A 1WDQA 2WVTA 2IUZA 1H0IA 2CERA 1QOXA 3W27A 4M29A 2CHNA 4PMUA 1XC6A 2VTFA 3WIJA 3U7BA 2YOCA 1PX8A 3CH9A 4ACZA 1EHAA 4DWSA 3VIKA 4BCEA 1BGGA 4IPNB 1UWQA 1OIFA 2EEXA 1UHVA 4ATLA 3SCVA 3RM4A 3B9AA 2YA2A 3ZJ7A 4W88A 3WNPA 1M7XA 3WBEA 4MB1A 2O9OA 1ISVA 4WJXA 5A69A 1V02A 1B3XA 3W25A 3ARSA 2YBTA 3WNKA 4J3XA 2WLYA 1MXDA 1JD7A 4CN1A 5D4YA 1ZB5A 1CLXA 5A2AA 1E0XA 2VCCA 3THDA 3PZNA 2XVKA 4N0RA 1AVAA 3OLEA 4V27A 4JCMA 3RDKA 1E5JA 1V3KA 5I0DA 4DM2A 1WKYA 4ATDA 3VNYA 4GZIA 1V3HA 1JYXA 5BXRA 2BVDA 1ODZA 1OCQA 4PMXA 4DWSD 3VDHA 3WD4A 2OWWA 1NM9A 3FAWA 1PPIA 4V28A 3SCPA 1LG2A 4YHGA 2EPOA 4GXPA 2NSXA 2OWCA 4U3AA 3L4YA 4JZ5A 1YHTA 5DMYA 2XGIA 1JXJA 8A3HA 3WUGA 3ZJKA 5E70A 3AI0A 3W38A 3PZIA 2VMFA 1E55A 4PUEA 5CG0A 4AD5A 2E8ZA 3AZSA 2ZX6A 2W66A 4UQ9A 3RM8A 1UZ4A 3OB8A 1RD6A 3AS1A 1CNVA 2WBGA 2J8FA 4HPGA 1WDPA 4PSRA 3WD3A 4LXFA 1KWGA 3MO4A 1H09A 1GUVA 1NQ6A 1IT0A 5I5RA 4AW7A 1LWJA 5IHRA 1UWUA 2X09A 2XHYA 2XWEA 1M01A 1B3ZA 3TTOA 1HJVA 3OLIA 4WK9A 1UOKA 5LA0A 1XD0A 2YL9A 4JKKA 1EDQA 3WUEA 4WKAA 1XSKA 1TVNA 1UD4A 1QI4A 3WEZA 2VVNA 1EOKA 3SEPA 2PWDA 3J7HA 2FHBA 3ZIZA 5FL0A 4OBSA 1GOIA 4AYSA 1E6NA 1V02E 2GJRA 3NSXA 2YKKA 2W62A 3WF3A 1B1YA 1UH3A 4FK9A 5CLWA 3VIIA 3A3HA 4ZE4A 6CGTA 4ACZB 4H41A 4DWSB 1XH0A 1LWHA 2VNCA 4XV0A 3ZM8A 1E9LA 2WVUA 4GI9A 1XV8A 1OD8A 2GJXB 2VZVA 5DF0A 1E71M 1NWSA 1GCYA 4W8LA 5D8ZA 4HU8A 3SUSA 1NH6A 5EBAA 1W9BM 4X9YA 1IZJA 1CGVA 1QI5A 2PI6A 1OGBA 4UTFA 3EDDA 3M7SA 5TD4A 3TA9A 4UFHA 1ZS2A 4W8AA 3GXIA 1QNPA 3AJ7A 4NZCA 5FL1A 2V3GA 3PTKA 5A8PA 2ZX7A 1J9YA 1VBUA 1D7FA 1EO5A 2WB5A 2G3NA 2OYMA 3RJYA 1GZJA 1UR2A 1VEPA 3QHOA 4UFJA 1UH2A 3GBEA 3MV11 2YDSA 4JHZA 3W26A 1EH9A 4E8CA 1FH7A 5M17A 1ISZA 4M82A 4MNLA 4TXEA 3VD9A 3TTSA 3W53A 4FLRA 4D6DA 1HX0A 7CGTA 1ECEA 5A6BA 4PMRA 1TCMA 3T2QA 1WDSA 1JDCA 3GH5A 2CIPA 2ZUWA 3VM7A 2CHOA 1KCLA 4YN5A 1K9EA 2V3DA 3W28A 2VX4A 2QHAA 4AD0A 1J10A 1TFVA 5D9NA 1JNEA 2E0PA 4CD6A 4OZOA 1XHGA 3SCRA 1TA3A 4CKQA 1RP8A 2V3FA 1J0KA 2MANA 5EB8A 1VF8A 3VIMA 1Z32X 5AYIA 2VX6A 1V3LA 3AIQA 4AIUA 4QCFA 3ZT5A 4TTUA 1BVNP 1H0GA 3MUIA 2BFGA 4TTGA 3EDEA 5A95A 3RCNA 5D9PA 5BXTA 1GQIA 1Q4NX 4KMQA 3W6MA 2E3ZA 4W84A 4QDMA 3BGAA 5DFAA 1LL6A 2XM1A 1U30A 2E9BA 3BC9A 1H4PA 2ZUNA 1CGYA 2XIBA 4MAVA 1JYWA 2D0GA 3WL0A 3N9KA 1UKSA 1JI2A 4UQAA 3CUHA 2FHFA 2WMJA 4MAZA 4GZEA 2WCSA 4KRTA 2ZXBA 4A3HA 5E09A 2GK1B 5E6YA 2WYSA 1SFSA 1KGUA 3VNZA 5DT5A 3TONA 4AD4A 3SCUA 5IXEA 3TOPA 5IFPA 1XD1A 1FHDA 2BS9A 3AMDA 1NOWA 4S3KA 2ZOXA 4TOQA 3WSUA 1EDTA 3PTQA 2G41A 5CPSA 4GZJA 3QR3A 3U57A 4AEEA 1HN1A 2J7CA 3BAIA 4ZFMA 1ISWA 4HZ8A 5HOSA 1MWOA 1H3GA 3WDQA 2ZXAA 3I3DA 3UR8A 1WB0A 4AIEA 4UQEA 4F9JA 3N15A 1E4LA 1N82A 1UYQA 3L4TA 4WF7A 1I1WA 4W87A 1PX3A 1TZ7A 2VZUA 3GNOA 2OYKA 4J3WA 5DT7A 3GM8A 1JYVA 1J0JA 2AMGA 3VKKA 4PMDA 3ALGA 4PMOA 5LYRA 3T0DA 2GSJA 3T0BA 4HA3A 1CIUA 4UOZA 3F4VA 3VM5A 2FDMA 4ZEPA 1E40A 2D2OA 4P8VA 4QFUA 2PWFA 4CU6A 3GTNA 3VD7A 3ARVA 5CGTA 4PSPA 2J7BA 4IM4A 2J47A 1UD3A 4C7FA 4MTVA 1JXKA 4TX6A 1TA3B 4PUDA 3WN6A 3VOCA 5HPOA 2WMIA 2VQUA 4JKMA 1VEOA 3POCA 3W4RA 1E4IA 2VR4A 1TUXA 3AQUA 3K4AA 4U5IA 3S2CA 1BTCA 1QW8A 3AXXA 3KL3A 1E6PA 1L0PA 3G6MA 1UKPA 2W92A 3A6OA 1OT2A 4MDOA 1JYNA 1EQPA 2D23A 2HVMA 2WMFA 3WL1A 3ARXA 3LPPA 3TTYA 3DHPA 3ZT6A 1MW2A 3NSMA 4UQCA 2CBIA 4UQBA 3FHQA 3PZ9A 5E6ZA 4L4OA 4GO9A 3TTQA 4D6GA 4HTYA 5JUVA 3L2LA 3PZOA 1QNOA 4ACYA 2J7DA 4YPJA 3WMBA 4JFSA 1XGZA 2WSKA 2DH2A 3ZJ8A 3VIGA 2YLLA 3UERA 4D6HA 2Q8XA 4B16A 3A4AA 4MJ2A 4GQRA 4UCFA 2XWDA 1G0CA 3GNRA 2VT0A 1UD5A 3OGRA 3UESA 4P8WA 2CKRA 4CD8A 2CBJA 2CBVA 1ZJAA 2DSZA 1H49A 3VGDA 3DC0A 4W7WA 2BHZA 5F7UA 2VZSA 3BXWA 3CGTA 5JBEA 4P7LA 1UWTA 1W1TA 1W2PA 3EDJA 1EO7A 3CTTA 4HMDA 5JBDA 2Z1SA 3F5LA 3DYMA 2WLZA 3WY1A 3ZR6A 3BAXA 4F9DA 1GOOA 3ARUA 1J0ZA 1V6WA 3BLKA 4R27A 4Z2JA 1HVXA 1E15A 4D6CA 1JZ6A 3CZJA 2PBOA 1HP5A 5I23A 4D71A 2ZIDA 2XYLA 1NWRA 1E1FA 5ECUA 1C7TA 1GVIA 2RGMA 1JDDA 5BXPA 1ESWA 3VVGA 4XZBA 5A6SA 2YDRA 1A47A 4GQQA 1CXFA 2NT0A 3GH4A 1KXTA 3LPOA 4P8UA 2BY0A 3RMEA 3EMCA 4R5EA 1CXKA 3NJ3A 3VGGA 4XX6A 1VFMA 2WHMA 8CGTA 3BSHA 3ZT7A 2QLYA 5C8BB 2WMIB 3IANA 3WQ4A 4WKFA 1K9DA 1IV8A 4C7DA 4PMVA 4IISA 1XSIA 1UKTA 3WD1A 4KWUA 1E70M 1VJSA 2Z1KA 3W81A 4CN6A 2BHUA 3EDFA 2CITA 2WVVB 3PZUA 1UKOA 3MV01 2X0HA 2E9MA 3WNLA 1K9FA 3K1DA 1BG9A 2WCGA 2GJXA 3BAJA 2WC4A 1HL9A 3S6TA 5A8MA 1HVQA 1JNDA 3OZOA 1KXQA 5A6KA 3WQ8A 4QLKA 3CLWA 4W89A 3L2MA 3G6LA 2YBUA 2XIIA 4FMVA 5A6LA 1UD2A 4J28A 4D6FA 4M24A 4PMQA 3MS8A 3WDPP 2J7FA 1HL8A 4HOZA 3HU7A 4DUVA 1BQCA 2D24A 1WAWA 1ISYA 4AZ6A 4D6EA 2WWDA 1US3A 1XCWA 2CCRA 1QVBA 2W63A 4NRSA 4AWEA 2QMKA 2QMJA 4AXNA 3GZAA 3PHAA 2XVLA 1GQJA 1JAEA 3MKKA 3WF0A 4A3YA 1JFXA 2G8ZA 5KZ6A 3NYDA 3AS0A 1MFUA 3CZ8A 2EQDA 5A3HA 1W2VA 5EFDA 3SURA 3W6LA 4H8UA 3UG5A 1VFFA 1UD8A 2PF0A 3K8LA 5JIPA 2CNCA 4CD4A 2UY3A 4TX8A 2Y4SA 1DTUA 3OZPA 1FFQA 2FH6A 1CGTA 4KRUA 3OLGA 1A3HA 3ARQA 4NRRA 2A3EA 3WDIA 2Y8KA 4GPNA 3L4WA 3FN9A 4P7QA 5AC4A 5C71A 3UETA 2WPGA 1ZU8A 4W8BA 3AHZA 3CMGA 2VCAA 2DQXA 4D1IA 1V0NA 1GORA 3A4WA 4EE9A 4DM1A 4ML4A 1OT1A 3VTRA 3BCDA 5HPCA 1NP0A 4B3LA 2XG9A 3D3AA 2F61A 3GXMA 3WH6A 3WFZA 3AMCA 1R8LA 2J8GA 4YHEA 4P7OA 4JKLA 1NWTA 3OGSA 4QAWA 2CPUA 2DEPA 4ZE5A 1GONA 4GINA 3WDJA 1CGUA 1CXHA 1H41A 4D6IA 4P7NA 1ZBVA 1JZ3A 1HJUA 2YIHA 1HKMA 4BQ5A 1JGIA 5GPRA 2GK1A 2D0HA 2OSXA 3LMYA 3SCTA 4GO8A 2C7FA 5LA1A 4KH2A 2WMKA 4X0NA 1XYFA 3SCOA 4Y7EA 3MMUA 5IDIA 2DIJA 1UR4A 1E6QM 1VFOA 1GOKA 3M07A 4OKDA 1SMAA 5I24A 4J3VA 5I79A 3ZO9A 5I77A 1FH9A 1VB9A 2WZIA 2XVGA 1TR1A 2J79A 4OUEA 1PAMA 3EMZA 5I6SA 4BZYA 1UR9A 4WIWA 1AQHA 1HJXA 4MNKA 2Y5EA 3FXYA 1R87A 4RE4A 3N17A 5E9AA 2WHJA 4Z2HA 2W5FA 1B31A 3W0KA 3SIMA 3SCWA 2ZUTA 5FOOA 1OGSA 3ZQ9A 5BCAA 1O6IA 1EGZA 3VX1A 3WF4A 1BSIA 1JAKA 4JFTA 3WDHA 1E43A 2YL6A 4U31A 2EPMX 3ARRA 2WSPA 1NWUA 3WUFA 3HJEA 2XFRA 5AC5A 2YJQA 2WZHA 4PCTA 4H8VA 2DSWA 2W91A 5KEZA 3VIJA 2ZUSA 1W1PA 2DIEA 5FKYA 3MU7A 3QHMA 1E6ZA 1H5VA 1B2YA 1PJ9A 3GNPA 5IFTA 2Y24A 2XUCA 2VRQA 5A1AA 2IXUA 1LF1A 2G3IA 3GYCA 4J3SA 1AMYA 1B3WA 1OB0A 2WC3A 1G94A 1DWHM 2BNJA 1DEDA 3N11A 3VMNA 3UR7A 1ZJBA 3RJXA 1EDGA 4OOZA 5HNNA 1E6RA 1GOQA 2GDUA 4AY1A 2JIEA 2D3NA 4UZSA 3THCA 3QOKA 2ZUUA 5JIWA 1JZ7A 2X8RA 1ODUA 1VJZA 1UWRA 1NOUA 4RE3A 3T09A 2XTKA 2VRJA 3BAKA 3VGEA 4Q7NA 6A3HA 1MW0A 1V6YA 2PC8A 3B9DA 2VX5A 2NT1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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