4K7YA

Oye1-w116t
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLTVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces pastorianus
publication title X‑ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase
doi rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
total genus 151
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2013-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4k7yA00
2CLOA 2O7QA 1TPVA 3BW4A 3IGSA 5G1YA 1W3NA 2JKPA 4UTTC 5AYYA 4O17A 5EPDA 4NX5A 3KXQA 1R47A 4DXVA 4PC8A 5CSRA 4JD4A 1QMLA 5CZ0A 2R14A 3GXPA 3TSBA 2YW4A 3S42A 3IIPA 3SGZA 4O57A 3NPVA 4M6VA 4O18A 2G97A 3IIXA 2ISWA 1LRNA 4QNWA 1MXSA 3C52A 2GPTA 5LNRA 4O13A 4XKYA 3W7GA 3NEVA 2TYSA 1HG3A 3PSWA 4OV4A 1SO3A 3NPWA 4WXYA 5C54A 2Z6IA 3DFQA 1KV8A 4Y8FA 2ABBA 4JX4A 4FNRA 3CPRA 4FNUA 5D2WA 4K36A 3YPIA 1A5BA 4UFJA 3MI3A 1F6KA 2H3DA 3C8FA 1QPOA 3P8IA 1J4EA 4LRTA 4IWWA 4LRSA 3UY7A 5KMYA 3Q37A 1KV5A 2H6RA 2OT0A 3P74A 3LI1A 1WV2A 1T99A 1K8YA 2V2CA 3W6YA 3L0KA 5EL1A 3LI0A 1OFAA 2PE4A 3PG8A 1EWDA 3N73A 3QYQA 2XN0A 5E1QA 3HGJA 2GVLA 1FWTA 2VFDA 1XI3A 1OFBA 1L9WA 2E5DA 2Y88A 3A9IA 3P80A 1JCJA 1OFEA 1L6YA 3W83A 4NT0A 1C8VA 1QOQA 2V0TA 4BWLC 2V2DA 1VCGA 3MBFA 4MOZA 3CIXA 2QF7A 4JNMA 4X9SA 3S0CA 4M7TA 4FIQA 3TCEA 4ADSA 3B03A 1GG1A 5FF2A 5D04C 1XBXA 1I8JA 3SFKA 4IMCA 1OX5A 1VGAA 2R8WA 1H1ZA 5TQLA 3W7JA 3MYPA 3QM3A 3OVPA 2FPTA 1EIXA 1JUEA 3LERA 4NQ1A 4QNEA 2ISSA 3FYPA 3EX2A 3G22A 3IVSA 1KW1A 3NM1A 3O05A 3STEA 2NX1A 3PBYA 5H91A 1H7PA 4YCOA 1OF8A 1IXQA 1PL9A 3RFAA 3UWYA 1JCYA 1GJPA 2QCNA 3C3NA 3BW3A 3D0CA 1RQHA 4IPJA 3IIVA 3W7KA 3HO8A 2OCZA 3B0PA 3CTLA 3KVJA 4N9BA 4WUIA 5FF4A 2J9XA 1QWGA 3HG5A 5BRBA 3OIXA 5D2XA 1EB3A 5KTLA 4AEOA 1OFPA 1EP1A 3LB0A 5LKYA 2B7OA 3GKAA 1QPRA 3Q58A 3OG3A 3E9AA 1PE1A 1DQXA 2ZRXA 3SY5A 1OX6A 3FS2A 3BV4A 4B5NA 4JR5A 4JTLA 1GZGA 4WJEA 2E5CA 3W73A 4AHPA 1C29A 3HG4A 3HJZA 1EWEA 3MI2A 3U2OA 1YPIA 1JUBA 4LV4A 3WJSA 1F6PA 2YFNA 3EKLA 1F05A 1YYAA 5HUPA 1PS9A 4IMEA 5ABTA 4WD0A 5TBOA 4AF0B 4NXSA 5BNKA 4GE8A 5D2YA 3W7OA 1A5AA 3PF3A 4FXSA 3U8GA 3MHUA 3TW6A 1TRIA 1H63A 1LOLA 1R30A 3NQ6A 1B57A 1I2PA 2PRHA 2DZSA 5K3VA 1Z48A 1DORA 4A29A 2RHGA 5AHEA 1JCMP 4QAIA 5D03A 4UTUA 4JTJA 3QW4B 4LVBA 4M6PA 3TW7A 2E5BA 2RFGA 2WKJA 4TR9A 1OG0A 1EP3A 1XDMA 2HTMA 2FTPA 2EAWA 2ZFAA 5F1VA 2ZA3A 4HIBA 4OQVA 3VNDA 1ADOA 1KM6A 3L66A 3W2MA 5G2WA 4UFLA 1KBIA 1TTIA 4K8EA 3FIGA 1HTIA 3S8HA 4ORIA 2Y63A 1TV5A 5D30A 3R8RA 5CPOA 4IMFA 4JTSA 3I7RA 3LRKA 2CZFA 2ZRZA 1V7YA 1KTCA 1LOQA 3DH7A 2WV8A 3A5VA 3RLVA 4RXGA 2VELA 3STCA 2J27A 3E12A 2ZZ2A 3LRMA 1W54A 3B05A 3GDKA 5HMSA 2G95A 3DFOA 1IGSA 2V5BA 2Z6JA 5G1TA 1GVSA 5AHFA 2O7SA 1BWLA 3V75A 5CGQA 2WNNA 1RR2A 3PUOA 5F2GA 4IUOA 2BTMA 1GG0A 1ME7A 5E93A 1LLWA 3CM4A 4DPQA 3ANYA 1G7UA 3OHIA 2Y7EA 1G4TA 2ZA1A 3M41A 4JTGA 4H4IA 4CCEA 4RZ6A 5A8GA 3IIZA 4K7VA 1OFOA 3QSRA 5I3HA 3TH6A 4YCPA 1G7VA 2VOMA 4CQ8A 1TYGA 4K8HA 3CB8A 4R53A 3LDVA 2WSRA 4RX0A 3UWWA 4QQ3A 3BPWA 4HSOA 3EEGA 1K8XA 1YDVA 4O1DA 2P0OA 3PSVA 3QF0A 2NXGA 4U28A 1RV8A 3ABQA 3WJXA 1B4EA 1VHCA 1FCBA 3ATZA 3G18A 2HMCA 5FEXA 4W9TA 5DY2A 2P10A 3TSDA 2OZ0A 3W7LA 4M6QA 4IGHA 4X22A 3ZR4A 4NJJA 3STGA 2ZYFA 4DF0A 1WOAA 3CEPA 1TTQA 2E6FA 3S9YA 3SSJA 4UMCA 2ALDA 3USBA 4DF1A 3M9YA 2Q8LA 4HNUA 2DP3A 1FCUA 1I2QA 3T78A 4NX0A 2I1OA 1EA0A 3T7VA 3T44A 5DY3A 4ORMA 4G1KA 1K7FA 2ZTJA 3GVGA 3M43A 1YXDA 3PWAA 1JUKA 5IBXA 4UTHA 1B3OA 3P60A 2C13A 3N2XA 2UV8G 2DJLA 2Y62A 2ZZ6A 5GVJA 1B9BA 3LBCA 3EXTA 4OE7A 4Z1CA 4HN4A 1F74A 3TUUA 2X1RA 3KHJA 4QIUA 3ABOA 3C2OA 2NX3A 1JR1A 1W3IA 3W2NA 2J24A 4UXDA 4NNAA 4BI7A 5D02A 3DBPA 3WJYA 3W87A 4XTIA 4PTNA 4GRSA 3W1RA 5CPNA 5FF3A 3RNDA 1THFD 1G6CA 3DHFA 1GTEA 2ATMA 3MP3A 3NO5A 1I45A 3NAVA 2F7FA 3LHZA 1QR7A 1TSIA 2I14A 2YGYA 4UNKA 3SGUA 4Z0JA 4DO6A 1OFDA 3NPXA 1SO5A 3CQ0A 3EX3A 4ZZ9A 3FKRA 1FDYA 2P1FA 3NOEA 3S1VA 3NL2A 3UXDA 3I6RA 2ZZ7A 1O60A 4DELA 3G1YA 5LGXA 5L9FA 4R33A 3MBDA 3O1NA 4MZ1A 1G69A 1UBSA 3G0XA 4XUGA 3EWUA 6ALDA 4TU1A 1GEQA 2ZBTA 3DXIA 3I65A 3M6YA 3G1VA 4N6FA 1GVFA 3W7NA 3W88A 4AHQA 3B4UA 3G1XA 4ZQRA 3QQ0A 2YSWA 1QDSA 4JY8A 4MLRA 1AW1A 4A2SA 3DFTA 4HNVA 2EHHA 2ZTKA 1ZHAA 4FEZA 1KBJA 1LBLA 1YADA 3IEBA 3P81A 1H7NA 4Q4KA 3TXZA 4RK8A 2ZZ1A 4O54A 1G67A 3NL5A 2CZDA 2QCGA 4JYFA 4O19A 3TDFA 5LNVA 2E68A 4DPPA 4M19A 3LX9A 3NL6A 5AC6A 5L6UA 4O16A 4O8RA 1WOBA 4YL2A 2PURA 2WQPA 5C6MA 3W1XA 4GUJA 2E09A 3TC7A 2C14A 2JGYA 1S3HA 4RZ4A 1VCFA 3W86A 4N9EA 2J6XA 3GLCA 2BX7A 4AVFA 2ISVA 4MY8A 3FA5A 1LOSA 5G5IA 3NQGA 4FO4A 1VQTA 3I7QA 2Z2UA 3IGXA 3NL3A 2QCLA 4WY0F 5BMXA 1EP2A 3WJZA 5EA9A 1IXOA 1J5TA 1XBYA 4CCCA 5C5YA 2BWGA 2Y70A 1TJRA 8TIMA 4RKAA 4GWEA 1YDNA 5DCDA 1KFLA 3P5ZA 3HBLA 5EY5A 4IXXA 4UFMA 4A2RA 3C61A 3QEZA 5LZLA 5KINA 2E6YA 4UR7A 1GYNA 1FWNA 3R89A 4Y6GA 3O06A 3DFPA 4QJ1A 2C18A 1Q6RA 1M7PA 4A22A 3P5YA 2QKFA 2NXIA 3QMRA 3QC3A 3SIZA 1TPC1 1NVMA 4HNTA 1C9DA 4U4MA 1Z41A 2DORA 2DZWA 1LBFA 4DQWA 3ABSA 4E0CA 3TQ0A 2WNZA 1VPXA 2G5WA 3DHDA 1WAUA 2A7PA 3UNDA 3BVJA 4Z0SA 4JY9A 3E02A 1JVNA 3O6DA 2ZCGA 4NNBA 1ALDA 2ZDRA 3MWAA 3BARA 4N4QA 3LRLA 3N14A 4WQ6A 4BI5A 1GVQA 1JJKA 3G3DA 1FY6A 1X7FA 1KM0A 1FDZA 3IGUA 1AW2A 1QOPA 3N2MA 3W84A 1H51A 3TJXA 5FESA 2FPYA 3W3OA 4HKPA 1SO6A 4JDYA 3TFCA 1GTHA 1OX4A 4N9CA 1M5WA 4OBTA 1SSDA 4CNPA 2Z1BA 5D2VA 2FQIA 2X30A 1Q45A 4MYXA 1CX9A 3QH2A 3W23A 1OJXA 3F4WA 4NXKA 3UXAA 3L5AA 4MY1A 3KX6A 3L67A 2WSYA 2NWRA 4P2VA 4ICNA 4IX2A 4CNNA 3THQA 4FNSA 4NU7A 2OJPA 1BTMA 4O4VA 3L2IA 3M44A 2H8XA 2QAPA 4O0ZA 1SW3A 4O53A 2DZTA 5F2MA 1P0NA 1ZFJA 5KZMA 5CZSA 4JTKA 3W7MA 1JULA 1PV8A 3GAYA 3G1FA 3BLFA 3A5FA 1YXYA 2XN2A 4MVAA 3NZRA 4LTSA 3S1UA 4AWUA 2A4AA 4WX2A 3EX4A 5CZJA 1JCLA 3FYOA 1E51A 3HB9A 5D32A 1DJQA 4AXKA 2X2GA 5DBUA 5H2ZA 3VE7A 3T55A 5G4WA 1RQBA 1OF6A 3EWZA 3EB2A 1GT8A 3DZ1A 4LUIA 2C0AA 4LS0A 3CHVA 2Y6ZA 1KM5A 4GC4A 1EEPA 4WOQA 3SW6A 4P61A 3LCHA 4IX0A 5DXXA 1A50A 2GQ9A 1XL9A 3Q94A 2PC4A 5HWMA 2V30A 1H1YA 3UD6A 2GVJA 2C19A 4K39A 4JS3A 3S5YA 3R5EA 2VEMA 3QPYA 2QDGA 1VH7A 4XKYB 3WK1A 3S5NA 3W2JA 2V9DA 5DN1A 4WZHA 2XFWA 1TTJA 1KFCA 3R13A 3VKJA 3PY2A 3MI6A 1ICSA 2VKZG 4OU1A 4KFOA 5AB3A 3GK0A 1SSGA 4O15A 2W0UA 2NUXA 2WOQA 1L6WA 4MFDA 4X3ZA 3V1PA 3GIYA 3BO9A 4POCA 4JYEA 4NJKA 4UTIA 1XM3A 1UUMA 4OWGA 2OX1A 4K38A 4JTEA 3B04A 3LM7A 2QEZA 3NYZA 2VFEA 4XWUA 5T26A 1XDLA 3K30A 3M16A 1ZALA 3G1DA 1I2OA 2E1DA 4MFEA 1SZFA 1Y0EA 2ZRVA 3HPXA 1T8XA 4LVDA 3TQKA 3W1TA 1UB3A 3LTYA 4OT7A 3P61A 1LROA 5KSWA 1MEIA 3WK3A 1VLIA 1QNVA 2WPBA 1VRDA 1P1XA 1XBVA 3S1XA 1JCNA 5LNSA 2CLLA 5EKYA 3TK7A 3GDMA 1VYPX 3DU0A 2QJGA 4N6EA 1QFEA 4TX9A 1DVJA 1NSJA 2NUYA 2A6NA 3VCRA 1OABA 4JIPA 3WFAA 4OHQA 3B0UX 1EPXA 4FX8A 4IJBA 1FQ0A 4O12A 4TMBA 2R94A 5IBXC 4RV8A 1EUAA 2NXHA 3OEXA 4CLMA 1TV7A 3LGEA 1TPDA 1ZCOA 5D37A 3HGRA 1KM3A 1N7KA 3NM3A 4O1CA 2GVGA 3LXAA 2TMDA 4LOCA 1XUUA 1TIMA 3EWWA 1W5OA 2QCEA 3GNDA 3M5XA 4GUGA 1RQEA 5AHMA 4UR8A 1VS1A 2QUUA 4YLWA 3W1AA 3W7IA 3W71A 2Q3RA 1LP6A 3N19B 1XBZA 1YTDA 1JRBA 3LXBA 4AMAA 4BR1A 3NVTA 3TROA 1T96A 3W1PA 1K7XA 1AMKA 1GQNA 3DI1A 3KOFA 4I7VA 3IV3A 4EF9A 2ZZ5A 4GUHA 3LXCA 3B06A 3PM6A 4I7UA 2FPVA 4JGDA 4RXFA 1VR6A 2GQAA 3W7HA 1UCWA 2B0MA 4ONVA 5G2IA 1T0OA 3CWNA 4UMBA 3LCGA 2ZZ4A 3QRHA 2HS6A 2VENA 4CCDA 2QCHA 1HO1A 1L2UA 1TCDA 3B0VC 2GOUA 3HOJA 4O0KA 5HR6A 1N8FA 3UY8A 1SUXA 3TV8A 3TNOA 3L0NA 3T4CA 4M7SA 3H55A 5EMUA 2B7NA 3W2UA 1MZHA 5KZEA 5K4XA 1RPXA 2C6QA 2NV2A 2DZUA 1NEYA 2CU0A 1FWSA 4BFAA 2E6DA 3IIOA 3P82A 4EVZA 2CFFA 4LS1A 2VFGA 1G4PA 1KTBA 1Z44A 3QFEA 4XTDA 3E49A 4PFMA 2ZRWA 3DI0A 4NZJA 4Q32A 3GX9A 1IIGA 4N4PA 4JTFA 2I9EA 1AW5A 3U6WA 1YTEA 1IIHA 4LNYA 2CW6A 3KRSA 1ICQA 3ZS4A 3G24A 4UTKA 3KRUA 1K3UA 2RKXA 1W5QA 4LUJA 1KFEA 4R34A 4DEFA 5K4ZA 1A5CA 3QPZA 1LZOA 1FXPA 3DKLA 2GJLA 1M6JA 2AGKA 4KWVA 3HGSA 2RDTA 3PULA 2J88A 1H50A 2BLEA 1QCWA 3LCIA 4EIVA 2VXNA 2Y85A 4WXZA 4MJZA 3M5YA 2A1YA 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 4TMC A;  5AOU A;  6TIM A;  4O28 A;  5HUL A;  2JKA A;  3S5O A;  3BLI A;  1H7O A;  1TQJ A;  4JX6 A;  3HG3 A;  1OHL A;  4UIO A;  3W9Z A;  3BGJ A;  3PB0 A;  4AAJ A;  4O52 A;  5HUO A;  4N02 A;  4ML9 A;  4X2R A;  4A3U A;  1OYA A;  1R46 A;  2WO5 A;  1DV7 A;  3W1U A;  1ZY9 A;  2CLI A;  1P0K A;  5AC7 A;  4UTW C;  3P84 A;  5CSS A;  4QIS A;  2RH9 A;  3C2V A;  3NG3 A;  4MZY A;  3BG5 A;  2Y7D A;  2YPI A;  3GB6 A;  4FX7 A;  3TMQ A;  4K7Y A;  3ZWT A;  1IXP A;  5J5R A;  3EKZ A;  5CPL A;  5G4E A;  4IPI A;  2BZN A;  5HQE A;  3G3M A;  3MUX A;  1VYS X;  2H8Z A;  3MMT A;  3NQD A;  3G8R A;  3WJW A;  2GUU A;  1K03 A;  2CLH A;  5A5W A;  4ZQP A;  2OMA A;  2DZX A;  5I3F A;  3M5V A;  2B7P A;  1K8Z A;  1FXQ A;  3I68 A;  3O15 A;  1QO2 A;  3S1W A;  1ZNN A;  4Z08 A;  3DFN A;  4XBK A;  2D73 A;  2C15 A;  4NVT A;  4ALD A;  2NUW A;  3LHT A;  3W7D A;  2Q8Z A;  1YLV A;  3BW2 A;  2FB2 A;  1I2N A;  1UAS A;  2CLF A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3R7M A;  2O7Q A;  1TPV A;  3S4T A;  4RE2 A;  1VFS A;  4GVI A;  4S3D A;  1LL6 A;  5G1Y A;  5EPD A;  1VIW A;  4H8N A;  3AYR A;  8XIM A;  1PEZ A;  1ISW A;  1R47 A;  4DXV A;  5CSR A;  4JD4 A;  1QML A;  1MRA A;  5A6L A;  3QQW A;  4HA4 A;  2YBV A;  4H04 A;  4O57 A;  3B9N A;  3NPV A;  3GXI A;  4M6V A;  5I23 A;  3IIX A;  2ISW A;  4HB7 A;  5D4Y A;  3S3G A;  4NZ1 A;  1RY8 A;  3T2O A;  3C2Y A;  3HTW A;  5MF5 A;  3W7G A;  4UQD A;  1RVK A;  2F6X A;  4DWS A;  5CC5 A;  1BF2 A;  4OOZ A;  4BQ4 A;  4LGX A;  1SO3 A;  3CZE A;  3WLP A;  3T0D A;  4WXY A;  2W9M A;  2Z6I A;  5C54 A;  1KV8 A;  4LAU A;  4Y8F A;  3AMK A;  4JX4 A;  1AJ0 A;  1EQP A;  3W81 A;  3GE7 A;  4IWW A;  3REQ B;  3MCN A;  3UY7 A;  5KMY A;  1XIJ A;  2PCE A;  4LYR A;  1US0 A;  5AYI A;  2V2C A;  1D7F A;  3QGA C;  2VR4 A;  3PZQ A;  4XAG A;  4DZ5 A;  1FH9 A;  1E9Y B;  3KCO A;  1EJR C;  1OFA A;  1RY0 A;  3N73 A;  5EMK A;  2PP0 A;  1CTN A;  2BVY A;  4H9V A;  5E1Q A;  4TX8 A;  2W62 A;  1FWT A;  3EA2 A;  5EML A;  4PRW A;  1OD0 A;  1GKR A;  1L6Y A;  5A8O A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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