3WH8A

Crystal structure of gh1 beta-glucosidase td2f2 isofagomine complex
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
439
structure length
437
Chain Sequence
RFPADFVWGAATAAYQIEGAVREDGRGVSIWDTFSHTPGKIADGTTGDVACDSYHRYGEDIGLLNALGMNAYRFSIAWPRIVPLGAGPINQAGLDHYSRMVDALLGAGLQPFVTLYHWDLPQPLEDRLGWGSRATATVFAEYADIVVRQLGDRVTHWATLNEPWCSAMLGYYLGVHAPGHTDLKRGLEASHNLLLGHGLAVQAMRAAAPQPLQIGIVLNLTPTYPASDSPEDVAAARRFDGFVNRWFLDPLAGRGYPQDMLDYYGAAAPQPEDLTQIAAPLDWLGVNYYERMRAVDAPDASLPQAQRLDDPDLPHTADREVYPEGLYDILLRLHNDYPFRPLYITENGCALHDEIAEDGGIHDGQRQAFFEAHLAQLQRALAAGVPLKGYFAWSLLDNFEWAMGLSMRYGICYTNFETLERRIKDSGYWLRDFIAGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords beta-glucosidase
publication title Crystal structure and identification of a key amino acid for glucose tolerance, substrate specificity and transglycosylation activity of metagenomic beta-glucosidase Td2F2
pubmed doi rcsb
source organism Metagenomes
total genus 177
structure length 437
sequence length 439
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2013-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wh8A00
2XVGA 4BQ4A 2ZX7A 1G1YA 4MTVA 1UD5A 3WDPP 4FK9A 3U5YA 2HISA 3SCRA 1E70M 5C8BB 1ESWA 3RIKA 2PWFA 1CWYA 4PMQA 2PWEA 1G5AA 1JDDA 5I23A 1OIFA 1UR9A 2PWGA 3RM4A 2YDSA 3OZOA 4UQBA 1TMQA 1UWIA 3VTRA 4J3TA 3RJXA 4E4PA 2W92A 3CZEA 4EK7A 3WH6A 3VGFA 2XTKA 3AMGA 1E3XA 4BCEA 1IV8A 4RE2A 1B3YA 2JIWA 1UD2A 4WIWA 2D24A 3RMEA 5AC4A 4WJXA 3VD7A 3CZGA 4QLKA 5D4YA 4DWSA 3T2OA 1NWSA 2BVYA 2F61A 1VFFA 3EDEA 4Z2KA 1CNVA 1E71M 3AXHA 3SCUA 2WCSA 2VZUA 4ACZB 4GO8A 2G3IA 4ML4A 2X05A 1BAGA 1BVNP 2WC4A 3AICA 4ZE4A 1D7FA 3WQ8A 1ZU8A 1XYFA 4HMCA 3WELA 1DWHM 1WZAA 1XSKA 3AZSA 4DM2A 3PZTA 4P8WA 1UKSA 5LYRA 3ZT6A 4JAWA 1AQMA 4JKLA 1B3VA 4YPJA 2XM1A 2XFFA 2CYGA 1QOXA 1QI5A 4X0NA 1E4IA 3K4AA 2VZVA 3ZSSA 2YA2A 3PHAA 2WWDA 1NP2A 1LL6A 3AHXA 3NUKA 3CMJA 5A95A 1WDSA 3BAYA 4JFVA 1E15A 2QPUA 3HN3A 5GNXA 4OUEA 7CGTA 1HVXA 3NSXA 1P6WA 5DO8A 3AXIA 5A94A 1J11A 3UG3A 4BA0A 2YIHA 1F4AA 3AI0A 2FH6A 2YL5A 4F8XA 4KRUA 1JG9A 5A2AA 2BVDA 2JIEA 1J18A 3A4AA 3HJEA 2UY2A 3HU7A 1S46A 2WLYA 4AZGA 4HA4A 2BXYA 1FOBA 1FA2A 1H41A 3ZJ7A 3RILA 3QHOA 4DWSB 1HXJA 1UKTA 3L4UA 3OG2A 4CKQA 4HU8A 1W9XA 1BVZA 4MNLA 1QI0A 2VVSA 1GQLA 2NT1A 2VR5A 1J9YA 1J01A 1BPLB 4Z2LA 4J7RA 3KWXA 1L0PA 4J3WA 2VI0A 1JF6A 1GCYA 4YHEA 1LQ0A 3VX1A 5AYBA 3WD0A 2O92A 2J77A 1E6ZA 1EQCA 4PSPA 4M1RA 5DFAA 1EDGA 1PPIA 1GJWA 5HXMA 4ZFMA 3G6LA 4UQAA 1QW9A 5D8WA 5A6BA 1UWSA 4K68A 1H49A 3EYPA 1JI1A 2QHAA 3VDBA 4RE4A 3NDYA 1W1VA 1GPFA 4F9JA 1U30A 2CNCA 2V3DA 1KB3A 1SMDA 3AROA 2VVNA 1OD8A 1SR0A 1OGBA 1J0KA 3WH9A 2BY2A 4DWSC 4H7VA 1TA3A 4U3AA 2DSKA 1UH2A 4LYQA 3VGGA 1XCWA 4AZ7A 1QBAA 1VFOA 4FF5A 3AISA 3AIRA 5AYIA 3SUUA 1MW2A 1K9TA 4JHZA 1FHLA 4U2YA 2A3EA 1CXEA 4M81A 2DIJA 5A8OA 4P7OA 4IPLA 1DWFM 1EO7A 3GXDA 3OGSA 1R8LA 1H4PA 1E6QM 4GI6A 5BROA 3ARTA 3BAWA 3ARPA 2ZX9A 2DT1A 1GHSA 2CPUA 3KEHA 3M07A 1WDQA 2Y2WA 1F4HA 2WMGA 2W63A 3QR3A 4M82A 2QV4A 1Q6DA 1IT0A 1HKJA 4ACYA 2BHYA 3BSHA 4U2ZA 2E40A 2WKGA 5JIPA 1BLIA 1M01A 1ISZA 3WD2A 2E8YA 1N82A 2BV9A 2FH8A 3VDHA 1Y7VA 3IK2A 4AYSA 5IXEA 4IUGA 4AW7A 2XIBA 2UY3A 1E0XA 1GVYA 3PZQA 3AJ7A 3IJ7A 3WNLA 1TA3B 1OGSA 2OSXA 3DC0A 4AZHA 3L4VA 1JAEA 2J7DA 1JZ8A 1G94A 3WIJA 4M80A 3N17A 1NH6A 3A4WA 3B8SA 1KXTA 4DUVA 3GBEA 4KRTA 4X9YA 1XH2A 5D9OA 1TUXA 2WHJA 2WKLA 1JAKA 2EPKX 2CBUA 4PEEA 5GQBA 2E4TA 6TAAA 1PEZA 2Y24A 4D6IA 2VZSA 3WKZA 4MB5A 3ALFA 5BRPA 1WDPA 2D23A 4AMCA 2J62A 3EDJA 2ZXDA 2WXDM 4M8UA 2V3GA 4MJ4A 4ZEPA 3WH5A 2EXOA 1E9LA 4P8UA 3WY1A 3WBAA 1NM9A 2ZXBA 5CLWA 2GDVA 1EGZA 5D8ZA 4MDOA 3KL3A 3KL5A 3WDRA 3W81A 2AAAA 1X6NA 3ZR5A 2ZUSA 4KGLA 3W6LA 2XGBA 4W85A 1CECA 2WMHA 1O6IA 3UERA 1XSJA 4J3SA 2ZXQA 3ZT5A 2B31A 4JFWA 3CO4A 5CGTA 2VMFA 3GH4A 5FL1A 1QVBA 1Q6CA 4HOZA 5JUVA 2BXZA 3DHPA 4F66A 3K1DA 3BAKA 5IHSA 1W32A 3OZPA 1QNSA 2BY1A 1GZJA 2ZIDA 3IJ8A 1NARA 5E09A 1TFVA 3OA5A 3NYDA 2WHLA 1HIZA 1GJUA 1WCGA 3M46A 1H0IA 5ABEA 3W82A 1JGIA 3RM9A 2XFYA 1PZ2A 3CUHA 1VF8A 1QBBA 1CLXA 4BQ5A 5BXTA 1QPKA 1B30A 3AYRA 4P8VA 4A3YA 4NZCA 1EHAA 3T08A 1EDQA 3A47A 1LG2A 4AXNA 4S3JA 5E6YA 4QDMA 3OIHA 2JEQA 1UHVA 2J7FA 1KQZA 1RD6A 4JFUA 4JFTA 1EOMA 4MAZA 1VEMA 4CCDA 1WKYA 1ITCA 1QW8A 2IXVA 1ECEA 2WW5A 3WH8A 2Y8VA 2VL4A 1XH1A 4JIEA 3NSMA 3TTQA 1OD0A 3VIFA 2QMJA 2D2OA 4CD7A 4WSJA 3ZJKA 1E73M 1MQQA 3PZOA 3WQVA 4JKMA 2YKKA 3EMCA 1J0IA 2WZIA 1JNDA 2JALA 2UWFA 3ZMRA 1E6XM 2D22A 1V3MA 2VT0A 1AMYA 3MUIA 2GSJA 3RO8A 1CTNA 2DH3A 2WCGA 3W24A 4UR9A 3CLWA 2D0HA 4E8CA 3OLGA 1RP8A 3PZGA 3WL0A 2VUYA 1EDTA 2A3AA 4IPNB 3VGHA 2GJRA 2E3ZA 2CIPA 1B3XA 4Q22A 1C3FA 1C8XA 3ARSA 4TVDA 3KZSA 1MFVA 2J7HA 2PF0A 3WEMA 3ZR6A 3SUTA 5I0DA 1QNRA 1DHKA 5TD4A 5DT7A 1B90A 2G3NA 2XUCA 2UY5A 5ABHA 2J7CA 2E0PA 6CGTA 1QI2A 1JYWA 1ZBVA 3W25A 2OYMA 3WQ5A 1JFXA 4W87A 2PWHA 1UH3A 1H0GA 2F8QA 4PMUA 3GTNA 1KR0A 2NT0A 4YHGA 4MDPA 1NOWA 2J8FA 4R5EA 2W5FA 3ECQA 3K8LA 1OB0A 3OB8A 1W91A 1I1XA 3SURA 1VB9A 1UA3A 3L4XA 2XWDA 1B2YA 3GDBA 4PTXA 3AOFA 4XZWA 3SCOA 3WMSA 2BNJA 4W8AA 3VGEA 4W84A 1B31A 1V3IA 3WFLA 4LXFA 5A3HA 2ZXAA 4GPNA 4UFLA 4AD3A 3D5HA 3ZO9A 4TUFA 1YHTA 4DUWA 5I5RA 1CGVA 2HVMA 1B3ZA 1UZ4A 2XSAA 4RL3A 3WD3A 1BF2A 3MUY1 4W8LA 1ITXA 3I3BA 2EO7A 2VZTA 1BSIA 4UZUA 4PMZA 1UQZA 2XYLA 5A6JA 1M53A 3VIPA 3B9AA 2ZE0A 3IAQA 3L4TA 4D1JA 4CU6A 1MW1A 2YDQA 1BYDA 1MXDA 2FGZA 4AZCA 3VMOA 3GXMA 2O9TA 2BS9A 2J74A 3OBAA 3AMCA 1MQPA 1KR1A 4AC1X 4UQEA 3IJ9A 3SUSA 1PX3A 1C8QA 2WNWA 1VJZA 3F4VA 2QLYA 3AIVA 2D20A 4ACZA 2D3NA 1CLVA 1QI4A 3OGRA 5HPOA 3LPFA 3II1A 3AMDA 3MUAA 1UR8A 3EMQA 3N15A 1JD7A 2EPMX 1CXKA 3UR7A 3W29A 2J7BA 1EIBA 4XZBA 5GNZA 4PMYA 2FDMA 1PZ3A 1J0JA 1KBBA 3U7BA 4B3KA 1FHDA 2D0FA 4HMDA 3VX0A 3TONA 3AHYA 3NCOA 3ARZA 3WQ4A 3WD4A 1WAWA 5A6MA 3CIVA 4C7DA 4H8UA 4P7NA 1HJUA 1HL9A 2WZEA 2VCCA 2YA0A 3WQWA 4AIUA 3SCNA 4MNMA 4AZCB 4QCEA 4U3CA 2E9LA 1QHOA 1GQIA 5A8QA 1QHPA 1WZMA 3WNNA 2Y4SA 4UOQA 5CG0A 1YQ2A 5BXRA 1C8YA 1QNOA 1W3LA 1X6LA 4DWSD 3NJ3A 1QNQA 4Y7EA 3POHA 1JYNA 2YBTA 4N42A 2GFTA 1RPKA 1VIWA 2CXGA 4ZENA 3THDA 3U5UA 2VQTA 3L4YA 3AS2A 5CZKA 1K9DA 4PSRA 2MANA 1DWAM 1VBRA 3VMPA 1UR4A 1KGWA 4URIA 4W5ZA 1KXQA 2J4GA 3SCVA 3LMYA 3CGTA 2QPSA 2GK1B 5IDIA 3WNPA 1E40A 3QHMA 3A4XA 5CXPA 1UD4A 5DF0A 1JDAA 1GNXA 2VURA 2BHUA 1A47A 1GQJA 1KGXA 4XV0A 2BFGA 1W3JA 2WYSA 2CKSA 2DT0A 1CXLA 1BYAA 4UFHA 1ZBWA 3SUVA 3VKKA 3N1AA 3UG5A 1TG7A 4W8BA 1RP9A 3OLEA 3RPMA 1OBAA 1UKOA 3VIMA 3AS0A 1CGUA 4PUEA 1V3HA 4FLQA 3WF4A 3AIQA 5A6AA 4RE3A 2XVNA 3PZIA 1VFUA 4JL1A 3N18A 3F5KA 5IHRA 4Z2HA 3W38A 3PTQA 3VM5A 3LPPA 2WANA 1W1TA 2ZUVA 3SUWA 2FHFA 1NP0A 1R7OA 1PJ9A 5FOOA 3L2MA 4CCEA 4WF7A 2J25A 2O9OA 5EB8A 3N11A 3MMUA 1NQ6A 3W37A 3BAXA 5HDRA 1NOFA 3WDQA 1XHGA 4UFMA 2A3CA 4HZ8A 3OLDA 2EQDA 1W3HA 1ZJBA 2OWCA 5A6BD 4PRWA 2WVSA 1KXHA 4OBRA 1V03A 3BSGA 1ISWA 1DTUA 3WN6A 2FHBA 3VGBA 4MB4A 3WQ6A 2JF7A 4OKDA 1Q6GA 1E72M 3APGA 2YL9A 2ZUNA 4H2CA 1DEDA 1UR0A 4LPCA 1QNPA 4W7UA 3EDFA 4UFKA 3SCWA 4F79A 8A3HA 3TTYA 2WMIA 2ZOXA 1C7SA 2YJQA 2BY3A 4JKKA 3FAWA 2DH2A 4QCFA 1GOMA 4NSBA 1TCMA 1W2VA 1R86A 1OINA 1BG9A 1E5JA 2PI6A 1NWTA 2J7GA 2XJ7A 3HMCA 4AD4A 5FCZA 4HMEA 1HX0A 3MS8A 3GYCA 3FAXA 3RCNA 1KCKA 1HJWA 4XX6A 2WMFA 4GQRA 3W26A 2DQXA 1V6UA 1HJVA 1E5NA 3VGDA 4TX6A 3ZQ9A 3CZKA 3PTMA 3GM8A 1XV8A 1PAMA 2G3MA 5E9AA 1CXIA 4ATLA 1HT6A 2ZWZA 5CPTA 2ZX5A 2WVVB 2CESA 3BAJA 4NF7A 2XIIA 2TAAA 3QOMA 3SIMA 5A8PA 1VEPA 1V02A 1W3KA 2IXUA 4PMVA 1HJQA 4QFUA 1UD8A 2W66A 1R85A 4AISA 3AIBA 7A3HA 4GO9A 4AY1A 3VIHA 4B9YA 3SCSA 4KWUA 3VIOA 4U5IA 4HU0A 3A3HA 2WB5A 4NRRA 4CVUA 5BYWA 2Q8XA 2WMIB 1OT2A 1LWHA 2D3LA 3CUIA 2G4FA 2XVLA 3TA9A 1CGWA 1OSEA 1H2JA 1M03A 1HP5A 1UOKA 3N9KA 4FLOA 3WF0A 3MMDA 3VU2A 1OT1A 3POCA 3VOCA 4D72A 2VQUA 2YA1A 1UYQA 2JFEX 2A3BA 4ZXLA 1W1PA 5CLTA 3UR8A 3G6MA 2QF8A 1HKIA 4HP5A 1AVAA 1B3WA 4AD1A 1JYXA 5JBDA 2O9RA 4CN6A 3FN9A 2V3FA 4NRSA 1NOUA 4H8VA 3VO0A 4BZYA 2W4XA 3WEZA 1PIFA 1ODUA 2VCAA 3K4DA 1Q6FA 1SYTA 2ZUUA 3QGVA 4OOUA 2V38A 4IISA 1WE5A 2D1ZA 3W4RA 1EQPA 4DUXA 2GDUA 4OBSA 4R27A 2DSVA 3CZ8A 1XRVA 3O9NA 5CSYA 4M56A 1VFMA 1OIMA 1H09A 4EKJA 1GHRA 3BH4A 1E56A 3GBDA 1ZJAA 3FNDA 3W27A 1JYVA 3KE0A 3UG4A 4U31A 2AOSA 5A6KA 2RGMA 5LA0A 2GJXA 1PX4A 1ZL1A 2ZUMA 1WP6A 1X1NA 3AHZA 3I3DA 3AS3A 4KMQA 2WK2A 3AZTA 3WFZA 3VD9A 1V3LA 2VX4A 1W2PA 3T0BA 3BMWA 4C7FA 1V6XA 1MFUA 2DSWA 1LLOA 3AQUA 3GNPA 4H41A 3VD3A 1HKMA 1MQRA 4HTYA 1PIGA 1E6SM 4GI8A 1W9DM 2XSBA 4B15A 3UESA 3OGVA 1KFWA 4DM1A 1AQHA 1RH9A 3MO4A 2DIEA 1W9VA 5IFPA 2X2YA 1OM0A 5E6ZA 5ABFA 1H1NA 3NDZA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XVG A;  4BQ4 A;  2ZX7 A;  1G1Y A;  4MTV A;  1UD5 A;  3WDP P;  4FK9 A;  3U5Y A;  2HIS A;  3SCR A;  1E70 M;  5C8B B;  1ESW A;  3RIK A;  2PWF A;  1CWY A;  4PMQ A;  2PWE A;  1G5A A;  1JDD A;  5I23 A;  1OIF A;  1UR9 A;  2PWG A;  3RM4 A;  2YDS A;  3OZO A;  4UQB A;  1TMQ A;  1UWI A;  3VTR A;  4J3T A;  3RJX A;  4E4P A;  2W92 A;  3CZE A;  4EK7 A;  3WH6 A;  3VGF A;  2XTK A;  3AMG A;  1E3X A;  4BCE A;  1IV8 A;  4RE2 A;  1B3Y A;  2JIW A;  1UD2 A;  4WIW A;  2D24 A;  3RME A;  5AC4 A;  4WJX A;  3VD7 A;  3CZG A;  4QLK A;  5D4Y A;  4DWS A;  3T2O A;  1NWS A;  2BVY A;  2F61 A;  1VFF A;  3EDE A;  4Z2K A;  1CNV A;  1E71 M;  3AXH A;  3SCU A;  2WCS A;  2VZU A;  4ACZ B;  4GO8 A;  2G3I A;  4ML4 A;  2X05 A;  1BAG A;  1BVN P;  2WC4 A;  3AIC A;  4ZE4 A;  1D7F A;  3WQ8 A;  1ZU8 A;  1XYF A;  4HMC A;  3WEL A;  1DWH M;  1WZA A;  1XSK A;  3AZS A;  4DM2 A;  3PZT A;  4P8W A;  1UKS A;  5LYR A;  3ZT6 A;  4JAW A;  1AQM A;  4JKL A;  1B3V A;  4YPJ A;  2XM1 A;  2XFF A;  2CYG A;  1QOX A;  1QI5 A;  4X0N A;  1E4I A;  3K4A A;  2VZV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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