4OQV | Genus

Total Genus 139

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	139
sequence length	362
structure length	353
Chain Sequence	DERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Fluorine Modulates Species Selectivity in the Triazolopyrimidine Class of Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus	139
structure length	353
sequence length	362
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2014-02-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4oqvA00

4JTFA 4D2JA 3NQVA 2VELA 3IVUA 2QR6A 3W1UA 4N2YA 3QM3A 1JCNA 3E12A 3BW2A 3ABQA 4WD0A 3L0GA 2YYUA 2V0TA 4RCXA 2Y70A 4Q4KA 4N9BA 1ME9A 4MFEA 4JEQA 3W2UA 1FY6A 5F2LA 5C54A 3UWWA 4JIQA 3DENA 3QW3A 4S2BA 4O13A 4POCA 4R33A 2YW3A 1ZNNA 3TU9A 2J6XA 3W1AA 2D73A 3TR2A 3HG2A 3M5XA 4JY9A 3Q2DA 3LHZA 5DCBA 4FXSA 4ZVJA 4LW7A 4NJHA 4HNTA 2V5LA 1MXSA 3NG3A 3B05A 4XZ9A 2G96A 3G1YA 1S5VA 3N2XA 1VLIA 1KTBA 3LTPA 1EIXA 3W7JA 1UJPA 1LROA 2AGKA 4O16A 5AYYA 3NQCA 1CI1A 4IXXA 4I7UA 4GUHA 2QCMA 1G7VA 5DY2A 3PC0A 5LGZA 1SFLA 1H51A 3RU6A 3P84A 5HWJA 4OE7A 1DL3A 2H3DA 2PRHA 4JTHA 3SW6A 3MI6A 1I2NA 4MFDA 5HULA 4LVBA 5BMWA 3T78A 5K7JA 2A7PA 5L9FA 3W83A 2TSYA 4M6VA 3B04A 1EA0A 3IV3A 2DU2A 3TCEA 1XCFA 4AF0A 3NQMA 4X9SA 2ZFAA 3RMJA 4O19A 1UB3A 3UZ5A 4O4VA 4FNTA 2BSLA 5AC8A 2J9ZA 3R5EA 4KKXA 3LGEA 2AQWA 4KFOA 3PSVA 4CLMA 4O57A 5F4SA 1L6WA 2DJXA 2O7SA 4UTHA 3E96A 5CZ0A 3LCLA 3LHVA 4A2SA 3NEVA 3C2RA 4GUFA 2E1DA 1T0OA 1THFD 4AXKA 3K30A 1TQJA 4MOZA 3HG4A 1O95A 1VR6A 1W5NA 2QJIA 2RFGA 4YMZA 3W1PA 2G95A 3NPXA 3M44A 4QNEA 3LCHA 2P0OA 3P8IA 3NOEA 3GNDA 3BW4A 1AMKA 2TRSA 1M6JA 3LXCA 2DZSA 2ZZ3A 1ZHAA 1QWGA 1HG3A 2ZZ7A 3L67A 5LGXA 1VCFA 4DF0A 2YR1A 2V30A 4XWUA 3CLMA 5D2TA 1M7PA 5D09A 4NNCA 4UFJA 1G4TA 2QCEA 1FWSA 3DHDA 1K8ZA 1YTEA 1DJQA 3PBWA 3R13A 1XL9A 2WOQA 3LTSA 3BLFA 1ZAJA 3M43A 3MJYA 1XI3A 3PAJA 3MW7A 3KOFA 4UMCA 4ZQPA 4LUJA 5BRBA 3LV5A 3CB8A 2VXNA 1X1OA 3DFTA 2CLKA 3OG3A 4IWWA 3W7DA 2X2GA 3THQA 2ZRVA 3W73A 2YZRA 1OVDA 3STGA 3GX9A 4M7SA 1Q3NA 1EP1A 2HSAA 3IIOA 5GVJA 1TRDA 4NZJA 3UWQA 4O52A 2YPIA 2ZA1A 5DY3A 3W7LA 1TB3A 3ZFHA 4QITA 3TSDA 4CNPA 1EP3A 1EUAA 1XBVA 1KM1A 2OZ0A 1H7NA 2Y6ZA 4JICA 4CCCA 2WQPA 4PC8A 1PV8A 2WNZA 4CCEA 2OX1A 3NL5A 4LC8A 3FYOA 2FLIA 2Z6JA 1L9WA 2YW4A 1OF8A 1FCUA 2WO5A 1M5WA 2WNNA 3E9AA 4TU1A 3ATYA 2PCQA 3TFXA 4K37A 4NQ1A 1JR1A 3W1QA 3G8EA 3CU2A 2IQTA 2NUYA 5K3VA 3QJAA 3L68A 3S0CA 5C6MA 5G1YA 1MO0A 3W3OA 4EOUA 1N8FA 3BGJA 4XQ6A 1SSDA 1WBJA 1XXXA 1JUBA 5C55A 4ALDA 3S1UA 1VLWA 5D38A 4EF9A 2Q3OA 3CEPA 3W1MA 1I2RA 1XFBA 3HBLA 1MSSA 4UTIA 3NL3A 3U8GA 3NQ2A 3TKFA 5KMYA 1T96A 2DORA 3UWVA 4N4QA 1GT8A 2GVGA 3LERA 1OFOA 2RDUA 2ATMA 1YADA 1TTPA 2W79A 3SGUA 4PEKA 3GVGA 2DJLA 4ZQCA 8TIMA 1GTEA 1UASA 1H61A 3W1NA 1SO6A 1TJPA 5LNSA 4UR7A 4IMFA 2FDSA 2A6LA 3PWAA 1VYSX 1Z48A 2GQAA 3MBDA 1WAUA 3TSMA 1JULA 3NQ7A 5E93A 3CHVA 3G1HA 3GDLA 1KM2A 2CLLA 1NSJA 1ME8A 4CQAA 3G0XA 3B03A 2WV8A 1EX5A 4DXVA 4Z1CA 1TPC1 2YXGA 5AHFA 4Z0SA 2QJGA 2DP3A 1L6YA 3LLDA 3JS3A 5FF0A 3O6CA 1H7XA 3EEGA 1I4NA 1OFDA 5I3FA 4IMCA 3O63A 4PH6A 4XUGA 1G4PA 3WK2A 3NQEA 4JTSA 3FYPA 5I3GA 4O17A 2GQ8A 5AFDA 4K39A 5EPDA 2ISVA 3DH7A 4P2VA 1GG0A 4EF8A 4C1LA 1S3HA 4JTEA 1FWTA 1JCLA 5KZDA 1RD5A 3EKZA 4JTKA 3F4NA 3PY2A 1LTDA 3C56A 1A5SA 4HKPA 1XBYA 2FPVA 2B7PA 4Z1BA 1ZALA 2UV8G 2VFFA 2J24A 1I8JA 1C8VA 3PG9A 1ZAHA 3B0UX 3C4UA 1TPVA 2ZRWA 3MP4A 2A0NA 1KM6A 1OK4A 4JTGA 5FEZA 3L5LA 1QOQA 1OYBA 3M6YA 1LBFA 3GKFA 2ISWA 3W7GA 3T44A 4RZ6A 5TQLA 4DO5A 4XKYA 1XDMA 3LTYA 4AB4A 4CQ8A 2GUUA 2RH9A 1BWKA 4UIOA 5EBUA 4OV9A 3FOKA 4LTSA 3O05A 3PR2A 4MYXA 4NNAA 2Y62A 3C2FA 1JRBA 1O60A 3QSRA 3STFA 4ML9A 3AO0A 5F1UA 3FIGA 3T55A 1X7FA 4UC5A 2PRLA 3ANYA 3QQ1A 1EP2A 3L5MA 4AWUA 3PBVA 4LS1A 1EB3A 5FEWA 2B7OA 1ZY9A 2Z6IA 3M1ZA 5EMUA 4RXFA 5F4WA 1OFPA 2OJPA 3KVKA 3CIWA 4DPPA 4BI5A 4X2RA 2OCZA 4UUIA 3M5ZA 1XBXA 2VFDA 1VCGA 1K3UA 3KRSA 4K38A 1TV7A 3CTLA 1R47A 4FNSA 4O1DA 2A6NA 1B4EA 1GVOA 2CWNA 2ATSA 3NM3A 2VOMA 4N9DA 3NPWA 3P60A 1KFKA 4QIUA 4PA8A 2Z2UA 2E5CA 1HUVA 2QCFA 4UTUA 2FB3A 4YWIA 4RK8A 2QKFA 1U5JA 2R94A 1QAPA 4AMAA 4LOCA 4M6PA 4JTTA 2ZA3A 3LCFA 3Q94A 4S2CA 4UMAA 3QMRA 4A3UA 4WOQA 3UXAA 2TMDA 5F4XA 2YFOA 3SECA 2CLHA 3W7EA 4BFAA 2J27A 2NX1A 3TC6A 3S6DA 2NXGA 1W54A 2R14A 5CKSA 1FDZA 1KLZA 3O1NA 4QJ1A 4ZQRA 1SZNA 2DZXA 4TIMA 4GE8A 3V1PA 2XFWA 5CPNA 5LNRA 1ALDA 1DV7A 5K9XA 3DFNA 1G7UA 3FJ6A 3HGOA 1DHPA 2A85A 1W1ZA 4O53A 1Z44A 4NXKA 3G1AA 1VHNA 4Q33A 3DAQA 3MI3A 3BVJA 3STCA 3OVPA 1DJNA 3PUDA 2CFFA 2JGQA 3W7RA 2QJHA 1ZFJA 2ZRYA 5TBOA 4IGHA 1KV8A 2B4GA 3LBMA 4G1KA 4WX2A 2Y7EA 3UWZA 1YPIA 4IX0A 1A50A 3TX9A 3NQAA 4FX7A 2QCCA 3PUOA 2Y63A 1H7PA 3S1XA 1R2RA 4HPXA 4FNUA 3S8HA 1FCVA 3DGRA 3SIZA 2QDHA 3ABSA 1TV8A 4EVZA 1YXDA 2H90A 5DLCA 3OIXA 1TMHA 4MZYA 3O8AA 4WZHA 1R2SA 3C3NA 1K03A 4QISA 2E6FA 3W2KA 2V2CA 5CPOA 4RZ5A 4Y9AA 4CNNA 2XN1A 3P81A 4JTUA 1K8XA 1QO5A 4J9JA 2GOUA 2E5BA 1F6PA 3HGJA 3HG5A 3GDTA 3QH2A 2X30A 3KFTA 4LY8A 1A5CA 1DQWA 3HGSA 2ZZ6A 3M9YA 3TIMA 2V82A 4UXDA 4GXMA 4UNLA 4AVFA 3OHIA 3DHFA 4PCFA 4P61A 1HO4A 2A2IA 2E6YA 4NVTA 5AC7A 4QAIA 1H62A 3WJZA 4ADSA 4MZ1A 1KM3A 4MLJA 2TPSA 4NX5A 2QDGA 1F5ZA 1FDJA 2E6DA 4DF2A 1AK5A 5AYZA 2VEPA 3R12A 2Y88A 2BTMA 4QM1A 1G4SA 1OFBA 2YFNA 1N55A 4O10A 1KW1A 3CM4A 3SI9A 1GVSA 1RPXA 1W0MA 5U4NA 2ZTJA 2C14A 1QFEA 5IBXC 5EKYA 1AW5A 3MP5A 2C0AA 3NQFA 2QAFA 1GVRA 3B8DA 1IXPA 4E2DA 5A5WA 4FNRA 1FQ0A 3CEUA 4FNPA 2KZHA 4AHPA 3QPZA 4OQVA 3TUUA 3W7KA 4HHPA 3PB2A 3F03K 5J5RA 3C2EA 3TNOA 5CZTA 3WK1A 4ORMA 1Z42A 5G2WA 4XTDA 4O0ZA 3FA5A 1QO2A 1H1YA 3U6WA 1LOQA 4JX5A 4HN4A 2ZBTA 1W5PA 2CW6A 2X1TA 4NJGA 3NQGA 3EKLA 2V2HA 3W74A 5D32A 3ZWSA 3A24A 3UD6A 5AHMA 1F05A 1PHWA 3LDVA 1RR2A 3W1LA 4JTLA 3EXTA 1GWJA 1P4CA 3N3MA 4YL2A 4RLIA 2VEIA 3UZJA 3EX4A 3IVTA 2A7NA 1J4EA 4UFIA 3P7YA 4ZQMA 1OX4B 4KWVA 3GIYA 3FLUA 1F2JA 2FTPA 1WBHA 1A5AA 4FHAA 3QMSA 1Z41A 3DKLA 1ML1A 4WY0A 3SGZA 3KHJA 5BMXA 3G3MA 4BWLA 1TO3A 1ME7A 3GDMA 3NAVA 4LWWA 3LM7A 3TROA 5HWNA 4N02A 4ORIA 3ABRA 4CCDA 4I7WA 1B3OA 2QCNA 5EY5A 4M6QA 2E09A 1OFRA 3W6YA 3BARA 3L2IA 1LORA 4AAJA 2I14A 2R8WA 1VYRA 2YX0A 3L0KA 4GJ1A 1RZMA 1FWWA 2DZWA 2FPTA 1W3NA 3DKJA 3QYQA 1I2PA 3NDOA 5D03A 3L66A 1JJKA 1YDNA 3OA3A 1OK6A 4U4MA 3TMQA 3W72A 1AW2A 1XM3A 2WPBA 3M5YA 1W37A 3I7RA 4RJEA 3FEMA 1NF7A 2Y85A 2WSRA 1SW7A 2H8XA 3BG3A 4FX6M 3M0ZA 1QR7A 3HPXA 1K7FA 3A5FA 5EL1A 4JY8A 1GVQA 3PUEA 4DO6A 3UWYA 1R46A 4K36A 4TX9A 5K9DA 2NXHA 5F2MA 1MZHA 1TPH1 1Q6LA 2EHHA 4MIMA 3S5OA 2ZZ5A 4EIVA 2E77A 2ZDRA 4XTIA 1ICPA 3QF0A 4K8EA 2WSYA 2YDAA 1H7OA 1TPDA 2XN0A 3L5AA 3GXTA 1IIHA 1EWDA 1KA9F 2QCDA 3LCGA 1T99A 1JUKA 4A21A 3M5VA 1XUUA 3W7HA 1OX6A 3QZEA 4RKAA 5CPLA 2EKCA 2FQIA 3HO8A 1PVNA 2OMAA 2V5BA 3V75A 4Y90A 1GYNA 4DBDA 1LYXA 2GJNA 1WX0A 1XBZA 2OT0A 3WFAA 1WOAA 4WOZA 5IBXA 3NYZA 1FWNA 2W6RA 4YCPA 1HFBA 4R53A 4JYFA 3EXSA 2J9XA 3H53A 2HTMA 1QDSA 3M47A 3NL2A 4MPQA 1ICQA 3G18A 4JS3A 1YDVA 3HIJA 4TO8A 4O28A 2NUWA 4JTIA 3S5NA 2JBMA 4GWEA 1W5QA 3P67A 3PSWA 3IIXA 3M16A 2A4AA 3DI1A 4R7JA 4MZ8A 3G22A 2CLMA 3TV8A 3ELFA 1DOSA 3C61A 2Y7FA 4HSNA 2V81A 3RK8A 1D3GA 4MY9A 4AWSA 5FESA 1J2WA 1H50A 3MYPA 1G67A 2F7FA 4AEOA 5H2ZA 4MJZA 2ZCGA 1YTDA 3S9YA 4MKNA 1G4EA 1NFBA 5FF4A 1KM0A 3W76A 3G8RA 1YXYA 3GXPA 3TXVA 1FCBA 1QCWA 3G24A 3BLIA 3UXDA 1S5TA 4AF0B 5CSSA 3QFEA 4QSHA 4Z0JA 3W07A 1KFEA 3L65A 1LBMA 3HG3A 4JGDA 5HUOA 3W85A 4K6AA 4NT0A 3EXRA 1SO3A 4LVFA 4DO4A 1TPEA 2NV1A 3CWNA 1VGAA 4UTWC 4N9CA 3LI0A 4CNOA 2YYTA 2Q3RA 1C29A 1TJRA 2B7QA 2X16A 3N73A 3IVSA 1SO4A 2GVJA 3W7OA 3EWUA 4MLRA 3N19B 4JYDA 4O15A 4LVDA 4O1CA 5D2XA 3T40A 3WJXA 1XUZA 3B0VC 1FBAA 5F2IA 5KINA 4MYAA 1VYPX 3BLEA 3NPVA 1IXNA 1SPQA 3DU0A 3FJLA 4LC6A 1VPXA 1B57A 3LRMA 1VRDA 1AW1A 1HTIA 2ZRXA 3INPA 2V8ZA 5HWMA 3LBCA 2GPTA 1LOSA 1Y0EA 5K2ZA 1N7KA 5FEPA 4MY8A 5IM51 4XBSA 1TTIA 4M5PA 1IXQA 1EEPA 1LRNA 2PURA 3QEZA 5I3KA 4OT7A 2PC4A 1EUNA 1UUMA 1TYGA 2VFEA 4DEFA 6TIMA 1L2UA 1QOPA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4OQVA

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