4OQV | Genus

Total Genus 139

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	139
sequence length	362
structure length	353
Chain Sequence	DERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fluorine Modulates Species Selectivity in the Triazolopyrimidine Class of Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	139
structure length	353
sequence length	362
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2014-02-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4oqvA00

1HO4A 5CPLA 5D32A 1GOXA 1G4TA 5DXYA 3IIZA 1CI1A 3C3NA 5A5WA 3AO0A 1UUMA 2E1DA 3BW2A 1BWKA 4ADSA 3LB0A 3KVKA 4AWUA 2FB3A 2J9XA 3LCXA 4DPPA 2KZHA 4ZMGA 1YXDA 3CT7A 4MJMA 1GZGA 1DHPA 3TJLA 1TTPA 3MUXA 3TXZA 4QIUA 1S3HA 1THFD 3LTYA 1WOBA 1C29A 2WJZA 4L4MA 2PRMA 1NF0A 1XCFA 2QCMA 5G4EA 2GQAA 3O63A 5LGZA 3LHTA 2Y61A 3STFA 4MYXA 2YFNA 5SWUA 1K8YA 3FKKA 1KM5A 4O13A 1IXOA 5D2VA 2CWNA 3LM7A 2Q8ZA 2V5LA 5EBUA 2ZRXA 4DF0A 4ZQOA 2A7PA 3EKZA 2R91A 1K8ZA 2DZSA 3B0UX 4WOQA 2HMCA 5AHEA 3NOEA 2FB2A 3DZ1A 4JTSA 2QAFA 5HQEA 5LSMA 2TYSA 4R53A 3A9IA 2X1SA 3M43A 3A5FA 2J88A 3CM4A 4TX9A 4CCCA 3U6WA 5K4ZA 2ZA1A 1K7FA 1W8SA 2TMDA 1G4SA 3GNNA 4FF7A 2QCCA 5F4SA 1GG1A 1FXPA 1YADA 5KZMA 1GYLA 3E0IA 2QUTA 3SGUA 1IF2A 1W37A 4M6PA 4ZQRA 3ABRA 3G8EA 1LOLA 1KW1A 3TJXA 2ABAA 3FJ6A 5HUOA 5LNVA 2CZFA 2A7NA 2OX1A 1SQ7A 3B8DA 4JTLA 1H1YA 1YLVA 3W1PA 2YW3A 3TU9A 1L6WA 2F84A 3GK0A 3LRKA 4NNCA 3SGZA 3UY8A 4FEZA 4O12A 4D2JA 3C2VA 4IJBA 1K02A 4CQAA 2YCEA 3HF3A 4XWUA 2G97A 2BWGA 3ATZA 3TCEA 4E0CA 1SO4A 1I2RA 4IX0A 2WSRA 3LXAA 5LNUA 2XFWA 1W3NA 2ZBTA 3EWXA 2E6FA 2WQPA 3DFOA 3OVQA 5D33A 4CQ9A 4PH6A 1KTNA 3FS2A 3G1SA 4KWVA 3DFTA 2BLEA 3NQCA 5D2TA 5D05A 4NZFA 1I4NA 2NX3A 3ANYA 1TMHA 4FNTA 2GOUA 1TJPA 4RK8A 3ZWSA 3KFTA 5DELA 1KBJA 2GQ9A 2H8ZA 3I7SA 4NQ1A 3LLDA 1X7FA 3F1QA 5EYWA 5G2WA 3HQ1A 4LC6A 1ZJIA 1JQVA 3W2LA 3W22A 4FNRA 4IXHA 4JTKA 3T44A 2V0TA 1EP1A 4XTDA 5BW6A 2Z2UA 1H7OA 5K9XA 3L0GA 2DZXA 2DP3A 2X2GA 1TSIA 1DORA 1XUUA 2A4AA 2AAMA 4NZJA 1ZENA 4S2CA 5D37A 1AMKA 1WA3A 1P4CA 5DXXA 3LRMA 3HG4A 2FTPA 4N6EA 1JRCA 3MHGA 5EL1A 2VFGA 4TMCA 1Q3NA 4M7SA 1OYBA 4YLWA 2CLIA 5HMSA 3TDFA 3TUUA 1ML1A 3DI0A 3DGRA 2ZRWA 4P2VA 1YPIA 4JDYA 3ZFHA 1EX5A 4NX5A 1KTCA 3FLUA 3E02A 1BEUA 4K8EA 2CLFA 1AK5A 4K36A 1W54A 4LVFA 5BMXA 4TIMA 3E9AA 1OF8A 4XBSA 3W88A 3W74A 3USBA 3CLMA 1TPVA 5TBOA 3ABQA 3CEUA 3I65A 3S9YA 2G95A 1OK4A 5AN7A 3HG5A 5AC7A 2ATMA 3W84A 2E5BA 3MMTA 1KM4A 3DU0A 3BLEA 5I3GA 1VYSX 1YYAA 3WJXA 1G67A 2WSYA 5D30A 3KVMA 3W23A 2F7FA 1FWSA 4QAIA 3S42A 3W73A 1GEQA 1OK6A 3GR8A 4CNPA 1ADOA 3G0UA 4DXVA 3O6DA 5G2IA 3SI9A 2GPTA 3LHWA 2TPSA 4NJKA 4TO8A 3EWUA 3NQ8A 4O57A 4PL2A 1KM2A 3W1XA 3M5VA 4GRSA 2QCDB 1LLWA 1YTEA 3TE9A 4Z1BA 1SUXA 5F1UA 4NJGA 2NXIA 3DI1A 1OX4A 5IBXC 4LV9A 2QCLA 1H61A 5TIMA 3B04A 4CNOA 3G1YA 3NPVA 3P82A 1YDVA 3NQVA 1YTKA 1PHWA 1H5YA 3F03K 3BG3A 4AMAA 3TH6A 3QH2A 1KM6A 3G18A 1HUVA 1VYPX 3QPYA 2GQ8A 1F5ZA 1GVSA 2RH9A 4JD4A 5DCDA 3TSDA 1O5XA 5I3JA 2JGQA 3DAQA 1TCDA 2VC6A 1FWRA 3TFCA 3PSVA 3NQDA 3BPWA 4QSHA 5KITA 3MP3A 3WFAA 4FB7A 5EY5A 3UPBA 3LX9A 3MBFA 1VR6A 2C3ZA 3N2XA 3EB2A 5CZTA 4JXCA 4N2YA 5D2XA 1JULA 2V5BA 4Z0JA 3WK1A 3U2OA 1NSJA 3FOKA 3LHYA 3SW6A 1OFEA 4MLRA 3GYEA 1XBYA 3G22A 3GB6A 4ADTA 5CSSA 2YPIA 3M5ZA 3TSMA 3I7QA 4AF0B 3N9SA 4XKYA 4JTUA 1JCMP 4UFMA 5G5IA 2ZCGA 1OJXA 3W7MA 1VRDA 5U7SA 1SW7A 1QFEA 4E38A 3G1HA 2V81A 2E68A 3LI0A 1N8FA 2I1OA 4Y6GA 4DO6A 4PTNA 2Z6JA 3UQNA 2GVLA 3W1TA 3TA6A 2NX1A 4L4LA 1HL2A 2C1HA 2NUWA 3TK7A 2QDGA 3W7KA 3OG3A 1Z41A 4O1BA 2A85A 3PBYA 1TV5A 3RFAA 3IIPA 1CW2A 4K7VA 3H55A 4NUWA 4RR4A 5FI8A 3TC7A 4JR5A 3S1UA 4WXYA 5FESA 3IVTA 1IIHA 1PHQA 1V7YA 2QJIA 3B06A 4DF1A 1M7OA 4TMBA 5F2GA 5I3FA 1EPXA 2PC4A 1W5OA 2WNQA 3EX1A 4MPQA 1OX5A 4RX0A 3EXTA 3S5YA 4RJEA 1JUBA 2CLHA 4U28A 3TFXA 4OWGA 4O50A 4X2RA 3FEMA 3M9YA 3NL6A 5LGXA 3OBKA 1VQTA 1TPDA 5HWMA 1X8FA 1MEIA 4NNBA 1F73A 3DHDA 1R2TA 3LDVA 1GVQA 3UXAA 1LBLA 1TTQA 2CLKA 3HIJA 2V30A 4PEKA 1KFBA 2J9ZA 5K2ZA 1M5WA 4HKPA 1QPRA 4IMDA 5FF7A 1XI3A 1OG0A 2HTMA 3NNTA 4BI6A 5AB3A 2Q8LA 5BRBA 1H7WA 3OA3A 1SZGA 3KVJA 2VENA 3QMTA 2CLOA 3KHJA 1FWTA 1TPH1 1FDJA 3INPA 1A5AA 5LHFA 3NPWA 4UNLA 2NUXA 4LTSA 2YX0A 1UASA 3FYOA 1F76A 3L9CA 3NQGA 1Q6QA 2ZA2A 3LRLA 5KSWA 3W7JA 3CWNA 3W1RA 4BR1A 3PY2A 3MWAA 5C55A 4UFJA 1XDMA 3CIWA 4UFLA 4MVAA 3PUDA 3I7RA 3TQVA 3NGJA 1OYAA 3VCRA 4CCDA 1T8XA 2Z6IA 1YPFA 3DENA 4Y96A 4DBEA 2E6DA 4I7WA 2EAWA 3W7NA 3PF3A 5FEXA 1LP6A 4GWEA 2DJLA 3RU6A 2X1TA 4S1FA 3U8GA 2B0MA 4JS3A 4MFEA 1ALDA 3RLVA 3TNOA 4C1LA 4NJJA 3O6CA 4NXSA 3L68A 2Y85A 3KAOA 3PBUA 3M5XA 1LM1A 3TV8A 1JR1A 5G1TA 3PR2A 1YTDA 3NYZA 1MSSA 3ELFA 1KFCA 3UZJA 1S5TA 3NQAA 4K37A 5AHMA 4MUZA 3BVJA 3NQEA 2YYTA 1NF7A 2YZRA 4FNUA 4PFMA 2VKZG 3UWWA 1EB3A 3TX9A 4JX5A 3N73A 3PM6A 1JRBA 1ICQA 3LCLA 3Q37A 1LROA 5G1YA 3EWZA 1P1XA 2H3DA 2OT1A 3BLFA 1H50A 3MYOA 3SSJA 3W7HA 1FCQA 2VEKA 3OVRA 4FIRA 2A7RA 4HNTA 3W07A 4JTTA 4GJ1A 3NQ6A 3NVTA 1KV5A 4UFKA 4R34A 4AEOA 3GNDA 4AHPA 2WNNA 2Z0IA 3RNDA 3WK2A 1TTJA 1SFJA 3P74A 1W5NA 1P0NA 2NXHA 3IIOA 1VC4A 4K7YA 2YYUA 1OFAA 1JCLA 1ZALA 2CFFA 4K39A 3W1MA 1G7VA 3R12A 4LW7A 4Q32A 4UMCA 3W86A 1HG3A 3TAOA 2CLEA 1TIMA 3N3MA 1ZAIA 1YDOA 1QCWA 1X1ZA 4GBUA 4UUIA 2QCGA 4IUOA 1D3HA 3GKAA 5HULA 2LLEA 5FF3A 1ZY9A 4N6FA 2ZZ1A 1LCOA 3QM3A 4YXGA 1AW5A 2WV8A 5IBXA 4IMCA 3TIMA 1QMLA 2B4GA 3NL3A 3LCGA 2H6RA 4IX2A 2X1RA 5LNSA 4GC4A 2CLLA 1G4EA 1XXXA 1J2WA 1FWWA 4O10A 1G4PA 3LOTA 4BFAA 1QO2A 2Y88A 4WX2A 5GVJA 5FEPA 3LERA 1DKWA 1K3UA 3DKJA 3W2JA 4AXKA 4AWTA 3FA5A 3QW4B 1H62A 3L0NA 4O0KA 5U4NA 3NO5A 3GAYA 1OFOA 3M0ZA 3NEVA 1RR2A 2FPVA 3P80A 1G69A 8TIMA 1T0OA 1WV2A 1LOSA 1FCUA 1SO6A 2DZTA 1FQ0A 4JYDA 1SW0A 5HWJA 3ZR4A 1TO3A 1ZAJA 3NA8A 4UTJA 4UTUA 1EIXA 4O15A 3WK3A 4UFIA 1GTEA 4MOZA 3W2KA 3EXRA 4ICNA 4N02A 4XZ9A 4HN4A 2DZUA 1VZWA 1SZEA 3IVSA 2ZRYA 4HT3A 3A22A 3VE7A 5I3KA 2QUUA 4WY0B 1FCBA 1JUKA 3HPSA 2FIQA 1OFQA 4FXSA 4C1KA 3QEZA 1P5BA 4IPIA 3BV4A 4LNYA 1S5WA 4KFPA 4G1KA 3W1AA 2JKEA 5DY2A 1ME7A 5HR6A 5EKYA 4NJIA 2Y7EA 1TB3A 4LVBA 3OHIA 4MZ8A 1H63A 4HPXA 2YGYA 4EF9A 3LV6A 3M41A 1VYRA 4LV4A 3T4CA 1CX9A 1AW1A 3LBMA 3K30A 4NX0A 5LNRA 3WJSA 4O1AA 2OCZA 1JCJA 3C2FA 3UWUA 3LI1A 3C6CA 2OMAA 2XN1A 4O8RA 3DHFA 3NZ1A 1VJIA 1XM3A 4ZL1A 3O06A 3UWQA 2NV1A 4AAJA 4IXXA 1H7NA 4FNPA 4O17A 2C16A 3PG8A 1A50A 4A21A 5FF2A 6TIMA 3EKLA 4ML9A 1LORA 2J9YA 3MJYA 3LV5A 1RD5A 1GYNA 1XUZA 3SJ3A 3IVUA 1X1OA 4K6AA 3THAA 3TR2A 4JNMA 3I68A 5LNWA 4QJ1A 1TTIA 2H90A 3IGUA 3FIGA 4WJEA 3VKJA 4LRSA 1A5BA 4PA8A 1LRTA 3MHFA 3S0CA 3OEXA 1SW3A 4LU0A 4OV4A 2YSWA 1B57A 3S5OA 1NEYA 3STGA 3UXDA 3CPRA 3KXQA 3LTSA 3PB0A 1QDSA 4YMZA 3WK0A 1Q6RA 4O1DA 1OFPA 1OF6A 2GVGA 1YXYA 1W0MA 4N9CA 1T96A 2VEMA 4RLIA 3B0PA 4OBTA 1QPQA 4A22A 4LS2A 2CZ5A 3P62A 1K7EA 5ABTA 2JBMA 4MKNA 4MZYA 1J4EA 3KX6A 3W75A 4AWSA 1F6PA 3BO9A 3O1NA 3TROA 4OGZA 5CZ0A 1R46A 3W7PA 4AHOA 1GJPA 4RKAA 1GVFA 3ABOA 5DBUA 1Q6OA 2FDSA 1C9DA 4O16A 4NXKA 3ATYA 3TMQA 3W1UA 1VH7A 1B4KA 2G96A 3T40A 3B05A 2J6XA 5AFDA 1FBAA 3TSBA 4QQ3A 1O5KA 3P81A 5I3HA 4KFOA 3V75A 2GVJA 3L67A 4RV8A 3S1WA 1RV8A 1KTBA 5C54A 2EGZA 1EP2A 4FX7A 4UTTA 3W7DA 4Z1AA 3UNDA 4UTKA 2H3BA 4DO5A 2DZPA 1R2SA 4POCA 3TQ0A 3O07A 4UTWA 5D09A 1RPXA 1Q45A 2FPYA 3M44A 4R7JA 3TQKA 2PE4A 3N2MA 4GUJA 3C52A 4K38A 3M16A 3F4NA 5D2WA 3KRSA 3M7WA 2NV2A 1G6CA 2FJKA 3SECA 3PSWA 1QWGA 3Q58A 3C61A 1KM1A 4MY1A 2AGKA 4QM1A 4ZQNA 2R14A 3W7CA 2DJXA 5EA9A 4QNWA 5DY3A 3HO8A 1ZHAA 3HPZA 4UTIA 3WJWA 3M5YA 4QISA 3UWVA 3W7LA 2B7PA 4JIQA 3OVPA 1BTMA 1GG0A 3O8AA 3GAKA 2E6YA 3S8HA 3CIXA 3MI3A 3C0JA 1G7UA 3VE9A 3NL2A 1I8JA 2BTMA 1O4UA 3EX6A 2A2IA 2X16A 2ATSA 1VCVA 2QCDA 1JCNA 4UTHA 1KFJA 3LGEA 4DEFA 4GFSA 4O54A 5D38A 3NZRA 3NPXA 1ONRA 1LRNA 3PBVA 5E0KA 2DZVA 2QKFA 4M5PA 2QF7A 3BGGA 4YCOA 3W3OA 4MY9A 4O19A 2A21A 3O6YX 4PCFA 3STCA 1LTDA 1DL3A 1QNVA 4JX4A 1Z44A 4JYEA 4EVZA 1K8XA 1H1ZA 3L0KA 1YDNA 1Q6LA 1TQJA 1NFBA 5LHEA 4Z08A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4OQVA

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