1ZAIA

Fructose-1,6-bisphosphate schiff base intermediate in fbp aldolase from rabbit muscle
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High Resolution Reaction Intermediates of Rabbit Muscle Fructose-1,6-bisphosphate Aldolase: substrate cleavage and induced fit.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 143
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2005-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1zaiA00
4RXGA 3ATYA 4NJIA 2V9DA 5AN7A 5C55A 1C9DA 4JGDA 1B3OA 1J2WA 4JY8A 3GKFA 4OGZA 4AHPA 2JBMA 4MJMA 4JTJA 1JQXA 1TO3A 2ISSA 2X16A 4HPXA 3EX6A 3ZR4A 5FESA 1RZMA 4BI7A 2XN2A 2Y88A 3I6RA 3LXBA 3GDKA 2NX1A 2ZYFA 1OFQA 3ABSA 5CPOA 4FXSA 1SPQA 2QKFA 1T99A 3M5VA 3C2VA 4XKYA 2C15A 2OZ0A 3NNTA 3HG4A 3HG3A 3B05A 3STCA 2GUUA 4TR9A 3LRMA 5E0KA 1VYSX 3W7RA 4H6KA 2RDWA 1J4EA 4Q4KA 1W56A 4IJBA 2JKPA 4DF1A 5F4XA 1RV8A 3FLUA 5F4SA 2QJGA 3IGXA 4IMEA 2TSYA 3PBVA 4WOZA 1TPFA 3GNDA 4JNMA 4UTTC 1R30A 2RDTA 3TAKA 1TPEA 1AMKA 1G4SA 2B7NA 4RZ6A 1TRIA 3IVTA 1LBLA 1PHWA 8TIMA 4O8RA 1FDYA 3M9YA 3P61A 3NQAA 3B03A 2YPIA 5DXYA 1C8VA 3C2EA 4WZHA 4IPJA 1H61A 3MO7A 4E0CA 3QFEA 2YSWA 4XQ6A 2ISWA 3EXTA 4AF0A 4JTFA 3QMRA 2E5BA 3TU9A 4JIQA 5LKYA 2WNQA 1TMHA 6ALDA 5C54A 3SI9A 4L4LA 3A9IA 3QJAA 5KINA 1GVQA 4ZQNA 3USBA 3GX9A 2CLKA 1ZENA 1LBMA 2C13A 1F73A 4JTGA 5HWJA 2VELA 2GJNA 1DVJA 4UTLA 4O54A 4FX7A 3WJYA 1DBTA 3P7YA 2EPHA 3FYPA 1KV8A 3E49A 4E2DA 4UTIA 3W73A 4DELA 1M6JA 4UTTA 4WY0B 5I3KA 3LRLA 5KITA 4LC6A 4LS0A 1QOQA 3C8FA 1FWSA 2LLEA 3TNOA 3W1UA 3LCIA 3LXCA 3L5AA 5HWNA 5DLCA 1EEPA 5G2HA 2A7RA 4WJEA 2JKEA 1PE1A 1O5XA 2QUTA 3W83A 3M1ZA 3VFLA 3W2MA 4FNTA 3W3OA 3A21A 3BG5A 3R12A 1DQWA 3IIZA 1WA3A 1FXQA 3QW3A 3QEZA 3LM7A 3LTPA 3BW2A 3BLIA 3W7HA 4WX2A 2CLMA 2JKAA 3G1VA 3DENA 1TPB1 2H90A 2DZTA 3HGJA 1TPH1 3KRZA 4LT9A 1PL9A 1OYCA 3P8IA 1PCKA 2Y62A 2G5WA 3F4WA 2ZTJA 2YGYA 3HGOA 3W23A 1JR1A 4LV9A 4O13A 1KM2A 4UXDA 2A5HA 5CZ0A 4IX2A 2YX0A 1WBHA 4I9AA 3GDLA 3WFAA 3DU0A 3G0UA 3W2UA 1D9EA 3WK3A 3EXRA 2WKJA 3L5LA 3GYEA 5BMWA 3LXAA 3P60A 1WAUA 3RMJA 2H8ZA 2AQWA 3LLDA 4FNRA 4IXXA 4EOUA 1K7FA 1OG0A 1SW0A 3W1NA 5AC8A 1H7PA 1QPOA 3OVRA 2J27A 1SW3A 2QCMA 3W1MA 5GVJA 4Z0SA 3L0NA 3HBLA 1TYGA 1OFBA 3V75A 1LORA 4JTHA 3P67A 3W7PA 2V82A 4Z0JA 4Z08A 5G5IA 5AHMA 1KLYA 1T0OA 4CNOA 1M7OA 1X1ZA 4OE7A 3A23A 4DPPA 4KFPA 4LW7A 3G24A 3LCXA 4FX6M 4HHPA 5G1YA 4KWVA 3B0VC 4H3DA 4UTHA 1GYLA 1QR7A 5LGZA 3FIGA 1LRQA 2Z1BA 4Q32A 3SR7A 3FYOA 1SU5A 4NNCA 2EKCA 3GXTA 3O6YX 4GUGA 4X2RA 1LBFA 3EKZA 2VC6A 2XN0A 4ADTA 3G8EA 2ZZ5A 5K9CA 1KM1A 2A6NA 3L0KA 3SGUA 4EWND 4QSHA 5EPDA 1VGAA 4HNVA 4N6EA 3VNDA 1K02A 4GBUA 1FDZA 2ATSA 3S0CA 1AW5A 3GB6A 1GWJA 2A7NA 1SR9A 3DHDA 3KVKA 3W85A 2QCDB 1K8YA 3N2MA 4EVZA 3GR8A 4W9TA 1SSDA 1ICPA 4MZ1A 1Q6RA 1GVOA 3BLEA 1W3NA 2V2HA 1WXJA 1XDMA 2X1TA 3QSRA 2J9ZA 3TIMA 3PULA 1DL3A 1W31A 2WV8A 3NG3A 3QM3A 3HOJA 1ZALA 3UYCA 4J9JA 3JS3A 4CCDA 3UNDA 3N9SA 5LNSA 2YYUA 2NZLA 1GG1A 1RQBA 3O07A 1W54A 3NPUA 2J6XA 2P0OA 4XTDA 1KM3A 1ZNNA 4O4VA 1KFJA 3A5FA 4DO5A 3G3MA 3LBMA 2PE4A 2C3ZA 5TBOA 1H51A 2R14A 2Y61A 1LOSA 1I8JA 4PCFA 1OJXA 5DY2A 4YCPA 5TIMA 4Z1AA 3NM3A 4JX6A 3NEVA 4S1FA 4UFJA 2O7SA 5HINA 1I4NA 3NQVA 1FX6A 2QDHA 4JYFA 3PM6A 4EIVA 3B8DA 1XBXA 3TXVA 4OQVA 1KM6A 1VS1A 1JCMP 5HR7A 1GVFA 2FPTA 3NL2A 1SZNA 3STGA 1OF8A 3ZS4A 5K9XA 3DXIA 2NV2A 3STFA 2PRHA 3QRHA 1G7UA 4ZQMA 4LNYA 4AWTA 3CEUA 3GVGA 5D03A 1EX5A 3B4UA 3FKKA 2WPBA 5AHLA 3LOTA 1VJIA 4N4PA 1FCVA 2VFGA 4X22A 3T4CA 3L65A 1O95A 4K6AA 4O14A 1U83A 4LTSA 3KOFA 3QPYA 3NGJA 4M7SA 5H91A 4O28A 4N4QA 2C16A 4M6PA 3G22A 3QH2A 3EWBX 1YDNA 3B0PA 4HIBA 1OFOA 3HB9A 1OFPA 1KM0A 1SO3A 3HPZA 5U7SA 2QAFA 1H5YA 1R46A 4AEOA 1F76A 3P5YA 3TCEA 2H6RA 3W74A 3M6YA 4GWEA 5BRBA 2FPVA 2Y7FA 4DF0A 3NPWA 4JN6A 3N2XA 3MP4A 1E51A 2TYSA 1VHCA 4R53A 1QNVA 4R34A 3PR2A 3VE7A 5AYXA 2A6LA 1ADOA 4MYAA 2VEKA 2WSQA 4JTEA 4GUJA 1QWGA 4MYXA 3HIJA 1TPC1 1ML1A 2Z6IA 3W84A 2A4AA 5K4ZA 5EY5A 3TR2A 2Q8LA 1EPXA 3TSMA 3N14A 3HQ1A 1AW2A 4XKYB 4WOQA 2Z0IA 4UTMA 1NEYA 3CWOX 4HN4A 1GTEA 2ZA2A 4TX9A 4Y90A 1EUNA 2Y7DA 4DO6A 4E38A 3Q58A 4AH7A 5J5RA 3GAKA 1FCUA 4O19A 3NYZA 5AOUA 3UQNA 3C2OA 3TA6A 2R91A 1KFKA 1KFBA 3N34A 1FCQA 2KZHA 1XDLA 3I68A 4RCXA 2Y63A 3TROA 5LNRA 2X1UA 5E93A 4IQLA 1MSSA 2FPYA 3FJLA 1K8XA 4QISA 1KFEA 4O1BA 5C6MA 1TPDA 4JTLA 2TMDA 3LV6A 3L0GA 3L68A 2E1DA 3WJWA 3M7WA 2OT1A 3CIXA 4K8EA 2ALDA 2ABAA 3BG3A 4ICNA 4IOTA 4I7WA 2A2IA 2VEIA 4A22A 4TIMA 3IIVA 4HNNA 1LLWA 1VLIA 1VR6A 4LUIA 1LRNA 4ZQOA 3LHYA 4A21A 1XM3A 2V8ZA 2PURA 1VCVA 1ZAHA 5HUPA 1B57A 2VOMA 1TIMA 3THAA 5F4WA 4O18A 3IVUA 5CSRA 3EWUA 3EB2A 4K8HA 2ZZ1A 3L2IA 2E09A 5D2WA 2E5CA 5CZTA 3UPBA 5LGXA 1G4PA 4NNAA 3MYPA 4I7VA 3S1WA 5K7JA 3KX6A 1O5KA 1OX4B 3NPXA 4O4WA 1SW7A 3MHGA 3W7JA 3KXQA 1A5CA 4N9BA 1W8SA 3MP5A 2YZRA 4O10A 1DJNA 5AC7A 4ZL1A 4MPQA 4QNEA 2VFFA 2B7OA 3LTYA 4U28A 7TIMA 4ADSA 1GOXA 4QJ1A 4KFOA 1KFLA 2E77A 2OJPA 4UFLA 4FF7A 4YMZA 2NX9A 5E1QA 4IMGA 4M6VA 1BTMA 2V2CA 4NXKA 2NXGA 3TMQA 2WNNA 3PUDA 3S42A 1F5ZA 4HPJA 4UCGA 2QF7A 4YXGA 4HSOA 5FF4A 3QQ0A 4BR1A 3PWAA 4LY8A 1JCXA 5KTLA 2ZRZA 3NQEA 2DZVA 4WY0F 2YFOA 3W7NA 5HNRA 3NQCA 2EGZA 5FF2A 3IGUA 1WBJA 3B06A 4UFHA 5G1TA 1V7YA 3IEBA 2GOUA 4XUGA 1SSGA 3NPVA 3CC1A 3FFSA 1P0NA 3N73A 1JVNA 1QOPA 3GNNA 3DZ1A 4UMBA 1L9WA 2FB3A 4ZQCA 2QJIA 3EXSA 4ZMGA 4JS3A 4LU0A 5AYYA 4PFMA 3TJLA 3KHJA 3G1XA 1B4EA 1R2SA 1RPXA 4C1KA 1F2JA 3CTLA 1HG3A 3W7MA 1AG1O 3PB0A 1H1YA 2WO5A 1FXPA 3LHUA 3UWQA 1Z42A 3N19B 1I2QA 2EF9A 3BW4A 3OG3A 1FWRA 3NQ2A 5I3JA 1ZFJA 4GJ1A 5HQEA 5AFDA 3O16A 4MY8A 1TTPA 4IPIA 4X9SA 4ALDA 3LCWA 3HPXA 1K7EA 4A3UA 3G3DA 3NVTA 3MJYA 4IXHA 1UUMA 1OF6A 3BG9A 2GVJA 1JUEA 5EBUA 2VFHA 3DKJA 5SWUA 4DF2A 5MHBA 3SFKA 2TRSA 1IXPA 3PBUA 5L6UA 2O7QA 5I3IA 2GPTA 3C56A 3PY2A 4K37A 5FEXA 4BK9A 1A5BA 2VFIA 2WNZA 4JTTA 3LCGA 3LX9A 2PRLA 4E2BA 4Y9AA 4O0ZA 5DBUA 3LCLA 5FF0A 4OHQA 3S5YA 2Q3RA 1CI1A 1WYIA 1JUKA 3D0CA 3VKJA 4JYEA 1AW1A 1XBVA 2FTPA 3W1TA 4PC8A 5FI8A 1MEHA 4BI6A 4O1AA 2YR1A 2HS6A 4AMAA 1OX6A 4LRSA 1Q3NA 3PG9A 1IXQA 2G97A 3WJZA 3NXFA 2AAMA 4UNKA 3TW7A 1Q45A 3EWXA 1N8FA 1H7RA 3GAYA 2OX1A 4BF9A 1W1ZA 3DAQA 2BLEA 2A0NA 3NDOA 4OU1A 2P10A 4ZQRA 3NO5A 2PRMA 5BMXA 4M7TA 5BW6A 3BLFA 2RDUA 1FWTA 4N9DA 4R33A 3Q94A 3MBDA 2V5LA 2W79A 1HTIA 4MY1A 4CQAA 4PL2A 5C2XA 3MYOA 2V0TA 2YYTA 2HSAA 2V2DA 1ICQA 3FA5A 2A21A 3SECA 1SZEA 2CLOA 3SIZA 1LROA 4O52A 3OA3A 3BVJA 3W1AA 4FEZA 3WK2A 1F6PA 1UBSA 3MUXA 1X7FA 3QSTA 3RU6A 4UR8A 3W2NA 1IF2A 2QCLA 3UWZA 4JDBA 1EP3A 4CLMA 3LV5A 3GXNA 3T55A 2H3DA 3ATZA 2P1FA 3NL6A 4OBTA 3ABQA 4LC8A 2CLIA 1CW2A 2CLLA 5D2XA 2RFGA 3SZ8A 4DBEA 3RF9A 5F1UA 3WJXA 3TQVA 2DZXA 1WDWA 3MI2A 4U4MA 5D38A 3WK1A 4UTUA 4FNPA 4UFIA 4O12A 1XXXA 4K38A 4B5NA 4M19A 5LNWA 3ELFA 5HULA 2ZA3A 1LOQA 3QZEA 4YWIA 2VEPA 4N2YA 2GJLA 4NJHA 5U4NA 2B7QA 3M47A 1Z44A 3N3MA 1YDOA 1OYBA 1FDJA 3H53A 1XFBA 1UJPA 1XUUA 4O50A 3TC6A 1DV7A 2CLHA 3INPA 1TJPA 3EWZA 3NM1A 2J88A 4DBDA 1OHLA 5DBTA 3M41A 3C61A 3G18A 4FO4A 1QPQA 5T26A 4Z1DA 1DJQA 1HUVA 3GZ3A 2J9XA 2ZZ4A 3BPWA 3OBKA 3HG5A 1W3IA 3UZ5A 1KFCA 1F7BA 4LUJA 4O17A 3W9ZA 4JIPA 3TV8A 1S3HA 3DBPA 4HKPA 1JCNA 1Z41A 3IRDA 4LVGA 1QFEA 1KLZA 1OK4A 5EKYA 2FLIA 4AXKA 3UXAA 1YYAA 1RQHA 3O1NA 1TB3A 3T44A 4DPQA 4RX0A 3TXZA 3BV4A 1DORA 2X2GA 5FEZA 2B4GA 3W1PA 3MI3A 1I45A 3NOEA 1EP2A 3C2RA 1KV5A 5A5WA 4BI5A 1P0KA 4O16A 1G69A 1SZFA 1EB3A 4ZQPA 3OHIA 2Y70A 2X30A 2ZCGA 4CCCA 1ZJIA 2I14A 1S5TA 3MBFA 1QMLA 3GR7A 5DY3A 1YPFA 4O53A 3TAOA 3W6YA 1TREA 4UUIA 5KZDA 2ATMA 3DKLA 5D32A 3YPIA 1HL2A 1KA9F 1FQ0A 3G1FA 1NSJA 5CZJA 3SY5A 2JGYA 1UB3A 3DHFA 1L6SA 3C2FA 5LZLA 1CX9A 2E68A 1M5WA 2YFNA 2DZWA 4JD4A 2B7PA 4JXCA 2NXHA 1LOLA 1PV8A 2DJXA 5DCDA 3W1LA 4M6QA 1X1OA 5I3GA 3TMLA 5F2IA 2WJZA 3GXPA 1NF0A 3TUUA 2QCCA 5K2ZA 2HTMA 1GVSA 1I2PA 4OV9A 1WOBA 4YLWA 1LDCA 1OK6A 2DJLA 2E6DA 4H4IA 5AYZA 5LSMA 4YL2A 3HGRA 1JULA 5AHIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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