1EP1A

Crystal structure of lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase b
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
ENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMTEKLPWLNENFPELPIIANVAGSEEADYVAVCAKIGDAANVKAIELNISCPNVKHGGQAFGTDPEVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRQPILANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQDVDIPIIGMGGVANAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIDKLPELMDQYRIESLESLIQEVKEGKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of dihydroorotate dehydrogenase B: electron transfer between two flavin groups bridged by an iron-sulphur cluster.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (PYRD SUBUNIT)
total genus 99
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date 2000-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ep1A00
2X2GA 2QCDB 1XM3A 3U2OA 3EWWA 4J9JA 2J24A 2OT1A 1J2WA 1WYIA 1OFBA 3EKLA 3TQKA 4Y8FA 4L4MA 3W7PA 4O1CA 3W84A 4JDBA 3UY8A 2I9EA 3CTLA 4FIRA 2CZFA 5CZ0A 4AH7A 2V0TA 2QCDA 4JS3A 1RQBA 3LCIA 4UTUA 4O15A 1LOQA 3KRZA 1O4UA 1F05A 2YW3A 4O1DA 1QMLA 2XN1A 3DU0A 5CZJA 3WJZA 5L9FA 3PG9A 3STEA 4DQWA 1PCWA 2NLIA 3TFCA 2ZCGA 3G0XA 4HNNA 3N2XA 2X1RA 3P8JA 1SZEA 1H1YA 2BTMA 3M9YA 3NOEA 3QC3A 4XWUA 3T78A 1FWWA 1R47A 4OWGA 4FX6M 2OMAA 3SSJA 2Y7DA 1IIGA 2B4GA 4GUIA 4JX4A 7TIMA 4RZ4A 4M7SA 3OEXA 4UTWA 4Y9AA 3SJ3A 2A6NA 4HNVA 2Q8LA 2NX3A 3N19B 4XKYA 3TV8A 1RVGA 4RXGA 5HR7A 3C2RA 1LROA 4ALDA 4ICNA 1NF7A 3SIZA 4CQ8A 3LV5A 1DBTA 4Q33A 1FCVA 3LGEA 3QJAA 3W7RA 2CLIA 3MW7A 3W7LA 1LLWA 3ABOA 2X30A 4UNKA 2GPTA 1G4TA 3G1DA 1I4NA 2Y70A 4UMBA 1E51A 3TC7A 1XI3A 5ABTA 3D0CA 4CCCA 5IBXA 3T40A 1R30A 3NQDA 1DJNA 3AO0A 4UNLA 4NJIA 5F2LA 1OFAA 3GYEA 3NL2A 5D04C 1HTIA 2TRSA 5DBTA 4DPPA 1W5OA 4ORMA 5K2ZA 1DQXA 3TROA 2YX0A 4ADTA 2QCHA 1B57A 3Q94A 1ZFJA 4UMCA 1TCDA 5FI8A 1ICSA 1KFJA 4GC4A 2V5BA 4WUIA 4MZ1A 3M5YA 3CHVA 3S1XA 1XUZA 4R34A 1AMKA 3CC1A 4UFHA 3OVPA 5C54A 4KWVA 1KW1A 4IX2A 2RFGA 2QUTA 3IVSA 1HO4A 4I7UA 4QITA 3QF0A 4CNOA 1EUAA 4UFJA 2O7SA 4JX5A 2ALDA 1ZALA 3A9IA 3SGZA 3DAQA 2R8WA 3L68A 4PFMA 3W71A 1WDWA 4AWUA 3QMSA 2DZSA 3W1NA 2Z0IA 1WBHA 1H1ZA 4JYEA 1KTNA 4MY9A 2Z6JA 4LVBA 2F7FA 3EXSA 3QFEA 3S9YA 2DZUA 5F4WA 2WNZA 2NXGA 3GDRA 3STFA 1H7PA 4WOQA 4MJZA 3H55A 4IQLA 5FEZA 4DXVA 3S5OA 3EWBX 5EKYA 2ZZ2A 4WZHA 2RH9A 4O18A 2B0MA 5EBUA 1TO3A 1AW2A 3WK0A 1TPWA 3L0NA 4JIPA 3GXPA 1K8XA 3HF3A 3I65A 4IMDA 3LCWA 4JGDA 3UXDA 3OVQA 3DKLA 1RQHA 4LNYA 1VYPX 1LP6A 1N7KA 3VE9A 4M6QA 1F76A 3QQ0A 3T4CA 1DKWA 3W73A 4HIBA 1P4CA 1H62A 3G1XA 2YFNA 3HPSA 3QYQA 5LGXA 3TH6A 3E49A 1Z48A 5AYZA 3V1PA 4K8HA 3R12A 3BV4A 3NQ6A 3B4UA 4LTSA 5DCEA 4M5PA 1ADOA 2VEMA 3OBKA 3LHUA 4PCFA 2ZZ7A 2ZZ3A 3NYZA 3PUOA 3GIYA 4D2JA 2Y7GA 3BLFA 3MHGA 4NZJA 3U6WA 3HGRA 3W2KA 2VKZG 4TMBA 3UQNA 1G4PA 3DFSA 1OABA 1KTBA 2YDAA 2VFEA 3M7WA 1U5JA 4PODA 4PL1A 2DZVA 3G18A 5K9XA 5FF0A 1D3GA 2UV8G 3B04A 1DHPA 4IMFA 3W7NA 3C0JA 4UR8A 4MZYA 2AGKA 4AB4A 1EIXA 4DF0A 2PE4A 3CU2A 4NNAA 4JTJA 1L2UA 1NF0A 1AW5A 5FF7A 2ATSA 2ZZ5A 3LRLA 1LCOA 4PH6A 2QDHA 3P5YA 2Y63A 4RCXA 5G4WA 3TKFA 2BXVA 5HQEA 3QSTA 3N73A 5BW6A 3H54A 5D2TA 2NUXA 3GAYA 3PSWA 4ZZ9A 1HFBA 1WV2A 2BLEA 3O15A 3NZRA 4GRSA 5AN7A 2KZHA 3LBMA 4GNJA 4FNQA 1KFEA 3NQ7A 1W3TA 2Y6ZA 4NXKA 1DORA 3TFXA 1DL3A 2A7RA 1VCGA 1XBZA 5DCBA 4UTHA 4LY8A 1FWSA 3F4WA 2OCZA 4QM1A 2RDWA 3W7HA 4YMZA 1JCLA 4IWWA 3PBVA 2VFFA 2GVGA 2YW4A 1VS1A 2B7PA 3QSRA 3TK7A 4NJJA 3KVJA 3GNDA 1XXXA 3ZR4A 1GTHA 5IM51 1TTIA 3L67A 3S42A 3BO9A 1XCFA 3W70A 3W7QA 3PC0A 5L6UA 1ZJIA 4K37A 3QM3A 3NQMA 4JICA 1LDCA 2YZRA 3HGJA 2CLEA 3P81A 4A21A 2H3BA 2EGZA 2WV8A 1KV8A 1SO5A 2QAPA 2FB2A 3CEPA 5D02A 2YGYA 3W7KA 1H7OA 1J4EA 5FEPA 3DH7A 3I6RA 1ICPA 5D09A 3GDKA 1ONRA 1OYBA 1KFLA 3F1QA 4E38A 2C13A 1L6WA 2H90A 4JDYA 1G6CA 4U4MA 2WO5A 2GJLA 3C2OA 1XKYA 3NPUA 1LOSA 2A7NA 3FKKA 3I7SA 5AHNA 1KLZA 3M43A 2J27A 4NT0A 5HUOA 4B5NA 1PS9A 4MYAA 3NPXA 2NWSA 3RLUA 1A53A 2GUUA 3W7JA 3S1WA 2WPBA 1SZGA 1J5TA 3EXRA 2E6YA 5D38A 5IBXC 4UMAA 1QPQA 3GAKA 3NQVA 1PIIA 1YXCA 4WX2A 2F84A 5TQLA 2Z2UA 4O53A 1TSIA 3M41A 5K3VA 4O0ZA 1OYAA 1TPDA 4QNEA 4DEFA 3NPVA 1GT8A 3HGOA 2Y88A 1UB3A 3W1TA 4LUJA 1GVFA 2NUYA 5CSSA 3NL6A 5FEWA 2VFIA 5BOOA 3IV3A 2XFWA 3I7RA 1O95A 4JTEA 3P5ZA 5EPDA 1PE1A 5BRBA 4N4QA 2E5BA 3ZWTA 1JR1A 1GWJA 3IIPA 4JX6A 4GJ1A 2P10A 3GLCA 2A5HA 3PS7A 5DCDA 2Y61A 2JGYA 4KFOA 3W7CA 1YPIA 3KXQA 4Y90A 3B0UX 1SQ7A 3F4NA 1ML1A 5A8GA 3SGUA 3LHVA 4IJBA 4OV4A 3FFSA 4N9BA 3L5LA 4DO6A 2XN2A 3N14A 4E2DA 1SSGA 2QDGA 5D32A 3NG3A 3LLFA 4GUFA 5AHEA 2Z6IA 5EL1A 1F74A 1IXOA 1O5KA 4O11A 4Z1AA 1DQWA 3ZFHA 3I7QA 3IIZA 3MO7A 2YYUA 3EX4A 1HO1A 5D2WA 1F7BA 4M6VA 1N8FA 4FO4A 5KSWA 2HSAA 3IGXA 4JD4A 1IF2A 4ZQOA 1L6SA 5TBOA 1R2TA 3O6YX 1VH7A 5GVJA 2E6DA 2Z1BA 3ZS4A 3NQ8A 4X2RA 3C3NA 4OGZA 4ZQRA 3LCHA 5CSRA 3OG3A 3HJZA 4JY9A 3G3DA 4YLWA 1H63A 1WAUA 2R91A 1ZAHA 1KA9F 2NX1A 1LTDA 5D37A 3L2IA 5F4SA 1WX0A 1NSJA 2Y89A 3EWYA 3BG5A 3S5YA 1H7XA 4N9CA 4QJ1A 2PURA 4S2BA 4BFAA 3DENA 1H7RA 1G4SA 1TREA 3BLIA 2GVJA 3C2FA 1TYGA 2DZTA 2P0OA 3SECA 4R33A 4K7VA 4Q32A 1N55A 3LHWA 3NQFA 5DY3A 2PC4A 2V2HA 2QCCA 3M5VA 3LCGA 4S1FA 1VHNA 3LHZA 5EY5A 1LORA 5G1YA 2QUUA 4QAIA 2OX1A 4ONVA 3STGA 5KINA 1Q45A 3NO5A 5EA9A 4Y6GA 3UWWA 1WXJA 3VFLA 2E68A 1W5NA 1TJRA 2WKJA 3BARA 4A22A 3TSDA 3UWZA 4FXSA 1PV8A 1KBIA 1XBYA 3TR2A 4NVTA 1XBVA 3OA3A 4MKNA 3GXNA 1K8ZA 1VRDA 1K03A 1HL2A 1EP3A 1ZAJA 3C56A 1A50A 4JR5A 3GVGA 4N02A 3L0GA 3UPBA 1GEQA 2WNNA 4QIUA 1ZNNA 3PM6A 2I14A 2CLLA 3NQ2A 4RV8A 2ZRZA 5BMXA 3SFKA 5AC7A 3LCXA 4QQ3A 4GUJA 1XDLA 1GZGA 1YADA 4RX0A 4E2BA 1S5TA 3WK2A 4FEZA 1I8JA 2J6XA 4EVZA 3MYOA 3W2JA 3EB2A 4UFLA 4JXCA 4MOZA 2H3DA 5AHFA 5CZSA 2GJNA 2E09A 1T96A 2ZZ4A 3W1AA 1FWRA 4XKYB 4EWND 1EB3A 2X16A 1TTPA 3F03K 4NJKA 4L4LA 4XTIA 2CLFA 3CB8A 3KFTA 2WOQA 1QO5A 5CPNA 4Z0SA 4AVFA 4ADSA 1W3IA 2YYTA 3MUXA 3RF9A 4I7WA 3GR7A 3HGSA 4ZMGA 4LVAA 3FYPA 4ZVJA 2V5LA 3WJXA 3L21A 1PVNA 3EX6A 4WQ6A 5HINA 3LRMA 3NVTA 3M0ZA 2C16A 3PWAA 5AYXA 3IRDA 3MYPA 1Z44A 1VHCA 3WFAA 5AHIA 1W5PA 4BI6A 3CIXA 1ME8A 5KTLA 5A5WA 4BR1A 4CNPA 3S5NA 2VELA 3LOTA 3DHFA 4UTKA 1Q3NA 2E6FA 3L66A 3NPWA 5FEXA 2YFOA 3UPWA 1XFBA 2A7PA 4IXHA 5K9DA 2PRHA 1AL8A 4UFKA 3UNDA 3QPYA 1SW7A 3TU9A 1TRDA 3NQAA 3LHYA 3BG3A 4QNWA 3CT7A 1QDSA 3FA5A 3LTPA 1SO3A 2QCMA 2V2DA 3VNDA 1K7XA 5AHLA 2WSYA 3NL5A 3NQGA 2EPHA 3O1NA 2QCEA 3UY7A 4UTTC 3JS3A 2AAMA 1C29A 2VOMA 2DJXA 3W2NA 2J9ZA 1XBXA 2YXGA 5FF2A 1VC4A 3G0UA 3KAOA 3U8GA 1OHLA 4UUIA 3SI9A 3GDTA 3DXIA 1SW0A 2HTMA 2VENA 1KLYA 1OJXA 3CEUA 3FEMA 4N9DA 1VLIA 3W2UA 1IXQA 2CLHA 1FDYA 5LGZA 3S6DA 1TPC1 3L9CA 1TIMA 2VXNA 3KOFA 1DJQA 2CLKA 4K6AA 4AMAA 5KZMA 2PRMA 2V2CA 4OHQA 4LWWA 3C2VA 2FJKA 1FWNA 2BWGA 4MJMA 3OVRA 1P0KA 1OF8A 3A5FA 1ZHAA 3W7OA 1FCBA 1KM2A 3G1VA 4C1KA 4N2YA 3P84A 1TPH1 3G8RA 2C19A 3LLDA 2Q3RA 1T0OA 1FQ0A 4IGHA 1VLWA 1ZCOA 3ZWSA 3HOJA 1CI1A 3NNTA 1OVDA 4EIVA 2HS6A 1QPNA 1QPOA 2ZZ6A 1JVNA 1F5ZA 1H5YA 4YCOA 1MEIA 3P82A 5I3HA 3G1SA 4TU1A 3RK8A 1S5WA 5G2IA 4HSOA 1LBLA 4CQ9A 1OFEA 1GTEA 3EX1A 3HB9A 4KWWA 3TC6A 4E0CA 3ATYA 5CPOA 2V9DA 1RPXA 2EHHA 1H7WA 2AQWA 3PUDA 3TSBA 4WJEA 3FLUA 3LCFA 5AC6A 5FESA 3FYOA 2C6QA 4MY8A 5DN1A 1KFBA 4FX8A 1SFLA 3VKJA 5LNWA 1GPWA 1LM1A 5EYWA 3LV6A 1JCNA 3TJXA 4AHQA 3GDLA 2A85A 4AEOA 2Y7EA 3MMTA 4FF7A 4HPJA 5HULA 3BW3A 4GFSA 5HJLA 1MZHA 2QCGA 3A22A 2H8ZA 2A6LA 1P0NA 1TPVA 5D33A 2CZDA 3ABQA 3P60A 1SW3A 4W9TA 3M1ZA 2Y85A 3O8AA 2A2IA 3IVTA 1Z42A 1OX5A 3M47A 1B9BA 1SR9A 4JTLA 3B8DA 4IXXA 3HIJA 1K02A 3O6CA 5FF4A 3USBA 5T26A 1GG1A 4TMCA 4ZQCA 1MEHA 3E0IA 2ZA1A 3TW6A 4TO8A 2QCNA 2NUWA 3R2GA 4YL2A 5E0KA 4H6KA 4P61A 3W72A 3EWUA 1W1ZA 1LRNA 5G2WA 2VFDA 5LNVA 4QISA 1Q6RA 5DBUA 3MP3A 3PY2A 5F2IA 3P74A 2J88A 4FNSA 2JGQA 4A3UA 1F6KA 4NQ1A 1A5CA 3PSVA 2JKPA 3S5ZA 1EA0A 3DZ1A 3MI2A 1W37A 3PB2A 4HNTA 4Z1BA 2PCQA 1LOLA 4JIQA 4DELA 3W6YA 1H61A 3PULA 4MFEA 5G5IA 1TRIA 3IIVA 4X3ZA 1PHQA 3YPIA 4PC8A 4X22A 5HNRA 3FJ6A 4O52A 4TIMA 4HNUA 2W6RA 3IIOA 4IPIA 1FCUA 2YCEA 3B06A 4JTGA 1TV8A 5K4XA 1R46A 1LRQA 1QOPA 3E9AA 3LXCA 2QCLA 1JULA 2G5WA 3LBCA 4FNRA 3WK3A 3ATZA 5D2YA 3W3OA 3QPZA 5HWMA 4MFDA 1CW2A 2FIQA 4OBTA 4PL2A 2CU0A 1OYCA 1DVJA 1QPRA 1RR2A 1X1OA 3VI2A 3I68A 1DOSA 4X9SA 5F2GA 2QCFA 3N2MA 3NM3A 4O13A 3PUEA 4WY0A 4N9EA 1GYNA 1VJIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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