1EP1A

Crystal structure of lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase b
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
ENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMTEKLPWLNENFPELPIIANVAGSEEADYVAVCAKIGDAANVKAIELNISCPNVKHGGQAFGTDPEVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRQPILANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQDVDIPIIGMGGVANAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIDKLPELMDQYRIESLESLIQEVKEGKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
publication title Structure of dihydroorotate dehydrogenase B: electron transfer between two flavin groups bridged by an iron-sulphur cluster.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (PYRD SUBUNIT)
total genus 99
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date 2000-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ep1A00
2VKZG 1T96A 1OFAA 3TQ0A 3W7DA 1IXOA 1GG1A 3CIWA 3W2NA 1XBZA 2Y61A 4BF9A 1TQXA 1UCWA 1H51A 2VOMA 3LI0A 4GUHA 4BK9A 4D2JA 2NV2A 2Z0IA 3A5FA 3QFEA 4IMCA 1OF8A 1LBLA 1H7WA 1DVJA 1JR1A 2DZTA 4MLJA 1LTDA 1G4TA 4IMEA 3ATZA 5MHBA 4JTIA 5L6UA 4FNTA 4DF0A 1FWRA 2PRHA 4AB4A 3LCWA 4M19A 1H7OA 3NPUA 4CCEA 2QCLA 4UTMA 4NZJA 4UTKA 1XXXA 1FCQA 3CC1A 3ATYA 1ZY9A 3SSJA 1YTEA 5K4ZA 5AHMA 1F05A 3FJLA 2ZRZA 2Z1BA 3M1ZA 3LXBA 2Y88A 3Q2DA 1XUZA 3LHVA 5D03A 3W7PA 4CLMA 1MEIA 4JTKA 1FCVA 4Q33A 4MY9A 2FJKA 3GNNA 3I68A 3BG3A 3P5YA 3F1QA 1GOXA 4JDYA 3NQEA 3PC0A 3L0NA 2B7OA 2A7RA 3UPBA 4UR8A 2HSAA 5FF2A 5HULA 4LW7A 3ZWTA 3M41A 1JCNA 3STFA 1JUBA 4MJZA 4TIMA 4UMCA 3I6RA 3NQ2A 3G8RA 3STEA 4P61A 4K36A 1SZGA 3RK8A 5F4WA 1R30A 2QUTA 5AC6A 2V82A 4UTTA 3C6CA 2V30A 1AG1O 2ZZ4A 2CFFA 3H55A 4JY8A 3PB2A 1G67A 1B4KA 1WBHA 3QQ0A 1TV5A 3TQVA 1VCGA 2G96A 3HBLA 4OBTA 3NL2A 3W7HA 4UMAA 3G1DA 1DOSA 2Z6JA 1VYPX 1LLZA 1XBVA 1OVDA 4UTTC 2VEPA 4IWWA 5G2HA 1ICQA 3H53A 2WPBA 3UXDA 4O4VA 1G4EA 4B5NA 4HSNA 2ZZ1A 1EUNA 1TPC1 3UPWA 4IQLA 5D30A 2Y70A 2CLKA 4OT7A 1IXQA 3SECA 1SPQA 3NYZA 3MO7A 1OFBA 3N2MA 2YCEA 1EWEA 1AW2A 4JIPA 3EXSA 1QCWA 2Y7GA 1I8JA 2A21A 1UUOA 3IV3A 3UD6A 3VE7A 2QCMA 3G3DA 3FA5A 2YXGA 1JCYA 1KM2A 3QSRA 3SJ3A 5F2IA 2X1TA 3IIZA 4GRSA 3EX2A 5BW6A 3W9ZA 1UASA 2E09A 3ABQA 4TO8A 3PF3A 3TFCA 1H7PA 4X9SA 4HHPA 1HG3A 4QAIA 5I3HA 3B03A 3LBMA 1VYSX 3VFLA 2AAMA 3BG9A 4UFMA 1LRTA 1KFEA 4JD4A 1A5SA 2CU0A 3C2OA 3MBFA 3LRKA 2W0UA 5F4SA 5BRBA 4LUJA 5K9XA 4R33A 8TIMA 4EIVA 3IVSA 2AQWA 2X30A 1TPEA 3N3MA 2BSLA 3C8FA 5F4XA 3MP5A 3CEPA 4ICNA 1AK5A 4PTNA 2E5CA 3MUXA 5F1VA 4IX0A 1WQ5A 3HMJG 4A21A 1RV8A 3NL5A 5KZDA 5AHEA 1YDNA 1TQJA 2ZFAA 1FDZA 2QAPA 2XN2A 4HT3A 1XL9A 5DCBA 2RHGA 5CZSA 1W56A 2C14A 1OFQA 2JBMA 2NWSA 3G0XA 4K7VA 1VLWA 4U28A 1W1ZA 1KTNA 2YPIA 3TSBA 1EP2A 3S5NA 1ME9A 2NX3A 4KFOA 1PIIA 2E5BA 2E6YA 3FEMA 3EWUA 4H4IA 3YPIA 3IGXA 1P5BA 4M5PA 4JN6A 5HJLA 2CLOA 4DXVA 4LRTA 1A53A 1VHNA 4N9DA 3GDMA 1JJKA 1GPWA 1QAPA 5DLCA 1AL8A 4QISA 2A6LA 1FBAA 3DFNA 3W7EA 4H6KA 1Q3NA 3TMQA 3CWOX 1FCUA 3OEXA 3EX1A 1GVOA 3W72A 5KINA 3HF3A 4IMFA 3ANYA 3W22A 2ZZ7A 4UTJA 4UUIA 3WJXA 1I2RA 3LDVA 3N9RA 1OFDA 5HNRA 1H61A 4Y6GA 2GQ9A 4MUZA 4PFMA 2DZUA 2E6DA 3NQGA 4DBEA 2E6FA 2PRLA 4QNWA 3DFQA 3GAYA 1SSGA 1RR2A 3HGJA 5ABTA 3C2RA 3RU6A 1X7FA 4RZ4A 1JULA 1EP3A 2A85A 3QRHA 3L21A 3MI6A 2DZPA 3ZFHA 4E38A 1DHPA 2RDTA 4BFAA 2PC4A 5CPMA 4HN4A 4JTGA 3GIYA 2JKPA 4JYFA 2A7NA 4Z1AA 4ZQOA 3R5EA 1ZAHA 4Y9AA 1KFKA 4Z1DA 5D37A 4UTLA 2ALDA 4C1KA 1G4SA 3TXZA 3T44A 2A1YA 5HR7A 3P61A 3HG2A 4LTSA 3W1AA 3NA8A 1SR9A 2DP3A 2Q3OA 4EF8A 2ZRVA 4NUWA 1SFJA 2QJIA 4JR5A 4WX2A 5A5WA 1A5CA 4UFLA 5FI8A 5G2WA 3THQA 3DFPA 1UBSA 4EOUA 2J27A 4OE7A 3MYOA 4YL2A 3VKJA 3O05A 4LVBA 1RQBA 3I7QA 1H7NA 3LB0A 4K6AA 3W75A 1O94A 1QFEA 2WV8A 4LS1A 2XN0A 4JTEA 1I2PA 2ZRUA 4WQ6A 5D2XA 1G7UA 4JEQA 4JS3A 1LCOA 5K7JA 2V2CA 2HTMA 5AHFA 3KFTA 4UXDA 1OFEA 3P74A 5F1UA 3TK7A 5LNWA 3GXNA 4AF0A 4XWUA 1ICPA 3M5YA 4R53A 4RZ5A 4LVGA 4U4MA 4DQWA 5L9FA 1FWTA 4DPQA 1KFCA 5F2GA 4JTJA 3UQNA 2WSYA 3W6YA 4N02A 1QPRA 3NM3A 1RQHA 2V9DA 3OIXA 1V5XA 4NT0A 1J4EA 3LLFA 3O1NA 2VFEA 2A5HA 1OYAA 4TR9A 4ZQNA 3L68A 3P62A 2C15A 2UV8G 4GUFA 2QCFA 3W1RA 1YXCA 4O1AA 4OWGA 4GE8A 3WJYA 1FWWA 1SU5A 4QJ1A 4TMBA 3GB6A 4HNUA 4LRSA 1PCKA 4MFDA 5AYXA 2CLEA 4NJIA 4AWTA 2V0TA 4JX6A 3W1MA 3M44A 4YLWA 2B4GA 3S5YA 4AEOA 1TRIA 3N14A 1DQXA 2Q3RA 3M43A 3WFAA 4MKNA 4AWUA 4O53A 4WXZA 1WX0A 2OT0A 5AC7A 4OHQA 3W23A 2JGYA 1Q45A 3LTYA 2H90A 3N19B 4IPJA 3QM3A 4JXCA 5C5YA 3QF0A 3BW4A 4GFSA 5I3KA 4KFNA 5LKYA 4Z0SA 4O12A 4FX6M 1YXYA 3N9SA 5G5IA 4HNNA 3BV4A 3SI9A 3KXQA 3PY2A 3UYCA 5LNUA 1TPWA 3W7RA 2NV1A 5EYWA 2H8XA 2QCDB 1MEHA 3B0PA 3G1VA 1C8VA 4GNJA 4M6PA 4MYXA 3TUUA 4UR7A 5AYYA 3C52A 1HO4A 1O60A 3BLEA 4HKPA 3QMRA 2BTMA 4LU0A 2E77A 2DZWA 1KLZA 1HTIA 3VI2A 1TPB1 2A4AA 4YWIA 2ZDRA 4PODA 5DCEA 4MYAA 3UXAA 2QCEA 3W87A 3HIJA 3PBYA 4FNUA 3NG3A 4X2RA 4AWSA 1M7OA 1TTIA 3NQAA 3O63A 1SZEA 3M7WA 4MPQA 1LYXA 1SW3A 2WNQA 4DO6A 4CQAA 1TB3A 3WJSA 4N9BA 2V2HA 4QSHA 3W1UA 1NVMA 5FEXA 5EL1A 3PBWA 4O1DA 3QEZA 5D2WA 4G1KA 3IIVA 5HWMA 3DI0A 4XKYA 5EMUA 1R2RA 4O18A 3TU9A 3GLCA 1EPXA 1ZJIA 4WOZA 3C2VA 3G1SA 4FXSA 3LHTA 3SR7A 3ZR4A 3O16A 4ADUA 4FNPA 1QPOA 3W1PA 3T4CA 4E0CA 2P1FA 4OGZA 5FEZA 4QNEA 4M6VA 5U4NA 3LXCA 2EPHA 1R47A 5D38A 2V5BA 1VQTA 1WYIA 1OK6A 3W83A 4M6QA 2ZRYA 1F2JA 1IIGA 3G1YA 2CZ5A 2YGYA 1MXSA 3NEVA 5G4EA 2H8ZA 3IEBA 1QDSA 1OX4A 2YZRA 4LC8A 3EWXA 2CZFA 4JDBA 4UC5A 3W2JA 3B0UX 4HIBA 4MZYA 1Z48A 1PCWA 1JUKA 1O5XA 3IVUA 4N4QA 4OV4A 1S5VA 1VH7A 1KTCA 4K8EA 1SZNA 4R34A 4FX8A 2I9EA 4NU7A 4MZ1A 3CB8A 3U6WA 4L4MA 2CLMA 3WK3A 3PB0A 4UFIA 1IGSA 5CGQA 4GUJA 4O16A 3TCEA 3NQFA 4NZFA 3PR2A 2OZ0A 4NQ1A 4UFJA 1BWLA 4LY8A 3DGRA 1CI1A 3D0CA 1LDCA 1GYLA 4PH6A 1UUMA 3CTLA 4NX0A 2YYTA 3E02A 3MP4A 4P2VA 3S42A 2R94A 2C1HA 4RXGA 3W70A 5LHFA 5G1TA 1ALDA 5D04C 3WK1A 3A5VA 1NAL1 3LHWA 3WJWA 1S5TA 4C1LA 2J6XA 1FDJA 1JCMP 3WJZA 3W7OA 4DELA 3T7VA 4O0KA 3TA6A 1QMLA 4FIRA 3M0ZA 2GQAA 1N8FA 3GNDA 3L66A 2VEKA 3NQDA 1T8XA 1KBJA 4FNRA 1OFPA 3S0CA 4O0ZA 2AGKA 1VR6A 2H3DA 2JGQA 1X1OA 4LOCA 3M9YA 3SW6A 4N6EA 1M6JA 3UWUA 1WOBA 4PC8A 2WNZA 4MY1A 3G0SA 4ZQMA 2ZZ5A 3L0GA 2Y7FA 3EWBX 3W7QA 2NUYA 3LV6A 1NF7A 1TJPA 4R7JA 3LRMA 3P7YA 1H7RA 1TPFA 1MZHA 2IQTA 3TAKA 1H1YA 3LHZA 4LUIA 3MJYA 4OV9A 2RDUA 2RDWA 4FO4A 2TMDA 1FXQA 4ZQPA 3DFTA 4AHPA 3LOTA 4AHQA 1TMHA 5DBUA 2B7PA 2Y6ZA 2ISVA 2Y7DA 3EKZA 3LERA 1LM1A 4EVZA 1WXJA 1EIXA 3TDFA 1A5BA 3OVQA 4A3UA 4I9AA 4NJKA 3VCRA 1LZOA 3NPVA 2ISSA 4N4PA 2GUUA 1ZHAA 5HWNA 3C0JA 2Y63A 1OFOA 1O95A 1R46A 4DF1A 5KTLA 3STCA 1DJNA 2ZZ2A 1G69A 2HMCA 3IIXA 3DKLA 3TSMA 3G1HA 3S1WA 2O7SA 1VCVA 2QUUA 3P67A 3QSTA 3BPWA 1S5WA 2R91A 2FPYA 2R14A 3AO0A 5HMSA 2DZVA 1YLVA 5K4XA 2WOQA 3LX9A 4GBUA 1Z41A 3W85A 1VC4A 3CM4A 1ZALA 2NLIA 3W7KA 3G8EA 3UZ5A 2QDHA 1AL7A 1Q6QA 2G95A 3BW3A 3DXIA 5IM51 3C2FA 5DY3A 1I4NA 2Z6IA 3KVKA 3E12A 2ZYFA 5DN1A 4GC4A 4HSOA 5D2VA 2OX1A 4DF2A 3L2IA 1Y0EA 2C18A 2ZRXA 2ABAA 4RXFA 2O7QA 1B9BA 3KVLA 4S1FA 4NJHA 1ML1A 2VEIA 5J5DA 2DZSA 1PV8A 4WOQA 3ZWSA 3SY5A 1HUVA 4IJBA 1Q6OA 1LLWA 2QCNA 3GR8A 3S9YA 4GXMA 2ZA2A 1VPXA 1TPVA 1YPIA 3IGSA 4YCOA 3QZEA 2GVGA 1F76A 3OG3A 2CWNA 4CQ9A 2TRSA 1AMKA 5GVJA 1GVRA 3NZRA 1HFBA 4FNQA 2ZZ3A 3E96A 4FHAA 4OU1A 1FQ0A 4CNOA 3W76A 3NXFA 2PURA 4WY0A 3QC3A 2DZXA 4WY0F 3ABOA 1KTBA 1G7VA 1XC4A 1XCFA 3UWWA 3ZS4A 1EA0A 3NQ6A 1VS1A 1F73A 1NSJA 4JIQA 3A22A 3FKRA 3C3NA 2BXVA 1R2SA 3S8HA 3ELFA 1WBJA 1LBFA 1X8FA 1G4PA 1KLYA 2VFFA 3PG8A 2CLHA 4N6FA 1OX5A 3A24A 2EGZA 3I65A 3O8AA 2WJZA 3LGEA 4X22A 3UWQA 3NAVA 3QH2A 4NJJA 2NXGA 1SSDA 3L5AA 3PVFA 2J9ZA 4YMZA 1B3OA 1LP6A 3EWZA 5LSMA 3OA3A 4XBKA 1W3TA 3A23A 3LLDA 1DV7A 4LV4A 4O1BA 7TIMA 3R8RA 3W74A 1I2NA 1HL2A 4UTWA 1YYAA 2DU2A 1H62A 5LGXA 1H7XA 1P1XA 4XZ9A 3VE9A 1QPNA 5BMWA 4WD0A 3TC6A 3NGJA 1GEQA 1PHWA 3S1UA 1A50A 1IXPA 4FIQA 1OF6A 4PL1A 1OYCA 3CLMA 3TJXA 2ZBTA 3QYQA 2CLFA 1VCFA 4UTHA 5D05A 2QJHA 2QCCA 3DENA 1XM3A 1NEYA 2GQ8A 4O52A 5D09A 2QUVA 4UTWC 4RX0A 4O11A 4YXGA 3NQ8A 3G24A 2QJGA 2I1OA 4EWND 4JGDA 3UWZA 5HINA 5DCDA 5AC8A 3C56A 2J9YA 5FF0A 1NF0A 1W5NA 5DBTA 1ME7A 3PS7A 2NWRA 3GKAA 5HR6A 2F7FA 3HJZA 4LVDA 2X16A 4WJEA 2TSYA 1E51A 2YDAA 3LI1A 5D02A 1OG0A 4RKAA 1XFBA 3LBCA 4UCGA 2PE4A 1K03A 1ZAJA 1YTDA 2VFHA 2QEZA 5K9CA 4XQ6A 4AF0B 3DAQA 3GKFA 2BWGA 4N2YA 3H54A 3MMTA 3W7JA 3QMSA 2JKEA 3LCLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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