1G67A

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
225
structure length
225
Chain Sequence
GIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVAAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
total genus 82
structure length 225
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g67A00
3M43A 3NQ7A 3TV8A 5G2HA 4WOZA 5F1UA 4QAIA 2Y62A 5FEWA 3TU9A 4TX9A 4N4PA 5LGXA 4ZZ9A 4WX2A 2EGZA 1F5ZA 2YW3A 4ML9A 2ZZ5A 3IIOA 2WO5A 3KHJA 3M7WA 3NXFA 1QPRA 1TPB1 2Y7FA 3UWVA 3LTPA 2IQTA 1K8XA 2ZFAA 2V5LA 5D2VA 2ZTJA 5HWMA 3L66A 3QM3A 2YFOA 3S1UA 3IIPA 3W7PA 4N9CA 2RDUA 3P74A 1FWWA 1NF7A 1OX4B 4FNUA 3NAVA 3P81A 3O1NA 5EY5A 1M5WA 5CPMA 4LW7A 2XFWA 2ZQ0A 4GRSA 2ZYFA 4WY0F 5A5WA 3ATYA 3ZS4A 2BWGA 3KVMA 3ZFHA 4JX5A 4HIBA 5ABTA 5FF2A 1ZALA 1YLVA 4E38A 3HMJG 2H8ZA 1B9BA 4O1BA 4JTIA 5DBTA 3NZRA 3V1PA 3W86A 1VS1A 4UNLA 1VGAA 1KBIA 2F84A 3R89A 2P1FA 3W72A 5FEZA 4GBUA 2QCHA 4UXDA 1DJNA 1DL3A 1YXYA 1I2OA 3TFCA 5D33A 1HL2A 4ONVA 4RR4A 2FPVA 2AAMA 2NXIA 2FQIA 3GR7A 4CNPA 4CLMA 3IIVA 3BO9A 4AEOA 4FNRA 5G1TA 3GYEA 3TE9A 4QNEA 3NL3A 2GVGA 2YCEA 4GUFA 4OBTA 5CZJA 3BLFA 1XKYA 2B7PA 2DORA 3RU6A 5EKYA 3CWOX 1E51A 1O5XA 1T8XA 3O8AA 1GYLA 3PULA 1IXPA 4TMBA 4JDYA 4JXCA 4JX6A 4GUGA 4JY8A 1BTMA 4WD0A 2X16A 1SO5A 3UZ5A 1T99A 1FXPA 1DOSA 4RZ6A 4FNSA 3LBMA 3EX3A 5G2WA 2QCDB 1DHPA 2YZRA 3EWUA 4AHQA 3HB9A 4BWLA 4L4LA 1UUOA 2E1DA 2FLIA 2PRMA 1KM6A 2DZPA 1H1YA 1RR2A 3MO7A 3C2OA 3GK0A 4CQ8A 1EP2A 4HNVA 1TPWA 2BLEA 3IEBA 5D03A 2QUVA 3G1AA 5LNSA 1EX5A 4K6AA 1TYGA 4O1CA 5L9FA 5LNWA 3LTSA 3MUXA 2Y7DA 1I45A 1G4TA 1V5XA 1F6KA 4K7YA 3IIXA 4PH6A 4CNOA 3L9CA 5FF7A 5DCDA 3DKJA 2ZA3A 1DKWA 3P67A 4PA8A 1O94A 3W1UA 1EA0A 3NA8A 4HNUA 4UFMA 3N2XA 3S5ZA 2VC6A 5GVJA 1SW0A 1WQ5A 4JS3A 2EKCA 4WXZA 1GQNA 1R30A 1OYAA 3T40A 2A85A 4IMEA 1WBJA 2D73A 2PCQA 3W1RA 3L5AA 2ZCGA 2E6FA 3HPZA 3P8JA 4Z0SA 5G5IA 5K2ZA 1JQXA 1F76A 4HPJA 4UMCA 4M7SA 1YTEA 3QZEA 1K8ZA 2HTMA 3LRLA 1UASA 4ORIA 1VYSX 4ZQRA 1YPFA 1KM3A 2B0MA 3OA3A 3ABQA 3WK3A 1DQXA 5AYXA 4LVFA 3BW4A 3C52A 1B4KA 2E68A 2QCFA 4O19A 3FFSA 4NUWA 1VLIA 1P5BA 3YPIA 4Z0JA 4AH7A 3NGJA 3OVPA 3G1SA 3NZ1A 4TR9A 3P82A 3QPYA 4UTJA 3RFAA 1KFJA 2X30A 4IXXA 3N73A 1DV7A 3A5FA 2C15A 5HWNA 1PL9A 3KRUA 1XI3A 2H8XA 3TSBA 2QUUA 3VE9A 3W07A 1SFLA 4K38A 5G1YA 2Z0IA 5AHIA 1GEQA 3BARA 1W3NA 5LSMA 1W56A 5FF4A 1F7BA 2WQPA 4C1LA 3Q94A 3EX6A 1EEPA 2CZFA 1W0MA 3EB2A 3RLVA 2Z1BA 3LCFA 4R53A 1FCBA 3OVQA 4U4MA 4M5PA 4DPQA 3TMQA 4PFMA 2CLEA 4GE8A 4IQLA 3W2MA 1ZENA 3C8FA 3PBUA 3W73A 4JTEA 2DP3A 1FCUA 2ZZ1A 2BX7A 2V5BA 4KFOA 4AWUA 5FEPA 5C6MA 4UR7A 2FIQA 1TV5A 2AGKA 4ZQNA 2NXGA 4Z1CA 3UXDA 3HIJA 4XKYA 3BG9A 4BI7A 4EIVA 2X1UA 3GNDA 1F2JA 2GJLA 3WK1A 3M16A 3B05A 1W3IA 3L0GA 1K7XA 5DCEA 4A29A 2H3BA 5I3KA 4DO5A 3U2OA 3QQ0A 1AW2A 5F1VA 3R13A 1HFBA 3HF3A 3OIXA 1H63A 1LCOA 1N8FA 4LVDA 4IPJA 1H61A 1WOAA 2CLMA 4QJ1A 4XWUA 8TIMA 1QMLA 2RHGA 2Z6IA 3OVRA 4JICA 5F4WA 1Y0EA 1N55A 1TV8A 3TR2A 2NWSA 3B03A 3LCWA 3LXCA 3C56A 3DFTA 5HQEA 1WX0A 5CPOA 3DHDA 1ZY9A 3QFEA 3HOJA 3CEUA 3GZ3A 4R34A 4LTSA 4W9TA 5H91A 1OX5A 5CSRA 3TFXA 3PY2A 4UFIA 1JVNA 3NQFA 3TMLA 3LLDA 1QDSA 3TA6A 2NXHA 3W1AA 2E5DA 2GJNA 4ZL1A 1EUNA 5AC7A 2E6AA 3Q37A 2PRHA 5I3JA 3TIMA 4DBEA 1EWEA 4M7TA 3R8RA 4DF2A 4S2CA 2NLIA 3UY7A 1SSDA 3MI6A 1H50A 2Y6ZA 3FEMA 1VCFA 5EA9A 4AVFA 3TQ0A 2Y7GA 3E9AA 4LS1A 1JULA 4GFSA 1N7KA 3C6CA 1PE1A 1OG0A 2CU0A 5F4SA 4EF8A 4UTTA 1Z48A 4AWTA 3I7QA 2GQ8A 4OQVA 3M5VA 3O16A 1I8JA 3Q58A 1OFRA 5D2WA 2V8ZA 1TQJA 3M41A 3DGRA 4JTJA 1UCWA 4QSHA 4UMBA 2JKEA 1RQBA 4UTMA 3KVKA 1YPIA 1ICPA 2ZDRA 5K4XA 1F74A 4EWND 3FYPA 4JTTA 1SO6A 2B7OA 3OG3A 3HPXA 1WAUA 2I14A 2YDAA 3KVLA 3O06A 3P7YA 3BG5A 4YL2A 1MEHA 4JYFA 3EWYA 2TMDA 2ZZ3A 3E0IA 4OWGA 4YXGA 4ZMGA 3UNDA 2VFHA 3LM7A 2JKPA 4O14A 1FXQA 4NJHA 4FX8A 5FEXA 3GAKA 3S1VA 4FIQA 4X22A 5K9XA 5I3GA 3EWXA 4UTLA 3UY8A 3GDLA 2OCZA 3G22A 1JUEA 3FKRA 2Q8LA 1GVSA 3UWZA 3S5OA 4TIMA 1LYXA 3CQ0A 2QJHA 5U7SA 2V30A 4UIOA 4PCFA 1KBJA 1W8SA 5TQLA 4O1DA 1VYRA 1QAPA 3BPWA 3KOFA 2B7NA 3L68A 4FX7A 3ZWTA 2ZRYA 5LKYA 1UB3A 1AW5A 3W7GA 3Q2DA 1KFEA 3GDMA 2WNQA 2DZTA 1D3HA 4JNMA 5G4EA 1SU5A 2VFIA 3W1LA 1XDMA 5FF0A 3NOEA 3P5YA 3QRHA 3TSMA 2GUUA 1RD5A 1LRNA 1XDLA 1Z44A 1JCLA 1QR7A 2J6XA 5HWJA 2PRLA 4XQ6A 4LY8A 3EKZA 4Z1AA 1QFEA 3QMSA 3I6RA 3WJYA 3HG2A 1ZAHA 3I7RA 3F4WA 3CC1A 2VENA 2EF9A 1H5YA 4JYEA 5E1QA 1TV7A 4O28A 3CIXA 3W71A 2BTMA 3R2GA 1J4EA 3N3MA 3G0XA 3MWAA 2A7PA 3PUEA 1GPWA 1RZMA 4AF0A 3EXTA 3FIGA 3NQ6A 2G95A 3G0SA 2RDWA 4QNWA 5HR6A 1W1ZA 5HJLA 4GC4A 4UTHA 4QITA 3P5ZA 4A22A 3B0VC 3W1MA 2WOQA 1OK6A 5HMSA 1LRTA 1DQWA 4NX5A 3CM4A 3LV6A 1R47A 3LRMA 4Y96A 4NNBA 1CW2A 4E0CA 3DFSA 2I9EA 3LX9A 3H55A 4CCEA 4MOZA 4DXVA 1MO0A 4WUIA 5E93A 2EAWA 5D2XA 3L21A 3NL6A 4FNQA 3EWZA 4NQ1A 1S5TA 4DBDA 1K02A 4O4VA 1A5SA 4ALDA 1SZNA 3LCHA 4O10A 3STGA 1A5AA 5CGQA 3TX9A 1TJRA 3LXAA 2XN2A 4IMGA 2QAPA 3S9YA 1TPVA 1TRIA 3ANYA 3W3OA 5CG7A 1UJPA 4MJZA 2RFGA 1Q6OA 3SW6A 4O13A 4DF0A 3RK8A 2J9XA 2VFGA 1WDWA 4WY0B 3FJ6A 5C2XA 1ONRA 3LHYA 1OF8A 2H3DA 1JUKA 4UC5A 2W79A 6TIMA 4S2BA 3WK0A 3CU2A 2TYSA 2XN0A 4R7JA 2FPYA 3O15A 4TMCA 4IGHA 3S1WA 4LNYA 4O16A 4P61A 3C2RA 3S8HA 2G96A 2CLLA 1OK4A 3C2EA 2C3ZA 3T55A 3M5ZA 1ALDA 4IXHA 3QEZA 1DBTA 2ISVA 1F6PA 4JDBA 1Z41A 3NEVA 1LOSA 4R33A 3O63A 4DEFA 2ZBTA 2VELA 4N4QA 1BWLA 1FDZA 3CHVA 3KXQA 1TJPA 2DZWA 1MSSA 1I2QA 1JRCA 1EP1A 2V0TA 2O7QA 3N34A 3G1YA 4YMZA 1M6JA 1OX4A 1EP3A 3NM1A 1G4SA 5AB3A 3CLMA 3TXZA 1VR6A 3LLFA 3W1NA 1Q3NA 1TIMA 5IBXA 2QF7A 4FEZA 4BWLC 4NJIA 4JTKA 3O6CA 3F1QA 1QCWA 3W85A 2J27A 3CWNA 1TO3A 3TROA 1X8FA 4JTGA 3PF3A 3L5LA 1D3GA 3QF0A 3RNDA 4MZYA 1FQ0A 2C13A 4ADTA 4RZ4A 1A50A 2KZHA 3W7CA 3NQ2A 1QPQA 1XFBA 1LBLA 1RQHA 4UUIA 3NQ8A 4TO8A 4XBKA 3UWUA 1BKSA 3W1QA 1L6SA 2QCGA 3TCEA 2Y63A 3EXRA 5BMXA 1WV2A 1TPEA 2JK2A 1W5MA 3LCLA 5AC6A 2EPHA 1O5KA 4Q4KA 4PC8A 1G4EA 3FA5A 2JGQA 2CLOA 1TMHA 2QR6A 3MP4A 1JQVA 4OT7A 5DY3A 4NZFA 3E12A 4CNNA 1H51A 5AHFA 2WKJA 4JTFA 4UMAA 3W7RA 3TJXA 3HJZA 4AXKA 4O17A 3NQAA 4LC6A 3RLUA 2YX0A 4GJ1A 2TPSA 4DF1A 4NJGA 1M7PA 5KMYA 4LS2A 2C0AA 1IGSA 2Z6JA 2WSQA 3LCIA 2OMAA 2QCDA 1FY6A 1EIXA 4MKNA 2PE4A 2X1TA 3OEXA 4M6VA 5AYYA 4MIMA 3S0CA 3ABOA 1MXSA 1R2SA 4LS0A 2QAFA 3W87A 2FB3A 2NX1A 4JX4A 1PHQA 5C54A 4KWVA 3LXBA 3USBA 4RJEA 4KFPA 3TKFA 5FESA 1FCVA 2YYUA 4OV4A 3NQMA 3L2IA 2NUYA 1QPNA 3L0KA 4H6KA 5EMUA 5L6UA 3W7DA 1JUBA 3GDTA 3PB0A 3QC3A 2JGYA 1XBZA 3AJXA 3W7JA 4PL2A 2X1SA 3B0PA 2QJIA 4MLRA 1L9WA 5CZTA 3ATZA 1BWKA 3IV3A 5LZLA 1KM5A 5D38A 4O0KA 3PSVA 1HO4A 3JRKA 3BLIA 4WOQA 3F03K 4ZQPA 2DU2A 3EEGA 3LRKA 3FYOA 1CX9A 1IIGA 3TAKA 2J9YA 5KZEA 2BXVA 5CPLA 4A2RA 4TU1A 2R8WA 3HG5A 3QSRA 1H7RA 4PODA 2ZRVA 3DXIA 1GVQA 1HTIA 1KFBA 4LVGA 4N6FA 4MY9A 3G1VA 4I7UA 4K36A 2YGYA 4HNNA 4WXYA 1OFDA 3GB6A 1GVRA 2NZLA 3MI2A 3W2JA 1TTQA 3LB0A 2CZDA 2X1RA 1TTPA 5AN7A 3VCRA 4MJMA 3G3MA 3GNNA 4O4WA 3NPWA 3PWAA 4ZQOA 2O7SA 5EL1A 4AAJA 1WXJA 3L0NA 3GVGA 4IUOA 1TPDA 4BK9A 1XL9A 4PTNA 1VCGA 3TH6A 1I4NA 4FIRA 3I7SA 4N9EA 4YLWA 5D09A 1KM4A 4POCA 4OHQA 1XBXA 1UUMA 1KFKA 2W0UA 4FNTA 1OF6A 3LI0A 2WNZA 2R14A 1C8VA 1UBSA 3LTYA 1LDCA 4OGZA 3AO0A 3FOKA 5T26A 4N2YA 1JCJA 1TREA 2FDSA 3HG4A 4MFEA 3R5EA 3SGZA 5H2ZA 4WQ6A 5J5RA 5KINA 1GG0A 3N19B 3ABSA 1OX6A 1FWRA 4MYAA 2VEPA 2GOUA 4H3DA 3W9ZA 3SGUA 4XKYB 4KKXA 3B8DA 3DFPA 3W7LA 3CTLA 1GT8A 3TW6A 1TTIA 3M47A 3MI3A 1H7WA 4NZJA 2FTPA 1JJKA 1R46A 1L6YA 1EB3A 4NX0A 5AHEA 3S6DA 3EX2A 4N02A 4ZQCA 1RQEA 3DU0A 2RH9A 2WSYA 5CPNA 3T4CA 3W6YA 3NQGA 4IJBA 2QJGA 1O60A 1ZAJA 3GLCA 1MEIA 1EWDA 3WK2A 4RK8A 1PHWA 4LUJA 5U4NA 2G5WA 5CZ0A 4UTTC 4IX2A 4G1KA 3I65A 3B04A 2QDHA 3SY5A 3NPUA 1SZFA 1OABA 3D0CA 4JD4A 3QQ1A 3VFLA 1G4PA 2V81A 4PEKA 3QJAA 1I2RA 1VQTA 2NV2A 3W7IA 3WFAA 4K8HA 1K7FA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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