1E0VA

Xylanase 10a from sreptomyces lividans. cellobiosyl-enzyme intermediate at 1.7 a
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGRLSDSTYTSIAGREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSSADRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSALRQAMIDHINGVMAHYKGKIVQWDVVNEAFADGSSGARRDSNLQRSGNDWIEVAFRTARAADPSAKLCYNDYNVENWTWAKTQAMYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGAPASTYANVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDSDSWRSEQTPLLFNNDGSKKAAYTAVLDALNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Substrate Specificity in Glycoside Hydrolase Family 10. Structural and Kinetic Analysis of the Streptomyces Lividans Xylanase 10A
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE A
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces lividans
total genus 123
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2000-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e0vA00
1EH9A 4FLOA 3WQ8A 4B9ZA 2Y4SA 2V3EA 4W87A 2CXGA 3WEOA 1NWUA 1U30A 2YOCA 2CYGA 2G3IA 1MW0A 1W9VA 3MMUA 1W1PA 4QLLA 1QW8A 2VT0A 1J0YA 3VIHA 3AXIA 1O6IA 2CETA 3OLIA 5ABEA 3RILA 2W92A 1DWAM 4DWSD 2BVDA 3CZGA 1UWQA 4YPJA 2F2HA 1QNQA 2OYKA 2UY2A 4HOXA 5BXTA 3EDJA 4B9YA 1XSJA 1OD8A 3WUEA 1C7SA 4QCFA 3MV11 5FKYA 1TR1A 1CXFA 2EPOA 5CG0A 3MS8A 3VU2A 1WPCA 2PB1A 2WCAA 4HU8A 2WZIA 3A4WA 5I77A 2ZWZA 2BY1A 5E6ZA 2WBKA 1CECA 2VRKA 3AOFA 4PRWA 8A3HA 4GZIA 3WQWA 3T0BA 4DUXA 5KZ6A 1W9XA 4LPCA 4JFVA 4CU8A 3O9NA 4RE2A 1XH0A 1D3CA 1JI2A 1GPFA 2JALA 1E5NA 3THDA 3THCA 3OIHA 3NJ3A 1GONA 4HZ7A 3ALFA 2GUYA 2BY3A 2CHNA 2CHOA 1QVBA 1RP9A 4UQCA 4AW7A 4D6JA 3VIIA 3W81A 1UA7A 3WN6A 5AY7A 1HKIA 2DDXA 2J7GA 2D1ZA 1QI5A 3WNOA 4PSRA 1HJSA 2X2YA 1V6VA 5BROA 3WD2A 1MXDA 5A8OA 4M81A 1CNVA 2VCCA 3PTMA 1D2KA 3PZMA 4HOZA 4F8XA 3NSXA 5D4YA 4PEEA 4W8AA 1EO7A 2CESA 5A94A 2VCBA 4M80A 1JYXA 3G6LA 5BRQA 2QLYA 2YIHA 2G8ZA 1LL4A 4PUDA 2DSUA 2ESCA 1R86A 3FY1A 3EMQA 4L4PA 4NRSA 3UESA 3WF4A 2CNCA 3ARYA 4D6IA 3VX0A 3RO8A 3AIBA 1GHRA 2D0HA 1US3A 1GOKA 1XYZA 5IXEA 2QMKA 1CXHA 2EXOA 2W61A 4CN4A 1E9LA 4UQ9A 3WQ6A 1M7XA 5A8QA 1HJUA 3VKKA 3WD4A 3WDRA 2CBUA 4GQRA 1FHLA 1J0JA 5A6BD 1EHAA 2NT0A 2WVVB 4TTUA 3RM4A 4R27A 4FK9A 1JZ8A 1JZ4A 2E9MA 3T08A 4CVWA 1BSIA 2ZE0A 4RE3A 1AQHA 3W6LA 1ZL1A 1KFWA 3CUJA 3PZIA 5A8MA 3FXYA 1VRXA 2DT0A 4D6FA 1ZBVA 5LYRA 4MDPA 2YDRA 3OLEA 3SUVA 1HKMA 3AS1A 4W7UA 1BFNA 3RDKA 1CGUA 3BAXA 4KWUA 4OOZA 4URIA 1SMDA 4HA3A 2TAAA 3TTQA 3ARPA 4AIOA 3WNNA 8CGTA 3RMEA 1BYBA 2YKKA 5HPCA 3AYSA 4GI6A 2WWCA 5I3DA 3PHAA 1ZU8A 1J18A 3ZR5A 4LX4A 1NOFA 1DP0A 1ITCA 3GNOA 2GJRA 1XCXA 2WC7A 4HA4A 1J0HA 1H0GA 4MB5A 3WNLA 1XCWA 1CDGA 3WBAA 5IFPA 3AROA 3BMWA 2Y8KA 5EFDA 4P8WA 1E4MM 1FOBA 2YL9A 1JDAA 1V3KA 4UQEA 1JDCA 2FDMA 3N04A 4EK7A 4FLRA 4AZ5A 1QNRA 1A47A 3SUWA 3BAJA 3MSDA 6A3HA 1W3JA 2B31A 4J28A 2PWFA 4P7NA 3WMSA 1XV8A 4ZE5A 3NSMA 4FF5A 5E0CA 3WEMA 2VCAA 1W9BM 4QFUA 3BMVA 1H2JA 4AY1A 1JXJA 1SFSA 3PN8A 2BHZA 5ABHA 3DHUA 2VZTA 3ZSSA 2YL5A 3PZUA 2QMJA 3WDJA 4CKQA 1GORA 1UUQA 3CPUA 1E6PA 3F5LA 3WUGA 2Y5EA 9CGTA 3B9AA 1I1WA 2VUYA 3VD7A 1UG6A 2XHYA 4OIFA 5M03A 5GNZA 3F5JA 3AHTA 4W8BA 1K6AA 5A2AA 1WAWA 2VC9A 2JF6A 4QDMA 4S3KA 2FH8A 2AOSA 4D6CA 4N0RA 5A8NA 3RJXA 2XG9A 3DECA 2GK1B 3NIYA 4QLJA 3N13A 1XSIA 1HKJA 1OWQA 1BVZA 3PTKA 4X0NA 4XUYA 1HP4A 2NSXA 1NWRA 2VOTA 3GNRA 4CVUA 1CIUA 2WCGA 3SUSA 4BF7A 5LA1A 3GNPA 2C7FA 3I3EA 3RJYA 5A1AA 1B30A 2ZIDA 1BVNP 1B3YA 2BV9A 1Q6FA 2ZXDA 2DIEA 3U57A 2EBNA 1W9UA 1K9DA 5A8PA 3IJ8A 5C70A 3CUHA 5DO8A 2WM0A 4MNKA 1ZJAA 1TVNA 2PWHA 4LYRA 3POHA 3O6AA 4HP5A 3ARRA 3K8LA 4UFHA 3ECQA 2EJ1A 1X6NA 4MAZA 3AZRA 4YN5A 4BQ2A 1JL8A 4UOQA 4UCFA 1ZS2A 1BYAA 4UFKA 4PMYA 4GKLA 3F4VA 4JCLA 5C8BB 1B3XA 4UFMA 4BA0A 1IV8A 2OSYA 4P7QA 4B3LA 1JI1A 2EQDA 2DGAA 4MPKA 4AWEA 3CZEA 3GYCA 3F5KA 5LA2A 4U3AA 2D0GA 1PX4A 3AMDA 5IHRA 2DSZA 3PZGA 3VD9A 5I23A 2WKGA 1QW9A 3DC0A 3NUKA 5I78A 2D22A 4H04A 5DT7A 3FNDA 1U33A 4KGLA 1E3ZA 1OGGA 1W91A 1NH6A 4J3UA 4WK9A 2W5FA 2WVSA 4CUCA 5HBFA 5LA0A 1VEMA 2J7EA 1GOOA 3NCOA 2HVMA 1Q4NX 1GQKA 4GZEA 1E6SM 1CXLA 5M17A 3VPLA 2XUCA 4M8UA 3POCA 4EE9A 1E0VA 5JBFA 3ZT6A 1E72M 4F66A 1FH7A 1JYNA 2VO5A 1LLOA 1MVYA 5ABFB 4U5KA 1WZAA 5CZKA 5BWFA 4Z2GA 3SURA 3WL1A 5D9PA 4B16A 2WW5A 3KL3A 1E40A 3W25A 1KWGA 3OGRA 3VGGA 1UKOA 2D3NA 3CZLA 4TVDA 4TVCA 2XTKA 2VVSA 2J4GA 5DT5A 1E56A 2VX7A 3EMZA 1CGWA 3ZR6A 3IJ9A 3WDHA 2G3NA 5BXRA 4QP0A 1U2YA 4JFUA 1B0IA 2JFEX 3LPFA 2QF8A 4H8VA 1HT6A 2QPSA 2MANA 5BCAA 4CCCA 5CJ5A 1UZ1A 4IUGA 3AIEA 2EPLX 4M1RA 2WMJA 4N42A 4IISA 5I5RA 1GJWA 2G41A 4IM4A 2VL4A 1E70M 4HTYA 5EFFA 3L4WA 1KWKA 1PZ3A 3W82A 2YJQA 2CPUA 4WLCA 2ZX7A 3WMCA 1QI0A 3VINA 3BCDA 2UWFA 3AMCA 1FH8A 3VDBA 4OOUA 4DM2A 3UETA 1ZJBA 4KRUA 2WMHA 1DWIM 2E40A 4ACZA 2ZUTA 5FCZA 1BTCA 3HJEA 5CXPA 5KEZA 2BVTA 2E9LA 5CPQA 4ATLA 1CBGA 4ACYA 5A6JA 4UOJA 3VO0A 2E9BA 1G9HA 1ZBKA 1W2PA 1WCGA 5GNYA 1FH9A 3MMDA 1HL8A 5CLWA 1UH2A 2YLLA 1LWJA 1H4PA 1WE5A 1TMQA 1E6XM 3AIUA 4M29A 5HDRA 2XSAA 5AYIA 4ATWA 2VNCA 5FIPA 3VNYA 1KXVA 4W84A 3W53A 2ZXAA 4AIUA 3BCFA 3T2OA 4JL1A 1CENA 5HOSA 1C93A 1HJXA 3KL5A 3KEHA 2VZUA 4ZXOA 4HMCA 1QI3A 1G1YA 2WB5A 2XWEA 2XVNA 1IZJA 3PBGA 3DYOA 1JDDA 2XVLA 3W29A 4CD6A 3VD4A 3SEPA 3VGHA 4L4OA 3AJ7A 3JUGA 4ATDA 1OB0A 2ZICA 3VGEA 4CN6A 3UG3A 2J7DA 1UKSA 1JXKA 2E8YA 3UG4A 1R7AA 3AXXA 1HXJA 2VQTA 1EOMA 3GDBA 4Q7NA 2X05A 1PIGA 4BQ4A 5DEZA 3DHPA 1L0PA 3NYDA 5A6AA 2Y2WA 3MV01 4AZBA 4PMRA 4CD4A 4E8CA 3WENA 3FHQA 1VBUA 2CKRA 1UKTA 3L4ZA 4PTMA 1V3HA 1H11A 4XZBA 2BXZA 3UG5A 3W28A 1WZMA 3QOKA 1CGYA 3ARZA 2OYLA 4JAWA 1H1NA 4MADA 1QHOA 4WIWA 3VM5A 5I6SA 1US2A 1DTUA 1BQCA 1QNSA 3DYPA 1JF6A 1VBRA 3NDYA 1BG4A 5TD4A 4QAWA 3VX1A 1JZ3A 1E1FA 1EIBA 2XFRA 4AZCB 3WY1A 2DT1A 5BXSA 3ARTA 1PBGA 3CMJA 4JFWA 1EDQA 4U33A 3L2LA 4C7GA 3K4AA 1MYRA 2ZUNA 1UD2A 1EQPA 2X0HA 1CEOA 3MO4A 2X1IA 4HU0A 1JZ5A 3VIJA 3N9KA 1VFMA 2D20A 2YA0A 1W9PA 1JD9A 2AMGA 2DEPA 4Z2IA 4WKAA 4UR9A 4GIAA 1LG1A 1UOKA 4DUVA 4V2XA 4AEFA 2OLHA 5JIPA 3GM8A 4W85A 3VIOA 2Q8XA 1EDTA 3RM9A 1CLVA 4GI8A 2ZX8A 3WUBA 5GQBA 1WP6A 4JIEA 4WSJA 1V3LA 1WKYA 5ECUA 1Y7VA 2VI0A 3WL0A 4W89A 1QBAA 2JIEA 3BLPX 2DSWA 4KH2A 1KGUA 4X9YA 1KGXA 1NOUA 4UQDA 1QPKA 1M01A 1KQYA 2J62A 2O9PA 4PMVA 5ABGA 1MW2A 1OGSA 1V6WA 2AAAA 3EDEA 5A3HA 2WHKA 2WVVA 3A4XA 4GINA 4PCSA 1VEOA 2ZX9A 2DPEA 4XB3A 4P8XA 1DWHM 1JAKA 5AYBA 3VTRA 2VURA 1X6LA 4A4AA 1JYWA 2WPGA 3CHEA 3A6OA 1JF5A 1WNOA 4LYQA 2XGBA 4MNJA 3ZIZA 2WBGA 3RIKA 4S3JA 3T2QA 3N11A 2QPUA 1GOMA 4TX8A 4MB3A 1ZBCA 1EXPA 1R7OA 1W3HA 4ZE4A 1VAHA 3GXDA 3SCTA 3CTTA 1J01A 3BSGA 1OCQA 1BHGA 2OSXA 1QI4A 3HN3A 1WDRA 3CBWA 1CTNA 2J47A 3GBEA 4H41A 4U5IA 3GH4A 2EPMX 3QGVA 3PTQA 3AMKA 3OGSA 2CITA 2D0FA 1UWUA 1M04A 4D72A 4NI3A 4B3KA 1CPUA 1KBKA 3ZJ7A 1UD3A 3OLGA 4UFIA 3WNMA 3VIGA 1CXKA 2WLZA 2J7FA 4H7VA 1CYGA 4NSBA 4JCMA 2XFFA 4PMQA 1EQCA 3CO4A 3WBEA 1QOXA 2YA2A 2JF7A 1PAMA 2ZXBA 1NP2A 3OZOA 2CERA 1PEZA 2O9RA 2WAGA 4HZ6A 1UA3A 5D9OA 1V0KA 2J74A 2WMIB 1R85A 1HL9A 2YDSA 4MJ2A 2J8GA 3MUZ1 3OG2A 1E43A 3VGDA 3GH5A 1E71M 2GDUA 3VIFA 3T0DA 3CUIA 1CLXA 3QHMA 4PTVA 4AIEA 1BF2A 1G0CA 3BH4A 3D5HA 4F79A 3E1F1 3TONA 1HX0A 4PMNA 5JBEA 1KCLA 3WF2A 4DWSB 3AIWA 3L4VA 3W4RA 2WXDM 3U7BA 1C7TA 1E6QM 3ARVA 4Z2HA 2VZVA 3J7HA 5I79A 2WSKA 2GK1A 1M53A 3BAIA 2XM1A 4BQ3A 1VFFA 1V6UA 4P8UA 1UD6A 2XGIA 1GZJA 1GOWA 1ITXA 5M5DA 4DWSC 5AC4A 1BYCA 4PMDA 2ZUSA 5DF0A 4WKFA 2W66A 3PZ9A 3VIPA 3BC9A 3SCVA 1NM9A 3CHDA 5HNNA 4BQ5A 3ARXA 2FH6A 2E8ZA 3TOPA 4EANA 3EDKA 1J0IA 3K46A 1WB0A 1NOWA 1XGZA 1ISWA 3U5UA 2CKSA 4W93A 1G01A 3CH9A 2YLAA 2WANA 3PZVA 4AZ6A 1LJYA 4GO8A 3S6TA 5M3WA 3MANA 3LPGA 3ZJ8A 4CD5A 2YBUA 3WNPA 2FHCA 2GVYA 4OZOA 1NWSA 4PTXA 1HN1A 1P6WA 2WKLA 2FHBA 2CEQA 3ZOAA 4CD8A 1JAEA 4M56A 4GO9A 1UD8A 1E6ZA 3VNZA 2WMFA 4U2YA 4UZSA 2WC4A 4H8UA 4UQBA 2WHMA 1J10A 4EAMA 4LXFA 4CD7A 1GUVA 4UZUA 2G4FA 3QR3A 4AZGA 2GJXB 3VGBA 4HA1A 2XVKA 2J75A 1W3KA 2PWGA 4AISA 1AMYA 4HMDA 3A4AA 4UFJA 1TZ7A 3SIMA 1BPLB 2ZUMA 3L4XA 2XIIA 1ZB5A 2ZXQA 4KMQA 2BY2A 3IAPA 5E9AA 1YHTA 1E4NA 2W91A 3N1AA 1W9DM 3FAXA 3AHZA 2V38A 1XH1A 1KXTA 3MUY1 3VIMA 1UKPA 2BY0A 3II1A 2UY4A 3T2PA 4W7VA 3GH7A 1E1EA 3W24A 1L8NA 1YQ2A 2O92A 2VMFA 1JFXA 1TA3B 1H09A 3AHXA 1JYVA 1UZ4A 3L2MA 3BAWA 3T0AA 1FP8A 5ABFA 5EB8A 4AD1A 4Z2LA 5JBDA 3W27A 2OYMA 5E0FA 1QNOA 4W5UA 3EDFA 3MSGA 4ZXLA 2ZX5A 1VJZA 1HP5A 2NW0A 4X0VA 4MJ4A 2J77A 1UH4A 4HZ8A 2XJ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1EH9 A;  4FLO A;  3WQ8 A;  4B9Z A;  2Y4S A;  2V3E A;  4W87 A;  2CXG A;  3WEO A;  1NWU A;  1U30 A;  2YOC A;  2CYG A;  2G3I A;  1MW0 A;  1W9V A;  3MMU A;  1W1P A;  4QLL A;  1QW8 A;  2VT0 A;  1J0Y A;  3VIH A;  3AXI A;  1O6I A;  2CET A;  3OLI A;  5ABE A;  3RIL A;  2W92 A;  1DWA M;  4DWS D;  2BVD A;  3CZG A;  1UWQ A;  4YPJ A;  2F2H A;  1QNQ A;  2OYK A;  2UY2 A;  4HOX A;  5BXT A;  3EDJ A;  4B9Y A;  1XSJ A;  1OD8 A;  3WUE A;  1C7S A;  4QCF A;  3MV1 1;  5FKY A;  1TR1 A;  1CXF A;  2EPO A;  5CG0 A;  3MS8 A;  3VU2 A;  1WPC A;  2PB1 A;  2WCA A;  4HU8 A;  2WZI A;  3A4W A;  5I77 A;  2ZWZ A;  2BY1 A;  5E6Z A;  2WBK A;  1CEC A;  2VRK A;  3AOF A;  4PRW A;  8A3H A;  4GZI A;  3WQW A;  3T0B A;  4DUX A;  5KZ6 A;  1W9X A;  4LPC A;  4JFV A;  4CU8 A;  3O9N A;  4RE2 A;  1XH0 A;  1D3C A;  1JI2 A;  1GPF A;  2JAL A;  1E5N A;  3THD A;  3THC A;  3OIH A;  3NJ3 A;  1GON A;  4HZ7 A;  3ALF A;  2GUY A;  2BY3 A;  2CHN A;  2CHO A;  1QVB A;  1RP9 A;  4UQC A;  4AW7 A;  4D6J A;  3VII A;  3W81 A;  1UA7 A;  3WN6 A;  5AY7 A;  1HKI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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