1EP2 | Genus

Total Genus 93

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	309
structure length	305
Chain Sequence	ENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLEVIMTEKLPWLNENFPELPIIANVAGSEEADYVAVCAKIGDAANVKAIELNISCPNGQAFGTDPEVAAALVKACKAVSKVPLYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRQPILANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQDVDIPIIGMGGVANAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIDKLPELMDQYRIESLESLIQEVKEGKK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
publication title	Structure of dihydroorotate dehydrogenase B: electron transfer between two flavin groups bridged by an iron-sulphur cluster. pubmed doi rcsb
molecule keywords	DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE B (PYRD SUBUNIT)
total genus	93
structure length	305
sequence length	309
ec nomenclature	ec 1.3.1.14: Dihydroorotate dehydrogenase (NAD(+)).
pdb deposition date	2000-03-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1ep2A00

2J9ZA 4ZQCA 1XC4A 5DN1A 3HF3A 2VEKA 1PCWA 3PF3A 8TIMA 4UTHA 1H5YA 1LP6A 1O94A 1NVMA 3FLUA 2FIQA 2QCMA 4JTEA 1M7OA 3TFXA 2F84A 1O4UA 3CQ0A 1KFCA 2ATSA 2YX0A 5HUOA 4LT9A 4N4QA 4LWWA 3M6YA 4H3DA 3NQAA 3IRDA 3DFPA 5J5DA 2TMDA 3FKRA 3R13A 4CLMA 4ZL1A 1TB3A 5KZDA 2ZZ6A 3P8JA 4K7YA 3STFA 1F2JA 3W7NA 4XWUA 3M9YA 1FX6A 3QSTA 4XKYB 3LTYA 2QUVA 3NQ7A 3P82A 1CW2A 4NXKA 2ZQ0A 3GX9A 4HPXA 5D05A 1OX5A 4FX8A 4IX2A 4O15A 3LHTA 5KTLA 2A5HA 1QFEA 1WOBA 2CW6A 3FYPA 3G24A 3W7DA 2A21A 1S5TA 4X2RA 1PIIA 2OCZA 1LDCA 2CLHA 3HGOA 5FF2A 4JX4A 4NU7A 5I3IA 4DO5A 3GXNA 2ZDRA 2QEZA 1QPQA 1PE1A 3RLVA 1B9BA 3U2OA 2DZXA 3GNNA 1L2UA 4XBSA 3L0NA 3NOEA 1TPDA 5K2ZA 1F5ZA 1QMLA 1JCXA 1WBJA 4HIBA 4N9BA 3W7PA 2H3DA 3B04A 2FFCA 2X30A 2XN0A 1FWRA 1C29A 4RJEA 4D2JA 3NPWA 4GUHA 4PCFA 5HWMA 5DY2A 3LTSA 4CCDA 1OYCA 3MP4A 2H90A 4O1CA 2V2HA 3T78A 3VKJA 1DQXA 2GJLA 1O5KA 4Z08A 4NUWA 2DZVA 1JUBA 3P62A 3HB9A 5HWNA 1DJQA 2QCHA 3EWBX 2DU2A 3DZ1A 3EXTA 3B0PA 1OYAA 4OGZA 5EKYA 3KXQA 1M6JA 2ZFAA 5DXYA 2VELA 2WV8A 5AYZA 1GVRA 3CEUA 1BWLA 4Q33A 2GOUA 4N9EA 3PSVA 5FEPA 4JY8A 5H91A 1H1ZA 4YLWA 1WV2A 2GVJA 5F2MA 3HPXA 3W22A 4UUIA 5AN7A 3WFAA 3BGGA 4UTWC 4LVGA 3PB2A 3VE9A 4BFAA 3GDLA 4BI7A 5AFDA 1TO3A 4RCXA 5J5RA 1WAUA 1H62A 4O18A 3LXCA 1KFEA 3MJYA 1DKWA 2Y7DA 1KM2A 4O14A 3CLMA 5CZJA 2H8ZA 3B0UX 1VHNA 1SUXA 4IMEA 6TIMA 4FNUA 3DXIA 1JQVA 1VPXA 2WOQA 4UTJA 3QH2A 3NM1A 3W2LA 2YYUA 1KM6A 4PL1A 2Y85A 4Z1BA 5HMSA 2C13A 4RV8A 3GLCA 5FF3A 3L67A 3LHYA 5G4EA 5FEZA 1DJNA 5F2GA 1FDYA 1R2TA 2BX7A 3C0JA 3HBLA 3NQVA 3HGJA 2WSRA 4EOUA 3AJXA 1KFBA 5I3KA 4O11A 1R46A 3GVGA 1NAL1 2BZNA 3G8RA 3KHJA 3A9IA 2YR1A 4FNTA 4I7WA 2VEMA 4UMAA 1SSDA 2NX1A 4JDYA 5TIMA 4GUIA 1OFRA 3HGSA 3P80A 5D38A 3SZ8A 3NO5A 4UXDA 3UWWA 4UMCA 3N14A 3N73A 4JIPA 3SJ3A 4MFDA 4UTTA 3LHVA 2HS6A 3GYEA 2ZA3A 3PBVA 2ZZ7A 1TPEA 1T8XA 5G2WA 5DELA 4A2SA 3W1XA 3CT7A 4Z1CA 1Q6RA 3S1VA 5LHEA 5E1QA 3LM7A 2H3BA 4IX0A 3C8FA 3W85A 1W31A 4TMBA 1HG3A 3P84A 4FB7A 2AGKA 2OT0A 3WK3A 2QKFA 3GZ3A 5FEWA 1YYAA 3HJZA 4RXFA 4ADUA 1ZAHA 3NL6A 5HJLA 4JTHA 2E6YA 3P74A 2TYSA 3C56A 1DL3A 2AQWA 2Q3RA 2Z0IA 5A8GA 4IXHA 2GQ8A 3M5VA 2QDHA 1EB3A 3M7WA 5K7JA 2Y62A 2EGZA 1W3TA 3HQ1A 5F1VA 3ABQA 3BPWA 1X1OA 3PC0A 1L6SA 1XDMA 4JR5A 4JTUA 5EYWA 3JRKA 1HO4A 2Y7GA 2QCNA 4ORMA 5CPLA 4Z0JA 3S5YA 3MI2A 3L5LA 1ZHAA 1K8YA 5EPDA 1Q6OA 1SZEA 1KFKA 3NQ8A 2JKEA 4LS0A 5K9DA 1H51A 3LV5A 2GJNA 4O19A 3LRMA 4K8EA 3G18A 1J4EA 2FB3A 4CNNA 3OHIA 3O16A 1XL9A 4JY9A 3G1AA 5EBUA 4ZZ9A 3FEMA 4O13A 1TRIA 2ZRYA 1AW5A 4RK8A 1DV7A 4DEFA 1LRQA 1WYIA 3QEZA 4O54A 4S2CA 4NNAA 4Q32A 1OK4A 3UPBA 1O95A 5DY3A 4LRSA 2JGQA 2CLFA 2VFGA 2I14A 1AL8A 4FO4A 1XBXA 3PVFA 3DGRA 4JTFA 4NX0A 3P5YA 1U5JA 3V1PA 2WNZA 4CCCA 2A7RA 2DZTA 3CWNA 3ZWTA 1DORA 1ME8A 5CSRA 3TAKA 3FJLA 2ISWA 2C1HA 3MO7A 1W56A 3NQ6A 3L0GA 3PUEA 2ATMA 1N7KA 3W6YA 3EX3A 1Z41A 5AHEA 4O12A 4I7VA 3NPXA 1FCQA 3G0UA 3IVUA 3TE9A 1ZY9A 3LRLA 1G69A 3QPYA 1W5OA 5I3FA 1QNVA 3W1AA 4IPJA 3G1VA 2VFDA 3LCFA 3E02A 4O1DA 3QQ0A 3CTLA 3W71A 3OVRA 5DCEA 1UBSA 4O1BA 4MY8A 1VLWA 3W2UA 4BF9A 1GZGA 1TPWA 1XBZA 4JYDA 4RLIA 1PVNA 4LUJA 1LBFA 1LRTA 3G1YA 1R30A 2CLOA 1GVSA 1XDLA 4LNYA 5AHMA 4LVFA 3NXFA 5DBTA 2EF9A 5AHIA 1ZNNA 1B57A 3BW2A 4MYAA 1GTEA 2C16A 3QRHA 4TU1A 2QUTA 2C14A 5D2WA 4LC6A 3TV8A 1RD5A 4HT3A 1G7UA 1X8FA 4LUIA 2E68A 3N19B 4TIMA 3WJXA 2GVGA 2EAWA 3NQMA 1THFD 1NSJA 4IWWA 3FKKA 4L4MA 3EWWA 2FTPA 2ALDA 3LB0A 1QOPA 3UWVA 1TIMA 3G8EA 3NNTA 1OFDA 1GG1A 3GXPA 5D30A 3P81A 3W1TA 1P4CA 3P60A 3LCHA 3E96A 3SGZA 1ZJIA 4NQ1A 4AHOA 5I3JA 2NUXA 1IIHA 2QCDA 1YLVA 3UWQA 3W1QA 1WX0A 2ZZ4A 3PG8A 3EWZA 4Y6GA 4IMDA 3N34A 3G0SA 4X3ZA 4EIVA 4E2BA 2DP3A 4LVAA 4B5NA 1OFBA 1TJPA 4R33A 4FX7A 1KBIA 3B03A 4EF9A 3TA6A 3TQVA 1LZOA 1QDSA 2X2GA 3TCEA 3TW7A 2R91A 4G1KA 5KINA 2WPBA 4UFHA 3S42A 2E6FA 3LCLA 2JK2A 3S5OA 2YCEA 2YGYA 4GRSA 5HULA 1ADOA 3C2FA 4DO4A 5E0KA 1LORA 4QSHA 5D03A 1EUNA 4UFJA 4PTNA 2ISVA 4RZ6A 1TQXA 2VEPA 1GEQA 4IMGA 2CZDA 4UR7A 3KRZA 2G97A 4DO6A 3T55A 2VOMA 1KM3A 3MP5A 3QPZA 1VJIA 1AW1A 3HG2A 5E93A 3OBKA 1H7NA 4K37A 4OWGA 1K3UA 4O4VA 5EA9A 2VEIA 4K39A 2DJLA 1EEPA 1W5QA 5TQLA 1VYPX 3S9YA 1G4TA 3NQDA 1VHCA 1VLIA 2QR6A 4GJ1A 3W7JA 5D2VA 2C18A 3TSMA 1TTQA 3KRSA 3WJSA 2VXNA 4HSNA 3W9ZA 3DHFA 4UCGA 3A22A 2NV2A 5CPNA 4Y9AA 1OX4B 2BSLA 1PL9A 2QF7A 1YDNA 1B4KA 3O05A 3TW6A 5DLCA 1UB3A 4AEOA 4BWLC 2CLMA 2ZRVA 3TROA 4WOQA 3FA5A 4AVFA 4S2BA 1FCUA 3V75A 4EWND 3L5MA 3KVJA 3O63A 1N55A 2YXGA 4K36A 4WUIA 4M6VA 2CU0A 2NUWA 1KTBA 3W72A 4GWEA 5EMUA 5DBUA 5I3HA 1FY6A 4WX2A 4MJZA 2JBMA 4KWWA 3UZJA 2NXIA 2Y89A 3PR2A 4UNLA 5FF4A 1ZAJA 4Y8FA 1N8FA 2B0MA 3EXRA 4X22A 4E0CA 1V5XA 3W7RA 1MEIA 3W1NA 1RR2A 4TX9A 4QQ3A 3LCIA 3STGA 4UR8A 1W54A 1TTPA 4UFMA 1ZALA 5IBXC 5BW6A 2QCEA 1XBVA 4E2DA 5CZSA 3NEVA 3MMTA 3PBWA 3WJZA 3IIVA 2HS8A 2A85A 4I9AA 4OU1A 3TJLA 3RMJA 3S0CA 1EP2A 4MYXA 4XTIA 4JEQA 1ICQA 1YTDA 3GDRA 1H1YA 3TSDA 3KRUA 4H4IA 4BI5A 1IXOA 1KM4A 4EF8A 5L9FA 1PV8A 1MEHA 3ATZA 4Z0SA 2AAMA 1QWGA 1ZAIA 5AYYA 1YDOA 1WBHA 4AMAA 3MYOA 5CGQA 3HPZA 3RK8A 1Z44A 1QPNA 1OHLA 3R89A 5ABTA 1AL7A 4AH7A 2Q8ZA 1IXQA 3QW4B 5F4SA 3O06A 1O5XA 4DF1A 5F2IA 1HTIA 1KM0A 1WOAA 3LCGA 3UXAA 2W6RA 4IMCA 3P61A 2Y6ZA 1LOQA 3GKAA 2YSWA 1LYXA 1XCFA 4KFNA 3O6CA 2E6DA 2V2DA 5F4XA 5AC7A 5K4ZA 3DU0A 1Q45A 3CIXA 3F03K 3UQNA 1LBLA 3W2MA 4UFKA 3W7HA 1WA3A 3DI0A 4WQ6A 4AHQA 1GG0A 2KZHA 3F4NA 1ZCOA 3KFTA 3R12A 4XUGA 4FXSA 3LI0A 3CHVA 4AF0B 5I3GA 4MY9A 4ORIA 4GBUA 2TSYA 1F73A 3W1UA 1B4EA 3W7GA 2ZRXA 4JTJA 4Q4KA 5AC8A 4JNMA 1MZHA 1LROA 5C2XA 2OJPA 3UWZA 1SQ7A 5G4WA 3W83A 1H61A 1GYLA 1RQBA 3NL5A 4DF2A 4WY0B 1VS1A 4DPPA 1M7PA 1OFPA 4A21A 3L5AA 5D02A 3NDOA 4U28A 2QCFA 3CC1A 2ZYFA 2Y61A 4R34A 1W5PA 1FCBA 3BLFA 3NQEA 5C6MA 3TNOA 3GR8A 1A53A 2DZSA 2QAPA 3U8GA 2X1SA 1FWWA 3M5XA 1D9EA 2DZPA 3BO9A 3EWYA 3NZ1A 1SPQA 3LHUA 5EL1A 1G6CA 1TYGA 2A1YA 4RZ5A 5D09A 4DBDA 4R7JA 5LSMA 1ME9A 2LLEA 5D2TA 3G0XA 3N2MA 4X9SA 3FFSA 1H7WA 3OVQA 1FXQA 3QJAA 5LGXA 5G5IA 1KM1A 1KBJA 7TIMA 3QSRA 3C3NA 3TX9A 3W75A 1YXDA 4WXZA 1OX6A 4MZ8A 4NZJA 3NPUA 1YTKA 3SIZA 4OBTA 3LV6A 4ZQNA 2YYTA 4R53A 4O50A 1VYRA 4O0ZA 1OFAA 3NZRA 1A50A 2A6LA 5LNRA 3JS3A 3L68A 1ME7A 3QYQA 3A5VA 3GKFA 3WJWA 1DBTA 4JGDA 3HG3A 1F6PA 4GNJA 1C9DA 1I45A 1RV8A 2NLIA 1K7FA 4N6EA 3E0IA 3TMLA 3TC6A 2B4GA 4QM1A 1YADA 3KVLA 4CNOA 4DPQA 3LLFA 2JKAA 5BNKA 2CLIA 2C0AA 4ICNA 2QCLA 3DI1A 5DCBA 1JCYA 3LCXA 4A22A 1GQNA 4XKYA 5HNRA 1PS9A 4Y96A 3QMSA 1IXPA 2QUUA 3EXSA 4NT0A 3P5ZA 3LHZA 5D33A 1K8ZA 1QOQA 5FF7A 3G3MA 4HNNA 1FXPA 2XN1A 1KFJA 3EKZA 3QMRA 3MI6A 3I7QA 4QIUA 5GVJA 3PG9A 2I1OA 3LX9A 4C1LA 4CQ8A 3CB8A 3HG4A 3M16A 4O16A 4K6AA 2RFGA 1VCVA 3TDFA 1SO3A 1TTIA 3W7QA 1SO4A 1QPOA 4HN4A 3QW3A 3UY7A 3F1QA 3ABRA 4N9DA 1SFLA 2NXHA 1NF0A 1QCWA 2X1RA 3L66A 3RF9A 2DZWA 1KFLA 4JTTA 5IM51 3C2VA 1D3HA 3KOFA 2ZTJA 3BG3A 3S5ZA 1FCVA 1GT8A 3GDMA 3BLEA 3R5EA 4GC4A 2ZZ5A 4FXRA 4WY0A 4RX0A 3NQGA 5AHLA 1YPFA 3HIJA 3CM4A 3OVPA 1HL2A 1JULA 2NX9A 1K8XA 3TH6A 4NJJA 3MHFA 1FQ0A 3GR7A 4O1AA 1XXXA 2E5DA 3C4UA 1U83A 2PC4A 4PH6A 3OEXA 1HO1A 3FS2A 1T96A 2RKXA 3U6WA 1KTNA 1NF7A 3VI2A 4A29A 3W1RA 2A0NA 3BK0A 3HGRA 3PAJA 2CLKA 3BV4A 4BWLA 3GXTA 2YDAA 1G4EA 3C2RA 1DOSA 5HWJA 4MPQA 2GQ9A 2V5LA 4XBKA 4AWTA 3K30A 4PC8A 3G3DA 3I6RA 5SWUA 1VH7A 4HNUA 5D32A 3B05A 4FEZA 3W07A 4K8HA 3TKFA 2J24A 3MHGA 2WJZA 2YW3A 3W7LA 4OQVA 3M1ZA 4LV9A 4P2VA 3SI9A 4UTKA 1VQTA 3W7EA 1OF8A 5LZLA 2FLIA 4LRTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1EP2A

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