1TJPA

Crystal structure of wild-type tryptophan synthase complexed with 1-[(2-hydroxylphenyl)amino]3-glycerolphosphate
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
267
structure length
267
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the structural basis of the catalytic mechanism and the regulation of the alpha subunit of tryptophan synthase from Salmonella typhimurium and BX1 from maize, two evolutionarily related enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
molecule tags Lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 99
structure length 267
sequence length 267
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2004-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tjpA00
1O60A 1LLWA 1RQHA 1UUMA 3FEMA 4JTFA 1GJPA 3VNDA 4DQWA 3G1SA 1OX4B 5I3FA 4LU0A 4K39A 3S5OA 3NL2A 4GNJA 4R7JA 5C5YA 3W1AA 2DZSA 2V5BA 2FIQA 3LCGA 2NV1A 2QCFA 3M5ZA 1J5TA 3TQ0A 3IGSA 4LOCA 1TYGA 1O94A 4RK8A 4O4WA 3SFKA 2CLOA 3WK2A 5K2ZA 1O95A 4A3UA 2VC6A 4ZQRA 3NA8A 2Y7GA 4AHOA 4JTUA 1YYAA 1BWLA 3TR2A 3TJLA 5HQEA 4MIMA 2WO5A 2NLIA 2Y6ZA 5I3HA 3PBUA 4Z0JA 5A8GA 2XFWA 1NVMA 3HF3A 3P5ZA 4X9SA 4M7TA 1F5ZA 1S3HA 2V5LA 1P5BA 3N73A 2VKZG 3RLVA 2DZVA 1ZALA 4AWUA 2Z1BA 1ZENA 4WXYA 3DFQA 4PA8A 2Q3OA 3P5YA 3BV4A 4RJEA 1T99A 5BNKA 4I7VA 4UTTC 3FFSA 4NXSA 3EWZA 3PB0A 4JIQA 5EYWA 3S8HA 4Y6GA 2B7NA 1SZGA 4RLIA 1S5TA 1LRNA 4NJGA 4Z1AA 3CIWA 4QIUA 3W1MA 3ZR4A 4KWWA 4XWUA 3IV3A 2PC4A 2CZDA 1Z42A 4NXKA 1PV8A 3A5FA 2CZ5A 1GYNA 1RQEA 1W5NA 5SWUA 4S1FA 3TC7A 3MMTA 4D2JA 3O05A 1KBJA 4ZL1A 3LRMA 5IBXA 1Q6LA 3PG9A 2V2HA 1ICQA 1SZFA 5KZEA 4JD4A 1L2UA 1TPFA 2Y63A 1MEWA 1AW5A 5AYYA 2ZRWA 3NL5A 5AYZA 4O0KA 4NJIA 5K3VA 2PCQA 3H55A 3B06A 3GZ3A 4UFJA 5F1VA 1W1ZA 5KZDA 5U4NA 1S5VA 3O06A 3QMRA 1K8YA 3W3OA 1OG0A 3CQ0A 5CG7A 3T55A 3LHTA 3PS7A 1YDNA 2VFIA 3C8FA 4O4VA 2ZRZA 3M44A 4E2DA 5G4EA 4E38A 1R2SA 3S6DA 1WXJA 1B3OA 5FF4A 3W85A 4O13A 1WAUA 4FNPA 5EBUA 1ADOA 3W2JA 1LM1A 3NQ7A 3JS3A 3FJLA 3A22A 3NG3A 3TROA 1C29A 2AQWA 3N2XA 3VI2A 4ZMGA 1MO0A 1VHNA 3FYOA 1ME8A 3G1AA 2E6YA 2R91A 2TSYA 3B4UA 3PBWA 4LRTA 4IGHA 3GX9A 3KVLA 5CKSA 1W37A 1FWNA 5K9CA 5FF3A 3CM4A 3PSWA 2P0OA 3G8RA 3KRUA 2OJPA 3L65A 1KW1A 3STGA 3TX9A 3LLFA 2OT0A 4GUIA 2C18A 3MYPA 2E5CA 4OQVA 3RFAA 3QJAA 3G0XA 1H7PA 4GBUA 4P61A 4FNRA 5LNSA 1AL7A 3PUDA 3LHYA 2C14A 4MOZA 4FO4A 3RF9A 2Y7EA 5D05A 1NF0A 1A53A 3BW4A 3QQ0A 2PURA 5F4WA 3G0UA 1NFBA 4S2CA 3TAOA 5FEXA 2QCNA 1ZCOA 5G2WA 3CLMA 3DFOA 5G5IA 1NAL1 4LUJA 1ONRA 1GVQA 4YXGA 4DBDA 5AHNA 2QCDB 1JCJA 4DF2A 1ME7A 2DP3A 1HTIA 4O12A 4HNUA 1TCDA 1TTQA 2I14A 3L9CA 1JCNA 4MLJA 2B0MA 1NSJA 2VEPA 5HR6A 3LRKA 3O16A 4RCXA 3TXZA 1H7NA 3LI0A 2NWRA 4TX9A 4MYXA 4BR1A 3M9YA 3O6DA 4ADUA 3GNNA 1P0NA 3ATYA 1BWKA 3TUUA 5HULA 1ZAHA 4K7YA 3M0ZA 3MO7A 3GVGA 3SY5A 1G4TA 4N02A 1B4KA 1QR7A 1H63A 4NUWA 4IMEA 8TIMA 4YCPA 1VGAA 1AW1A 2QAFA 2A6LA 1Q45A 2YYUA 3QMSA 5HWMA 3GXPA 1KFEA 1QO2A 5EPDA 3NO5A 3WK3A 4MLRA 3TSBA 2FQIA 3HGSA 1TQJA 2Y88A 1YPFA 4IJBA 1F73A 2X16A 1VCFA 1TPB1 1WOBA 4IXHA 4FB7A 2QCLA 4LT9A 1PCKA 1SQ7A 4L4MA 3R5EA 3BPWA 3I6RA 3C0JA 4JTSA 2CZFA 2ZDRA 1WBJA 1MEIA 2QJHA 3G8EA 2E77A 2J27A 3STEA 3PC0A 4FXSA 3P80A 3B0VC 3M6YA 1TPC1 3E0IA 1PE1A 3ZWSA 3FA5A 4G1KA 3W7HA 4EF8A 4KWVA 2P1FA 3BARA 4AH7A 4XQ6A 3G3MA 1TPEA 4M5PA 3P60A 2YR1A 4AF0B 3HIJA 2FB2A 4RXGA 1SO4A 2DORA 3O1NA 3PG8A 3QZEA 3C4UA 2EPHA 4O28A 3T44A 3QM3A 1OFBA 2QCHA 3C6CA 4WY0F 4M7SA 3IEBA 3W1XA 1K3UA 1PHWA 1FWSA 4LNYA 5D33A 4FF7A 4HN4A 4JR5A 4LV4A 1YTEA 2TYSA 3IIOA 3P84A 1SW7A 2JGQA 3NQEA 3MWAA 4MJZA 1LORA 5LNUA 1BEUA 4UNKA 4CCDA 2QJGA 4HT3A 3CIXA 5LSMA 2J24A 3LOTA 3W2LA 4K6AA 3EX1A 1VH7A 4UCGA 4QAIA 1V5XA 3HOJA 2C19A 3IIXA 1SU5A 3F4NA 4AHPA 4JTEA 3PB2A 3O07A 3L0NA 2WNNA 2Y62A 5KITA 1YXYA 3C3NA 5E0KA 3NEVA 3DFNA 1EP2A 3LLDA 5BRBA 2NZLA 5D37A 3ANYA 3MI3A 2I9EA 4O1AA 1L9WA 2ZCGA 3EEGA 2OT1A 5D2XA 3M5XA 3EWUA 3UZJA 4UTWC 3NPWA 1QMLA 1KLYA 1O5KA 4FX6M 5K4ZA 2CLLA 4YLWA 4BK9A 1Z48A 3W2KA 3S0CA 3BGJA 3FKKA 4WXZA 2VEKA 2CZEA 2QCDA 2ZQ0A 3BW3A 3P7YA 5EY5A 4NZFA 3N2MA 3NPUA 2GQAA 2C15A 4JICA 4BWLA 4J9JA 5LKYA 4Q33A 1XCFA 4X2RA 1P1XA 4N2YA 3W88A 5F2MA 1IGSA 4M19A 1IXNA 1R30A 4IQLA 5AFDA 5CGQA 3S42A 4OE7A 3W1NA 4HSOA 3A24A 3NQVA 1MSSA 3Q2DA 3R2GA 1F76A 3C2FA 4JX4A 4RV8A 5FF2A 3G1FA 4BFAA 4MPQA 3TFXA 1R2TA 1AK5A 3TAKA 1EX5A 3LCWA 2UV8G 3NZRA 4OU1A 3FIGA 1RQBA 1UUOA 2GJLA 4LUIA 2NWSA 2CLKA 5C55A 4DO6A 3HBLA 3KRZA 4HNNA 1OHLA 2YFOA 3QSTA 1LOSA 1UBSA 5D38A 1C9DA 2H3DA 4O50A 3N9RA 3KVKA 3NQ2A 1DBTA 4DPQA 4JN6A 3W87A 1TV5A 2EHHA 3LHVA 3UY8A 3O63A 1XI3A 1FWTA 2A5HA 1XM3A 1LTDA 1KFJA 3AO0A 1PL9A 2RDWA 2DJLA 2A7PA 4EF9A 3HJZA 3TSMA 3LHUA 1KM0A 2FPYA 4MFDA 2YXGA 1JUKA 1X1ZA 3LHZA 1TRIA 3Q58A 4R53A 1PHQA 3HPXA 1JUEA 3DKLA 4JX6A 2Y7FA 2NUWA 2ZRVA 1G4PA 3CPRA 1SO3A 3FOKA 3LHWA 3STFA 3UWQA 1IIGA 2VFEA 3ATZA 3W83A 4O18A 3C2OA 1F7BA 3VKJA 1UB3A 3A23A 1TPVA 3G24A 3S1UA 3VE7A 4Y9AA 3LCIA 3UWVA 1PCWA 1BKSA 2Q8ZA 4K7VA 3LV6A 3W72A 3SW6A 1VZWA 4N9CA 1W5MA 3W75A 4OV9A 2QDHA 4WJEA 4A21A 1QFEA 2WNZA 4TMCA 1KV5A 2H90A 3JR2A 5L6UA 5MHBA 4C1KA 2VEMA 3CT7A 4U28A 1FDZA 3S9YA 1IXQA 4UTIA 3EX2A 3H54A 4K37A 3LDVA 5J5DA 1LOLA 2DU2A 4MFEA 4Z0SA 4LS2A 1I2OA 1RV8A 5G2IA 5D09A 1P4CA 3Q37A 4JDYA 2Q3RA 4QISA 2QCCA 2Z6JA 3EXSA 3B05A 3W7IA 5TQLA 2LLEA 3W74A 2NXIA 3GR8A 3O15A 3S5YA 4UFLA 2G95A 3KXQA 1JQVA 3P81A 1QAPA 1WDWA 1O5XA 2E6DA 2X1TA 2NX9A 1GVSA 1I2QA 4POCA 4XTDA 4K36A 3B03A 4JEQA 4YCOA 1SPQA 2CLMA 1M7OA 2ISVA 3NNTA 4IUOA 4O53A 2VFFA 1P0KA 3DHDA 2YCEA 2E09A 1KFKA 3TQVA 2GQ9A 1FBAA 2V0TA 2ZTJA 5EMUA 1KFCA 3DI1A 3P67A 3S5NA 3TCEA 1WYIA 2R94A 3E12A 1QO5A 3DU0A 3MW7A 3W7QA 5CSRA 2JBMA 2FFCA 1AG1O 2RFGA 4YL2A 5EL1A 3THAA 2FDSA 5CZJA 4NJJA 3TMLA 3LTPA 4KFPA 5A5WA 3G18A 3R13A 1TIMA 2ZZ6A 5L9FA 4UTMA 5F4XA 3KAOA 4GC4A 4OV4A 4MZ8A 2HTMA 3OVPA 3HGOA 1OFRA 1YTDA 3KRSA 3BG5A 3MHUA 1TREA 4DF0A 3I68A 1LBMA 4ONVA 1QOPA 3BG9A 5G2HA 3BK0A 1HFBA 1XDLA 5AC7A 2QR6A 3UY7A 2GQ8A 4GUGA 3TQKA 2Y61A 1VQTA 1KM1A 1DVJA 3UPWA 4QITA 4OWGA 3W84A 1TO3A 1DL3A 3HPZA 1EUAA 2QUTA 2YZRA 4O1BA 4DF1A 5FF0A 5LGXA 2A7NA 5FESA 4LVFA 5K9XA 3UYCA 3M47A 3SZ8A 1VR6A 2CFFA 4QNWA 5D02A 3M5YA 1TPWA 5K4XA 3GNDA 2C3ZA 2R8WA 5FEWA 2YX0A 2KZHA 3DBPA 5HUOA 4XTIA 4NJKA 3GDRA 3GKFA 1F05A 4H6KA 3T78A 4N6FA 4JY8A 4N9DA 1KM3A 1FDJA 3OEXA 5F1UA 5T26A 3E96A 2ZZ4A 3PULA 4NU7A 4MVAA 4P2VA 3OVRA 2F84A 3F03K 2VFDA 1XBZA 4LS0A 3FJ6A 5F4SA 3CWOX 1I4NA 1UASA 1VHCA 2B7QA 3LTYA 3W7GA 4R33A 1TQXA 5D2WA 2I1OA 3QRHA 2PRHA 4LVGA 2A21A 1F74A 4ZQMA 5GVJA 1RVGA 1I8JA 4UTUA 2CLIA 4QJ1A 4LS1A 3E9AA 5AYXA 1LDCA 1NEYA 1GVFA 1ZHAA 2ATMA 4IOTA 3G1XA 1GG1A 3IIZA 4PTNA 1SUXA 4X3ZA 4O0ZA 1S5WA 1QCWA 3V1PA 3AJXA 2YFNA 3MHGA 3DENA 4ML9A 4RZ4A 1K7XA 2F7FA 1FXPA 3W7JA 4C1LA 3WK0A 3W07A 1L6WA 3BGGA 2ISWA 1WBHA 4Y96A 3TK7A 3IGUA 3EX6A 3LXBA 4N9EA 5BMXA 2J9YA 2W6RA 3RK8A 4BI5A 3B8DA 1TV7A 5CZTA 3RLUA 3PY2A 1O4UA 4CCEA 4AEOA 1DQXA 5DCBA 5TBOA 4FNUA 4WOQA 4JX5A 3EX4A 1NF7A 3W1UA 2E5BA 4WX2A 5G4WA 4HHPA 3NQMA 6TIMA 5D32A 3UD6A 2EGZA 5D30A 3U8GA 3C52A 5AHEA 1N8FA 4Z08A 1H7RA 1YADA 4PH6A 1G4SA 5IBXC 1SFJA 1W5PA 1DHPA 4W9TA 3P8IA 4FIRA 3W7RA 1VPXA 3NQ8A 4O17A 5KINA 1D9EA 1A5BA 4JYDA 4LW7A 2CW6A 4O16A 3GXNA 1H5YA 4MUZA 5DLCA 5DN1A 3HG3A 2ZTKA 1F6KA 2VXNA 3NQGA 1YTKA 4XZ9A 1VCGA 2HMCA 5LHFA 3KX6A 3UXAA 1LP6A 2VELA 3SGUA 2ZRUA 4HPXA 1Q3NA 2PE4A 5DY3A 4UXDA 4NQ1A 4Z1BA 1FCBA 5J5RA 3FYPA 1W3IA 1FWRA 1ME9A 1DORA 3VE9A 4LVAA 4PL1A 4I7WA 5AC6A 1K7EA 1W5OA 2ABBA 3PAJA 1RZMA 1XXXA 2AAMA 3IIVA 3S1VA 3E49A 1DQWA 1TTIA 2A0NA 2QCEA 1DJQA 1A5AA 1DKWA 1KBIA 5F2GA 3BG3A 5I3IA 1ALDA 3GLCA 3W6YA 1VYSX 3T7VA 3CHVA 4FNTA 2E1DA 1V7YA 1IXOA 1FX6A 4R34A 1Y0EA 1T96A 3WJYA 1OF8A 4PC8A 5CSSA 1TV8A 4MY1A 3TA6A 1MEHA 2WOQA 1MZHA 1H7OA 3O6CA 5HNRA 4Q4KA 1EP3A 5AHMA 1TSIA 4JY9A 3W1PA 3LCLA 2XN1A 4JDBA 1SSGA 5C54A 4EIVA 3S1WA 4DXVA 2RDTA 3BO9A 3B0PA 4UTLA 3NQAA 1L6SA 3SECA 5CZ0A 3WJSA 4A2SA 2NX1A 1JVNA 1KV8A 2QJIA 3MI6A 1TTPA 1OVDA 3W86A 4X22A 1M7PA 3ABOA 2Z6IA 3N3MA 2WSYA 1I45A 3W1TA 1JRBA 1YXCA 4QSHA 1WX0A 2V82A 1OYBA 4XKYB 1X6UA 3IGXA 3S1XA 4MY8A 2V2DA 4IMFA 2ZA2A 1DOSA 1W3NA 1IXPA 1J4EA 4DPPA 3EWXA 3OIXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3T0D A;  5FJU A;  3O7U A;  2WWD A;  4JTF A;  3G1S A;  1OX4 B;  3GTI A;  3UA3 A;  3BL3 A;  3A13 A;  3S5O A;  3DYM A;  4GI8 A;  1V6X A;  1OB0 A;  3ITL A;  4XUY A;  1ZGD A;  1XLA A;  1CXF A;  3GC5 A;  3AXH A;  3M5Z A;  7ODC A;  1TYG A;  1O94 A;  2CLO A;  5A8N A;  3H2F A;  3NA8 A;  3G77 A;  3UNT A;  2E1W A;  3ONC A;  3H6O A;  2BHZ A;  1BWL A;  1UUQ A;  1MQR A;  1W9B M;  2Y6Z A;  5I3H A;  4XIA A;  1Q66 A;  3RX3 A;  1NVM A;  3LNP A;  2DSU A;  4J2P A;  3HF3 A;  1R38 A;  4M7T A;  1GON A;  1F5Z A;  2V5L A;  2BVD A;  3N73 A;  5FA5 A;  2WMF A;  2YJQ A;  3PNZ A;  2R6O A;  4PA8 A;  2NSO A;  3BV4 A;  4LJ3 A;  3WD0 A;  3VZY A;  4K1W A;  2WYS A;  2HVN A;  2Y8K A;  4L5Z A;  4NXS A;  3PB0 A;  4JIQ A;  1BYD A;  1SZG A;  1KRA C;  3RU8 X;  1IZJ A;  2CZD A;  3O9N A;  2CBJ A;  1DQU A;  3SQS A;  1RCO B;  1TVP A;  1CEO A;  5SWU A;  4QGC A;  5FSD C;  3DER A;  5IBX A;  1Q6L A;  2CBI A;  4LB4 A;  5REQ B;  1J0I A;  1M9H A;  2NSX A;  3GXF A;  4JD4 A;  3RG6 A;  1TPF A;  4FK9 A;  3WIJ A;  5HAO A;  4Z1Y A;  4NJI A;  3RCN A; 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