4FX6M

Crystal structure of the mutant v182a.r203a of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
MDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAIIVGASIYLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
total genus 86
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence N
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2012-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4fx6M00
1Q3NA 2GVLA 3FJ6A 2IQTA 1ZAJA 4JDYA 4WOQA 4DF0A 3BW2A 2J27A 1FCQA 1KLYA 3L9CA 1TPB1 2V30A 1CX9A 1LLZA 1TPEA 2Y63A 3SY5A 3NDOA 2V2DA 1D3GA 4LVFA 5G1TA 3GB6A 1H7WA 1TB3A 2JKEA 1NF0A 4JTUA 2QCNA 1EB3A 3CTLA 2O7SA 4AWSA 3LB0A 4E0CA 1SO5A 3IEBA 1PS9A 2RKXA 3TQVA 5EKYA 1FX6A 3EX4A 3KHJA 4LU0A 4E38A 1KBIA 1PCKA 1FCUA 2TYSA 3LV6A 4UTTA 2XN1A 1W31A 2Y7EA 4UFHA 3SW6A 4NZFA 2ZYFA 2BZNA 1L6SA 5KINA 1FXQA 4X3ZA 2CLIA 3LV5A 4R34A 2FDSA 2NWRA 2TRSA 5CZTA 3L21A 4DELA 4LV4A 4JTKA 4Q33A 3VE7A 5AC7A 4HSOA 5DLCA 3IRDA 2E6FA 3L0GA 1LTDA 3PAJA 3TUUA 3G0XA 1K03A 3DKJA 3VE9A 3HGSA 4J9JA 4X22A 3FFSA 4ALDA 1R47A 2WSYA 3L68A 3QC3A 4W9TA 3TMLA 3E0IA 3B4UA 1H7XA 2WSRA 3T7VA 3W1XA 3BGJA 3MBFA 5D2TA 3DFQA 4NXSA 4OBTA 4JX5A 4IX2A 4M6QA 2V82A 1PCWA 1LBMA 5AB3A 1EUAA 4IUOA 1QNVA 2G95A 3TU9A 3CEPA 1XL9A 3W1MA 1OFQA 3N2XA 3QSTA 1NSJA 3EXSA 1O60A 1B4EA 1H1YA 2C18A 4I7VA 4LWWA 1ZNNA 3IIZA 2E77A 1OG0A 3LM7A 3STGA 3W1AA 5HQEA 4ADTA 4MPQA 5LNSA 5A5WA 2H8ZA 3G0UA 2TSYA 3C8FA 1JJKA 4M6PA 3M1ZA 1RD5A 2ZFAA 3QQ0A 4AXKA 1LYXA 1WX0A 5FF4A 2YW3A 1VGAA 2QEZA 1KFBA 3UXDA 4PH6A 3BV4A 3WJWA 2I1OA 1TJPA 2QDHA 2V5BA 3GDLA 4IPJA 5EL1A 2QAPA 3NYZA 3M6YA 2Z6IA 4ZL1A 4JXCA 2B4GA 1H61A 3S8HA 1NAL1 5D30A 3QM3A 4LUJA 2R94A 3HQ1A 3FIGA 3LRMA 3GXTA 3MBDA 1Q6LA 2JBMA 3B0UX 1XBYA 3M43A 2ZZ2A 5FEXA 4Q4KA 3O6DA 3UY8A 4O1BA 1W5OA 4LS2A 3SJ3A 3L67A 5LNVA 1OHLA 2ZRXA 1OABA 2DZVA 4M7SA 2DU2A 4O15A 2G5WA 1TPWA 3O06A 3NQFA 3TKFA 3G3MA 2ZTJA 1SU5A 5F4WA 1LRNA 4AB4A 1GTHA 5H91A 1UASA 3WJYA 4MKNA 1FUYA 2OT1A 3AJXA 2C19A 4Z1BA 4OU1A 4JTEA 1VHNA 5DXXA 1OX4A 1YTKA 1GYNA 3L5MA 4YLWA 3UYCA 2QCEA 4ZMGA 3GR7A 3EB2A 3GDKA 5K3VA 3GKAA 3BK0A 3SR7A 2X1TA 3V75A 5AOUA 3C3NA 5LNRA 1O95A 4XTIA 1GVOA 2CFFA 4DO4A 5K7JA 4OHQA 3L66A 1KFEA 3W1QA 1TV7A 3W7GA 2DZPA 2QUVA 3ATYA 1A53A 2W0UA 3DI1A 2QCDA 2X1SA 3P8JA 2G97A 1VJIA 3DFNA 5KTLA 1W3IA 1KTCA 5DY2A 2OJPA 1ZALA 1YDNA 3DXIA 3W7DA 1S5VA 5DBUA 1OX5A 3PBVA 3UZ5A 2YGYA 2PRMA 1SO4A 4PFMA 3NOEA 3PR2A 5I3IA 3ZS4A 1XDMA 3DZ1A 5IBXC 3KRUA 4HHPA 3T44A 2F84A 4EWND 4E2DA 1X8FA 3N9SA 2V2HA 3KVKA 2B7NA 5D09A 3ZFHA 1VYPX 2Q3RA 2CZEA 3W1PA 1I2RA 5KZDA 5EBUA 3C61A 2B7QA 1TPUA 3TW6A 5DCBA 4IQLA 5AC6A 2GQAA 4X2RA 1ZAHA 2HTMA 2QJGA 2A7PA 1LCOA 1YTEA 4LVGA 3HMJG 4MVAA 1D9EA 1E51A 1JCYA 1OFAA 4HPXA 1EEPA 4JYDA 3W72A 4DXVA 4DPQA 2FIQA 4S2BA 1JULA 3UZJA 5SWUA 1GTEA 3VKJA 2EHHA 2VFEA 3PBYA 1RV8A 1VCFA 1G7UA 2JK2A 3MMTA 2NXIA 1RZMA 2PCQA 3WJSA 1TPH1 3DI0A 1FDYA 1QAPA 3HPZA 5T26A 2FPTA 4C1LA 1YADA 1M5WA 4AF0B 5GVJA 4U4MA 1R2TA 2NXGA 3IVTA 4CQ8A 3O6YX 5D03A 1OFOA 4FNSA 1HO4A 1UB3A 2Y61A 4EF9A 1PVNA 5HNRA 3TR2A 1P0NA 3IVUA 3NR0A 4WY0F 2C15A 2X16A 2QAFA 2E5CA 3NGJA 3TV8A 5K4ZA 1DJNA 1R2RA 4RJEA 1F73A 4IXHA 1FWNA 1KTNA 3OVPA 2VC6A 1DQXA 4UXDA 3C0JA 3JRKA 3L2IA 3LTPA 1DHPA 3HJZA 4RLIA 1QDSA 4N6FA 3T78A 1XFBA 5F4XA 4GFSA 4NZJA 1O94A 1HG3A 4JYFA 4UC5A 4EIVA 4KFPA 1SW3A 1M7OA 3EWWA 1Q6RA 4N02A 5EY5A 1QPRA 2WNQA 4QQ3A 2BX7A 5K9CA 1P5BA 1GG0A 1ICSA 3HPSA 4JTTA 3U8GA 3R12A 3W1RA 4IJBA 3TA6A 4MOZA 4BI7A 3RMJA 1ONRA 4RV8A 4D2JA 1LDCA 1DL3A 3E9AA 4Z1DA 3W2KA 3W87A 1Q6OA 1SZGA 1NVMA 4KFOA 4O13A 2QCCA 3PVFA 1SSDA 1TYGA 3NEVA 1CW2A 1TV5A 1I2PA 1WV2A 3M5YA 3P60A 2CWNA 5AYZA 2E6DA 4WOZA 5G2IA 4DBEA 1IIHA 5DELA 3KRSA 4OV9A 3WK2A 1ALDA 3LHVA 2HS6A 3OIXA 5HMSA 1A5BA 1H51A 1T0OA 4BI5A 4IMEA 3TFXA 3G24A 2FFCA 2GJLA 4UTLA 1ZJIA 3EEGA 2Y62A 3K30A 1LLWA 5AHMA 4O18A 2AAMA 5CPLA 2WKJA 3GYEA 2ZA2A 2O7QA 1GZGA 4FNPA 5DBTA 2ZA1A 1G67A 3TXZA 1C9DA 1TO3A 3LX9A 3S42A 1WXJA 1H5YA 2GPTA 2X1UA 2J6XA 3C2VA 4TMBA 3W76A 2H90A 1VR6A 2NUXA 5F2LA 4FNQA 1EA0A 5FI8A 2NXHA 1XM3A 2ZZ4A 1WAUA 1QOPA 2A1YA 3O16A 5DXYA 5D37A 2YPIA 2DZWA 2NUWA 1WA3A 4H4IA 5AHFA 5F2MA 4O57A 2ABAA 3SECA 1PV8A 1HTIA 2KZHA 4QAIA 4GRSA 1G4SA 3IIVA 3W1UA 3NNTA 1EPXA 1SPQA 4K36A 2P10A 4N9CA 3GDRA 4NJIA 1SW0A 5FF2A 3TQ0A 1B57A 3CT7A 3NA8A 1VH7A 2ZRYA 1LOSA 4GUHA 4A3UA 5HWNA 4TU1A 5I3JA 3WFAA 2Y7GA 3GNNA 4LVDA 4HIBA 1OYBA 3MUXA 5CGQA 2A21A 7TIMA 5LHFA 3I65A 5IBXA 4ZQMA 2A6LA 1OYCA 3HG3A 1KFJA 4QIUA 1OFDA 3CLMA 3UWWA 5G2HA 1W0MA 4AHPA 1CI1A 4MJZA 5D2VA 4WY0B 1KA9F 2YYTA 5K4XA 2BXVA 3DKLA 1K3UA 4YXGA 2ZCGA 1O5XA 3HGOA 4N4QA 2A7NA 1UUMA 3N73A 1SZFA 1WOAA 2CU0A 3SSJA 3W83A 1Z42A 3GK0A 4JDBA 2C6QA 3LHYA 5HWJA 2PRHA 3EX2A 1RR2A 1XBVA 5C6MA 1TJRA 3TIMA 2VFDA 3L0KA 4S2CA 3MHUA 1LBLA 2FPVA 3OEXA 1XUZA 2FPYA 3B04A 4UNLA 2QKFA 3C56A 1IXOA 3W7QA 5CZJA 1SW7A 1FBAA 3LHWA 2E5BA 5C5YA 1JUKA 3L5AA 3O15A 5F2GA 3NQGA 1U83A 2QCLA 3R5EA 1S5TA 4K38A 1QWGA 4ZQCA 3UPWA 3W7OA 4HNUA 1EWEA 1LOLA 3M7WA 3LGEA 2NV1A 1ZCOA 5FEZA 1X6UA 1XCFA 2CLHA 4EOUA 3HG4A 4DQWA 1W8SA 1OF8A 2XFWA 5FESA 2ZRVA 2WV8A 1L2UA 5BMWA 3O6CA 4Y6GA 5DN1A 3DU0A 3MP5A 3CU2A 1MEWA 3E96A 3P80A 5AHEA 4O4WA 1J2WA 3W7EA 3RLVA 2JGQA 3PUDA 1W54A 3PUEA 3HIJA 4GUIA 4OE7A 4XQ6A 2FB3A 1YXCA 3KVJA 4RZ5A 5FEPA 1I2NA 2B7PA 3FOKA 3B06A 2NZLA 2EKCA 4JICA 2I9EA 1JCXA 4O19A 4AH7A 2OT0A 3BLFA 1Z44A 4FX6M 3T55A 3YPIA 4AAJA 3C2RA 4MZ1A 1FY6A 3LCXA 3QMSA 4NJHA 4UTIA 2RFGA 1A5CA 4Y9AA 3TFCA 1TPFA 4HNTA 3N34A 1JVNA 3W74A 1PL9A 4IGHA 2ZQ0A 2H8XA 3LBCA 1H62A 1TCDA 1EWDA 5J5RA 2YZRA 2C13A 1B9BA 5LKYA 3BW4A 4Z1CA 2QR6A 3QW3A 3KVLA 1XI3A 3ZR4A 3CEUA 1KV8A 3LXCA 5H2ZA 4MUZA 5I3GA 1BEUA 2Y85A 2Q8ZA 4UTWC 1EUNA 1TPVA 1H7NA 4O1AA 3GKFA 1SR9A 4UTHA 5D2YA 3W6YA 4NX5A 1FXPA 5TBOA 1WOBA 3I7QA 5DCEA 5FEWA 2CZ5A 2Z0IA 3TSMA 3BLEA 1SUXA 1UJPA 3M5XA 4NT0A 3W84A 3NL6A 1GT8A 4Z1AA 5KITA 3UQNA 1HFBA 3C2EA 6TIMA 4KWWA 3CB8A 3HF3A 5E0KA 6ALDA 3HG2A 1SZEA 1SZNA 4MYXA 1V7YA 1KLZA 3FYPA 1XDLA 4FX8A 4IPIA 1H63A 1YTDA 2ZRZA 2C0AA 2A6NA 2PRLA 4O53A 3RLUA 3PY2A 2QF7A 3MYPA 1VYSX 4O11A 3NQDA 2HSAA 1TQJA 1W5PA 4ZQOA 1DV7A 1YPIA 2W79A 1K7XA 3H53A 4YCPA 2GOUA 3TC7A 4JD4A 1FWWA 4I7WA 1RQEA 4IOTA 1OX4B 2DJXA 4O12A 4WUIA 2C1HA 4UTUA 2ZTKA 3RNDA 5C55A 1XXXA 3W7HA 3B03A 1JUBA 1FDZA 5EPDA 3TH6A 1ME7A 4BFAA 3CIXA 1AK5A 2NUYA 2CLKA 3V1PA 1F2JA 1AL7A 4PL1A 3UD6A 5HJLA 3TXVA 4RX0A 2NV2A 3NQ2A 1K7EA 3WK1A 4LW7A 3C52A 4LV9A 3A5FA 4NNAA 4MY9A 2NLIA 1PHQA 3AO0A 1Z48A 3HB9A 3EKLA 1SFLA 3TC6A 3FLUA 4MZYA 3M16A 5AYYA 3HO8A 4UR8A 2DZTA 2HS8A 3TSDA 1PE1A 4BWLC 2E6YA 4Z08A 2FLIA 4YL2A 4O14A 2WPBA 3VI2A 3EWXA 4MFEA 4QISA 2VFFA 2V81A 1XUUA 1G7VA 3W7PA 5CSSA 1I2OA 2RDUA 5TQLA 3DFTA 2V9DA 4AMAA 4PTNA 3N19B 3CWNA 2A0NA 3ATZA 5D38A 3Q37A 5LNWA 1TMHA 3DFOA 3PG9A 4TMCA 3ELFA 5FF3A 4ZQRA 1PHWA 2CLFA 3QSRA 1J5TA 3LI1A 1RQBA 2FTPA 2H3BA 3I6RA 3W2JA 3W2MA 4JTJA 3SGUA 3BPWA 3VCRA 1TTJA 4MZ8A 5CZ0A 2R91A 4CCEA 3VNDA 4JYEA 2GQ9A 4XWUA 4UTKA 1AW5A 3CQ0A 4XTDA 3Q58A 1G6CA 3M47A 1AG1O 5F1UA 2J24A 4IX0A 3MJYA 1X7FA 2V8ZA 1KFCA 5CKSA 1DJQA 1NFBA 3W88A 4PC8A 1OFRA 5FF0A 2YSWA 3GX9A 3QH2A 3S1UA 4HKPA 1FQ0A 4R7JA 4ZQNA 3IGUA 4OT7A 1QCWA 4L4LA 1TSIA 3TAOA 4Y96A 2DZXA 3DFSA 1P1XA 3FJLA 4CLMA 2EF9A 2ATMA 3W1TA 2VOMA 3NPUA 3ZWTA 2WNZA 2NX3A 1FWSA 3KVMA 1OX6A 2NWSA 3G8RA 3TX9A 4LUIA 5L9FA 3LTYA 2GJNA 4HNNA 4GJ1A 3S5ZA 3WJXA 4K6AA 1VLIA 4UMBA 3JS3A 2Y6ZA 1P0KA 4DF1A 4A22A 2JKPA 1F05A 4IXXA 3S1VA 2A2IA 4LVAA 3SI9A 4X9SA 4TX9A 3Q94A 4CCCA 2A7RA 3W23A 3CPRA 3HGRA 4NNBA 1MO0A 3L5LA 3BGGA 3W1LA 4PEKA 3NQEA 4WD0A 4DBDA 3CIWA 2CLEA 3LCHA 4PL2A 1F5ZA 3LLFA 4JS3A 4K37A 4H6KA 3W7CA 3M5ZA 4UTWA 3ZWSA 2FJKA 3U6WA 4IMCA 3P5YA 3P74A 3P82A 4AF0A 4CQ9A 3WJZA 3O63A 4FF7A 4EF8A 1JUEA 1DOSA 4JTFA 5AC8A 4P2VA 5EMUA 3P7YA 3G8EA 4MLRA 4FXSA 1IF2A 2Z1BA 2Q8LA 1QFEA 3GXPA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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