1GVOA

Structure of pentaerythritol tetranitrate reductase and complexed with 2,4 dinitrophenol
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFYGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Enterobacter cloacae
publication title Kinetic and Structural Basis of Reactivity of Pentaerythritol Tetranitrate Reductase with Nadph,2-Cyclohexenone Nitroesters and Nitroaromatic Explosives
pubmed doi rcsb
molecule keywords PENTAERYTHRITOL TETRANITRATE REDUCTASE
total genus 140
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1gvoA00
4LY8A 2E5DA 1VYSX 3W07A 3W7EA 1OFAA 1TYGA 3W1LA 3NQGA 1W0MA 3NL3A 3G1XA 4Q4KA 1ICSA 3A9IA 3HGOA 3A22A 2HMCA 1VPXA 4O10A 4JTGA 4HHPA 4A22A 2PURA 1XI3A 1TPB1 2A5HA 3FYPA 3IVUA 2RHGA 5FF2A 3W23A 1VZWA 3EKZA 1O5XA 1SW3A 3DKJA 2NXGA 4TMBA 1TTQA 3OA3A 3P8JA 2VFGA 1SFLA 3TU9A 2H3BA 1KFCA 4MFEA 4O1DA 3K30A 4HKPA 2FPYA 4MOZA 3W75A 1IF2A 2RKXA 3EX2A 3P61A 4AAJA 1NVMA 1DORA 5I3FA 3GDKA 1QOPA 3KRZA 1N7KA 2NV1A 1ZENA 3NM1A 4X22A 3DFQA 3LXBA 2WNZA 3LDVA 4QNWA 3MHGA 3CWNA 5E1QA 2FTPA 2DU2A 1J2WA 3FJLA 3FKKA 3SGZA 2NXIA 3GB6A 3S8HA 3C3NA 2R8WA 3TSDA 1PCKA 5K4ZA 5F4XA 1NSJA 5HUOA 5BOOA 4YWIA 4GNJA 5DCBA 4IGHA 4UTIA 3LCGA 1Q6LA 1G4SA 4JXCA 4MIMA 5D33A 2Z6IA 5F2MA 2GQ8A 4HNTA 4FX8A 4QJ1A 2A21A 3CQ0A 1B9BA 4ZQOA 2R91A 3DI0A 3O07A 3MUXA 5A5WA 1EB3A 2FFCA 3USBA 1TV8A 3W70A 4G1KA 2YGYA 4IOTA 4JIQA 5HWMA 3PUDA 5G5IA 4FO4A 1OX6A 5BMWA 1XCFA 2H6RA 1XBVA 4DO4A 3TR2A 1ME8A 4MJMA 5BMXA 1D3HA 3NOEA 1LZOA 3DAQA 3RFAA 3W85A 1HTIA 3T7VA 4LW7A 3ATYA 4O0KA 3WK2A 3N19B 3H55A 4ZQMA 1H50A 4GFSA 4MZ1A 2WOQA 4FIQA 1JCMP 2FLIA 1QWGA 2Y88A 3B04A 4DBEA 1PS9A 4RCXA 5EY5A 4JX5A 3TQVA 1OFBA 3C6CA 2V2DA 1OHLA 2NUYA 3NO5A 4TU1A 1FY6A 1EIXA 3TSMA 2EF9A 3F4WA 1I2QA 2X2GA 2Q8ZA 4O1CA 3PC0A 3GYEA 3M7WA 2WNNA 2O7SA 3GDTA 3NR0A 1VCGA 2V9DA 2VFEA 2CLFA 4JICA 4N9EA 1GVOA 2B4GA 4WD0A 2X30A 3GAYA 3UPWA 1JUBA 3M5ZA 4E2BA 4E2DA 4ONVA 2ZZ1A 1XL9A 1QPQA 3QW4B 4PH6A 2A7PA 4N9DA 3O16A 3LHWA 3P82A 3QMRA 2QJIA 3EWWA 3TUUA 2CLHA 2VKZG 4GJ1A 3DFOA 4WXYA 5EA9A 5KITA 1UB3A 2OMAA 3P62A 2ZA1A 5FEXA 1UASA 5BW6A 2A1YA 2XN0A 3TC7A 1A53A 1DKWA 4S2CA 2E6YA 5D30A 2CW6A 2VEMA 3W2NA 3R5EA 1TPH1 2DZWA 3PBUA 4Y96A 4O54A 1BWKA 1J4EA 1I4NA 1LOSA 3HG3A 2J88A 2ZRWA 3RLUA 1YTEA 3EWZA 3N3MA 4JTFA 3P8IA 1DL3A 1XBZA 1VJIA 1VH7A 2ZRYA 3M16A 4IPJA 1R30A 4DEFA 2ZZ3A 4ORMA 1R2TA 3BO9A 4FNQA 3QF0A 1TTPA 1DJNA 1LP6A 2YSWA 4FHAA 1TREA 2ALDA 3GR8A 1XDLA 4A2SA 3W1AA 4I7VA 1FXQA 2JK2A 4IQLA 3B05A 3G0XA 1P5BA 3FEMA 1WBJA 4O4WA 3DFNA 5KINA 3HBLA 1ZALA 2QAPA 3QZEA 3LCWA 1GPWA 2UV8G 4BWLC 1MEIA 2WQPA 2H90A 3FA5A 2GOUA 4J9JA 3BG5A 5TQLA 3EXSA 6TIMA 5T26A 2NLIA 3GXPA 4XQ6A 2HSAA 5KMYA 2OT0A 1K7EA 4UFHA 2E77A 2X1SA 4XTDA 2AAMA 3W3OA 3NL5A 4RZ4A 4UTWC 3HG2A 3KX6A 1EPXA 1TPWA 4AHOA 2DJXA 2P0OA 4HSOA 3JR2A 1PVNA 4DQWA 4MY8A 3T44A 1J5TA 5LSMA 5EYWA 1R46A 3U2OA 5G2IA 1OX4A 1KLYA 4WJEA 2BWGA 3S1WA 3DKLA 3L5AA 3ZR4A 4K7YA 4DO5A 1OFPA 1TJRA 2DZVA 2QCHA 1FWSA 1W8SA 3W2LA 3M44A 4MJZA 3G22A 3MO7A 1A5CA 2WKJA 3WK3A 4ZQNA 2XN2A 1FBAA 3CEUA 3OHIA 3SJ3A 5CPOA 3NAVA 1OX5A 3M5YA 3I65A 4QQ3A 1QPRA 3CIWA 4ZQRA 1VHCA 2VELA 5AN7A 5G2HA 1VYRA 5F1VA 1YYAA 1WV2A 1P4CA 2X1RA 4YXGA 1TPC1 2ISSA 1WOAA 1RQHA 2ATSA 3G1AA 4O12A 2GJNA 3TW7A 2G5WA 3GNDA 5HULA 3KFTA 2E68A 2C13A 3IV3A 4KWWA 3PUEA 1OYCA 3W7DA 1X1ZA 3D0CA 4Z1AA 3GDRA 1RQEA 3I7QA 4TR9A 1T99A 1XBYA 3HPSA 4CCCA 4JGDA 4IPIA 2NX3A 3LCXA 4AB4A 3MI3A 4M7TA 5AYZA 3C2RA 3Q2DA 2Q3OA 3E9AA 1DV7A 3PR2A 4K38A 4LRSA 4UTKA 1FCQA 2GVLA 5AHNA 4XTIA 1W37A 5KSWA 1N8FA 3N73A 2OX1A 2ZQ0A 1KLZA 3VKJA 3KRSA 4GUIA 4UMAA 2FPVA 2YCEA 4JIPA 4QISA 4X2RA 3FJ6A 3IIPA 4NNAA 3PS7A 3O15A 4S2BA 3HG5A 3TAKA 3LHTA 3ZWSA 4DBDA 4NZJA 4FNUA 1LBMA 1NEYA 5CPLA 3TSBA 1VCFA 4R33A 1YADA 2QEZA 1UBSA 1W1ZA 3W87A 4HNNA 2JGYA 3TA6A 2LLEA 1RD5A 1MEWA 2ZZ2A 3H54A 3L68A 1KFEA 3L21A 3C2VA 3F1QA 3MHFA 5KZDA 1TPVA 3CTLA 3L66A 4N6EA 1A5AA 3DZ1A 3HPZA 4C1KA 1BKSA 2QCDB 4E38A 4IX0A 4U4MA 3G8RA 1K02A 3TXVA 3L65A 3LI1A 2I1OA 2ZZ7A 1MXSA 2E6AA 3EXRA 3LCIA 3LRKA 4UFIA 4Z0JA 3E12A 3W1QA 3NEVA 2Z0IA 3QSRA 4WXZA 1GVSA 1K8ZA 2TRSA 3LHUA 3UXDA 3WJWA 1JCLA 1H7RA 1FDYA 5FI8A 1Z48A 4LVGA 1T0OA 3UWWA 1VRDA 1OF8A 2WSYA 2W6RA 3LX9A 2WSQA 1GZGA 1O60A 4H4IA 3IIOA 4HIBA 1KW1A 3NQ6A 4Q33A 3MP3A 3I6RA 3G8EA 5LGXA 5K9CA 4UCGA 2QKFA 4WUIA 1KFKA 4NNCA 4RXGA 3TJXA 2BZNA 1PE1A 3FIGA 2WJZA 1O4UA 2C3ZA 2YR1A 3EWUA 5D04C 4MYXA 4UNKA 4LVDA 4JTEA 4FNSA 3G1HA 4LV9A 4A29A 3P7YA 5DBTA 3W6YA 4K36A 3BLFA 1PV8A 4UFLA 3UYCA 3EB2A 2TYSA 3A5FA 3W1RA 4O16A 4MFDA 3W1NA 3PY2A 4FB7A 1C8VA 5LHFA 2X1TA 1WDWA 4FEZA 3UWZA 1KTNA 3W88A 2QCEA 1XUZA 1KA9F 1K8YA 3UZJA 4MKNA 3GDMA 5HWNA 1I2RA 1ZFJA 1EP1A 5EBUA 5EKYA 3BVJA 2ZZ5A 1LYXA 1AW1A 4C1LA 3EX4A 3INPA 1I45A 3O6CA 5G2WA 1TRIA 2NWRA 2FDSA 1DQXA 3GZ3A 3FLUA 1KBIA 2IQTA 1JVNA 1TCDA 3C2EA 3AO0A 1AW2A 4A21A 2NX9A 3QYQA 2I9EA 5D02A 5L6UA 3QRHA 5H91A 1OK4A 2ATMA 4GUFA 4JEQA 1V7YA 4O18A 3OVQA 4JTIA 2EHHA 1I2OA 1R2SA 3W7MA 1YDNA 3W2MA 4OBTA 2A6LA 4QIUA 3MI6A 1T8XA 3NQ8A 2QUUA 3QSTA 3HOJA 4UTLA 3O1NA 1F6PA 1G6CA 3T4CA 1TQJA 3S0CA 1TPEA 1B4EA 1KV5A 5DN1A 3MP5A 2AGKA 2R14A 4LRTA 2H3DA 3UPBA 4JTHA 5AYYA 1NF7A 1FWWA 3GKAA 1LOLA 4ZMGA 3M5XA 1W5NA 2VFDA 4RR4A 3P5ZA 3DXIA 1H1YA 3LXCA 4M19A 2QCNA 3TDFA 4WY0A 2YYUA 1IGSA 4QAIA 5F2GA 4CCEA 4PEKA 4N6FA 3CWOX 1W5OA 2EKCA 3NL6A 5DLCA 4PTNA 1OYAA 3GXNA 3BARA 1X7FA 3G18A 1KFJA 1JCNA 2YFNA 3C8FA 3C52A 2ZBTA 4UC5A 4E0CA 3S5NA 4NX0A 4CQ8A 1H61A 2QJHA 1Q45A 3TIMA 1GG1A 3GLCA 5G4EA 4DO6A 4TO8A 3LHVA 5D32A 2Z6JA 3RU6A 5DBUA 3A21A 3W73A 4Z1BA 3M1ZA 3R13A 1HL2A 2CLLA 3HJZA 4N2YA 3LTSA 4PA8A 1WA3A 3KOFA 4IX2A 1Z44A 3QC3A 1AL7A 4UTMA 5C6MA 3N2XA 3W1UA 1G7VA 4UTUA 2C16A 1MO0A 4O53A 5G1TA 1XFBA 4BWLA 3STCA 3LTYA 2C14A 1Y0EA 1RPXA 3KVMA 2Y63A 3TAOA 4UTJA 4WQ6A 4JY9A 1S5VA 3PG9A 1D9EA 4BFAA 2Y89A 2A85A 5I3GA 5KZEA 1OFEA 1SSGA 2D73A 4KKXA 4ADSA 2CZ5A 2YYTA 3B0VC 1IIHA 1W3IA 4UTWA 1A5SA 4X3ZA 3PWAA 2G96A 3SSJA 2E09A 2CLKA 4PL2A 3W1MA 2Y7GA 5AYXA 2PE4A 3L67A 3NZ1A 1JRCA 1G4PA 4FF7A 3DHDA 3TQKA 1XDMA 1LOQA 4JYDA 3HG4A 2YDAA 4IJBA 2E6DA 4HNVA 4GRSA 1VQTA 4NJKA 3GK0A 1SQ7A 3M43A 1JJKA 2V82A 1W5MA 5IM51 2GUUA 2QCCA 3WFAA 2E1DA 4MPQA 2P10A 1SZGA 1YXDA 1TB3A 4NJIA 1YPIA 1P1XA 2EGZA 3TKFA 1X6UA 1ME9A 4UMBA 3BG3A 3NYZA 4O15A 4N02A 2J24A 3A5VA 2B7OA 4DF2A 5AC7A 4UR7A 3HMJG 3B0UX 4M6PA 4K7VA 3BV4A 1KTBA 3ABSA 2ZA2A 5HMSA 4OV9A 3V75A 3GAKA 4RK8A 1GVFA 4PC8A 3NZRA 4ALDA 4R53A 5D05A 4CQ9A 4LV4A 1VGAA 5I3IA 4K39A 1G67A 1LBFA 4WOZA 1JULA 1TPDA 4LS0A 1O5KA 1QNVA 3EEGA 3NG3A 3PVFA 4HSNA 2A2IA 3G0UA 4AHPA 3O05A 3DI1A 2PRMA 1WX0A 2CLIA 1EP2A 5AHEA 5AB3A 3MI2A 1H51A 3SY5A 3L9CA 2ZZ6A 4JX6A 4FXSA 3Q94A 3CLMA 5BNKA 1EUAA 4Z0SA 5FF4A 4O57A 1LRNA 3BW4A 3RK8A 4FXRA 1JCYA 4AVFA 1UJPA 2A6NA 3ZS4A 1RVGA 1QFEA 1ZAIA 2R94A 4AWSA 1W31A 4NX5A 2ZCGA 1OG0A 2GVJA 3SIZA 3NQ7A 2QF7A 1N55A 4S1FA 2TSYA 2NZLA 4GUJA 3G1SA 2V30A 1FX6A 3P67A 1EA0A 3GKFA 3UNDA 3S9YA 4ZZ9A 1MEHA 1WAUA 4K37A 5DCEA 4L4LA 3MYOA 3THAA 1OX4B 1W54A 2G97A 2CZFA 2ZZ4A 1LM1A 1B57A 4MY9A 2QR6A 4K8HA 1TRDA 1F74A 1ZCOA 3JS3A 1O94A 2J9YA 4OT7A 4BI7A 1HO4A 3EX6A 3B8DA 1YTKA 2NV2A 1F5ZA 3NQAA 1VR6A 4JS3A 1LTDA 3DGRA 2CLOA 2CLEA 1JUEA 4UNLA 2EAWA 3STGA 5K3VA 1JCJA 1WQ5A 5EMUA 1SO4A 1Q6OA 2ZRZA 4PL1A 4Y9AA 1TPUA 3NPWA 1QO2A 3KRUA 4WOQA 1SSDA 3NL2A 3QM3A 3DFTA 1GTEA 5K9DA 1IIGA 3EWYA 3B06A 3M0ZA 4EWND 3NQVA 3KVJA 5AHMA 3FOKA 4JTSA 4LS2A 1R47A 1RR2A 3UXAA 3G3DA 2V2CA 3N9SA 3A24A 1YDOA 2B7PA 4O14A 5ABTA 4CLMA 3PAJA 5CSRA 4UTTC 5AHFA 3WK0A 3G0SA 5AHIA 3BW3A 1L2UA 5IBXC 3MWAA 2NUXA 1QOQA 1FCBA 4XKYA 1MZHA 3W7GA 3TMLA 3H53A 4PODA 1DVJA 2J9XA 5F2IA 2VEKA 2E6FA 1DOSA 3QPYA 4BF9A 2ABAA 1XUUA 4FNRA 2W0UA 3TCEA 5F2LA 4YCOA 3ZFHA 2ZRVA 3S5YA 1QAPA 4CNPA 1WOBA 2Y7FA 3NXFA 5KZMA 3TX9A 3STEA 1QPNA 2JKAA 3TQ0A 5F4SA 5D38A 4UTHA 4HN4A 1H7NA 4O4VA 2CU0A 2VOMA 2V5BA 4FIRA 3L0KA 3QQ1A 2X1UA 3CB8A 3CEPA 4NZFA 3LLDA 4AH7A 3BW2A 4UFKA 1S5WA 2Z1BA 1JCXA 1XKYA 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