1NOUA

Native human lysosomal beta-hexosaminidase isoform b
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
498
structure length
480
Chain Sequence
ALWPLPLSVKMTPNLLHLAPENFYISHSPNSTAGPSCTLLEEAFRRYHGYIFGTQVQQLLVSITLQSECDAFPNISSDESYTLLVKEPVAVLKANRVWGALRGLETFSQLVYQDSYGTFTINESTIIDSPRFSHRGILIDTSRHYLPVKIILKTLDAMAFNKFNVLHWHIVDDQSFPYQSITFPELSNKGSYSLSHVYTPNDVRMVIEYARLRGIRVLPEFDTPGHTLSWGKGQKDLLTPCYSLDSFGPINPTLNTTYSFLTTFFKEISEVFPDQFIHLGGDEVEFKCWESNPKIQDFMRQKGFGTDFKKLESFYIQKVLDIIATINKGSIVWQEVFDDKAKLAPGTIVEVWKDSAYPEELSRVTASGFPVILSAPWYLDLISYGQDWRKYYKVEPLDFGGTQKQKQLFIGGEACLWGEYVDATNLTPRLWPRASAVGERLWSSKDVRDMDDAYDRLTRHRCRMVERGIAAQPLYAGYCN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Crystal structure of Human beta-hexosaminidase B: Understanding the molecular basis of Sandhoff and Tay-Sachs disease
pubmed doi rcsb
molecule keywords beta-hexosaminidase beta chain
total genus 178
structure length 480
sequence length 498
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2003-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1nouA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 1nouA01
4K68A 4HP5A 3THCA 4DM1A 1US3A 4PTMA 3WF1A 1EO7A 3VIMA 3ZJ8A 3U7BA 4CN1A 2WKGA 4QFUA 2CHNA 4H2CA 1GOMA 2J8GA 2WMIA 2PBGA 1JZ2A 3WH7A 3LPPA 1VB9A 5KZ6A 1ZBWA 2WVVA 4UFHA 3W27A 3CH9A 5A95A 1KWGA 5FOOA 1WE5A 5LA2A 3WFLA 1B3ZA 1SMAA 4WSJA 5ABEA 6TAAA 4TXEA 2VCBA 5C8BB 6CGTA 2XWEA 3WMBA 2WMGA 1UZ1A 4H41A 1OGBA 3CLWA 2VCAA 1WNOA 3WDQA 4D6GA 4QLJA 2XVPA 4TVDA 5AYIA 2ZXBA 1CYGA 5ABFB 4L4OA 1XH1A 4PEEA 3DYMA 3MUZ1 2E4TA 1NM9A 3AICA 4W88A 2CBVA 1PBGA 2CBUA 3VMNA 5BRQA 5I6SA 5A6AA 2VX5A 4P8XA 4IISA 2VZTA 1J0HA 1UG6A 5GNYA 1EHAA 5DF0A 2O9PA 2VL4A 3BSGA 1K6AA 3WDRA 3B9EA 2IUZA 4UTFA 1CWYA 2WZEA 5A2CA 2FHBA 3ALFA 1CXIA 5D9NA 3CIVA 1E0XA 1JNDA 2BVYA 1JF6A 1HN1A 1HXJA 4UZSA 2FHCA 1KWKA 5TD4A 4WKFA 1W9DM 4BS0A 2BV9A 2YL6A 1B3YA 2WW5A 5A69A 3L4UA 4IUGA 2GJXA 2YBTA 1J0KA 3VO0A 3VM7A 1QNOA 4ATDA 5E6ZA 1XCWA 3SIMA 1V6YA 5CPTA 3W25A 1M01A 1UWSA 1QI3A 1V08A 3HN3A 2ZXDA 4FLOA 4HA4A 3MV01 4C90A 2BXYA 1JDDA 3K46A 5HOSA 4HU0A 1BYAA 2W4XA 2J7DA 3SCQA 3VGHA 2GK1A 2CKRA 3VGFA 5CJ5A 2J8FA 1ZS2A 4CD7A 4MNJA 1EXPA 4S3KA 2O9RA 3RM8A 2WMIB 1U30A 5EB8A 2X0YA 1E6PA 1FA2A 1WZKA 4CVWA 4ML4A 1V02A 1TE1A 1Q6EA 2YA0A 4W93A 5E6YA 1VENA 1UWQA 2AOSA 1H0IA 1E6ZA 2WSKA 1QNPA 4CUCA 4QLLA 4Q7NA 4QAWA 2VZSA 3WQVA 3W4RA 2X2YA 4BQ4A 5HPOA 4Z2KA 1WAWA 4U3AA 1EQPA 4QCFA 3VD4A 2VMFA 1UH2A 1E70M 2BY3A 3FHAA 4H04A 2ZXAA 3GXIA 1J12A 1JAEA 2YIHA 1GHRA 2D3NA 3PZMA 4PMQA 3MU7A 2VVSA 2XM2A 3D5HA 5A8PA 3SUTA 1FP8A 1KR0A 4LX4A 4W8LA 3G6LA 1ZBCA 3ARXA 2UY3A 4AD4A 4OJYA 4UR9A 3UETA 3UESA 1ZJBA 5FIPA 1HP5A 4JKLA 1DEDA 1V6VA 2JEQA 4J3WA 2E40A 2RGLA 2Q8XA 1E4LA 1HNYA 2G41A 3K1DA 3VIPA 1FH8A 3PZNA 4J28A 4ZE5A 1D2KA 2VC9A 2DQXA 1GQKA 1ZBKA 2CBIA 2CPUA 4D6EA 1FFQA 3NDZA 3WNLA 5A6BD 1CGXA 3WSUA 1C93A 3F5LA 1PJ9A 4PMRA 3T0DA 1E4NA 1H49A 1GJWA 5IFPA 3IAQA 2VT0A 4E4PA 4M8UA 3BGAA 2XIIA 3RJYA 1UWIA 3WQ8A 4DWSD 4V2XA 4B9YA 3OGRA 2G3NA 3L4TA 2GJXB 3B9AA 1ITXA 4JKMA 3I3DA 5CPQA 3N17A 3W6LA 1V3MA 1QNRA 1JYWA 4D6DA 4PUEA 3SCRA 1GVIA 1PEZA 2J47A 2XYLA 2RGMA 3QOKA 1LWHA 2FH6A 2E9BA 3TONA 1E0WA 2XFRA 2QPSA 3WF3A 4TX8A 2WB5A 4W5UA 1HKMA 2GK1B 2ZIDA 3GXMA 7TAAA 5E70A 3DHUA 7CGTA 2BS9A 2VR5A 1OIFA 3VDHA 2W67A 3D3AA 3UG4A 4XUYA 4PSPA 3L4XA 3M07A 3LPOA 3MUIA 3M6DA 4CN6A 4DWSC 3CTTA 3WD1A 1UR0A 1HJVA 3VILA 1GNXA 4MB1A 1UA3A 3GH4A 4JFWA 3RO8A 4U31A 4AD1A 2WBKA 4PTVA 1NWRA 4UOZA 4AZHA 3BAXA 1MFUA 1JZ3A 1C8QA 3QOMA 1G01A 4MNKA 3N04A 1VEOA 2YDQA 1VIWA 1DWGM 2ZUWA 1VFFA 1OGSA 3NSNA 2BHUA 4KWUA 4FMVA 3VGEA 3GM8A 4E8DA 3HJEA 1NH6A 2XHYA 3VTRA 2YKKA 1FH9A 2J4GA 3RM9A 3WNKA 2ZX5A 1HT6A 1KGWA 1E72M 1EDQA 1HJUA 4FLRA 5EFFA 2ZWZA 3WN6A 1KXHA 1NARA 2XSAA 2XGIA 4HOXA 3KWXA 1SR0A 3KEHA 4TTGA 2W91A 2WCSA 3SCPA 4J7RA 3VDBA 5IHSA 4EKJA 2PWHA 1FP9A 2YDSA 4FF5A 3W26A 4D6HA 2DSVA 2DDXA 1VEPA 1FHDA 1HKJA 2W66A 3RJXA 4CN4A 1KGUA 1SYTA 3GZAA 4W8BA 5AY7A 1UQZA 3APGA 3AS3A 5AC5A 3CZGA 2YL8A 1ZB5A 4OKDA 3NIYA 1OBAA 3N9KA 1J0YA 4JL1A 2E9LA 1G94A 1AQMA 1D7FA 3SUUA 2AMGA 3A4XA 4UZUA 1LL6A 4B9ZA 4HOZA 5GQBA 1KCLA 4QCEA 4P7NA 2DT3A 1PX3A 4A3HA 3GBEA 1V02E 4AIUA 4FK9A 4YN5A 1GOWA 3UG3A 1WZMA 1ODZA 3AIWA 3RDKA 4M29A 3W6MA 3L4VA 2GJPA 3N18A 2V5DA 2J77A 4B3LA 3VPLA 1UD4A 1XD1A 1W9XA 1TA3B 3ARYA 4S3JA 2WAGA 2WZIA 1V3IA 3AXXA 2DPEA 5FL0A 1BYBA 3O9NA 4N42A 3VIOA 2CBJA 1CTNA 1M03A 4E2OA 1Q6GA 3DYOA 4CKQA 4NZCA 3AJ7A 4KGJA 1C7SA 3VDCA 4CD4A 3SEPA 3RPMA 1JFHA 3ALGA 3N1AA 3CZJA 2EEXA 1M53A 1GOOA 1WDPA 3GNRA 2WWCA 1NOWA 3WBEA 3LPFA 5A6BA 4PMOA 1W9VA 5A6JA 1JZ6A 1JIBA 1EIBA 3WQ5A 1QW8A 2EXOA 2J7EA 2OSYA 2VRQA 1E6XM 1W9BM 2WNWA 2J7FA 4JAWA 1R86A 4B15A 3T2QA 3UR7A 2PB1A 4NRSA 1KXQA 1GVYA 1HJQA 1TG7A 3U7VA 5IXEA 1XYFA 3ZT7A 3F4VA 1RD6A 5I0DA 1UUQA 4ZFMA 2J79A 4V28A 2XVKA 1PZ3A 2PC8A 3IK2A 2WK2A 1Q6FA 1R87A 4PTXA 2EQDA 3WEOA 3AXIA 3ARTA 5A8NA 3AHZA 3ARQA 1JYXA 2G3IA 3I3EA 3ZT6A 4X9YA 1ITCA 5BXPA 4P8WA 5C70A 1BVNP 3AIEA 3WF4A 2DT1A 2QMKA 3U57A 3WMCA 4HMEA 1BAGA 2VNCA 1OD8A 2VJXA 3GH7A 4MAVA 2GFTA 2NSXA 4W87A 3K8MA 1EH9A 4AD2A 5KEZA 2F8QA 2XTKA 3VINA 4HPHA 1NQ6A 2BY2A 5ECUA 1X6LA 4Q22A 5C71A 1C92A 3ARSA 1O6IA 3AHVA 3ZM8A 1NWUA 1XD0A 1DWFM 2CHOA 1W1VA 3AFBA 3NSXA 3IJ8A 4TTUA 3I3BA 2DSZA 1GQIA 1KFWA 1RH9A 3WKZA 1MW3A 3IJ7A 1ZBVA 2WVSA 2D2OA 1J18A 1GW1A 3ARZA 3OG2A 3ARUA 2JFEX 3GDBA 1K9DA 4A3YA 2WZHA 2WVTA 1K9FA 1B90A 5IFTA 4Z2GA 2XUCA 2NT0A 4BCEA 3CPUA 1GORA 3N13A 1JDAA 1E43A 1EO5A 3SCWA 1MW0A 5JBEA 2VX7A 1VJZA 1XCXA 1N82A 5EBAA 4GPNA 4HZ8A 3VNZA 3VD5A 1E55A 3CHFA 4MJ2A 1E5JA 3T0AA 4C91A 3KL3A 1H2JA 1JAKA 1E6QM 3ARVA 3VD7A 4M80A 1JL8A 2QLYA 2OYKA 1UOKA 3GXFA 4PSRA 3M46A 1I1XA 4RE4A 1UA7A 2ZX7A 4XZBA 2WC3A 2VZUA 4MJ4A 5CSYA 1MQRA 2PWFA 3S2CA 3CHCA 4IPNB 3HMCA 4Z2JA 3EMZA 3CUGA 3DC0A 2ZUSA 3TTOA 2OLHA 2F61A 2C7FA 2YJQA 3FNDA 1LL7A 1GQLA 1Q6CA 4GI8A 1DTUA 2IXVA 3IAPA 4XB3A 2VI0A 1X1NA 2Y8VA 4GIAA 5A2BA 3NDYA 1F4AA 1VJSA 5M3WA 1E40A 4UFIA 5DFAA 5LA0A 1EDTA 1GOIA 2VR4A 3K8LA 1DP0A 3LPGA 1V6XA 4Y7EA 3POCA 1TCMA 4GZIA 1EA9C 2EPLX 1FFRA 1J01A 3EDKA 3PZIA 1LJYA 2CERA 3O6AA 4AZ7A 2DIJA 8CGTA 3CUHA 2ZX8A 2D0FA 1W9UA 3GYCA 3VIHA 5FD0A 1E0VA 1UR2A 4ZEPA 2A3EA 1FH7A 2Y5EA 3VIGA 2E8ZA 4H8VA 3OGSA 5CQ1A 3AHXA 4AIOA 3VMPA 4C7GA 1BVZA 3AZRA 3BH4A 1TVPA 4PUDA 1CXHA 3PZVA 5DT7A 4GI6A 4UFKA 4EK7A 1KXVA 1KQZA 2WMHA 3A3HA 5JIPA 3WY1A 5A8OA 4NI3A 3II1A 1AVAA 4R5EA 3WBAA 3AXHA 3PTMA 1G5AA 1E6RA 1HJWA 2VCCA 3WNMA 8A3HA 4AIEA 1L8NA 3EDFA 2V3FA 1MWOA 1H1NA 3AMDA 4ATLA 1HJSA 5FL1A 1E73M 1HIZA 2YL9A 3W82A 1S46A 5E09A 5M5DA 1V0LA 1ZJAA 4C7DA 4UQCA 1UH4A 1WDRA 2Z1KA 2TAAA 4LPCA 2O9OA 4PBGA 2J75A 4ZENA 1UWRA 1ISVA 1E3ZA 1B3XA 3CUJA 4PMNA 1LLOA 5I5RA 2ZXQA 1LWJA 4PCTA 4W85A 4CU7A 2HVMA 1H11A 3CHDA 1V0KA 3J7HA 2VOTA 3CZLA 2C8NA 1PX4A 3RILA 2W92A 4GZEA 2B31A 1HF6A 3WF0A 2VQUA 2OYLA 4TX6A 1BF2A 5GPRA 2WXDM 1UQYA 4JFTA 1UKSA 4P8VA 4MB3A 3VIKA 2YA2A 3VDAA 3BMVA 4PMVA 4W84A 1KGXA 3MS8A 3ZJ7A 4D6IA 1OM0A 3MSDA 3OB8A 4UOQA 5E9AA 2D0HA 4KMQA 1JNEA 4PMUA 3WNPA 2E0PA 1H3GA 1QI5A 1UR1A 2VQTA 4J3UA 2VO5A 3PZ9A 2PWDA 3NCOA 1K9TA 1TVNA 2VX6A 1V3JA 2XGBA 2BFGA 2VRJA 3MV11 1ZL1A 4PMXA 3POHA 4U33A 4CVUA 5F7UA 3PZTA 3AISA 4ZXOA 2OWCA 1I75A 1MQPA 1RP8A 1MQQA 3AS0A 4AYSA 3G6MA 4AZ5A 1RP9A 4NRRA 4AD3A 2XPKA 3NYDA 2ZX6A 4WKHA 3BLPX 4YPJA 3OLEA 5JBFA 1OD0A 2AAAA 4Z2LA 1YQ2A 4JKKA 4LYQA 4FLSA 4RE2A 1VFOA 2BHYA 1W3JA 1KBKA 2J7GA 2WC4A 1CGTA 3T2PA 5GNZA 3GTNA 1A47A 4CGTA 1UKQA 2YBUA 3BCFA 1AQHA 2Y4SA 1MVYA 4F8XA 2J25A 3RIKA 1RPKA 4JFSA 3EMCA 1BSIA 4UFJA 3CBWA 1QNQA 3VNYA 3WDHA 2OYMA 3NSMA 1UZ4A 1WKYA 4DUXA 2CYGA 1UR4A 1TA3A 1WPCA 2VURA 2O92A 4F9JA 3WDPP 4X0NA 3WH6A 2JEPA 1VEMA 4F66A 3NJ3A 2XVGA 4DM2A 4JHZA 1GCYA 4IPLA 5CPSA 4GKLA 2D24A 2XIBA 4OIFA 5BYWA 4UQAA 4LXFA 1IZJA 2W63A 4CD5A 3BC9A 1CIUA 5FCZA 3WD4A 2Y8KA 2A3CA 5I78A 4UFLA 2WHMA 5IHRA 1WDQA 1Q4NX 2CCRA 2NW0A 4FLQA 1KB3A 4CU8A 1CLVA 1QW9A 4TVCA 2CEQA 4PTWA 4V27A 4HA3A 4MAZA 4OUEA 1JI1A 3W37A 2D23A 1X6NA 3MMUA 1E71M 1V03A 4PMDA 2DEPA 2GSJA 3U5UA 3DHPA 3T0BA 2OSXA 3AI0A 1JYNA 1HJXA 4F9DA 4HTYA 1PIGA 1B3WA 4JFUA 1R7AA 1XHGA 4AZIA 1Q6DA 3QR3A 4AC1X 3TTSA 5I2UA 1KCKA 3CMJA 2JF6A 1QI0A 1UYQA 4P8UA 1G0CA 3W81A 4EAMA 1JD9A 1QBBA 3WEMA 1ECEA 5D9PA 4PRWA 4AY1A 4AD5A 1WZAA 4AISA 4BQ2A 1G9HA 1XC6A 1AQ0A 2ZUVA 1U2YA 4TOQA 1XH0A 1JI2A 3PTKA 1MW1A 3WD2A 1E15A 4JZ5A 3L2MA 1MFVA 3WQ4A 3B9DA 2X0HA 2MANA 2PBOA 3F5KA 3RCNA 1Z32X 2V3DA 2UWFA 3F5JA 3W53A 1QI4A 4AEEA 1QHZA 1QHOA 5ABGA 3A4WA 3KL5A 1CBGA 4AMCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4K68 A;  4HP5 A;  3THC A;  4DM1 A;  1US3 A;  4PTM A;  3WF1 A;  1EO7 A;  3VIM A;  3ZJ8 A;  3U7B A;  4CN1 A;  2WKG A;  4QFU A;  2CHN A;  4H2C A;  1GOM A;  2J8G A;  2WMI A;  2PBG A;  1JZ2 A;  3WH7 A;  3LPP A;  1VB9 A;  5KZ6 A;  1ZBW A;  2WVV A;  4UFH A;  3W27 A;  3CH9 A;  5A95 A;  1KWG A;  5FOO A;  1WE5 A;  5LA2 A;  3WFL A;  1B3Z A;  1SMA A;  4WSJ A;  5ABE A;  6TAA A;  4TXE A;  2VCB A;  5C8B B;  6CGT A;  2XWE A;  3WMB A;  2WMG A;  1UZ1 A;  4H41 A;  1OGB A;  3CLW A;  2VCA A;  1WNO A;  3WDQ A;  4D6G A;  4QLJ A;  2XVP A;  4TVD A;  5AYI A;  2ZXB A;  1CYG A;  5ABF B;  4L4O A;  1XH1 A;  4PEE A;  3DYM A;  3MUZ 1;  2E4T A;  1NM9 A;  3AIC A;  4W88 A;  2CBV A;  1PBG A;  2CBU A;  3VMN A;  5BRQ A;  5I6S A;  5A6A A;  2VX5 A;  4P8X A;  4IIS A;  2VZT A;  1J0H A;  1UG6 A;  5GNY A;  1EHA A;  5DF0 A;  2O9P A;  2VL4 A;  3BSG A;  1K6A A;  3WDR A;  3B9E A;  2IUZ A;  4UTF A;  1CWY A;  2WZE A;  5A2C A;  2FHB A;  3ALF A;  1CXI A;  5D9N A;  3CIV A;  1E0X A;  1JND A;  2BVY A;  1JF6 A;  1HN1 A;  1HXJ A;  4UZS A;  2FHC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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