2X1TA

Crystallographic binding studies with an engineered monomeric variant of triosephosphate isomerase
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
238
structure length
233
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADALASLKDFGVNWIVLGHSERRWYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLAGLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Trypanosoma brucei brucei
publication title Crystallographic Binding Studies with an Engineered Monomeric Variant of Triosephosphate Isomerase
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE, GLYCOSOMAL
total genus 88
structure length 233
sequence length 238
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2010-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2x1tA00
4Y96A 3KVJA 4UUIA 5LNVA 4XKYB 1XI3A 3PM6A 4UTLA 4N2YA 3GKAA 4E2DA 1IXOA 3S42A 1VYSX 3TKFA 1YTKA 1T99A 4MKNA 1W5PA 3A9IA 5HUPA 3QRHA 3NQEA 4MJZA 3EWYA 3S1UA 3W7JA 1OFDA 3EX3A 3C2VA 3LCXA 1DJNA 4RZ6A 4WOQA 2C14A 5G4WA 2B7OA 1TQXA 5I3IA 1SO3A 3SZ8A 1W5MA 4O0KA 1Q6QA 3KAOA 2ZA3A 1IIGA 2YFNA 3TUUA 5H2ZA 1QOPA 5DXXA 1G7VA 1A5SA 5HQEA 3EWZA 5HJLA 5FF4A 1H61A 2H8ZA 3UWWA 3B06A 5AHMA 5KMYA 4ZQOA 2R94A 3G0XA 3NQ2A 2ZRXA 4OT7A 4Z0JA 3LXBA 4UTKA 1A5AA 3DAQA 4FB7A 4JDBA 5KITA 3P7YA 3LCGA 3E12A 4DF2A 1H50A 3IVSA 1O94A 4C1KA 1YLVA 2GPTA 3BG5A 2TRSA 1OYAA 1B9BA 1EP2A 2QCHA 1TPB1 2YX0A 4N6FA 1EWEA 2ZRUA 3FIGA 4MOZA 3DFNA 2QDHA 2V5BA 1I2NA 2C6QA 1OF6A 1LM1A 4NX0A 3KVMA 4LVDA 1NAL1 3P5ZA 1LOSA 1GTEA 1OFEA 2P10A 1LDCA 4P2VA 2ABAA 2OT0A 2JKAA 3MWAA 4GUGA 3RFAA 4M6VA 4HSNA 2B0MA 4HIBA 4PCFA 2BZNA 1XM3A 3C2EA 1DBTA 2CU0A 2ISWA 1XKYA 3O16A 4QSHA 1JULA 1P1XA 2DZUA 3KXQA 3QW3A 3FFSA 1LRNA 1R2TA 4LRSA 1Q45A 3HG5A 2WQPA 3QZEA 1EIXA 1KBIA 1D9EA 2GQ8A 4EF9A 3O6CA 3IGSA 2ZCGA 3TXVA 3WJZA 1W8SA 1UCWA 1WDWA 3MYPA 2DZXA 1RV8A 3F4NA 5D09A 4Z1AA 2C15A 3UY7A 5DXYA 1L2UA 4JXCA 2WNZA 4M6QA 3EB2A 1EPXA 4Q32A 1QPOA 3O63A 1FCUA 3G1SA 4IX0A 4K7VA 1TPVA 3OVRA 4LS1A 2PC4A 4L4LA 1JCNA 1KFCA 3PG9A 2BWGA 3GR7A 2J9YA 2X1UA 4CNOA 3W87A 1H1ZA 3PUEA 3GX9A 4BWLA 3RMJA 2ZZ6A 4X2RA 1LBFA 3LHWA 2C16A 1KFEA 2VEIA 3C2FA 4Q33A 2G95A 3MP5A 2FPVA 4KWWA 5IBXA 4CCEA 2LLEA 2RHGA 1R2RA 1E51A 3FJ6A 5F4SA 1H62A 4K7YA 4HNTA 4MFEA 2WSRA 2NUWA 1Q6RA 1OABA 2PRLA 1NF0A 4A22A 1TV5A 2J9ZA 1PS9A 4UNLA 4GNJA 3M44A 4BK9A 2A7RA 3W9ZA 3QH2A 1FDZA 3F4WA 3NPUA 1X8FA 2NX1A 4JX6A 3KVLA 2E6YA 4PL1A 2QCMA 4LUIA 1EWDA 3VNDA 4Y6GA 3EWWA 2GVLA 2JK2A 4RXFA 1OFAA 5CSRA 1HFBA 3FJLA 2Y7FA 3S5OA 1ICSA 1JRCA 4TMBA 5AC8A 2QDGA 4JY8A 4EIVA 3R12A 3PB0A 1ZAIA 4AF0B 2GJLA 1ZJIA 1WA3A 1T0OA 1Q3NA 1FWTA 2Y63A 3LCWA 4RLIA 5LGXA 1ALDA 1JUKA 3LHUA 4A2RA 1MZHA 3NEVA 4MUZA 2DZTA 4O1DA 3MBFA 3V1PA 3I68A 5D32A 1T8XA 2V8ZA 3UXDA 2E5BA 3LTYA 4LT9A 4HNUA 2YZRA 3BW3A 3T4CA 4AWSA 3A22A 1LLWA 1LYXA 3C3NA 4MPQA 1OVDA 3JS3A 1TPWA 2QCFA 5LGZA 2H90A 1OFRA 4QM1A 4S2CA 1G4PA 1LBLA 1SO5A 1ME7A 4JYEA 1TV8A 2BLEA 1LTDA 2W6RA 2VFFA 5F2GA 4FX6M 3GAYA 3IIPA 4EOUA 3CU2A 3IIOA 2G5WA 1FDJA 1T96A 3M0ZA 3QSTA 3KRSA 1F73A 2F84A 4FNPA 3W83A 3DHFA 3TAKA 3TQ0A 5K9DA 3QQ1A 2QJHA 4FF7A 2C18A 3FS2A 3NPXA 5CPOA 4FXSA 4YL2A 4JTUA 4IXXA 1OX4A 2A7PA 4O8RA 1EX5A 4LU0A 1PHWA 1ICPA 5DLCA 5DY2A 3NGJA 3ELFA 3SIZA 1RQEA 3HGRA 1TTPA 3S1XA 2TSYA 2A2IA 2EGZA 4UFLA 1W0MA 2JBMA 3THQA 3E9AA 2EF9A 1GEQA 3WJWA 2Z1BA 3CPRA 1TPUA 2J9XA 4AWTA 3GZ3A 2ATMA 5G2HA 3G1VA 1KM0A 4ZQRA 4IMDA 3T78A 1SZNA 5AHNA 4NU7A 1AMKA 1GVSA 3GYEA 3FKKA 4DQWA 3N9RA 4GUJA 2FIQA 5H91A 4UFHA 5AN7A 2V30A 3CEPA 4QAIA 3S1VA 3SJ3A 1KTNA 3L65A 2FPYA 1F05A 3IGUA 1GVRA 1W54A 1VQTA 3NXFA 3TE9A 3HOJA 4FXRA 5F2MA 4XBKA 1RVGA 3LHZA 4O53A 1CW2A 2CLMA 3W2JA 3CM4A 3DU0A 3PG8A 3LGEA 4UR7A 1XBYA 3AO0A 4BF9A 4JR5A 4QQ3A 2RDWA 2VXNA 1SU5A 3O06A 4ADUA 4PTNA 2ZZ5A 1OFOA 4K8EA 3MO7A 3DKLA 1AK5A 4AMAA 1THFD 3EXSA 1OJXA 4UIOA 2ZRYA 3PF3A 1DOSA 3LLDA 3RK8A 1F2JA 2HSAA 5D04C 1KFKA 4MYXA 2R91A 2QCNA 1OK6A 5GVJA 1I2QA 1IIHA 4WX2A 2NWSA 4LY8A 4E0CA 5C5YA 4IQLA 3P84A 4O18A 4HNVA 3TJLA 4LV4A 2DZSA 4DO6A 5KZEA 2Q8ZA 1I2RA 1WX0A 1GWJA 3STEA 2HS8A 3G1DA 3GDTA 5SWUA 1LOQA 1VJIA 1SZGA 1JUBA 2W0UA 3OIXA 1DQWA 3LXCA 2B7NA 2WV8A 4N02A 3W3OA 4IX2A 3ABQA 4NZJA 4GRSA 1BWLA 5DBTA 2ISSA 2RKXA 1FX6A 3W88A 2QCGA 3PBWA 1F7BA 4BFAA 1SW7A 2NZLA 5E1QA 5IM51 1MXSA 1XC4A 5FF7A 3G8EA 2YCEA 3T44A 3UWZA 4FIRA 5EL1A 3CQ0A 3KOFA 1HO1A 3G1AA 3W7OA 4UXDA 1TRIA 2JGQA 3NL2A 5EYWA 1MSSA 3IIZA 1N55A 5I3HA 5LHFA 1GYNA 3IIVA 5KINA 1P4CA 1X6UA 5U4NA 3PBUA 4FEZA 2RDTA 3DZ1A 5K9XA 3O6YX 1YDNA 3BO9A 4NJHA 4O1AA 5AC6A 1QOQA 1JUEA 3GDLA 4ZL1A 3UPBA 2Y7DA 1DL3A 1TO3A 5G5IA 4LC8A 1M5WA 1UUMA 2NLIA 4IJBA 1ADOA 1NFBA 4A3UA 1JR1A 3S1WA 3E49A 2VFGA 1DV7A 4QNWA 2Y70A 1YYAA 4MVAA 5DCEA 3W7NA 3QQ0A 2NX3A 3THAA 7TIMA 4UFJA 3M41A 4UTWC 3B0VC 4O4VA 3R2GA 3CLMA 3GK0A 5CSSA 4JTJA 3LTSA 4M6PA 4ZQMA 3OBKA 2CLFA 4TU1A 3GDRA 2B4GA 2WO5A 3W7CA 3QFEA 3NA8A 3Q2DA 3PSVA 1XBZA 1VR6A 4O10A 4CQAA 5AYXA 3SGZA 2OZ0A 5LHEA 3QM3A 3QMRA 1X7FA 4TMCA 4ORIA 1YXYA 5J5DA 3MI2A 3SR7A 4G1KA 5F4XA 3W1XA 1JCJA 4ZQPA 5BNKA 3TSBA 3O6DA 3N34A 2V9DA 2OCZA 3SW6A 1SW3A 1G67A 1NSJA 3BG3A 3HG2A 3SFKA 4DF1A 4YXGA 4OV4A 3W2LA 3G8RA 1A5BA 4MY1A 4P61A 5LZLA 3HGSA 3NQGA 2G96A 4JTKA 2E68A 2BSLA 1WBJA 4K36A 4MZ1A 4CLMA 2CZ5A 4GWEA 2QAPA 4ZQNA 3NL6A 2E6AA 2PRHA 2QCLA 4ICNA 4LVFA 4X9SA 2ZZ1A 3NPVA 1J5TA 2QUUA 4PFMA 5D2VA 1QO5A 2JKEA 3VI2A 4WQ6A 3IGXA 3NVTA 3DFTA 2OJPA 1ZAHA 1TIMA 2WPBA 4JTIA 5FEWA 1VZWA 3GXTA 4U4MA 2C3ZA 3LCHA 1C29A 1KM4A 2QCCA 1UJPA 4JYFA 5CZ0A 4NXSA 4KWVA 3HG3A 4XZ9A 1TTJA 5G1YA 3DFOA 2FQIA 1YTDA 1KFJA 2A85A 2NV2A 2QCDA 5G2WA 1QAPA 3LRMA 2FFCA 4HNNA 3TX9A 3N14A 4LV9A 5K4ZA 3O15A 3H55A 2FDSA 3ZWTA 3G24A 2VELA 3N2XA 4GBUA 3WJXA 5EA9A 3NQDA 1HG3A 2Z0IA 3LERA 1JQXA 2X1RA 2H6RA 1KW1A 4B5NA 1HO4A 3UY8A 1FCVA 3QJAA 3BK0A 5DELA 4FNTA 3PUOA 3UD6A 1QMLA 3WK2A 1ZENA 2GVJA 3SI9A 5HULA 3L2IA 5G4EA 1H7RA 5EMUA 5D05A 2P0OA 1VCVA 2VFHA 5LSMA 1UASA 4FNRA 4O1BA 5TQLA 4AEOA 4IXHA 3ZR4A 1FDYA 3NM3A 1SFJA 2Y85A 4TO8A 2YDAA 1W56A 3BLIA 4EWND 1SFLA 1I2PA 5D02A 2XN1A 3TCEA 3G3MA 1BEUA 3BLEA 2C0AA 4ONVA 1I2OA 1W5OA 5L6UA 2NUXA 4JN6A 4ZMGA 2GJNA 4IUOA 1W5NA 2WSQA 1N7KA 4XUGA 4ZZ9A 1B3OA 4Z08A 3LB0A 2WNNA 3W1PA 5HWJA 3HB9A 1XDLA 3P5YA 2PCQA 4TX9A 1BKSA 3U6WA 4DO5A 1O4UA 1LLZA 3C56A 4UTIA 4KFNA 4IPJA 4MZYA 5ABTA 3STCA 5J5RA 2TPSA 3PR2A 5K3VA 3QSRA 1VC4A 4RX0A 4IMGA 5HUOA 3W7GA 3ZS4A 4TIMA 1WAUA 5DBUA 3UQNA 1W31A 3GB6A 1ZFJA 4PODA 1AW5A 3DFQA 3G0UA 2Q3OA 3HQ1A 1PIIA 2WKJA 1OX4B 2VENA 2VEKA 4UTTC 3EX4A 2G97A 3W22A 1TRDA 4LNYA 4X3ZA 4IWWA 2HS6A 3LHVA 5AYYA 3M7WA 3Q37A 4XKYA 2QUVA 1G4SA 3HPXA 2CFFA 4GXMA 3P8JA 3O05A 3CB8A 3DKJA 4CNPA 1G7UA 5A5WA 5KTLA 4LW7A 3G1FA 1F6PA 1L6SA 1Z42A 3G0SA 1RR2A 1GTHA 1D3HA 1XBXA 3P8IA 1DVJA 4WXYA 4OGZA 3NQMA 1LOLA 2X30A 3IV3A 2F7FA 3W72A 1TJPA 3PUDA 1S5WA 1VLWA 4AHPA 5LNRA 3LHTA 1QCWA 2XFWA 5KSWA 4BR1A 4Y90A 3EWUA 2E6DA 2NXIA 3SY5A 4K6AA 4UR8A 4NXKA 5CGQA 3KVKA 1DKWA 3LTPA 3OG3A 2Y88A 2ZZ4A 1U5JA 1LRQA 3OEXA 3P80A 3W1MA 4I9AA 1GT8A 1SPQA 1YDVA 2BXVA 5EPDA 3NOEA 5HMSA 1K03A 4FIQA 2A7NA 5EBUA 3EWXA 2NV1A 3I65A 4O16A 3M5ZA 1RQBA 1O5XA 5TIMA 4JX5A 3DBPA 3KRUA 5CZTA 3P61A 4R33A 2NXHA 4MJMA 3USBA 1EUAA 2VOMA 3LHYA 1H7PA 3B05A 4OQVA 4UFKA 2ZZ7A 5G1TA 3RU6A 3A21A 1BWKA 2ZRWA 3PC0A 5CG7A 3FYPA 4LVBA 1FCBA 4K8HA 1P0NA 1X1ZA 1MEWA 5BMWA 1K8XA 3VE7A 2VFDA 2I14A 3TDFA 4PEKA 4RCXA 2CLLA 3MHFA 5D38A 4DBDA 3QYQA 4DPQA 1WQ5A 1WXJA 5I3FA 1DJQA 2ZZ2A 1K8ZA 1WYIA 3NG3A 3TH6A 3NQ7A 3VKJA 4N9DA 4NT0A 5D2TA 4MZ8A 4JYDA 3S6DA 5C6MA 1W5QA 2Q3RA 3NR0A 1GYLA 3GR8A 2V81A 2YPIA 3M43A 3LI1A 3NL5A 4Y8FA 3W1AA 4MFDA 3U2OA 3CWNA 4UFMA 3W75A 1AG1O 3WK1A 5FI8A 4UTWA 3TK7A 3DFSA 1K7FA 1KA9F 3INPA 3N2MA 2ISVA 1C8VA 3TQVA 3W7IA 4QISA 3MI6A 1KLYA 3ANYA 1SUXA 3W7EA 1OFBA 1VCGA 1TSIA 1VGAA 5I3KA 3B03A 4AH7A 1FWWA 3LI0A 4E2BA 5AFDA 2OX1A 2CZDA 5D30A 5I3GA 4EF8A 1I45A 4JIQA 3I7SA 1W3TA 1JJKA 1VH7A 1YPFA 4HHPA 1AW1A 1GG0A 1HTIA 1KBJA 1F76A 1O60A 2C13A 2QCEA 4PC8A 1OK4A 1JVNA 3P62A 4GUHA 3W1RA 1MO0A 3EX2A 3W7MA 4C1LA 5HR6A 2RFGA 4PL2A 3SSJA 3W1UA 3C52A 3O1NA 3NQFA 1XFBA 3ABSA 2ZFAA 1R2SA 1YTEA 2O7QA 2O7SA 1FCQA 1ICQA 1ZAJA 3W2UA 1B4EA 2EPHA 3CIWA 2JKPA 3W74A 1TTIA 2GQ9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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