2NXH | Genus

Total Genus 88

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	88
sequence length	262
structure length	262
Chain Sequence	KFLVIAGPNAIESEELLLKVGEEIKRLSEKFKEVEFVFKSSFDKANRSSIHSFRGHGLEYGVKALRKVKEEFGLKITTDIHESWQAEPVAEVADIIQIPAFLCRQTDLLLAAAKTGRAVNVKKGQFLAPWDTKNVVEKLKFGGAKEIYLTERGTTFGYNNLVVDFRSLPIMKQWAKVIYDATHSVQLPGGLGDKSGGMREFIFPLIRAAVAVGCDGVFMETHPEPEKALSDAPTALPLSQLEGIIEAILEIREVASKYYETI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase
source organism	Aquifex aeolicus
publication title	Structural and Mechanistic Changes along an Engineered Path from Metallo to Nonmetallo 3-Deoxy-d-manno-octulosonate 8-Phosphate Synthases. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase
total genus	88
structure length	262
sequence length	262
chains with identical sequence	B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature	ec 2.5.1.55: 3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase.
pdb deposition date	2006-11-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2nxhA00

3LXAA 4EF8A 3T55A 3NPVA 2A85A 2B7OA 3QSTA 3BLFA 3BO9A 2NZLA 3MI3A 3QEZA 3W2LA 3ZWSA 4IMEA 3H55A 1GWJA 1OX4B 2FPYA 4O16A 4O1DA 2E5BA 5KTLA 1Q45A 3HF3A 3F4NA 5BW6A 3W1NA 5AFDA 3GIYA 1HTIA 3IIVA 2AGKA 4LVBA 1KTCA 2NWSA 1FBAA 2FDSA 3W7MA 4NZJA 3G1SA 1SW0A 3T78A 1N8FA 2A2IA 2J9YA 2V2CA 3EWYA 3LCHA 1U83A 1FCUA 1E51A 4WOQA 2ATSA 4LUIA 4WQ6A 3DU0A 5F1UA 4NUWA 4BWLC 4Z0SA 4QJ1A 4QISA 3EKLA 1LRNA 3LBCA 2DZSA 4WJEA 3BGGA 1XBXA 1SU5A 4AHPA 3C2VA 3GDLA 2YX0A 3BW4A 3W1AA 4Y6GA 1WBJA 2C18A 2H8XA 1TRIA 5D2VA 2QUUA 1YLVA 4MZYA 1SZFA 3CTLA 3F4WA 3GR7A 4EOUA 5KZEA 4NJIA 4QNEA 1M5WA 3IGUA 4UTUA 2ZYFA 4UTWA 4KFOA 3W7JA 1WYIA 3TA6A 5LNWA 1AL7A 3G1DA 2VEMA 3UY7A 4JR5A 4S2CA 3CLMA 1H60A 2RDTA 2PE4A 3TSMA 5HWNA 1H7WA 1W5MA 1G7VA 1I45A 4AXKA 5AC8A 3W76A 4FHAA 3UNDA 2HMCA 2HS8A 1QOPA 4O1BA 3P80A 2EGZA 3W87A 1TPWA 1W1ZA 4K36A 3L66A 3LV6A 4DPPA 3LI0A 4UFMA 3CIWA 1TO3A 2VOMA 2UV8G 3TR2A 3PSVA 3W7NA 3W7EA 2C14A 2E09A 5DCBA 1F5ZA 2JK2A 3R89A 3W85A 3N73A 1SW3A 1DVJA 2W6RA 5G2WA 2PRHA 3WK1A 4OV9A 2QJIA 2BZNA 2GUUA 1F05A 3CWNA 3TJLA 2P0OA 3T7VA 3MBDA 1B4KA 4YXGA 1T99A 5MHBA 2GQ8A 3O8AA 1TQXA 1S5WA 1QMLA 1WOBA 2Y7FA 1LOSA 3PUDA 4A22A 4AHOA 1GEQA 1QPNA 2J9ZA 3GK0A 2J9XA 3NL6A 3O05A 3VCRA 3NQ8A 1TCDA 2VELA 4S1FA 4LY8A 2ZA1A 2I1OA 3DENA 4HPJA 1K3UA 5AB3A 1ICPA 1S5VA 4HNVA 1OK6A 3Q94A 4HN4A 3VE9A 4MJMA 5DN1A 4JXCA 3P8IA 1W5OA 3DKLA 1PE1A 3HPZA 2CLLA 1MSSA 1VPXA 2FB2A 2B4GA 1D3HA 1JQVA 3S1XA 2ZRZA 4YCOA 2ABBA 3Q2DA 5LNUA 3NPXA 4GRSA 3B4UA 3WJXA 3MUXA 3T4CA 5EYWA 4FNSA 3W9ZA 4FEZA 4LVAA 5FEXA 3W1UA 3W70A 2JGYA 2G5WA 4PEKA 2ZBTA 4GNJA 2JKPA 3GKFA 1XM3A 4N02A 3R13A 4L4MA 3W1PA 4FF7A 3HBLA 1ZAHA 1YDNA 1ZNNA 4KFPA 3OG3A 4MLRA 1RZMA 1QNVA 2ABAA 5G2IA 3DZ1A 3KVLA 1PIIA 3I6RA 4PTNA 2ZRXA 1KTNA 1SR9A 2I14A 2QJGA 4OGZA 5AHNA 3R2GA 1Z44A 1LOQA 3C56A 5K9CA 3LTYA 5AHMA 1KFEA 3FIGA 4UNKA 3G1YA 1X1OA 1JQXA 2DZUA 2G97A 3L0KA 4R33A 4JTGA 1BWKA 4LS1A 1EWEA 4EF9A 4N6EA 2R94A 1TPDA 3TMLA 1XBVA 1GTEA 5HMSA 5FEWA 3LV5A 3E0IA 4ZZ9A 4W9TA 2B7NA 2ZDRA 3G1AA 2VKZG 4KWVA 1YDOA 4JDBA 3MJYA 4GUGA 4XZ9A 3DFNA 5HUOA 1YPIA 4NXSA 4UFKA 3I7QA 2VFIA 4U4MA 4HNUA 5A5WA 3UWZA 1Q6RA 5L9FA 3B0VC 3PG9A 2VFEA 1TREA 5FI8A 2DORA 4Z0JA 3WJYA 2FPTA 3NQAA 3DFTA 4I7UA 1Q3NA 3NVTA 1XUUA 3C2FA 3C52A 3A24A 4RZ6A 3YPIA 1HG3A 3TFCA 1MO0A 4ADUA 1UASA 3WFAA 3KRUA 3NQ7A 4M6PA 3NL3A 4JY9A 1A5AA 2GPTA 2PC4A 2V81A 3TC7A 4HHPA 1LYXA 4O18A 2V30A 1N55A 2WQPA 1FXPA 2ZZ3A 1A53A 3O6CA 3SZ8A 1QPQA 1HUVA 3QZEA 1GPWA 5EPDA 3NZRA 2ZRVA 5CKSA 3UZJA 3W2MA 1FCBA 3NZ1A 4ADSA 2ZTKA 3HG3A 3KVJA 3S5YA 3CM4A 2A21A 4LS0A 2C19A 4DF0A 2CLIA 2QCDB 5AOUA 4HKPA 3E49A 1ONRA 4DXVA 3IIZA 2DZXA 2A6LA 3CEPA 5BMWA 3RFAA 3NQVA 4XKYB 5HWJA 3W7CA 1TPEA 1UB3A 3LXCA 3P74A 3U6WA 1VS1A 1ALDA 3MHUA 3S1VA 4NQ1A 1WAUA 3QSRA 1PHQA 4UFLA 3TQKA 3W1MA 3QMTA 3GXTA 1W3NA 3E9AA 3MP3A 4RXFA 4DF1A 1L2UA 2BLEA 3QW3A 3G1XA 4H4IA 3KX6A 4RJEA 3DFOA 4JIPA 2VENA 4DPQA 4O0ZA 2WKJA 3W84A 4H6KA 4N4QA 5K4ZA 1FX6A 1EEPA 1YXYA 2WNZA 2A7PA 1XC4A 3T44A 3HMJG 3E02A 4QIUA 4GBUA 4KKXA 5BOOA 4POCA 1VHCA 4UTTA 3EWUA 3L65A 1GTHA 3F1QA 3UWVA 3LXBA 3G8RA 2YPIA 3N2MA 1QR7A 4PH6A 2NX3A 3W7GA 1I2RA 3LERA 2X1SA 5AC7A 3UQNA 3HGOA 2WJZA 3B05A 3C2EA 5DCDA 4KFNA 4QSHA 1JCXA 4JD4A 4BFAA 3KXQA 4ML9A 3L9CA 3B03A 1OYCA 4N2YA 1J4EA 1YXDA 1GOXA 2Y7GA 2Q3OA 3DFQA 4N9EA 4NU7A 4UTWC 1GVQA 1O5KA 2Y63A 3LCXA 2OCZA 3U8GA 1XCFA 1H7NA 3QFEA 3NQEA 4KWWA 2GJLA 2GVLA 2XN2A 1L9WA 3ELFA 4MPQA 2QCMA 1G4TA 1KLZA 5LNVA 5DBUA 2ZZ7A 1TQJA 1AK5A 1VCGA 1YADA 3UYCA 4CNOA 4K7VA 2V0TA 4TX9A 4O54A 5IM51 2ZRUA 1B4EA 1EWDA 3PBUA 4JX4A 3I65A 3EXSA 5D38A 2YYTA 4RCXA 2QUTA 1TPH1 2X1RA 4EVZA 3L5AA 4FIRA 3BV4A 3B8DA 3SJ3A 2G95A 3GVGA 3G1HA 3L67A 5LSMA 1LM1A 3V75A 1PS9A 5H2ZA 3GR8A 5CZTA 1TRDA 3EWBX 1XFBA 4GUIA 3CB8A 2O7QA 3I68A 2DZWA 3BLIA 1H50A 1XBZA 4O57A 5G1YA 3IV3A 1FXQA 2AQWA 3FKRA 3O6DA 2RKXA 1GZGA 4NNCA 3EWWA 4JYDA 3THAA 2VC6A 3BG3A 4GUHA 3SSJA 3THQA 4UTLA 4GUFA 2G96A 1ZAIA 4FNRA 2QCLA 4JGDA 1JRBA 5J5RA 4CQ9A 4LV9A 2TPSA 1G7UA 4P2VA 3KFTA 5HNRA 3IIOA 5HULA 1SPQA 1SQ7A 4WY0A 3NG3A 1PL9A 4K7YA 2QAFA 4IMDA 1GVSA 3BG9A 1FDZA 1K7EA 3EXTA 3O07A 3C61A 1R2SA 3DH7A 1G4PA 1F2JA 2V82A 4K38A 1VCFA 3L5MA 3IGSA 3LRKA 4YL2A 3MP4A 3OVQA 3WK2A 5C2XA 1NFBA 1QOQA 1BEUA 4UFJA 2ALDA 1KFJA 3BGJA 2FQIA 1ICSA 4NNAA 3JS3A 1HO4A 1OABA 3LCFA 5F4SA 4CCCA 4OBTA 5KITA 2C16A 4WXYA 1VRDA 2FPVA 1W3TA 2VEIA 3O63A 4DBDA 3WK3A 4RZ5A 2Q3RA 3VE7A 7TIMA 4GJ1A 2A6NA 3DXIA 4R7JA 1VZWA 3NAVA 2QEZA 1QPOA 2TSYA 3GLCA 5G4WA 4LVDA 2VXNA 4IX2A 2YSWA 1T96A 1VHNA 4ZQCA 1KFKA 3TAKA 2FTPA 2RDUA 5I3HA 2ISWA 3A21A 5DXYA 3OVPA 3LM7A 3KOFA 1GJPA 4AEOA 4XBKA 3TU9A 1EP3A 4DBEA 3QQ0A 4GE8A 2H3BA 3QH2A 2H8ZA 3UXDA 4AAJA 3MHGA 2EF9A 5L6UA 1XDLA 2AAMA 5D04C 1JR1A 5HR7A 1GYNA 4NT0A 2J27A 3IIXA 2IQTA 3N9SA 2YGYA 4LT9A 3M1ZA 2Y7DA 4LTSA 1IIGA 4WZHA 2CFFA 2CLOA 1XDMA 3I7SA 4TIMA 3STCA 4MZ8A 3P84A 4NJHA 5G5IA 1DV7A 4O50A 3TKFA 3LCGA 1GVRA 5LZLA 3NOEA 2WSYA 3DAQA 3PBVA 4FX7A 1KM4A 3P8JA 1OX5A 3LRMA 3NM3A 1SUXA 3TW6A 4QITA 4LC6A 1KFLA 5CZSA 1SO5A 1H7PA 3LRLA 4DO6A 3K30A 4WY0B 3PY2A 2DZTA 3PC0A 5K9DA 1W5NA 2C0AA 4GFSA 1DQWA 4FXRA 1PVNA 1VJIA 3A23A 2A7RA 2OT0A 3PG8A 2YFNA 2ISVA 3M16A 1FY6A 2EPHA 4K6AA 3A5FA 3HGJA 3UXAA 5EBUA 3M47A 4IWWA 3PR2A 2WSRA 3PUEA 3M41A 1VYRA 1K03A 3HQ1A 1L6WA 3LLDA 3PWAA 1W37A 4R34A 5D2TA 2JBMA 1LORA 1F73A 4CCEA 3W7KA 3WJZA 3ANYA 1WV2A 3FYOA 2Y6ZA 3ABOA 1MEWA 1FCVA 2Y88A 4M6QA 2QCEA 2QCGA 3DFPA 4FNQA 5AHEA 1IXPA 2CZEA 3MP5A 1OYAA 4ZQRA 2Q8LA 4JX6A 4MLJA 4BK9A 5DLCA 4B5NA 1VYPX 1P5BA 2KZHA 4O4VA 3HGSA 3VFLA 2Y70A 3C3NA 4Q4KA 3LGEA 1SZGA 4HIBA 3OHIA 1M6JA 1P0KA 5F2IA 4OQVA 1RVGA 4IMCA 2B7PA 4O52A 3A9IA 2GQAA 4O15A 2ZRWA 2TYSA 5AN7A 4MYAA 5E1QA 3STEA 2B0MA 4UTTC 3IRDA 1EA0A 2DU2A 1AW1A 5K4XA 3SGUA 1R2RA 3TIMA 3TCEA 4XTDA 1B57A 3UWQA 3W22A 4DO4A 4JICA 2CLEA 4XBSA 2TMDA 5FF0A 4JTSA 4NJJA 3R8RA 3DHFA 1X7FA 4Y9AA 5LHFA 4O0KA 3GNNA 5HQEA 3W86A 4HSNA 3LI1A 3GB6A 2Q8ZA 4TO8A 4X9SA 1W56A 3TNOA 5I3GA 4CQ8A 2VFHA 3GDMA 4JTTA 3PB2A 3W2KA 5D02A 4G1KA 3OA3A 3M6YA 3F03K 4FX8A 3SW6A 1FQ0A 1AW5A 4ZQNA 3TSBA 3W7QA 3NQFA 2WOQA 2NUWA 4M7TA 3LCIA 1AW2A 1OFEA 3TW7A 3GDRA 3PSWA 1Z41A 4NX0A 5HUPA 4H3DA 4ALDA 3LHVA 3C0JA 2A0NA 4AH7A 1UJPA 3W2UA 2R14A 5K3VA 4JYEA 4O11A 1YXCA 5F2GA 4UTMA 3D0CA 4UUIA 3N34A 3WK0A 1G67A 1TMHA 2ZZ2A 4JYFA 1JCLA 4AHQA 4OU1A 4MYXA 4IJBA 5AHIA 5FF7A 1MEHA 1SO3A 1SFJA 4FXSA 1WXJA 3MO7A 5FF3A 4DF2A 2ZZ5A 1RV8A 4ZQPA 2FB3A 1F6KA 4FNPA 3W6YA 1FCQA 3LCLA 1WA3A 1YTDA 1G6CA 1H62A 1OF8A 5BNKA 2BXVA 4R53A 5BMXA 3DKJA 1KM3A 3OEXA 5I3JA 3KRSA 4K39A 2YDAA 4N4PA 3GX9A 1GG1A 1H51A 4X2RA 1A5CA 1W0MA 5DCEA 2Y89A 3LDVA 3UD6A 2ZA3A 1Y0EA 1FDYA 4PC8A 2Z0IA 2Z1BA 4UTIA 3B06A 3CT7A 4UTKA 5GVJA 1A50A 4LWWA 4TR9A 1FWTA 3SECA 1QO5A 4N9CA 1KM5A 3W74A 3DGRA 4DQWA 3Q37A 1AG1O 3MYOA 2R91A 2NXGA 4M7SA 2X2GA 4JTFA 1LZOA 3GNDA 1IXOA 4JN6A 4MY9A 3UPBA 4JX5A 4AMAA 2PRLA 1TTQA 1KBIA 4MIMA 1TTIA 2NUXA 1FWNA 1DHPA 1DJQA 5CPOA 4Y90A 3W1QA 2I9EA 3W71A 4RZ4A 2ZZ1A 1IXQA 3LHTA 1OYBA 2PCQA 3NGJA 3PUOA 1PCWA 1TJPA 4AWUA 3EWZA 1TIMA 1TV7A 1AL8A 2QKFA 2FFCA 4CNNA 4BI6A 1O5XA 1DBTA 4IPIA 3S9YA 5DY2A 1W8SA 3PAJA 1J2WA 3C2RA 3Q58A 4E2BA 4IUOA 4BI5A 3SY5A 1EX5A 4WD0A 4WX2A 2C3ZA 3BLEA 5C54A 1V5XA 1KBJA 5HJLA 4YCPA 2VFFA 3TAOA 3AJXA 3M7WA 3QPYA 3CQ0A 5D05A 1HL2A 1W3IA 3GXNA 4LRSA 1Q6OA 2XFWA 4TMBA 5G4EA 5TIMA 3HB9A 2E6AA 2YW4A 1PV8A 1XBYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2NXHA

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