2NXHA

Structural and mechanistic changes along an engineered path from metallo to non-metallo kdo8p synthase.
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
KFLVIAGPNAIESEELLLKVGEEIKRLSEKFKEVEFVFKSSFDKANRSSIHSFRGHGLEYGVKALRKVKEEFGLKITTDIHESWQAEPVAEVADIIQIPAFLCRQTDLLLAAAKTGRAVNVKKGQFLAPWDTKNVVEKLKFGGAKEIYLTERGTTFGYNNLVVDFRSLPIMKQWAKVIYDATHSVQLPGGLGDKSGGMREFIFPLIRAAVAVGCDGVFMETHPEPEKALSDAPTALPLSQLEGIIEAILEIREVASKYYETI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase
publication title Structural and Mechanistic Changes along an Engineered Path from Metallo to Nonmetallo 3-Deoxy-d-manno-octulosonate 8-Phosphate Synthases.
pubmed doi rcsb
source organism Aquifex aeolicus
total genus 88
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
ec nomenclature ec 2.5.1.55: 3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase.
pdb deposition date 2006-11-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2nxhA00
1GT8A 1FWRA 3G1HA 1YDNA 2TRSA 4KWWA 1EB3A 3CQ0A 3L67A 2P1FA 3HO8A 4FIQA 4Z0SA 1W56A 3C52A 5KSWA 3NNTA 3T55A 4GXMA 3G0UA 5J5DA 2YFNA 1DHPA 2A6LA 1LOSA 3E0IA 2HSAA 3BW4A 4LVGA 2ZRWA 1I2QA 2NXGA 4GUHA 1OFDA 2GVLA 4AMAA 4R33A 2NUYA 1OYAA 1FCQA 2V30A 5A5WA 3UY8A 3QQ1A 3W7DA 4O11A 4RXGA 1AW5A 2QCNA 2OJPA 3LCHA 5LNRA 4WX2A 3INPA 1Q6OA 3TV8A 1FDZA 3B0VC 1H7RA 2V82A 2NX3A 5I3GA 2CZ5A 1LCOA 3L0GA 1VCVA 4MY1A 1GTEA 1THFD 1DJNA 1VYRA 4MPQA 1EUNA 4UUIA 4MVAA 1KFEA 4YLWA 3DFTA 3ZFHA 3LM7A 3TAOA 3TQKA 1H7NA 1R47A 4MFDA 2FIQA 4N2YA 3W1XA 1TPFA 2C16A 1PVNA 3DFSA 3P5YA 3EXTA 4POCA 3DFPA 3UWQA 1FCVA 4UNKA 2J9YA 5ABTA 2Z0IA 1WOBA 3IIVA 4UTTC 2C0AA 2V5LA 2CZEA 1XUUA 4WY0F 3QM3A 4K6AA 3KRUA 1DKWA 5D33A 1W5MA 3T78A 1LBFA 2ZFAA 5D2XA 2A4AA 4FEZA 4JYFA 3ABQA 1ME7A 5LNUA 3R89A 4HN4A 3WJYA 4UTUA 2B4GA 5IM51 5CPMA 4MOZA 1X8FA 1F05A 4HIBA 4N9EA 3HPXA 3QFEA 2BTMA 3LCXA 5CG7A 3L0NA 1RR2A 1MEHA 2YYUA 1F5ZA 4DELA 1D9EA 4UMBA 3WJZA 4WD0A 1PHWA 1DQXA 4WQ6A 2JKEA 4UTMA 3SY5A 2ZTKA 2E77A 1OFQA 4GUIA 2DZWA 3TXZA 4JS3A 4WY0B 2FPYA 3W7CA 2VEKA 4AVFA 3E12A 5CGQA 1QO5A 5EY5A 1Y0EA 1IIHA 2H3DA 2B0MA 1EP2A 3BW3A 4NZJA 1C8VA 2WNNA 5AFDA 2Y7FA 1JCXA 4LW7A 1J2WA 4JTUA 3MHUA 3OEXA 4IPJA 3W2LA 1W31A 1F76A 3LV6A 3QMRA 3W76A 1TSIA 3HG2A 1R2SA 3BPWA 4MZ8A 4UFHA 3W7OA 3QJAA 4IQLA 4UTHA 2Y7EA 5DBUA 5K2ZA 4IXXA 1JR1A 2ISWA 1I8JA 1IXOA 3PB2A 4NU7A 3FYPA 3L2IA 3C61A 1PE1A 3E96A 1LROA 2RDUA 4FF7A 4PODA 3PF3A 3PR2A 1BEUA 3THAA 4LRSA 4QQ3A 5IBXC 3W87A 3G1AA 3V75A 3O63A 5I3JA 4YL2A 1QFEA 4NQ1A 4CQAA 1T0OA 2RDTA 3CC1A 4NXKA 5EL1A 2ZTJA 1CI1A 3KVLA 4QM1A 3DXIA 5DCEA 1K8ZA 2FTPA 2C18A 3BGGA 2ZZ1A 3FYOA 2FJKA 2Q3RA 1K03A 2CZFA 3NDOA 3RFAA 3DHFA 3FKRA 4FNQA 3NQ7A 2CLLA 3M16A 3W07A 4IMDA 1LTDA 5D2WA 1YADA 4O0KA 4O19A 1L9WA 2RFGA 2PRHA 1ZAHA 3M5VA 1ZJIA 4UTIA 2QJGA 1H5YA 4CNNA 2LLEA 1EEPA 1SW7A 2Z1BA 5KINA 5H2ZA 3DKLA 1XCFA 4S2BA 1QDSA 4UXDA 2C1HA 2VKZG 5AYZA 3MUXA 5AHNA 4RKAA 3EX4A 2BLEA 3LBCA 3UZJA 1SR9A 3NL6A 2NX1A 5AHFA 4AF0A 3VI2A 4O8RA 1QCWA 2CU0A 3IVSA 2QDHA 3FFSA 4PL1A 1J4EA 1GJPA 1U83A 3UWVA 3YPIA 4AHPA 4RLIA 4ZQOA 2CLHA 3EWXA 4IUOA 1W3IA 1HL2A 1ZY9A 3W2NA 1NVMA 1XBZA 2YW4A 3W7QA 2OT1A 1BWLA 1G4SA 1Q6RA 3W7GA 1W5PA 3TSDA 3OHIA 1EPXA 1G67A 3KRZA 3SW6A 4AXKA 3S5YA 4PA8A 3G1DA 2PC4A 2NUXA 2A1YA 1Z44A 1VR6A 1GG0A 2F84A 2J9XA 2WPBA 3LBMA 1A53A 1K7EA 4GWEA 3PM6A 4X2RA 2QCCA 3R8RA 5FF2A 1XBVA 2GPTA 3QZEA 1G6CA 3GDMA 1W5QA 5FESA 1MSSA 3NL3A 4ZVJA 2ZRZA 1ICSA 2FPVA 3S8HA 1A5SA 3TR2A 2YSWA 3G1SA 1ZFJA 5K9DA 3TUUA 1H63A 4UTWA 4YCOA 5K3VA 1LYXA 2ZA2A 4H6KA 5TIMA 5HWMA 4JTTA 4IXHA 4GC4A 1KM6A 4Y6GA 3LHZA 2E5CA 2W6RA 3OG3A 5HULA 3W7LA 1KM5A 3BW2A 5FF3A 5G5IA 3M7WA 4N4PA 3TNOA 2V8ZA 5K4XA 3VNDA 3A23A 1JJKA 3LI0A 3MI3A 3QW4B 4AHOA 1QOQA 3G0XA 3W85A 4QSHA 4YCPA 1OFAA 4MYAA 2Y6ZA 4LUJA 1EIXA 3P61A 3TIMA 1K3UA 1QPNA 1XXXA 1PS9A 3PAJA 2J9ZA 3P60A 2ZRXA 5HINA 4O1CA 1W5OA 1G7UA 1EP1A 2DZXA 3NQ8A 5HQEA 1YTEA 4D2JA 3LRMA 1ALDA 1BTMA 3QSRA 4R34A 3HG4A 3UPWA 3NQCA 3GDKA 4WOZA 3A22A 3B8DA 3RK8A 3PC0A 4CCEA 2E6YA 3FA5A 4TX9A 2J6XA 1ZALA 1O95A 3LTSA 5CZJA 3FJLA 5G4WA 4N9DA 2EF9A 1GOXA 4HNTA 4K36A 1ME8A 1B4KA 2JK2A 2GVJA 4JYDA 3MHGA 4JR5A 1SZNA 4O15A 5CZSA 2CLOA 3O6CA 3TJLA 4XBKA 2PE4A 3NQGA 5G2IA 1LRTA 4LC8A 4GRSA 4O4WA 3TCEA 4RV8A 2JKAA 5G4EA 3TKFA 5TBOA 1DOSA 3S1VA 4Z1AA 3NM1A 3SZ8A 1GVRA 3UYCA 4OE7A 4Y90A 1M5WA 3Q37A 4RZ5A 4XWUA 1O60A 1H61A 2P0OA 3W7JA 3NVTA 5D04C 1WQ5A 3HMJG 2YXGA 3EEGA 1DVJA 1OYBA 1G4EA 2DP3A 4NVTA 4ZL1A 3E9AA 4AB4A 1EWDA 4UC5A 3UXDA 2CWNA 2QCMA 2CLKA 3NA8A 3EWBX 4Z1DA 2FDSA 3BGJA 3QPZA 1PCKA 5EMUA 3FOKA 3AO0A 3R12A 5TQLA 1AMKA 4UFIA 3UPBA 2OT0A 1S3HA 1UBSA 3L65A 1W3TA 3UWZA 2A5HA 3GNNA 3PG8A 3BG5A 3NQ2A 2WV8A 3IVTA 1V7YA 1DBTA 3CEUA 1GG1A 3KAOA 3C2FA 3OVRA 5EBUA 1SFLA 1VHNA 4KFPA 4AF0B 3P7YA 1WOAA 2ZYFA 1B3OA 1MO0A 2CLIA 4LY8A 5E1QA 3Q58A 1UUMA 2QKFA 2W79A 2V2CA 2C6QA 5FEWA 1K7FA 4ZQMA 4HNVA 4EF9A 4TMBA 3M1ZA 1KFBA 3FIGA 1FXPA 3HQ1A 3NPUA 4U28A 3CWNA 4HNNA 3VKJA 3IIPA 1BKSA 4NJIA 4JTLA 2BXVA 4NT0A 1XDMA 2Y7DA 1HG3A 2QR6A 1EWEA 1XM3A 3NOEA 3FEMA 4MLRA 3DAQA 4Y9AA 3N3MA 3GXPA 3ELFA 3LV5A 4FX6M 1F6PA 2RHGA 2EHHA 1Q3NA 4OHQA 3TFXA 3GIYA 1T96A 2UV8G 2QCDA 2ZZ6A 4OV4A 1TV7A 3G18A 1F2JA 3DKJA 3S6DA 1TPVA 3LHTA 4ZZ9A 2Y85A 1QR7A 3ZS4A 3TSMA 5LNWA 2C15A 1JQVA 2ATSA 4GFSA 3C2EA 3IIZA 3S5OA 4ADUA 3CT7A 3EX2A 3HPZA 3NGJA 3QRHA 4C1KA 4Q32A 4TR9A 3O6YX 1OFPA 1WBJA 5DCBA 5F2MA 2J88A 3EWZA 2Y7GA 4KKXA 1QPQA 1LBMA 3MBFA 1OFBA 4R7JA 1VC4A 3NG3A 2DZVA 3BG3A 3O05A 4DO5A 1TJPA 3G3DA 2QUUA 4JYEA 3M5ZA 2YZRA 1AK5A 5KMYA 4FNSA 3HG3A 3N9RA 1F7BA 3LHYA 2DJLA 1SO5A 3KVKA 1VQTA 1K02A 1ZAJA 4RK8A 2VENA 4X3ZA 4WOQA 3GKFA 3LXAA 3TDFA 1YDOA 2DORA 4JNMA 3G1YA 4MUZA 4KFOA 1O5KA 4QJ1A 5U4NA 3CEPA 1TPC1 3EWYA 4LS0A 2VOMA 4K7VA 5AHEA 4RX0A 3W7NA 4N9BA 4UTLA 3MP3A 1JCYA 5LHFA 2G95A 1OG0A 2E6FA 3W1LA 3O15A 5H91A 1SW0A 4Y96A 1VPXA 3DBPA 3W1RA 4K8HA 2QF7A 4YMZA 3LERA 3MMTA 2JGYA 4EIVA 4LOCA 1WYIA 4IMCA 3TX9A 3BVJA 2NZLA 5CZ0A 2EGZA 3ZWTA 2XN0A 4DBEA 3W75A 5BW6A 1R46A 2BSLA 4NJJA 4ZMGA 1JUKA 4K8EA 2W0UA 3EX3A 3W3OA 5F4WA 5CPOA 2AGKA 1H7PA 3M44A 3W9ZA 4RZ4A 3ABSA 3LCGA 4A29A 3NXFA 4JEQA 5DY2A 3W7PA 4A2SA 2G97A 3QQ0A 2Q8ZA 3W71A 3THQA 3M5XA 3BARA 1VS1A 4YWIA 3ANYA 4Q33A 2QCEA 1RV8A 3HB9A 3W1NA 3S42A 3STGA 3P62A 1GPWA 3SR7A 1W54A 2BZNA 3P8JA 3QF0A 2KZHA 2A7NA 4MZYA 3W72A 5LNVA 4M6PA 1HO1A 4QNEA 2VFHA 3LRLA 4OU1A 3E02A 3HBLA 1PHQA 2DZUA 4BFAA 3LLFA 3W1MA 5K9CA 1T8XA 3IGXA 1L6YA 1L6SA 3IIOA 4XTDA 4DF0A 2F7FA 3MYPA 4NNBA 2WO5A 3CLMA 1FX6A 4GUJA 1O94A 4ICNA 4LVAA 1KBIA 3B06A 3DU0A 1W8SA 4LRTA 4HSOA 1TMHA 3NPXA 4XBSA 1GVSA 3GNDA 3MP4A 4O53A 3LHUA 5J5RA 2AQWA 3UZ5A 5C54A 4G1KA 3C6CA 2JBMA 3JRKA 4DPQA 3TMLA 5DXYA 4MJZA 4DQWA 1IXNA 4MKNA 3LTPA 4P61A 5AHMA 3LDVA 1LZOA 3PUOA 1KFKA 3GDRA 3HIJA 4PCFA 3B05A 3NQMA 3B04A 1OFOA 1Q45A 2I9EA 4I9AA 2A6NA 4BWLA 3SI9A 2ALDA 3O8AA 2ISSA 3NAVA 2HS6A 1ME9A 2VEPA 2YDAA 5AYXA 5FF0A 1SSDA 2WQPA 4JGDA 4MZ1A 4U4MA 2I14A 5EKYA 1LP6A 4K37A 3WK0A 3WJWA 3F03K 4S2CA 2QCDB 4BR1A 3MBDA 1YDVA 4A21A 3W22A 3W83A 1JVNA 3CHVA 3P74A 3F1QA 3HJZA 1QMLA 1C9DA 1SZEA 2TPSA 5F1VA 2WSYA 5KZDA 5C5YA 3W2JA 1NEYA 3G1VA 4O17A 1Z41A 2E5BA 5I3FA 4A2RA 1EX5A 2ZRUA 3ATYA 2VFGA 1EA0A 5LNSA 1LOQA 1RQBA 4K39A 3TH6A 2OX1A 4JDYA 4IX2A 3QMTA 2NV1A 1PV8A 1KA9F 5LHEA 4UNLA 4IGHA 4PEKA 1TO3A 4FB7A 2HTMA 2CW6A 4TMCA 4UCGA 1YXYA 2ZBTA 5DBTA 1O5XA 2H90A 2CFFA 2RKXA 1F73A 1OX4B 3O06A 3L66A 5HNRA 1L6WA 3EKLA 3MJYA 1OFRA 5LGXA 4W9TA 2PRMA 2ZQ0A 4GJ1A 5D2TA 3C0JA 1TPEA 1UJPA 3LLDA 3BV4A 2O7QA 4JTSA 3HF3A 1O4UA 3GXTA 3LCIA 3MWAA 4OV9A 5EPDA 5BOOA 3STEA 4IPIA 4HSNA 4UFJA 2XFWA 5BMWA 1PL9A 3C2OA 1ADOA 3SFKA 1OF6A 3EX1A 4ZQRA 1XKYA 2V2HA 3HOJA 3PS7A 2J24A 2Y62A 3V1PA 3TXVA 3GAYA 1P4CA 3M0ZA 3DFQA 3TW6A 1JULA 3RF9A 4O0ZA 3LCWA 4LV9A 1B57A 1LOLA 3M41A 3SGZA 5L6UA 1ZHAA 2ZZ4A 1KTCA 3A24A 4MIMA 1XFBA 3TC6A 2GQ9A 2Q8LA 5D38A 2A7RA 4A22A 1KM2A 1HTIA 2VFIA 3GX9A 2NWRA 2NV2A 4FNPA 1WDWA 4JXCA 3TJXA 5CPLA 2FB3A 5C6MA 2QCFA 4RCXA 4JX6A 5D2VA 3W1QA 1X1ZA 4O18A 3OIXA 4EVZA 2RDWA 3KVMA 1XL9A 2PURA 3NQ6A 4WJEA 5F2IA 3B0PA 2V5BA 4LUIA 6ALDA 4AWUA 3NL2A 3ABRA 4L4LA 4WXZA 3B03A 3W70A 2CLEA 1DORA 3CTLA 2Q3OA 5DELA 2GJNA 1SW3A 2NLIA 3SIZA 1SQ7A 4O28A 1N7KA 2B7PA 3P82A 1C29A 4FNTA 1VJIA 2YFOA 4UFLA 3PBWA 2ZZ2A 3R5EA 4AAJA 4H3DA 4UTKA 3IVUA 1TPWA 3BLIA 3MI2A 3W7IA 4NZFA 5AB3A 2Z6IA 4DXVA 1DJQA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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