4OT7A

X-structure of a variant of ncr from zymomonas mobilis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
359
structure length
308
Chain Sequence
MPSLFDPIRFGAFTAKNRIWMAPLTRGRATRDHVPTEIMAEYYAQRASAGLIISEATGISQEGLGWPYAPGIWSDAQVEAWLPITQAVHDAGGLIFAQLWHMGRMVALRLDEIPRLLDDYEKAARHALKAGFDGVQIHAANGYLIDEFIEYGGAVENRIRLLKDVTERVIATIGKERTAVRLSPYGVFNGIVQVFIPAAKMLSDLDIAFLGMREGAVDGTFGKTDQPKLSPEIRKVFKPPLVLNQDYTFETAQAALDSGVADAISFGRPFIGNPDLPRRFFEKAPLTKDVIETWYTQTPKGYTDYPLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Zymomonas mobilis
publication title Surface Loops Representing Enzyme Modifying Element in the Field of Tuning Enzyme Properties
rcsb
molecule keywords NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase
total genus 104
structure length 308
sequence length 359
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ot7A00
3QEZA 2ZZ1A 1RPXA 4O4WA 2WQPA 1FXQA 4GUFA 2C13A 4GRSA 4CNNA 3I6RA 1V5XA 1DJQA 3GAYA 4MJZA 1FQ0A 4O13A 3PWAA 4EWND 4DELA 1W54A 2A6LA 4WOZA 2QUTA 1EWDA 1KFEA 5CPOA 3C4UA 3QH2A 4JX4A 4AB4A 5EYWA 1QCWA 2H3BA 3UY7A 2J9YA 1B4KA 5AYYA 2QR6A 1FCBA 3UNDA 2JBMA 5I3KA 1RD5A 1AW1A 4Z1AA 2ZRVA 1I2NA 1ZALA 2DZWA 2QCGA 2TSYA 2WO5A 1G4SA 3PF3A 1DL3A 1XL9A 3O6CA 4YL2A 2CLMA 4NNCA 3BLIA 3STEA 1W3TA 5CPNA 4JEQA 1S5TA 3NL2A 3OVQA 5CZSA 1KM0A 1XDLA 4QNEA 3FS2A 1GVQA 1IIHA 3W1MA 3P7YA 1LYXA 4Q4KA 1H7XA 3UPWA 3LCGA 2J6XA 3ABOA 2E77A 2A0NA 1ICQA 1F74A 2Y7EA 1IIGA 1LM1A 4FEZA 3L2IA 2FJKA 3G3MA 2ZBTA 5BMXA 3A9IA 3W1UA 2X1UA 5KITA 1JCJA 1TPWA 4B5NA 2P0OA 1X7FA 4ADUA 1KM4A 2EF9A 4UTWC 3KVJA 2NWRA 3C52A 1EIXA 3U8GA 3TXZA 3VFLA 4UFHA 3WJSA 3IIXA 3N19B 4O4VA 3P81A 3OBKA 3NQGA 4IXXA 1XBZA 5I3JA 1C29A 3NYZA 1KM6A 1OVDA 3NM3A 4UFIA 5HWMA 1VCFA 1SW3A 4BFAA 2NX1A 3NDOA 2Y7DA 1P1XA 7TIMA 4JXCA 4JTTA 5I3GA 1Z42A 3O05A 1QWGA 3TSMA 5ABTA 2PRLA 1VYPX 3SECA 1LOSA 2WSRA 5C6MA 1LDCA 5D05A 5E93A 4FO4A 4LS0A 4BI6A 3QM3A 3OVRA 4L4MA 5EPDA 2FLIA 3GK0A 3DKLA 4EF8A 1FX6A 2F7FA 2V30A 3E0IA 4Y96A 5BW6A 3KRZA 4JX6A 3L9CA 4UTMA 1X8FA 5U7SA 4IMGA 4LVBA 4NJIA 1C9DA 3DFQA 2VEMA 3NO5A 1HUVA 2A7PA 2BXVA 2DORA 2ZZ4A 4AHOA 1ZY9A 1R2SA 5AB3A 3W2JA 2I1OA 3LX9A 1FCUA 4JDBA 4HIBA 4S2CA 4JDYA 2ZRYA 2D73A 1BKSA 4UNLA 3TIMA 3TQ0A 1WA3A 4WXZA 3KRUA 4TO8A 2H8XA 2PRHA 5BMWA 3L68A 3TQKA 4FF7A 3S5OA 4FXRA 4JTEA 3CLMA 4XKYA 1KFBA 2R8WA 4AWTA 3S1VA 1YLVA 4JS3A 3P82A 4A3UA 3VE7A 2I14A 1TSIA 3GLCA 3ABSA 4K38A 1JCMP 3BLEA 1SR9A 1EUAA 1Z44A 2EKCA 1FCVA 4OU1A 3M1ZA 4HNTA 3LBCA 3G0XA 3JR2A 4YMZA 2A6NA 1NVMA 3W7EA 2QJIA 3L5MA 1FCQA 5H91A 3W86A 1W3IA 2YR1A 3DI0A 4O15A 1MSSA 1QAPA 5LNRA 3NQ6A 4WQ6A 3TV8A 2A21A 4GE8A 4NU7A 3HG3A 3RLUA 4GJ1A 3N2XA 4N9DA 5MHBA 1Q6OA 1WX0A 3W7NA 3NQVA 2UV8G 6ALDA 4UFJA 2CFFA 4O10A 3PB2A 3TA6A 3TAKA 4ICNA 1DKWA 5F4WA 3PG8A 1SO4A 4M5PA 1Z41A 3LHVA 5AYZA 3EEGA 3S9YA 3EKZA 5AHIA 3FYOA 3G0UA 3TJLA 1WYIA 1W5QA 3PM6A 4O18A 1OFRA 2QJGA 1QFEA 1JCNA 1ME9A 2YW3A 1IF2A 1XI3A 5LNVA 2QCEA 4HT3A 4O11A 5D09A 3M43A 2GQ9A 2X1RA 2J9ZA 4LU0A 4S1FA 4AWUA 1R2RA 3QC3A 3FYPA 1H7RA 3C2EA 1TTQA 5J5RA 3NXFA 3M16A 4OHQA 5TQLA 4MYXA 2V8ZA 3CU2A 4WXYA 3EWUA 2V82A 3G1DA 3GXTA 5C2XA 2ZQ0A 3MBDA 3HQ1A 2QDHA 2WSQA 2VFDA 4M7SA 2TYSA 3UXDA 1WV2A 3GDKA 2GQ8A 2QAPA 4D2JA 1TPDA 2V2CA 3CB8A 3F03K 1H51A 2HSAA 4O54A 4NJHA 3W7LA 4UTKA 1PHQA 3O07A 2QCLA 3HO8A 3LRMA 5CZJA 1TTJA 3NR0A 5EBUA 4CNPA 1OFQA 2WNZA 2C16A 4O17A 2B7QA 5G4EA 5D30A 3NPVA 4N9CA 2CLLA 5DXYA 4O16A 3SY5A 3LV5A 5D04C 3BGJA 4ZVJA 3KVKA 5K4ZA 3HF3A 4O1DA 1VHCA 4JGDA 1EA0A 3DFPA 3TKFA 2A5HA 3TAOA 1JUKA 3O63A 3T7VA 1YXYA 3C6CA 3O6DA 1SZEA 2G5WA 3OA3A 4LY8A 4XTIA 1TYGA 1KM5A 4MLJA 1QO2A 4JTSA 3HOJA 4DF1A 4JTHA 3G1VA 3O6YX 4MPQA 2ZZ3A 5FF7A 3QFEA 1B3OA 3S5ZA 1YDNA 4HSOA 1QOQA 4X22A 2VKZG 1G7UA 4FNQA 3EXRA 4NVTA 1TQXA 3IGSA 4Q32A 4TU1A 5HWJA 1VPXA 4JIPA 1VJIA 3GNDA 2R14A 3P60A 1SO5A 2Y7GA 2JGQA 2CLIA 2LLEA 1H50A 5D2WA 2VELA 1I4NA 4N02A 2ABBA 3E96A 4ZZ9A 4IGHA 3G1AA 3FIGA 4QM1A 2NWSA 1UJPA 4FB7A 3NGJA 3USBA 4AF0B 3TFCA 1FWWA 2HMCA 3L0KA 3GAKA 4LVGA 3MI2A 3FKRA 4FX6M 5G5IA 1OX4B 2ZYFA 1OHLA 1AG1O 3QZEA 1X1OA 3CIXA 4CCCA 3W87A 4PTNA 4UFKA 4PODA 3U6WA 3C3NA 4DXVA 4ONVA 4QISA 1RVGA 3THAA 3P84A 5F2LA 3ZR4A 4IJBA 2FB3A 1WOBA 1ZCOA 1I2QA 1T0OA 3DENA 5DLCA 5CZ0A 3W7RA 3HPZA 3HBLA 3EX4A 4NNAA 3LCIA 1PHWA 1TV7A 5I3FA 1P5BA 2E6YA 4O0KA 3W7PA 1CX9A 3NL5A 3EX2A 4KFNA 1QDSA 2YXGA 4WJEA 2CZFA 2ISWA 1Z48A 2CZEA 3UWWA 1ZJIA 5AHFA 1PCKA 3O06A 4BK9A 3UWQA 3M47A 2FIQA 5KZDA 1IXOA 4HSNA 4OE7A 1AL8A 1L6YA 2E6DA 1WOAA 3N9RA 3B05A 1SQ7A 3L67A 3WK3A 1ZNNA 5K3VA 4A2RA 3PULA 2J24A 5D02A 4RKAA 1QR7A 5DCBA 4IMDA 1F73A 2V2DA 3WK2A 2JKAA 1F6PA 1EWEA 4IPIA 3W7JA 4GUHA 1KTCA 3VCRA 3LTYA 3EXSA 1M7OA 5BRBA 1BWKA 2H6RA 3MJYA 3P5ZA 5EA9A 1SW7A 3RK8A 4GWEA 3UD6A 4WY0B 3W9ZA 1K7XA 4CQ9A 2A7NA 3P8IA 1LRNA 4POCA 3KXQA 1N55A 2V81A 1UASA 3TUUA 3IIPA 2BLEA 1TRDA 3SI9A 1LBFA 1KBJA 1H5YA 1KFKA 3Q37A 4LVAA 1W0MA 4YCPA 5D2TA 4RCXA 1K7FA 2H8ZA 1GEQA 3MO7A 3H55A 1FXPA 2V0TA 1KTNA 4GUGA 2O7SA 1FWRA 4P61A 2E1DA 3IGUA 3ELFA 1T8XA 4NJKA 5C54A 1HO4A 2ABAA 4HN4A 3GXPA 1VLIA 2DP3A 1SFLA 1RQBA 4ML9A 1XCFA 1OFOA 1A5CA 1EPXA 5AOUA 1UUMA 3FA5A 1RQEA 3A21A 3KFTA 4NZFA 2WOQA 4G1KA 5FF2A 3LHTA 1P4CA 2BTMA 4DPQA 2ZTKA 1ZAIA 4Z0SA 3TSBA 2YGYA 2CLKA 3BG9A 3MWAA 3TFXA 3EX6A 4LUJA 2E6FA 3W3OA 2J9XA 4DBEA 1F6KA 1EX5A 1ZENA 4A22A 4UFLA 3BO9A 4I7UA 2CLEA 1JVNA 5CSRA 2DJLA 1TIMA 1XKYA 3NQMA 4R33A 3S6DA 4JY8A 4HKPA 3DFOA 1W5MA 2NX3A 5LSMA 4BWLA 1VC4A 4QAIA 5HUPA 1QPNA 4EVZA 3HJZA 4DO5A 4LWWA 2I9EA 3MI6A 1YPIA 1OFBA 3PBWA 1MO0A 1J5TA 1FDZA 5KTLA 2QCHA 3EWZA 3C2FA 3TW6A 2V2HA 1EUNA 4KFOA 5G1TA 4O52A 5D2XA 4GXMA 3MHGA 4Z1CA 3BARA 1YDVA 2ISSA 1LLZA 3I7RA 3DI1A 2B0MA 3GIYA 4LVFA 3IGXA 1FBAA 1W56A 1ICSA 4XUGA 2JKEA 5FESA 2YZRA 5HINA 1JUBA 3SGUA 3H54A 2C1HA 3GX9A 4M6QA 2TMDA 3W22A 4U4MA 1VRDA 3S8HA 3G1YA 1GT8A 5K9CA 1Q6RA 3FKKA 3ATZA 1GYLA 4JTKA 3QSRA 3PC0A 3B0UX 5E0KA 4DF0A 4MY9A 1I2PA 2WKJA 5LNWA 4NX5A 1QNVA 2E09A 3TC7A 3GZ3A 3M7WA 3EX3A 3P61A 2A1YA 4Z0JA 2ZRXA 3C61A 3GDMA 3R12A 4BR1A 1AMKA 2CZDA 3DFTA 3N34A 2QCDB 5HMSA 3SGZA 3RF9A 4CLMA 4EOUA 1A5AA 4NT0A 4UMAA 3TMLA 2PE4A 1JCXA 3SJ3A 4IMCA 1FWTA 4WD0A 3A22A 2ZRZA 1F05A 1T99A 3BK0A 4JTLA 5CPMA 3W71A 4H4IA 4LVDA 2X2GA 1H1ZA 2VEIA 2AGKA 2GPTA 3LCWA 3LB0A 3W74A 1RQHA 5IM51 2GVGA 3S0CA 3DU0A 1TPH1 3TNOA 1K8XA 4GUJA 1VYRA 1VH7A 4NJJA 1RR2A 4NXKA 3CHVA 1WBJA 2OMAA 3BPWA 1AW2A 1TJPA 2CW6A 3QYQA 1P0NA 5HJLA 3ABRA 3QJAA 5HWNA 2GUUA 4LUIA 1TV8A 3N14A 4MY1A 2FQIA 5KZEA 2G97A 1F76A 1L9WA 2C15A 3C8FA 3R13A 3LHWA 1KFCA 1GVFA 4H3DA 1A5BA 2Z6JA 5L6UA 2FTPA 4FX7A 3G24A 3W88A 4MLRA 4RX0A 4O57A 3S42A 2QCCA 3U2OA 2AQWA 4LNYA 4JYDA 3NQCA 4I7WA 5DY2A 1A5SA 3LHZA 4MY8A 2ZZ7A 3NQ7A 3LGEA 3W7QA 1KA9F 3UXAA 1OF6A 3RFAA 3W85A 5AHLA 5D38A 3EX1A 1J2WA 4UUIA 5AN7A 1QO5A 5LZLA 3BW2A 2EGZA 5DCEA 1EEPA 3P62A 1OYCA 4FNPA 4K36A 3TE9A 3W72A 1EP3A 3DGRA 3GDRA 4KWWA 3QMTA 1W37A 3ABQA 1XUZA 5G2IA 3T40A 2QAFA 1JRCA 3C0JA 3O15A 3HB9A 3VI2A 4UTTA 3W1AA 1G7VA 4FNRA 1O60A 4X9SA 4AWSA 2NXIA 1H1YA 1NSJA 2C18A 5FEWA 1W5OA 3W7OA 2BX7A 1XXXA 3I65A 3THQA 4MFDA 2HS6A 4XZ9A 1Q6LA 1H7PA 1H61A 2OZ0A 1YPFA 2QCFA 4JNMA 4YCOA 1TPC1 3G1HA 3Q2DA 4ZQMA 3WJYA 3SFKA 2E68A 2OJPA 1VS1A 3UQNA 5F2GA 4BI7A 4RXGA 1LRQA 4PFMA 2ZA1A 4YWIA 4IMEA 4MIMA 3C2OA 3YPIA 3TXVA 2ALDA 8TIMA 1OFPA 2QCNA 3RLVA 1D3HA 1B9BA 3W1QA 3CEUA 4O14A 3G1FA 2EPHA 3BW3A 1ME8A 4UTIA 1TREA 3O1NA 4AHQA 2YPIA 3R8RA 1I45A 4WZHA 4R7JA 1UB3A 2ZZ6A 4AEOA 2Y61A 4DF2A 3LOTA 3PBUA 5HUOA 1KLZA 1GTHA 2TRSA 2X30A 2X1TA 1KFLA 3V1PA 1KV8A 4BWLC 5D03A 3EB2A 5FEXA 1QMLA 1A53A 3NVTA 2V5LA 3WK0A 4YXGA 1RZMA 2ATSA 3GKAA 2EHHA 2QF7A 3CTLA 3N2MA 1MEWA 3B04A 2RDTA 2ZDRA 4FNTA 1IGSA 3T78A 4EIVA 1G4TA 3Q94A 3P74A 1GWJA 4ZQNA 4KFPA 1FWNA 1JJKA 2FPYA 3BW4A 3NQ8A 1FWSA 3LCLA 3PBVA 3W1TA 3QW4B 1W1ZA 3CWNA 3GVGA 1F2JA 3GR7A 3GXNA 1N7KA 1LORA 4MOZA 1IXQA 2GVJA 2ZA2A 4JTUA 3INPA 4UCGA 4DO6A 3FJ6A 2Y88A 4FIRA 1HG3A 1O4UA 3M5XA 3K30A 4MYAA 1K03A 2VEPA 2OCZA 4LRTA 3IIZA 4LV4A 5EL1A 1KBIA 4XTDA 4WUIA 1PIIA 5HNRA 3MBFA 3C56A 5DELA 2ZCGA 4PH6A 1R30A 4ZQOA 3LI1A 3L21A 1LLWA 3G1SA 3TJXA 3NNTA 2YYUA 3CT7A 4I9AA 3L66A 3W7CA 3W70A 3NQ2A 5LKYA 1G67A 2VFEA 5LHFA 1GTEA 3LTSA 3E49A 4OV9A 5G1YA 1OX6A 1G4EA 5AC6A 3SW6A 1J4EA 4FXSA 4AXKA 3OHIA 1DORA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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