1FH9A

Crystal structure of the xylanase cex with xylobiose-derived lactam oxime inhibitor
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
publication title Detailed structural analysis of glycosidase/inhibitor interactions: complexes of Cex from Cellulomonas fimi with xylobiose-derived aza-sugars.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-1,4-XYLANASE
total genus 128
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2000-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1fh9A00
3EDFA 3GTNA 5JIWA 4ZXLA 3WNMA 1PBGA 5GQBA 5A6AA 4UZSA 1HP5A 1E6SM 1V0MA 4D6CA 2C7FA 3W81A 4CD4A 2EXOA 3AHZA 4M24A 4XZBA 4UOJA 4W8LA 3IAPA 3ARVA 3PZMA 1IZJA 2V3FA 1CGYA 5A8MA 1JZ5A 5EB8A 1J0IA 2O9OA 3RCNA 3GBDA 2E8YA 1CLVA 3RM8A 1PIGA 1CEOA 3WDJA 1HJXA 4A3YA 2JE8A 3DECA 3SCNA 1ISZA 1NQ6A 1DWJM 3W4RA 2J74A 4PEEA 4H8HA 3GYCA 5HPCA 5FL0A 2VURA 1F4HA 4KGLA 5IXEA 1OM0A 3AISA 1KBBA 2EPKX 2BVYA 2VI0A 5CPTA 1J0ZA 4C7DA 2WW5A 4U2ZA 5GNZA 1CGWA 3VX1A 3ZJ6A 4E8DA 2VX5A 3VIFA 5TD4A 1LF1A 3A4WA 4S3KA 3VD7A 1BHGA 1UR8A 3VIHA 2J7DA 4DM1A 3CZKA 4PSPA 4H04A 2ZUUA 1HKJA 1OD8A 3DHUA 1EQCA 1JNEA 5A6BD 5I77A 8CGTA 3BMWA 3WDHA 1AQHA 5C8BB 3VIJA 1B3WA 1JG9A 2VUYA 2XHYA 1OBAA 4PTVA 3BSGA 3SCWA 1GW1A 2X1IA 2WHKA 1ZU8A 3MANA 5DT5A 4CN4A 4AZBA 3VGEA 4W86A 3KEHA 4V28A 3WUBA 1BG4A 3W6MA 1C7TA 4P7QA 1XD1A 4QCEA 4HPGA 1UH2A 3WQ8A 6CGTA 3F5KA 3L4UA 1B3ZA 1QNSA 1JFHA 2VCAA 3WEOA 1PPIA 1PX8A 4AD5A 3VX0A 1GPFA 1WAWA 2ZUSA 5D9MA 2PWFA 1VEPA 4D1IA 3BAKA 1MQQA 3WDRA 4CD7A 3VMOA 1DWHM 3WEMA 2E40A 2QLYA 2V3GA 3BMVA 4XUYA 2GJRA 4J7RA 1UWQA 3BCFA 2EPOA 4TTGA 2EBNA 2G3MA 1SYTA 2WMIA 4PCTA 1UKSA 2ZWYA 4L4PA 4B9ZA 1PX3A 2XSBA 1R7AA 3QOKA 1W1VA 3WF4A 2GK1A 1CECA 3MUZ1 1NM9A 3MUIA 3RIKA 1JZ8A 1EOMA 1CGXA 3WF0A 1E55A 5ECUA 2CBVA 3PZ9A 2OSYA 2OSWA 4TOQA 1FH8A 2VRJA 5FKYA 4PMUA 3CGTA 3MS8A 2ZICA 2TAAA 2ZWZA 3L4YA 2ESCA 1BSIA 4DUWA 1CPUA 4ML4A 2GJXA 7CGTA 3WEZA 2ZXQA 2C8NA 2WC7A 2BFGA 1W9PA 4D6EA 3WH9A 4DUVA 3SCQA 7A3HA 5CGTA 1ISWA 2WB5A 2XFRA 2X2YA 1WDQA 4FLRA 5AYBA 3VGBA 2X09A 3VOCA 1TA3B 3NJ3A 3THCA 5FD0A 1H3GA 3BAIA 5E6ZA 4AEFA 1CZ1A 3GBEA 4E2OA 5DEZA 1MXDA 3WQ4A 1KB3A 1BLIA 2E4TA 1GONA 4RL3A 2WANA 5D9NA 1H0GA 3FXYA 2J47A 2WM0A 4EK7A 2VZTA 4Z2GA 3IK2A 1ZBCA 2WMHA 1KWGA 4WJXA 3ZOAA 1B3XA 1CGUA 1LJYA 2WAGA 3QGVA 3SCSA 3I3DA 1DWFM 4NRRA 2CIPA 4TUFA 4MTVA 3GXDA 1DP0A 1OGSA 3PZIA 3WH6A 1E6ZA 1EH9A 2WNWA 2J79A 3AROA 4GKLA 4H2CA 1JYNA 3K4DA 1P6WA 1M03A 3QR3A 3SUWA 3L2MA 5C71A 2WBGA 3DC0A 1B3YA 3BLKA 1X6LA 4D6GA 4ZE5A 1UR2A 3VDCA 4EAMA 2VRQA 5E70A 1WO2A 1X1NA 3WBAA 3WIJA 5DO8A 2NT0A 5I6SA 1C8YA 4C7GA 1CDGA 4TXEA 4JL2A 3UEQA 2QPUA 5EFFA 1JZ4A 3PTKA 3K8KA 4WLCA 5M17A 2Y8VA 2NW0A 1Q6FA 1FH7A 3PZNA 3NCOA 1QVBA 3O9NA 4QLJA 3WQVA 3AOFA 2Y5EA 4NZCA 4Z2KA 3KE0A 2A3CA 1NWRA 3AMCA 3CUFA 1RP9A 2JALA 2QF8A 1XH0A 2BHUA 5CZKA 3M07A 4YHGA 1V0NA 1FHDA 4N42A 1XCWA 4BS0A 3O2LA 4U33A 4MADA 4AIEA 3S2CA 2D3NA 1OINA 1HL8A 4HZ6A 1JL8A 4N0RA 3MV01 2UY2A 2RGMA 1OB0A 1LLOA 1WB0A 1UH4A 4EE9A 5D9OA 4F79A 4CCEA 3M6DA 3SCTA 3W25A 1V6VA 4AW7A 3W28A 4Q22A 3T2PA 2E0PA 3W0KA 4V2XA 5HDRA 3MSGA 3UG5A 4X9YA 4W87A 1BYCA 1JYWA 3WDQA 4CVUA 2IXUA 2PWDA 5LA2A 3W29A 3WD1A 4EKJA 2JIWA 3A4AA 4LYPA 4XB3A 2WK2A 4AMCA 4A4AA 2OYKA 1J18A 2WZEA 4M56A 2V3DA 2XIIA 1HVXA 4AZ7A 2E8ZA 1WDSA 3MSDA 1RD6A 2ZX6A 2XGBA 4TTUA 4JFTA 1E40A 4QCFA 4JCMA 1HX0A 1QHOA 4H8VA 1VEOA 3SCPA 2EPNA 2OWXA 4CD6A 1GORA 1QNRA 1WZAA 2VL4A 3VM5A 3O6AA 3OZPA 3AYRA 2JEQA 1VIWA 3VO0A 1Q4NX 3ZT5A 3ZJ7A 4UQAA 1FP9A 2GJPA 4CN1A 1N82A 4W89A 1DWIM 1OGGA 1KXTA 2D2OA 1PX4A 3PN8A 2WCGA 1EXPA 1OGBA 5A8OA 1RP8A 3WFLA 1W3JA 3RJXA 2YBTA 3ZMRA 1PAMA 2DGAA 2OLHA 2WC3A 3F4VA 4JAWA 2YL8A 4IISA 5C70A 5BWFA 1US2A 2W92A 3NIYA 1H0IA 1H09A 4AEEA 3W24A 2WHMA 2B31A 2GSJA 3ARZA 2XSAA 3ECQA 3DHPA 4WKFA 1UD4A 3ARUA 1W3HA 2DIEA 2XM2A 2ZUMA 1XYFA 1F4AA 5HXMA 2W91A 1D2KA 1V0KA 4S3JA 2X8RA 3B9AA 2D0FA 2J77A 4P7OA 1KGXA 1E56A 3MUAA 5A2CA 1HJQA 4PUDA 4D6IA 4U5KA 1BTCA 3AQUA 1CXIA 1W2PA 1W9UA 3UESA 5JUVA 4KRTA 4AZ6A 2PF0A 5JBEA 1EGZA 1EA9C 4Z2HA 4KRUA 2BV9A 5CLTA 4CUCA 1UA3A 3BSHA 1BG9A 1E1EA 2MANA 3DYMA 3GNPA 4GXPA 2D0GA 1DEDA 3ARPA 5E09A 4DWSD 3FHAA 1QNPA 1E6PA 3WDIA 5BRPA 3W6LA 3VIOA 4QLKA 3KL3A 3VMPA 4PTMA 4MPKA 3WKZA 4U5IA 1E9LA 5A8QA 3T2QA 4PMOA 4MB3A 4F9DA 4AIUA 3NSNA 4GO8A 1V6XA 5E0CA 5M5DA 3L4VA 1TFVA 2DSWA 4CKQA 5FL1A 4BA0A 4D72A 3EMCA 4AC1X 2ZE0A 1GVIA 4X0VA 1MW1A 4CN6A 2J7CA 4OOZA 3TP4A 2BXYA 2BY3A 1TA3A 3EDJA 3ZR6A 4HMEA 2W66A 3GXMA 2Z1SA 5LA0A 1JDCA 4PN2A 1E4IA 1XV8A 1EDQA 2F8QA 2OWWA 4EANA 5A6LA 2RGLA 4AWEA 2E9BA 4ZENA 3A4XA 4MB1A 4J3UA 1HT6A 1M04A 4GQRA 2XWDA 1A3HA 1JI1A 5F7UA 3WD3A 3ARXA 1E3XA 1LG2A 2QMKA 3BXWA 3GH4A 4WKHA 4W5UA 5A2AA 1K9FA 2FH8A 3OG2A 2G41A 1C3FA 3NSMA 3SURA 3POHA 4PMQA 3HJEA 1E72M 8A3HA 3MU7A 3GZAA 3UR8A 5JBFA 4JZ5A 3N04A 5BROA 2CESA 2VJXA 3VGFA 1WCGA 1W1PA 2AOSA 5D8WA 3VNYA 3T0AA 5I78A 4D6DA 4AD2A 2Y2WA 4BQ4A 3RPMA 1AMYA 1IT0A 1B9ZA 2CERA 3TTSA 2VMFA 5FOOA 1M7XA 2UY3A 2NSXA 2VC9A 1NOWA 3CIVA 4P8VA 3AIWA 4PTXA 4PTWA 3SUUA 3WMCA 5A8PA 3ARYA 1S46A 1Q6GA 3WUGA 3OBAA 1E4LA 3G6LA 1GQKA 1QI5A 3PZOA 4FMVA 2ZXDA 5JBDA 1U30A 3WH7A 1HF6A 1E4NA 3B9EA 1KGWA 2GDVA 1UQYA 2ZUVA 1G9HA 4OIFA 1J11A 2CKSA 2W5FA 2YA1A 2FHBA 4WK9A 1XSKA 1JZ7A 4CGTA 4ATLA 2O9PA 1V3IA 3GM8A 3AFBA 4QP0A 2JF6A 4QLLA 1W91A 2V5CA 2XFYA 3NUKA 1GCYA 1GNXA 1OD0A 3VVGA 3WQ6A 1ZB5A 1O7AA 1NWTA 1W2VA 1UH3A 1C8QA 2VNCA 2G3JA 1HN1A 2VX6A 3ZM8A 1VRXA 4PSRA 3OIHA 5AC5A 2WKGA 1TZ7A 3BAWA 1HKIA 1MW2A 2CETA 4OZOA 4U3CA 4MDPA 5D9PA 3G6MA 2DEPA 2G3IA 2BY0A 1C90A 2PC8A 1VJZA 2CBUA 4IM4A 2DQXA 1OSEA 3W27A 1HKKA 1ODZA 1DWAM 1SR0A 4AIOA 2VO5A 1E1FA 1O6IA 3KZSA 3DYOA 3L4TA 3U7BA 3AZTA 2DT0A 1XD0A 3VIGA 2CEQA 2XTKA 4UQBA 4J27A 3VUPA 1VFOA 5A6BA 3AHTA 2DSVA 2EO7A 3VU2A 1W9DM 1QNOA 1L8NA 2WVSA 3PZTA 3SUTA 1CLXA 5KZ6A 1NOFA 1HIZA 5IHSA 1UR0A 4JIEA 2J7GA 3M46A 1C91A 4CVWA 4CU6A 2E3ZA 1J9YA 1UZ4A 4FLSA 1L0PA 1CXHA 1M53A 1X6NA 1B90A 3M7SA 1VFMA 4D1JA 1VF8A 4UFHA 1I1WA 2GUYA 5M03A 4HTYA 4CU8A 1ECEA 1RH9A 1MQPA 1UWIA 3N17A 4PBGA 1OWQA 2QPSA 2WXDM 2W62A 3QHOA 1JFXA 1WDRA 2XG9A 3CUHA 2CHNA 1J01A 1VAHA 4W7WA 1E43A 3MKKA 2XIBA 1E70M 4HMDA 1KWKA 5CGMA 1MYRA 2VT0A 3VGHA 3CHCA 3FNDA 1MFUA 3AS0A 1RPKA 1TVNA 4AD1A 1B2YA 1QBAA 3WF2A 4V27A 4CD8A 1W9XA 2VZUA 4UQDA 1GJWA 3K8MA 2WCAA 2WC4A 3TTYA 5LA1A 1EHNA 1CNVA 4YN5A 2VTFA 3WD2A 1JXKA 4GZEA 1EIBA 1HJUA 1U2YA 6A3HA 3VPLA 4DWSB 1CWYA 5HOSA 1DTUA 3LPFA 4BCEA 4ZFMA 1VB9A 4CCCA 1V03A 1J0YA 2XVPA 3KWXA 3BGAA 2VRKA 5CXPA 1GOMA 1E5NA 1NWUA 4JFSA 5CSYA 4LGXA 4HMCA 2WMGA 4NSBA 4UOZA 2W63A 2XVKA 3UR7A 1CYGA 1HJVA 1NWSA 1UUQA 3BLPX 4HZ8A 4NRSA 2BHYA 3CUJA 1E3ZA 2O9RA 3E1F1 2YKKA 1H41A 2YA0A 2GDUA 3VMNA 5BXRA 3K46A 1GHSA 4HOWA 3ZR5A 9CGTA 4F8XA 4L4OA 2E9LA 1J12A 3PTQA 4GIAA 1PZ3A 2YDSA 4XV0A 4UFMA 1E15A 1G0CA 1J10A 2UY4A 2IXVA 1V3MA 1W1TA 3IJ8A 1JZ2A 1E6XM 2AAAA 4P7RA 3D5HA 4IUGA 1XH1A 3AS2A 3NSXA 1WZMA 2V38A 3ARTA 5JIPA 3HN3A 1FA2A 5A1AA 1TG7A 3EBVA 3OGSA 1AQMA 3AHVA 3N12A 1CENA 2A3AA 4UQEA 5E9AA 3S6TA 2Q8XA 1JAEA 5HBFA 1BYDA 4MB4A 4WSJA 3BCDA 2VQTA 3TTOA 1FHLA 2D20A 4D6HA 5DFAA 3K8LA 3RILA 4YHEA 2CHOA 1WNOA 3GNOA 2J7HA 1YHTA 2D3LA 1HXJA 2E9MA 3AIRA 1UD3A 2Y24A 4H7VA 1OT1A 3SIMA 4J3WA 2BXZA 1KXQA 2WLZA 2DIJA 4UZUA 4UNIA 2YDRA 2J62A 5BCAA 4JCLA 3HMCA 3GXFA 1Q6EA 2WVVB 3ZSSA 1SMAA 3IANA 1CXLA 1BYAA 1JZ3A 5A3HA 1WKYA 4Q7NA 4CCDA 1CXKA 4KH2A 5E0FA 3OZOA 5LYRA 1B30A 1R86A 2WPGA 4PRWA 3VIIA 2WWCA 2WBKA 4DWSC 2ZIDA 2BY2A 3ZIZA 3WUEA 1JYVA 3TTQA 1V6WA 4JHZA 5CQ1A 4ZEPA 3UERA 2CPUA 1CGVA 4GO9A 4YPJA 4CU7A 1NARA 2XVLA 2F61A 1OIMA 4B3KA 1ITCA 1J0HA 3L4ZA 2FH6A 1QNQA 1DHKA 4A3HA 5CJ5A 1JYXA 1BAGA 3AHYA 4OKDA 2XPKA 1QOXA 5HPOA 1UOKA 1UWTA 1KCKA 2XYLA 3EDEA 2OYMA 2Z1KA 4PMRA 4ATDA 3EMZA 3WH8A 3N15A 1SFSA 1GOOA 3AMKA 2QV4A 3AICA 1C92A 1EDGA 1H11A 4MNKA 4AZGA 3W38A 2WMFA 3PZQA 2A3BA 1HJSA 3CZJA 1XC6A 3CMGA 5BXSA 2BVTA 2VX4A 4W84A 2WZHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3EDF A;  3GTN A;  5JIW A;  4ZXL A;  3WNM A;  1PBG A;  5GQB A;  5A6A A;  4UZS A;  1HP5 A;  1E6S M;  1V0M A;  4D6C A;  2C7F A;  3W81 A;  4CD4 A;  2EXO A;  3AHZ A;  4M24 A;  4XZB A;  4UOJ A;  4W8L A;  3IAP A;  3ARV A;  3PZM A;  1IZJ A;  2V3F A;  1CGY A;  5A8M A;  1JZ5 A;  5EB8 A;  1J0I A;  2O9O A;  3RCN A;  3GBD A;  2E8Y A;  1CLV A;  3RM8 A;  1PIG A;  1CEO A;  3WDJ A;  1HJX A;  4A3Y A;  2JE8 A;  3DEC A;  3SCN A;  1ISZ A;  1NQ6 A;  1DWJ M;  3W4R A;  2J74 A;  4PEE A;  4H8H A;  3GYC A;  5HPC A;  5FL0 A;  2VUR A;  1F4H A;  4KGL A;  5IXE A;  1OM0 A;  3AIS A;  1KBB A;  2EPK X;  2BVY A;  2VI0 A;  5CPT A;  1J0Z A;  4C7D A;  2WW5 A;  4U2Z A;  5GNZ A;  1CGW A;  3VX1 A;  3ZJ6 A;  4E8D A;  2VX5 A;  3VIF A;  5TD4 A;  1LF1 A;  3A4W A;  4S3K A;  3VD7 A;  1BHG A;  1UR8 A;  3VIH A;  2J7D A;  4DM1 A;  3CZK A;  4PSP A;  4H04 A;  2ZUU A;  1HKJ A;  1OD8 A;  3DHU A;  1EQC A;  1JNE A;  5A6B D;  5I77 A;  8CGT A;  3BMW A;  3WDH A;  1AQH A;  5C8B B;  3VIJ A;  1B3W A;  1JG9 A;  2VUY A;  2XHY A;  1OBA A;  4PTV A;  3BSG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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