2EXOA

Crystal structure of the catalytic domain of the beta-1,4-glycanase cex from cellulomonas fimi
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Cellulomonas fimi
publication title Crystal structure of the catalytic domain of the beta-1,4-glycanase cex from Cellulomonas fimi.
pubmed doi rcsb
molecule keywords EXO-1,4-BETA-D-GLYCANASE
total genus 129
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1994-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2exoA00
1MXDA 3WH9A 4W87A 3SIMA 3OB8A 3WQ6A 5BXSA 8A3HA 1KXTA 2GJXB 4EAMA 1H5VA 3CZKA 2WCSA 5IXEA 4KMQA 2PB1A 3WDIA 3EBVA 3RPMA 2XIBA 2J7EA 1UR9A 4ACZA 3SUVA 3N18A 2W62A 1WO2A 3K46A 4JZ5A 3HMCA 4GO8A 2XM2A 3WH7A 4V28A 2CKRA 1JAKA 4JKLA 3PZOA 1QVBA 2E9LA 5I78A 1KWGA 4GZIA 1RH9A 4JHZA 2UY3A 3NYDA 4JL2A 1W9UA 4GPNA 1J0KA 1HP5A 5CLWA 4HU8A 1E1EA 1HP4A 1DTUA 4DWSD 2CHOA 2WC7A 2CBUA 1WZKA 4DWSC 2X05A 5A2AA 1GVIA 1J0HA 4QDMA 3CBWA 1QI4A 3EMQA 3VPLA 1QBAA 2VX5A 2NSXA 1JDAA 3AOFA 3CO4A 4AZBA 2GUYA 5CPQA 3UG4A 1UOKA 3VO0A 4AZCB 2WC3A 1FHLA 3NIYA 2VZVA 3FHAA 3VD4A 3N17A 2O9PA 3WH8A 1ESWA 3ARZA 5JBEA 2Z1KA 3DHPA 1JDCA 4MTVA 2VZUA 4D72A 1H41A 5CXPA 4UZSA 4TOQA 3PZMA 3WKZA 2J7BA 3VIKA 4LGXA 4AD4A 3SCQA 4BQ2A 4CN6A 3CHDA 2WVTA 1B3YA 3VINA 3ARQA 1ISYA 1EQCA 3ALFA 4F9DA 3OLDA 1UQYA 4DWSB 5IFTA 4PEEA 2VURA 4ZENA 4EANA 4B3KA 4OIFA 4EE9A 3ZJ8A 1Q6FA 4MB5A 1KGWA 1JF5A 4QFUA 1H0IA 2YDSA 1J10A 1MFVA 2DGAA 1CXLA 4WJXA 3VX1A 3KZSA 1MQRA 1EDQA 4CU7A 4J3VA 3QR3A 4AISA 3VGFA 1W2PA 3A3HA 2V3DA 2XVLA 1UR0A 5EFFA 5CGTA 2DSWA 4XV0A 2J78A 2DIJA 2A3BA 2VQUA 4TVUA 1M53A 2CKSA 1NWUA 1NP0A 1ISWA 1GOQA 1CENA 3VMNA 2GJRA 1R87A 3D3AA 3WQ8A 1A3HA 1TA3A 5FIPA 2JIWA 1JXJA 1X1NA 3N13A 3GXIA 4M29A 2GVYA 1TZ7A 3F5JA 1G94A 3CH9A 1CXEA 5A6KA 1UKPA 3VIIA 4D6HA 5A95A 5I6SA 4PN2A 1P6WA 1V3HA 2BS9A 4U2ZA 1AQMA 3L2LA 1US3A 3VM5A 4UNIA 1PIFA 3EDJA 4W86A 5BXTA 5LA1A 4H8VA 4Z2HA 1XCWA 3CHFA 4PUEA 3T2OA 3SCTA 4P8VA 4MNKA 2OYMA 4OBRA 3G6LA 1BHGA 2EPMX 7CGTA 1G01A 1DWIM 3WH6A 3ARTA 2UY4A 4BS0A 4TXEA 3SCVA 1XV8A 1B0IA 1UR1A 4H8UA 3PZVA 1GONA 5E6ZA 3T0DA 5BRPA 2J74A 3HJEA 4RE4A 3AZTA 4CD7A 4P7QA 2VNCA 3NCOA 4CCDA 3VDAA 3L4WA 1UD6A 3DC0A 2EQDA 3WF2A 4AXNA 1LWJA 5D9OA 1ZBKA 4CN1A 1W32A 4CUCA 4M24A 1PAMA 1LWHA 1QNSA 4PCTA 3VIMA 1S46A 3OGVA 1W3HA 2DT2A 4OOZA 1E3ZA 3MSGA 1E5JA 3WNMA 4BCEA 3WF0A 1E73M 2XM1A 1JFXA 2EEXA 1E4IA 3F5LA 2D22A 2WMFA 1JYNA 4AZ5A 3AMDA 2W4XA 3PZNA 3O6AA 3SUTA 5HPCA 1JNDA 4W85A 3PTKA 2Z1SA 3DYMA 5I24A 3W4RA 4M8UA 2WHMA 5I79A 3SUSA 4P7NA 3AISA 1E70M 1UKQA 3CUHA 2BHYA 2ZUVA 3RCNA 2ZX9A 1BLIA 1MW2A 7TAAA 1FP8A 1ZBCA 1R8LA 1PX4A 3AJ7A 4AYSA 1W3KA 1U33A 4IM4A 3LPGA 4NZCA 1E9LA 1J9YA 3OBAA 4J3UA 4MAZA 1W2VA 4UR9A 3IK2A 1CXFA 1EDGA 1E0WA 1NH6A 2WSPA 2GDUA 2CNCA 2ZX7A 1IV8A 1K9EA 1W1VA 2O9TA 1HIZA 2E0PA 5DMYA 4Z2IA 4GINA 5KZ6A 2DSKA 4B15A 2C0HA 3U5UA 1G9HA 5A6MA 2BY3A 1SFSA 2VJXA 2XTKA 1WE5A 3BMWA 4D6JA 2XVKA 4LYQA 3D5HA 5DEZA 2YIHA 4YN5A 3GZAA 4PMOA 4WIWA 1ITXA 1DWJM 3WUFA 4Y7EA 1OIMA 1XSJA 2WZHA 1V0NA 3MUZ1 1HF6A 2VTFA 1QNRA 3FN9A 5ABGA 3VIFA 4B16A 4AZ7A 3AS1A 2BXYA 4TTUA 1KXHA 5IFPA 2E9BA 3WDQA 5A1AA 5EFDA 1XGZA 2IUZA 4AW7A 1OT2A 3ZR5A 3L4TA 3CHEA 1W1PA 1K9FA 3AIWA 1A47A 3VMOA 3NDZA 1WB0A 5GNYA 1V0MA 3W53A 3O2LA 1LQ0A 1HJUA 2BXZA 3OGSA 2WLZA 4HOZA 1GNXA 4D6GA 1DWGM 2FGLA 4LX4A 3WL0A 3ARWA 3A4AA 3BSHA 3OLEA 3CUFA 3SCPA 1NWSA 3K8LA 1UR2A 1CTNA 3CUIA 2CHNA 5C71A 5BXPA 3BAJA 3BAYA 4PBGA 3SCUA 3U7BA 4HPHA 3AIBA 4XZBA 2QMKA 1JI1A 4LXFA 4HZ6A 2VMFA 1JNEA 2GK1A 2V5DA 4A3HA 3EDFA 3RDKA 4J3TA 4HZ7A 1JIBA 1MQPA 2EBNA 4HPGA 1E71M 4TVDA 1OB0A 2VVSA 4MADA 3KL5A 3W0KA 1NOFA 3AIQA 2Y2WA 5AY7A 4N42A 1OCQA 1TVPA 3PBGA 2D24A 2WC4A 2A3HA 2VR5A 3CZ8A 4U3CA 2E3ZA 5DT7A 5D8WA 2QPUA 3BLKA 5EB8A 1LG2A 4CD8A 2W92A 2ZUUA 4H7VA 4RE2A 3K4DA 2JF6A 2WMKA 5I0DA 1WPCA 2J47A 1V3IA 2XHYA 2UY2A 2AAAA 4HMEA 1KGXA 3W27A 2ZX5A 1DEDA 2O92A 2FGZA 4F8XA 1W9DM 2G3MA 4UFHA 1V3LA 2ZE0A 4XB3A 2BNJA 2DT0A 4PMVA 3SCWA 2W5FA 2RGMA 3ZR6A 4KWUA 2JIEA 2X09A 4GKLA 3W81A 4C7GA 3RILA 3LPPA 1EGZA 3M07A 2WW5A 4B9YA 3CIVA 2VUYA 4OJYA 2WWCA 1GOOA 1WDSA 3VMPA 4ML4A 4U5KA 3MKKA 4PMQA 2DDXA 2OYLA 1JXKA 3AIEA 3L4YA 3WFZA 1UWSA 1BG9A 2PI6A 5AYBA 1VBRA 1HNYA 1WDPA 5EMYA 2EPKX 4MJ4A 1UKTA 5E9AA 2FHCA 1VRXA 1E5NA 1LL4A 1E6PA 2XPKA 4XZWA 2G8ZA 4OZOA 1H09A 1QNPA 2D3NA 4X0VA 4DM1A 4KGLA 3TTOA 4W8BA 5F7UA 3ARRA 5LA0A 3VIHA 3GXDA 1UR8A 3AHTA 2JFEX 1D3CA 4IPLA 4TTGA 1EDTA 3TA9A 1UKOA 1V6YA 1FOBA 4CU8A 3SUUA 1NOUA 4DUXA 5AC5A 1E0XA 1C91A 1GOWA 4WKHA 3T08A 2J77A 4KGJA 1JG9A 4GZJA 1C93A 4TVCA 5A69A 3AI0A 2F61A 3ZMRA 1CBGA 5IDIA 4U2YA 4YPJA 2TAAA 3EMCA 1C8XA 3UR7A 3B8SA 4BZYA 3BXWA 4DWSA 1ZL1A 5D4YA 5GNZA 1GORA 1EQPA 8CGTA 2JEQA 3NJ3A 2CITA 1C7TA 3MMUA 5TD4A 1NWTA 1Q4NX 3CLWA 2BY1A 4MAVA 2G3JA 1UD5A 4D71A 3K4AA 4J28A 4UFMA 3AMGA 3RJYA 4UFIA 1ECEA 2VL4A 9CGTA 6TAAA 4FK9A 5DT5A 4M81A 3GH5A 2WM0A 5A6SA 1VBUA 2XWEA 1O6IA 4NRRA 3HN3A 1V02E 2F8QA 2FH6A 1DWFM 1W9XA 3WMBA 4P8XA 3II1A 3WL1A 1XYZA 4P7OA 3VGGA 3FXYA 3T2PA 2V5CA 3BAXA 2VI0A 4E4PA 2BHUA 4W8LA 1JGIA 3S6TA 3SCNA 4H04A 1FH7A 4B9ZA 2WNWA 4GXPA 2CCRA 3L4UA 1W91A 1C90A 1VF8A 1AMYA 7A3HA 4LPCA 1I75A 2EPOA 3ZT5A 2AMGA 1HT6A 4W88A 2Y8VA 1BPLB 2BVTA 3AZRA 1UUQA 1L0PA 1CXKA 3CZEA 4PSRA 5C8BB 4U33A 4WF7A 2ZICA 1Y7VA 4NRSA 1X6LA 1LLOA 4F9JA 5A2BA 4TX6A 3THCA 2YL5A 5HPOA 1I1XA 3PZQA 3ZJKA 1QHPA 3OG2A 2YA0A 3A47A 1GJWA 2OLHA 3AXIA 3BGAA 3CUJA 2OWXA 1CXIA 5ABFB 3MU7A 3W29A 5CZKA 2DIEA 1OD0A 1SYTA 1OBAA 5BRQA 2CPUA 1OIFA 1H4PA 2CERA 3VIJA 2VO5A 3W24A 1C8QA 3L2MA 2ZOXA 2WZEA 4J3WA 3ZSTA 1V0KA 3OLGA 4WK9A 1NP2A 4JFWA 3FNDA 3WNNA 4AMCA 4D1IA 4D6CA 1HL9A 4W93A 4D6FA 1OT1A 2QF8A 1DWHM 3FAXA 3MUY1 3ARXA 3EMZA 2DQXA 4HA1A 3GDBA 1LG1A 2XJ7A 4RE3A 4AIOA 1E6XM 3PZ9A 3TTSA 1IZKA 4UOZA 4MDPA 2XVPA 2E9MA 5HBFA 3JUGA 2QLYA 1VENA 4OOUA 1CGTA 3AHVA 4OBSA 1UYQA 4HTYA 5JUVA 5M5DA 2OWWA 3WH5A 1BYAA 2PF0A 1K9DA 2YLLA 1CGXA 3T2QA 1HN1A 1JZ7A 6A3HA 4J27A 1VIWA 3IJ7A 1TUXA 5FKYA 4YHGA 1IT0A 1DHKA 1GQIA 2VT0A 3IANA 1QI3A 1G1YA 2PBGA 3IJ9A 2WXDM 5A3HA 3SCSA 4M1RA 2VX4A 3THDA 5GQBA 1UD8A 4PMZA 4Q7NA 4WSKA 2ZUWA 3BH4A 2XFFA 1EXPA 4UQDA 4AEFA 2DSZA 3UEQA 1CXHA 2D2OA 4JL1A 3MMWA 1CPUA 1J12A 1OINA 4ACYA 4D6IA 1V6VA 3WD1A 4ZEPA 4MNMA 1EH9A 1OGGA 2PWFA 1UZ1A 1QW9A 2JF7A 3MUAA 1HKJA 2PWEA 4UQCA 1E6RA 2RGLA 4Z2KA 3CZGA 1ZJBA 1H49A 2C7FA 4KRUA 5KEZA 3I3BA 4N0RA 2GSJA 3CPUA 4F66A 2DT3A 3W38A 1WNOA 5JBFA 1F4HA 5FOOA 3E1F1 4JKMA 4L4OA 3VOCA 2NT1A 1M7XA 1E4LA 1GOKA 3F5KA 4GQQA 3WF4A 3SCOA 1EA9C 4R5EA 3RJXA 1WKYA 4LYRA 1FP9A 2BVDA 1JFHA 5HNNA 1KFWA 4CD5A 4ATLA 4BQ4A 4D6DA 3WQWA 1ISXA 1W3JA 2CETA 3QGVA 4AEEA 4UQAA 2PWDA 5D9PA 2IXVA 1CGVA 3WNLA 4HP5A 1BAGA 1E6NA 3CMGA 3N15A 4QAWA 3AYSA 4S3JA 3ARPA 3VIGA 3VGDA 3VDBA 4AD2A 1MW3A 3AICA 1CNVA 4MB3A 2YL9A 4CD6A 3AROA 1C7SA 1MFUA 2WHKA 4FLOA 1QI2A 3TTQA 1VAHA 2BY0A 4X9YA 1KCKA 1CIUA 4QP0A 3GNRA 1HX0A 3RMEA 3BLPX 3SURA 2WLYA 1HKIA 2WANA 1M03A 5BYWA 4IPNB 1EO7A 3GTNA 5M3WA 1CYGA 4P7RA 3QOMA 2E8YA 1C3FA 1J11A 1ZBVA 2HISA 2V3GA 4UFLA 1H11A 4UTFA 1BQCA 2EPLX 2PBOA 1J0JA 3FW6A 5A6JA 2Y4SA 2BHZA 2NT0A 5HOSA 4M82A 1GOMA 4UOJA 1XRVA 3MMDA 1QNOA 2XGBA 4W5ZA 4NSBA 1VFFA 3ZO9A 2Q8XA 4XX6A 5FD0A 3LPFA 2YBTA 3L4XA 3PHAA 1GOIA 2V38A 1XD1A 4CGTA 2OSXA 3CGTA 1HVXA 3T0BA 1UWQA 3UR8A 3WDRA 4IISA 4AD0A 3GXMA 1VFMA 4PSPA 3LMYA 4UFJA 3GNPA 2YLAA 5A6BD 4W7WA 3WEOA 3AZSA 1JAEA 3L4VA 1W1YA 1WZMA 4PCSA 5A8MA 1ISVA 3TONA 4P7LA 3WF1A 1W9PA 1UWUA 5BCAA 1UZ4A 1B1YA 3ARYA 1TG7A 1E0VA 4CD4A 4BQ3A 1J0YA 3QHOA 1J0IA 3AHZA 4HU0A 2DSVA 3ZSSA 4ZXLA 5A94A 1VJSA 4GI9A 1R85A 4J3SA 3VGHA 1BG4A 2WCGA 2ZX6A 1TFVA 3A4WA 1V03A 2W91A 2QV4A 1KR1A 4PMXA 4AIUA 4W5UA 1J01A 4GI8A 1ISZA 3W82A 2ZWYA 3VD9A 1JDDA 3GM8A 2DSUA 3ZIZA 1N82A 4AY1A 2CIPA 4U3AA 2W63A 2XWDA 2VOTA 2WHLA 1UHVA 3UCQA 1XCXA 2X2YA 1BFNA 5AYIA 1EOKA 1NARA 1GW1A 1SR0A 2G4FA 4PTWA 2G41A 1ODUA 5FL1A 3VTRA 3BMVA 3WFLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1MXD A;  3WH9 A;  4W87 A;  3SIM A;  3OB8 A;  3WQ6 A;  5BXS A;  8A3H A;  1KXT A;  2GJX B;  4EAM A;  1H5V A;  3CZK A;  2WCS A;  5IXE A;  4KMQ A;  2PB1 A;  3WDI A;  3EBV A;  3RPM A;  2XIB A;  2J7E A;  1UR9 A;  4ACZ A;  3SUV A;  3N18 A;  2W62 A;  1WO2 A;  3K46 A;  4JZ5 A;  3HMC A;  4GO8 A;  2XM2 A;  3WH7 A;  4V28 A;  2CKR A;  1JAK A;  4JKL A;  3PZO A;  1QVB A;  2E9L A;  5I78 A;  1KWG A;  4GZI A;  1RH9 A;  4JHZ A;  2UY3 A;  3NYD A;  4JL2 A;  1W9U A;  4GPN A;  1J0K A;  1HP5 A;  5CLW A;  4HU8 A;  1E1E A;  1HP4 A;  1DTU A;  4DWS D;  2CHO A;  2WC7 A;  2CBU A;  1WZK A;  4DWS C;  2X05 A;  5A2A A;  1GVI A;  1J0H A;  4QDM A;  3CBW A;  1QI4 A;  3EMQ A;  3VPL A;  1QBA A;  2VX5 A;  2NSX A;  1JDA A;  3AOF A;  3CO4 A;  4AZB A;  2GUY A;  5CPQ A;  3UG4 A;  1UOK A;  3VO0 A;  4AZC B;  2WC3 A;  1FHL A;  3NIY A;  2VZV A;  3FHA A;  3VD4 A;  3N17 A;  2O9P A;  3WH8 A;  1ESW A;  3ARZ A;  5JBE A;  2Z1K A;  3DHP A;  1JDC A;  4MTV A;  2VZU A;  4D72 A;  1H41 A;  5CXP A;  4UZS A;  4TOQ A;  3PZM A;  3WKZ A;  2J7B A;  3VIK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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