3M7WA

Crystal structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium lt2 in covalent complex with dehydroquinate
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
KTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKEGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGQISVADLRTVLTILHQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
publication title Insights into the mechanism of type I dehydroquinate dehydratases from structures of reaction intermediates.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
total genus 92
structure length 251
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2010-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3m7wA00
1LM1A 4RXFA 3G1AA 4XTDA 5HUPA 3QYQA 4HN4A 4PL2A 3TMLA 2ABBA 4ZQRA 4JTGA 4UTIA 3PULA 1GQNA 4QITA 3W1NA 1GG1A 3NPWA 1QFEA 2QCLA 5CZTA 3PC0A 5DCBA 3W74A 5HINA 3LBCA 4M7TA 1UUMA 3EWWA 4AH7A 3UY8A 4RKAA 4DELA 1MEHA 2YX0A 2X2GA 2YZRA 4O57A 3W22A 5LNVA 1KA9F 4O1CA 3BV4A 3LHZA 4O54A 4O1BA 1FCQA 1A50A 2J6XA 2Y7DA 3FFSA 1GYNA 3E0IA 4LC6A 5HWJA 5TQLA 5FESA 4BWLA 1JCJA 4X3ZA 1I4NA 3NA8A 1F6PA 1FDJA 1KTCA 4QIUA 5D2XA 1W5QA 3TE9A 1VGAA 2Y63A 4Z0SA 2VFIA 3VKJA 4LNYA 4FXSA 3R13A 5D2WA 4MIMA 4KFOA 1GG0A 2RFGA 2Q3OA 1SO5A 1ZAIA 1GEQA 1PE1A 6ALDA 2NXHA 1W5MA 2CLMA 2NX3A 1JCNA 4BI5A 3FOKA 4JDBA 4Q33A 2ZFAA 2X1UA 4AEOA 1PIIA 1A53A 1KV8A 2QDHA 1WYIA 3WJYA 4X9SA 1OX6A 4XBKA 4DBEA 2E6FA 2QDGA 4YCOA 2ZZ5A 3F4WA 4BF9A 5G5IA 2AGKA 1H60A 1SZFA 4ZMGA 4JTIA 1JVNA 5G2IA 4E2DA 3N3MA 3MMTA 5D05A 1TSIA 4JYFA 2VFEA 4YWIA 3GK0A 3P62A 1WXJA 3LHUA 1P5BA 4HPXA 1AW2A 2Y62A 3FA5A 1XBYA 4MZYA 3LTPA 3L21A 4R34A 3HIJA 1H5YA 4FF7A 1HUVA 3LCFA 1RV8A 4QNEA 2DZTA 1LBFA 1LLWA 3QSTA 3LRKA 1BWKA 4PODA 3NM1A 2HMCA 4WY0A 1OFRA 2ZZ2A 1VLIA 2IQTA 3FLUA 3P60A 1LRQA 5C55A 2FB3A 5HR6A 2G97A 1DKWA 3CLMA 3GVGA 4P61A 1FCBA 1G6CA 3G1VA 1W5PA 3USBA 1RVGA 3P61A 2QCEA 3P8JA 4JTKA 4CQ9A 1JRCA 1MZHA 3T40A 4ZQOA 2QCNA 2W6RA 1X7FA 3W7HA 3BG9A 1YDVA 3NR0A 2WJZA 3M44A 1Z41A 4UTWA 1RQBA 3BK0A 1H51A 2GQ9A 5I3IA 2H8ZA 1H50A 3CEPA 1LTDA 1F76A 5DBUA 2X30A 5LGXA 1OHLA 4RZ4A 2J9YA 1QOPA 2Z0IA 3I7SA 2OMAA 3RFAA 4FX7A 4XTIA 2J24A 3OVRA 2ATSA 2FPYA 2GOUA 3HG2A 3MP5A 3HQ1A 1FWTA 4Z1AA 4O16A 3SZ8A 3L9CA 1JCYA 4N4QA 3C4UA 3NOEA 3S42A 2GUUA 1VC4A 4K8HA 5G4EA 5EMUA 3OHIA 5LNWA 4MVAA 2VXNA 3BPWA 3F4NA 3PB2A 4WUIA 3KVKA 4IWWA 3KAOA 1K7XA 3H53A 3TSDA 3C6CA 2CW6A 1DVJA 4ZZ9A 3W7EA 2W0UA 4JTSA 3HPSA 5J5DA 1LROA 4DEFA 1JUKA 2YDAA 3BW2A 3H55A 3W23A 2PC4A 2F84A 3UXAA 3GNDA 3SY5A 3WK2A 5KZMA 2X16A 2CZEA 2I1OA 2Z2UA 4LRSA 1ICSA 5DELA 3ZS4A 2QCCA 3NL2A 5KITA 4HT3A 5AHIA 3IVTA 1KTBA 1AW5A 2QCDA 3W75A 1KM3A 5AC7A 3LERA 1DJQA 3C2RA 1YLVA 3KRSA 1TJRA 3A23A 3MI3A 3Q2DA 5D04C 5FEXA 4WXYA 4M6PA 5G1YA 3ANYA 3IGUA 4R7JA 3W71A 3HJZA 3GXNA 3W1UA 2B7QA 1XUZA 3QW4B 3DFQA 1VR6A 5D03A 4JR5A 3W1XA 4K8EA 3A24A 5LNRA 5KZEA 3S8HA 4O15A 3WK1A 3IVUA 1YTDA 1IXQA 3CEUA 1TIMA 1X8FA 3FKKA 3C8FA 3GAKA 3HG4A 4Z0JA 1WQ5A 2CLIA 4FNUA 5K3VA 4ZVJA 3GDTA 4M19A 5E93A 1YPIA 5U7SA 2CLFA 5F2MA 2QUUA 3H54A 1LOQA 5AB3A 3GKAA 2VEKA 1TPDA 2H3DA 2NXGA 1QCWA 1R2TA 3FYOA 1UCWA 2EAWA 3VE7A 4NX0A 3UZ5A 3LV5A 1WBHA 3RU6A 3PUOA 5EPDA 4HSNA 1ZAJA 2E6DA 3NQEA 3TX9A 3W88A 1TTPA 5KINA 3R89A 1N55A 3NQAA 5DN1A 4A2RA 4FNPA 1S5TA 3MP4A 4DQWA 3HF3A 3PWAA 3B05A 3W6YA 1YXYA 4FXRA 1GTHA 3TUUA 4UCGA 1F7BA 1GYLA 4CLMA 4E2BA 1O5KA 1FX6A 5F2IA 1W0MA 3MBDA 4QISA 1AL7A 4ZL1A 3SW6A 5DY2A 3KVLA 3M0ZA 2Y70A 3L5AA 3L0NA 2NLIA 3V75A 3G8RA 3MW7A 1VYSX 5LNSA 2E6AA 5EBUA 1DJNA 3TAKA 4QAIA 1O60A 1ZY9A 3W1TA 1W1ZA 1UBSA 1LBMA 1FWSA 4PL1A 2G5WA 3O06A 4AWSA 3CWNA 3GDKA 4TX9A 4LV9A 5EKYA 3ZWSA 5FF7A 1SR9A 5K9CA 1DV7A 1CX9A 3TSBA 1A5SA 3U8GA 3KRZA 1GPWA 1R2SA 1ME9A 3IGXA 4EIVA 2DJXA 4EF9A 2QJIA 3OEXA 1XXXA 4UMAA 1FWNA 4JIPA 1ML1A 2GJNA 1GVOA 4LRTA 2D73A 3L5MA 3GXTA 3W7DA 3M1ZA 3NQMA 5EA9A 2ZZ4A 3OA3A 2A2IA 4QJ1A 3VFLA 2E5DA 4O12A 3T78A 3O8AA 2C0AA 3KVMA 1KFKA 4YXGA 4AAJA 4EF8A 1LBLA 4FX8A 2FLIA 1VCGA 4NT0A 1UB3A 3TDFA 1YTKA 4IX0A 3I6RA 2JGQA 4RZ6A 3TK7A 1OX4A 5KZDA 1VS1A 4MJMA 3P7YA 1RR2A 1S3HA 4FX6M 3PG9A 1VZWA 1QO5A 2QCFA 4H3DA 4X22A 4ZQCA 3PY2A 1KFJA 1OABA 3MWAA 1L6WA 1G4SA 3R8RA 1YDNA 3HG5A 4HSOA 1JR1A 3NQVA 2A4AA 3LXAA 3UPWA 4K37A 3W87A 3BW4A 2ZZ1A 3KFTA 3AJXA 4FIRA 4ZQPA 3I68A 1W5OA 5LZLA 2H3BA 4MKNA 1IGSA 1WAUA 1HG3A 1OFPA 5HMSA 3PUEA 3B0VC 4W9TA 1OYAA 3DFOA 1PCKA 4XBSA 1G69A 5SWUA 1QR7A 1OYCA 4NVTA 1U5JA 1TPC1 3UWZA 3JRKA 4UFKA 1TRDA 4ZQMA 4BK9A 1NEYA 3IRDA 2DORA 3ABOA 2WSYA 2YFNA 1SZNA 1K3UA 3IIZA 1K8ZA 4UFJA 2RDWA 2JKAA 1TYGA 4ICNA 2RDUA 1OK6A 2H8XA 4ORMA 1QPQA 3TJXA 4DF2A 1THFD 3C56A 1P0KA 4NZFA 1FXPA 1QNVA 3FKRA 3BLEA 5MHBA 5H91A 4JY8A 2TRSA 1W54A 2Y89A 1IXPA 3E9AA 3LXBA 1EP1A 3SGUA 1SW3A 3DHFA 4MFEA 6TIMA 1JUEA 2TMDA 3M43A 3HOJA 3G1FA 4WZHA 2FPVA 4AHQA 1WV2A 2ZQ0A 4K7VA 1C8VA 3EXTA 1YADA 3NO5A 2FIQA 4ORIA 3LCWA 2CWNA 2PURA 3O16A 5IBXC 3P5ZA 3LRLA 4GXMA 1ZCOA 4J9JA 4UTMA 3W7KA 3CPRA 4LVAA 1LOLA 3QFEA 3DZ1A 3W7JA 4FNSA 1KFEA 2YW3A 2V82A 2WNNA 4CCCA 2V8ZA 2GVJA 3W83A 3TJLA 4TO8A 2V9DA 3W7GA 1W31A 5CG7A 2BZNA 4KWWA 2QF7A 2ISVA 2YPIA 1VRDA 1H7WA 3WJWA 3G8EA 2NWSA 1UJPA 3CWOX 3TQ0A 4MZ8A 3PS7A 4OHQA 2PRHA 1W56A 4N02A 3DFSA 1B4KA 4K36A 1LP6A 1XL9A 2V2HA 3NYZA 4GJ1A 3DENA 2GQAA 1TQXA 1PV8A 1XCFA 1RQEA 4UTLA 1VH7A 4FB7A 3DFPA 1WDWA 3DFNA 3UNDA 2JK2A 3LM7A 3CHVA 1XBZA 3EKZA 1SPQA 3DH7A 4TMCA 1NFBA 2VEMA 3B0PA 3IGSA 3O15A 1K7EA 4IOTA 2A7NA 4GC4A 3M5ZA 2X1TA 1O4UA 1OFOA 2B4GA 5HR7A 3UWYA 3NDOA 3NPUA 4M6QA 3OBKA 1N7KA 1TV5A 4NUWA 3DI0A 2HS6A 3W1PA 2CLOA 5K9XA 4BI7A 3LHWA 4MOZA 3M7WA 5K4ZA 2CU0A 3EX3A 4UTKA 1FWRA 5CPOA 4IX2A 5KTLA 5BMXA 2TYSA 3GXPA 1HTIA 2WNQA 2YW4A 2ZZ6A 3LRMA 4JY9A 3L0GA 3HG3A 4IMGA 3GB6A 4H6KA 3G1XA 1TTIA 1DL3A 1WOAA 2ZA3A 1R30A 5K7JA 5TIMA 4Y6GA 3QMRA 1AL8A 3W9ZA 3W7MA 2EGZA 3NPXA 1LCOA 5FEZA 2A0NA 3NL3A 2FTPA 4NNAA 5TBOA 2GQ8A 3WK0A 4OE7A 1TQJA 1NVMA 5J5RA 1FXQA 3QJAA 2ZRVA 3BLFA 4WX2A 5LHFA 3LCIA 4UTUA 5D30A 3W7IA 3GAYA 4WXZA 2ZTKA 3ZR4A 1S5VA 2J9ZA 1L6SA 1TPH1 2C6QA 1H1YA 1FCVA 4PEKA 1V5XA 3EEGA 5ABTA 1JRBA 4LVDA 1OFEA 4PCFA 5EYWA 3LHYA 3BLIA 3ELFA 3L5LA 4DPPA 4NXKA 3S1UA 2CLEA 4U4MA 3IEBA 1XKYA 1SUXA 3LOTA 3TV8A 3LHVA 3F1QA 1QWGA 1G7VA 4O50A 5AN7A 3TW7A 1SFJA 3UQNA 5F4SA 1ZNNA 3QEZA 2X1SA 2WKJA 4JIQA 3MHFA 3NQ6A 3SGZA 4IXXA 2NV2A 3LDVA 3G1SA 1EWEA 4MY1A 4S1FA 3DKLA 4FNRA 2BWGA 4GRSA 1AK5A 4AHOA 1KM2A 3G18A 3NG3A 3T7VA 4RCXA 3QMSA 3G3DA 3W2LA 4LUJA 2JBMA 3VE9A 4HNNA 1YTEA 4O52A 4JYEA 1J4EA 4PA8A 3ABQA 4RR4A 4UFIA 4RX0A 2YXGA 3Q37A 2QKFA 3W73A 4NJKA 1A5AA 4OBTA 2Y61A 1P0NA 1JJKA 3FJ6A 4N9EA 5LSMA 2FFCA 1O95A 1PHQA 1XDMA 3PM6A 2TPSA 2VFDA 4U28A 1F74A 3E96A 3PBWA 2PRMA 3F03K 1DBTA 3S1XA 4AXKA 5AHLA 3S5YA 2A5HA 5D2YA 1MSSA 2Q3RA 2VFFA 3T55A 5F1VA 4WY0B 3BARA 3RLUA 3S1VA 5HWNA 3O6DA 3G0UA 4IGHA 2OX1A 5BNKA 2BSLA 3EX2A 5FEPA 4O14A 4AF0A 4QM1A 1EPXA 4DO6A 4TIMA 3RLVA 4RJEA 1D3GA 3GDRA 3MI6A 4UFLA 1WBJA 2V0TA 3LCGA 1IXOA 4IMEA 3MHUA 5CPNA 3NQ2A 2XN2A 4HNUA 3WJSA 2HTMA 3QSRA 2Q8ZA 2JKPA 3DKJA 3GLCA 5CZJA 3B4UA 3W85A 4O17A 5G4WA 4JTUA 1SSDA 5FI8A 3RNDA 3NM3A 1OJXA 2E6YA 1Q6RA 4P2VA 2KZHA 3A21A 2Q8LA 5CZ0A 3KOFA 5D37A 2BXVA 2F7FA 3A9IA 1W3NA 4A22A 1LZOA 4UTTC 5E1QA 3SI9A 2WV8A 2WOQA 4OGZA 3P67A 3N14A 4DPQA 1TTQA 2AAMA 4RK8A 4IMDA 1ME8A 1QOQA 1XC4A 1K8YA 2H90A 1LYXA 4JTJA 3LGEA 3GDLA 2XN0A 2VKZG 1BEUA 3NZRA 1SZEA 4BWLC 1EUNA 3B03A 3MBFA 1F5ZA 5IBXA 3HBLA 3IIOA 5A8GA 5AHEA 1F6KA 4DO4A 2GVGA 4JEQA 3LXCA 2VOMA 1ALDA 4NJGA 4XZ9A 3UPBA 2E77A 3P80A 3DHDA 3R2GA 5G1TA 4A3UA 2ZZ3A 3A5FA 3W7LA 3HMJG 1F05A 1IIHA 1VLWA 5HWMA 1BTMA 2TSYA 3NQ8A 1I2RA 3CU2A 4IPJA 2Y88A 3L65A 1T0OA 2ZTJA 5G2HA 4UR7A 1ZENA 2A7PA 3GZ3A 2DZWA 4GUFA 3G0XA 2QCDB 4JX5A 1QO2A 3ATYA 3TKFA 3M41A 2E1DA 3Q58A 2FQIA 4EVZA 1L6YA 4Y90A 1EP3A 2O7SA 4JICA 3W72A 1O94A 5D2VA 2ZA2A 4RV8A 1TCDA 1ICQA 1W5NA 3MP3A 5C6MA 1H61A 3MI2A 2V81A 4IPIA 5D2TA 3LB0A 1HO4A 4MZ1A 1H7NA 1JUBA 1TB3A 1R47A 2NUXA 5C5YA 1SZGA 5I3FA 1VHCA 4E0CA 4GFSA 2CFFA 2XN1A 4M7SA 4XKYA 3HGOA 1W3TA 4RZ5A 1H62A 2CZFA 3N9SA 1Q6OA 2DZPA 3EXSA 4H4IA 4Y9AA 2CLKA 3RK8A 1J5TA 4LTSA 3SIZA 3G0SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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