3MO7A

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 2'-fluoro-6-iodo-ump
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Novel interactions of fluorinated nucleotide derivatives targeting orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
total genus 98
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mo7A00
3I6RA 4EIVA 4O54A 5HNRA 3GYEA 3L67A 1ICQA 2PRMA 3O6CA 2DZTA 5I3IA 1KFLA 3LXBA 3ABOA 4NJKA 5EMUA 1KM4A 1WOAA 3W76A 3LCIA 4Y96A 4LUIA 2BX7A 2V2HA 1SSGA 3AJXA 1GT8A 1JVNA 5CPMA 1GEQA 3TJLA 2CZDA 3RF9A 5AOUA 2Q3OA 4HHPA 2ZZ6A 2YGYA 2WO5A 1EP3A 1LLZA 3ABQA 4YCOA 1OYAA 2EHHA 3QPYA 4GUIA 3LOTA 3P62A 3W73A 4QNEA 4POCA 4OQVA 2Y7DA 4R7JA 4E2BA 1SR9A 5HWJA 4OU1A 2CLIA 1XUUA 4MJZA 4R53A 2A1YA 2C14A 4N9CA 4CNNA 1FWWA 2WNQA 1XM3A 2CW6A 4LS0A 2J27A 2R91A 3QMRA 2C15A 5FF2A 4OV9A 1DKWA 3IEBA 1XBYA 2ZQ0A 4JTFA 1MZHA 4N6EA 1JCNA 3FJLA 4JTKA 2FIQA 3LCLA 3H53A 3KRUA 3SY5A 1YXCA 2PE4A 1EUNA 5LNVA 3W07A 4Y9AA 3LGEA 1MEHA 3EWWA 3BPWA 3JS3A 2PC4A 3DBPA 4NJGA 2NXIA 4Z1BA 4DO4A 4MFDA 4AHPA 1F2JA 1EP1A 1LP6A 1RD5A 3DFPA 3TQVA 1KLYA 1B9BA 2V2DA 4JNMA 3HO8A 1ZALA 4DEFA 5K9CA 4L4LA 2C18A 3W1PA 4FNUA 4IPIA 2YSWA 1KM1A 4ONVA 4X22A 4BWLC 1L9WA 2CZEA 5FF4A 1KM0A 3ABSA 2X1RA 4U28A 3LTSA 2O7SA 3O6YX 3BO9A 1SFLA 3P8JA 4WOZA 5LZLA 1T99A 3PUEA 5LSMA 1UUOA 3MI2A 3TKFA 5FEWA 2CWNA 1EWDA 3SGZA 2IQTA 5LNWA 5HULA 1F74A 2J24A 2OCZA 2P0OA 5AB3A 1EIXA 4LWWA 1K8YA 2Q8ZA 3UWVA 1XBXA 3TFCA 1LOSA 5K3VA 3FFSA 1WQ5A 5D2XA 1H7NA 1X6UA 3P5YA 3M41A 1K8ZA 4XQ6A 3W7PA 1I2RA 4UFMA 2PRLA 1QNVA 3BW4A 3L5MA 2ALDA 1Y0EA 3LHYA 1G4PA 4MFEA 1FWTA 2NXHA 1LM1A 3OA3A 1N7KA 1OVDA 4UIOA 5AYZA 4LT9A 5LNSA 1FDYA 4OHQA 4NX0A 1R47A 4RV8A 2BTMA 3HB9A 3UWQA 1L6SA 3STFA 3CPRA 4GUJA 3GK0A 2F84A 4WZHA 1F5ZA 2W6RA 3NQ7A 1YTKA 3L0KA 1DVJA 2FTPA 1GJPA 2VELA 4K37A 1G7UA 1TQXA 4AMAA 4JTEA 3G0XA 1GVRA 1JJKA 3RMJA 5DY3A 3H54A 4XTIA 4NZFA 2YX0A 3LX9A 1V5XA 4UFJA 4XUGA 3TAKA 2NX1A 4GE8A 2E68A 4LY8A 2FPYA 2YFNA 4N4PA 5BMWA 1EB3A 3BW3A 3S1WA 3G8RA 4WXZA 1YADA 3O15A 1GZGA 1YPIA 1RZMA 1TIMA 1X7FA 2B7OA 4LVAA 2YW3A 2R8WA 3W71A 1Q3NA 1J2WA 2OT0A 1VLIA 3W7LA 3IVSA 3IIZA 3W74A 5EA9A 1LRTA 1KV8A 3T78A 5D38A 1E51A 4GJ1A 1BKSA 3QEZA 4Z08A 5EPDA 3W7JA 1MO0A 3JRKA 4IMGA 1FCBA 1G4SA 2FPVA 2C3ZA 4OWGA 2WQPA 4PCFA 3NQDA 3B8DA 3W70A 4OGZA 4IMDA 4IXHA 2ZRUA 2XN0A 1H61A 1Q6QA 3LHZA 4I9AA 5CPNA 5LHEA 3NQGA 2FLIA 1XUZA 1SZGA 2QCFA 3A22A 5DCEA 3EX1A 1JULA 4YMZA 1BEUA 4FF7A 4ALDA 1KTNA 4S2CA 3G18A 3S42A 3CIXA 5KZMA 5H2ZA 4MJMA 3TV8A 4JY9A 3MYOA 3MP5A 3N3MA 5AYXA 5DN1A 3W85A 1TJPA 4UFHA 3I7QA 3W2MA 1FDJA 2CLOA 3M5YA 1VH7A 2QJGA 1GG1A 1QMLA 1K7XA 2G96A 1GQNA 4UFLA 1T8XA 3B05A 4CQ8A 1VHNA 4FNPA 4AXKA 2R14A 5AHIA 3SZ8A 3W7OA 3UWWA 3NXFA 3TROA 4W9TA 3GAKA 5IBXA 4JEQA 3PBVA 3QJAA 1O5XA 1FWSA 2YCEA 3DU0A 4U4MA 2BZNA 4BR1A 3TW6A 3DFOA 3STEA 1OG0A 1UASA 3RK8A 3LI1A 3TMLA 3WJYA 2ZA3A 3DFTA 5EY5A 2ATSA 4TIMA 4Q4KA 1J4EA 1OFDA 2ABBA 5J5RA 4Z0JA 3SJ3A 1H7XA 2V0TA 4D2JA 3W1TA 1S3HA 1W0MA 3FJ6A 3ZWTA 4FXSA 4ICNA 2XN1A 3HG3A 3NQMA 4ZZ9A 3PULA 4AH7A 4JGDA 4JY8A 2WNZA 4MZ1A 4LS1A 3WK2A 2QJHA 1I2PA 3S1UA 2QR6A 1GVOA 1O60A 3N2MA 3NYZA 4N9DA 1D3HA 1S5WA 4EWND 4JTGA 3MMTA 3PUOA 3GB6A 1LORA 2J6XA 2G97A 2X1TA 4O13A 1FDZA 1KA9F 4YL2A 2KZHA 3BLIA 1TPH1 1THFD 1YYAA 2NWSA 3KVKA 3B03A 2CU0A 1I2NA 3BG9A 3HOJA 4GNJA 1AL8A 1KFKA 4JD4A 1AW1A 1W5NA 3I7SA 5LNUA 3Q2DA 1KW1A 2RKXA 3WK0A 3W6YA 2ZBTA 1UJPA 1KLZA 1QOQA 2EGZA 3C8FA 4O10A 3L5LA 3P74A 1QAPA 2PURA 3TX9A 4DELA 1JUBA 1LYXA 4MKNA 1P0KA 1VQTA 4JN6A 3VE9A 2UV8G 2VENA 3TFXA 4UMCA 3MBFA 3IIXA 3TJXA 1JRCA 3OBKA 4K39A 2P1FA 4LV4A 3GR8A 1XI3A 2ZCGA 5I3FA 1OX4B 3OEXA 2WV8A 3C2VA 4LVDA 1Q6RA 3I68A 1HO4A 2GOUA 2OMAA 3P61A 5U4NA 3ATYA 1OYBA 2FDSA 3R5EA 4RLIA 3W7EA 2FB2A 5DBTA 4A22A 1JUEA 5DCBA 3MJYA 3W83A 1G6CA 2CLLA 3M9YA 4CNOA 2DZPA 3SIZA 4LTSA 1M6JA 2Z6IA 4N02A 3QW4B 2P10A 5I3KA 2AAMA 2ABAA 5LNRA 2RDWA 3TH6A 4JX4A 1IF2A 3P81A 5AC6A 4O14A 1LLWA 1TPVA 1PIIA 1U5JA 3CTLA 5TBOA 1H1YA 1PCWA 2RDUA 5FESA 5F2IA 3BW2A 4UR7A 3HPXA 4CCEA 1Z48A 1QOPA 4KWVA 1H7RA 3HG5A 1SSDA 1G67A 1P1XA 3IV3A 3ZR4A 3DFQA 5D02A 1SO6A 1TREA 2DZVA 4GRSA 3SW6A 4MY1A 4ZQMA 4E2DA 3OHIA 5L9FA 3SGUA 3PS7A 5EKYA 5G2HA 2FJKA 3C2RA 3EKLA 3FS2A 2YFOA 5FEXA 3UPWA 2V8ZA 4BI6A 1TPC1 4PODA 3EWBX 4ML9A 3NG3A 3M44A 5D2TA 3O05A 5CZJA 1VR6A 3C2OA 4WQ6A 5DY2A 3P8IA 2EPHA 1SZEA 2O7QA 1UBSA 3LBCA 1W31A 4LVFA 3TIMA 3NQVA 3ANYA 2YR1A 2BLEA 3CIWA 1DHPA 4MYAA 2VFEA 3NZRA 1SFJA 1TTIA 1F7BA 1TJRA 1H7PA 2EF9A 3E02A 1QWGA 3NDOA 1L6YA 2V81A 5HUOA 1OX4A 2BWGA 1YDNA 2GQ8A 3HGSA 1JUKA 4JYDA 3HGRA 3KX6A 2QAPA 1AL7A 4O8RA 1PVNA 3UWZA 4JIPA 4Y90A 1EUAA 3G1XA 4FEZA 1G7VA 4K7VA 2ISVA 1GWJA 3SSJA 3HPSA 3P82A 4IWWA 2YXGA 2WNNA 4M6PA 2RFGA 2A7NA 4QISA 3A9IA 3QQ0A 2NWRA 5D09A 1JCLA 5DXYA 3W1RA 2E5CA 4GUGA 1TPEA 3B4UA 3Q37A 4O57A 4CCDA 4O4VA 3W84A 2VFHA 1Z42A 3FYPA 1LBLA 4C1KA 2PCQA 1MSSA 3MHFA 5E1QA 3W7RA 3R89A 2CLFA 2ISSA 4H3DA 4JX5A 1ZAIA 3HJZA 1KFCA 3W22A 1WXJA 5KSWA 3V1PA 4LV9A 3M47A 2C13A 2RHGA 4O18A 3O8AA 1YXYA 1IXOA 2E6YA 4RXFA 3DFSA 1OABA 1B57A 3QQ1A 3GDTA 3L68A 3RFAA 3NAVA 3PY2A 3CWOX 3NPUA 5HQEA 5T26A 3FLUA 3G1HA 1Z44A 1VC4A 5A5WA 3LXAA 3WK1A 1TB3A 2B0MA 2BSLA 3NPVA 1P4CA 1AW5A 3B0PA 3PSVA 2DU2A 2CFFA 2ZA1A 4Y8FA 1VRDA 5C55A 4FX7A 1I4NA 1FXQA 2DJLA 1ZNNA 3PBUA 5I3JA 2CLKA 1XDLA 2QUVA 5H91A 4PL2A 2ZZ7A 3NM1A 3CM4A 3EWXA 4JTHA 3LDVA 3MHUA 3MW7A 1H62A 4FXRA 1YLVA 4BWLA 3NL6A 3NQEA 3IIVA 3LB0A 1O5KA 2J9ZA 4LVGA 1UCWA 3GNDA 4N6FA 3T7VA 5SWUA 2AQWA 4I7VA 4NVTA 1FCVA 2RDTA 1LOLA 2G95A 2NUYA 3C2FA 1NVMA 3QC3A 3M43A 3W1UA 2EAWA 2ZTJA 5CGQA 3UPBA 4Y6GA 1QFEA 4UXDA 1K8XA 1SZFA 3HQ1A 3OVPA 2JGQA 3EKZA 3C6CA 1RR2A 3L2IA 3NQ6A 4JTUA 1OYCA 4IUOA 4JTLA 4GBUA 4GC4A 4I7UA 3BV4A 4EF8A 5HR6A 1JQVA 4JICA 4C1LA 1OFEA 3VNDA 2CLHA 3W86A 1IIHA 3CQ0A 4I7WA 1VZWA 1XC4A 4FB7A 1XDMA 1KFJA 4IOTA 4O53A 4NX5A 3NPWA 4LW7A 5CKSA 2ATMA 3OIXA 2WJZA 5K2ZA 4O0ZA 3THAA 1H63A 2YYTA 2A7PA 4DO6A 3DI1A 3W7GA 2OZ0A 2F7FA 5D37A 1H7OA 1SZNA 4Z0SA 1S5VA 2A0NA 6TIMA 2B4GA 4IJBA 1Q6OA 1NEYA 3WJXA 4NZJA 4JX6A 5FF0A 3UQNA 3MWAA 4RK8A 1PL9A 1WA3A 3QF0A 4ADUA 4AWUA 2NX3A 4FX8A 4M6VA 1SW3A 3PB0A 2GJLA 3K30A 4AEOA 4Z1DA 4LRTA 4MLRA 2ZRYA 2X2GA 3LRLA 3UWUA 1TPB1 1H1ZA 3B0VC 2C0AA 5AFDA 5F4WA 4RCXA 1GYNA 2CLMA 3A24A 1SQ7A 1C9DA 1VS1A 4ZQPA 5AYYA 3HGJA 2E6FA 2VXNA 4BK9A 1TO3A 3R2GA 1XBZA 4LUJA 2Q8LA 4ZQRA 1ZENA 4AWSA 1OFOA 3LCFA 3O06A 4O1DA 3GIYA 4NJJA 1EWEA 5F1VA 5K7JA 4JDYA 1F6KA 1H7WA 2Y6ZA 4TX9A 4Z1AA 1WBHA 2W79A 4S2BA 3TW7A 4B5NA 2ZFAA 1QPRA 3VE7A 3PR2A 1T0OA 3TSDA 4UTMA 2TMDA 4Q33A 4O16A 4UFIA 3MBDA 3W2NA 3W7MA 1EA0A 4LS2A 3DI0A 1ZAJA 4M19A 4WD0A 5E0KA 3E9AA 3C3NA 4P2VA 4MIMA 1YPFA 5E93A 1R2RA 4WY0A 5BW6A 3HG4A 1V7YA 4FO4A 3T40A 3TUUA 3NPXA 1C29A 4RJEA 4QNWA 2E1DA 3O07A 3VFLA 2Y7EA 2GQ9A 4HNNA 1LROA 1OFQA 4A29A 1VYPX 5C54A 4UNLA 4KFPA 1NFBA 3O63A 2I1OA 1TSIA 2WOQA 4JDBA 1K03A 3MI3A 3LBMA 1HFBA 3T4CA 2GVLA 1ME9A 3GXTA 1IXPA 5DLCA 4JTIA 4A2SA 3M0ZA 1GOXA 1G4EA 1SU5A 3TA6A 2Z1BA 4X3ZA 1ME7A 4KFOA 1QO5A 4UNKA 4K38A 2E6DA 2Y7GA 3GDMA 4LNYA 4G1KA 3GZ3A 3IGXA 1WOBA 4M7TA 5D03A 1KM2A 1TPWA 2NV1A 1GVSA 4X2RA 1RV8A 5G4EA 1W3TA 4RKAA 4JXCA 3FOKA 2QDGA 5I3GA 3GAYA 2V9DA 5K4ZA 3TXVA 1R2TA 5BMXA 1Q45A 3Q94A 1CI1A 4JTTA 3GX9A 4WXYA 3S5YA 3LV6A 3INPA 4AVFA 2DZXA 3NNTA 1JR1A 4BI7A 3WJWA 1VCFA 2ZRXA 1H60A 3GXNA 3W1XA 5F4SA 1W54A 5CZSA 1VLWA 3B04A 3O16A 3G1YA 3S6DA 2QAFA 3QW3A 4O19A 1O95A 3LLFA 1QPNA 1QCWA 5AHNA 1OFPA 3LCWA 5AC8A 3E49A 3EXRA 3P80A 4PA8A 4IQLA 5F1UA 3S9YA 3PM6A 3SFKA 1H50A 4OE7A 3YPIA 1H5YA 2QCMA 6ALDA 1G4TA 3F03K 4HT3A 2Y88A 3QSRA 5LGZA 1QO2A 2NUXA 2H90A 4O11A 2A6LA 5HR7A 3ZWSA 3W7DA 3M7WA 2JK2A 2LLEA 5D04C 2GVGA 5L6UA 5EYWA 1ZFJA 3PBYA 3S1VA 3PB2A 2Y62A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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