3F5LA

Semi-active e176q mutant of rice bglu1, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 199
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
199
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 199
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2008-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3f5lA00
4KWUA 5GNZA 4ZE5A 4WKHA 1PIFA 2J8GA 3WEOA 3GXIA 3KL0A 1TE1A 5I5RA 4JFSA 2AMGA 4H8VA 4MB1A 3SURA 3SEPA 1OM0A 3NSXA 2CITA 1OCQA 3BMWA 4FMVA 2JE8A 2JF6A 3K4AA 3GYCA 2WCSA 3WNOA 2O9OA 2QMJA 4B15A 3UEQA 2DH3A 1HJXA 1QOXA 3HN3A 1L8NA 2WMKA 2PBGA 1PPIA 1WDRA 4KRUA 3AIUA 3ZQ9A 4HMDA 4F8XA 2Z1KA 3VM7A 3ARWA 5JUVA 3ZO9A 4D6HA 8A3HA 3BAXA 1OIFA 3WD0A 1B30A 1EXPA 4KGLA 1E43A 2WHJA 1JZ5A 2BVYA 3PBGA 1HVQA 2G3JA 4GZIA 1RP8A 4UR9A 1WZLA 2J62A 4MB4A 3CH9A 4DUXA 2J79A 4OOUA 2Y4SA 1V02A 2WSKA 1CENA 1GHSA 4RE2A 3OBAA 3II1A 5AYBA 3MUZ1 1J0HA 1BQCA 1W9XA 1HL9A 2Z1SA 1C8YA 4IM4A 2FH8A 1UWIA 4LXFA 3U7BA 4H8UA 2D3NA 1WP6A 3WF3A 4ATWA 1E0XA 1V0KA 2PWEA 3CUIA 5A8PA 3LMYA 1XSIA 2WZIA 5GNYA 5BWFA 5CLWA 4MB5A 3RDKA 3PTQA 3VGGA 1CGVA 1E4NA 1PX4A 5A2BA 3BAKA 5JBDA 2BS9A 3ALFA 1KB3A 4CN4A 4UQBA 1E0WA 1ISVA 2OYLA 2ZUNA 2OWCA 4GI9A 4AEFA 3SCNA 5A6AA 4XUYA 4MAVA 4WKAA 5HPOA 4IPLA 4W85A 3OGRA 4PRWA 4PN2A 4W7VA 1HXJA 4HA1A 5ABEA 3PZTA 1QNSA 2OYKA 1UKPA 1VEMA 3VPLA 3G6LA 5I78A 3WFLA 1LG1A 5BXPA 1TVNA 3TA9A 1LWHA 1W3HA 3EDDA 1XH0A 4JFUA 1W9UA 1J0ZA 4M1RA 3KL5A 4F79A 4PSPA 1M04A 3K1DA 2V3EA 4AD2A 4PMDA 1GHRA 1UD3A 2WVVA 3GH5A 1ITXA 3MU7A 1E6NA 4J3UA 4C7FA 3ZM8A 2YA0A 1KGUA 4GI8A 1UZ4A 2G3MA 2CBIA 1JZ6A 5EFFA 5KEZA 1V0NA 5FIPA 3I3EA 4F9DA 2O9PA 1V0MA 1QBBA 1EDGA 2WHMA 5A6KA 4D1JA 3AHYA 4P8WA 4F9JA 2DIJA 2AAAA 4GPNA 2DT3A 3HMCA 2ZX7A 1JNEA 9CGTA 4BQ5A 1JAEA 2O9TA 3T0BA 3MV01 3AS0A 3B9DA 1OIMA 4HZ7A 2ZICA 3CBWA 4K68A 2WPGA 1UUQA 1UQZA 4B3LA 1QI5A 1FHDA 1QHOA 1C92A 2J7EA 1B0IA 1I1XA 2C7FA 2ZUWA 1TR1A 2J8FA 2VL4A 3KL3A 4AMCA 5BYWA 2BXYA 1X6LA 4GINA 1L0PA 4B9ZA 1FH7A 2VZTA 5E70A 5CZKA 4TVDA 3VD3A 4MNLA 2ZWYA 3IK2A 1DWIM 4M82A 5GQBA 3WL1A 1IZKA 1B31A 1XGZA 2A3CA 3GNRA 1ISXA 5IHRA 4OBRA 4J28A 4UNIA 3A4AA 4ACZB 2GUYA 3WMSA 1JZ8A 2DPEA 1KBBA 3SUWA 1DWJM 1A47A 5DT5A 5AC5A 1FH9A 1UH2A 3A3HA 1M7XA 1KBKA 2WVSA 1QPKA 1JIBA 2X8RA 4P8VA 4AZGA 3VD4A 4Z2JA 1C7SA 1QNRA 1V3KA 4M8UA 1CLVA 4CUCA 1J0JA 1UR9A 1WB0A 3NUKA 2J7GA 2Y5EA 1JF6A 1F4HA 4PMVA 3TOPA 1V03A 4W88A 2DSWA 2IXVA 2YA1A 1FFQA 5BXRA 3BC9A 1KR0A 1OT1A 2BHYA 3WNLA 2UY5A 1LL7A 1E4IA 2WWCA 4J3TA 3WDJA 4HZ8A 3ZR5A 5HOSA 3VVGA 3GXMA 1JNDA 1LF1A 4QDMA 3KEHA 1W1TA 2PWHA 1CZ1A 3CHEA 5ECUA 1CGUA 4OBSA 1QBAA 2W62A 3W26A 3N17A 1V6UA 4KRTA 1CXKA 3EDFA 2RGLA 2X09A 3A47A 4AIOA 2WMIB 1W9PA 1BSIA 1EA9C 4U5IA 1UD8A 3PZOA 2WVTA 2GFTA 2E9BA 2J7FA 4HMCA 1E3ZA 3PZQA 3GBEA 1EHAA 3EYPA 5E09A 1E6ZA 1QVBA 3OZOA 1GQKA 3FHQA 1G01A 3WD1A 1HKIA 1C3FA 3L4TA 1WAWA 1BVZA 2WSPA 3TTQA 4W7UA 3CZJA 3WEZA 5HNNA 1KGXA 1UWSA 1D2KA 3BSHA 3D3AA 4WKFA 4BQ4A 5EBAA 4WLCA 3OLGA 3ZT6A 1BGGA 3VD5A 2IXUA 4V27A 5CXPA 4S3KA 3PZIA 4ZXLA 2WB5A 5CJ5A 3T2QA 3K8KA 2XFYA 4OUEA 3FHAA 4RL3A 3DECA 4HP5A 2UY4A 2MANA 1RPKA 3AIVA 3CLWA 3W25A 3VDBA 1YQ2A 1HKMA 2YDQA 3AS1A 3DYPA 3VIPA 4FLQA 2G3NA 3SUTA 3PTMA 5CSUA 1Z32X 3VU2A 4PBGA 2BVDA 1E56A 1WNOA 1BAGA 1ZL1A 3MANA 5D9NA 2XVLA 4YPJA 5HBFA 3VX1A 2EEXA 2EPOA 4E4PA 3AS3A 2GVYA 2J7BA 3EBVA 1AQHA 3VINA 1H4PA 1E6QM 1B9ZA 3RIKA 4M56A 4D6CA 3RM8A 1W91A 2XVKA 1XYFA 4AD5A 1OINA 1VIWA 2GDVA 4XZWA 1K9FA 1EIBA 2BY0A 3WF4A 6CGTA 2XWEA 5JIPA 2V3FA 4R27A 4AZIA 1EDTA 1MVYA 1UHVA 1TZ7A 3UCQA 1WDSA 1J10A 4IISA 3RMEA 4PTWA 4QFUA 1MFVA 4YN5A 1UOKA 1QNPA 1Q6GA 1GJUA 2W91A 4RE3A 5E6YA 3L4XA 4GO9A 3NDZA 1UZ1A 2ZUMA 1HJSA 2F61A 2XVPA 5FL1A 2XSBA 4HOXA 2YA2A 1XSKA 1NARA 1GOKA 3U7VA 1JFXA 3L4VA 3ARTA 4M80A 1CGWA 3AFBA 2XJ7A 1JYXA 1KXTA 2VR4A 4UFKA 3W28A 5A6BA 4QCFA 5BRQA 1A3HA 3S2CA 2YDRA 3CGTA 3WDIA 1WCGA 2J25A 1JZ2A 4UFIA 3ARRA 3N13A 3WF1A 2VX7A 1E15A 1QW9A 3IJ8A 5HDRA 4MJ2A 2Y8VA 2WNWA 3WH7A 4UQ9A 3OLIA 4B3KA 1JYVA 2XTKA 1JDAA 1V3HA 1GOIA 1E4LA 1E6XM 3MO4A 3CZEA 4EKJA 2W92A 1U2YA 3DYOA 3GBDA 3UESA 5BXSA 3QGVA 2W66A 1EO7A 4LYQA 4ML4A 4CD7A 3ARPA 4X0NA 3F4VA 4UFHA 2E9MA 2YBTA 2YL9A 4AXNA 3EDJA 2X05A 4AC1X 2D2OA 3QHNA 5C71A 5A1AA 3SCQA 1HN1A 1OD0A 3OIHA 2CYGA 2ZE0A 1JD7A 1XV8A 5A69A 5DFAA 2A3BA 4GKLA 4D1IA 2YLAA 8CGTA 1JI1A 3W29A 4Q7NA 4Y7EA 1LG2A 3MV11 4JFVA 1XHGA 3BCDA 3CMJA 5I23A 3AMDA 3QOKA 3AZRA 1UD5A 2E8ZA 1ZB5A 2WHLA 3WQVA 4H41A 3PZVA 3PZ9A 1V3IA 1MQQA 4WIWA 1NOWA 1PIGA 1VAHA 1O6IA 4F66A 1NWSA 1GJWA 4OJYA 1U33A 1I1WA 4HPGA 1HJWA 3ZSTA 3CZKA 2DT0A 2WW5A 3WQ4A 1EOKA 2VZUA 2WZHA 5CSYA 3VGHA 3SCVA 1B3VA 3GM8A 1CPUA 2VX4A 3RCNA 4HOWA 4AD0A 1US3A 2PI6A 3T08A 3VDCA 1US2A 1KCLA 2ZXBA 4BCEA 4TVCA 2VNCA 2QPSA 3QHMA 4YHGA 4ACZA 3WNKA 2VRJA 3LPOA 1K9EA 2CNCA 3TONA 4WJXA 5JBEA 3VGBA 1WDQA 2VCAA 3PN8A 1RH9A 3PTKA 1XCWA 2W61A 1GOWA 3SCRA 3GXDA 2WAGA 3CIVA 3VIGA 1B90A 5FCZA 1XD1A 3A4WA 3WENA 4AZ5A 1VFUA 4D6DA 1E70M 1EGZA 1E72M 2GSJA 4PUDA 3CHDA 4JHOA 1OGGA 4AZHA 1WZMA 1KQZA 3SCWA 1YHTA 1UKSA 3WELA 5IFTA 5D9MA 1IZJA 4PMOA 3K46A 3DHPA 1R85A 5C70A 3O2LA 2A3AA 1JZ7A 3WNPA 1HKKA 2XWDA 1W1VA 4PMUA 1SR0A 4HU8A 1H49A 5AYIA 1GONA 4XZBA 4PEEA 1FA2A 4JHZA 3SCSA 4UCFA 2X1IA 1UYQA 4ACYA 4URIA 1CIUA 1WDPA 4U5KA 1G5AA 3B8SA 3K4DA 4AISA 4CCCA 1WPCA 1CBGA 2NT1A 2WMIA 1V0LA 2D0FA 1JXKA 1W9DM 1BG9A 4AWEA 3AHXA 3VKKA 4W7WA 4RE4A 3ZT5A 1IV8A 1UKQA 3DHUA 4J3SA 4AW7A 3BAWA 1UKOA 1UG6A 5A8NA 2DQXA 1V3LA 5HXMA 3MS8A 3WN6A 2DH2A 5IFPA 1HJQA 3ARXA 1BYAA 2VJXA 1UH4A 4W89A 3MMDA 4GIAA 3WNMA 4QLKA 2Q8XA 3WMCA 2WLZA 1R86A 3VMNA 3AMLA 1E3XA 1MW2A 5E0FA 2WLYA 4D71A 3M46A 3GNPA 4EAMA 2BHZA 1MXGA 1HKJA 5D8ZA 4QAWA 2EJ1A 1B3ZA 2XVGA 1HF6A 1XH1A 2WVUA 4MNKA 4PTMA 4S3JA 1H0IA 3ECQA 4UQDA 1VENA 2VUYA 2CBJA 1UR0A 2ZUTA 3AXXA 1PX8A 2VOTA 2YL8A 3OLEA 1NQ6A 3CZLA 2DGAA 2WCGA 2ZXAA 4HU0A 1AVAA 1PZ3A 1CXIA 5D4YA 4JCLA 3T0DA 4R5EA 2OSYA 1H2JA 2W5FA 2G41A 1ITCA 4UFLA 1BGAA 1VBRA 5CG0A 2C0HA 2XM1A 3W53A 2OWXA 2PF0A 1E9LA 1VB9A 4ZFMA 2BY2A 1NWTA 1E5JA 1K9DA 1RD6A 3WD2A 3A4XA 3N9KA 3THDA 3CZ8A 3OG2A 1GOMA 4OIFA 1UD6A 3AIRA 3WNNA 2NT0A 4TOQA 5I0DA 2NW0A 5D9PA 1I75A 1JGIA 3WBEA 3S6TA 2VQUA 2VO5A 4FK9A 3NIYA 2JIWA 5D8WA 1JZ3A 1LLOA 5HPCA 5I24A 4H8HA 2BXZA 3AZTA 4E8CA 4MDOA 4U3CA 1CDGA 1QNOA 4PUEA 1KFWA 3M07A 3AMKA 1FFRA 1W1YA 2EPNA 1XH2A 2YJQA 4Z2HA 4W86A 1UR2A 2WM0A 4ZXOA 7CGTA 4FLOA 1CXFA 4CGTA 3F5LA 2XG9A 2BVTA 1OGSA 4ATLA 2WMFA 3ARYA 4TX6A 3FAWA 3SIMA 2PWDA 4L4OA 4DUVA 2XIBA 2EXOA 1UQYA 2QHAA 2DSKA 2UY3A 3GNOA 1W3LA 1ODUA 3VO0A 3FNDA 4TTUA 3CTTA 3EMZA 4A3HA 3QOMA 1FH8A 2BFGA 2YL5A 1CXHA 2ZXQA 1BTCA 3UERA 4FLSA 1KR1A 4NSBA 2XM2A 3CHCA 3VTRA 2BHUA 2YOCA 2EQDA 2YLLA 4A3YA 3AYRA 3CUGA 3N12A 3POCA 3WFZA 4TVUA 1E6PA 4Z2KA 2JALA 1HL8A 4PYSA 1W32A 4CD4A 4HOZA 2FHCA 2WC4A 3WUEA 5E0CA 4X0VA 1ISYA 1LL4A 2WK2A 3T09A 2F2HA 1F4AA 4KH2A 3EMCA 1J11A 3F5JA 1AMYA 3GH4A 4J3WA 3WEMA 1GVIA 2BY1A 5CGMA 1HNYA 4J27A 3W82A 1N82A 4DWSD 3AHTA 3WUGA 3IANA 1W1PA 2PWGA 1ECEA 1KGWA 1VBUA 3CMGA 4GZJA 4HZ6A 1HVXA 1KXHA 1AQ0A 3ZJ6A 4JKKA 1GVYA 2FHBA 2YL6A 1E4MM 2D22A 3K8LA 1ZJBA 2J4GA 5IDIA 1LJYA 2CKRA 4LPCA 4CD5A 1ZBCA 2FDMA 4ZENA 2EPLX 4BS0A 3ZJ7A 4TX8A 3OGVA 1E1FA 1J9YA 2E9LA 2D24A 4AZCB 5A8MA 1V3JA 1EQPA 1JI2A 3VGFA 1X1NA 2HVMA 3WDPP 1Y7VA 1TVPA 2YIHA 3RM4A 1MQRA 1GORA 2G3IA 1MQPA 2JEPA 2D20A 5E6ZA 2VX6A 1OB0A 2EPKX 1V6VA 4P8UA 2GK1B 4AEEA 3A6OA 4CVWA 1B3XA 1BYBA 1LQ0A 2QV4A 4WK9A 1V6XA 4AZ7A 1HX0A 3TTYA 2DIEA 2OSXA 4H7VA 3JUGA 3ZOAA 3N04A 4GO8A 5CQ1A 2PBOA 4W93A 4ZEPA 1R7OA 2EPMX 3SCTA 1M53A 1PAMA 3WBAA 1GQIA 2W67A 1GPFA 1QI2A 3IJ7A 3ZJ8A 3WDRA 2VI0A 4EK7A 2VURA 4X9YA 4XX6A 4B16A 2E4TA 1DWGM 2CIPA 1JG9A 1CWYA 4W8LA 2Y24A 1D7FA 4FLRA 2O9RA 4QLLA 4W84A 5DF0A 1CECA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KWU A;  5GNZ A;  4ZE5 A;  4WKH A;  1PIF A;  2J8G A;  3WEO A;  3GXI A;  3KL0 A;  1TE1 A;  5I5R A;  4JFS A;  2AMG A;  4H8V A;  4MB1 A;  3SUR A;  3SEP A;  1OM0 A;  3NSX A;  2CIT A;  1OCQ A;  3BMW A;  4FMV A;  2JE8 A;  2JF6 A;  3K4A A;  3GYC A;  2WCS A;  3WNO A;  2O9O A;  2QMJ A;  4B15 A;  3UEQ A;  2DH3 A;  1HJX A;  1QOX A;  3HN3 A;  1L8N A;  2WMK A;  2PBG A;  1PPI A;  1WDR A;  4KRU A;  3AIU A;  3ZQ9 A;  4HMD A;  4F8X A;  2Z1K A;  3VM7 A;  3ARW A;  5JUV A;  3ZO9 A;  4D6H A;  8A3H A;  3BAX A;  1OIF A;  3WD0 A;  1B30 A;  1EXP A;  4KGL A;  1E43 A;  2WHJ A;  1JZ5 A;  2BVY A;  3PBG A;  1HVQ A;  2G3J A;  4GZI A;  1RP8 A;  4UR9 A;  1WZL A;  2J62 A;  4MB4 A;  3CH9 A;  4DUX A;  2J79 A;  4OOU A;  2Y4S A;  1V02 A;  2WSK A;  1CEN A;  1GHS A;  4RE2 A;  3OBA A;  3II1 A;  5AYB A;  3MUZ 1;  1J0H A;  1BQC A;  1W9X A;  1HL9 A;  2Z1S A;  1C8Y A;  4IM4 A;  2FH8 A;  1UWI A;  4LXF A;  3U7B A;  4H8U A;  2D3N A;  1WP6 A;  3WF3 A;  4ATW A;  1E0X A;  1V0K A;  2PWE A;  3CUI A;  5A8P A;  3LMY A;  1XSI A;  2WZI A;  5GNY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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