1XYZA

A common protein fold and similar active site in two distinct families of beta-glycanases
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
NALRDYAEARGIKIGTCVNYPFYNNSDPTYNSILQREFSMVVCENEMKFDALQPRQNVFDFSKGDQLLAFAERNGMQMRGHTLIWHNQNPSWLTNGNWNRDSLLAVMKNHITTVMTHYKGKIVEWDVANECMDDSGNGLRSSIWRNVIGQDYLDYAFRYAREADPDALLFYNDYNIEDLGPKSNAVFNMIKSMKERGVPIDGVGFQCHFINGMSPEYLASIDQNIKRYAEIGVIVSFTEIDIRIPQSENPATAFQVQANNYKELMKICLANPNCNTFVMWGFTDKYTWIPGTFPGYGNPLIYDSNYNPKPAYNAIKEALM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A common protein fold and similar active site in two distinct families of beta-glycanases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1,4-BETA-D-XYLAN-XYLANOHYDROLASE
molecule tags Glycosyltransferase
source organism Clostridium thermocellum
total genus 140
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1995-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1xyzA00
1CLXA 3BCDA 1UG6A 3WNOA 2IXVA 3L4XA 1V0NA 5LA2A 1H5VA 4B9YA 1IZKA 3O2LA 3VPLA 2QMKA 4CU7A 2C8NA 5A6SA 2VX7A 5C70A 1HXJA 3M7SA 1W3JA 1YQ2A 3AIBA 4D6HA 4R27A 4W8LA 5CXPA 2J7HA 3WKZA 2IUZA 1VAHA 1JZ7A 4MJ2A 4AZIA 3WD0A 3IJ9A 1GVYA 1ZJBA 4BZYA 5FOOA 3WUGA 3UG5A 1W91A 3HJEA 4UQAA 3CMGA 4W5UA 3IANA 1TR1A 1JZ3A 2WKGA 2X8RA 4IPLA 1WDRA 4Q7NA 4ZE5A 2QMJA 1TUXA 3I3BA 1RH9A 4JZ5A 2BVTA 4S3JA 2WHMA 4PMOA 1FOBA 4Z2KA 4HP5A 2W67A 3BMWA 1QI2A 2EEXA 1QI3A 2PBOA 2AOSA 1J11A 1D2KA 1MW2A 1US3A 3POCA 3WDPP 1AQMA 1CXHA 3ARWA 2XM2A 1WB0A 1CXKA 3LMYA 4TX6A 4J3XA 4AD2A 1E73M 4W87A 3QHNA 3WH6A 1QNSA 4Z2IA 3WH7A 1E3XA 3MV11 1JDDA 5I24A 2J79A 1UKOA 1HJVA 3BSHA 4W7WA 3SURA 1TE1A 3VX1A 2OYKA 4WIWA 4TXEA 1BPLB 3VD9A 2W61A 4K68A 1C8YA 2YL8A 3AMKA 1N82A 1E70M 2FHBA 4MNKA 3BGAA 1QBAA 3RILA 4UFKA 5E70A 3MS8A 4GXPA 1E6NA 5D4YA 2GFTA 1SFSA 3ZR6A 3W82A 3FHQA 1JZ4A 3A3HA 3PTKA 5GNZA 4GZJA 4OOUA 4UFMA 3VGDA 2UY3A 3MMWA 2IXUA 3IJ8A 2DPEA 3FN9A 5BXRA 3MMUA 3PZIA 4JFSA 4AD4A 1C8XA 2MANA 1E9LA 4D6DA 1ISWA 3VGEA 2ZUUA 3WDJA 2J62A 4MB4A 3RM8A 3WF0A 1V6VA 2ZX9A 4HMEA 3WUBA 1W9VA 4L4PA 5I77A 1VIWA 3TTQA 4CGTA 1EQCA 1JDCA 3VD5A 1GQKA 3DHUA 1EQPA 3W37A 3BMVA 4BQ4A 1WPCA 2EPMX 2AMGA 2Z1SA 4AEEA 3W0KA 1JIBA 2X0HA 1V3JA 3PZQA 3QHOA 1W1VA 1JZ5A 1G0CA 4AZCA 2F2HA 4J3SA 1J9YA 3VGBA 3AZSA 2DEPA 3WEMA 1UKTA 2WHJA 1NP2A 2JF7A 1UD6A 2BY2A 2E0PA 4OBSA 3WFLA 3N12A 1J18A 2PB1A 2DDXA 3AS2A 4D71A 3PZUA 1W2VA 4AEFA 4IUGA 3DECA 1QW8A 5A2CA 1Q6CA 3WF3A 2VVSA 1H0GA 4PMNA 4W7VA 3SEPA 3AZRA 3N15A 4HOZA 5CQ1A 1M53A 1TA3B 2PI6A 3KE0A 2XGBA 3VIOA 5ABFA 1DWFM 3NDZA 2VTFA 1JF5A 3ARQA 2J4GA 1V03A 1CNVA 1JYWA 5A6KA 1HL9A 3WUFA 4OJYA 2YJQA 3W28A 3ARTA 2O9RA 3CMJA 2E9LA 3MANA 3GNPA 1VRXA 3SCSA 1UR4A 1QHPA 3MUZ1 3WUEA 1R85A 4M29A 2XVPA 2J7BA 1VFUA 1ZJAA 4OOZA 2VRKA 3CO4A 4CVWA 4EKJA 4OBRA 1NWTA 1PBGA 3AXHA 4UQBA 1HIZA 2FDMA 4FLOA 1NWUA 4Z2JA 1FFRA 3U57A 1W9DM 4JIEA 3KWXA 5IFTA 4AIUA 4U5KA 1V0LA 2WYSA 4CD6A 1B3ZA 5M3WA 5LYRA 1JI2A 4QAWA 4GZIA 1JXKA 3VIKA 4D1IA 1KB3A 1EIBA 3F5LA 3WY1A 1W32A 1MXDA 1XSIA 2J25A 1LF1A 4JL1A 4V28A 1BSIA 3OLDA 4NSBA 4ZFMA 2D23A 5A8PA 3VDAA 2DSUA 3MUIA 3ARSA 3SCUA 4W5ZA 5D9MA 3TONA 2J7GA 2V5DA 5E6YA 5E6ZA 1JYNA 4F66A 2J77A 4TX8A 1HNYA 1A47A 3VIIA 1PX3A 2BVYA 3T0DA 3ZQ9A 4CD7A 2O9PA 3OBAA 3N04A 1LL4A 4DUVA 2W91A 3G6LA 4E8CA 1VB9A 3ARXA 1XCXA 2WMKA 3ZIZA 2D22A 1WNOA 2J7DA 3K4AA 3KEHA 5JUVA 3IK2A 1B31A 1B90A 1KGXA 4HA3A 2YDRA 2VURA 1ZBCA 3ARRA 2JIEA 4D6CA 3EDKA 3ALGA 3L4WA 4UQ9A 5A8NA 1WKYA 5CSUA 1QI4A 1I1XA 3K8LA 2FHCA 3PZMA 3CZGA 1XSKA 1UR8A 3ARUA 1DWAM 3PZ9A 1TCMA 3SCOA 3FNDA 4GI8A 3KL0A 3CPUA 3OLGA 2HVMA 3SCVA 1AQ0A 3WEZA 9CGTA 3MSGA 3AYRA 3ECQA 4NRRA 4Q22A 1NWRA 4QLLA 2HISA 3N17A 1OINA 3WDIA 3GXIA 3VIHA 4EK7A 3RDKA 2EO7A 3AFBA 3GZAA 1NP0A 4ZXLA 3UERA 4KGJA 3RIKA 4GZEA 2VQUA 4P7LA 3L2LA 3BSGA 3VIMA 4PMUA 5DMYA 1V6XA 1QHOA 1KR1A 4MB1A 4KRTA 2J8GA 2GDUA 3ZSSA 2WZHA 5FL1A 1MYRA 1HJUA 4XZWA 3LPPA 5E09A 1J0KA 1HKKA 4Z2HA 1J0JA 3ARZA 3ZT7A 1EGZA 8A3HA 3M6DA 3AIRA 4W88A 3GXMA 3FHAA 5A6MA 4J3VA 4DM2A 4UTFA 4ATWA 2XJ7A 1NARA 3AICA 3ZR5A 1JNEA 4FLSA 2OSWA 3ARYA 4W8AA 3OG2A 2VZSA 5M03A 4B9ZA 4TTUA 1Q6EA 2X1IA 2GJXB 1WE5A 3W81A 5ABHA 2WVUA 4H7VA 1G9HA 2PWHA 3FAWA 2WVSA 3A4AA 5I23A 2E9BA 1X6NA 1UR0A 1EDTA 2XIBA 1B0IA 1OB0A 5CG0A 2OLHA 1UD8A 4D6FA 4Y7EA 2OWXA 4J27A 3BXWA 3MSDA 3WNPA 2VR4A 1GNXA 3AIVA 3ZJ7A 4WSKA 2EXOA 3PZVA 3FAXA 2A3AA 4M82A 3EDJA 1OSEA 3ARPA 4UOQA 1X6LA 1XD0A 4WKAA 3WH5A 1HL8A 2VX6A 3DYMA 3NIYA 1ISXA 3QHMA 3VM7A 2XG9A 2OYMA 1ISZA 1UKSA 5A94A 1KXTA 1E6RA 3CGTA 2WANA 1V3LA 5LA0A 1UA7A 1CXIA 1UWIA 1BFNA 4P7NA 1LLOA 1E6SM 1VEMA 3BAJA 1TMQA 4JFTA 2D2OA 3VGGA 3N9KA 4PTMA 3MO4A 5CSYA 5DO8A 4D72A 1ZU8A 3K4DA 4UFIA 1FA2A 1ESWA 1H11A 1ITXA 1JZ6A 3WIJA 1K9EA 5A1AA 3TTYA 4X0VA 3WD3A 2A3EA 2YA0A 3O6AA 3J7HA 5BCAA 2OSYA 3CHDA 1JAEA 1PZ3A 1J12A 3WL1A 4PUDA 7TAAA 3K8MA 3AROA 3AYSA 5DEZA 1XGZA 1PX4A 5D8WA 1KBKA 1PAMA 3BAIA 6A3HA 1MFVA 3L4TA 2ZWZA 1W2PA 1B9ZA 4OKDA 1HX0A 4NRSA 1E5JA 1E4LA 1BAGA 1TG7A 4GO8A 1E40A 3LPFA 3W27A 3L4UA 1C7SA 4ML4A 1FP8A 4IPNB 3CHCA 4JKLA 4HMDA 4W85A 1FH8A 2XWEA 3OLIA 3SUTA 3CZLA 1GPFA 4UOJA 2WC4A 2W92A 3EMCA 3T08A 3K1DA 1WDQA 2ZUMA 2EBNA 3WN6A 1ZS2A 2J74A 3GH4A 2C7FA 1BVNP 1HP5A 1J10A 4WKFA 1L8NA 1JDAA 3CZEA 4LYRA 2VX5A 4UNIA 2OSXA 3OLEA 5AC5A 1EXPA 1OBAA 1LL7A 1V3IA 1VF8A 4C7GA 5D8ZA 5GQBA 2PWEA 2VNCA 1V08A 2WZEA 4KMQA 1DWIM 3VX0A 5A69A 4TVCA 2XM1A 3K46A 3TOPA 5BRQA 2D0FA 3SUSA 1UWTA 4D6IA 4U33A 2VZTA 3WMBA 3AI0A 2AAAA 4JAWA 3VNZA 3WH9A 1MFUA 4MDPA 1GORA 2UY4A 2VQTA 4W86A 5A2AA 1DTUA 2QPUA 2DSWA 4CCEA 2YLLA 1VFFA 3GXFA 2CPUA 1XD1A 3CLWA 3F5JA 3K8KA 4CU6A 2CKSA 2ZX5A 4GKLA 3WH8A 3EMZA 1JYVA 1DP0A 3SIMA 4TUFA 5A8MA 4FMVA 3VTRA 2VO5A 2BY0A 1QHZA 1CEOA 1WDSA 1OD0A 3CHFA 2BXZA 2QLYA 4KH2A 1TFVA 2WMIA 3GYCA 2XGIA 2BY1A 1M03A 2WVTA 3U5UA 4P8WA 1OCQA 5EB8A 4AZCB 1LL6A 3UG3A 1OIFA 2G3JA 3IAQA 4IM4A 1EH9A 4UCFA 2YBTA 2XTKA 2BV9A 3AMDA 2WC3A 4ACYA 4XX6A 1OWQA 4FLRA 3F4VA 3VNYA 1V0MA 1GOMA 2XYLA 1BVZA 1W9XA 4E2OA 3RMEA 4C7FA 2XVGA 5KEZA 1R7OA 3CUGA 1UH2A 4FK9A 4HU8A 5ABFB 4QFUA 3FXYA 3QOMA 4UZSA 4W8BA 4TVUA 4ZENA 2JF6A 4PYSA 2W66A 3DC0A 3AIQA 1VBUA 1HJSA 1OGGA 3WQ4A 1UA3A 2YA1A 2E9MA 2WM0A 1GCYA 1PIFA 2NSXA 4AXNA 1E4NA 4GI9A 1MW1A 1E55A 1CPUA 1PZ2A 4ACZA 1MQQA 4HMCA 1W9BM 3T2QA 4HU0A 4H8UA 1KR0A 4U3CA 1GOIA 3VD7A 1W1PA 4IISA 5CLWA 1CLVA 2O9TA 2ZX8A 4DWSB 3GNOA 1V6WA 1HVQA 3A6OA 3W53A 1XH1A 3SCTA 3AXXA 1WP6A 4LGXA 1H0IA 1C7TA 4BA0A 3HMCA 3WD4A 2PWFA 3AHYA 2XSBA 2YL5A 2J7CA 4PEEA 1TZ7A 1KXHA 3KZSA 1CIUA 4F8XA 4MNJA 1B3XA 3WDHA 1GHRA 4MJ4A 1RP9A 1FH7A 2E3ZA 3VIGA 1EHNA 1FFQA 1UOKA 1V6UA 1O7AA 2UWFA 1E3ZA 1LWJA 1UZ1A 3WFZA 4XZBA 1UD5A 2A3HA 2D3NA 1E0XA 2WB5A 6CGTA 1NQ6A 2O92A 2WK2A 5GNYA 3S2CA 1WO2A 4W84A 1LJYA 4HOXA 3U7VA 2CITA 1XH2A 2JFEX 3A4WA 1DWGM 2ZXQA 4FLQA 4MAVA 2RGMA 2C0HA 2BNJA 2DH3A 1CWYA 5HXMA 4UFLA 3SUVA 4P8VA 3ARVA 3MUAA 4DM1A 5E0FA 2VZVA 4CN1A 2VUYA 4Z2LA 1F4HA 3L2MA 1GHSA 2DSZA 2G3NA 2GVYA 2E8ZA 1V0KA 3BH4A 3I3EA 4CN6A 1K9FA 3THCA 4RE4A 2BXYA 1K9DA 3OA5A 3UG4A 1JL8A 1NWSA 5A95A 1GUVA 1JZ8A 5A8OA 5HDRA 5HBFA 3WBEA 2FGZA 2CEQA 1KGWA 5EFFA 4DWSA 2EPOA 5CGTA 1UR2A 1HKIA 3N11A 3OB8A 1O6IA 1UR9A 4KGLA 1UH3A 1W3LA 3AS0A 4TTGA 1BG9A 1WDPA 1CGUA 2XFFA 1RP8A 1UKQA 3NCOA 1ZB5A 4ZXOA 4XB3A 4PMYA 1GJWA 2CHOA 1IT0A 1OGBA 4D1JA 2PBGA 1D7FA 1C3FA 2B31A 1C92A 2CBIA 4LYPA 2Y4SA 5JBDA 4AD3A 4NI3A 2WLYA 4UQDA 7A3HA 1B3YA 1WZAA 4H41A 3CZJA 2CKRA 1BF2A 2OWWA 1US2A 3HU7A 2J47A 1HKJA 2WPGA 2WMHA 4JHOA 4HZ6A 5CPSA 5E9AA 4LYQA 3PZTA 4C7DA 1HJXA 3GH7A 4Z2GA 3SCRA 1EO5A 1NM9A 3AS3A 1M01A 2XSAA 2QPSA 2WWCA 2YIHA 3F5KA 4RE2A 4CD4A 3TTOA 2J7EA 2VVNA 2A3CA 1V02A 4A4AA 3CUIA 4CD8A 2DQXA 5A6AA 4WLCA 1W9PA 4AZ6A 3AHTA 1NOUA 1RD6A 4V27A 1BYCA 3UCQA 1OD8A 3GBDA 1R86A 4M24A 1MXGA 1JG9A 5DT5A 1K6AA 3TTSA 3PZOA 5M5DA 1HF6A 1W1YA 4XUYA 4RE3A 1ZBVA 1KXQA 2XFYA 3EBVA 2PF0A 3QGVA 2VCCA 4E4PA 2WZIA 4PMZA 2WKLA 1C91A 4PTVA 1YHTA 1CGTA 1EDGA 1WZLA 2GK1A 4AZBA 2PWDA 3GTNA 3SCWA 1WZKA 1IZJA 2FHFA 4NF7A 1I1WA 4LX4A 2XVNA 2ZIDA 2W62A 2WMGA 3EDFA 3AMGA 3D5HA 3BLKA 5IHSA 3VM5A 1CXFA 1EHAA 3VO0A 3AHZA 5FIPA 2YL6A 5AYIA 3WDRA 4KWUA 4CCDA 1EDQA 1Q6DA 2CHNA 1KBBA 3MUY1 3B9DA 2WC7A 2J78A 4W89A 1LQ0A 2YOCA 5CPTA 3WNKA 5TD4A 5IXEA 1B30A 1R87A 5LA1A 4UR9A 1HKMA 3WQWA 2G8ZA 2YA2A 3AOFA 4YHGA 1HJWA 3WF2A 2XPKA 4BQ2A 3VGFA 7CGTA 3AMLA 2E4TA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CLX A;  3BCD A;  1UG6 A;  3WNO A;  2IXV A;  3L4X A;  1V0N A;  5LA2 A;  1H5V A;  4B9Y A;  1IZK A;  3O2L A;  3VPL A;  2QMK A;  4CU7 A;  2C8N A;  5A6S A;  2VX7 A;  5C70 A;  1HXJ A;  3M7S A;  1W3J A;  1YQ2 A;  3AIB A;  4D6H A;  4R27 A;  4W8L A;  5CXP A;  2J7H A;  3WKZ A;  2IUZ A;  1VAH A;  1JZ7 A;  4MJ2 A;  4AZI A;  3WD0 A;  3IJ9 A;  1GVY A;  1ZJB A;  4BZY A;  5FOO A;  3WUG A;  3UG5 A;  1W91 A;  3HJE A;  4UQA A;  3CMG A;  4W5U A;  3IAN A;  1TR1 A;  1JZ3 A;  2WKG A;  2X8R A;  4IPL A;  1WDR A;  4Q7N A;  4ZE5 A;  2QMJ A;  1TUX A;  3I3B A;  1RH9 A;  4JZ5 A;  2BVT A;  4S3J A;  2WHM A;  4PMO A;  1FOB A;  4Z2K A;  4HP5 A;  2W67 A;  3BMW A;  1QI2 A;  2EEX A;  1QI3 A;  2PBO A;  2AOS A;  1J11 A;  1D2K A;  1MW2 A;  1US3 A;  3POC A;  3WDP P;  1AQM A;  1CXH A;  3ARW A;  2XM2 A;  1WB0 A;  1CXK A;  3LMY A;  4TX6 A;  4J3X A;  4AD2 A;  1E73 M;  4W87 A;  3QHN A;  3WH6 A;  1QNS A;  4Z2I A;  3WH7 A;  1E3X A;  3MV1 1;  1JDD A;  5I24 A;  2J79 A;  1UKO A;  1HJV A;  3BSH A;  4W7W A;  3SUR A;  1TE1 A;  3VX1 A;  2OYK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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