3CUJA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase cex (cf xyn10a) in complex with sulfur substituted beta-1,4 xylopentaose.
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Exo-beta-1,4-glucanase
publication title Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides
rcsb
source organism Cellulomonas fimi
total genus 131
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2008-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cujA00
3AXIA 4UFHA 3I3EA 1UKQA 1UKSA 4OIFA 3WL1A 1OT2A 1TCMA 2D0FA 4JL2A 3NUKA 4TTUA 4GI8A 1A47A 3AI0A 4CCCA 1E0XA 3I3DA 1CXHA 1FH8A 1CEOA 2J25A 3AICA 1ZBKA 3QGVA 1IZJA 1P6WA 3BGAA 1Q4NX 2PWFA 1E4NA 1V0MA 3PZMA 3VMOA 5A6MA 3AMKA 3L4ZA 4U2ZA 2VZVA 3SCRA 1OBAA 3BSGA 1DEDA 1HJXA 3OGRA 2W5FA 1C8YA 1ISWA 5F7UA 4CU8A 2OSWA 2DSUA 3SCUA 2OSXA 2J4GA 4XX6A 2EPOA 3VVGA 1UH2A 2C8NA 3BC9A 1VIWA 2OYLA 1NWSA 4QP0A 4MTVA 4UFIA 3BLPX 2WCSA 2XGIA 4AW7A 3SCVA 1FHDA 3O6AA 1E72M 1UD5A 1O7AA 1BPLB 2J7GA 1C90A 1WZMA 4OZOA 1NP2A 1GQJA 1W1VA 3GBEA 1E1EA 3N04A 1NOWA 4DWSC 2EXOA 4WK9A 3BAXA 4AC1X 4EAMA 2Z1SA 2ZX6A 3IK2A 3EDJA 3UG4A 1ISVA 2X8RA 2RGMA 3VIMA 3A3HA 2DIJA 1JZ7A 1E3ZA 1LJYA 5FIPA 1ODUA 4UR9A 3AHYA 3QHNA 1CXKA 2J8FA 3B9DA 3ECQA 3PZIA 4AD2A 1MXDA 1LG1A 4CVWA 3CUFA 2ZUNA 4P7RA 1SMAA 2VI0A 1KQZA 3MUZ1 1ZJAA 5I6SA 1J0HA 1EGZA 1QNSA 4PCTA 1JXKA 5EFFA 3POCA 1HJUA 2IXUA 2V5CA 3WUBA 2D3NA 4D6DA 1PPIA 1E0VA 3IJ9A 1PBGA 2DH2A 4UFKA 3VGBA 4W7WA 1NWUA 5A1AA 1H41A 5JBEA 2YJQA 3G6LA 5I2UA 5BWFA 4GINA 2DDXA 3UR7A 3W26A 1VFUA 2GDVA 2ZXAA 2VZUA 3ZOAA 3FNDA 3AS1A 4MDOA 1TFVA 4KRUA 3T2PA 3GNRA 1XH0A 2G41A 2QV4A 3WNKA 4R5EA 1KWGA 1K9EA 1C8XA 1V6VA 3BXWA 1J0JA 3IJ8A 4JHZA 4M80A 2W91A 3ARUA 3AMLA 1CGYA 2E9MA 3OIHA 3BSHA 5ABHA 4PMYA 1JZ2A 1Q6EA 2IUZA 1KXVA 3GM8A 2CERA 4ACZA 4U3CA 4P7LA 1QI4A 1B2YA 4TUFA 1XH1A 3OLGA 3RIKA 4CD7A 3MU7A 4DUVA 5A8QA 1V6UA 1GQIA 4PUEA 3OLIA 4PTMA 2G4FA 4BQ4A 1QNRA 4B3LA 3D3AA 3EDFA 1XYFA 1WZKA 2MANA 1W2VA 3ARXA 3PHAA 4AD4A 2CNCA 3RJXA 4UQEA 2DSZA 1CZ1A 1BG4A 2ZIDA 4MB4A 2G3NA 3WBEA 3CIVA 1CGVA 3SUSA 2PWHA 2CETA 2AMGA 5A94A 5EBAA 1HKKA 3SCSA 2BVDA 1R8LA 5D8ZA 5I79A 1VBRA 2PI6A 3VIKA 1M01A 2CXGA 2WCAA 4PMOA 1MQQA 5A95A 2OSYA 1JXJA 1JFHA 5LA1A 3ZJ6A 1HIZA 1ZU8A 3ZSSA 4FLOA 1DWIM 3WDRA 4UTFA 3TOPA 1UWRA 2WAGA 2XYLA 3WFZA 3WQ6A 1J0IA 1V0LA 1JNDA 1H5VA 2BY1A 3BMWA 1WKYA 2ZXQA 5KEZA 4EE9A 1JZ3A 1B0IA 1DWGM 1GHSA 3N1AA 1QNOA 2XTKA 1OD8A 3WD1A 4IPNB 4J28A 4JHOA 4B3KA 4NI3A 1V6YA 2ZWZA 4PSPA 4MJ2A 1W3JA 3WDJA 2D20A 3VDHA 5A6AA 4Z2IA 2PB1A 3ARWA 3MUIA 5FKYA 4D1JA 3WF1A 1G0CA 4HMEA 1LL7A 2QLYA 4HZ8A 4X0NA 2QPSA 1C7TA 2BS9A 5A8MA 3WUFA 3AROA 4K68A 5JBDA 3VGDA 2WLYA 2WW5A 3W29A 1W9VA 3MSGA 1JD9A 4ML4A 2VO5A 4H41A 1OM0A 1HP5A 3A47A 3AS0A 3GZAA 3RJYA 1PZ2A 4AZBA 3UR8A 2J78A 5FL1A 3WNMA 3POHA 1E71M 2W63A 5A2AA 1BYBA 1KBKA 2WNWA 3ZR5A 1NOFA 3AS2A 2J62A 1ZBCA 3FY1A 1FHLA 4UOZA 2WZIA 1OGSA 4V28A 5LYRA 2HVMA 5D9PA 2FH8A 2EPMX 1H11A 2JALA 1UR0A 4J3XA 1ODZA 1K9FA 2VCCA 3AXXA 3K8LA 1QW9A 2X2YA 1E70M 8A3HA 4PUDA 4GQRA 5I78A 4PTVA 3S2CA 1BF2A 3NJ3A 1WZAA 1BTCA 1KXTA 1QBBA 3EMQA 1UD2A 3W53A 4IUGA 2WMIA 4DWSB 1QI2A 1RH9A 2WVSA 3GYCA 1CPUA 1KCKA 2HISA 1CXEA 4NRRA 1GVIA 2YOCA 3K8MA 4ATLA 1EH9A 1B3WA 2V3DA 2UY2A 2WMFA 2WPGA 2WLZA 1B90A 1MQPA 4BQ2A 4H04A 4P8UA 4GZJA 5BYWA 1VENA 1PX4A 3M6DA 1W9UA 4PTXA 1BFNA 3BAIA 4TX6A 2FHCA 9CGTA 1UHVA 1B3VA 4PMRA 3CMJA 4PCSA 1U2YA 3M46A 1H4PA 5D9OA 1XV8A 3CUIA 3U5UA 2VZSA 3N9KA 5A8NA 5DFAA 3VMNA 2O9TA 4W8LA 1BVNP 4YHEA 1UD4A 5M5DA 1TA3A 2D24A 3QOMA 4DUXA 1E6QM 1GQLA 1WDQA 3OGSA 4OBSA 3T08A 4TVDA 1OCQA 3BCFA 4ATWA 1E0WA 1E1FA 3WDQA 5DT5A 2XVKA 1AQMA 4Q7NA 3HN3A 2W4XA 1RP9A 2EQDA 2VX6A 1B1YA 4W93A 1M7XA 2G3MA 3CZEA 3VDBA 1WDPA 2WWCA 5FD0A 4HPGA 1J0ZA 5M03A 3MMUA 3W6MA 1I1XA 2VTFA 1ZBVA 2WHKA 1PZ3A 1E40A 1CGTA 3CLWA 2GJPA 4L4OA 1Q6DA 2CKSA 1V08A 1JF5A 1UD3A 1GOQA 2GK1B 1LWHA 1W1PA 5ECUA 3WDHA 2WZHA 3MUY1 2GUYA 2FHBA 1GJUA 3KL0A 1DTUA 3T2QA 4LQ1A 2J74A 2VMFA 4UQAA 2CEQA 2YL9A 1UH4A 2WVTA 3FHQA 4HU8A 3OBAA 4MADA 4CN6A 3VINA 1OINA 4IISA 4DUWA 3VIJA 3RCNA 1X6NA 1R7AA 2V5DA 2WHLA 4QDMA 3U5YA 3NSMA 4ATDA 2DSKA 4HZ7A 1BVZA 4JCMA 4HOXA 4M56A 4UFLA 5CG0A 3WL0A 4ZENA 3T0DA 3KEHA 1JDAA 3TONA 2Q8XA 2YLLA 1QHOA 5DO8A 4PBGA 1UD6A 3S6TA 2YKKA 4JFUA 3SIMA 2XM1A 2Y8VA 1CIUA 4W84A 1U30A 4CD4A 2W67A 1JYXA 1OGBA 5HNNA 1J10A 1JYVA 3ARVA 3GNPA 1KBBA 2WBKA 2PWDA 4DM2A 1E5NA 1JZ4A 1NP0A 3ZMRA 1EDTA 4AMCA 3WQ8A 2WSKA 1HL9A 3VIOA 3W27A 3WH5A 5A6SA 4BQ3A 1HJSA 1UH3A 2UY5A 3CUGA 1YQ2A 3L4TA 1UWUA 5FCZA 5HBFA 3PZUA 4BQ5A 4MNLA 3MKKA 1EDQA 4J3SA 3A6OA 1CTNA 3MO4A 4D6HA 4E8CA 4J3VA 2ZX7A 2CKRA 3CHCA 3N15A 1JGIA 2YL5A 1GOKA 3WDIA 2FGZA 5D9NA 1CXLA 1CGWA 3WELA 2PBOA 3U7VA 2GJXA 1BSIA 4RE4A 1VFFA 2XGBA 3QOKA 4TVCA 1E6ZA 1QW8A 4GI6A 1X1NA 1NWTA 1XH2A 1HJWA 4L4PA 1BQCA 1OGGA 5ABFA 3PTKA 3CHFA 2V3EA 3F4VA 2V3GA 4P8VA 3TTOA 4AZCA 2EPLX 3W25A 3VD5A 1MW3A 3WQ5A 3GXDA 5A6KA 3PZ9A 1BG9A 1WZLA 3NDYA 1PX8A 4M1RA 6TAAA 1F4AA 1SFSA 1CXIA 2XM2A 3MSDA 4JKMA 5HOSA 2WMGA 4PN2A 1U33A 3ARYA 3KWXA 2ZUWA 1EXPA 1ZJBA 1WDSA 2A3HA 4TXEA 4NF7A 1V3KA 1QNPA 2WC3A 1FOBA 4M81A 5I0DA 5E0CA 3VOCA 2WZEA 1OWQA 3FAXA 1ISXA 3QR3A 1UZ4A 4M29A 5CLWA 1EOKA 2A3BA 3SCQA 3EMCA 3ARZA 3WUGA 3NSNA 4LXFA 3T2OA 5AY7A 1WB0A 2D22A 3WF4A 1G01A 2J7CA 3VIIA 1CGUA 3VX0A 2VC9A 3AFBA 4D6EA 2E8YA 4UZSA 1VB9A 4FLRA 5CGTA 3AYRA 1HP4A 2OWCA 4WLCA 4WSKA 5IHSA 2WWDA 1W32A 3WH6A 5BCAA 3WY1A 1JD7A 4S3JA 1ITCA 2C0HA 3CZJA 4HOWA 1G1YA 2ZX9A 2CBVA 1BHGA 3W4RA 3A4AA 1UKTA 3ARPA 3VIGA 1NOUA 1RPKA 2QMKA 4GIAA 3WH9A 1EDGA 1UUQA 2WANA 1C91A 2WHJA 3PN8A 4HPHA 2O9PA 3LPFA 4W89A 1WP6A 2WMJA 1AQHA 1NWRA 1QHPA 2BY3A 4AZ7A 1HKIA 3MMDA 3W24A 3LPOA 1VEOA 3W28A 3W82A 4DWSD 1LLOA 3VIPA 1MW0A 1E6XM 5CLTA 3VNYA 1L0PA 2XHYA 4U5KA 1VJSA 2G8ZA 3VU2A 4D6IA 4U5IA 2VX7A 3VILA 2F8QA 2RGLA 4RE3A 2YLAA 4V27A 3WNPA 4HOZA 3WN6A 3NIYA 4HA1A 4XZBA 3CGTA 3KL3A 4WIWA 2DH3A 1JYNA 3WMCA 1ISZA 1LL6A 4LYPA 3VPLA 1JYWA 1J12A 1UR9A 4M24A 1E4LA 4BZYA 1IV8A 3WMBA 1J0KA 4NZCA 2WKLA 3T09A 4E2OA 4QFUA 4A3HA 2VR5A 1DP0A 2XPKA 4MJ4A 2YDQA 2W66A 2W62A 2O9OA 2YA2A 1CDGA 1JI2A 1WPCA 3ARTA 1G9HA 3VTRA 1GUVA 3UEQA 5M17A 2YDRA 2XFFA 2JF6A 3SCOA 2Y4SA 1CWYA 1W3KA 3OZOA 4HMDA 4JL1A 4Z2LA 4KGLA 3WH8A 1YHTA 1CNVA 3T0BA 1XSKA 2WVVB 4WKFA 1E5JA 5IDIA 2TAAA 1E15A 1E4IA 4JIEA 2WBGA 3FHAA 1E73M 4HU0A 4W88A 4P7OA 1NH6A 3AZSA 4MAZA 4AIOA 1UYQA 3CUHA 3EDDA 1K9DA 1R7OA 4HTYA 1XSJA 2JEPA 3AS3A 1GOMA 2OYKA 3SCTA 3WQVA 5GQBA 4JFTA 3WEOA 5A2BA 2DT1A 4E8DA 4JFWA 4B16A 1H3GA 3FAWA 1K9TA 3BAWA 2XWEA 4CN4A 3SUUA 4D72A 1W1YA 2UY4A 4AYSA 3GTNA 1RD6A 1BYDA 1V3IA 1FP9A 5FL0A 2XWDA 4UQDA 4OKDA 1NM9A 3VD7A 2VZTA 4Z2JA 1EQCA 1FA2A 2WK2A 3PBGA 1DWFM 3IANA 3OGVA 3TTSA 4GQQA 2DIEA 1D3CA 1MFVA 3L4WA 1UKOA 3AZTA 5C71A 4IM4A 4GKLA 3WNOA 5BXRA 3VGGA 1QI3A 2VVSA 3NSXA 4AEFA 4F66A 1CLXA 2V38A 1C8QA 2PWEA 4F9DA 4J3UA 5BRPA 1CGXA 2CCRA 2VOTA 4CU7A 3IJ7A 3CZLA 3WH7A 4WSJA 2XVLA 1HKMA 1Q6CA 1HNYA 1J11A 4YN5A 1BYAA 5BXPA 2ZUUA 1KFWA 4CUCA 3RM9A 3VGHA 3MUAA 2NT1A 3LMYA 4OJYA 3AMGA 2BY2A 3N13A 4F8XA 3SUTA 4CVUA 4KH2A 1GJWA 4MNKA 2WCGA 1E56A 3B9AA 4W7VA 4UZUA 5EFDA 3WEZA 1OSEA 3DYPA 1VEPA 2CESA 3WD4A 3WENA 2DSVA 3K4DA 2GJRA 4QLLA 5A3HA 1JDDA 1VEMA 3GH7A 1QHZA 3ZJ7A 4MAVA 5A2CA 1UWTA 3SUVA 4E4PA 4W86A 3B8SA 4J27A 2A3CA 2D1ZA 4P8XA 4AISA 1D2KA 4GO8A 4UOQA 4CCEA 2JF7A 1RP8A 2ZE0A 5CSUA 3WKZA 3EDEA 1XHGA 1H0IA 1KGXA 3L2MA 2ZUMA 4AD0A 2F61A 1TVPA 1V6WA 2XSAA 1NARA 3SCWA 5E09A 3E1F1 1R85A 1FH9A 1TR1A 2A3EA 4MPKA 1J18A 4H7VA 3ARSA 4JKKA 5TD4A 4D6JA 4WJXA 4MDPA 4AD3A 2E3ZA 4P8WA 3EMZA 1US3A 1VF8A 1EA9C 1XCXA 4UCFA 4XZWA 7A3HA 4RL3A 2W61A 1V3JA 2UWFA 5LA2A 5BROA 1IZKA 3AMDA 2D3LA 3CO4A 1K6AA 5HDRA 1R87A 4JKLA 4F9JA 3PZGA 3GDBA 1UWIA 3VUPA 2GFTA 4CD8A 1UZ1A 4AD5A 3WF3A 4AXNA 3OA5A 4PMNA 1H0GA 3DYMA 4C7GA 1KR1A 4AZ6A 3RO8A 4AZGA 4U2YA 1HVXA 3PZVA 1G94A 1MXGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AXI A;  4UFH A;  3I3E A;  1UKQ A;  1UKS A;  4OIF A;  3WL1 A;  1OT2 A;  1TCM A;  2D0F A;  4JL2 A;  3NUK A;  4TTU A;  4GI8 A;  1A47 A;  3AI0 A;  4CCC A;  1E0X A;  3I3D A;  1CXH A;  1FH8 A;  1CEO A;  2J25 A;  3AIC A;  1ZBK A;  3QGV A;  1IZJ A;  1P6W A;  3BGA A;  1Q4N X;  2PWF A;  1E4N A;  1V0M A;  3PZM A;  3VMO A;  5A6M A;  3AMK A;  3L4Z A;  4U2Z A;  2VZV A;  3SCR A;  1OBA A;  3BSG A;  1DED A;  1HJX A;  3OGR A;  2W5F A;  1C8Y A;  1ISW A;  5F7U A;  4CU8 A;  2OSW A;  2DSU A;  3SCU A;  2OSX A;  2J4G A;  4XX6 A;  2EPO A;  3VVG A;  1UH2 A;  2C8N A;  3BC9 A;  1VIW A;  2OYL A;  1NWS A;  4QP0 A;  4MTV A;  4UFI A;  3BLP X;  2WCS A;  2XGI A;  4AW7 A;  3SCV A;  1FHD A;  3O6A A;  1E72 M;  1UD5 A;  1O7A A;  1BPL B;  2J7G A;  1C90 A;  1WZM A;  4OZO A;  1NP2 A;  1GQJ A;  1W1V A;  3GBE A;  1E1E A;  3N04 A;  1NOW A;  4DWS C;  2EXO A;  4WK9 A;  3BAX A;  4AC1 X;  4EAM A;  2Z1S A;  2ZX6 A;  3IK2 A;  3EDJ A;  3UG4 A;  1ISV A;  2X8R A;  2RGM A;  3VIM A;  3A3H A;  2DIJ A;  1JZ7 A;  1E3Z A;  1LJY A;  5FIP A;  1ODU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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