3CUJA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase cex (cf xyn10a) in complex with sulfur substituted beta-1,4 xylopentaose.
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Exo-beta-1,4-glucanase
publication title Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides
rcsb
source organism Cellulomonas fimi
total genus 131
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2008-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cujA00
2X09A 3W53A 1KR1A 3A47A 5M3WA 2EEXA 3DC0A 3AHZA 5A6BD 1V3KA 5A6JA 1J0HA 1E5JA 3TOPA 3WQ8A 3VIFA 3L4TA 4E8DA 5KZ6A 3BSHA 5A95A 1B31A 1VIWA 2QMKA 3VIKA 1V0KA 4IPNB 1UR8A 4MADA 2ZXQA 2J47A 4HU0A 2ZUMA 2E9LA 1UA3A 2CBIA 1BHGA 2OYKA 2UY2A 1DWFM 3FAXA 2AOSA 4H2CA 1EXPA 3RIKA 2YA1A 2NW0A 3UCQA 2PF0A 1ZL1A 1PX4A 3ARXA 4L4OA 4QLLA 3ARPA 4PTMA 3WD0A 2CBJA 4U3CA 1XRVA 4M81A 2AAAA 2ZUVA 3NYDA 3AMDA 3VDAA 4YN5A 4MJ4A 3K8LA 1RD6A 2QMJA 4W8BA 4UFMA 3MSDA 1QI4A 2D1ZA 3BGAA 1C90A 4M8UA 4JL1A 4JFVA 1J0JA 1UKQA 3ARQA 1R86A 3KZSA 7CGTA 4W7UA 2BY0A 5I5RA 3WF2A 3WDJA 2FGLA 5EBAA 3WL0A 2VO5A 2DT2A 2J77A 1S46A 3ZOAA 1X6LA 1VFMA 3AS3A 3WDQA 4DWSC 4W5UA 3OLDA 4W85A 1FP9A 1BGAA 3DYPA 4U5KA 1H41A 3CMJA 5ABHA 4AZGA 2YDRA 3NCOA 4JHZA 1KCLA 3A6OA 4PMZA 3AROA 3IJ7A 2YL5A 3ARWA 3PZNA 4MB3A 3SURA 2CCRA 5FL0A 1TFVA 3IAPA 4BQ2A 5CSYA 5CLTA 1JL8A 1JI1A 3SUVA 2JALA 1GHRA 2WMIA 4A3HA 3PZGA 5I3DA 1E3ZA 4LXFA 4E4PA 4PMQA 4JCMA 4U2ZA 3QR3A 4H41A 2WK2A 1JAEA 1UD3A 4EAMA 4FK9A 1QNSA 1HX0A 2GFTA 3GYCA 2XWDA 3NJ3A 2E4TA 2OYLA 3VDBA 3VGDA 2DIEA 1US2A 1GZJA 1QNQA 1JNDA 3T2QA 4PEEA 2WXDM 3PBGA 4AW7A 2G41A 1UD2A 2X0HA 2OWCA 5BXSA 3TTOA 5D9NA 2W4XA 3L4WA 2IXVA 1MW0A 3VD5A 3VX0A 4B9ZA 3N1AA 1V02E 5BYWA 1HIZA 1ODUA 4PYSA 4C7GA 3AS2A 4PCTA 3WD1A 4DWSB 1O7AA 2W67A 3L4UA 4CD5A 1JG9A 1JXKA 2RGMA 1LWHA 1UA7A 1OINA 1PZ3A 4QAWA 4PMXA 1EO5A 3K4DA 1M7XA 4TVCA 1W9DM 1FOBA 1HNYA 1DWGM 1MFUA 4P7NA 2ZX7A 1EOKA 2WKGA 2D2OA 4HA3A 4CVUA 2D0HA 3WQ6A 2JFEX 4CUCA 1JAKA 1TE1A 1J0ZA 1CGWA 3VD3A 4PMVA 2Z1SA 3BAKA 4U31A 4V28A 3DHPA 2QF8A 2ZIDA 1TA3A 1UOKA 1E55A 1TMQA 4W86A 3AMGA 1EHAA 1P6WA 2G3JA 4K68A 3MV11 4CCCA 5CPTA 2XVGA 1FHDA 2WCAA 4WK9A 4Z2HA 3OGVA 1ZJBA 1TVPA 2ZWYA 1UD4A 1PAMA 1CWYA 3THDA 5F7UA 3GZAA 3OLEA 2TAAA 2VRJA 1CXKA 2BVTA 2E8ZA 5E6ZA 4D6IA 5CZKA 1BYBA 2VURA 3WMSA 3N11A 2BHUA 1FH9A 1OIMA 2V5DA 5A6KA 4AIOA 3WD2A 1KR0A 1V6XA 4H8VA 3RM9A 2VX6A 4UTFA 3ZIZA 2GJPA 2YL6A 3SEPA 3AIBA 2WPGA 3EYPA 3U5YA 1ITXA 1E6RA 3MSGA 1ZBVA 3WIJA 3ZT6A 1H1NA 1B3ZA 1CXFA 2XUCA 3O6AA 3WNKA 4PSPA 2DIJA 2JF6A 2OYMA 1E6QM 5E9AA 1QI2A 1M01A 4MDOA 4WKHA 3BMWA 3AYRA 3MUY1 1H4PA 3PZIA 1MXDA 3N9KA 4HA4A 1E0WA 2ZE0A 5A3HA 2XSBA 2YKKA 3CMGA 3WMBA 3U7VA 4TX8A 4PUDA 4CN1A 5HXMA 4JHOA 1UD6A 5C70A 2WYSA 4HOZA 3WNMA 2V3EA 2VT0A 2BVDA 3CUHA 1CENA 4HMDA 5A8NA 3CPUA 5LYRA 3UR7A 4KGLA 4AYSA 5A6AA 3WEOA 1E6ZA 3EMQA 2C8NA 4AZ7A 3W28A 4BQ3A 2D23A 3F4VA 4JIEA 3CZGA 4GIAA 2WVVA 3RPMA 3OGRA 1EH9A 1GOKA 2ZUSA 1MWOA 9CGTA 1GJWA 2Y5EA 4NRRA 1A3HA 3IAQA 4U3AA 2J7HA 3D5HA 4D6EA 1A47A 4UFKA 5A8OA 5BXRA 4LX4A 1UR2A 4RL3A 2CPUA 1H3GA 5CPQA 3AIQA 3WL1A 1JF6A 2FHBA 3VGGA 1JYXA 2W61A 1V3LA 4GI6A 3BAYA 3FAWA 2YLAA 3B9EA 2ZUUA 2OLHA 4XX6A 1U30A 3SCQA 3AI0A 4OIFA 1QVBA 4D71A 4N0RA 3VD9A 3EMCA 2VQTA 1LL7A 3LPFA 1XV8A 3M6DA 4J3TA 3WY1A 1MYRA 4HTYA 4LQ1A 3T0DA 3FHAA 3AIRA 4FMVA 3ZR5A 3VU2A 1JGIA 2CBVA 2YDQA 1ZBWA 3B9DA 3MUIA 2ZXAA 1WPCA 2WC4A 4MJ2A 4P7QA 1VENA 4CN4A 2PC8A 2FH6A 3CZJA 2WMKA 4KRUA 1Q6CA 2W5FA 3GBEA 3VPLA 4RE3A 1V3MA 2JE8A 5FKYA 3VNZA 1JZ5A 1BG9A 2CITA 1B30A 2V5CA 4GXPA 1QHOA 3VIHA 2W63A 1QBBA 1XHGA 2VUYA 3GNOA 1XYFA 5ABEA 3CIVA 2XGIA 3LMYA 1HKJA 2OSXA 1PIGA 1HKMA 1UWSA 1KQYA 1MW3A 1G5AA 1VJSA 4GPNA 2X8RA 3ZT5A 1ZBCA 1LLOA 2FDMA 2VVSA 1NH6A 1W3KA 3W82A 2WMIB 4UQAA 1QHZA 2BY3A 3K4AA 4PMNA 1V0LA 1GQJA 1W3LA 4J3SA 3ARYA 4AD0A 3RCNA 5D8ZA 1QI5A 1BTCA 4AZIA 4PMYA 3AFBA 1J12A 4QCFA 3OLGA 5HPCA 4W7WA 3SIMA 5E0CA 3W25A 4HZ8A 1NARA 5GPRA 1M04A 3VGEA 1E0XA 2E0PA 3T08A 4WSKA 3FW6A 2PWHA 3F5LA 1ZS2A 1H0IA 4RE4A 1DEDA 1JD7A 4M1RA 3BAXA 1KXHA 4S3KA 2WMFA 4TTGA 3BC9A 4XZWA 4KGJA 2DGAA 3IK2A 3ZSSA 3MANA 1NM9A 5I78A 1GOWA 1E6XM 1E6NA 5IFPA 3MS8A 4S3JA 1TCMA 3VM5A 1CXEA 1SFSA 2WM0A 5A2AA 1W2PA 2W92A 5KEZA 2J7BA 2VCAA 1HL9A 1JDAA 4OZOA 3VVGA 3WFLA 3THCA 5E70A 1W32A 1FH7A 3PTQA 2VC9A 4GQQA 4AZ6A 1ESWA 3WEMA 4FF5A 2VRKA 4W8LA 1HXJA 4WLCA 2V3FA 1TA3B 5BRQA 1GQKA 1C3FA 1JDCA 1GQIA 1BSIA 1X6NA 3ARTA 3UG3A 4F9JA 1JF5A 1CXLA 1GPFA 1V0NA 4P7LA 3GNRA 4CKQA 1SMAA 1LF1A 4QP0A 1E0VA 1TG7A 2MANA 3TTQA 1H5VA 3RM8A 2EPLX 4BCEA 3T0AA 3WQ5A 1BYAA 4PMRA 4H8HA 1EQPA 3WD3A 2NSXA 4KH2A 1TUXA 1V6UA 5C71A 2A3HA 2WZHA 4CCEA 2DH2A 1VBRA 4W8AA 3CUFA 2WMJA 1B3VA 5JUVA 1D2KA 4ZE5A 2ZOXA 5GQBA 1AMYA 1WZMA 2F8QA 3FN9A 3BXWA 4UCFA 2G3IA 1GOMA 3WEZA 1H2JA 1E70M 4R5EA 1KXVA 1W1PA 5D9MA 2WBKA 2WZEA 4X0VA 5CSUA 1KGUA 3WQWA 1UZ4A 1Z32X 2E9BA 3K8MA 2VX4A 2JIEA 1BVZA 2OSWA 2D0FA 2CERA 1WP6A 1V03A 3VO0A 3K1DA 3VM7A 3N12A 4V27A 4JZ5A 4EKJA 2BV9A 4DUWA 1QW8A 4AIEA 4J3UA 4UFJA 2XVLA 3RO8A 1UQYA 4M56A 1CBGA 3LPOA 1B90A 4P7OA 1HKIA 3U57A 1JIBA 4RE2A 5I79A 5I2UA 1QI3A 2JEPA 3N17A 2VR5A 1UUQA 4AXNA 4UQBA 4W88A 1H09A 2WVVB 5D4YA 1NWTA 3GH5A 4E8CA 2G4FA 5BROA 3W26A 1U33A 5DFAA 2XVPA 5FOOA 4UQCA 4CVWA 1XCXA 1VJZA 4H04A 2XJ7A 4B3KA 3WF4A 3WNNA 2YBTA 3WNPA 1UR4A 3VKKA 1GOQA 1KWKA 2VMFA 2BFGA 3AS0A 4UFIA 4MB5A 1MQPA 3KL0A 1EDTA 2A3BA 4JFTA 3QGVA 1OD8A 4F79A 1CXHA 1K6AA 1HJQA 1E56A 2CETA 1JYNA 1J10A 3W6LA 4HA1A 3QOMA 4P8WA 1JYVA 3KWXA 1UHVA 3WFZA 4EANA 2VTFA 1VEMA 1NQ6A 4BQ5A 1BLIA 2RGLA 1VEPA 4AY1A 3HMCA 4HZ6A 3QHMA 3MU7A 1CLXA 3HN3A 1N82A 1UWTA 1F4HA 1SR0A 3AHVA 2IXUA 2F2HA 3W37A 1W9PA 3BMVA 3OZOA 5HBFA 3KE0A 3AICA 2BS9A 3LPPA 1NP2A 4HZ7A 2FHCA 4JCLA 4CGTA 3TONA 1WE5A 1I1XA 3DHUA 2WHJA 3A4WA 5A1AA 3WENA 1XSJA 1JZ8A 5M17A 3OB8A 1KGXA 3CZ8A 3VIOA 3ZJKA 4D6JA 2XG9A 1LL4A 1KCKA 5AC4A 3BAIA 1DHKA 3FY1A 3OG2A 1CXIA 1GONA 1QNOA 3APGA 3WBEA 1CZ1A 5DO8A 3VD4A 2J7FA 3PTMA 1CDGA 4UNIA 4ZXOA 4D72A 4ZEPA 3W38A 3SCSA 3ZSTA 2W62A 2WB5A 3CH9A 4HP5A 3WDRA 2PWEA 1MQQA 4C7DA 3UG5A 1K9DA 1C7SA 1EO7A 1HJSA 4DUVA 2CESA 4P8XA 1MVYA 4ML4A 3MV01 2GJRA 2EPNA 1J9YA 2D20A 3QHOA 4GI8A 2O9PA 4BQ4A 1EHNA 2HVMA 3GM8A 1WNOA 1W1VA 2Y8VA 1CECA 3CTTA 2GK1A 3N18A 2VVNA 3WUGA 2D3NA 4FLQA 5EMYA 2B31A 4Z2JA 1UQZA 3SCTA 1AQ0A 2Y2WA 1KBBA 5DT5A 1NOUA 2VZUA 4TTUA 4M24A 1BYCA 3FNDA 2DDXA 1V6YA 2XFRA 3AHYA 3GNPA 5CQ1A 3PZ9A 1UWUA 2CIPA 3GH4A 2X2YA 5D8WA 1Q6FA 5A8PA 1MQRA 3NDYA 2IUZA 3F5KA 8CGTA 3CBWA 2CHOA 2XVKA 1HKKA 1R87A 3B9AA 1MW2A 3WH7A 3OIHA 2VJXA 3UEQA 1ISZA 3UERA 1B1YA 2D0GA 2DT3A 5ECUA 1YQ2A 4AEFA 5A8QA 5I0DA 3K46A 2WCSA 1TZ7A 3MMWA 1GW1A 1XD0A 2OWWA 1XH0A 1W1TA 1NWRA 4NRSA 4UR9A 1RH9A 2EXOA 3RJXA 2WANA 4HMEA 4GZJA 2DPEA 1BG4A 1VEOA 1RPKA 1WCGA 2NT1A 3L4YA 3VIIA 4UOZA 3N04A 1HF6A 1V3IA 2XFFA 3EDFA 2VQUA 2VI0A 3L2MA 4GO9A 1ODZA 5AY7A 5CXPA 3WDHA 1UKPA 4Q22A 1UH2A 1J01A 3AMCA 4WIWA 4JL2A 4AMCA 1HL8A 3A3HA 4D6HA 1DWIM 3VX1A 5EFDA 1WB0A 5IDIA 3SUTA 4C7FA 3PHAA 1JZ7A 5I6SA 3TTSA 1UH3A 3WH8A 3MO4A 3TA9A 4B3LA 5I77A 2E9MA 3RDKA 1CLVA 1V0MA 3AMKA 2ZUNA 2V38A 1JXJA 3U5UA 1CGTA 2V3GA 1JD9A 4UZSA 4P7RA 1LG2A 2CXGA 4GZEA 2WNWA 1WDQA 2XYLA 2ZUWA 3CHDA 2XIIA 2OSYA 1ISYA 1WDRA 3VUPA 2YIHA 4L4PA 1FP8A 1UG6A 2GDVA 1UZ1A 5BXPA 1W2VA 2VZOA 2YL9A 1BPLB 1ZB5A 4W87A 3SCVA 3OZPA 3HU7A 4MB1A 2DSZA 2GJXA 1HJVA 4ACYA 4AWEA 5A69A 4NF7A 2HISA 1HP5A 4PMDA 1KQZA 1TVNA 4IUGA 1NWSA 1I75A 3W4RA 3DYMA 1XGZA 5A6SA 3T2OA 4BF7A 1SYTA 5GNYA 2E8YA 4MAZA 5JIWA 4AIUA 2VX7A 4B9YA 2D22A 1PZ2A 3SUSA 3GTNA 2YA0A 3AIEA 3UESA 3WMCA 4OBSA 4UQDA 3I3DA 1E4IA 3CLWA 4PN2A 4AD5A 3K8KA 3WQVA 2JEQA 1DWJM 2W91A 4AD4A 4ZFMA 3AIVA 5FCZA 3VD7A 3T0BA 4PTVA 4MNKA 4QFUA 4W89A 5BWFA 1HJXA 1OWQA 1X1NA 1AQMA 5CLWA 5DMYA 1UR1A 4ATLA 1JYWA 1YHTA 3WDPP 1OM0A 4X0NA 1OGGA 5EFFA 3W0KA 3WQ4A 2VX5A 2WHMA 3O2LA 3VIMA 1W91A 3VOCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2X09 A;  3W53 A;  1KR1 A;  3A47 A;  5M3W A;  2EEX A;  3DC0 A;  3AHZ A;  5A6B D;  1V3K A;  5A6J A;  1J0H A;  1E5J A;  3TOP A;  3WQ8 A;  3VIF A;  3L4T A;  4E8D A;  5KZ6 A;  3BSH A;  5A95 A;  1B31 A;  1VIW A;  2QMK A;  3VIK A;  1V0K A;  4IPN B;  1UR8 A;  4MAD A;  2ZXQ A;  2J47 A;  4HU0 A;  2ZUM A;  2E9L A;  1UA3 A;  2CBI A;  1BHG A;  2OYK A;  2UY2 A;  1DWF M;  3FAX A;  2AOS A;  4H2C A;  1EXP A;  3RIK A;  2YA1 A;  2NW0 A;  3UCQ A;  2PF0 A;  1ZL1 A;  1PX4 A;  3ARX A;  4L4O A;  4QLL A;  3ARP A;  4PTM A;  3WD0 A;  2CBJ A;  4U3C A;  1XRV A;  4M81 A;  2AAA A;  2ZUV A;  3NYD A;  3AMD A;  3VDA A;  4YN5 A;  4MJ4 A;  3K8L A;  1RD6 A;  2QMJ A;  4W8B A;  4UFM A;  3MSD A;  1QI4 A;  2D1Z A;  3BGA A;  1C90 A;  4M8U A;  4JL1 A;  4JFV A;  1J0J A;  1UKQ A;  3ARQ A;  1R86 A;  3KZS A;  7CGT A;  4W7U A;  2BY0 A;  5I5R A;  3WF2 A;  3WDJ A;  2FGL A;  5EBA A;  3WL0 A;  2VO5 A;  2DT2 A;  2J77 A;  1S46 A;  3ZOA A;  1X6L A;  1VFM A;  3AS3 A;  3WDQ A;  4DWS C;  4W5U A;  3OLD A;  4W85 A;  1FP9 A;  1BGA A;  3DYP A;  4U5K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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