3W1NA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-iodoorotate
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-iodoorotate
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus 108
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1nA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1nA01
4QISA 3LHUA 3QJAA 4UMCA 4XBSA 3HPZA 4X9SA 3E02A 4GBUA 3G8RA 5AHFA 4FXRA 1AW2A 1VYPX 5CPOA 1A5SA 4UFJA 4IWWA 2VFHA 1XBXA 2TSYA 3NEVA 2YXGA 3NM3A 4DPPA 5D02A 4O18A 1UUOA 3C2VA 3HB9A 3NYZA 4TMCA 3M5XA 4MIMA 3SSJA 1LBLA 3R5EA 1YTEA 3O63A 3LBCA 3TFXA 1TYGA 4HIBA 4DBEA 2YDAA 3UZ5A 3DKJA 2YPIA 1VJIA 4O1AA 4NU7A 5F1UA 3G1SA 3DFQA 4YCOA 4OHQA 3OEXA 1VS1A 3IIVA 4M5PA 2RKXA 4DF0A 1A5AA 2JKEA 3FFSA 3QW3A 1WX0A 4WJEA 3DFTA 1T99A 3H55A 4HNTA 4H3DA 1LROA 4K36A 1G67A 1LRTA 4FX7A 3RU6A 3N73A 3Q2DA 1G4PA 5CSSA 4IPJA 4UR8A 3W71A 3W23A 1BEUA 3SI9A 2G95A 3G22A 1TIMA 2A7RA 2RDUA 1PE1A 4FEZA 2ZRZA 1WV2A 1FXPA 4JTFA 3WK0A 3I7QA 2OCZA 4NZFA 1OYBA 1Y0EA 4K6AA 1LOSA 3W2MA 1XM3A 2GVJA 3HQ1A 3UPBA 4A21A 5C55A 3TMQA 3NR0A 4YL2A 3ATZA 4M7TA 3W74A 1HTIA 2RDWA 1O5KA 1RQBA 2YYUA 2JGYA 1LCOA 3L5AA 1ICSA 1S5TA 3PB2A 3GLCA 3NPXA 4DO4A 1GG0A 1K03A 4NNCA 2CLEA 3UD6A 4RXGA 4JY9A 4Z08A 4IGHA 1OJXA 3HGOA 2JKPA 5HWJA 4ADUA 2E5CA 3TSMA 1UBSA 3O6CA 3BLEA 3BLFA 3L5MA 3EKLA 1ZHAA 2OT1A 3TUUA 4TIMA 1SZFA 2Y7EA 2ISSA 4RZ4A 2ZRYA 2YYTA 5AHNA 5CSRA 3S5NA 3G3DA 3N14A 4TX9A 2V30A 4WY0B 5DCEA 3GR8A 4Q4KA 4CCCA 3LI0A 1WYIA 3QFEA 2YZRA 3PBYA 1I2PA 2O7QA 3TC7A 1H1ZA 2QAPA 2Z6JA 1F76A 1IF2A 2WOQA 4NJHA 3I68A 1L6SA 4JNMA 4WX2A 1KW1A 3VE7A 2BTMA 1LOLA 3TXZA 3U6WA 1SFJA 3N3MA 2LLEA 5CG7A 1FDZA 1Z44A 3W7JA 4NJJA 3CIXA 1DQWA 1SW3A 2ATSA 2R14A 4MJMA 3W83A 3UY8A 5I3JA 4QM1A 5D2VA 2GUUA 3SY5A 1ALDA 1H51A 3TJXA 1C8VA 2CLIA 3O05A 4GNJA 3HG4A 4AEOA 3BVJA 4RKAA 3USBA 1U83A 4OV4A 1XBZA 2TPSA 3W2JA 3CEUA 3NO5A 2YFOA 2P10A 4ORMA 5HULA 1KM0A 4FNRA 4HNNA 1ZJIA 3ZR4A 1YDVA 3WJXA 2Z2UA 1LM1A 2WNNA 1OFPA 1B4KA 4GXMA 5AYXA 1K7XA 4JDYA 2E5DA 4AF0B 3W1LA 5CZTA 5J5RA 2B7NA 4Z1AA 4RR4A 4Y96A 1ZAIA 3MI3A 3M44A 1TPUA 4UFLA 2Z1BA 2A4AA 4QIUA 1R2TA 1X7FA 2OZ0A 1M7PA 2DP3A 2Y85A 5FF3A 4QSHA 1XCFA 3ABRA 1DJNA 4E2BA 2DZTA 5KTLA 4N6EA 3EWYA 3P8IA 3M47A 1ZENA 3VNDA 3KHJA 5F2MA 1B57A 1GJPA 2RFGA 3D0CA 3UYCA 1XBVA 3FS2A 1A5CA 1RPXA 1JCJA 3TCEA 3HBLA 2V8ZA 1O95A 3DENA 5KSWA 3O15A 1X1OA 1ME9A 2QKFA 1Z41A 3TC6A 2C16A 5D09A 1FWNA 2FLIA 3HOJA 2IQTA 3EX6A 4BK9A 2TYSA 2X2GA 1DL3A 1TV5A 3MYPA 3FA5A 1MXSA 1LORA 3B4UA 3W1MA 3IRDA 4N9BA 2B4GA 3SW6A 3L66A 3C52A 2J9ZA 3VE9A 1GWJA 1GTEA 2Y61A 4LT9A 2ZTJA 1MEHA 3FYOA 5EYWA 3WJSA 1ADOA 1WDWA 1FY6A 2QJGA 1IXOA 2E6YA 3TXVA 1I4NA 2VEKA 4OBTA 1T96A 1XUZA 3O1NA 2J6XA 5LNWA 4UTIA 3W7CA 1Z42A 3BPWA 2GQ9A 4Q33A 1SZGA 1VQTA 4CNOA 5F2GA 3TFCA 1ICPA 2OT0A 1VZWA 4GE8A 4JEQA 1F05A 4A29A 3PUOA 3ZS4A 2ZZ2A 1EA0A 4JDBA 5BMWA 1LYXA 2NZLA 5HJLA 1YTKA 4XBKA 3SIZA 1TO3A 5FI8A 4IQLA 1O5XA 1PCKA 3HMJG 3T40A 3FLUA 2C14A 3DAQA 3LERA 2QAFA 3LRKA 4FF7A 4JTGA 3P84A 4TU1A 2VFDA 1QPOA 3O07A 3ABSA 1PL9A 3S5OA 1OG0A 1I45A 1F73A 2QCHA 4K39A 4JIQA 3NPUA 3SECA 4MZ1A 2X1RA 3S0CA 1M7OA 1H60A 2CWNA 2QJIA 3NPVA 2VEMA 2EKCA 2YGYA 1THFD 3PBWA 3ZFHA 2QUTA 4ADTA 1SQ7A 3MHGA 3STFA 1J2WA 5FF0A 2QCFA 3SZ8A 3TSBA 3QQ1A 1W56A 4MKNA 1OVDA 3UWUA 1KM5A 1TPEA 3DXIA 3CQ0A 1DVJA 3TSDA 2H6RA 2ZFAA 2AGKA 3A21A 5EA9A 3T44A 1AL7A 3IIOA 5HR6A 5HINA 1RVGA 1DV7A 1XC4A 3EX4A 2DZVA 3LTPA 2D73A 1W3IA 1D9EA 5I3HA 3C61A 5CZ0A 1XI3A 5HMSA 4UFHA 2H90A 2QCGA 1TMHA 2QCEA 1OFAA 3C6CA 4LTSA 3MO7A 3R13A 4RXFA 1PHQA 3PR2A 3MP3A 2WSYA 3IV3A 3PBVA 3KVJA 5FEPA 5I3KA 2CZDA 1F6PA 3M16A 2VC6A 4UR7A 3CLMA 3MBFA 4X22A 2FJKA 4UUIA 1W5PA 4I7VA 3W1UA 1KFEA 4QITA 3UWQA 1HL2A 4O19A 3IVUA 2NUYA 5CZJA 3YPIA 5U4NA 1PCWA 3A9IA 4JTUA 1KM3A 3G3MA 5F4WA 1ZY9A 4NJGA 5F2IA 1A53A 1V7YA 5AC8A 2ATMA 3I65A 1QWGA 3QPZA 1K7FA 2A6NA 3TK7A 5K9CA 2PCQA 1FWWA 2BWGA 4HN4A 2CZFA 2J9XA 3ABOA 5I3FA 4ML9A 5AB3A 2VEIA 2X16A 1EX5A 3QEZA 4M19A 1JRCA 3P80A 3PULA 4WXYA 5K3VA 3F03K 2BX7A 1O60A 4FX8A 3W85A 1O94A 4PH6A 1UB3A 1AK5A 4BI7A 3CPRA 3MP5A 3W7OA 4XWUA 2YCEA 1K8XA 3QSTA 4JTKA 3AJXA 3ATYA 3CM4A 4IMDA 3EXRA 1OFOA 3M5VA 5G2WA 3GB6A 4XTIA 4C1LA 4DELA 2W79A 1B9BA 3MYOA 3L9CA 4L4MA 4Y6GA 4JTJA 3LCIA 1YLVA 2E6DA 1EPXA 1JJKA 1BTMA 4CQ8A 2YFNA 1T0OA 5AHLA 5HNRA 5BOOA 2C19A 4DO5A 3NQ2A 4UTLA 3DI1A 2V0TA 1IXNA 1QMLA 1SW0A 1TV7A 1GVFA 4EF8A 3W1PA 2ZBTA 4O0ZA 1W54A 3BO9A 3E96A 1ZALA 5F1VA 2Z6IA 4IXHA 4IUOA 5LGXA 4K8HA 3QRHA 3TU9A 3GDRA 3DI0A 2F84A 4IJBA 3GXPA 1XL9A 1OABA 1KV8A 4IMCA 3KRUA 4ZQCA 4MOZA 1G6CA 3S6DA 3M1ZA 4AB4A 4FNUA 2E5BA 3NQAA 1G7UA 3C0JA 3LHVA 3MBDA 3LXCA 4NUWA 1GVRA 4PA8A 1R46A 5G1TA 3N9RA 1GVQA 2CZ5A 2QCCA 1JUKA 1LLWA 4JYEA 3MHUA 3W2NA 2A7PA 5A5WA 3GK0A 3GDLA 1ONRA 1XXXA 2WPBA 1DQXA 1N7KA 1GYLA 3I7RA 4OGZA 2NWSA 1KTBA 1TQJA 3TIMA 1KFBA 5LKYA 2OJPA 2NWRA 2G96A 1A5BA 3LBMA 1W3TA 3NAVA 3W7LA 1GPWA 1NSJA 3GKFA 3IIPA 3TX9A 3LLFA 3BGJA 4JICA 5C2XA 3LTSA 4FNPA 5C54A 1H7RA 4MYAA 3VKJA 2I9EA 5FESA 1W0MA 1FBAA 4TMBA 5AYYA 3NM1A 2V2HA 4NQ1A 4MLRA 1LBFA 4FIRA 4GUIA 1W5OA 4OU1A 4U28A 3JS3A 1KFLA 5DY3A 3LCXA 4RZ6A 3DFOA 4RLIA 2ZZ5A 1N55A 2HSAA 3MUXA 4IMGA 5FF7A 5K9XA 2H3DA 4N4PA 3GNDA 1MO0A 1TTJA 3DHDA 3NL6A 3WK2A 6TIMA 1QPNA 1W8SA 2PRMA 5IBXA 5G4EA 4UNKA 1H7OA 4I9AA 3W7HA 3DH7A 2V2DA 4E0CA 5L6UA 2AAMA 2KZHA 1PHWA 1TPH1 1VLIA 1VPXA 3LB0A 3IGUA 4M6PA 1NFBA 3W3OA 2GQAA 3TROA 4O8RA 1ICQA 2A2IA 3BV4A 2V82A 3TE9A 1GVOA 4I7WA 1FCVA 4J9JA 1TPB1 5FEZA 3V1PA 2QDHA 5LNUA 4DEFA 4UFIA 3BG9A 1W5QA 2RDTA 2P0OA 4PTNA 4ALDA 1HO1A 3ZWSA 5D05A 1Q6OA 2Y7GA 3WJZA 3M5YA 3PWAA 4QNWA 4TO8A 1R2RA 3N2MA 3TJLA 3SR7A 4KWWA 2JKAA 4AWSA 3G1FA 4O4VA 4JTEA 1XFBA 1GOXA 4LS0A 1H7NA 3OVPA 3W76A 1OFEA 2GOUA 2ZRUA 3E49A 3W2LA 4ADSA 3IVSA 1FCBA 3L68A 1F7BA 3DZ1A 3G1HA 4JY8A 4XUGA 2C3ZA 2VKZG 1FCUA 4O1BA 4XKYA 3LXAA 2QJHA 4GJ1A 1D3GA 1FUYA 1TREA 3CIWA 1DHPA 1AW1A 2DZPA 4LVDA 3TV8A 2ZZ6A 2C0AA 5HQEA 3OVQA 3LHZA 4KFNA 3EKZA 1H7WA 4LRSA 3GAYA 3M41A 4EIVA 2G5WA 3W7QA 1O4UA 4LWWA 3G24A 1TTQA 3SFKA 1TPDA 2ABAA 4JTLA 1XKYA 1VR6A 3TMLA 4LVFA 3G1DA 2ZRWA 1VCVA 3HO8A 3OVRA 2CFFA 5K2ZA 2FPTA 4GUGA 1JULA 4NJKA 1JVNA 3FJLA 1KFKA 1IGSA 3CC1A 1OX5A 3P74A 2WNZA 1CW2A 3QPYA 4O50A 2VELA 3ZWTA 1AL8A 1FCQA 4WUIA 1S5VA 1SO6A 2B7QA 1I2OA 3UWVA 3L0GA 1SSGA 4O10A 4BR1A 1R47A 4S1FA 1EWDA 2A21A 2XN0A 3L65A 3NQMA 1TJRA 3ELFA 4GUJA 4S2CA 3PUEA 3DFPA 4JXCA 5IBXC 3S1WA 1TJPA 4NXSA 5I3GA 3BW4A 4AVFA 1S5WA 4FNSA 4NT0A 5AYZA 3P61A 2DZUA 3LCFA 1JCMP 3EWZA 3N34A 2NUWA 1H61A 1QO5A 1K7EA 3S1UA 4JTIA 3MHFA 5E93A 3NDOA 1QO2A 1DBTA 4MJZA 3B05A 2JK2A 5C6MA 1KTNA 4R53A 5FF2A 5C5YA 5BMXA 3LCWA 4ICNA 2ZZ4A 4MFDA 2FDSA 4ZVJA 2FB2A 4HNUA 1ME7A 1JQXA 3M6YA 5FEXA 4ZZ9A 1RR2A 1V5XA 1KM1A 2B7OA 2VFIA 3UXAA 4O14A 4UTWA 4O1CA 1FDJA 1OF8A 3JRKA 5MHBA 4N4QA 4RV8A 4BI5A 3FKRA 2XFWA 4E2DA 4LUIA 2VFEA 3QMSA 1H1YA 1X8FA 3TNOA 3VCRA 5EPDA 5KITA 2GVGA 3ABQA 1W5NA 1Q45A 5LSMA 3BG5A 3RNDA 1JCYA 5D33A 3KFTA 2EGZA 5DXYA 3PAJA 5D32A 5LNRA 4MYXA 4PEKA 4UTTA 1R30A 4WZHA 1NVMA 4MLJA 1OX6A 1FWTA 1F74A 3RLUA 1OF6A 5D2TA 2XN1A 3TA6A 3NVTA 4EWND 1M5WA 2GQ8A 5BNKA 3BARA 4AHQA 3B06A 4FHAA 1PV8A 1UCWA 4O13A 4BWLA 2FPYA 2ZRVA 2ABBA 4ZQNA 4DF2A 5IM51 3H54A 1HO4A 1S3HA 4LS1A 3MJYA 2I1OA 3W22A 1X1ZA 1KM2A 1FWSA 2A5HA 3GX9A 4M6QA 3TQ0A 3HG3A 3WK3A 1BKSA 3SGZA 1DJQA 3S9YA 2QCDA 1JUEA 4GRSA 3N9SA 3P5YA 1BWLA 2C6QA 4UTJA 3PY2A 3NQ7A 2VENA 4MPQA 3B04A 3EWBX 1DORA 5FEWA 4IMFA 3T4CA 3NQGA 4NJIA 1DOSA 2Z0IA 3IIZA 3PSVA 3VI2A 4WQ6A 3KXQA 5HWNA 1H62A 1U5JA 3O6DA 4LV4A 5CPMA 1SO5A 2UV8G 3PM6A 3W7NA 4YCPA 6ALDA 5H91A 3TAKA 3SJ3A 5HUPA 3OBKA 1E51A 5DBTA 3M9YA 1SO3A 1BWKA 3LHWA 1KBJA 1SZNA 5HUOA 1YADA 4O4WA 1YXYA 4JN6A 3L5LA 3GAKA 2V9DA 1Q3NA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 1GVS A;  3BG3 A;  3PB0 A;  1FXQ A;  3RLV A;  4MY1 A;  3W7I A;  4K7V A;  2PE4 A;  3A5V A;  3FYP A;  3KOF A;  4YLW A;  3INP A;  3PVF A;  3CT7 A;  4UTK A;  3KVL A;  2RHG A;  4MZY A;  3RK8 A;  3W1N A;  2DJX A;  1I2N A;  3BW3 A;  3EXS A;  1RZM A;  1YTD A;  1YXC A;  3S1V A;  4FNT A;  1D3H A;  3C8F A;  3KVK A;  3W84 A;  3HIJ A;  1P0N A;  3DKL A;  4FX6 M;  4K7Y A;  2GVL A;  3IVT A;  3C3N A;  4O57 A;  2GJN A;  1YDO A;  2NXI A;  4W9T A;  3V75 A;  4D2J A;  1MEW A;  4JGD A;  3W73 A;  3HG2 A;  3DGR A;  1IIH A;  1VHN A;  3W7E A;  3LXB A;  1WQ5 A;  5HWM A;  4UTU A;  4A22 A;  2ZZ3 A;  4DPQ A;  2CW6 A;  2Y89 A;  3GNN A;  1KFC A;  1TCD A;  3OA3 A;  1K02 A;  5CGQ A;  3E9A A;  3HG5 A;  1LLZ A;  4JTS A;  4NX5 A;  4Z0S A;  1UAS A;  2C15 A;  4N9E A;  1EP1 A;  3GDT A;  4JS3 A;  3G1A A;  3T78 A;  4UFK A;  4WOZ A;  5LZL A;  1GTH A;  2PC4 A;  2NUX A;  4PFM A;  3Q94 A;  3OIX A;  5L9F A;  3WFA A;  5E1Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GGB A;  4S3J A;  4D6F A;  5CPQ A;  1A0D A;  4QIS A;  1MW0 A;  4GBU A;  2YL6 A;  1IT0 A;  3PNU A;  3QHO A;  1W3J A;  3PPH A;  1AW2 A;  3QHM A;  3TTS A;  4NYY A;  4IWW A;  4DZ5 A;  2VFH A;  1MQP A;  3AQU A;  3PTD A;  3B9A A;  3C2V A;  3SQM A;  3N4A A;  1PIG A;  3BCD A;  3M5X A;  1LBL A;  1YTE A;  3O63 A;  3LBC A;  3TFX A;  4H2C A;  4IL2 A;  2WM1 A;  1CGX A;  7ENL A;  2OLA A;  3DFQ A;  4YCO A;  4KF1 A;  3IIV A;  3ZM8 A;  1V93 A;  1CXH A;  4DF0 A;  4HZ8 A;  2VM8 A;  2IXU A;  4HNT A;  1G67 A;  3Q2D A;  3ITC A;  1G4P A;  5T9B G;  3WF4 A;  1EC7 A;  5IHR A;  4UR8 A;  2G95 A;  1HXJ A;  1KXV A;  2RDU A;  4PTD A;  4FEZ A;  2ZRZ A;  1Y0E A;  1HX0 A;  1LOS A;  1OT1 A;  4A21 A;  4B5V A;  3KM8 A;  3QBU A;  3NR0 A;  1LL6 A;  1JZ7 A;  2ZXB A;  2RDW A;  3CH9 A;  2GGJ A;  4D8L A;  3URA A;  4YVP A;  3ZYZ A;  3AUJ A;  1K03 A;  1U1J A;  4RXG A;  1AD4 A;  4IGH A;  3HGO A;  2CKR A;  2G3J A;  5HWJ A;  1VAH A;  4C6C A;  2E5C A;  3TSM A;  4HMC A;  1R5Y A;  4AXN A;  3L5M A;  1ZHA A;  2HK1 A;  3VMN A;  2ZRY A;  3JZU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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