3ANY | Genus

Total Genus 192

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	192
sequence length	453
structure length	453
Chain Sequence	MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	How coenzyme B12-dependent ethanolamine ammonia-lyase deals with both enantiomers of 2-amino-1-propanol as substrates: structure-based rationalization. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
molecule tags	Lyase
source organism	Escherichia coli
total genus	192
structure length	453
sequence length	453
chains with identical sequence	C
ec nomenclature	ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date	2010-09-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF06751	EutB	Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.220.70	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Annexin V; domain 1	lyase	3anyA02
2.30.170.30	Mainly Beta	Roll	Ribosomal Protein L24e; Chain: T;	ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like	3anyA01
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3anyA03

5FEXA 3NAVA 1G7UA 3N3MA 4H3DA 3L0GA 4WXZA 1DJNA 3G3MA 4UUIA 3P60A 4A3UA 3R2GA 1B9BA 3HGOA 1FXQA 3HG4A 3W1MA 1TPVA 3QH2A 1K7XA 1LLZA 1YTDA 5BRBA 1J5TA 3DAQA 3GK0A 3HF3A 5A8GA 2QJHA 1LZOA 3GNDA 4LC8A 3N19B 2ZZ3A 5DXXA 4JIQA 1C8VA 3IRDA 3BGJA 4O1DA 2TYSA 1MZHA 4Z1AA 2OT0A 2YW4A 4MJMA 4O13A 3A23A 1OX4A 3G1VA 1W3TA 4JY8A 3DU0A 3M6YA 5HMSA 4JEQA 3M9YA 1SO6A 1IXOA 5D02A 3EX6A 3MHFA 2TSYA 2WKJA 2Z1BA 4JYDA 1BWKA 2Y7DA 2RKXA 3W86A 1PVNA 1WV2A 4M6QA 2VEKA 3GDLA 4I9AA 3RLUA 1VCVA 2G5WA 3O1NA 4M6VA 3IIPA 4Q33A 2NXIA 1GVFA 3G1FA 3PUEA 5EL1A 3U6WA 4IUOA 3FYPA 1R46A 1KFBA 1LOLA 1W1ZA 5D30A 1TPUA 3P5YA 4GNJA 4OT7A 4R33A 3SY5A 1VPXA 3TU9A 1GTEA 4LVGA 2V82A 3O07A 5DY2A 4CQAA 1OHLA 4RZ6A 1W3IA 4KFOA 1G4EA 3DFPA 4ZQRA 4LVDA 5CSSA 2QCNA 5E1QA 3OEXA 4PL2A 2WO5A 4QQ3A 4QISA 5G1TA 5F4WA 5G2HA 3QC3A 3PBVA 2B4GA 3ATYA 3G1DA 1CW2A 3NL3A 2H8ZA 3LRKA 4O57A 5BNKA 1DVJA 4FIRA 2QCFA 4CQ9A 1X7FA 4M7TA 5I3HA 1GVOA 1GJPA 2WSRA 4WY0A 3BV4A 4UFLA 1ME7A 2VENA 5FI8A 3RU6A 1KM1A 1Y0EA 3E96A 4MJZA 5TQLA 3P74A 5U4NA 2DU2A 3BLIA 3STFA 2GJNA 5FF2A 2A7NA 5C6MA 1GT8A 4DPQA 4AH7A 3NL2A 1IGSA 3EWYA 1TTQA 2GQ8A 3T40A 2ZZ6A 3H55A 4MZ1A 3W7RA 2A85A 4O54A 4ZQNA 3W1TA 1GQNA 1M7OA 1L9WA 4UFIA 3UPBA 2RDTA 4HSNA 1LDCA 5DBUA 2BXVA 1S5WA 1UUOA 3GDTA 2ZRUA 3HPZA 4E0CA 3KRZA 3NG3A 1KBJA 5DCDA 4BFAA 2A5HA 3R8RA 1L6YA 1BEUA 4O1BA 2ZZ4A 2C3ZA 1VS1A 2GQ9A 3HBLA 3TJLA 3LXBA 1TJPA 4M7SA 1KM2A 3HJZA 1OFEA 4UCGA 2RHGA 1FUYA 3PBUA 1RQEA 5D37A 1WXJA 3GDKA 1AMKA 2ZA2A 4LOCA 3C2EA 3EWUA 2Y62A 3LRMA 1XBYA 4O50A 3R12A 1ZAIA 2GQAA 3UWVA 4E2DA 3V75A 3W1RA 3S1VA 3EWBX 3CLMA 4I7UA 2DZWA 5F4SA 2WPBA 5AB3A 3M1ZA 1FY6A 3NQ8A 1GG1A 4X22A 3O6CA 3C52A 4BI7A 4MLJA 2Z6JA 1OG0A 1KM6A 1NSJA 2WNZA 4JX4A 3C61A 2WNQA 2ZZ7A 3PR2A 4GXMA 2FPYA 4RKAA 2OX1A 4MFEA 4NNBA 3THAA 3DENA 3NQ2A 4FF7A 4AXKA 4ZQOA 3LCHA 2NLIA 2V5LA 3IEBA 1AL7A 4UFKA 2J88A 4EF9A 4UTJA 4DBEA 4BI5A 1C9DA 1XCFA 1P4CA 3O16A 3NXFA 3ANYA 1Q6RA 4OHQA 1H1ZA 4UMBA 2UV8G 4P2VA 3CEUA 1SZNA 1RPXA 2QCGA 1X8FA 4WOZA 1RZMA 3W2UA 4IMGA 3C2RA 4UMCA 3UWUA 1DV7A 4O0KA 1M6JA 3PC0A 2Y63A 3WK3A 3TMQA 1FWWA 4MFDA 4Q4KA 1VR6A 4CLMA 3P67A 4IGHA 4JTEA 5G2IA 1ZENA 4R7JA 3W7PA 3QYQA 3NO5A 2H3BA 3IVTA 3W75A 1JCXA 3MHGA 4DBDA 2C19A 4L4LA 4AF0A 3C3NA 1JCLA 1T0OA 2JKEA 4S2BA 4HNTA 2E6DA 5CPMA 5CKSA 1YXYA 4MZ8A 1OK4A 3BO9A 2ZTKA 7TIMA 4FIQA 4X2RA 4MVAA 4HSOA 4JDBA 4MYXA 1O95A 2EGZA 1R47A 1KTBA 4OV9A 3S8HA 4OBTA 3QSRA 2ZBTA 3CQ0A 5E0KA 4GUFA 2X30A 1XL9A 1VRDA 5BW6A 5FF0A 1LORA 2CLFA 1EUAA 3N14A 4UTLA 1KFCA 5DN1A 4CNPA 2HSAA 2WSYA 3DKJA 4UFMA 3GDMA 3GXNA 4CCCA 3RF9A 2YDAA 5AHNA 3NZRA 1FDYA 3JRKA 3P82A 3HG5A 2NV1A 3B03A 4POCA 3S5YA 2ZCGA 4LRSA 1PS9A 3FYOA 1GTHA 3Q37A 1H61A 2JKAA 5EY5A 4K8HA 4HKPA 2KZHA 4NT0A 1GPWA 3HG3A 4PC8A 3SIZA 1KV5A 5AN7A 3P81A 1OFBA 1X1ZA 3N9SA 4ADSA 1OX5A 1EPXA 3TAOA 5K7JA 4HN4A 4ICNA 1JCYA 3HGRA 1GVSA 4UFHA 4UTUA 2G97A 2CLHA 1K7EA 4LY8A 2EAWA 3P8JA 1VYSX 4WD0A 3NQVA 2ZRZA 1QPQA 2E1DA 3NGJA 5I3JA 3TR2A 2J9XA 3MUXA 1I2OA 5HR7A 3IIXA 2H90A 4IJBA 5K3VA 4JNMA 3W88A 1F7BA 1ICQA 1T8XA 3KVLA 4Z0SA 3V1PA 2LLEA 4XTDA 3WK1A 2QCCA 4FNTA 2HS6A 4JR5A 5T26A 3E12A 1OX4B 1DQWA 1QOPA 1MEIA 1FCBA 5AFDA 2JKPA 4NQ1A 5AYZA 1KFEA 3GDRA 3LI0A 1T99A 4S1FA 5ABTA 2Z6IA 1U83A 2BTMA 1VC4A 3WJYA 2YCEA 4NJIA 4QITA 2QUTA 4FHAA 3OVPA 4LW7A 3G0XA 3GIYA 3HO8A 4TU1A 4MKNA 1OABA 2DJLA 3CT7A 4GRSA 4GUJA 2TPSA 4HT3A 3NQDA 1J2WA 3LX9A 4IWWA 2QAFA 5F2MA 2PURA 1QWGA 2E09A 3G24A 1LRQA 1YPFA 2V30A 3T55A 1QO2A 1Z48A 4O1CA 2Q8LA 3CHVA 3I6RA 4QIUA 1VZWA 2VFIA 4Y6GA 1PIIA 1U5JA 3C56A 3BG5A 1DL3A 1JR1A 2FB3A 1DJQA 3WK0A 1K02A 5D2WA 1LP6A 3ABRA 3I7SA 3IVSA 1VLWA 4LUJA 3FJ6A 3OIXA 3TC7A 3CWNA 3MMTA 2G96A 3L66A 2W79A 3TW6A 4N4PA 3S1UA 1LRTA 1YTEA 3ZWSA 3QRHA 5L6UA 5K9CA 3I7QA 1HL2A 4ADUA 1AW1A 2J27A 1SO5A 5A5WA 4TMCA 2C14A 4NX0A 1W8SA 3IGXA 1A53A 3QMTA 3RK8A 1KW1A 2E77A 4LC6A 3NQ6A 5FEWA 3STGA 1I8JA 4GJ1A 3FOKA 3M5VA 2GVJA 5F4XA 3HMJG 2A6NA 4XTIA 2CLLA 3A9IA 4LV9A 4J9JA 3Q94A 4WY0B 1XM3A 1XFBA 3NL6A 4AEOA 3BW2A 1JCMP 2YSWA 3O15A 3UY8A 2C18A 1LCOA 3TXVA 4FX6M 4R53A 2RDUA 3M5YA 4YWIA 3NPXA 3GXTA 3LBMA 2H6RA 3QQ1A 3JR2A 3DFSA 1G4TA 3ZWTA 3G3DA 3PSWA 1B4EA 3W85A 3KOFA 1L6WA 4O4VA 1JUEA 3KVKA 3QPZA 1YDOA 4DEFA 4RZ5A 3W7OA 4LVBA 3LHUA 3NQMA 1YDVA 4D2JA 4RJEA 3TV8A 3EX3A 3E0IA 5D2YA 1MEWA 5K4ZA 4TR9A 3GX9A 1G69A 3LCXA 1LBLA 4WQ6A 5D04C 3LM7A 3QMSA 4YL2A 1T96A 4HNNA 3U2OA 1TPB1 4MY9A 2TMDA 3PF3A 1XC4A 2ZYFA 3W83A 1H63A 1LOQA 1DQXA 4N02A 1C29A 3W2LA 3H53A 1G4PA 1QAPA 3NDOA 3UWQA 4Y90A 2OMAA 4PL1A 4RV8A 3LGEA 2J6XA 1PHWA 5EYWA 1Z44A 4FNUA 2A4AA 4KWWA 1F73A 3LBCA 1RQHA 3G1XA 4P61A 1LROA 2VC6A 1SZFA 2X16A 4JXCA 3W84A 1RQBA 5I3GA 3B06A 3BW3A 1NAL1 1P0KA 3L5AA 4K38A 4UNLA 5D38A 5F2GA 5C2XA 4NXKA 1A5BA 3G0SA 4JTTA 5GVJA 3DFQA 1M7PA 3WK2A 4EVZA 1KA9F 2JGQA 1QPNA 5HWMA 4NJHA 1FWRA 3PS7A 5CZJA 4BI6A 3R13A 4WY0F 3PB0A 3L5LA 4XBSA 4FNRA 1ZNNA 4AHPA 1H50A 5DLCA 1FQ0A 1GYNA 4JTIA 1EA0A 1OF8A 2ZRXA 6TIMA 2QEZA 5H91A 1W5QA 1EX5A 3KHJA 1B57A 2O7SA 2G95A 3CIWA 3L5MA 1SO4A 4MOZA 1OYAA 1IF2A 1XDMA 4ONVA 1NVMA 5AC7A 2I1OA 4NJGA 4XKYA 3NOEA 2A21A 2C1HA 1YDNA 4W9TA 3WJXA 3W1UA 4AF0B 2NXGA 3M47A 1QOQA 4OQVA 2H8XA 4ADTA 2QKFA 2YPIA 2Y88A 1MEHA 1W0MA 1WYIA 4JD4A 2A7PA 3QF0A 4I7VA 2H3DA 6ALDA 3KXQA 3MJYA 3HPXA 1GVQA 4Z0JA 4WOQA 1F76A 5LNUA 1GOXA 3LXCA 5HINA 2YX0A 3VCRA 1KM4A 5G2WA 3NEVA 3IIOA 3W1QA 3UQNA 2DZSA 1KM5A 1XI3A 1X1OA 2B0MA 1TIMA 5EMUA 3EKLA 1JJKA 1H7RA 3I68A 5LNWA 3PBWA 3JS3A 4QJ1A 1VGAA 1SZGA 4UC5A 2GVGA 5HJLA 3KRUA 1SSGA 2I14A 5MHBA 3W7IA 4NXSA 3W2JA 2NWRA 3THQA 4JS3A 1ZJIA 4PTNA 1PCWA 1FCQA 4YCOA 3T7VA 3KX6A 1TRDA 3IGUA 1OFRA 4K8EA 3MI6A 4XBKA 3KAOA 2OCZA 2QR6A 4EIVA 3TCEA 3FJLA 5D32A 3PULA 3UXAA 2Y7FA 3W2KA 4ZQMA 1QCWA 2BZNA 3M7WA 1W5MA 4UFJA 1ZFJA 5LNRA 2DORA 3M41A 2NX9A 3CEPA 3SR7A 3TQKA 4IMFA 4GFSA 4K7YA 3W7QA 4BR1A 3WJZA 3WJSA 3W87A 3QPYA 2NZLA 1F6PA 4O28A 1CX9A 3STEA 3HPSA 1I2QA 4G1KA 3G1SA 3G8EA 4AAJA 4Z1BA 3LTSA 3SI9A 3W76A 2ZZ2A 4OWGA 3T78A 1KTCA 3PSVA 2V9DA 4XWUA 3P7YA 1L2UA 3TFCA 2Z0IA 2NX1A 3NL5A 3UY7A 5FESA 3LHWA 1FWNA 3W1NA 1JRCA 3A22A 2NUWA 3NQCA 1O60A 4GUGA 2BLEA 1VCGA 1EUNA 1W3NA 5HUPA 3TW7A 3UWZA 4GC4A 1CI1A 3CM4A 4DO6A 4HPXA 4ZZ9A 3RFAA 2W0UA 3HIJA 2VEPA 4AVFA 3W7HA 1PV8A 3BVJA 1BTMA 1V7YA 3P62A 1WOBA 1SW7A 3GVGA 3LCGA 4LVFA 5D2XA 2J9YA 2PE4A 4IX2A 1G7VA 3B8DA 2AGKA 2YW3A 2EF9A 4LS0A 4WZHA 4UMAA 4UTHA 1HG3A 3N2MA 4RX0A 1ZCOA 1VYPX 2GUUA 2V2HA 1TV7A 1UB3A 5C55A 2QUUA 1WX0A 4WX2A 3TQVA 1LBMA 3ZS4A 3M5XA 3EX1A 1DOSA 2E6AA 3L2IA 1WOAA 4RR4A 1UUMA 4YLWA 3TKFA 3LDVA 2TRSA 2Q8ZA 3FA5A 3PBYA 3OA3A 4EWND 3MBDA 2HMCA 5FEZA 1S3HA 4O8RA 3Q2DA 2FQIA 1TPDA 3EX2A 4Y96A 3W7NA 5AHMA 4CNOA 4WUIA 4E38A 3TC6A 1R2TA 4MZYA 5CPNA 1W37A 2EPHA 3NPVA 2RFGA 4JTKA 3ELFA 2X1UA 3MHUA 4NZFA 3G22A 4NVTA 3C4UA 3DI1A 4PFMA 5FF7A 1VHCA 2AQWA 3C2OA 1KLZA 3MBFA 4QM1A 2ATSA 3S42A 4JTSA 3O6YX 4YCPA 4GWEA 3W74A 2QCDB 4FXSA 3DHFA 1FXPA 3BPWA 1R2RA 4M6PA 4YMZA 3LRLA 4JTLA 1Q6LA 4AWUA 3E02A 1ADOA 3SSJA 1B4KA 4AB4A 3QEZA 2CWNA 3Q58A 3UZ5A 4QNEA 2ZA1A 1EEPA 1K8YA 4JY9A 4MIMA 2FPVA 3NYZA 2PRHA 5FF3A 3C2FA 2F84A 3C2VA 3NQEA 1JCJA 3LHTA 3W6YA 2C15A 1A5AA 2X1RA 2C16A 2WNNA 3GYEA 2X2GA 3LCLA 3M16A 4KKXA 4PEKA 1SZEA 3GAKA 3LB0A 1EIXA 5D09A 4ML9A 3UPWA 1LM1A 3UWWA 5LSMA 2YGYA 3KFTA 1AK5A 3W7GA 4IPJA 2VFEA 3BG3A 4UR7A 4O52A 1I2NA 4O19A 5KZMA 4ORIA 3O8AA 1G4SA 1ZAJA 3GLCA 5BMXA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1OT2 A;  4XUY A;  3GIQ A;  3N6Q A;  4HZ8 A;  3BK0 A;  1UCW A;  4TX6 A;  2Q6Z A;  4PFH A;  1MXS A;  1VFS A;  1FA2 A;  3N73 A;  4IQL A;  4OFC A;  4A2R A;  3POC A;  1TMQ A;  1H5Y A;  1PIF A;  1VYR A;  1TPC 1;  1AW5 A;  4A8L A;  1TZ7 A;  1RCQ A;  1L0P A;  5C5Y A;  4JNZ A;  2NVD A;  1LOS A;  1UAS A;  2ABB A;  3FVD A;  3R5E A;  3WQF A;  1IXP A;  4HTY A;  2PLK A;  4PH6 A;  2G3I A;  2IIC A;  2QHA A;  4WR3 A;  4K1W A;  2XM2 A;  4W5Z A;  1P1M A;  2YCI X;  4NL1 A;  3QZ6 A;  4WJE A;  1K9D A;  1OFQ A;  3E49 A;  4ZL1 A;  3TYD A;  3WF1 A;  3NUK A;  3OA5 A;  3DHU A;  4C6F A;  2PP0 A;  1RBL A;  4WXY A;  3WBA A;  1VD6 A;  2Y85 A;  4IPI A;  3NPW A;  1EF2 A;  1SQ7 A;  3QLD A;  4MWA A;  5HQE A;  2PRM A;  3F5J A;  2YXO A;  1HW6 A;  1O1Z A;  3FK4 A;  3A21 A;  3KVJ A;  4N6E A;  3VGF A;  4H9V A;  3TSD A;  3AUJ A;  3EA1 A;  3G5E A;  4NU7 A;  2AMX A;  2Q3O A;  2OSW A;  1G0C A;  3G8R A;  1N41 A;  1NDY A;  1HO1 A;  5E93 A;  1CNV A;  2Y70 A;  2INZ A;  3G0U A;  1H41 A;  3HV8 A;  2WOQ A;  2XFW A;  4HSH A;  2PMQ A;  2FVM A;  4LBS A;  5ABH A;  4FQ0 C;  2ZUW A;  1HQT A;  1A50 A;  1YXD A;  1FX6 A;  5XIM A;  1Z7A A;  3AJC A;  3NGF A;  2CLI A;  2VOT A;  3PUG A;  1DWF M;  1XCX A;  4BQ3 A;  2C13 A;  2VOM A;  2X40 A;  5AYY A;  2E25 A;  3AJX A;  4FLR A;  2AQV A;  1W5P A;  1Z41 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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3ANYA

Total Genus

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