3ANY | Genus

Total Genus 192

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	192
sequence length	453
structure length	453
Chain Sequence	MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	How coenzyme B12-dependent ethanolamine ammonia-lyase deals with both enantiomers of 2-amino-1-propanol as substrates: structure-based rationalization. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
molecule tags	Lyase
source organism	Escherichia coli
total genus	192
structure length	453
sequence length	453
chains with identical sequence	C
ec nomenclature	ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date	2010-09-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF06751	EutB	Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.220.70	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Annexin V; domain 1	lyase	3anyA02
2.30.170.30	Mainly Beta	Roll	Ribosomal Protein L24e; Chain: T;	ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like	3anyA01
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3anyA03

4K7YA 2Z6JA 4LRSA 2A7PA 1A53A 2ALDA 2ZZ1A 3OHIA 4JDYA 3L0GA 3IGXA 3L5LA 4GUGA 2GVGA 1LCOA 2X1SA 3GDRA 4HHPA 3LOTA 3LHTA 1QAPA 3NQ6A 4BFAA 1P0NA 4JIPA 2YW3A 4OT7A 4X22A 4LVAA 1CW2A 4ALDA 3QPZA 5H2ZA 1Z44A 4FXSA 3C2FA 3ABQA 4WXYA 3TXZA 1DHPA 1I2OA 5DXXA 1GG0A 3TV8A 2KZHA 1TPFA 4MUZA 2FQIA 1K7EA 5D05A 1YLVA 3BGGA 1L6YA 2DZPA 3LERA 4GXMA 2EAWA 4IPIA 4AVFA 3U2OA 4KWWA 4X9SA 5K2ZA 4DBDA 3LHYA 1H62A 2QCEA 3LCXA 1OABA 5KITA 1GVQA 3LCIA 4OWGA 3CB8A 1O5KA 4PC8A 2GPTA 3QM3A 4A29A 5EA9A 5HR7A 2ZQ0A 3RFAA 1TB3A 1A5SA 3O07A 5I3IA 2ZZ5A 5AHLA 3HOJA 1TRDA 2Z1BA 3W22A 3G0SA 4WUIA 4O1CA 2V81A 3EWXA 1HO1A 4MVAA 1T8XA 2O7SA 3UWVA 4WD0A 1W3IA 1H60A 4CQ8A 5D2VA 2WNQA 4H4IA 1JJKA 3LTYA 5AC8A 1Q6LA 6TIMA 2UV8G 1A50A 1C29A 5CG7A 1WBHA 4CNPA 3W85A 1MEHA 3RMJA 3GDMA 4Z1BA 4PA8A 4AF0B 3NYZA 2RDUA 1EX5A 3A21A 1M7PA 2CLIA 4JXCA 2NV1A 4KFNA 3R5EA 3ATYA 3NOEA 2QAFA 5A5WA 3M5XA 3EX6A 2HS6A 3TX9A 1Z48A 3MW7A 1WX0A 3L65A 2XN1A 4LVFA 3QH2A 3HGSA 5LNWA 4IGHA 1OX4B 3A5VA 3CWNA 1BEUA 4WOQA 3NM1A 5F1UA 2DZTA 4X3ZA 4IWWA 1JUBA 5AOUA 3W1NA 5IBXC 1EA0A 3NQAA 4LOCA 2FDSA 3M44A 3W07A 2NX1A 2BWGA 1LORA 4UMAA 3TFXA 4CCDA 4DXVA 4WJEA 3IVUA 3W7CA 1TIMA 3DU0A 5KZEA 1F73A 3OBKA 1GWJA 4OHQA 3MMTA 3G22A 1LBLA 5LSMA 3M43A 1F05A 1SZFA 1TTPA 4UTWA 5DY2A 1XFBA 3LM7A 2C3ZA 3JRKA 4G1KA 2X16A 3NQGA 1L6SA 3NQFA 1YTEA 1NVMA 3PUDA 3S1UA 3G18A 1XUZA 4AXKA 3W71A 3C3NA 1KLZA 2B4GA 1ICQA 3O8AA 3W7KA 1ML1A 3PUOA 1KFBA 3STEA 3MI2A 2BSLA 4JGDA 2WSRA 4JICA 1TPH1 3PR2A 4MOZA 3PULA 4I7VA 1H1YA 3TKFA 1WOAA 1GVFA 3PVFA 1YPFA 1Z42A 3DKLA 5HWMA 5SWUA 3W7DA 4IJBA 3M5VA 4B5NA 4UTTA 3I7SA 5CZSA 1PVNA 4H3DA 4JN6A 2I9EA 3CU2A 1G67A 2X1TA 5DXYA 1XDMA 5AC7A 4Z08A 2NZLA 2VELA 4UTKA 1PS9A 3RNDA 1JUEA 3T4CA 3STCA 3LRLA 4IMCA 2TPSA 1FCUA 3IGSA 3W1TA 2ZZ7A 4LVDA 4O14A 2EHHA 3QSRA 2FIQA 3KHJA 3NNTA 5K3VA 2VFIA 4E2DA 2YDAA 5CKSA 1HL2A 4NZFA 3TNOA 3KFTA 2ZRVA 1VZWA 5G1TA 1G7UA 4DF2A 2NUWA 4JIQA 5D30A 4MLRA 1SO3A 2DZSA 4CQ9A 1FUYA 5I3HA 2A7RA 3LCGA 3PSWA 1T0OA 4JTTA 1VLWA 2R14A 4JTEA 1ZFJA 4FNPA 4IX2A 4O4WA 1HFBA 3CIWA 3C0JA 2FJKA 1H51A 4AWSA 1SW3A 1NSJA 1F7BA 2VFHA 3F03K 3U8GA 3EEGA 2Y62A 4S2CA 4UIOA 3RF9A 3N2MA 3A5FA 1OYBA 2QEZA 5DLCA 3W7MA 3WJZA 1I4NA 1MEIA 4PFMA 2GUUA 5HINA 1KM0A 4NU7A 1KFKA 3R2GA 3FFSA 4MIMA 1B57A 2NUYA 5D2YA 3BG3A 3A24A 4FIQA 1KM2A 2W6RA 1OF8A 1W5MA 2JKPA 2Y85A 4HT3A 4DO5A 1F2JA 4ADTA 4RZ6A 1JCJA 3TSBA 5C54A 2QCDB 3IV3A 3A22A 3CTLA 4OE7A 5T26A 2V9DA 2YFOA 1KTBA 4O53A 1VQTA 3S42A 3DFTA 5F4XA 4UUIA 1R2SA 5J5DA 4N9EA 3G1VA 2BTMA 3KOFA 2A21A 2CLHA 5ABTA 4UTIA 5I3GA 1RV8A 3FLUA 1TTJA 2F7FA 4RX0A 4O1DA 3NPXA 1ZAIA 3N19B 1X7FA 3DFSA 3WK3A 3I6RA 3S5NA 5E93A 5HMSA 2YSWA 5K4XA 2VENA 2R94A 5AN7A 3NQ8A 5FI8A 1JCNA 4AB4A 4UTMA 2G97A 3NPUA 5I3FA 3AJXA 4O19A 4QIUA 4AEOA 2B7PA 1JRBA 2G96A 4HSNA 4O10A 1ALDA 2VFFA 5K4ZA 1H63A 1W5QA 3QQ1A 3CIXA 3SJ3A 3OA3A 2V8ZA 4AAJA 8TIMA 3NQ7A 3QF0A 3S8HA 4QNEA 3LHVA 4JDBA 1O60A 3BW3A 1G4PA 1S5TA 2R91A 1KBJA 5D04C 3THAA 3HGOA 4BI5A 1EUAA 2QUVA 1M5WA 3BLIA 3GXTA 4UTLA 3EWYA 5G2IA 1C9DA 2YGYA 3RU6A 1YXDA 2G95A 3P81A 2A85A 4QJ1A 2GQ9A 3OVQA 4HNTA 2E5BA 2CZ5A 3RLUA 3GVGA 3CEPA 3BG5A 3ANYA 1PV8A 2ABAA 3G1SA 3JR2A 1QDSA 1W31A 2E1DA 4CCCA 4JTLA 1AW1A 2ZRXA 4UTWC 4GUIA 5FF2A 4DF0A 4CNNA 3IGUA 1OYCA 3FS2A 3W1PA 4HKPA 3IIVA 3TH6A 1UASA 3GKFA 4WOZA 1OFPA 1VR6A 2DORA 1YXYA 1R47A 3NPVA 1D3GA 4MY9A 3LLFA 2JKEA 3U6WA 1NAL1 2NX9A 5F2LA 3LGEA 3R12A 5AYXA 4TR9A 1DJQA 1A5BA 1TPWA 3LCFA 3MJYA 3I65A 1A5AA 4I9AA 3LHWA 3O16A 1TMHA 1AL7A 2G5WA 3B04A 2VKZG 3ZWTA 3QJAA 5DY3A 3QW3A 5F4SA 3P7YA 3H55A 2WSYA 4D2JA 2C13A 3NL6A 1S5WA 3SY5A 4UFLA 3TXVA 1VGAA 1W0MA 3HQ1A 1G6CA 2V30A 3PB2A 3KVJA 4LVBA 5GVJA 5FEWA 2RDWA 4AHQA 1UBSA 5FEXA 1OK6A 2QCMA 4UC5A 4UTTC 1XM3A 5AFDA 2CU0A 2VEPA 3LI1A 4WY0A 2VEMA 1O95A 1DKWA 1TPC1 2CLFA 1XXXA 3DZ1A 3B05A 4IX0A 4MZYA 2RKXA 3ABSA 3DI0A 2CLEA 2FPTA 3HG5A 3DFPA 2JK2A 4XKYB 5AYYA 2CLOA 3MP3A 1C8VA 3BK0A 4LC6A 3KAOA 1K3UA 1W1ZA 1DV7A 4O28A 4AF0A 1QPRA 1GPWA 4MFEA 5LHEA 3C4UA 2F84A 3QRHA 2J27A 3EWBX 3TCEA 4JNMA 2PE4A 3NL5A 3GZ3A 1QCWA 4MZ1A 1J4EA 2ATMA 2ZA2A 4Z0JA 5C5YA 4K8HA 2E5DA 3HB9A 4K6AA 1PCWA 3WJSA 3B0VC 1I2QA 3C56A 1LTDA 3F4WA 3GAYA 1IXPA 4QM1A 3G24A 4DO6A 1PHQA 1TPB1 2NXHA 1OX4A 3P62A 1GQNA 4LVGA 1SU5A 4AMAA 2DZUA 4GC4A 2ZRYA 2DJLA 3WJXA 1KV5A 4JX4A 1UUMA 3SSJA 3QMTA 5DELA 4DBEA 3W7LA 4IOTA 2D73A 2EKCA 3QZEA 4UNLA 3MUXA 4CLMA 4UTJA 1DJNA 1EEPA 3NA8A 3TSMA 2VEKA 4WY0F 1MEWA 2NLIA 1W37A 3EX1A 2ZTJA 4UTHA 4FNSA 1ME9A 5KZMA 3EXTA 4N02A 3UNDA 2FFCA 3GNNA 4WXZA 4CNOA 5FF0A 2OCZA 3E12A 3UXAA 4WZHA 3W84A 3V75A 3E96A 4NX5A 4TMBA 5G4EA 3UZ5A 4N9CA 2WO5A 3QC3A 3GX9A 5I3KA 3UWQA 4ZQRA 3SGZA 2P1FA 3ZR4A 4C1LA 3C2RA 5CZ0A 5FF3A 2ISSA 4QQ3A 3OVPA 4NXKA 3UWYA 3TC7A 1RVGA 3W1RA 4PEKA 3LHZA 1WV2A 3SI9A 3CWOX 4NT0A 3W1LA 2HS8A 2YCEA 4WY0B 4OQVA 4FO4A 4Y96A 4GJ1A 2DZWA 3W2NA 3M9YA 3CM4A 1AW5A 4WX2A 3P61A 4MY1A 1ADOA 1TV5A 5EL1A 3T40A 1GVOA 2QUUA 4OU1A 2ZZ3A 4A22A 2QCFA 1M6JA 4O11A 1JRCA 3N3MA 1QO2A 3G8RA 3GB6A 1K02A 4HPJA 3IIZA 1XL9A 2I1OA 1VCGA 3SZ8A 3MHFA 3TROA 4Z1DA 1Q45A 3UPWA 4S1FA 4ADSA 1FDYA 2Y88A 4UFIA 1VYPX 2H3BA 5DN1A 3VFLA 4ZQNA 2ZDRA 3DFOA 3WK2A 2ZZ2A 3LV5A 1H5YA 3TMQA 3KVMA 3WFAA 2ISWA 4ZMGA 3KXQA 1NF0A 1KM6A 2FPVA 2ZFAA 2E09A 5HJLA 1IGSA 4NNAA 4EIVA 4UFJA 2NWSA 4GFSA 3W75A 3P67A 3MWAA 2GVJA 3NQEA 1LRNA 1H1ZA 3NZ1A 1O5XA 4AHPA 4JTSA 1FCQA 1P1XA 1Q6QA 3JS3A 3DFNA 3BLEA 6ALDA 1DQWA 4K37A 1W54A 2P0OA 3KVKA 1TPVA 2C1HA 1BKSA 3QPYA 4Y9AA 5EY5A 1SZNA 1Q3NA 3W1XA 4E38A 3W2MA 3CQ0A 1K8XA 3LXCA 1TJRA 3HO8A 3PS7A 3MP4A 5TBOA 3C8FA 2VFGA 1MSSA 2NXGA 3DAQA 4NJIA 3G1DA 1HG3A 4LWWA 1YDNA 3Q2DA 3QMRA 2ZRWA 3CT7A 5D03A 5EPDA 2ZRUA 4IMFA 4MPQA 5DCEA 2I14A 1K7FA 3EWWA 5LNVA 4ADUA 3PBVA 3W72A 4A21A 2C16A 4R7JA 1JCYA 4LUJA 4I7UA 3BGJA 5D2XA 1W5OA 3VE9A 2OT0A 2ZRZA 1OFAA 2CLLA 3L9CA 5TQLA 3S6DA 4O50A 4W9TA 3QEZA 3ABOA 3TQVA 3HG2A 3PF3A 3LB0A 5BNKA 1YXCA 3W7NA 3GYEA 1KM4A 2GJLA 1AK5A 2PURA 4UXDA 3IRDA 1FXQA 1VCVA 3F1QA 1AW2A 1KM3A 4IPJA 2AGKA 3G1FA 5LGXA 1EP2A 1LRQA 2QCDA 3HG3A 4FXRA 4Q32A 3L68A 1FX6A 4O18A 2ZZ6A 1FXPA 3OIXA 2XN0A 4MYXA 4BWLC 2YXGA 5F2IA 2W79A 3STGA 4RCXA 3OG3A 4CCEA 3S1VA 1QNVA 5FEZA 2Q3OA 2QF7A 1I45A 4O54A 1AG1O 2WPBA 3FYOA 3SFKA 3W7HA 4DEFA 3PY2A 3DKJA 3L0NA 3O6DA 4J9JA 5HUOA 4TO8A 1VC4A 4MJMA 3PC0A 1PCKA 3LI0A 4FHAA 3NQDA 2NXIA 3CPRA 3FYPA 1H61A 3ATZA 3GR7A 4NX0A 5HUPA 2BXVA 1FWWA 4AWUA 3NL3A 3S1WA 1VHNA 1IIGA 1QR7A 3W1MA 1RQHA 4UTUA 1D9EA 1TPDA 4EF8A 3QQ0A 3TDFA 5CPNA 3P8JA 4AH7A 1JCXA 3LTSA 1GT8A 2A7NA 1QMLA 4QITA 2FB3A 4YLWA 2XFWA 1XUUA 4JYDA 1KM5A 3CC1A 3KRSA 1K7XA 4ZQMA 4XZ9A 5AC6A 1W8SA 1EWDA 1VYSX 4HIBA 1Q6RA 1TQJA 2E6YA 2J6XA 5BW6A 3P80A 3GXPA 3FJLA 2CFFA 1SQ7A 1WYIA 1J5TA 3GDTA 1I2RA 2WSQA 4QSHA 1OF6A 2H3DA 4LUIA 4N4QA 3S5ZA 3O15A 3QYQA 2VXNA 3PAJA 3W3OA 2OZ0A 3M1ZA 1LLZA 4NJJA 2PC4A 4UFKA 3M5YA 1IXNA 4POCA 5F4WA 3L2IA 3UWUA 2E68A 1FCVA 2YFNA 1GEQA 3IVSA 1TO3A 3CLMA 4BI6A 1DBTA 5EKYA 4YWIA 3TQ0A 3PBWA 5LNRA 3P8IA 3NDOA 5HNRA 4LS1A 4RLIA 2EPHA 5CSSA 2VFEA 3UPBA 3LCHA 3KRZA 3W86A 2GQAA 3FA5A 2PRLA 1JVNA 1H7OA 4M6VA 4YL2A 1R30A 4GRSA 5E0KA 1YTKA 3O06A 3MI3A 1OJXA 1RD5A 4FX7A 4Y6GA 1EWEA 3BPWA 4DF1A 4NZJA 4MKNA 3DXIA 1TV7A 5KZDA 1JR1A 5CSRA 1VRDA 2Q8ZA 1ONRA 3FIGA 2E6AA 4FNTA 4RR4A 4IMGA 4YCOA 4UFHA 1L9WA 4M7SA 3TR2A 4NJGA 3GLCA 2OT1A 1FWTA 1BWKA 5D2WA 3VKJA 3R8RA 5HWNA 4O15A 1H7RA 4H6KA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3ANYA

Total Genus

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Chain Sequence

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