2PB1A

Exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-b-d-glucopyranoside at 1.9 a
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Hypothetical protein XOG1
publication title Exo-B-(1,3)-Glucanase from Candida Albicans in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-B-D-glucopyranoside at 1.9 A
rcsb
source organism Candida albicans
total genus 154
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2pb1A00
1XCWA 2WMJA 1LG2A 1V6VA 1HXJA 1KQZA 3AIQA 4MPKA 3AS0A 3LPPA 1MYRA 1J01A 5CG0A 3RM9A 2XVGA 3ZSTA 3FW6A 3AI0A 2J8GA 4JIEA 2WHJA 2EPOA 4Z2HA 5E70A 4F9JA 3W4RA 4V27A 1UWUA 2E4TA 1MW3A 1QI4A 2V3GA 2V5DA 2CYGA 1X1NA 3LMYA 3L4YA 3CUHA 1E3XA 1KWKA 2ZOXA 2QHAA 2J8FA 2J77A 3FHAA 3W25A 1DWHM 4LGXA 3BLKA 3T2QA 3PTQA 5FKYA 2Y24A 3WF0A 2BVTA 2XVKA 2GK1A 1GQKA 3SURA 4UOQA 2W66A 1WDPA 4NZCA 4UQAA 5I24A 1X6LA 3OZOA 1QNQA 3A3HA 4GI9A 2EXOA 4OBRA 1VFOA 3ZT7A 3RPMA 5FD0A 4DM1A 1NWSA 4NRSA 1OD8A 2JE8A 4CD8A 5BCAA 2WHLA 1UKOA 3SCTA 2W61A 4F79A 4LXFA 1E0WA 2W5FA 3AS3A 1ESWA 1AQ0A 4M8UA 3OZPA 1VF8A 3VIMA 1ISZA 1E0XA 5FL0A 4E2OA 1W9UA 1LF1A 1V3KA 1ZL1A 2W91A 1BFNA 1V0NA 1ZBKA 4D6JA 1A3HA 1VFUA 1MQRA 4DUXA 3L2LA 4KMQA 1NOUA 4BQ3A 2WKLA 1LL4A 3A4XA 4IM4A 7A3HA 4MNJA 4UZSA 4GI8A 1XSJA 4D1JA 1UKTA 3WNLA 2F8QA 2WVTA 3OLEA 4AEFA 2J7EA 1Q6EA 3W0KA 1XH1A 1JZ7A 1E4IA 4WKAA 4M29A 3U7BA 4J28A 1VRXA 2XFYA 2XWDA 5CZKA 4HOXA 3CTTA 5EFDA 1Q6CA 4GQQA 4J3UA 2BY3A 1LWJA 2WAGA 4GXPA 5JBFA 4MADA 5BXTA 3J7HA 4XB3A 3W24A 2WCGA 2GJRA 3BMWA 3AHYA 3ARPA 1RD6A 4J3XA 2EPLX 2ZICA 3N1AA 4UFHA 2E3ZA 4AWEA 4ATWA 2VZUA 3ZM8A 2WVSA 2QPUA 4D6DA 3OLIA 1L8NA 4JCLA 2WMIA 3VMNA 1OM0A 2NW0A 1PBGA 1VEPA 3VIIA 5A8QA 3CZEA 3BAKA 3N9KA 5ABEA 2NT1A 4XUYA 5CPQA 4BQ2A 3PZTA 5JBDA 4BCEA 2VX6A 3T2PA 4CCDA 2WMFA 3MSGA 1JZ2A 1UWQA 4D72A 3E1F1 4IUGA 5BROA 1PPIA 3W38A 1XC6A 1WB0A 3K8MA 3WNOA 1ODUA 3VIFA 3AHXA 2ZWYA 1CGWA 4CUCA 3PZ9A 4C7GA 5CQ1A 1UKPA 3CHCA 3HN3A 2ZUTA 4DWSB 4EANA 4QAWA 1E9LA 1UWTA 4CN4A 5LYRA 1Q4NX 1YQ2A 1C8QA 1MFUA 4S3KA 1EGZA 3CZLA 1XD0A 4P8WA 2BHUA 5AYIA 1V08A 2X0YA 3NDYA 4TX8A 2Q8XA 1C3FA 2D3LA 2WLYA 5A6SA 2WHMA 4P8UA 2WWDA 1SMDA 3F5JA 3SCUA 2D0FA 4TVUA 1NP0A 5I2UA 2CBJA 1OINA 3T08A 4Q7NA 3WNKA 5D9NA 5CPTA 5HPOA 1G9HA 1OD0A 4AD2A 4PMZA 4ZXOA 4PMRA 2O9TA 4F8XA 2ZX9A 1J0ZA 4WKFA 4DM2A 4C7DA 5IXEA 4H04A 3GTNA 1XCXA 5LA1A 4HA4A 1EDGA 3BGAA 4HU0A 4CN6A 2XG9A 3MSDA 1W91A 2C8NA 4JHOA 5FCZA 3FAWA 1V6XA 1KBBA 2CCRA 3AIEA 4QLLA 1C8YA 5BRQA 1ISVA 3D3AA 3AHTA 1VEMA 5HBFA 1E6SM 2DH3A 2QMJA 1E56A 1JDCA 1UR2A 4J3TA 2BY1A 3BCFA 2NT0A 1GQIA 2BVDA 3K8LA 1UHVA 2YDQA 2VVSA 1KQYA 4X0NA 2CKSA 3BLPX 3VNZA 1JGIA 2PC8A 2OSWA 1HF6A 4NI3A 3I3BA 2YL5A 3KL0A 2OWWA 3RDKA 1CYGA 5E09A 3GH4A 3K46A 1UQYA 2JIWA 5KEZA 4D6IA 3VUPA 3CZ8A 2VX4A 4PTXA 1UZ4A 2X09A 3DYMA 1JD7A 1KXVA 4OIFA 1E15A 3PTMA 5CGMA 5AC5A 3JUGA 3PN8A 3KL5A 2Y2WA 1UH3A 4PCTA 3MS8A 4H7VA 3TTOA 3VD5A 1UYQA 2VOTA 3PTKA 4PUDA 4LX4A 3PZIA 4OKDA 2CITA 1WAWA 3DC0A 3ZMRA 3VIKA 5CLTA 6TAAA 1HX0A 7CGTA 1E71M 2YLLA 3MU7A 1G5AA 2G3IA 3SEPA 5DO8A 2UY3A 1WKYA 4U5IA 5HOSA 3WBAA 3AMKA 3U5UA 4PMDA 4GPNA 3AQUA 4U31A 2YL6A 1K9DA 1W9DM 5I23A 2WSKA 3NSMA 3WF4A 1E6NA 3WUBA 4KRUA 5KZ6A 2QPSA 4DUWA 3O9NA 3BSHA 1RH9A 3IAQA 1BVNP 2O9RA 4PMQA 4Z2GA 2J78A 2VCBA 3WD1A 2DSKA 1WZAA 4OZOA 1K9EA 1J0HA 3ZJ8A 1PX8A 2W67A 2GVYA 1PIGA 1UG6A 3WDRA 3ZJ7A 1HN1A 2J79A 5IHRA 5TD4A 2ZX6A 5HNNA 1VFFA 4CGTA 4DUVA 2JALA 2J7BA 3WH8A 4B3KA 3WENA 4HPHA 1F4HA 3VM5A 1H0GA 4UQ9A 3UESA 1UR0A 3SIMA 1UR4A 1H3GA 5BWFA 2D20A 1GCYA 4KGJA 4U3CA 3FHQA 4TX6A 4F9DA 3GBDA 3A4WA 4LYPA 5D9MA 3OLGA 3W81A 3RJXA 1BQCA 1QI3A 5A8NA 4AYSA 4AIOA 3RM8A 4ATDA 2O9OA 3WQ5A 3VGDA 1R7AA 4ZXLA 1MW0A 3D5HA 3W29A 2NSXA 1HKIA 3SUWA 1PX3A 2DT3A 3PZNA 1E6RA 5A6BD 3ALGA 5JIWA 2ZXBA 1OT2A 4XZWA 4OOUA 2AMGA 4QDMA 3MUAA 3GBEA 3W37A 1FA2A 3N11A 1M01A 3EDDA 2C0HA 3WN6A 3OGRA 1BAGA 3PZOA 4J7RA 4QCFA 1VAHA 5A6MA 4NRRA 4CN1A 3W28A 1J18A 3B9DA 2CNCA 2DPEA 4W8BA 2YOCA 2FGZA 2CHOA 3DYOA 3PZVA 2YL9A 2BV9A 2ZWZA 1W2VA 4BZYA 1DP0A 3EDFA 2CBIA 3FN9A 4UFIA 4FLSA 2PWHA 2J74A 1E6XM 1ZS2A 4H8HA 2VNCA 4A3HA 4AISA 4PUEA 4K68A 1CWYA 3VGHA 3RO8A 1P6WA 3AMDA 3CZKA 1N82A 1TFVA 2G3NA 1X6NA 2G8ZA 1JI2A 3N17A 3AMLA 2HISA 1V6WA 1TZ7A 1OCQA 1B0IA 2GUYA 3WFZA 5A8OA 1QW8A 2E9LA 4JAWA 3WSUA 2A3HA 3GXMA 1E6QM 4E8DA 1S46A 1BVZA 4UTFA 3PZMA 1JFHA 1L0PA 1ISXA 3GXIA 4HA3A 3BH4A 3AYRA 4AZHA 5IHSA 2J7CA 5A3HA 1B1YA 2VC9A 4UFLA 2WCAA 1E40A 1JXKA 3SUVA 3VGBA 1U33A 4XZBA 2DQXA 1VJZA 3OIHA 5EB8A 1HIZA 1WE5A 1OIMA 1G01A 2CBUA 4IPLA 3WD3A 5A1AA 1BYAA 3M46A 2BFGA 3UG4A 3VDAA 4H2CA 5F7UA 4Q22A 3OBAA 2F2HA 2PWDA 3WEOA 4J3SA 3VDCA 4AMCA 3F5LA 3M07A 1V3JA 3PZGA 4MB3A 4AD3A 5I0DA 4LQ1A 2D2OA 4CU6A 2EEXA 4DWSA 2D22A 1W3KA 1Q6FA 2YL8A 3IJ7A 2ZUUA 4AZCB 2XIBA 3L4UA 2Y5EA 4M82A 8A3HA 4W87A 5CLWA 4BF7A 2PB1A 2CERA 4V2XA 1EH9A 2OYKA 1E3ZA 1D3CA 4UOZA 3WD0A 3M7SA 1HJUA 1JAKA 5E9AA 4U3AA 1DEDA 2PBGA 1GOQA 1GOKA 2D3NA 4NSBA 1OSEA 3WMBA 4XV0A 1W1YA 1NWTA 3BAIA 1W1TA 1BGGA 4RL3A 1BG9A 1OB0A 4AD1A 3WDHA 1U30A 1VFMA 1UD3A 2XVNA 2J7GA 4QLKA 5DEZA 5I78A 4B15A 5IDIA 2F61A 1B3WA 3ARWA 2VR5A 4XX6A 1BYDA 3VIPA 1AMYA 2J4GA 4BQ5A 3OA5A 3PZQA 3SCPA 3SUTA 1PEZA 4L4PA 3IK2A 3UG3A 1GW1A 2XSAA 1UD6A 3K4DA 4AIUA 3AZTA 4GQRA 3WQ4A 3AHVA 1SYTA 3AICA 1GNXA 4P8VA 4URIA 3UG5A 2AOSA 4PEEA 4WK9A 1KB3A 2EBNA 4X0VA 4EKJA 4HMDA 3ARQA 3ZT5A 2OYLA 4KGLA 1EHAA 1WZLA 1GOMA 4CD7A 5FOOA 1B3ZA 4W84A 2XFFA 1ZBWA 1H4PA 1QI2A 1MVYA 3WH7A 5FIPA 3WQWA 3MUIA 1HT6A 3ZR6A 3OGSA 3BMVA 1MW1A 3FAXA 2WC7A 3MANA 1NOFA 2DH2A 1E43A 1ZB5A 2WVVB 1JDDA 2BXYA 1EO7A 5DMYA 3W82A 1J0YA 3WH6A 1H41A 1UR8A 3AISA 4W5ZA 4CD6A 1R85A 3OLDA 4EK7A 2WK2A 1KGXA 4W93A 1V03A 1BYCA 1Q6GA 1RP8A 2VO5A 4PYSA 2RGMA 1R8LA 3W53A 3WUFA 2PWFA 4CKQA 5I79A 2BHYA 4HZ7A 1A47A 2YA0A 3CBWA 4AZGA 1XSKA 1XV8A 1GVIA 4ZENA 4QP0A 3IJ9A 4WIWA 4CCEA 2GDUA 3SCWA 2Y4SA 3F5KA 3AZRA 1M53A 1UQZA 3CZJA 1NQ6A 1UD2A 3WQ6A 2DIEA 4FK9A 2XPKA 1V3MA 4JKMA 2JEPA 1DWJM 1QHOA 1AQMA 3WKZA 4KH2A 4PN2A 4L4OA 1GVYA 2J7DA 4M81A 1FH7A 1NWRA 1XYZA 4M24A 4GINA 4B9YA 4LPCA 4J3VA 1W1PA 1DWGM 4Z2IA 3CPUA 2WM0A 1GJWA 1OBAA 4MDPA 3VVGA 3WNNA 1B3XA 2VRKA 1JFXA 2ZUMA 3MUY1 5E6ZA 1XSIA 3AFBA 1O6IA 4R5EA 3WUEA 1GZJA 5C70A 3GYCA 1VJSA 3U7VA 3SCVA 1EDTA 3POCA 2PBOA 3BC9A 4JFTA 4HZ8A 1TG7A 2WPGA 4MDOA 2VR4A 3ZSSA 1XGZA 1C7SA 1CXLA 5A8MA 2E9MA 1H49A 3CUJA 4D6FA 1E6ZA 1HP5A 3DECA 1W1VA 2PWEA 1CZ1A 3ARXA 3AHZA 1KFWA 2V5CA 1AQHA 1V0MA 1E72M 5DT7A 3BAYA 4KRTA 2WZEA 1EOKA 3II1A 3EMZA 1CXIA 1J12A 1IV8A 3WFLA 1V3HA 5FL1A 1EO5A 2XHYA 2FH6A 2QLYA 1CPUA 1V02A 2WKGA 4QLJA 1GONA 3WDJA 3THCA 3VIGA 2WZIA 3UERA 5M5DA 2ZUVA 2X8RA 2FH8A 3ARRA 3KEHA 2VZOA 3MMWA 5AYBA 1E73M 3I3DA 1HKMA 5BXRA 3K4AA 2BS9A 5A6BA 3OGVA 3KZSA 2XIIA 2J7HA 1US2A 2BY0A 1UR9A 1QI0A 3EMCA 1E70M 4WKHA 1QVBA 1XHGA 1MQQA 2JFEX 1JYWA 1CXEA 1LWHA 3CHDA 5DT5A 5A94A 2VT0A 2DDXA 3PHAA 5AC4A 1ECEA 5GNXA 3B9EA 1MXDA 4AD4A 1E4LA 1MQPA 4JFWA 3WUGA 5CGTA 1HJVA 2FDMA 2YA1A 3UETA 2Z1SA 3UCQA 3VGEA 1PJ9A 1LLOA 3CMJA 4Z2KA 3HJEA 2A3EA 4AY1A 1WPCA 2XGIA 4PMYA 1RP9A 1NOWA 3SCOA 2DT0A 4TUFA 3ARUA 2WMHA 5JUVA 2G3JA 3RCNA 4ZFMA 3EDJA 1B30A 3B8SA 1V0LA 4Z2JA 1QW9A 5M17A 2EQDA 5D8WA 2WBKA 3BAXA 3GXDA 3SUSA 1ZBVA 1XH2A 2UY5A 4UQDA 1PZ3A 4WJXA 4P7OA 5M3WA 1MWOA 3DHUA 1M7XA 4D6EA 2EPMX 1EA9C 3L4VA 3OG2A 1FOBA 3CUIA 4AZ7A 2ZUWA 3AIVA 3VMPA 4AZCA 3GH7A 3IAPA 4W7WA 1CNVA 4B3LA 2E8YA 3TTSA 1CXFA 3N18A 1QNPA 1NWUA 1JXJA 1RPKA 4N42A 2O9PA 3AYSA 4J3WA 4ZE4A 3QOKA 4OJYA 1JZ8A 3ZJKA 1DWIM 1QHPA 4LYRA 4CU7A 2PI6A 3SUUA 2YBUA 3TOPA 5BXSA 7TAAA 4JZ5A 2EO7A 5A95A 5AY7A 1JL8A 1R7OA 1JD9A 2XFRA 2WNWA 1QNOA 3LPOA 1ISWA 3WQVA 1WZMA 2DT2A 3WF2A 4EE9A 1MXGA 1KXHA 1O7AA 4QFUA 1JZ6A 4P7LA 2D24A 2ZX8A 1GHSA 4JKLA 1TMQA 5BYWA 1EOMA 4DWSC 2XVLA 3IANA 3TONA 4M80A 1TUXA 1B2YA 1NP2A 5C71A 3ZT6A 1CXKA 4RE2A 3WL0A 4H41A 4LYQA 2JIEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XCW A;  2WMJ A;  1LG2 A;  1V6V A;  1HXJ A;  1KQZ A;  3AIQ A;  4MPK A;  3AS0 A;  3LPP A;  1MYR A;  1J01 A;  5CG0 A;  3RM9 A;  2XVG A;  3ZST A;  3FW6 A;  3AI0 A;  2J8G A;  4JIE A;  2WHJ A;  2EPO A;  4Z2H A;  5E70 A;  4F9J A;  3W4R A;  4V27 A;  1UWU A;  2E4T A;  1MW3 A;  1QI4 A;  2V3G A;  2V5D A;  2CYG A;  1X1N A;  3LMY A;  3L4Y A;  3CUH A;  1E3X A;  1KWK A;  2ZOX A;  2QHA A;  2J8F A;  2J77 A;  3FHA A;  3W25 A;  1DWH M;  4LGX A;  3BLK A;  3T2Q A;  3PTQ A;  5FKY A;  2Y24 A;  3WF0 A;  2BVT A;  2XVK A;  2GK1 A;  1GQK A;  3SUR A;  4UOQ A;  2W66 A;  1WDP A;  4NZC A;  4UQA A;  5I24 A;  1X6L A;  3OZO A;  1QNQ A;  3A3H A;  4GI9 A;  2EXO A;  4OBR A;  1VFO A;  3ZT7 A;  3RPM A;  5FD0 A;  4DM1 A;  1NWS A;  4NRS A;  1OD8 A;  2JE8 A;  4CD8 A;  5BCA A;  2WHL A;  1UKO A;  3SCT A;  2W61 A;  4F79 A;  4LXF A;  1E0W A;  2W5F A;  3AS3 A;  1ESW A;  1AQ0 A;  4M8U A;  3OZP A;  1VF8 A;  3VIM A;  1ISZ A;  1E0X A;  5FL0 A;  4E2O A;  1W9U A;  1LF1 A;  1V3K A;  1ZL1 A;  2W91 A;  1BFN A;  1V0N A;  1ZBK A;  4D6J A;  1A3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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