2PB1A

Exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-b-d-glucopyranoside at 1.9 a
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Candida albicans
publication title Exo-B-(1,3)-Glucanase from Candida Albicans in complex with unhydrolysed and covalently linked 2,4-dinitrophenyl-2-deoxy-2-fluoro-B-D-glucopyranoside at 1.9 A
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein XOG1
total genus 154
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2pb1A00
3DECA 1HF6A 3VNZA 4C7GA 1GQLA 3ZR5A 2Y5EA 5A8NA 1CTNA 3EDKA 4ZE4A 1BHGA 1UKPA 1WB0A 2DT3A 2D20A 3ZMRA 4MADA 1PEZA 1E1FA 2QLYA 4AMCA 5HXMA 5ABFB 4DWSA 1A47A 4AZGA 3IJ9A 2WVSA 2BNJA 1DWAM 5CQ1A 3ZJ8A 1E6RA 4W7VA 1YQ2A 5FL1A 4W8BA 1V3MA 3T2QA 2FHFA 1MYRA 4UQBA 1UD4A 2HISA 4OBSA 3VKKA 3GH4A 3PTMA 4UCFA 2W61A 4H7VA 1B3VA 1LWJA 3W0KA 2JF7A 4U3CA 1UD2A 3BMWA 2J7HA 5ECUA 2VMFA 4CCCA 1UH3A 4TXEA 3S2CA 1Q6CA 3EDJA 5IHSA 1PPIA 3VIOA 2XVGA 1R87A 3ARSA 2XM2A 2VZTA 3MUY1 2XGIA 1GQIA 1V6YA 3GBEA 4P8XA 4TVUA 3WH9A 5CSUA 2EPOA 2XM1A 3WF1A 1EHAA 1U2YA 1UA7A 4LXFA 2PC8A 1W2PA 1MXGA 2FH8A 3TONA 3VMPA 3UEQA 2ZWZA 4HOWA 2GDUA 1UA3A 4TTGA 1PX4A 1H2JA 1R7OA 1LWHA 2CHOA 4PUEA 4AZCB 5EMYA 3W38A 3WDRA 4PMXA 2ZX9A 1W3JA 5AC4A 3RCNA 5A6BD 3CHCA 4H8HA 2J62A 4OIFA 1TG7A 1RPKA 2D23A 4D1JA 2E9MA 3BAJA 2OYLA 2W92A 1O7AA 2XFRA 1JIBA 1VFOA 3KL3A 3TTQA 3GM8A 1Q6DA 1CBGA 4WKHA 2FGZA 4QLJA 4AEFA 3OLGA 3DYOA 4DWSD 4CD6A 2NT0A 3WDQA 4FLQA 3A4WA 1MVYA 3PZMA 2WNWA 2CNCA 3SUUA 5BROA 3OZOA 3MMDA 5LA1A 3FHAA 1KWGA 7CGTA 1EH9A 1GJUA 3MANA 3SCOA 1PX3A 2ZUUA 3T08A 1C7SA 3AROA 1Q6FA 1U33A 3IK2A 4FLRA 3EDEA 4UFLA 3SCQA 1QNOA 1NH6A 1V3LA 3IANA 3DHUA 1WE5A 3DYPA 3K1DA 4KGLA 3S6TA 3WBAA 1UR1A 4QP0A 4U31A 5D8WA 4R27A 4NI3A 5E0FA 1E6QM 1V3KA 5IDIA 4OOZA 3AXIA 3D3AA 1SMAA 3AISA 2J7FA 2DT1A 3OLEA 4P7QA 5I78A 1CIUA 1FA2A 1NWSA 3WF3A 1E73M 4CKQA 5F7UA 1LLOA 2MANA 4PMVA 1UHVA 1B9ZA 3WEOA 3DC0A 4H41A 3UG5A 2D3LA 3SCRA 1H09A 2BVYA 4W86A 5I77A 3OGSA 1CGWA 2Z1KA 1XCWA 2WVVA 1V6XA 3W53A 5M17A 4P7OA 1DWFM 2BY3A 1W9PA 3WFLA 3A6OA 2ZUTA 4KWUA 1RD6A 3AIUA 4HMCA 1QOXA 4J3TA 3SCVA 2IUZA 1V3HA 1UG6A 4CN6A 3ALGA 1E43A 2VCAA 2WKLA 3PHAA 4W84A 3K4AA 3HJEA 1UZ1A 3AI0A 2BVDA 4UQDA 1JYXA 3T0DA 1WO2A 2QHAA 3W37A 2YDQA 2WWCA 2BVTA 4M80A 2D24A 4HA1A 2ZICA 4NZCA 3POHA 3OBAA 1G94A 2UY3A 1KR1A 3QOMA 1MQRA 1GORA 4GINA 5CPSA 3FHQA 4TVDA 3N04A 1E3XA 5HNNA 1W32A 3ZT6A 4A3YA 4L4PA 3TP4A 1E71M 3E1F1 1UH2A 1SYTA 1JDDA 4UFIA 4DUVA 2WC7A 2WANA 4F66A 1GUVA 3PTQA 4GI8A 3TTYA 5A95A 4B15A 1GVIA 1XH1A 1JYWA 1LL7A 3AIEA 3VINA 3QHMA 2WC3A 4AD4A 5A69A 5A2CA 1JFHA 1UWSA 3U7VA 1PZ3A 3NSNA 2ZUNA 2B31A 1QI4A 2BHZA 2X0YA 5CLWA 1E72M 3OA5A 1V0MA 2WAGA 2HVMA 3WN6A 2G3NA 1C90A 3N1AA 1IZJA 1VEMA 3WKZA 4OUEA 5JBFA 2VX5A 3AHZA 2VNCA 3WY1A 2V3DA 3VUPA 2VCBA 1JF5A 4V28A 1JDCA 2ZIDA 4W8LA 1UWIA 1OIFA 8A3HA 2UY4A 1JZ2A 2WPGA 3L2LA 4U5IA 1JYVA 1ODZA 1CEOA 3BLPX 1CYGA 5I3DA 3GXFA 4AC1X 2FDMA 3SCTA 4U33A 1SFSA 1W9XA 5KEZA 3QR3A 4YHGA 5E9AA 2UWFA 2XVKA 3VM7A 1TVPA 1MW2A 2W66A 4XZBA 2ZXBA 1B1YA 4MNLA 5FCZA 1V6WA 4OOUA 2PWFA 3NSMA 4E4PA 3DHPA 4YHEA 2CIPA 4M1RA 3L4XA 4HOZA 1FHDA 3EDDA 2DT2A 3BAKA 3RM9A 4OZOA 2VURA 4HMDA 1JNDA 1RH9A 3EDFA 4OKDA 5BXPA 1WDRA 2VI0A 4TX8A 2BV9A 4B3LA 3CZEA 3WD4A 4CUCA 3AYSA 3RJYA 2OWXA 1KBKA 1J0JA 5D4YA 1QBAA 1XH0A 1GQJA 4MJ2A 4IPNB 4MAVA 5CG0A 4AZ5A 4AD3A 4CN4A 1UKTA 4LYRA 3T0BA 4UTFA 2CBJA 8CGTA 4NRRA 2GSJA 2CPUA 4PCSA 3U5YA 4LQ1A 4H8UA 3FNDA 4P8VA 2PWDA 2WKGA 2A3AA 3HMCA 2X8RA 4UR9A 4XB3A 3CBWA 3KWXA 1CECA 2CBVA 2E8YA 4TVCA 1OBAA 3OLIA 4ZXOA 1VEOA 5A94A 3NYDA 5A6SA 3I3BA 2D0GA 3I3DA 1GCYA 3ARQA 4JIEA 4B3KA 2VOTA 1UR9A 2CYGA 5BWFA 3BCDA 4ATLA 4D72A 3ECQA 3SUVA 5A6AA 5ABEA 1GOOA 1UYQA 4GQRA 1V6UA 4BQ2A 5FL0A 4PSRA 3PZQA 3VIIA 3W82A 2WLYA 3AIQA 3A47A 1FHLA 5HOSA 4UOJA 4D6JA 4MJ4A 4TTUA 3WNKA 1JXKA 3A4AA 3CZGA 1XHGA 1CWYA 2DQXA 4IM4A 1E4MM 2GJXB 3APGA 4JKLA 3FW6A 1VENA 1JF6A 4UOZA 2D2OA 3VO0A 3MSGA 4QCEA 3WDHA 4WIWA 3VMOA 2GVYA 4C7DA 2X2YA 1CXEA 4E8DA 3AOFA 1QBBA 3IJ7A 2QMJA 4J3SA 4HPHA 2YKKA 4CVWA 1LG1A 1G01A 2VL4A 1J9YA 4PMRA 1HNYA 3VGDA 1LL4A 1KWKA 5M5DA 1FH8A 2J7DA 2W67A 2J4GA 1JAEA 1H4PA 4OJYA 2Y8VA 1IT0A 1DWJM 1J0IA 1GQKA 1X1NA 2DGAA 2WCAA 2OSYA 4M81A 1LG2A 1XGZA 5CXPA 1OGSA 1UWQA 2VJXA 1J12A 2VT0A 4L4OA 2V5DA 2E40A 3VGHA 1MW0A 2C7FA 4JL1A 3ZM8A 2Y8KA 3AZRA 1Q6EA 3K8MA 3BXWA 3W26A 3WDIA 4A4AA 1OD0A 4AZHA 1CXLA 4W85A 3SCSA 4CU8A 5D9PA 2VUYA 3WNNA 5ABGA 2VCCA 3TTSA 1TA3A 1AMYA 1BYCA 1I1XA 1SR0A 4P7NA 1G5AA 5I24A 4NSBA 4J3VA 1VAHA 2XHYA 1QNQA 3GNOA 1E55A 3BSGA 2G8ZA 2A3BA 1HJUA 4EAMA 5A8OA 4GKLA 3MUZ1 1NWUA 1V02A 4CCEA 1QHOA 3CGTA 1DWIM 3A3HA 5E70A 4TX6A 4ZE5A 2ZX6A 3VGGA 4XX6A 3U5UA 4D6HA 4HZ8A 1VJSA 1BPLB 2X0HA 2ZUVA 3BAXA 4AW7A 3W6MA 4GXPA 4PMUA 2J75A 4PMOA 4M24A 1E56A 5FKYA 1KCKA 2YLAA 5EFFA 1E1EA 1O6IA 1J0YA 2VR5A 3VIGA 2D1ZA 2VRJA 2WMIA 3LPPA 3M6DA 4P8UA 1NP0A 4FK9A 1IZKA 3BAIA 3W25A 5AYIA 1DP0A 1ZU8A 4S3JA 2XFYA 1QHZA 2DSKA 1GOQA 2Y4SA 1V3IA 1NOUA 3ZSSA 5CZKA 3ZJKA 1W2VA 5GPRA 1CGTA 2J74A 3WMCA 4UQCA 3WSUA 1Z32X 1KXTA 2EPLX 1R7AA 3WDJA 1HJXA 4DWSB 5BRPA 1KB3A 3RDKA 3TOPA 2E9LA 3BH4A 1E4LA 3IAQA 2ZX5A 3WMSA 1LF1A 1L8NA 1C93A 3AHXA 1EO5A 2WHLA 2EO7A 2G3JA 2WSKA 3EMCA 1EA9C 1K9EA 1JZ4A 1CGVA 1JI1A 2YBTA 2AOSA 3RM8A 2IXUA 2PWGA 4AZCA 2WBGA 3MUIA 4JHZA 1WP6A 2CXGA 3ZSTA 3AS1A 3CH9A 3CUJA 3MKKA 1C8QA 5A6MA 4CVUA 2XFFA 1V03A 1WCGA 1RP9A 4K68A 1DEDA 4XZWA 1B3XA 2V38A 1KR0A 2J79A 2XIBA 2EPNA 3EBVA 2VC9A 2Q8XA 4Z2LA 1QW9A 2J77A 2VQUA 1HVQA 2JIWA 4MB4A 3ZOAA 4MDPA 2YOCA 3RIKA 4RL3A 4WLCA 4WSJA 1X6LA 1QI0A 2OLHA 4E2OA 3RM4A 4AISA 3NDYA 3GXIA 3VTRA 2PWEA 1W3HA 1XC6A 5HPCA 4B16A 1CLXA 3QHOA 1HXJA 1FOBA 3GXDA 2V3EA 3CUHA 1XSJA 5C71A 2PBOA 1WNOA 4AZBA 4MB3A 1S46A 2ZUWA 4N0RA 3MSDA 1E6XM 1EO7A 2DEPA 2JEQA 2DDXA 3NSXA 5A6LA 1R85A 5BCAA 4GPNA 1BGAA 1JG9A 1J0ZA 4P7LA 2PI6A 4PTVA 1H0IA 3N13A 4AIEA 2G3IA 1HKJA 3QOKA 2O9RA 1L0PA 4HU8A 5HPOA 3AIBA 5A2BA 1GVYA 4ML4A 1UUQA 1JD7A 3WH8A 2WW5A 1W3LA 4TUFA 1EIBA 3KZSA 4D6EA 1J01A 3ZR6A 1VBRA 3N12A 2ZX7A 3WNOA 4ZENA 1W1PA 2OWWA 5D9OA 3U7BA 3SIMA 1BLIA 1JGIA 1BG9A 1M01A 1EXPA 3CZJA 1ISYA 2RGLA 2XPKA 4D6DA 3WENA 3WH5A 2YL6A 3VD9A 3N11A 3T09A 1BGGA 1RP8A 3LPFA 3UR7A 4QLKA 3D5HA 4YN5A 2NW0A 4HZ7A 4CCDA 5DFAA 4ATDA 1LQ0A 5FD0A 4M8UA 2XVLA 3WQWA 3GH7A 1E5NA 3UESA 4B9YA 5BXRA 1VF8A 5CPQA 1K9TA 2D3NA 1ISZA 4HTYA 4FF5A 5TD4A 4D1IA 5A8QA 2ZE0A 2A3EA 5GNYA 1W1TA 1D7FA 4PTMA 3SCUA 3TA9A 2WVVB 2E4TA 3A4XA 4FLSA 3VD5A 3K8KA 4RE2A 3GXMA 2WZIA 4BQ3A 2J8GA 1WZMA 3WEZA 3OB8A 1W9BM 4KH2A 1K9DA 1A3HA 4LYQA 3VIPA 1UR8A 1WZAA 2O9OA 1HL9A 1JZ5A 4JFWA 5I6SA 2WHJA 3ZJ7A 3ZJ6A 1E6PA 5C70A 5A1AA 3II1A 1QI2A 2J25A 2NT1A 1NOFA 2JALA 4QAWA 3UG3A 1E0WA 2OSWA 2WHKA 3G6MA 3W29A 3W6LA 4QFUA 1UOKA 4AIOA 3WUGA 3VIHA 5CGMA 4AYSA 1PZ2A 3VM5A 4BS0A 2X05A 1PJ9A 2J7EA 2BY0A 5DF0A 1UQYA 3PZGA 3LPOA 2W4XA 3L4YA 2JE8A 3O6AA 5I5RA 1ZJAA 3DYMA 2OYMA 3M46A 2XJ7A 1JD9A 1XYZA 3PZUA 5EBAA 1CDGA 4FLOA 1E3ZA 1HL8A 4BF7A 1ZJBA 4JFVA 3F5KA 2FGLA 4WK9A 2AMGA 3FAWA 4BQ4A 2ZOXA 5DEZA 4F9DA 4EKJA 3T2PA 2GK1A 4NF7A 3AYRA 4AZ6A 3CTTA 1J10A 3LPGA 4U5KA 1BSIA 2VZOA 1GOMA 4AY1A 5IFTA 3KL5A 2OWCA 5AYBA 1M53A 2YJQA 2F8QA 1YHTA 1XSKA 3VX0A 5BRQA 3AMDA 5HDRA 1BVZA 1PAMA 4UQEA 1UWRA 1V08A 2CETA 1E4NA 3RO8A 3KEHA 1WPCA 4D6GA 2ZXAA 1X6NA 1WDSA 2JF6A 2XWEA 2YDSA 4WSKA 3MU7A 4PSPA 2J78A 2XWDA 1EOMA 3FY1A 1ZL1A 2CKRA 4GQQA 3SUTA 2JIEA 1HIZA 3VGFA 1C91A 3PZVA 4RE3A 1XSIA 1EQPA 2XSBA 4P8WA 1XCXA 4C7FA 1CGYA 1JNEA 1V0LA 4DUWA 1K6AA 4PMYA 3BAYA 3GTNA 4PMQA 4MPKA 4Z2HA 3PZTA 1VB9A 4AD1A 4GZIA 4X0NA 2XG9A 3HN3A 2X1IA 1VJZA 2D22A 4MNJA 1MW3A 1MQPA 1FFRA 5DT5A 3VDCA 3CUIA 1VBUA 3VU2A 4CN1A 4ZEPA 5DO8A 2D0HA 3WH6A 4MDOA 4BA0A 4BZYA 1BVNP 2GDVA 5DT7A 1QNPA 3J7HA 1DTUA 2GJPA 1KCLA 1G0CA 4UZUA 2PWHA 1OGBA 5M3WA 4JCMA 1TVNA 1Q6GA 3ARRA 2XVNA 1CXKA 1UH4A 2G3MA 5DMYA 1UD6A 1CXFA 4LGXA 1C8XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3DEC A;  1HF6 A;  3VNZ A;  4C7G A;  1GQL A;  3ZR5 A;  2Y5E A;  5A8N A;  1CTN A;  3EDK A;  4ZE4 A;  1BHG A;  1UKP A;  1WB0 A;  2DT3 A;  2D20 A;  3ZMR A;  4MAD A;  1PEZ A;  1E1F A;  2QLY A;  4AMC A;  5HXM A;  5ABF B;  4DWS A;  1A47 A;  4AZG A;  3IJ9 A;  2WVS A;  2BNJ A;  1DWA M;  5CQ1 A;  3ZJ8 A;  1E6R A;  4W7V A;  1YQ2 A;  5FL1 A;  4W8B A;  1V3M A;  3T2Q A;  2FHF A;  1MYR A;  4UQB A;  1UD4 A;  2HIS A;  4OBS A;  3VKK A;  3GH4 A;  3PTM A;  4UCF A;  2W61 A;  4H7V A;  1B3V A;  1LWJ A;  3W0K A;  2JF7 A;  4U3C A;  1UD2 A;  3BMW A;  2J7H A;  5ECU A;  2VMF A;  4CCC A;  1UH3 A;  4TXE A;  3S2C A;  1Q6C A;  3EDJ A;  5IHS A;  1PPI A;  3VIO A;  2XVG A;  1R87 A;  3ARS A;  2XM2 A;  2VZT A;  3MUY 1;  2XGI A;  1GQI A;  1V6Y A;  3GBE A;  4P8X A;  4TVU A;  3WH9 A;  5CSU A;  2EPO A;  2XM1 A;  3WF1 A;  1EHA A;  1U2Y A;  1UA7 A;  4LXF A;  2PC8 A;  1W2P A;  1MXG A;  2FH8 A;  3TON A;  3VMP A;  3UEQ A;  2ZWZ A;  4HOW A;  2GDU A;  1UA3 A;  4TTG A;  1PX4 A;  1H2J A;  1R7O A;  1LWH A;  2CHO A;  4PUE A;  4AZC B;  5EMY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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