3SUUA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with gal-pugnac
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-hexosaminidase
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
source organism Paenibacillus
total genus 193
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3suuA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3suuA02
3VTRA 1H11A 1BPLB 2YDSA 4UQEA 2CESA 3ZR6A 3VD9A 4YHGA 4EANA 4PMDA 1R7AA 1UKPA 3W24A 2WVVB 4PMYA 4M29A 4UQBA 3WH5A 3W53A 3WH8A 2Y8KA 1JZ5A 1LG2A 3A4WA 4D6IA 1LF1A 2ZUNA 1JGIA 1E6QM 2CKSA 3SCVA 1DHKA 2J75A 1V0KA 2OSXA 1IV8A 3WY1A 1YHTA 4E4PA 2JIWA 1J01A 2D20A 3IK2A 5GNZA 1CXFA 4D1IA 1CXLA 1G0CA 3WL1A 3IJ9A 1XV8A 3VDBA 2E40A 2WLYA 3CUGA 4IM4A 3AXIA 3AIRA 1GOKA 1TVPA 3SUSA 1NWRA 5A2CA 3U7BA 1CYGA 2V3EA 5I6SA 2BVDA 5E6ZA 2VRJA 4AD5A 3WQ6A 2ZXAA 1WE5A 3FY1A 1WDSA 1W1YA 2RGLA 5CG0A 1Q6EA 4KRTA 3VKKA 5GNXA 3CZJA 3WQWA 1XGZA 2XHYA 4CN6A 1ZBKA 3UESA 3II1A 3WDIA 4AZIA 1JXKA 2V3GA 2PBGA 4PSRA 1CDGA 1JZ8A 1E6NA 4QLJA 4ZFMA 1Y7VA 5E0FA 4E8CA 4HZ6A 4P8VA 4JFUA 3NYDA 3EMCA 4D1JA 2GDUA 4KH2A 2ZE0A 3VDHA 3GDBA 1JZ6A 1W32A 2XGIA 3O9NA 3NUKA 3I3EA 2PWDA 2JF7A 4LXFA 1EDGA 1ITXA 4UOZA 4M81A 2DSUA 1XYFA 2WWDA 8CGTA 3S6TA 4W5ZA 1R86A 3VMOA 1JG9A 1FOBA 1E73M 1J12A 4W93A 1HX0A 5JUVA 5DFAA 2IXVA 3CGTA 3PZQA 3VDAA 5FOOA 1HJQA 3VNZA 3W4RA 3AS3A 3M6DA 3QHNA 1UA3A 3TTSA 4JKKA 3RJYA 1TZ7A 5BRPA 3W25A 1BVZA 4DUWA 4BZYA 1XYZA 2VUYA 3WMCA 3VU2A 3KWXA 1DWJM 4ZXOA 1BHGA 1G1YA 1J0ZA 4TXEA 1ODUA 4H8UA 4HZ7A 4GZIA 4E8DA 4F9DA 2CHOA 2GVYA 3CZGA 2CCRA 5ABEA 4JKMA 3VIJA 3BLKA 1UUQA 4CD6A 4C90A 3CTTA 5I24A 3AI0A 3ZSTA 1GONA 1OIFA 1WZKA 1L0PA 3ZR5A 1UR4A 2VVSA 2FGLA 1FHDA 4Z2IA 2V5CA 1C8XA 3VM7A 3FHQA 4NF7A 4J3SA 2DH2A 1V6VA 5I23A 1MW1A 1ECEA 4CU7A 1BYAA 1GOWA 1OIMA 1Q6DA 3AXHA 2Y2WA 3CZ8A 4UQAA 1CENA 3SCQA 2W4XA 1H0IA 2GJXB 3WFLA 3AHZA 3W82A 5CZKA 5FCZA 1MQRA 2UY3A 1LLOA 1GJWA 1E56A 4BQ5A 2JEPA 2VT0A 1VBUA 2J7FA 2JALA 3HJEA 1K9EA 2E0PA 5M3WA 1PBGA 2DSVA 2G3IA 3W6LA 4CU6A 2BV9A 1CZ1A 1W91A 3AMDA 3ZT6A 1UD2A 3A4XA 4LYPA 1QI5A 1GW1A 1X1NA 3KZSA 4HU8A 4UFLA 1ODZA 1LL4A 1ZL1A 4GKLA 3GH7A 1JZ4A 3CMJA 1XD0A 1VB9A 2WZIA 3T2OA 1HVXA 3W37A 2DH3A 2WW5A 1NOUA 1UHVA 2ZUSA 4TOQA 4YHEA 1NH6A 1J0JA 1DEDA 4AIOA 2EPMX 2XSBA 5E70A 4C7FA 2Z1KA 3WQ5A 6CGTA 4DWSC 2CHNA 3MMDA 1MQQA 3ARVA 1B3ZA 2DIJA 3SEPA 3NJ3A 4PMZA 5A95A 1QI2A 2WHKA 1UG6A 5ABHA 2WMFA 4AIUA 2D0FA 2A3HA 2WMIB 2ZUVA 3N04A 1TMQA 4ACZA 1ZBVA 3QOMA 1W3LA 4MB5A 2JFEX 1ISXA 4AXNA 1U30A 1QNOA 1S46A 3BC9A 3WNMA 2EJ1A 1Z32X 1I1XA 4CN1A 1TA3A 1US2A 3ZOAA 4B15A 2VCBA 3PZOA 1UWTA 4KGJA 2EQDA 1D3CA 4UQ9A 3AIQA 1NWTA 5DF0A 4MB1A 4K68A 2WCSA 1C7SA 3ZJ8A 3I3DA 1UZ4A 1EHAA 2G4FA 5A8PA 4NZCA 1OD0A 1C8QA 1CGUA 2VRQA 1OB0A 1V0NA 4D6HA 1WCGA 2BHYA 4U31A 3SUUA 4H8VA 4AZ6A 1XSIA 1QNQA 1JD9A 3O2LA 3VO0A 2QMJA 3FNDA 4N0RA 1BTCA 1CPUA 2BNJA 1SR0A 1SMAA 5EBAA 3ZO9A 2C7FA 2WMJA 1KCLA 4HA1A 3L4VA 4AEFA 1DP0A 2CBUA 3BSGA 5IFTA 3ZQ9A 3MMWA 4TX6A 2D0GA 1HJXA 3L4TA 1H0GA 4M80A 2G3MA 2UWFA 3AS1A 1CBGA 5A6BA 3WF2A 2ZICA 4AYSA 1VF8A 5D9OA 1MW0A 1NOWA 2BY1A 4WIWA 3AS0A 4UOQA 3AXXA 5A8QA 5I3DA 4MPKA 2VCCA 3WH9A 4ACYA 4D6GA 2BS9A 2PBOA 2D1ZA 5DEZA 2XIIA 1GVIA 3B8SA 1XC6A 2G41A 1OM0A 4EKJA 1IZJA 4HMDA 5DT7A 3DECA 2FHBA 3VM5A 4UOJA 4GO9A 3UEQA 1EO7A 2J8FA 1DWFM 4ATDA 3SUVA 9CGTA 3ARRA 1LWHA 3OZOA 5BYWA 1JNEA 1SFSA 4MNLA 3CUJA 3WNNA 4CN4A 4TTGA 3BAYA 3MUIA 3CMGA 2WHJA 4FLOA 3THDA 3RM8A 2ZXDA 3CZLA 2ZX5A 2WAGA 2ZUTA 1KWGA 3MV01 2DIEA 4S3JA 1W3KA 4F79A 1H41A 1BGAA 3OBAA 2D24A 4OKDA 4CKQA 4Z2KA 1JAKA 1UA7A 2J74A 3ARXA 3CLWA 2ZX8A 4UCFA 1SYTA 1DWIM 3WUBA 2WNWA 3ARPA 4PMRA 1JAEA 4JHZA 3SCPA 4H04A 4QFUA 4JCMA 1D2KA 4EK7A 8A3HA 4CGTA 5CSYA 1ISZA 3W26A 3WBAA 4WKFA 5FIPA 1VRXA 5A6LA 4WJXA 2XVKA 4GXPA 4EAMA 4UQDA 3N12A 1XH2A 1EA9C 4NSBA 7A3HA 1PIFA 3N13A 2GDVA 1OBAA 4CD4A 2OYMA 4WKHA 5ECUA 5C71A 2VJXA 2OWWA 5DMYA 1W9BM 4MJ4A 2WK2A 3VIIA 1FFQA 1CTNA 3WBEA 2ZUMA 3DYMA 4ATWA 3ALGA 1PJ9A 3DHPA 1WP6A 1TVNA 2E9LA 1E5NA 1QI3A 3CIVA 2VZTA 2J7GA 4JL1A 1GOOA 5I77A 2CERA 2VC9A 5JBDA 4Z2JA 1EHNA 3CHEA 2WHLA 2YDRA 1PZ3A 1MYRA 2GJXA 3LMYA 2BXZA 4XX6A 3VX1A 3WD2A 5HBFA 2WBGA 2B31A 3GH4A 1MW2A 4Y7EA 2BXYA 1GORA 4WF7A 3BCFA 1UH4A 4W8AA 2PC8A 5E9AA 4W5UA 5BCAA 4DWSD 4DUVA 1GHSA 5BXRA 2XFYA 2E8YA 4W86A 3D5HA 2J7BA 2DQXA 3T0DA 4DM1A 1JFHA 4BQ3A 5D8WA 1O6IA 1EGZA 4FK9A 1HL8A 5A2AA 3VIFA 1JIBA 2OWXA 3TOPA 4TVCA 4AZBA 3LPGA 1V0MA 2O92A 1ISWA 5BROA 2IUZA 4HOZA 3FAXA 2WSPA 1A3HA 3NDZA 3QOKA 2DSZA 4GI6A 3UR7A 2VX5A 4UZUA 3M07A 5D9MA 2D2OA 3VIOA 4NRSA 2W62A 1EIBA 3ZT5A 2E4TA 5EMYA 1NQ6A 1BG4A 5BWFA 4HOWA 4CVUA 4JAWA 1RP9A 2ZWYA 1HNYA 2CETA 5IDIA 3MU7A 4F9JA 2XM2A 3TTOA 2NW0A 1XSJA 3IJ7A 3BAIA 4MTVA 2Y5EA 4CD5A 4MNJA 4ZXLA 1B30A 1JDDA 2OYLA 3NSXA 1E4NA 2WMIA 5CXPA 1W3JA 4HPGA 1H2JA 2QPUA 3VD3A 4DWSB 1GQKA 4RL3A 4UR9A 3A4AA 2Q8XA 3BGAA 3FW6A 4PMQA 1I75A 2VCAA 2QF8A 2WWCA 3EDFA 2D3LA 2CBJA 2X0HA 1XH1A 5JIPA 2YL5A 4P7NA 1V3IA 3VILA 1US3A 2WLZA 1JZ3A 4JL2A 4YN5A 1WZAA 3SCRA 1WDRA 5HDRA 3GZAA 3SCOA 1ZBWA 1HJWA 1BGGA 1LJYA 2W66A 2ESCA 1KB3A 3BAWA 1QW9A 4PBGA 1PIGA 2VR4A 2ZX6A 2UY5A 1BG9A 2WC3A 1UWRA 1AMYA 1C91A 2XGBA 5A6MA 1W9XA 1E72M 2VURA 4MAVA 3QHOA 1EO5A 2WKGA 4H2CA 1RPKA 4HTYA 4CCEA 1B9ZA 4CD8A 4B9ZA 4AD0A 4IUGA 1Q6GA 2BVTA 4AMCA 1B3WA 4OIFA 4AD3A 5AY7A 4H8HA 1V0LA 3GBEA 3E1F1 5E0CA 2V3DA 2FH6A 1HKMA 2DEPA 1UH3A 1JXJA 5M17A 2PWHA 1E70M 3WD4A 3N11A 5HXMA 4GZEA 1QNPA 2J7EA 3T2PA 4F66A 4ZE4A 2W91A 4P7OA 1UWIA 4URIA 2ZX7A 1K6AA 3AOFA 1XCXA 3ZMRA 1R8LA 3N18A 4KWUA 3T09A 5LYRA 3WSUA 1KWKA 1DTUA 3WFZA 4Q22A 3DC0A 3WD0A 5LA0A 3F5JA 3QHMA 4N42A 2CNCA 1PX3A 1MFVA 2XSAA 1VFFA 4UQCA 3ZSSA 1M01A 5IHSA 3GNOA 4CD7A 4QP0A 1W3HA 1XD1A 5CPQA 3THCA 3AHYA 1X6LA 1ITCA 1FP9A 2VR5A 4JFSA 2EPOA 2EPLX 4AW7A 1C8YA 1M04A 1MVYA 3UERA 3VGBA 1E6SM 4PRWA 1J11A 1B3XA 3VD5A 5BXTA 4AWEA 1ZB5A 1OGGA 1V3LA 3MSDA 3U7VA 4MDPA 1UH2A 5AC5A 1GOIA 2QHAA 5CGMA 2EPNA 3L4WA 3WUGA 1QOXA 4AZGA 1PX8A 3KEHA 4TUFA 4KGLA 3RO8A 4DUXA 2Y8VA 3AZRA 1CGVA 1KR1A 3CUIA 4JFWA 3OLEA 1JFXA 1UKSA 3WF0A 3WQVA 1V6UA 4BQ4A 5A69A 3NCOA 4GINA 5JBFA 1H49A 1BFNA 2WKLA 3WL0A 1D7FA 1H1NA 4HA4A 5TD4A 5AYIA 6TAAA 1EOKA 3CZEA 4HZ8A 3W27A 4MJ2A 3AIVA 3LPPA 4IPNB 3AMCA 1GCYA 2WZHA 2E9MA 4UFKA 1ISYA 4W7UA 2XUCA 2VOTA 3PN8A 4P7RA 3RIKA 2WYSA 1BYBA 3RILA 4D6DA 2ZX9A 1B3YA 1H3GA 3VOCA 1FH7A 2VZSA 1GQLA 1P6WA 2EBNA 5E6YA 3F5KA 3MUAA 1C92A 3RJXA 2WZEA 5AYBA 3JUGA 4R27A 2GJPA 4HOXA 3WENA 3AYRA 4MAZA 2QLYA 3BCDA 1C90A 1OINA 4XUYA 4TVDA 3WDRA 2J7DA 1FA2A 3OIHA 2WMHA 3AMKA 1V3MA 5CPTA 4U2ZA 2J79A 2CBVA 5CSUA 4MADA 4Q7NA 1BVNP 2WSKA 2YL8A 1W9PA 2YA0A 2WC4A 4GI8A 3ARUA 2E3ZA 2DT3A 3AICA 2D3NA 2EEXA 2UY4A 5F7UA 1WZMA 4L4PA 4ZEPA 2WB5A 1UZ1A 5CLTA 4U2YA 4J3UA 2O9RA 2NT0A 3K4AA 4S3KA 3VDCA 1E4IA 1E6PA 3EDKA 5CQ1A 1VAHA 4BS0A 2J8GA 3J7HA 2WCAA 3VNYA 4WSJA 2DSWA 1V6WA 1E0WA 3TA9A 3WN6A 4M56A 3N1AA 4W7WA 3BMVA 3BXWA 1QHOA 3KL0A 1WO2A 1CXKA 5A6JA 1KXVA 4J3TA 1V6XA 1JZ2A 5D9PA 3OLGA 2A3EA 4W8BA 1HVQA 1VJSA 2YJQA 3U5UA 2PWEA 4M82A 1UWQA 4HU0A 4OZOA 2IXUA 2V38A 1BF2A 3POCA 1WDQA 3EDJA 4Z2LA 5A94A 2C0HA 1HKKA 1TE1A 1LL6A 1ZJAA 1RH9A 4UFIA 3OZPA 1JNDA 4FLQA 3AIBA 2JEQA 1CECA 4JIEA 4PUEA 3U57A 2J47A 3WUFA 1KBBA 4PMOA 1E4MM 4FF5A 3POHA 2EPKX 3WMSA 4KRUA 4AY1A 5I5RA 3ALFA 3BAXA 3WD3A 3EYPA 1V3KA 4J7RA 2X2YA 3RM4A 1G01A 1PPIA 2GK1B 3AMLA 4GPNA 1QPKA 2ZIDA 3OA5A 3VGDA 4XZWA 4L4OA 2X05A 4V2XA 4GQQA 4DWSA 2VZVA 1H5VA 1DWHM 3ZIZA 2G3JA 1CGXA 5A6AA 3BMWA 1JYXA 3APGA 1FHLA 2AAAA 1OGBA 1M03A 4GO8A 4OOZA 5BXPA 3UCQA 1KR0A 1VFOA 1GPFA 1TCMA 2DT1A 4LPCA 4Z2HA 2XFRA 3ARTA 5I0DA 3K1DA 4LX4A 4OBRA 3ARZA 3PZVA 3HU7A 3EBVA 5KEZA 3K8KA 3TTYA 3L4YA 1JYNA 1HT6A 3WDQA 2OLHA 3NSMA 3UG5A 3T0AA 3WNKA 4NI3A 4CCCA 1NM9A 4W88A 2VTFA 3SURA 3OG2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VTR A;  1H11 A;  1BPL B;  2YDS A;  4UQE A;  2CES A;  3ZR6 A;  3VD9 A;  4YHG A;  4EAN A;  4PMD A;  1R7A A;  1UKP A;  3W24 A;  2WVV B;  4PMY A;  4M29 A;  4UQB A;  3WH5 A;  3W53 A;  3WH8 A;  2Y8K A;  1JZ5 A;  1LG2 A;  3A4W A;  4D6I A;  1LF1 A;  2ZUN A;  1JGI A;  1E6Q M;  2CKS A;  3SCV A;  1DHK A;  2J75 A;  1V0K A;  2OSX A;  1IV8 A;  3WY1 A;  1YHT A;  4E4P A;  2JIW A;  1J01 A;  2D20 A;  3IK2 A;  5GNZ A;  1CXF A;  4D1I A;  1CXL A;  1G0C A;  3WL1 A;  3IJ9 A;  1XV8 A;  3VDB A;  2E40 A;  2WLY A;  3CUG A;  4IM4 A;  3AXI A;  3AIR A;  1GOK A;  1TVP A;  3SUS A;  1NWR A;  5A2C A;  3U7B A;  1CYG A;  2V3E A;  5I6S A;  2BVD A;  5E6Z A;  2VRJ A;  4AD5 A;  3WQ6 A;  2ZXA A;  1WE5 A;  3FY1 A;  1WDS A;  1W1Y A;  2RGL A;  5CG0 A;  1Q6E A;  4KRT A;  3VKK A;  5GNX A;  3CZJ A;  3WQW A;  1XGZ A;  2XHY A;  4CN6 A;  1ZBK A;  3UES A;  3II1 A;  3WDI A;  4AZI A;  1JXK A;  2V3G A;  2PBG A;  4PSR A;  1CDG A;  1JZ8 A;  1E6N A;  4QLJ A;  4ZFM A;  1Y7V A;  5E0F A;  4E8C A;  4HZ6 A;  4P8V A;  4JFU A;  3NYD A;  3EMC A;  4D1J A; 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 1Q6D A;  3AXH A;  2Y2W A;  3CZ8 A;  4UQA A;  1CEN A;  3SCQ A;  2W4X A;  1H0I A;  2GJX B;  3WFL A;  3AHZ A;  3W82 A;  5CZK A;  5FCZ A;  1MQR A;  2UY3 A;  1LLO A;  1GJW A;  1E56 A;  4BQ5 A;  2JEP A;  2VT0 A;  1VBU A;  2J7F A;  2JAL A;  3HJE A;  1K9E A;  2E0P A;  5M3W A;  1PBG A;  2DSV A;  2G3I A;  3W6L A;  4CU6 A;  2BV9 A;  1CZ1 A;  1W91 A;  3AMD A;  3ZT6 A;  1UD2 A;  3A4X A;  4LYP A;  1QI5 A;  1GW1 A;  1X1N A;  3KZS A;  4HU8 A;  4UFL A;  1ODZ A;  1LL4 A;  1ZL1 A;  4GKL A;  3GH7 A;  1JZ4 A;  3CMJ A;  1XD0 A;  1VB9 A;  2WZI A;  3T2O A;  1HVX A;  3W37 A;  2DH3 A;  2WW5 A;  1NOU A;  1UHV A;  2ZUS A;  4TOQ A;  4YHE A;  1NH6 A;  1J0J A;  1DED A;  4AIO A;  2EPM X;  2XSB A;  5E70 A;  4C7F A;  2Z1K A;  3WQ5 A;  6CGT A;  4DWS C;  2CHN A;  3MMD A;  1MQQ A;  3ARV A;  1B3Z A;  2DIJ A;  3SEP A;  3NJ3 A;  4PMZ A;  5A95 A;  1QI2 A;  2WHK A;  1UG6 A;  5ABH A;  2WMF A;  4AIU A;  2D0F A;  2A3H A;  2WMI B;  2ZUV A;  3N04 A;  1TMQ A;  4ACZ A;  1ZBV A;  3QOM A;  1W3L A;  4MB5 A;  2JFE X;  1ISX A;  4AXN A;  1U30 A; 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