3C2OA

Crystal structure of the quinolinate phosphoribosyl transferase (bna6) from sachharomyces cerevisiae complexed with quinolinate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
293
structure length
265
Chain Sequence
PVYEHLLPVNGAWRQDVTNWLSEDVPSFDFGGYVVGSDLKEANLYCKQDGMLCGVPFAQEVFNQCELQVEWLFKEGSFLEPSKNDSGKIVVAKITGPAKNILLAERTALNILSRSSGIATASHKIISLARSTGYKGTIAGTRKTTPGLRRLEKYSMLVGGCDTHRYDLSSMVMLKDNHIWATGSITNAVKNARAVCGFAVKIEVECLSEDEATEAIEAGADVIMLDNHFLLECSGGLNLCDDIDIYSTSSIHQGTPVIDFSLKLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Comprehensive X-ray Structural Studies of the Quinolinate Phosphoribosyl Transferase (BNA6) from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 88
structure length 265
sequence length 293
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2008-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c2oA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3c2oA01
2H6RA 1HTIA 1YXCA 3WJZA 3DKJA 5G2HA 2CU0A 3TMQA 3HG4A 1VRDA 3IVTA 1OX4B 3LXCA 5DBUA 3WK2A 3EX6A 4FNSA 5IBXC 2GOUA 4MY8A 3L0GA 1DOSA 2Y70A 2C14A 3N2XA 4Z1DA 3RF9A 1TJPA 3NPUA 5CZ0A 1OK6A 3DHFA 4JTHA 4JX6A 4O12A 1KM3A 1ME9A 4JN6A 3PBVA 1AW5A 2E77A 3R13A 4O19A 4NJJA 2ZQ0A 1SZNA 1H7OA 3G1HA 4GWEA 3W1XA 3TFXA 3MYPA 3N14A 4CNOA 3CTLA 4LV9A 2QR6A 1HFBA 1BWLA 4IOTA 1J4EA 4AF0B 4R53A 5LNRA 4N4PA 1XKYA 4UXDA 3LCLA 3HGRA 3HGSA 3G1YA 4FIQA 5AC6A 3DFOA 2Y85A 5BMWA 3LHUA 3P81A 1G7VA 3G3MA 2E5DA 3ANYA 1RV8A 5EY5A 1TJRA 1XC4A 5D04C 4QM1A 4FNQA 3QEZA 1YLVA 3WJYA 2I14A 3SFKA 3P7YA 1I2PA 3GDRA 3W7GA 5FF0A 4NT0A 1JCXA 1QMLA 4XBKA 3LTYA 1NEYA 3C2RA 5K3VA 1OX6A 4IX0A 3W7EA 1ALDA 5C5YA 4N9CA 4LS2A 4DF1A 3NGJA 4QSHA 5AN7A 5HWMA 3G8EA 1OG0A 4AWSA 1G6CA 1KTCA 2JGQA 2ZTJA 2ABAA 4UR8A 1LLZA 3M44A 2EPHA 5DELA 3FA5A 1TRDA 2YFOA 3UZJA 3NQDA 1PL9A 4QITA 1PCWA 4RZ6A 2A6NA 2R14A 3OEXA 4OHQA 2E6FA 4MVAA 1PV8A 3QMRA 4HSNA 5DXXA 3WK0A 2TYSA 3ZWTA 2YYUA 1RQBA 4IQLA 1L6WA 3LBMA 4N9BA 4H6KA 1SW0A 1WBHA 3LV5A 3HGJA 1N8FA 1GVRA 5FESA 3GKAA 1AMKA 1G7UA 4E38A 1W56A 4KFOA 3TV8A 3C52A 1RPXA 3DFPA 1OFRA 4JYFA 3H53A 3W3OA 1IXQA 1OX4A 4UNKA 4WY0B 2NX3A 1SUXA 4BWLC 4O14A 3W84A 4JXCA 4IWWA 3UPBA 2C19A 5LZLA 2TMDA 3NYZA 5CGQA 3IGUA 5AYYA 2A21A 2WO5A 3CEUA 3NL2A 4O10A 1WOAA 1LOQA 1YADA 2Z2UA 1N7KA 1KLZA 3QQ1A 4Z08A 1KTNA 4UMAA 3UZ5A 3E49A 2J24A 4GUFA 1VYRA 1GG0A 1SU5A 3PBUA 2HS8A 2FQIA 4AB4A 3LI1A 2B7QA 1H62A 5DBTA 3EWWA 4HKPA 3S5NA 1KFCA 1THFD 4ADUA 1DKWA 1TTPA 1WA3A 3HPSA 1GPWA 2GJNA 2V5BA 1AL7A 1I2OA 3IIOA 4RR4A 2VC6A 3W7NA 4IUOA 3FYOA 4O1CA 1SW7A 1TQXA 4O13A 3Q2DA 4YCOA 2GPTA 4NJGA 1ZNNA 5TBOA 1RR2A 3BW3A 1AW1A 4MLRA 4RXGA 2NXGA 1ML1A 5BOOA 2Z0IA 3WJXA 1F6PA 1OF8A 3P67A 4AHOA 3INPA 3PY2A 4JIPA 2AGKA 3BARA 2GVJA 1LBFA 3IVSA 3E96A 3T4CA 3V75A 1WX0A 1TV7A 3C61A 1PCKA 1OK4A 4IJBA 2E5CA 4TR9A 3UWUA 1T0OA 4O8RA 5AFDA 3TQ0A 3B06A 2Y62A 3BK0A 3W7JA 3E02A 3NQEA 1NVMA 4UFJA 3MI6A 2XN1A 3CU2A 4XTIA 5A8GA 4O17A 5C54A 3TDFA 3GR7A 1LP6A 3QJAA 5D03A 1OHLA 1GZGA 3TKFA 2ZBTA 3G0XA 1B3OA 5LHFA 2Z1BA 1W5NA 4FHAA 1LRNA 2B7NA 3DKLA 4WJEA 3DI0A 2JK2A 2PRHA 3HO8A 3W2KA 3CIXA 4K7VA 1I4NA 4DQWA 3S5OA 5DCEA 3U6WA 3S9YA 3T78A 2DZUA 5U7SA 2BWGA 5EL1A 1DV7A 3WK1A 2WSQA 1TPWA 2WNNA 4GUHA 2QCEA 4WY0A 3MHUA 1DBTA 3NXFA 1JQXA 2QF7A 2AAMA 3IIPA 4OBTA 1F74A 1A5CA 3ABQA 1LRTA 3W7PA 2ZA1A 4ONVA 4LS1A 2CLLA 5ABTA 1AW2A 3W1QA 2A1YA 1FXQA 4PODA 3CPRA 1VS1A 5D2TA 2YPIA 2QJGA 3KVKA 3EWBX 3C2VA 3OHIA 2KZHA 1F7BA 1H7PA 4OE7A 2HS6A 2ZA3A 3NQFA 1R47A 3R8RA 2ZDRA 1H51A 2PCQA 3QC3A 3TQVA 5D05A 4MY1A 5AYZA 4O16A 2Y63A 4O1BA 4UTMA 1EB3A 3L5LA 2ZZ4A 3W88A 5AHFA 1QR7A 4JX5A 4A21A 3TXVA 5LHEA 3UY8A 1XBYA 3PB0A 3TQKA 1H7XA 1GVFA 5FF4A 2C6QA 2VENA 3T44A 2J9XA 1I2NA 4FX8A 1YTEA 3L2IA 4JTGA 2ZTKA 2OZ0A 3HIJA 2ZCGA 3UY7A 1GJPA 5EYWA 1ZFJA 1HO1A 5AHEA 4RLIA 2A7RA 2CZEA 1JCLA 4WQ6A 5CZJA 4UMBA 4Q32A 4MJMA 3NQCA 3L66A 2WPBA 1YXYA 1TSIA 3S1WA 3Q94A 1DJNA 1DL3A 3VE7A 1VC4A 4O50A 4LVDA 1SO6A 4CCCA 1DJQA 3EX2A 1JR1A 4MZYA 2UV8G 1JVNA 2C0AA 2Q8LA 5G2IA 5I3HA 1G4SA 1B9BA 1QAPA 5T26A 3GR8A 2V9DA 4PC8A 3G24A 4N02A 3UWWA 1VYPX 2TSYA 5G1YA 1WOBA 4JTKA 1W54A 3L9CA 3L68A 1IXNA 5G1TA 3MP3A 3LTPA 1RD5A 1ZAHA 1WV2A 1G4EA 3UQNA 3NG3A 3S42A 3IRDA 1OF6A 3W1MA 4IMGA 2NUYA 4LVAA 3N3MA 4JDYA 3GXNA 4MUZA 2EAWA 5F1UA 2CLKA 1TPC1 3FIGA 3SGUA 3G1SA 3GDKA 1Q6LA 3M5VA 3NPXA 3NR0A 4R33A 5CKSA 2QCFA 2G5WA 3CIWA 3YPIA 3MO7A 3SR7A 1PHWA 2QCDB 4MZ8A 4ZQCA 5EPDA 3ZR4A 3O1NA 6TIMA 2C16A 1I8JA 1KA9F 2JKEA 3N9RA 4BF9A 1OYCA 2HSAA 1GYLA 4GBUA 1U5JA 1W5MA 3NQ7A 4NUWA 4CNNA 1JCJA 2DORA 2V8ZA 5AC7A 3NEVA 3R12A 1VHCA 3RK8A 5D2YA 1T8XA 4L4LA 3O05A 1EWDA 3H54A 2P1FA 1F73A 2J27A 4UTWA 3NL3A 4YWIA 3ABRA 1IIGA 3NQ8A 2ZZ1A 3WFAA 3BLIA 1Q6RA 3GXTA 3MP5A 1K3UA 3NL5A 4IPJA 3LHVA 4BI6A 4UTTA 3A9IA 3SY5A 3G22A 3B0UX 5EMUA 4JIQA 4PH6A 3PF3A 1LBMA 1TB3A 1XCFA 3IGSA 2QUUA 3M1ZA 3M9YA 1UJPA 3MI3A 5E93A 3W1UA 1TO3A 3C2OA 3SZ8A 2OT0A 3DZ1A 4U28A 4Y6GA 4HNUA 4O52A 1VCVA 5FEPA 3NM1A 3W73A 3ZWSA 4DF2A 1K8YA 4M7TA 4DO5A 4HNTA 3ZFHA 1IXOA 3TIMA 1L6YA 3MMTA 1FWWA 3QF0A 3Q58A 3W7IA 2J6XA 3KVJA 1Z44A 1FWRA 4PL2A 4HT3A 4TO8A 1K8ZA 3EB2A 1Q6QA 2I1OA 3BGGA 3EWYA 3HBLA 3FFSA 3EKZA 3QMTA 2E09A 4BK9A 3WJSA 2F7FA 4O0KA 3S8HA 3W7QA 1SSGA 5D37A 2VFFA 2XN2A 3CT7A 2R8WA 2RDWA 1SFLA 3S1VA 4UTJA 4EF8A 3L0NA 4BR1A 3JS3A 4NZFA 4KWVA 1BKSA 4UTTC 2ZFAA 4IPIA 4LWWA 2ZZ2A 1V5XA 3G1DA 1S5VA 3IIXA 3V1PA 3QW4B 4IXXA 5FEXA 5D30A 1KV5A 4TIMA 2FIQA 1W5QA 1TTQA 4FNPA 2E68A 4CCEA 1FWSA 1QPRA 3W74A 4MOZA 4LVBA 2A2IA 5DN1A 3NQMA 4ZQMA 4LOCA 4FEZA 3U8GA 4CQ9A 5LNUA 3P82A 3PM6A 4UCGA 3C3NA 1P1XA 3B03A 5FF2A 1EUNA 4LC8A 4ML9A 1K7EA 3LERA 4FX7A 2Y6ZA 3RLVA 4MIMA 3CC1A 3NAVA 4L4MA 4YCPA 2QCDA 4MKNA 1IGSA 5HNRA 2QJIA 1FXPA 4YL2A 2C1HA 4NQ1A 1EIXA 1YTKA 2ZZ6A 2OJPA 2I9EA 3W87A 3DXIA 3F1QA 2XN0A 5F2IA 1JCYA 4EWND 3G3DA 4GUGA 5AHLA 1R2RA 1TMHA 2RKXA 2V5LA 2FPYA 4PFMA 4WZHA 3NPVA 2WOQA 2FPVA 1H63A 4Q4KA 5CPOA 4D2JA 1G69A 3HG5A 5F4XA 1Y0EA 1HO4A 1ZHAA 3PC0A 4K8HA 4PTNA 3A21A 4N6FA 2VELA 1O5XA 4JTSA 1FWTA 3BG9A 1KFEA 1D3HA 2ZZ5A 3I7RA 4K38A 3W86A 1W3NA 3W23A 4DBEA 1TV5A 4H3DA 1TPDA 1PE1A 4RK8A 4X3ZA 5D2WA 3SSJA 3I7QA 3W70A 1S5WA 5E1QA 1GQNA 3E9AA 3QQ0A 1DQXA 1KM4A 1XUUA 5GVJA 2ATMA 2OCZA 1OX5A 3W85A 4LVGA 4JTFA 2B0MA 1C8VA 2R94A 1YPIA 3THAA 3W1TA 2GVGA 4UNLA 2QAFA 3PG9A 2VEPA 1HUVA 1KV8A 4ADTA 4FXRA 1ADOA 1XBXA 4Y9AA 2EHHA 1P0NA 2VFHA 4KKXA 4DBDA 3F4WA 4N9EA 3MHFA 2PRLA 4NNAA 3LHYA 3TW6A 1VLWA 5HUPA 1Z41A 4CNPA 3VNDA 3KVMA 4CCDA 1XFBA 3MUXA 5BW6A 3S1XA 1PVNA 3HG2A 4RCXA 4ZVJA 2OT1A 5HR7A 3OVRA 2BSLA 2RH9A 3JR2A 4JY8A 2JKPA 4TX9A 4IXHA 1OFBA 1D9EA 3TJXA 4Y96A 2NWSA 3AJXA 4N4QA 1LROA 2Z6IA 4O54A 4CLMA 3TSBA 4JNMA 3RFAA 2CLMA 3FJ6A 3C8FA 3O07A 4FIRA 3M5XA 2ZRXA 3LOTA 2V2DA 1QOQA 3M43A 1LM1A 5F2MA 7TIMA 5DY3A 1SO4A 5K4XA 2ZA2A 4LT9A 1LRQA 3OVPA 3R5EA 4QIUA 1GVSA 4GUIA 3VE9A 4M19A 3L5MA 2QCNA 4WX2A 5BRBA 4OGZA 3A22A 3W7CA 1M7OA 4NVTA 2QUTA 5CZSA 3W7KA 2QAPA 3EX3A 1OFOA 1W5OA 3QH2A 1IF2A 2A6LA 2PRMA 5DCDA 1M6JA 3F4NA 1GTEA 3M47A 3A23A 1OJXA 3B05A 4TMCA 1R2SA 1AK5A 3BLFA 2DZPA 4UFLA 4WUIA 5A5WA 4EF9A 2WSYA 3GB6A 5KZEA 3G1AA 4NJKA 5BNKA 5LNWA 4TU1A 5HQEA 3UYCA 3UXDA 4AF0A 3WJWA 3HG3A 3TXZA 3TC7A 3GDLA 4HHPA 5G5IA 3CM4A 3SJ3A 2P0OA 1XM3A 3GDTA 1P5BA 4IX2A 4MFEA 4XBSA 3CQ0A 1AG1O 3G0SA 1LLWA 1TPH1 4FXSA 4UTKA 3TR2A 2FB2A 5CSRA 2XFWA 3STFA 1GVOA 2QDGA 4M6PA 3KX6A 3O6CA 4NJIA 1NF0A 4JTUA 1KM5A 3DI1A 2YYTA 3UWYA 2FTPA 2VFGA 1GT8A 1JCMP 3PS7A 5LSMA 5LGXA 4UFKA 4I9AA 2VFEA 4LRSA 4KFPA 5LNVA 4A3UA 3S0CA 4R34A 2PC4A 4NX0A 1MEWA 3B0VC 3LDVA 4HPXA 1JQVA 2A4AA 3QMSA 4WY0F 1EUAA 2ABBA 4MZ1A 1GWJA 3O06A 1C9DA 1SW3A 4HIBA 4GC4A 1TQJA 2ISWA 5HR6A 3IV3A 4MYAA 1JUBA 1D3GA 4UIOA 5FI8A 3BG5A 4UMCA 1EA0A 3M7WA 3G1XA 2C15A 1IIHA 2YZRA 1U83A 2CW6A 1GTHA 2O7QA 3W2JA 2F84A 4NNCA 4BI5A 1VQTA 3G1FA 3SECA 3PSWA 1TREA 5I3IA 1XBVA 3USBA 4NZJA 4UTIA 1QPOA 3D0CA 3E0IA 1V7YA 3PULA 3PB2A 1NF7A 5MHBA 4Q33A 3FOKA 1K03A 3LCGA 4KFNA 4A22A 4AHQA 1I45A 1UASA 1ZJIA 3W2NA 5CPLA 1F5ZA 2FDSA 4FB7A 2RDUA 4RZ5A 3ATYA 5H91A 2EF9A 3STCA 3P62A 4POCA 1UBSA 3THQA 2B7PA 4JTEA 3EWXA 3SI9A 5LNSA 3W72A 4ZQRA 1NSJA 2A85A 4UFHA 2ZRWA 4AWUA 2RFGA 1LOSA 3NDOA 1A5AA 1O5KA 1W31A 3W6YA 2DU2A 3HPZA 3TCEA 4C1KA 1FBAA 5SWUA 1XI3A 3FKKA 3ABSA 3QM3A 1M5WA 2ZZ3A 1OYBA 4ZQNA 5AHMA 6ALDA 1UCWA 1T99A 3TE9A 2A5HA 3BGJA 1MO0A 3NOEA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3PZQ A;  4QIT A;  1VEP A;  1DWF M;  2R14 A;  4I6V A;  4MWA C;  4MVA A;  1BF6 A;  1DHK A;  1OD0 A;  2EJ1 A;  1AQF A;  5DXX A;  1UKT A;  3GD6 A;  1PEZ A;  1PDZ A;  5CC5 A;  1M1B A;  4GH3 A;  1K9F A;  1WUF A;  1HZY A;  1QOX A;  5FES A;  3GKA A;  3IAP A;  4LAN A;  1UML A;  1A49 A;  2IQD A;  4KFO A;  3TV8 A;  3C52 A;  1UZH A;  3B8I A;  4QJ5 B;  2QPX A;  4IQE A;  2FGL A;  2ZKM X;  4M1R A;  2OXN A;  4P7N A;  4UNK A;  4KET A;  4GAB A;  1JAE A;  4Q3M A;  2QA4 H;  1DJZ A;  2FZB A;  1XWY A;  3TR9 A;  2TMD A;  4MKS A;  1XFC A;  3IGU A;  3WDI A;  1M01 A;  2WO5 A;  3CEU A;  3ZJ6 A;  3QY8 A;  4QTG A;  2HIS A;  4Z42 C;  1KLZ A;  4PUE A;  4Z08 A;  1KTN A;  2PTX A;  2J24 A;  3N6Q A;  4MKV A;  2IKH A;  4H04 A;  3PBU A;  3GBD A;  3PN8 A;  4Y9P A;  3LI1 A;  2NVC A;  1OGG A;  3AWO A;  3EMQ A;  5DBT A;  1P0B A;  4PMR A;  1THF D;  4H01 A;  2P76 A;  1EZ2 A;  2V5B A;  1I2O A;  3IIO A;  4IUO A;  3WQ4 A;  1JPK A;  2KAU C;  3Q65 A;  4YCO A;  4NJG A;  5TBO A;  1IZJ A;  1H41 A;  3PZT A;  3CL8 A;  1CYG A;  5BOO A;  1O5R A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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