3A9IA

Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with lys
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
375
structure length
347
Chain Sequence
REWKIIDSTLREGEQFEKANFSTQDKVEIAKALDEFGIEYIEVTTPVASPQSRKDAEVLASLGLKAKVVTHIQCRLDAAKVAVETGVQGIDLLFGTSKYLDIPRIIEEAKEVIAYIREAAPHVEVRFSAEDTFRSEEQDLLAVYEAVAPYVDRVGLADTVGVATPRQVYALVREVRRVVGPRVDIEFHGHNDTGCAIANAYEAIEAGATHVDTTILGIGERNGITPLGGFLARMYTLQPEYVRRKYKLEMLPELDRMVARMVGVEIPFNNYITGETAFSHKAGMHLKAIYINPEAYEPYPPEVFGVKGLHYGEEELHRVTQHIKALADRGQLTLEELDRILREWITA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Thermus thermophilus
publication title Mechanism of substrate recognition and insight into feedback inhibition of homocitrate synthase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Homocitrate synthase
total genus 129
structure length 347
sequence length 375
ec nomenclature ec 2.3.3.14: Homocitrate synthase.
pdb deposition date 2009-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3a9iA01
2NUYA 1RVGA 1EWEA 4HNUA 4JY8A 3O8AA 1GWJA 1IXOA 2Y89A 5A5WA 1W37A 5E1QA 3S5YA 2QEZA 3O05A 5TQLA 5D2YA 2JKAA 1Q6OA 2YW4A 3ZFHA 1JCYA 1TTJA 1K8ZA 5BNKA 3I65A 4HNTA 1YTEA 3DH7A 3P8IA 4JNMA 2VFHA 4Z1BA 4FEZA 4DBDA 3GXPA 3O06A 3HG3A 3B06A 4Q4KA 1P1XA 3SGUA 3ANYA 2VEMA 1ME8A 3UXAA 4FNQA 5T26A 4EF8A 3C8FA 1SO3A 3TUUA 1E51A 4GXMA 5CKSA 3NR0A 3PBVA 3TAOA 4X9SA 2VFGA 1YTKA 2WPBA 1ICQA 4C1LA 4N9EA 5C54A 3IGUA 1GTHA 2JGYA 4OQVA 5AHEA 1KTCA 2YPIA 1I2NA 4QNWA 2Q8LA 4AWTA 4OV9A 2GVGA 1O5KA 4NNBA 3KVLA 1RZMA 2NX1A 1V5XA 1P0NA 2V82A 4J9JA 3VE9A 1UBSA 2O7SA 4RKAA 1TPWA 1Q45A 3N34A 3KVJA 3W85A 3W7KA 2QCHA 1SSGA 2OJPA 1VLWA 3OA3A 4L4LA 3NQ6A 3G3MA 5G5IA 2Y7EA 4FX6M 3R8RA 1SZEA 2P1FA 1UJPA 3LRMA 1VGAA 3N3MA 3S5NA 3TW7A 4ZQOA 2H90A 1W56A 3TFXA 4JY9A 1KM5A 3TCEA 3DAQA 3E0IA 2ABAA 2ZZ6A 1AK5A 4EVZA 1H7XA 4GUJA 2D73A 2VKZG 4TIMA 3PAJA 1YXYA 3QW3A 3G0XA 5CZJA 1Z41A 1N7KA 1VYSX 3HIJA 5IBXC 1X1OA 2FPTA 1TV8A 2V0TA 1V7YA 3L67A 5CPNA 2J9XA 5CZ0A 3L68A 3GAKA 3GNNA 3LX9A 3QJAA 4LVAA 3Q58A 4DF1A 2R8WA 3FOKA 2WKJA 5AYZA 1VC4A 1JJKA 2E5BA 3L0KA 2YYUA 3W83A 2B4GA 3I7RA 5KZDA 3BW4A 4UMAA 3C2VA 4IMFA 1XXXA 4O4VA 4DQWA 1LBMA 4UTTA 4GWEA 2E77A 1OFRA 4IMEA 4GUHA 4DPPA 4N9BA 2PE4A 3MJYA 3NQAA 1KFBA 4MKNA 3STFA 3LDVA 3DENA 3DFNA 3G1DA 3BLEA 4UTHA 4GFSA 3BG5A 5LGZA 4XKYB 3NL2A 1JCMP 4NZJA 2CW6A 1KTBA 2WNNA 4MY8A 4UFKA 4JX6A 1AL8A 4A2RA 5K3VA 3F4NA 4TO8A 1LLWA 3VCRA 3LI0A 4EIVA 4P2VA 2Z6IA 3M9YA 1H7WA 1XBXA 3LBMA 2P0OA 1VZWA 2NWSA 3TXZA 3A22A 1LTDA 3CLMA 4BK9A 1JRBA 1MEWA 5HWNA 3QMTA 3LHWA 3OHIA 1TMHA 4M6VA 1EWDA 3U8GA 4UR7A 3M47A 3Q37A 3NQMA 2GUUA 5HNRA 3MMTA 3EX1A 3NPXA 2C16A 4W9TA 2V2HA 4QISA 2E5CA 3G1XA 5K9CA 2VXNA 4IPJA 3JRKA 1K03A 4JTLA 5HWJA 1SPQA 2QAFA 2J88A 1XUUA 5G2WA 2KZHA 2PURA 3W23A 1W8SA 2A21A 2V5BA 4ZVJA 5DY2A 1H62A 1X1ZA 4WOQA 4UTJA 3P84A 4HKPA 3C2FA 4UC5A 3PWAA 3QSRA 4WOZA 1SFJA 4JXCA 2E09A 3UWWA 5D05A 3CHVA 3M7WA 4R7JA 1LLZA 5C55A 1TQXA 1KM0A 4O8RA 4CNNA 1WDWA 3C56A 4K8HA 1IIGA 4NJJA 1IF2A 1TTPA 3W73A 3TAKA 1QAPA 2A2IA 1R30A 3S1UA 1A5AA 3MBDA 4TMBA 2RHGA 3QQ1A 3S5OA 2GJNA 4DF2A 3PG8A 4DO6A 2E6DA 4JEQA 5AHLA 3IEBA 3TE9A 3CPRA 3G0UA 4NQ1A 3P7YA 2J27A 2EAWA 2NXGA 4JTUA 4PCFA 4IGHA 3FIGA 3TSMA 1W5NA 3KVMA 3P74A 1H60A 1RPXA 3GDRA 4NJHA 3ZWSA 3SI9A 5F1VA 4XBKA 3W1PA 2DZWA 1H1ZA 1JVNA 3M44A 1R47A 2R91A 1QO5A 3LB0A 4PH6A 1H51A 1JCLA 1QPRA 3LXAA 1R46A 3W86A 1X8FA 4JGDA 1DL3A 1S5WA 1TPFA 3C2OA 1DV7A 2Z6JA 1WX0A 1ZNNA 2ZRWA 4ZZ9A 2GPTA 4ICNA 2QKFA 3A21A 4QNEA 4HSNA 2WJZA 3O16A 5CZTA 2CU0A 2J6XA 3LCLA 4K6AA 3T78A 2J9ZA 4I7VA 4WXYA 2Y88A 4H4IA 4PTNA 1GVQA 1WA3A 4ONVA 3STCA 3PM6A 3M5VA 3ELFA 3UZJA 1Z48A 4PL1A 1A53A 3BG9A 2ZZ4A 1I2QA 3QQ0A 3QMRA 4S2CA 1OK4A 1TIMA 5DXYA 3UWZA 3P5YA 3TC7A 2QR6A 5FF7A 3TIMA 4GBUA 3GDLA 4I9AA 5D2VA 1F5ZA 5HMSA 3W76A 5BMWA 3IVTA 1UASA 2Y6ZA 4WD0A 3RF9A 3O07A 2Y62A 5F4SA 3W7EA 3IVSA 2CZ5A 2G97A 3BLIA 1H5YA 1SW7A 3LV5A 4XZ9A 3G1YA 4O1AA 5CGQA 3TQ0A 3I7SA 3CWNA 3GKAA 3OBKA 1OFBA 4JTIA 4ZQPA 4FNPA 3MYPA 2H8ZA 1ONRA 1OYCA 2NV2A 1TJRA 5HJLA 2C0AA 4AWSA 1LDCA 1ZAIA 3NXFA 1WXJA 2UV8G 4NNCA 4OE7A 1GOXA 4YCPA 1XL9A 2OT0A 2FFCA 1FDZA 3EWUA 3F4WA 5LZLA 2Y7GA 3W7GA 3G22A 3WFAA 2QCDB 4S2BA 3L65A 3HPXA 5C5YA 5BRBA 4JR5A 1QOPA 2VEIA 5A8GA 3BGGA 3W22A 2X2GA 1TPC1 4Z08A 3EKLA 3QMSA 3W6YA 3W7DA 2YFNA 1RQHA 1F05A 2V5LA 1C29A 3OVQA 3HB9A 3W1LA 1TPDA 2DJLA 3W1UA 4UFHA 1I2OA 1A5CA 1J2WA 2DZSA 1PCKA 1H63A 1C9DA 5DBUA 2HTMA 4R33A 1I2RA 4MFEA 3PUDA 2FIQA 2CWNA 2NUXA 3PF3A 4Y9AA 4Q32A 2EPHA 3NOEA 1BKSA 2PRMA 3QSTA 4RR4A 3QF0A 3AO0A 1TYGA 4ZQNA 3E12A 3PC0A 5BMXA 2DZTA 1OFDA 3H53A 5D30A 2QJHA 1EB3A 3B0UX 1F73A 5EY5A 3NQ2A 1NF0A 2YYTA 5D02A 3W9ZA 4L4MA 1LZOA 3M6YA 5C6MA 1FCUA 3PR2A 4LW7A 4A29A 2NZLA 4JTGA 3DFSA 3NPUA 3IRDA 4UMCA 3LHUA 3SGZA 4YWIA 4O12A 3EXRA 1KM3A 3NQVA 1X7FA 3LHTA 1TTIA 2CLEA 4YMZA 5AN7A 2A0NA 3HBLA 1KM2A 3LRKA 5DXXA 3B04A 4DO5A 4RZ6A 4FF7A 4X2RA 5K9XA 1LBLA 1Q6RA 3PSVA 4O28A 3G3DA 4O11A 3P5ZA 4YL2A 2NX3A 5CPMA 4XTDA 1W31A 3GLCA 3G18A 2ZZ2A 4HN4A 1LRQA 3C3NA 4WQ6A 1SZFA 3QPZA 4JD4A 5LGXA 4XQ6A 5E93A 1W0MA 2EKCA 1G4EA 3BW3A 2Z0IA 4TMCA 3O6DA 3G1HA 2OCZA 1EPXA 2ATSA 4RLIA 3VE7A 1QO2A 1YDOA 1M6JA 4NUWA 2Y7FA 4LRSA 5CSSA 5LNUA 3LI1A 4WY0B 3WJSA 3KX6A 2PRLA 1M5WA 1PL9A 1K7EA 3WJZA 1VCFA 1VH7A 2E6YA 1R2TA 4HNNA 4ZQMA 3TXVA 1HG3A 3GKFA 4LUIA 5AHFA 3ABRA 2A6LA 1NF7A 1W3NA 3N2XA 4K36A 4RK8A 4UTWA 3W70A 4R53A 1ML1A 3G8EA 1G69A 4CNPA 2AAMA 4LY8A 4ORIA 1C8VA 1SO5A 4K7YA 4JYDA 4E0CA 4JDBA 3HPZA 4MUZA 1IGSA 1KLZA 1EUAA 4KKXA 4Y96A 1KBIA 1TPH1 3LTSA 4NJIA 2QDHA 5FF4A 5KSWA 3LOTA 3L21A 3THQA 5J5RA 2QCNA 2V30A 1ZY9A 3B05A 4GC4A 5CG7A 1TPUA 3GR8A 3GAYA 4ADUA 4FNUA 3FA5A 4JTJA 1XM3A 1TPB1 3NL5A 1SO6A 4PODA 3E02A 5EL1A 1B9BA 2PRHA 4PA8A 2F84A 3W7MA 2FB2A 4O54A 4GUGA 5D38A 4WUIA 2VFIA 3FLUA 5DLCA 1GQNA 5DY3A 2G5WA 1FWTA 2QCDA 5K9DA 1EA0A 3NQDA 3EWZA 3BGJA 3CU2A 4AHPA 1DKWA 2NWRA 5L9FA 4N6FA 3ATYA 3BARA 3PB0A 4LVDA 2C1HA 4NJGA 2BXVA 4K8EA 1JCXA 4XTIA 2ZRZA 1PS9A 2NV1A 3N9RA 1NAL1 4AVFA 3SZ8A 2I9EA 1O5XA 4K7VA 4UTTC 1TV5A 4Z0SA 1SZNA 1J5TA 1JUBA 2QF7A 3W7LA 2QCGA 4DO4A 2YX0A 3CIXA 2FPVA 5FESA 5FF3A 3TQVA 4OBTA 1DORA 2QAPA 2DU2A 1B3OA 4ML9A 4Z0JA 5G4EA 4CNOA 3IGXA 4BI6A 2QCCA 1H7RA 3CQ0A 1RQBA 2RFGA 1OK6A 4MOZA 4MIMA 3W1AA 1VLIA 1I2PA 5D32A 2YW3A 2PC4A 1DJNA 4CQAA 5U7SA 3VNDA 5D09A 1RV8A 3QFEA 3INPA 3WK0A 3M5XA 1KBJA 1IXPA 1OX4A 1RQEA 3WJWA 3PUOA 4N9DA 3W7OA 4P61A 3THAA 1WQ5A 3FEMA 5FEPA 1XBVA 5GVJA 4NJKA 2ZZ7A 4BI5A 3C0JA 5HINA 5FEZA 3BK0A 1I45A 1YDVA 3MHUA 3T40A 3TMQA 3HMJG 3W07A 1SZGA 3QM3A 4WXZA 1ZCOA 1OFAA 2V2DA 1L6WA 5F2GA 1UCWA 3W1MA 1FXQA 2ZZ3A 3OEXA 3QZEA 3FFSA 4NX5A 4O57A 3T4CA 1VCVA 3NVTA 2XFWA 1XUZA 3P80A 1CW2A 3M16A 1F6KA 3QH2A 1GYLA 2DZPA 2A5HA 2BSLA 2Y70A 3CTLA 3NPVA 1GT8A 3UNDA 3A9IA 1P0KA 2FLIA 3A24A 3S1VA 1TREA 3OG3A 5AC8A 4OU1A 5D33A 4ZMGA 3WJYA 3SY5A 1S5VA 1PIIA 4AF0A 3S1WA 1SU5A 4TU1A 5DBTA 3ZS4A 4A2SA 1AW5A 1ICPA 5HULA 3DGRA 1EP3A 3S9YA 4GUIA 4NX0A 3GXNA 4WY0A 1U83A 4IX2A 5IBXA 2A4AA 3E49A 3I7QA 1EEPA 3GYEA 1GJPA 2Z2UA 2BWGA 5HQEA 3ATZA 4MJMA 4UTMA 4RZ5A 1JR1A 2J9YA 2RKXA 3CWOX 4YCOA 1M7PA 3R13A 1OFOA 3DZ1A 3QPYA 2AQWA 3W7RA 1K7XA 3G1FA 2ATMA 4AHQA 3C6CA 1MXSA 3QC3A 5BW6A 1K3UA 3ABQA 3KAOA 3GIYA 1OYAA 4U28A 1PV8A 1SW0A 4MYXA 1MEHA 2Y7DA 4HIBA 3W72A 3NQFA 2O7QA 1EIXA 3EX2A 1ZENA 5F4XA 1YTDA 5D03A 4B5NA 3YPIA 3NQ8A 1FCQA 1GG1A 1W3IA 5F2MA 4HNVA 1VPXA 4DBEA 1JUKA 4RCXA 1TB3A 3N14A 4XWUA 3EXTA 2E68A 4NVTA 3UXDA 3UQNA 4MY1A 3JR2A 4RXFA 2OX1A 4TX9A 2FJKA 1W3TA 5EPDA 3NM3A 4LS1A 3M41A 4BWLA 1GVRA 2J24A 5DN1A 5D04C 3DHDA 3G24A 3M0ZA 4HSOA 1VYPX 1H1YA 2C18A 3MUXA 3NQGA 4UTLA 1A5SA 3NL3A 4N4QA 2Y63A 3PBWA 4AMAA 5KZEA 1P4CA 3NA8A 4LVBA 4UXDA 2NX9A 2CFFA 1KW1A 1F74A 3TKFA 3MHGA 2WSQA 1K8YA 3P61A 2X1UA 1TJPA 2BTMA 3IIXA 3N2MA 2X16A 4JS3A 4HPXA 3UD6A 4BI7A 3IV3A 3W7JA 3UWYA 1LRTA 4UMBA 3TJXA 5I3FA 2W79A 2GJLA 1BWKA 1KM6A 4HPJA 4IXXA 5F2LA 3STEA 3DI0A 4I7WA 3BG3A 5J5DA 3KOFA 4LVGA 5KZMA 5EMUA 1WV2A 1D9EA 1O60A 3G1SA 1W5OA 2YFOA 3O63A 2NUWA 4JTKA 1KV8A 4A21A 2CZDA 5AHMA 3OIXA 4O19A 1M7OA 1F76A 4Z1DA 2PCQA 2ISVA 3RNDA 2ZDRA 1XDLA 1G4SA 1OYBA 4A3UA 2H6RA 5D2TA 1W5QA 4JTTA 3N9SA 4UTKA 3W3OA 1HO4A 4M7SA 4CCDA 4UR8A 3MBFA 3LTPA 4RX0A 3KXQA 2WNZA 1JCNA 5LNRA 5KMYA 3H55A 3LCXA 3Q2DA 3LV6A 4WY0F 4A22A 1CX9A 4IJBA 4UNLA 3KVKA 4AB4A 4JTFA 1KFEA 3TA6A 1Q6LA 2ZBTA 3KFTA 2VELA 3PS7A 4O53A 3HGJA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3UVA A;  1RVG A;  4HNU A;  1RK6 A;  4HMN A;  3ITL A;  3O8A A;  1XX1 A;  3RX2 A;  5E1Q A;  1BKH A;  1BVN P;  4HQV A;  2B31 A;  5D2Y A;  2EKG A;  2GGG A;  1Q6O A;  3ZFH A;  1JCY A;  3KZS A;  4R85 A;  4WJ8 A;  3PBM A;  1K8Z A;  3H8A A;  3I65 A;  5BNK A;  2WSP A;  3P8I A;  3PBG A;  2OWX A;  5DT7 A;  4JNM A;  4CKQ A;  3C5Q A;  2PWD A;  1E9L A;  3O06 A;  3L4U A;  3ZM8 A;  2BXY A;  3ZLG A;  3QQW A;  3VU2 A;  1RP9 A;  4WF7 A;  1W1P A;  2VEM A;  2PC8 A;  2IPG A;  4GI4 A;  2XVN A;  2BGQ A;  1XIB A;  4GXM A;  3HMC A;  5CKS A;  2VFG A;  5A3H A;  1YTK A;  3BSG A;  3KP1 A;  1GTH A;  2JGY A;  4OQV A;  1PWM A;  2Y2W A;  4AIB A;  1HGY A;  4AWT A;  2GVG A;  3D47 A;  3W25 A;  1P0N A;  4HZ7 A;  1R0M A;  2V38 A;  2O7S A;  4BS0 A;  3KVJ A;  7REQ A;  2CEQ A;  3W7K A;  2QCH A;  3W85 A;  3M6D A;  6TAA A;  4WDX A;  2ZOX A;  3VPL A;  4ZO8 A;  2P1F A;  1UJP A;  4PB4 A;  4GNV A;  3S5N A;  1DPM A;  1Q85 A;  1JPK A;  1FH7 A;  2ZKM X;  1IZK A;  1E3Z A;  3WL0 A;  1YXY A;  3G0X A;  4ZFM A;  3MSR A;  4UBP C;  2J9X A;  3SRH A; 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 3UPM A;  3CHV A;  1V0L A;  1YIX A;  1JDC A;  3BMV A;  2D2O A;  2VZT A;  3ONC A;  1XLI A;  1AUS L;  4X0N A;  5C55 A;  1KM0 A;  3OLI A;  4CNN A;  3LZ5 A;  4HZM A;  3IJI A;  4K8H A;  1RD6 A;  3QKZ A;  4W89 A;  1EYE A;  4NI8 A;  3SRD A;  4TMB A;  4JTC A;  4B15 A;  1KXH A;  2GJN A;  5I09 A;  4P8W A;  4WCJ A;  1MZR A;  4JEQ A;  5AHL A;  2R24 A;  2O9R A;  1BG4 A;  1JXK A;  4FOJ A;  2J78 A;  3SB0 A;  2CXG A;  3G0U A;  3P7Y A;  1VEP A;  1U1U A;  4HPG A;  3WD0 A;  4AZC A;  4IGH A;  4O1E A;  3FIG A;  2ACS A;  2AL2 A;  4M82 A;  4W88 A;  4RZB A;  4J3W A;  3ZWS A;  1JDD A;  4W84 A;  3SI9 A;  3W1P A;  3PZM A;  3BL3 A;  2WHK A;  1Z6K A;  2R91 A;  5I3D A;  3WYZ A;  3LB0 A;  4DZI A;  1BQG A;  3LXA A;  3QHO A;  1RY8 A;  1XH2 A;  1X8F A;  1LT7 A;  1JZ2 A;  3C2O A;  4IHC A;  3GXI A;  4J40 A;  3NDZ A;  4BEQ A;  3T42 A;  2ZRW A;  4BY3 A;  3GTH A;  1O66 A;  4ICN A;  5GNX A;  4HSN A;  2WJZ A;  1X1N A;  5JMU A;  5CZT A;  3UXK A;  2IMR A;  3LCL A;  5CBI A;  2J9Z A;  4HA4 A;  4WXY A;  1AOD A;  4RNJ A;  3SJN A;  4DLM A; 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