1B3OA

Ternary complex of human type-ii inosine monophosphate dehydrogenase with 6-cl-imp and selenazole adenine dinucleotide
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
489
structure length
304
Chain Sequence
TSYVPDDGLTAQQLFNCGDGLTYNDFLILPGYIDFTADQVDLTSALTKKITLKTPLVSSPMDTVTEAGMAIAMALTGGIGFIHHNCTPEFQANEVRKVKDYPLASKDAKKQLLCGAAIGTHEDDKYRLDLLAQAGVDVVVLDSSQGNSIFQINMIKYIKDKYPNLQVIGGNVVTAAQAKNLIDAGVDALRVGMGSRPQATAVYKVSEYARRFGVPVIADGGIQNVGHIAKALALGASTVMMGSLLAATTEAPGEDKGSIHKFVPYLIAGIQHSCQDIGAKSLTQVRAMMYSGELKFEKRTSSAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Dehydrogenase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of human type II inosine monophosphate dehydrogenase: implications for ligand binding and drug design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (INOSINE MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE 2)
total genus 83
structure length 304
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 1998-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1b3oA00
1FWTA 2DZPA 3TROA 3LI1A 2ZQ0A 2HS6A 4OE7A 3QC3A 2ZZ2A 2OJPA 2X30A 3LCLA 2C6QA 3M5VA 1OX6A 1SSDA 1W3IA 4X22A 3C6CA 4N6FA 3VI2A 5EBUA 1DHPA 3NQCA 1LBLA 3HF3A 5DCBA 1ZAJA 4JYDA 4O50A 3W88A 4XUGA 3KAOA 2VFHA 4PL2A 4UFHA 3W1XA 4IMEA 2Y63A 3I7QA 2B0MA 1ME9A 3GXTA 3P8IA 2FFCA 1Z44A 4ORMA 1ME7A 4IX2A 3IIXA 4UFLA 4JIQA 5HWNA 5SWUA 3CU2A 5HUPA 3IIOA 3S8HA 4TU1A 4LS2A 3V75A 3C61A 2Y70A 1KW1A 1PVNA 2VKZG 1L2UA 3MHFA 3UWVA 2NLIA 2FB2A 3W23A 3TUUA 2WSQA 1DBTA 3UWYA 3HBLA 3PAJA 3W1MA 4A3UA 3AJXA 4WY0F 1LOSA 1K3UA 3HGRA 4H6KA 7TIMA 1DQWA 1I2OA 1TQXA 2Y85A 3IVTA 3MBFA 1JUEA 2ABBA 3TR2A 2VC6A 3W7JA 3G1XA 4GUGA 3Q58A 4WY0A 1EPXA 4UXDA 1UUOA 5FEXA 1H60A 3SFKA 2VEMA 3WJWA 4WQ6A 1AMKA 4QISA 1JCJA 2FB3A 1KV5A 3T55A 3MHUA 2ZYFA 1XDLA 2DJXA 1Z48A 3STFA 3NO5A 3RLVA 4HSOA 1CX9A 4IWWA 3IIZA 5LNRA 3D0CA 2E1DA 4O28A 1F7BA 4O11A 3QZEA 2DU2A 3QM3A 3NXFA 1MSSA 2GJLA 5KITA 3W1AA 4NVTA 4O1BA 3P81A 4N4QA 3W1NA 3W7QA 4N02A 1QO5A 5A8GA 5TIMA 5AHNA 1NVMA 1GG1A 5D2VA 5KZEA 4UTHA 2BTMA 2A1YA 4NJKA 1UCWA 1GYNA 1VJIA 4TO8A 1QFEA 1FCQA 4QIUA 3MMTA 1A50A 3O6CA 2JGQA 3P67A 3MHGA 3NOEA 4Z1CA 1Q45A 3DU0A 5DCDA 1LLZA 3NZ1A 3U8GA 4AMAA 1R2SA 3EWZA 4O8RA 3T78A 3A23A 4PCFA 4A2SA 2OCZA 2RDUA 1QCWA 3N2MA 1VH7A 3MUXA 3UZ5A 1VYPX 3W7IA 1EIXA 1RVGA 3ANYA 4OWGA 2ZRWA 4YL2A 4CNNA 5G1TA 2ATMA 4A21A 3QW4B 1ZNNA 3W72A 1LYXA 4ADTA 3G1AA 5C5YA 3O6YX 1JVNA 3M5YA 3MWAA 5GVJA 1L9WA 1RD5A 4IPIA 4OV4A 1SSGA 1U83A 1UBSA 5F2GA 3E9AA 3CM4A 2CZ5A 1FQ0A 1GJPA 4ML9A 1XM3A 2Y7GA 5LNVA 4FX8A 1ICPA 3CHVA 4Q4KA 3NPVA 1IXOA 4K6AA 1LCOA 4ZQMA 4NJHA 2V8ZA 3LCWA 2YYUA 5G2IA 2QCLA 1G4EA 4JGDA 2V81A 2ZZ1A 2VFDA 2E68A 2ZZ6A 4NNAA 3I7SA 3MI3A 4AF0A 4A22A 2QDHA 3B0UX 3UXDA 2W0UA 3HG2A 3DFQA 1UJPA 1GVRA 4HIBA 3UWWA 4ZMGA 4JY8A 2C13A 2CLKA 2JGYA 3DFNA 2R94A 1FCUA 3LV6A 2HMCA 1H62A 4MYAA 4BFAA 1O5XA 4XKYA 3SSJA 1HTIA 3M9YA 1B9BA 1JQXA 4JTGA 3W7CA 2GQ8A 4K7VA 3FKRA 4IXHA 5AYZA 4LW7A 2Y88A 2QCCA 3TC6A 2X16A 4J9JA 1FWNA 3S1UA 4ADSA 3LXCA 3O63A 3P62A 4N9BA 1LTDA 4WXZA 2GQAA 2WNNA 2NXHA 4HSNA 1ME8A 3MO7A 4O19A 4GWEA 4Y8FA 3KFTA 2E5BA 4P2VA 2D73A 4DF0A 1P0KA 4KFOA 3ZS4A 4UIOA 3LV5A 3B4UA 2YGYA 1M6JA 4JTUA 1VRDA 1XBYA 4M5PA 3BV4A 1W31A 1LROA 5CPLA 1K03A 3P80A 1KM0A 3ABRA 3LHVA 5LGXA 3S5OA 3OVQA 1AL7A 4FXRA 2GQ9A 4BWLA 1IXQA 2X1SA 4S2BA 3T40A 2QEZA 3Q37A 1K7EA 2C1HA 4IX0A 1JCMP 5TQLA 4K37A 1NEYA 5F4WA 4GUIA 1LP6A 4IOTA 1TPH1 2FQIA 2AAMA 2W79A 4LVAA 4Q33A 3CT7A 3LLDA 3HGOA 3LHTA 3M0ZA 3S1WA 5HINA 5LNWA 4QITA 5E1QA 2C3ZA 3LRKA 5K9DA 3T44A 3AO0A 1A5AA 4FXSA 1VLIA 2ALDA 3GLCA 1Z41A 4K8EA 3HMJG 3GAKA 2Z2UA 5DY2A 4B5NA 4NT0A 3C52A 4N9DA 1MZHA 1Y0EA 3HPSA 4IMDA 4O4VA 1D9EA 5D37A 3SW6A 2J9ZA 5C2XA 1OX5A 3TIMA 1IGSA 3L0GA 5EPDA 4ZZ9A 4X3ZA 3ZR4A 3EXRA 1SZEA 3G1DA 5I3IA 5KSWA 4IPJA 5K7JA 3L9CA 4NUWA 5H2ZA 4RV8A 1KA9F 4YCPA 3GYEA 1SO4A 5FI8A 2V2CA 1SR9A 1LORA 5F2IA 3W2MA 3TKFA 1I45A 4L4LA 1KTCA 1D3HA 1TMHA 3CLMA 2DZWA 2A2IA 3MP3A 1FXQA 1GG0A 1R46A 1FX6A 3L0NA 5G5IA 1H7OA 4NJJA 2BSLA 1TJPA 2NV2A 4MIMA 3B0VC 1PV8A 3EWYA 2WJZA 1I2NA 1NAL1 2GVLA 3W1TA 4ALDA 4Z1BA 2H3DA 3C56A 3UY8A 4O57A 4FHAA 3O16A 4FX6M 4O0ZA 3FKKA 1W5OA 3C2RA 4M19A 3TAKA 1B4KA 2JK2A 4DF2A 2E77A 4DEFA 3GIYA 1TPC1 1SUXA 4BI6A 1DQXA 3B06A 3KHJA 3L66A 2QCDA 4HN4A 2ZBTA 5IBXA 1GTEA 2QCMA 5D2YA 4GUJA 1RV8A 1N55A 3N9RA 4RX0A 3RFAA 4ZQNA 4JD4A 5FF0A 4I7WA 2H3BA 2NZLA 3BGGA 3JR2A 3K30A 1D3GA 3PB0A 4O54A 5D38A 4NQ1A 3NZRA 1H63A 3KRSA 3CIWA 3W2LA 1VS1A 4LC8A 1Q6LA 5C6MA 1J4EA 1G4PA 3F03K 2WPBA 3ABOA 3DZ1A 1H61A 3G1HA 1FWRA 3EX3A 3UPWA 1Z42A 1B4EA 3LXBA 4UNLA 3VE9A 3UQNA 4JTKA 1OG0A 4K39A 4DBEA 3B0PA 1KFLA 2E6FA 1CI1A 1UB3A 1VYRA 2E6DA 1AG1O 1KBJA 1Q6RA 1W5NA 1TQJA 3QMRA 3WK0A 4WXYA 2ZDRA 2NXIA 3GR7A 3IIVA 4YXGA 3HG3A 1NSJA 2PRHA 4NJGA 4FB7A 2YSWA 4UMCA 3WK1A 3N2XA 2BWGA 1XDMA 3HJZA 4C1LA 3INPA 2H8XA 3WJXA 3EKZA 4UR8A 5EMUA 4UTKA 3TMQA 1X1ZA 4PFMA 1NF7A 3GZ3A 3G24A 2YZRA 3TCEA 1JRCA 2ISSA 4ORIA 1VYSX 4OBTA 4EIVA 4LOCA 4WOZA 3R5EA 2VFFA 3WK2A 2X1RA 3RNDA 5J5DA 2CWNA 1YDNA 3DI1A 3JRKA 1QPRA 5BRBA 5U7SA 1EA0A 2VOMA 4JICA 1MXSA 1MEIA 1F2JA 3TSBA 1TRIA 1S5VA 3W7OA 3C2FA 4LS1A 3NQMA 2DP3A 1Q6OA 1XC4A 4EVZA 4POCA 4JN6A 1NFBA 5HMSA 4CLMA 2Z0IA 1N7KA 5CSRA 5I3GA 3G8RA 2WSYA 3RMJA 1SZGA 4LRSA 4S2CA 2ZA3A 1QAPA 3CWNA 4R33A 1WDWA 2RFGA 4H4IA 3IRDA 2CZEA 3M47A 5K4XA 3G0UA 3BW2A 3O05A 3SJ3A 1E51A 2G97A 4XTDA 2VEKA 3P82A 1XXXA 1I2RA 1VCVA 1P0NA 1LOLA 2A85A 1F74A 4RR4A 4DO4A 5AC8A 4QQ3A 3G8EA 4BR1A 3KXQA 4UTUA 4NX5A 4D2JA 2PRLA 4QSHA 4N2YA 3O06A 3W1RA 1MEWA 3SY5A 4JDYA 1I2QA 1G6CA 4O16A 3S1XA 3ATZA 3BG5A 3M1ZA 5AC7A 1H7NA 1PIIA 4MLJA 2E6AA 3VKJA 2QR6A 2RHGA 3NL2A 2ZTKA 1YPIA 3S1VA 3EX6A 1Q3NA 5HNRA 3IEBA 1OABA 2FPYA 1IIHA 2C15A 2XN2A 5FEZA 3G3MA 3GB6A 5MHBA 2LLEA 2GVGA 4MUZA 5AYXA 3NQGA 1H51A 3CWOX 2CZFA 1H7PA 1KTNA 1I8JA 2QUTA 1K7FA 3E49A 1JCNA 1KFJA 5E93A 3A5VA 3IGSA 3USBA 4JNMA 3W22A 4MFDA 1A5BA 4QJ1A 1JCYA 3PY2A 2YW4A 3W6YA 4EF8A 1MO0A 1GQNA 2RH9A 4IXXA 1HFBA 1F73A 1A5CA 1GTHA 3A22A 3TJLA 3QFEA 1JUKA 3N34A 4E0CA 2A6LA 3TSDA 5K9XA 1FWWA 1RPXA 3EEGA 1XI3A 1XUZA 1SFJA 2J24A 1TPWA 4Y90A 2RDTA 2V9DA 2ZCGA 3L2IA 4O13A 4WZHA 4K38A 1BTMA 5EY5A 3NA8A 2QJGA 3BLFA 2CLMA 3LGEA 4XTIA 3DHDA 2ZZ5A 5ABTA 3EX2A 3STEA 3I7RA 4CNPA 5E0KA 4X2RA 5D30A 5HR7A 1OX4A 1BKSA 1FDZA 3KVKA 2R91A 3HG4A 3G1FA 2FPTA 3IIPA 1QO2A 1LM1A 3QQ1A 1TPFA 2IQTA 3LCHA 3PVFA 4AWTA 4DF1A 4MKNA 4ZL1A 4RXFA 3VNDA 5KZMA 3C0JA 3R2GA 2GJNA 4MY9A 3FJLA 3R8RA 4QAIA 4DELA 4AHPA 4M7TA 3F1QA 1TCDA 5K3VA 1YXCA 3S0CA 3PUEA 4AXKA 3T4CA 4LV4A 1A53A 1O4UA 3QSRA 4NNBA 2Z6JA 4MYXA 3KVLA 2BXVA 4Y96A 4QNWA 3NGJA 1K8ZA 3DFSA 2XN1A 1BEUA 2ZA2A 4RK8A 3PG8A 5F1VA 2P10A 4GBUA 5FF4A 1G7VA 3HQ1A 2CLOA 4H3DA 5KMYA 3P84A 2HSAA 2Y7EA 1KM6A 2FIQA 1DORA 2TMDA 1S3HA 3CB8A 3EX4A 3TXVA 3IV3A 2Q8LA 1KLYA 2I14A 3GKAA 4LU0A 2Y6ZA 3L68A 1KTBA 1HO4A 5L9FA 1ADOA 2WKJA 5EKYA 3PBVA 3B05A 3LTYA 5AHMA 2WOQA 1SO3A 5DXYA 4O1DA 3T7VA 3PG9A 5D09A 3NYZA 3ATYA 4R7JA 4JR5A 4GC4A 1R2TA 3ABQA 3LCGA 4ZQRA 1TO3A 1ZFJA 1T96A 1T99A 4FNTA 1DVJA 2VEIA 5F2LA 3EWUA 1FWSA 1OK4A 4JXCA 4U28A 1G7UA 3FS2A 1L6WA 1EUAA 3W7RA 1OYAA 3W9ZA 4GFSA 2X1UA 2KZHA 3BVJA 1RR2A 4KWVA 4R34A 3I6RA 1S5TA 3TC7A 1KV8A 1H7WA 1XBXA 1IXNA 1YPFA 3NQ7A 3C4UA 1K8YA 3BK0A 3W7PA 3QMSA 4JTLA 3W7NA 1P4CA 3MP4A 1SU5A 3LERA 3A9IA 2R14A 4UFKA 3O6DA 1QMLA 5D32A 3H54A 4MVAA 3M6YA 4FNSA 5IBXC 2EF9A 2V5BA 4UC5A 4WOQA 5KTLA 1KM5A 4DPQA 5FF3A 3FYPA 5K2ZA 3DFPA 5K9CA 3P5YA 3IVUA 4ICNA 1AW2A 1YADA 4LRTA 2H8ZA 2Y61A 3LCXA 1WXJA 5DXXA 5LSMA 1W0MA 3HGSA 3QYQA 2VXNA 1JRBA 3EXSA 5J5RA 4CQ9A 2P1FA 3KVJA 2A5HA 4I7UA 3KRUA 4N6EA 2FPVA 3N14A 5G4EA 4AHOA 4JYFA 3PBYA 3QEZA 1IIGA 2E5CA 3P7YA 3TJXA 3WJZA 4YCOA 2ZZ4A 5C55A 1OFPA 1RQEA 5BOOA 1P5BA 4O0KA 1WOAA 4EOUA 4RZ6A 1SW3A 4Y9AA 1H7RA 2A4AA 3MYOA 4NNCA 5DCEA 1LBFA 1ICSA 3PWAA 2ZTJA 5AC6A 1QWGA 1W3TA 2FJKA 4NXKA 3SZ8A 1WYIA 2CLLA 4TMBA 3EB2A 4LV9A 4UCGA 5KZDA 4DO6A 4CQAA 1YDVA 3NAVA 3N3MA 2V0TA 4O1CA 2VEPA 3UNDA 3UWZA 3LDVA 5CSSA 1TREA 4KFNA 1OFAA 1ZALA 1SW7A 1OF6A 4CCEA 3IGXA 4PTNA 4OV9A 4N9CA 3R13A 3L0KA 1TSIA 5T26A 4N9EA 1OHLA 5AYYA 3RK8A 4NU7A 2G5WA 4U4MA 1QOQA 4PODA 4O4WA 2NWSA 1SO6A 2JKPA 4FIQA 1ZY9A 3THQA 1TPVA 3M16A 1PS9A 3NL6A 3NQ6A 3P5ZA 2YXGA 4O15A 3ZWSA 3NM1A 4FNQA 1LRTA 5I3KA 2BLEA 2J27A 5AHIA 3GVGA 2FLIA 1FUYA 1FY6A 1SQ7A 5LHEA 1YXYA 4M6PA 3KRZA 1JJKA 3LHUA 5FF2A 4LT9A 3QPYA 3C8FA 3QJAA 5I3HA 1L6YA 2B7OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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