3ATY | Genus

Total Genus 136

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	136
sequence length	379
structure length	379
Chain Sequence	MATFPELLRPLKLGRYTLRNRIIMAPLTRCQATEDDHVPRTESMLKYYEDRASAGLIIAEATMVQPNYTGFLTEPGIYSDAQIEEWRKIVDAVHKKGGLIFLQLIHAGRAGIPEKILQQSKSDQDPLAGRLLAASAIPIKDHRIPAYFAASGEKETYGVPEELTDDEVRDGIIPLFVEGAKNAIFKAGFDGVEIHGANGYLLDAFFRESSNKRQSGPYAGTTIDTRCQLIYDVTKSVCDAVGSDRVGLRISPLNGVHGMIDSNPEALTKHLCKKIEPLSLAYLHYLRGDMVNQQIGDVVAWVRGSYSGVKISNLRYDFEEADQQIREGKVDAVAFGAKFIANPDLVERAQQNWPLNEPRPETYYTRTAVGYNDYPTYNK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural insight into the stereoselective production of PGF2(alpha) by Old Yellow Enzyme from Trypanosoma cruzi pubmed doi rcsb
molecule keywords	Prostaglandin F2a synthase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	136
structure length	379
sequence length	379
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2011-01-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3atyA00

2J9ZA 3M47A 3O06A 3TIMA 2ZZ7A 2W0UA 3W1RA 4X9SA 4IOTA 5C54A 1QFEA 2Q3OA 3KVLA 3M7WA 1KFEA 1MXSA 3EKZA 3P81A 2J88A 3N34A 3RLVA 5A8GA 3ELFA 1SPQA 1SFLA 3UQNA 3W87A 1JUKA 4C1KA 1CI1A 5KZMA 2UV8G 5BMXA 4O52A 3QYQA 4DO4A 1WV2A 1OF6A 4JTFA 3NQAA 1DHPA 1S5TA 4DO6A 3CC1A 4UTLA 1OFDA 2E77A 2Y62A 3UZ5A 5HR7A 4TIMA 3CM4A 3MP3A 3TK7A 2YX0A 2GPTA 4OT7A 3EXTA 3TC7A 1O94A 3VE7A 3LXAA 2OZ0A 4HIBA 2FB3A 2DU2A 3DI0A 3N3MA 3UD6A 4JTKA 4BF9A 5BRBA 4LS0A 5FEWA 3WK0A 1G4SA 3SR7A 3THQA 5I3GA 4Z1DA 3WK3A 5CSRA 3RLUA 3BW2A 4N2YA 2DZXA 2VELA 2WSYA 2E6YA 3IGXA 4O16A 4RV8A 1XI3A 3TJXA 1VCGA 2NWRA 3NL5A 1K02A 2I14A 3PB0A 4KWWA 5DELA 5G1TA 4AF0A 2C0AA 3TFXA 1XBZA 1FWTA 2BSLA 4IXHA 4N4PA 4TR9A 2OJPA 1SSGA 5BW6A 2GVJA 3B05A 1KFCA 2C16A 4HNTA 4UTTC 2ZRZA 3LCIA 1XM3A 5KZEA 1SO6A 2FPYA 4QQ3A 2P1FA 1WQ5A 2V81A 2DZWA 1LOQA 2ZA3A 1TQJA 2B7NA 4ZQNA 2VC6A 2P10A 3GNDA 4EWND 1TPC1 3ABSA 3IVUA 3BG9A 3ATYA 4UMBA 1YPIA 1R2TA 2OX1A 3N9SA 3PR2A 3KRUA 3SZ8A 3R89A 1SZEA 5HUOA 3W7GA 2V30A 4GWEA 1LTDA 4O19A 3NGJA 1S5VA 4JTIA 3MI2A 3C2FA 4O4WA 2GOUA 3PC0A 4UR8A 2C6QA 1W5OA 1YXCA 1TSIA 1XDLA 4IMDA 1A53A 4ADSA 1LM1A 1GQNA 3EX4A 3STEA 3EWBX 2R94A 1JCJA 1Q6OA 2J24A 4LC6A 1TPH1 3HGJA 1W5NA 4GUFA 4MKNA 4NJKA 3B4UA 3LHWA 1WYIA 3LCGA 1AW5A 1KFKA 3DXIA 4HSNA 4QM1A 5EPDA 2QCFA 5D05A 1FWNA 3G1DA 3PULA 3NXFA 3PUEA 3M16A 3G1SA 4JY8A 4IXXA 5CGQA 2F84A 5AC6A 4JNMA 2RDWA 2A85A 4NU7A 1QMLA 3EEGA 1H50A 2BTMA 4JEQA 1SSDA 1VYPX 1UUOA 2NUWA 1EB3A 1W31A 2H3BA 3CT7A 4DBDA 1FCBA 4NZJA 1RV8A 2Y6ZA 3L21A 3HPZA 1MEWA 3IGSA 1F7BA 4H4IA 3L68A 4UCGA 4YLWA 2WJZA 5ABTA 3EWUA 3S1WA 4GUGA 4HNNA 3TJLA 3UWYA 3C8FA 3KVKA 2E5BA 2CLLA 3EWWA 2JGYA 4ICNA 3GX9A 1Z48A 3O6DA 1C9DA 1ZFJA 4LT9A 4M6VA 1F74A 4TU1A 4DEFA 2H6RA 1UASA 2WSRA 3NNTA 1LBFA 1CX9A 3ZS4A 3C4UA 2CLMA 1VYRA 1FXQA 3TCEA 5K7JA 3IVSA 2ALDA 4LY8A 4E2BA 3D0CA 2Y7FA 1GWJA 3LHUA 3V75A 3L5MA 4DPPA 5DXXA 5HNRA 1TPVA 1FDYA 3S8HA 4Z0SA 5KITA 4CNPA 3IEBA 1SZGA 3VFLA 2B4GA 4O1CA 4O14A 2CW6A 3T55A 2NUYA 3G1HA 3I6RA 2VEIA 3DFTA 3H55A 3E9AA 2QCEA 1VQTA 4FB7A 1OFAA 1ZAIA 3W7JA 3L65A 2A21A 2NX1A 1FDJA 1GVRA 2JKEA 4IWWA 2FJKA 4ZMGA 1PIIA 2A6NA 1K03A 3L0GA 3TKFA 2H8ZA 4N4QA 3FJLA 2YR1A 3UXAA 5C55A 1JUEA 3IGUA 1ME7A 5G2WA 4UTMA 3LTSA 1QO2A 2E5DA 4GFSA 5LNRA 3U8GA 3N14A 3M44A 1W56A 3TV8A 3GK0A 2VFGA 4JX5A 1SFJA 3C6CA 1LRQA 3T4CA 2P0OA 5T26A 1NEYA 2X2GA 2JKAA 1FCVA 1WX0A 1GEQA 3MHFA 4XUGA 3MYOA 1MEIA 1OABA 1SU5A 3QW3A 3O07A 1DORA 1O95A 3Q37A 2EHHA 3FYPA 4QNWA 1CW2A 3N2XA 1GTEA 1H1ZA 3OBKA 1D3HA 3NZRA 4AAJA 2Z0IA 4OU1A 4IPJA 4MIMA 4MZ1A 3LB0A 3OG3A 2WO5A 4NUWA 1P4CA 3EB2A 1Z44A 2FFCA 3HQ1A 4UTKA 4K6AA 3Q58A 1LOSA 2EGZA 4LV4A 4JIPA 3AJXA 1GYNA 1EUAA 1IXNA 1THFD 2X1UA 1I2OA 3HGOA 4LUIA 4O54A 4PTNA 4AWTA 3RK8A 4LVGA 1DV7A 3S42A 1W37A 1XKYA 2W79A 4D2JA 2X1RA 1WXJA 1DKWA 2CLEA 3M6YA 1PV8A 3W7OA 4JDYA 4PH6A 2PE4A 4L4MA 2WQPA 5LGXA 4PEKA 5FF3A 4FNPA 2ZQ0A 3NOEA 3NAVA 1FDZA 4OBTA 1B4EA 4X2RA 3ZWTA 3NM3A 2EPHA 3I65A 3HO8A 3IV3A 3PY2A 1SR9A 1QPOA 4H6KA 5E1QA 1TV5A 4OQVA 2Y89A 5C6MA 3W75A 4NX0A 1QNVA 3EKLA 1LROA 3TA6A 1A5AA 4HHPA 4EF9A 1KM0A 4IX2A 4Z08A 5L6UA 5CPNA 1PHWA 2TRSA 4A2RA 1ALDA 1A5SA 2H8XA 3DKLA 1X6UA 3BARA 1UB3A 1TTJA 3DHDA 4M6PA 2FTPA 4TMCA 3I7SA 3NQMA 5I3KA 4ONVA 2CWNA 2YFNA 2Z1BA 4BI6A 1KFLA 2Y61A 3SIZA 1I2NA 3QJAA 3W7HA 2Y7DA 3NYZA 4I7UA 3W7NA 2DJXA 2E1DA 1LP6A 3C3NA 4CQ9A 1AG1O 2PC4A 4O13A 3KRSA 2C3ZA 3GDLA 3G1YA 3W2JA 4LRSA 3G1VA 3FJ6A 3QSTA 3RFAA 3DH7A 2ZFAA 1FBAA 4DELA 3M5ZA 4RX0A 4LU0A 5K3VA 3QEZA 1EEPA 1K8XA 3WJWA 1R30A 4MJMA 1HUVA 1YLVA 1TV8A 1TTIA 1WBJA 3NPXA 3I68A 5E0KA 3W85A 3USBA 4OHQA 4QIUA 5AHEA 4XWUA 4IMEA 3RNDA 4K8EA 1BWLA 2VFIA 1W3IA 2C13A 4A29A 3LHYA 4Y6GA 1P1XA 1JQXA 1YTEA 2XN2A 5C5YA 5D33A 1PVNA 4U28A 1ZENA 1JRCA 5F1VA 3TQ0A 4AVFA 1OX5A 1OFOA 4ZQRA 2GVLA 5CSSA 2HS6A 4NNBA 3W7RA 1OX6A 2NUXA 1F6KA 2IQTA 3LHVA 4PL2A 1VHNA 4Z1CA 3S1XA 1GTHA 4O50A 1KFBA 4A22A 1JQVA 4GJ1A 2A0NA 3NQDA 2AGKA 3KXQA 5BNKA 1QPQA 3W73A 4HN4A 2ZA1A 1IF2A 2QJGA 2DZPA 4LVBA 2QUTA 2ISWA 5LGZA 1W0MA 5U7SA 1SW3A 1EPXA 3IIPA 3GR7A 4R34A 4DXVA 3TW6A 3OVRA 4QSHA 4JYEA 4W9TA 1GJPA 1TO3A 1TQXA 1NVMA 4JTSA 1QDSA 3L66A 1FUYA 3PWAA 4JXCA 4BFAA 2QDHA 3V1PA 1A50A 2QCHA 2R14A 1NF7A 5DXYA 3GDRA 3ZWSA 1Q6RA 3MHGA 4O10A 1HL2A 3R13A 2R8WA 5F4XA 4FIQA 1KTCA 1V7YA 1DVJA 1T8XA 2Q8LA 3GR8A 3W1XA 3HPXA 4LTSA 3NPWA 3NDOA 4LC8A 1VCFA 3S5OA 3W7KA 1XC4A 2B7PA 2FDSA 2G97A 3LCLA 4UFKA 1TMHA 3WJYA 3VKJA 1D9EA 1AL8A 1MZHA 3NPVA 3NL3A 4FO4A 1EX5A 3DGRA 4A21A 5KINA 5I3FA 4UR7A 1FY6A 1TPUA 1W8SA 1O4UA 3C2EA 3E49A 5LHEA 3TX9A 4WOQA 2QCDB 3W6YA 4RK8A 2J9YA 5K9XA 1TV7A 1NSJA 3P8IA 3M1ZA 2HS8A 3WJSA 4RR4A 4KWVA 4MUZA 4CCDA 3SECA 1ZALA 4O11A 1G7VA 5J5RA 5DY2A 4ZL1A 4POCA 4N9CA 1IGSA 1I2PA 1GT8A 2ZYFA 4LV9A 2V0TA 3W7IA 3NO5A 4HPXA 4GUJA 2VKZG 4YL2A 2VENA 4YWIA 3TDFA 4UIOA 1W5MA 4LOCA 2ATMA 4FIRA 1DBTA 1TPEA 2VXNA 1KLYA 4JTHA 3W76A 4KFNA 2CLOA 1FWSA 2ZZ4A 3EX6A 3HGSA 3W84A 1J2WA 1KV8A 3C2VA 1QWGA 1W5QA 2A7RA 2A4AA 4JTJA 3CB8A 4R7JA 4JN6A 4K36A 1OHLA 4WOZA 4RZ4A 2X30A 3GNNA 2TYSA 4M6QA 1WOAA 1L2UA 5FEPA 3W1NA 3STFA 1GPWA 1H63A 4N6FA 2GUUA 4Z0JA 1VLWA 3PBUA 2C18A 4DF0A 1W5PA 2ZDRA 2J6XA 4QJ1A 1X8FA 3DFOA 5G2IA 3QQ1A 4WJEA 2Y7EA 4G1KA 5HMSA 1IXPA 4HSOA 1IXOA 5IBXC 3WJXA 4WY0B 1OJXA 4DPQA 4IPIA 1QCWA 2H3DA 4MLJA 4EOUA 1HG3A 4ADTA 3W1TA 3EX1A 4L4LA 3UPWA 3O6YX 4NQ1A 1MEHA 2OMAA 2ZTKA 5I3HA 2E68A 4RZ5A 3Q2DA 3LLDA 3M41A 4UMAA 4S1FA 3ABQA 3HB9A 4XZ9A 3UPBA 2WNNA 4MVAA 4XTDA 3BV4A 4FF7A 1S5WA 2FPVA 4UFHA 1Q3NA 1UBSA 4JGDA 2YPIA 1RQHA 2R91A 5FESA 4O57A 3GZ3A 3VNDA 1I45A 4XQ6A 2QJHA 1N55A 3G22A 2C15A 1QOQA 4FX8A 4UTJA 5AC8A 3W2NA 2ZZ3A 4LVDA 4AMAA 4PA8A 3UWZA 3W1PA 1VS1A 3QF0A 4J9JA 3B0UX 3G0XA 5AYYA 3A22A 3KOFA 1OFRA 4DF2A 1UCWA 2VFFA 4I9AA 1ZHAA 1L6YA 3CWNA 1KTNA 1YXYA 3NQFA 1K8ZA 3KFTA 5TIMA 5AHNA 4XBKA 5L9FA 3GXPA 4NXSA 2ZRXA 2ISVA 1G67A 3OIXA 4BI7A 1EIXA 1MSSA 3W7MA 1KTBA 4JR5A 2QCCA 1F73A 3IVTA 3HIJA 3CU2A 2ZRYA 3FEMA 4AWUA 1H7PA 3O8AA 4IQLA 1LLZA 3EWZA 4JS3A 4GE8A 2ZZ6A 1KBJA 1M7OA 3BW3A 4UUIA 4CCEA 3W88A 4X3ZA 5HWMA 4UNLA 3U6WA 3OVPA 2Z6IA 3LLFA 5CZJA 4Z1BA 2NX3A 5AFDA 1BTMA 3W7DA 5G5IA 1XFBA 4NJHA 3QC3A 4LNYA 1OK4A 3O16A 3K30A 4JTTA 3O1NA 5AYXA 4FXSA 3DU0A 3W1MA 2EAWA 4IMFA 2RFGA 1OFBA 3O05A 1WDWA 1YDVA 3W9ZA 1HO4A 2YCEA 5AHIA 1JVNA 3UWWA 1ZNNA 4O1DA 1VCVA 4XTIA 2RDUA 3SI9A 5GVJA 2FIQA 1FCUA 2ZRUA 3BK0A 2QAPA 2O7SA 4M7TA 2YW3A 3OA3A 2Y63A 4JIQA 2QJIA 3DENA 3W2KA 2QCMA 2CLHA 4LUJA 3LOTA 4RXFA 4UTWA 4BWLA 3FA5A 1I4NA 4GRSA 5CPLA 4EIVA 4HNUA 3DI1A 2GQ9A 1ONRA 4Y9AA 2V8ZA 1ZAHA 3FYOA 3BVJA 1F5ZA 2E5CA 3IRDA 3QQ0A 4MZYA 5D04C 1KM1A 1M6JA 4JICA 4E0CA 1G4PA 1OX4B 3R12A 4MOZA 3W1QA 2BZNA 3TE9A 4PODA 1YXDA 5CZTA 3G24A 3C61A 1I2QA 4ML9A 4LVFA 2Z2UA 5EYWA 3YPIA 1EP3A 3A21A 5AYZA 1QO5A 3P84A 3TUUA 2Z6JA 1OFQA 4FHAA 3KAOA 4O0ZA 2V2CA 3DKJA 3NG3A 1QR7A 1R2SA 1EP1A 4MYAA 1QAPA 3B0VC 3ABOA 1MO0A 5CPMA 2RH9A 4BI5A 1OYCA 1YADA 3EWYA 5EKYA 3W86A 2PRMA 4UFIA 4R33A 2KZHA 2D73A 4NJJA 5AHMA 3BW4A 5DCDA 5DCEA 1LORA 2NXIA 4WY0A 3DHFA 3THAA 1PS9A 1W1ZA 3F03K 1KM5A 3CIXA 3LDVA 3NQVA 4TX9A 3ATZA 1YYAA 1ZJIA 3HGRA 3SFKA 3GXNA 4K7YA 1AMKA 2DORA 2YYTA 5D30A 2VEPA 3LRLA 1GVQA 5G1YA 5DN1A 3W83A 1OF8A 4RLIA 1Q6QA 5K2ZA 3WK1A 3OVQA 1GG1A 3LI1A 3P8JA 3HF3A 4HPJA 4DO5A 1K7FA 2V2DA 2I9EA 4IX0A 5LNWA 4H3DA 3HG2A 2ABBA 4OWGA 1P0KA 1HTIA 5F2GA 4WUIA 5CKSA 4JTGA 3P74A 1GVSA 1NFBA 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3L9CA 2PURA 3Q94A 3SGUA 1TRDA 3NQ6A 1OX4A 2W6RA 3NZ1A 3F4NA 4MZ8A 5HJLA 2E6AA 3IIOA 3C2RA 3E0IA 3HMJG 4PFMA 3TMLA 2GVGA 3DFSA 4WXYA 4Q33A 1G4TA 2J27A 1UJPA 3W7CA 1VLIA 3N19B 1SZFA 3SY5A 3BPWA 3NQGA 3BGJA 4MFDA 3LCWA 1JCYA 1LDCA 3PM6A 3FS2A 4O8RA 3RU6A 3CHVA 3EXRA 4ZQOA 2VFHA 5D2TA 1LRTA 3I7RA 5H2ZA 1T99A 5EA9A 3MBFA 5J5DA 3VCRA 1I8JA 3L0NA 1AL7A 1VYSX 3DFNA 2XN1A 3E12A 4NXKA 2HTMA 3GIYA 3U2OA 3QM3A 1KM3A 3MYPA 1C29A 3FFSA 3VE9A 3F1QA 3OHIA 2QEZA 5U4NA 3HOJA 3QPYA 3W07A 3W3OA 4MJZA 1O60A 1EWEA 4GC4A 1F2JA 3W23A 4X22A 4UTIA 3CTLA 3GVGA 2FQIA 1KM4A 4JYDA 5FF7A 3KX6A 2ZCGA 3LCFA 2DZSA 3LV5A 5I3IA 5LKYA 4ZVJA 3T40A 3O6CA 3HPSA 3GYEA 3C0JA 1LLWA 1YDNA 1JR1A 1FXPA 4HNVA 3B0PA 3W71A 2PRHA 4EVZA 3KVMA 5AN7A 5CZ0A 2YDAA 3N2MA 1TPFA 1KBIA 5EMUA 1FQ0A 4O18A 4UTTA 3BLIA 1OYAA 3ANYA 5F1UA 5AB3A 2ATSA 1XCFA 5FF4A 4MY9A 3TH6A 6TIMA 4WZHA 4O53A 3M5VA 5KMYA 3RF9A 3NQ7A 3S5ZA 4Y90A 1R46A 3BLFA 1ICPA 1YPFA 1ME8A 1RPXA 4WX2A 2B0MA 4EF8A 5D2XA 2V2HA 2VFEA 1X7FA 3PVFA 2RKXA 3F4WA 2WV8A 4ORMA 4N6EA 4JTLA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3ATYA

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