4FO4 | Genus

Total Genus 113

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	113
sequence length	363
structure length	348
Chain Sequence	MHMLRIAKEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLRTRLTKNIALNIPMVSASMDTVTEARLAIALAQEGGIGFIHKNMSIEQQAAQVHQVKISGGLRVGAAVGAAPGNEERVKALVEAGVDVLLIDSSHGHSEGVLQRIRETRAAYPHLEIIGGNVATAEGARALIEAGVSAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIADAAGVANEYGIPVIADGGIRFSGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEVILYQGRSYKAYRGMGSLGAMSKLVPEGIEGRIAYKGHLKEIIHQQMGGLRSCMGLTGSATVEDLRTKAQFVRISGAGMKESHVHDVQITKEAPNYRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from Vibrio cholerae, deletion mutant, complexed with IMP and mycophenolic acid. rcsb
molecule keywords	Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Vibrio cholerae o1 biovar el tor
total genus	113
structure length	348
sequence length	363
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2012-06-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4fo4A00

5LGZA 1F05A 2KZHA 1LOSA 4A22A 3L68A 1KM4A 3GNNA 5D2WA 4NX0A 3TR2A 2OZ0A 3OEXA 1KM6A 3CPRA 1R30A 4L4LA 2BSLA 3W2UA 3QPYA 2R8WA 3LGEA 5DN1A 1TPFA 1LM1A 3GDTA 4AHPA 3V75A 2Y88A 1SO3A 3SIZA 1LLZA 4JN6A 2HS6A 3DH7A 3FFSA 2PE4A 4NNCA 3OHIA 5C54A 3HG3A 4HIBA 3GR7A 4GUFA 5HJLA 1LOLA 5BNKA 3B06A 4WY0F 3MYOA 4AB4A 4ADSA 2QCGA 3EX4A 2E6AA 2QCMA 4CCCA 3LHZA 3SY5A 1FY6A 3O6YX 3H55A 1KM2A 4OQVA 3W07A 1QNVA 3F4WA 1FWNA 4LV4A 2CZEA 3QW3A 1DBTA 2PURA 1EP3A 2E6FA 1TJRA 4UC5A 5C2XA 4UTLA 4B5NA 1QPNA 3NZRA 1FDZA 1LBFA 1NF0A 3W3OA 1SZNA 3S6DA 1P1XA 5CPLA 4ADTA 1K7EA 2ATMA 1YLVA 3EX1A 1Q3NA 4FO4A 3MMTA 2Y70A 3NQ6A 1ZENA 3M5YA 3W7EA 5LKYA 3NM3A 1H7NA 2DZPA 3CU2A 3GNDA 4QIUA 4U4MA 1RPXA 1MEHA 2J9XA 4N2YA 5LNVA 3NXFA 1I2RA 1UCWA 1HTIA 4UMBA 2DJXA 4KWWA 3FJ6A 2A7RA 3FEMA 5C5YA 3GDKA 2J9ZA 1FXPA 3GAKA 3NQVA 4K7YA 1XUZA 3GAYA 4R53A 3N9RA 1KLZA 4Q4KA 1G4PA 3NZ1A 2A21A 1TMHA 2ZZ4A 2C3ZA 2X30A 2YSWA 4AHOA 5DY2A 2DZVA 1GG0A 1KM3A 4O14A 3C2EA 3TCEA 5KITA 1WX0A 2V2DA 4X9SA 3HMJG 4NU7A 4FIQA 4IX0A 4M19A 1RVGA 3M6YA 3SSJA 1ME8A 5HWNA 1EUNA 1TYGA 3BGJA 3P80A 2Y63A 3G1VA 4GUGA 3I68A 1WV2A 2V5LA 5F2LA 3DAQA 4M7SA 1UUOA 1F74A 3W87A 3W1XA 4YWIA 3UY7A 3NGJA 3Q58A 3WJZA 2W79A 3FJLA 1XXXA 3NG3A 4N4PA 3LXAA 1TRIA 5AHNA 3DKJA 4X2RA 2Y89A 4O17A 3PSVA 1DL3A 2NUYA 1D3GA 1FCVA 3NQ8A 3HIJA 2QCEA 3STEA 3UWQA 5L6UA 2YCEA 3BARA 1I45A 1HO4A 4AWTA 3A9IA 1OF8A 1W3IA 3KX6A 4WD0A 3LRMA 5G1YA 3RLVA 3TSDA 4KFPA 1GZGA 4Y90A 3L5AA 2GQAA 4KWVA 2ABBA 4IQLA 1KFCA 2B7QA 1G4SA 1T99A 2Z2UA 4NJHA 1R2SA 3M41A 3EWWA 3FA5A 1Q6LA 4NT0A 1QPRA 1XBZA 3ABQA 3LHTA 4EWND 3H54A 1BWLA 4K38A 3YPIA 5HUOA 4MYXA 4WZHA 1YDVA 2GJNA 4DQWA 2FTPA 2C19A 1YDNA 3TW7A 2Z0IA 1TTIA 4FF7A 3MWAA 1DOSA 3C6CA 3TMQA 3CWNA 3GB6A 1W3TA 1RQEA 3B4UA 5LNSA 3THQA 3IRDA 4LOCA 1WXJA 1EP1A 3BG5A 4IWWA 4ML9A 5D05A 5IBXA 1OYCA 5F2IA 3WJYA 1VYSX 3C52A 4N6EA 1MXSA 4CQAA 1PHQA 2Q3OA 1GVQA 3EXRA 4LT9A 5DCBA 3HB9A 1OVDA 3EKLA 4S1FA 5HNRA 2E77A 3T44A 1JULA 3TH6A 2V9DA 5G2HA 1VHNA 1ZHAA 2C1HA 5I3HA 5I3IA 2GUUA 3W2JA 1H61A 4XTDA 3PBWA 4HPXA 1Z44A 2GVGA 2FPYA 1OFOA 2Z1BA 3L67A 3FKKA 3WK3A 3IGXA 1UB3A 2ZZ6A 2B4GA 3CWOX 4JTFA 3UYCA 2P1FA 4A2RA 3LLFA 4UMCA 3G0XA 1LTDA 5G4EA 1U83A 4BR1A 2WOQA 3WFAA 3HG2A 1QCWA 3NPXA 1KBIA 4UTJA 4JD4A 2QR6A 1M7PA 1ICPA 2Q8LA 2X1UA 3KXQA 1IIGA 2Z6JA 5EPDA 1H62A 3NPVA 4HNUA 3OG3A 4ZQOA 2WSQA 5HQEA 3QMTA 3IGUA 4UTKA 3TJLA 4O15A 2WV8A 1OHLA 4HSNA 3GX9A 5G2IA 3S8HA 3R8RA 3EWUA 1VR6A 1M7OA 3MUXA 3LI1A 4JTJA 3UQNA 1Z41A 2RFGA 4O10A 2NX1A 1VJIA 3MO7A 4Z1AA 3P67A 1H1ZA 2TMDA 5K9DA 2YGYA 2NUXA 2Y7FA 4G1KA 2A7NA 1KBJA 1TCDA 3M7WA 3EXTA 3USBA 1VRDA 2ZCGA 1PE1A 4NNBA 3ABOA 5DBUA 1W5MA 3OVRA 2PRHA 1JCNA 3RF9A 2DZTA 2WO5A 3SGUA 1ZAHA 2TYSA 3UPBA 3W86A 4ZMGA 2ALDA 1OFRA 4JGDA 3O16A 4RZ4A 3VI2A 2WNNA 4YXGA 1KTCA 2WJZA 4EIVA 4R33A 1EWDA 2CLEA 4NZFA 3PBYA 3MW7A 3C2VA 3UXAA 4XWUA 3W7KA 5AHLA 4IX2A 1IXOA 3THAA 3BW4A 1SSGA 3WK1A 2G95A 3OA3A 3RK8A 4EVZA 5J5DA 1BEUA 3G3DA 4YLWA 3W1RA 3MI2A 4WJEA 3P8JA 4AHQA 3G0UA 3W7JA 3G1SA 2E68A 1ME9A 2WPBA 2VEKA 3PF3A 1ME7A 1EWEA 4Z1BA 4BI7A 1OFPA 2QDGA 4FB7A 1JCXA 3MYPA 1W8SA 2HMCA 4JTHA 2J88A 1LZOA 3LV5A 2JGYA 3FYPA 4FXSA 5TBOA 4LS2A 5CG7A 3C2RA 4DO4A 3P8IA 2QDHA 4QISA 3QZEA 1HUVA 1SQ7A 2CW6A 2GJLA 1VCGA 3W1QA 4I7WA 5LHEA 3OBKA 3TJXA 4LS0A 4PTNA 3CM4A 3UWWA 4HNNA 4NXSA 6TIMA 1OFBA 4RR4A 4TMCA 4JTLA 1QOQA 5HINA 1G4EA 2WSRA 3N19B 1TREA 3BLEA 5KMYA 1L6WA 3IEBA 5AHEA 4WOZA 1G4TA 1KTBA 3FIGA 3W70A 5F2MA 3MHGA 4DBDA 3QFEA 1V7YA 4TX9A 2NWRA 3LHVA 4LW7A 4WUIA 3M5VA 4A3UA 4YMZA 3HGRA 1HFBA 3DFOA 3W7LA 1TV8A 3T40A 1JVNA 2C16A 1MSSA 3NQCA 1VCVA 4O16A 2H6RA 1X6UA 3S5OA 4GNJA 2RDWA 4ZL1A 4MJZA 4NXKA 4N9EA 1SSDA 1OABA 1GYNA 1LRTA 1YXDA 3B0VC 4KKXA 3NA8A 1L6YA 1BWKA 2ZZ7A 2W0UA 1M6JA 5F4WA 4LVFA 4Q32A 3LTPA 2CFFA 3M5ZA 3W7QA 3W83A 3LXCA 4IOTA 2VEPA 8TIMA 1LORA 4OT7A 4U28A 2C15A 5CGQA 3QQ0A 3QH2A 5K9CA 2C13A 4WY0A 4FNPA 5AFDA 1W5QA 1CW2A 4RJEA 1FWWA 1KFEA 3P7YA 4M5PA 1VCFA 1KV8A 4FX7A 3F4NA 1FCBA 4S2BA 2VC6A 3LV6A 2A6NA 5D2VA 1ICSA 1W56A 1WAUA 2ZA2A 1K8YA 4N4QA 2R94A 3EKZA 3CHVA 3U6WA 2V81A 1ICQA 3MP3A 1AL8A 1XC4A 1YPIA 4I7UA 1OJXA 2X2GA 3PULA 2RDTA 3AO0A 2UV8G 3ABRA 5CSRA 4C1KA 1M5WA 3GKAA 5FF2A 3EWXA 4O57A 5EBUA 3LRKA 3OIXA 3W1AA 3QMRA 4O28A 1ZAIA 1FCUA 4XUGA 3I6RA 2OMAA 4AVFA 1P4CA 3LCHA 1KM0A 2NV2A 1OFAA 2FFCA 1XBVA 1PVNA 3SECA 2OT0A 3PAJA 2P10A 4OGZA 3RMJA 2DZXA 3WJSA 1KFLA 4A29A 1I2NA 2VFFA 1XL9A 3G1YA 4JICA 5D37A 4O1BA 1N7KA 4HNTA 1OF6A 5DXYA 1Q6QA 2XN1A 4IPJA 5AC8A 3N2XA 2ZDRA 4CCDA 4IMCA 4LC6A 1FDJA 1B9BA 3NVTA 2CZDA 1EX5A 4LC8A 4TIMA 2PRLA 5AN7A 1WYIA 3LM7A 4XBKA 4NQ1A 1QO5A 1DKWA 1XUUA 3LERA 4IGHA 3QYQA 3N34A 3MHFA 4TR9A 4UFMA 3KAOA 4PA8A 3C2OA 1VHCA 2ZRZA 3TC7A 1AMKA 3GDLA 1SW0A 1SZGA 1BTMA 4FHAA 2JGQA 4MY1A 1TO3A 3ATYA 2ZZ1A 2TRSA 5F4SA 3W2NA 3ZS4A 4MVAA 4JIQA 4N9DA 5CKSA 4GUIA 1XFBA 2YW3A 3LCIA 5CZ0A 3LHYA 4N9BA 3PB0A 1WBJA 3HPSA 5DCEA 1GWJA 2QCHA 1O5KA 4EF9A 4I9AA 3EWZA 1RV8A 3W9ZA 3T4CA 3STGA 1OFDA 4K8EA 3G8EA 3GIYA 5LNWA 2D73A 3UD6A 1AW1A 3HGOA 3N73A 3W1TA 4ICNA 3TKFA 4DF2A 3LOTA 1JQVA 4AAJA 3BW2A 4AMAA 4HT3A 5I3FA 1K8ZA 1O5XA 1LLWA 3EX3A 5DELA 1MZHA 3A5FA 1OX5A 4IMDA 4Z08A 2ZZ3A 3W73A 3UZJA 3G1FA 2QAFA 2VOMA 1SPQA 2FIQA 2VFGA 3C2FA 5HWJA 3W7HA 2EHHA 4GUHA 4LNYA 3W23A 1DQXA 5D2YA 4FNRA 3S9YA 1DHPA 3CIWA 3W7PA 4RLIA 1UUMA 1T0OA 1V5XA 5BRBA 1W5PA 1I2QA 1O60A 4LS1A 1A50A 1RR2A 1R46A 3GR8A 3EEGA 4MOZA 4JY8A 4O4WA 4UFKA 4O1AA 4RKAA 3W71A 5FF7A 1YTDA 3W76A 2G96A 4PL2A 3LB0A 4OE7A 4RZ6A 5KZDA 5FESA 2ISWA 3TXZA 3M16A 3PS7A 4JTSA 3W7OA 2FB2A 4TU1A 1K3UA 2IQTA 2V82A 3E0IA 3TU9A 2OX1A 1OK4A 1H1YA 1EEPA 1QR7A 3E12A 3TA6A 3UNDA 1Q6OA 4QNEA 1LRNA 3KVKA 1YXCA 3O15A 4JS3A 3L2IA 4JTEA 5AHFA 4UTMA 5GVJA 2QUTA 5LNRA 1Z48A 2BZNA 3GKFA 3BLFA 5CPOA 3NR0A 4LRSA 2AGKA 3M44A 4AWSA 1BKSA 1VZWA 2FB3A 3VE7A 1DJQA 2VFDA 2GQ8A 1AK5A 3ABSA 3IIXA 1W3NA 2TPSA 4O4VA 4AH7A 1SUXA 2DU2A 5I3JA 3VCRA 1TPVA 3QMSA 4UXDA 1MEWA 1VH7A 4RXFA 3SI9A 2G97A 3IVSA 3N2MA 2W6RA 4GBUA 3ZFHA 2DZSA 2ZA3A 3GXPA 1H7OA 4O19A 4DPQA 3MBFA 4FNTA 4O0KA 4O1CA 3W2MA 3P84A 1QPOA 1IGSA 3LBMA 3LCXA 1FXQA 2CLHA 1EIXA 2F84A 5F4XA 3UWYA 3BGGA 3G1XA 3JS3A 5CSSA 3G24A 1GYLA 5D2TA 5DY3A 4O50A 1JUBA 4P2VA 1EUAA 5HWMA 1FUYA 3O6DA 3DGRA 2GPTA 5AYXA 2NLIA 4JDYA 5AYZA 4Z1CA 4K8HA 4I7VA 1W37A 3HO8A 4C1LA 3L0NA 2JBMA 5LNUA 1HO1A 4JX5A 2E5CA 1FWSA 5LSMA 2DORA 3WJWA 3RLUA 4HNVA 3GXTA 3DFPA 3WK2A 3BO9A 4D2JA 1SZFA 3GK0A 1QAPA 5EKYA 1XM3A 3NAVA 3ATZA 3O07A 3FS2A 1OG0A 3Q37A 3QC3A 5TQLA 2FPTA 1K03A 2CZFA 4K36A 3G18A 4NJIA 2VFIA 1F6KA 5KSWA 4E38A 1Y0EA 4DBEA 1C9DA 1G7VA 3QEZA 1X1ZA 1K02A 5AOUA 1S3HA 4NVTA 3LHWA 4PCFA 3ZR4A 3UZ5A 1VYPX 3TX9A 3E96A 4IXHA 3W7GA 3E49A 4IMGA 1A5BA 4MFEA 2LLEA 1TJPA 2DZUA 3SZ8A 3W1PA 1PCKA 4HKPA 5FF3A 3NYZA 3MP5A 2NXHA 1KV5A 5G2WA 3BV4A 3TMLA 5DCDA 3BG9A 4RZ5A 4UTTC 4JTTA 3PVFA 3QQ1A 4AF0A 2QCDA 3PSWA 3W72A 5K4XA 1FWRA 1RZMA 1H63A 2JKEA 3I7RA 3CC1A 4JTKA 2VELA 4X22A 3W7IA 4JNMA 4NJKA 2QEZA 4ORIA 1VLWA 5D33A 3NO5A 5BMXA 2BTMA 3LBCA 3EWYA 4KFNA 3C56A 3JRKA 4IMEA 2X1SA 1AL7A 1NF7A 4O13A 2QCLA 3IIZA 5AB3A 3DFQA 4CQ8A 1NVMA 3KRZA 3PG8A 4IJBA 1DJNA 1TTJA 2G5WA 3HJZA 4Y6GA 1PS9A 3LCFA 1FCQA 1GG1A 1UBSA 4LV9A 5KZMA 1TPWA 2Q3RA 3UY8A 3NNTA 3R5EA 1PCWA 4BWLC 4GRSA 2XN0A 1FBAA 2BX7A 3C3NA 1A5AA 2YFOA 3M9YA 4GC4A 4UNKA 1TIMA 5I3GA 2Q8ZA 3DKLA 3EX2A 1NAL1 4RXGA 3KHJA 3BG3A 3P74A 4JYEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4FO4A

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