1H1NA

Atomic resolution structure of the major endoglucanase from thermoascus aurantiacus
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
AKVFQWFGSNESGAEFGSQNLPGVEGKDYIWPDPNTIDTLISKGMNIFRVPFMMERLVPNSMTGSPDPNYLADLIATVNAITQKGAYAVVDPHNYGRYYNSIISSPSDFETFWKTVASQFASNPLVIFDTDNEYHDMDQTLVLNLNQAAIDGIRSAGATSQYIFVEGNSWTGAWTWTNVNDNMKSLTDPSDKIIYEMHQYLDSDGSGTSATCVSSTIGQERITSATQWLRANGKKGIIGEFAGGADNVCETAITGMLDYMAQNTDVWTGAIWWAAGPWWGDYIFSMEPDNGIAYQQILPILTPYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Atomic Resolution Structure of the Major Endoglucanase from Thermoascus Aurantiacus
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO TYPE CELLULASE ENGI
total genus 124
structure length 305
sequence length 305
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2002-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h1nA00
1UG6A 3MUIA 4EE9A 4RE2A 2VX6A 3CHCA 3ZJ8A 1PPIA 4Z2IA 2VO5A 3CZJA 2QHAA 1FFQA 3GTNA 4HZ6A 1QNPA 5JBEA 2OYKA 3VIPA 5A6MA 3THDA 2OWWA 4OKDA 3ZMRA 3A47A 5I2UA 1UR1A 3ARXA 2CBUA 8A3HA 2DSZA 2XHYA 1KB3A 2WMKA 3QOMA 2DT0A 4B3KA 2WMFA 2VZUA 3AYSA 2V5DA 1E3ZA 1W32A 1CLXA 2E8YA 1E73M 1E3XA 1BGGA 4CU8A 1I1WA 2BVYA 3NIYA 6CGTA 5A8MA 5EB8A 1JZ3A 4XUYA 3WFZA 2YA0A 1OCQA 1KXHA 2WKLA 1NWRA 1ITCA 2J7BA 3NJ3A 4S3JA 1MW2A 3HU7A 2W63A 4KRTA 1M01A 3ALFA 2J47A 4KWUA 1C90A 4MJ4A 4N42A 2D24A 3VKKA 5JIPA 5I0DA 5FOOA 4AY1A 1V3JA 4X9YA 3CUHA 4AMCA 4HOXA 3AMDA 3IK2A 1OD8A 3WH5A 2FGZA 1DWIM 2XIIA 2XUCA 3AISA 2CHNA 1JI2A 4GZJA 4GPNA 1UD6A 1MXDA 2QF8A 1GW1A 1HJXA 3CBWA 2DSVA 1JYNA 4CKQA 1LWHA 3EDFA 2A3BA 1V0LA 1ISXA 1E43A 4Z2LA 1HP4A 4BF7A 4PMNA 2VQUA 2ZUSA 3G6LA 2W67A 2WMJA 5A8PA 2CYGA 1UD5A 1JDDA 1UKTA 4UQ9A 4JFUA 3SUSA 1E6RA 2WMGA 1H0GA 1MQQA 3PTMA 4P7OA 1H2JA 1OINA 2DSKA 2QMJA 2BY0A 1BYBA 1Q6EA 4JKLA 2XVNA 3VD3A 2WHMA 4AIEA 1K9TA 3A4AA 2DIJA 1I1XA 3GYCA 4U2YA 3S2CA 1TVNA 4XX6A 2OLHA 2EQDA 1JG9A 3RILA 4BQ3A 3OB8A 4C7GA 1RP8A 4D6IA 5A6BD 1ESWA 1UKSA 3AZRA 2J25A 3BC9A 2ZX5A 3WD3A 2YKKA 2RGMA 2E8ZA 3W6MA 3DC0A 3MV01 1MVYA 2XJ7A 1ZL1A 3IAQA 1FH7A 1ZBCA 1CDGA 4D6JA 5A3HA 4JFWA 4NRSA 3AS3A 1XCWA 5D4YA 4XZWA 1ITXA 2YL5A 3WNNA 1MWOA 1R8LA 4U31A 1LL4A 4H7VA 5JUVA 1VF8A 3WUGA 1CTNA 2W62A 1H1NA 4CCDA 5HDRA 1JZ8A 1VFUA 4MPKA 3IJ8A 4RE4A 2GDVA 3AIRA 1CGWA 4W89A 1B3YA 2AAAA 5EBAA 2EPLX 2CHOA 5I3DA 5M03A 2Y2WA 3OGRA 1BYCA 1D2KA 3GH7A 7TAAA 5FCZA 4PMDA 4GO8A 4OUEA 1E6NA 4MAZA 2PF0A 5DT7A 1C8YA 3I3EA 4CVWA 1RD6A 1BYAA 3O9NA 3PZTA 3UERA 3OBAA 3WNPA 4W93A 3VILA 5E9AA 1XCXA 3VX1A 1WZMA 3PZUA 1ISVA 1AQHA 5FKYA 1W3HA 3BAXA 4F9JA 3BXWA 4TUFA 5FL0A 4W88A 3SCQA 1E6PA 4UQAA 3PZVA 2W5FA 2F2HA 3W27A 4PMQA 1V0MA 2XVKA 3WBEA 2EJ1A 2WVSA 1X1NA 2VX7A 1EDGA 2Z1KA 2YJQA 4LGXA 4ZENA 1F4HA 1TFVA 2EEXA 3FHQA 4CD8A 1C91A 2BY1A 3W6LA 2BNJA 1XSJA 3W4RA 2DGAA 3PZQA 4OBSA 4W7UA 2WC4A 1Q6FA 3ZR6A 4CD4A 3KL3A 4TTGA 4AD2A 1YHTA 4PTWA 2OYMA 1GORA 1JZ7A 1TR1A 4P7NA 1GCYA 4K68A 4F66A 4ZE4A 3K4DA 2O9PA 3L4UA 5A8QA 1CXKA 1MW3A 1UR8A 3CH9A 1XH2A 4WIWA 3KWXA 3WY1A 3UG5A 4TVDA 4AEEA 4H8UA 4AIUA 3M46A 5IFTA 4JL1A 2G4FA 1QNQA 2XYLA 3LMYA 4ZE5A 3B9AA 3T2QA 4E4PA 2V5CA 3VGGA 1RP9A 3IANA 3WQ6A 3AZTA 4D1JA 1VFFA 4MADA 1H41A 5CJ5A 3N13A 1GONA 3SCVA 2ZX9A 1VEOA 3PTKA 2YL9A 1KQZA 4BQ2A 3AIEA 4J3UA 4PCTA 1GVYA 1VENA 2J8GA 3MANA 1W3LA 3MMDA 5EFDA 1LG2A 3ARPA 1V3LA 3ZJ6A 3WH8A 2NT0A 3FNDA 2OYLA 1EH9A 3TP4A 2XSAA 1EDTA 1FH8A 1WKYA 1TE1A 9CGTA 4W8LA 2GUYA 2WBGA 1BPLB 1IT0A 1ZJAA 4HTYA 4AZCA 2DT3A 4DUVA 3L4WA 3T0AA 4HOZA 3ALGA 5AC5A 1GQIA 1PIGA 2WNWA 5E0FA 1HT6A 1Z32X 2FHBA 3HN3A 4D1IA 5C8BB 4ATWA 2GJPA 3WL1A 4CUCA 2X1IA 3BLPX 2OSYA 2CITA 2XVPA 3VGHA 2DQXA 4UFHA 3VIOA 2DSWA 1CXFA 2VRKA 2J77A 1FOBA 1EDQA 3TOPA 2YL6A 4QP0A 3SEPA 1IV8A 3VIJA 2B31A 2XIBA 2Y4SA 5D8ZA 4PSRA 2BHYA 1J10A 5JBDA 2IUZA 4MB3A 1B0IA 3FAWA 3SCNA 3UG4A 2GK1A 4LYQA 4PRWA 3WMBA 2PI6A 3WF2A 4H8VA 1DEDA 1HJQA 2VL4A 1X6LA 4B16A 3T2PA 3LPFA 2J7FA 3JUGA 5BXSA 2CIPA 1SYTA 2XWEA 3WF4A 4GI6A 3SURA 3VGBA 3WBAA 2ZUUA 4BS0A 1RPKA 3FAXA 4AISA 4QCFA 2WMHA 3RM8A 3CUIA 2X05A 4AD0A 1PIFA 1LWJA 2WLYA 3K8MA 1E0WA 3QHMA 2JIWA 2ZX8A 3VNZA 1GZJA 5AC4A 2FHFA 1DHKA 1UR0A 4CCCA 4OIFA 1E0XA 2XVGA 3ARVA 1SFSA 1HJWA 1ODZA 4PMYA 4D72A 5BXRA 4L4PA 3U7VA 1W2PA 4Y7EA 3QGVA 2VOTA 4CD5A 2YBTA 3WUEA 1JYWA 3A6OA 3W81A 4UQBA 2J78A 3AIQA 2V3FA 3AMCA 4CVUA 2ZICA 5A6KA 1KGWA 1E4IA 4BCEA 3ARRA 1G9HA 2BXYA 2C8NA 1OGSA 1FHLA 5A6BA 3SUVA 5AYIA 2J75A 2CEQA 4UTFA 1OGGA 2NW0A 4YHEA 5HNNA 3KE0A 6TAAA 4MNMA 3TA9A 3TONA 4N0RA 1X6NA 1ISYA 2O9TA 1B3WA 1PZ3A 2VX5A 3DYMA 3W28A 3GM8A 1E4MM 1EQPA 2HVMA 1GOWA 5A8OA 5A69A 1UR2A 3VIHA 4AZCB 1WE5A 5D9NA 3VMOA 2UY2A 3FHAA 5DO8A 1BQCA 4U2ZA 4V2XA 1QI0A 4L4OA 3WNOA 2GFTA 2WVVA 4OJYA 3VD9A 1OSEA 1NWTA 4UQEA 4TOQA 1CLVA 1UR9A 1VIWA 3MSGA 3W53A 1JZ5A 4LXFA 1UD8A 4JKKA 3ZT5A 1GJUA 2D23A 3D5HA 2JEQA 1UD2A 1V3MA 1KFWA 1HKIA 1JAEA 1JNEA 1SMDA 4PMRA 3VD7A 4FK9A 2GK1B 2A3HA 2UY4A 3AYRA 3EYPA 1CIUA 3QR3A 3WIJA 3AHXA 3B9EA 1E4NA 2WVUA 4X0NA 3WNMA 5M5DA 2DT2A 4HU8A 4CD6A 2FHCA 1C3FA 3WKZA 1N82A 2WZIA 3BAYA 3GXFA 5CGMA 1QBAA 3WUBA 8CGTA 4DM1A 5HPCA 4JHZA 2WW5A 1NP2A 2VZTA 2BVDA 4GIAA 3W29A 2W4XA 4U3AA 1NWUA 2PB1A 2D1ZA 1E6SM 3ECQA 4QFUA 1OD0A 3MMWA 3LPOA 2F61A 3AIVA 1PEZA 2G3JA 4AD3A 4D6FA 2WBKA 5A2BA 2VRQA 1UD3A 1CXHA 5DT5A 1ZS2A 3SCTA 3UCQA 1B3ZA 2O92A 5HBFA 4MDPA 3WUFA 1ISWA 1OT2A 4AEFA 3WEMA 1OT1A 2QV4A 4AZIA 1E6XM 2CNCA 2VQTA 3VNYA 3MMUA 4WLCA 3U7BA 3CHEA 2OSWA 4PUDA 2NT1A 3NDZA 3OGSA 1EOMA 3AQUA 1LL6A 1V6XA 1PZ2A 2CETA 1P6WA 1JF6A 1ODUA 2WHLA 2ZUWA 5C70A 1G5AA 3VMPA 4D71A 1CPUA 1UH2A 4PUEA 1UH4A 4IPLA 3RCNA 3WQ8A 1KXVA 1NOFA 3MUAA 2GJRA 2Y8KA 5GNXA 2VUYA 1JL8A 3EBVA 5ABHA 2X09A 2YLAA 1QNRA 1AQ0A 1GHSA 2PWFA 3MSDA 3RMEA 3VIMA 3EDDA 4WSJA 1E5NA 1BTCA 3PZ9A 2J7CA 4AD1A 1JFHA 2AOSA 4UFLA 2EBNA 2WC3A 5I23A 3OG2A 1ZBVA 5GNZA 3RDKA 3RIKA 1LL7A 2PBGA 2E9LA 3N18A 4JL2A 3A3HA 3LPGA 1HKJA 2JF7A 2VVSA 4LYRA 1H3GA 3ZOAA 5AY7A 2XGIA 3AXHA 4RE3A 1G01A 2YLLA 3DYOA 1EGZA 3AHTA 2QMKA 4XB3A 1UWUA 4ZXOA 2WB5A 4MAVA 1VB9A 5D9PA 3WH7A 1R85A 1VBRA 1QPKA 2D2OA 3SCPA 5LA1A 2E0PA 3W24A 1B2YA 1B30A 4HZ8A 1HKMA 1V6VA 4HP5A 3FW6A 3MU7A 2Y24A 2V38A 3WQWA 1JAKA 2X0HA 4U33A 3GNRA 4M1RA 1CGUA 4W8BA 1LLOA 2ZWZA 3VGEA 1E6QM 4W86A 1H0IA 3RJYA 5E0CA 1CNVA 3VDHA 3OA5A 1GOMA 1Q6CA 5CSYA 1K9EA 4E8DA 3VIGA 3SUWA 2OSXA 3U5YA 3L4VA 3MUY1 4QCEA 1TG7A 1WZKA 1UHVA 1UWSA 2J7EA 1UZ1A 4KMQA 2O9OA 1ISZA 3BLKA 3CHFA 4ACZA 4V28A 4AD5A 1WPCA 5D9OA 2ZXDA 4QLJA 3KEHA 4EK7A 1E5JA 5A95A 3OZPA 1C7SA 2FH8A 3CO4A 5IXEA 5A8NA 4UQCA 3FN9A 2WZEA 4AXNA 1QNOA 4PYSA 4H04A 1HJUA 3WD2A 1TZ7A 1VFOA 4P8UA 4JFSA 7CGTA 1DWHM 4HPHA 4C7DA 2EPMX 5CSUA 4J3WA 2CCRA 1JZ6A 3U57A 1JF5A 3ARSA 5LA2A 1B9ZA 2WMIA 4FMVA 4OOZA 4R5EA 2VZSA 3ZR5A 3BCDA 1KGUA 3ARQA 2G3IA 5IFPA 3W0KA 4BQ5A 3GBDA 4J28A 4C7FA 1JDCA 1CGYA 3AROA 1E71M 2WSPA 4HA4A 3CZLA 1HF6A 5CPSA 3M7SA 3WH6A 1JYVA 1E56A 4QLKA 5IHSA 1W1TA 3NUKA 4HMDA 1UH3A 2E40A 1HIZA 1V0NA 2CERA 3AS1A 5BXPA 1HKKA 4W87A 3SCWA 1QI5A 3BCFA 5A2CA 3WQ5A 4KGJA 1VEMA 3M07A 2JE8A 1M04A 4KH2A 2E9BA 4ACYA 1J9YA 4GI9A 3MV11 3OLEA 5DFAA 3GXMA 2WVTA 4U5KA 4ZFMA 3CZKA 4HMCA 4CN1A 4AZBA 3PBGA 2BV9A 4B9YA 4P8WA 5FL1A 3AIUA 3IJ7A 5CG0A 2BHZA 4LX4A 2VNCA 3VMNA 3AS2A 4YHGA 1R7OA 4EKJA 4MNLA 4UCFA 4HOWA 1BF2A 1V0KA 1KCLA 4CN4A 3VM7A 2Y8VA 3K1DA 1W9VA 1VJSA 2WKGA 4ATDA 3CZ8A 4WKHA 4EANA 4DUXA 1KCKA 3G6MA 1VFMA 4PCSA 5CLWA 4NF7A 1E1EA 1W9PA 2OWXA 2YL8A 3J7HA 3PZMA 4FF5A 3PHAA 3ZIZA 2W91A 2BXZA 3VDAA 1GUVA 1GQLA 4Q22A 2JALA 2OWCA 3B8SA 2JEPA 3WDQA 1JXKA 4AW7A 3NCOA 2G3MA 3I3BA 1XSKA 4MB5A 3CUJA 4UZSA 1CZ1A 4YN5A 1EIBA 1JNDA 4BZYA 1WO2A 3POHA 3WD0A 4UFMA 2VI0A 3VOCA 2FH6A 2ZUVA 4X0VA 3HMCA 5BXTA 2ZX6A 3GH5A 4JFVA 1V03A 4HMEA 5IDIA 5ABFA 4OBRA 4JAWA 1K9DA 5D8WA 1G1YA 2WMIB 1QVBA 1AVAA 3AICA 3APGA 3POCA 2VCCA 1QNSA 1E70M 2WZHA 4P7LA 4B9ZA 1MW1A 1KQYA 1ECEA 2VJXA 4DWSD 3K8LA 2C0HA 4M24A 1R7AA 1OIFA 1NOWA 2JF6A 3VIIA 2E4TA 1DWAM 3THCA 1DWGM 3VGFA 4BA0A 1BHGA 2XM2A 3EMQA 2QPUA 2W92A 2EO7A 3ZM8A 2QPSA 4OOUA 1J11A 1K9FA 2ZOXA 2MANA 3QOKA 1US3A 5FIPA 2HISA 1JI1A 3GXIA 3CGTA 4J3VA 2UY5A 5GPRA 4MB1A 2WWCA 2YDQA 1B31A 1R86A 1KGXA 2XFYA 3AXXA 2DSUA 2ZXAA 2EXOA 1GQKA 3QHNA 2ZXQA 4BQ4A 2VVNA 1W1VA 2WHKA 5I77A 3MKKA 5E09A 1BAGA 1NARA 2BY3A 3KZSA 1C7TA 2ZIDA 1HNYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UG6 A;  3MUI A;  4EE9 A;  4RE2 A;  2VX6 A;  3CHC A;  3ZJ8 A;  1PPI A;  4Z2I A;  2VO5 A;  3CZJ A;  2QHA A;  1FFQ A;  3GTN A;  4HZ6 A;  1QNP A;  5JBE A;  2OYK A;  3VIP A;  5A6M A;  3THD A;  2OWW A;  4OKD A;  3ZMR A;  3A47 A;  5I2U A;  1UR1 A;  3ARX A;  2CBU A;  8A3H A;  2DSZ A;  2XHY A;  1KB3 A;  2WMK A;  3QOM A;  2DT0 A;  4B3K A;  2WMF A;  2VZU A;  3AYS A;  2V5D A;  1E3Z A;  1W32 A;  1CLX A;  2E8Y A;  1E73 M;  1E3X A;  1BGG A;  4CU8 A;  1I1W A;  2BVY A;  3NIY A;  6CGT A;  5A8M A;  5EB8 A;  1JZ3 A;  4XUY A;  3WFZ A;  2YA0 A;  1OCQ A;  1KXH A;  2WKL A;  1NWR A;  1ITC A;  2J7B A;  3NJ3 A;  4S3J A;  1MW2 A;  3HU7 A;  2W63 A;  4KRT A;  1M01 A;  3ALF A;  2J47 A;  4KWU A;  1C90 A;  4MJ4 A;  4N42 A;  2D24 A;  3VKK A;  5JIP A;  5I0D A;  5FOO A;  4AY1 A;  1V3J A;  4X9Y A;  3CUH A;  4AMC A;  4HOX A;  3AMD A;  3IK2 A;  1OD8 A;  3WH5 A;  2FGZ A;  1DWI M;  2XII A;  2XUC A;  3AIS A;  2CHN A;  1JI2 A;  4GZJ A;  4GPN A;  1UD6 A;  1MXD A;  2QF8 A;  1GW1 A;  1HJX A;  3CBW A;  2DSV A;  1JYN A;  4CKQ A;  1LWH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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