3N14 | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	359
structure length	359
Chain Sequence	SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHALE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
publication title	Determinants of substrate binding and protonation in the flavoenzyme xenobiotic reductase A pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xenobiotic reductase A
total genus	127
structure length	359
sequence length	359
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2010-05-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3n14A00

2GQ9A 1ZJIA 1TTPA 4ORMA 4UTKA 4IPJA 2PC4A 5CKSA 5FF7A 4Y8FA 3SR7A 4HT3A 1OX5A 3O8AA 1W8SA 3VCRA 1RPXA 5EBUA 2B7PA 3LTYA 2E09A 4JDBA 5G2IA 2V30A 4ZZ9A 1FQ0A 1H7PA 3QW3A 4WY0F 2DU2A 1EIXA 4AVFA 1S3HA 3EWYA 1GOXA 5AOUA 3GIYA 3A23A 4KFPA 3TAKA 4ZQOA 2B4GA 3W7RA 2C3ZA 4LS2A 4JX5A 2QKFA 3PBYA 4LWWA 3E9AA 1UASA 4U4MA 5AC6A 3G1DA 3C2EA 5DXXA 3B0VC 4UTHA 3IGSA 5I3GA 2VEIA 3WJZA 3ABOA 4RXFA 5D02A 3EWWA 3NXFA 1LBMA 2JK2A 1XBVA 4O53A 1G4PA 1GT8A 2B7QA 2C19A 2Y7DA 2VFFA 2NV1A 4M6VA 3TW6A 1G4SA 3C2OA 3BO9A 4JYEA 1M7PA 4FNSA 1OFBA 3EEGA 1R2RA 4FNTA 1JQVA 3GAYA 3GDMA 3ATYA 1J4EA 1D9EA 3C61A 1H7XA 3LXCA 4Q32A 1ICPA 1WOBA 2X2GA 3W83A 1ZY9A 3NQ2A 2AQWA 3A22A 1HTIA 4K39A 2D73A 5D32A 1DJNA 3WJWA 1G7UA 5KITA 3LX9A 1VCVA 1ME9A 4O1AA 3CQ0A 3NQ8A 2E6DA 2J6XA 1KM5A 3W72A 1ME8A 1LRTA 1Z42A 4AWTA 3PWAA 3MW7A 3LOTA 1M5WA 4PEKA 3NQAA 3R13A 1ME7A 1PVNA 3P8IA 5A5WA 1LRQA 4DF1A 2QJHA 1HO1A 3L21A 4HN4A 5MHBA 5AFDA 4UTTA 4E38A 1MXSA 5A8GA 3B06A 1EWEA 4PA8A 3LCGA 3V1PA 3WJSA 4QNWA 4IMDA 3F03K 1H51A 3FLUA 3UXDA 4O14A 4PH6A 3W2NA 4R7JA 4EF8A 4UTLA 3W74A 1L2UA 3NQEA 1WBJA 2J24A 4QISA 2I14A 3NQVA 3HGRA 3MYPA 3DZ1A 2VC6A 2ZZ5A 3UWYA 3T4CA 4HIBA 1TPWA 1A53A 5I3IA 1ZALA 3LERA 1AW5A 3TMLA 3HGOA 1YPFA 5D33A 1TPC1 2A85A 4K7YA 1AW1A 1EEPA 2E5DA 3PB0A 1G6CA 1YDVA 1AK5A 4ZQNA 3HOJA 2WNQA 5I3JA 2X1UA 4LS0A 3TQKA 3KX6A 3O6CA 1W1ZA 5FI8A 4BR1A 2NWSA 4CNOA 2PRHA 1PCWA 2VFHA 5AHFA 5F2MA 1VYRA 2E6AA 1V7YA 3KHJA 3I68A 2BSLA 3NQCA 5KZDA 4JR5A 1BEUA 4QAIA 4MY8A 3W9ZA 3FFSA 4A29A 5CG7A 1GZGA 1B3OA 3PS7A 5LNVA 1ADOA 1TTJA 3HO8A 3OHIA 2ZA2A 3L5LA 1GVQA 1XBXA 1LP6A 3L2IA 4A2RA 1HL2A 1GG0A 3T55A 5AC7A 1UUMA 4M7SA 4XKYA 3QRHA 3PAJA 4Z0SA 1HG3A 1UUOA 1EPXA 3CLMA 5ABTA 2I9EA 3W2JA 3B0PA 4HSOA 5D05A 2QCDB 1BKSA 3DAQA 3N19B 3G1VA 3W7QA 2OT0A 3LXAA 3HQ1A 5KTLA 1SW3A 3M6YA 2XN2A 3SIZA 3E49A 5F1VA 5HINA 1GJPA 4AH7A 3DBPA 4UTJA 3UWZA 1RD5A 1SO5A 1TPVA 3GXNA 2ZA1A 3LTSA 1O95A 3P74A 3PUOA 3M43A 2NUWA 2CW6A 3SFKA 1OFPA 3LV5A 4R34A 2W6RA 3ZWSA 1QPQA 1ZAHA 2ZCGA 4N6EA 2EGZA 4KWVA 1NSJA 2HMCA 4AB4A 1GVRA 3W6YA 4IUOA 3W7IA 3W2KA 1F6PA 4O19A 3S5YA 1GVOA 3A21A 3W88A 3NPXA 1O5XA 3LCFA 3GDLA 4NNAA 4P2VA 3LCIA 4FB7A 4KWWA 3G3DA 3RNDA 5AC8A 3B03A 2BXVA 4HSNA 4QM1A 3BGGA 3EX3A 1LRNA 5HWMA 2C0AA 1GTHA 3W7MA 4S1FA 3NZRA 4UTWC 4AWUA 5D2VA 3S0CA 2ZBTA 4NJIA 4OV4A 3R5EA 2RDWA 3TJLA 5K4XA 1SZEA 1TSIA 1P5BA 3THQA 1T99A 5BRBA 3PBWA 4HNUA 1TPEA 4CQAA 3NPUA 2WQPA 2ZRWA 1KM3A 3UZJA 3EX6A 1VPXA 3PUEA 4NVTA 3WFAA 3DH7A 3QQ1A 5EA9A 1TQJA 1QNVA 5FESA 3NQFA 1OYCA 3L67A 4IQLA 3M7WA 3MJYA 3TC6A 1OK4A 1NAL1 1SFLA 4JTSA 2A6LA 4TU1A 4JX4A 4MZ1A 2OX1A 4JTJA 3W2LA 4LUJA 4IMCA 4FX8A 4XBSA 5HQEA 3BVJA 3EXTA 1YADA 1I2OA 1XCFA 1IXQA 5HR7A 3W2MA 3IGXA 3PR2A 4NNCA 4WX2A 3W2UA 3GVGA 5I3KA 2PE4A 3N9SA 4O52A 1H7RA 1OYBA 1NEYA 1G7VA 3TCEA 3MBFA 3DU0A 4AF0A 2J88A 3QMRA 4J9JA 1YLVA 3RFAA 2A7RA 1EX5A 1AL8A 4FNUA 3L9CA 3WJXA 1JULA 3P67A 2V81A 2CU0A 3NA8A 5LZLA 3LCHA 1FWRA 1KFBA 2RFGA 2Y88A 4GFSA 1V5XA 2YYUA 3RF9A 1EWDA 4TMCA 1WA3A 2J9YA 4CNPA 1FUYA 1LTDA 4DBEA 2RDTA 1XDLA 3P60A 4WZHA 4AWSA 4RX0A 4PODA 1KTCA 3F1QA 1OABA 3W1RA 1TRDA 1A5CA 4O11A 1TMHA 4FXRA 4MJZA 5LHFA 5AHIA 1H63A 3ZR4A 1DVJA 5DCDA 3ZWTA 1K8YA 2ZZ3A 3UY7A 1KW1A 1LROA 3TQ0A 4NU7A 3G1YA 3HMJG 1GVFA 2QDGA 3W87A 3I6RA 3HBLA 4JX6A 1DOSA 5C2XA 2QF7A 3NDOA 2WV8A 3UNDA 5LGZA 1U5JA 3FOKA 1TQXA 4FX7A 4XBKA 1Q6OA 2H8XA 4WD0A 3G8EA 3TU9A 3N2XA 2W79A 4JTEA 4X9SA 4MOZA 2NX9A 2YSWA 3KXQA 2C18A 2ZDRA 5KINA 1QR7A 3GX9A 1IF2A 1GEQA 3QF0A 3TV8A 4CQ8A 3QFEA 2ZZ6A 1XL9A 2A7PA 2Y89A 4JTUA 3PBVA 1SSDA 1DQXA 3NNTA 1NF7A 1FWSA 1FBAA 3PULA 5DY3A 1F05A 3S1XA 1VJIA 3G24A 5D09A 4NUWA 4UXDA 3LCXA 1TCDA 1VR6A 3DENA 5FEWA 1UB3A 3UQNA 4O0KA 4QQ3A 5LNRA 2G97A 1WV2A 2ZTKA 3JR2A 4RLIA 4A3UA 4WY0A 3STGA 1R2TA 2JGYA 3DGRA 1B4EA 1KLZA 2DZSA 3G8RA 4Z0JA 4LNYA 3C3NA 3TJXA 4E2BA 1KM1A 1OFRA 4RCXA 1CX9A 2UV8G 4N4QA 1SO4A 1LLZA 1M7OA 4WQ6A 3G3MA 2A1YA 4MYXA 3W22A 2Z6IA 1D3HA 1W56A 3YPIA 1D3GA 2Y63A 3NGJA 1F5ZA 3DFOA 4K38A 1TV7A 1ZHAA 3R2GA 1RVGA 1ZFJA 4UCGA 3RLVA 4YWIA 2X30A 5E93A 1K8ZA 1N55A 3GKAA 1UJPA 1YTKA 2FPTA 2P0OA 2QCLA 2H8ZA 1QOPA 2E77A 1X7FA 3TR2A 5K9DA 1FCQA 4AXKA 2VFGA 1FWWA 3NAVA 5IBXC 4DBDA 4LVFA 4ML9A 5D2YA 1GYLA 2TMDA 5HR6A 4L4LA 4E0CA 1QOQA 5K3VA 3PSVA 1X8FA 5CSSA 3MBDA 4NZJA 2VENA 4WOZA 1VC4A 4JICA 1JUKA 4CLMA 2YXGA 5TIMA 5EYWA 4AAJA 2NXGA 3KVJA 4EIVA 2Y85A 4UR8A 2GVGA 3C6CA 3BG3A 4UFLA 5E1QA 1PS9A 2R91A 3BW2A 4Y96A 2VEKA 3IRDA 3GKFA 1I2NA 3Q2DA 3LHZA 4CCCA 2GQ8A 3CU2A 4H6KA 1OHLA 1VYPX 3Q94A 3GR8A 4AHOA 2JGQA 5CSRA 4O15A 2NZLA 2AAMA 4IXXA 2CFFA 4GUJA 4OGZA 1WDWA 4ICNA 4QITA 1SQ7A 3M9YA 3G1AA 5LGXA 5SWUA 4MY9A 4I7WA 5HUPA 5G2HA 2QDHA 2H90A 1KBIA 2WNZA 3MWAA 3CWNA 2ZZ4A 1TIMA 2A0NA 3OA3A 2ISSA 5CPMA 4LVDA 4JY8A 4FX6M 3JRKA 5FEZA 5D30A 3A5VA 3W1TA 1EUNA 1YPIA 4DO6A 4FNPA 1VHNA 3MI6A 1P0NA 1GQNA 1UCWA 1QAPA 2ZRXA 1KM2A 2CZFA 2HS8A 3STEA 3TX9A 1C9DA 3SW6A 3PVFA 1SO6A 4Z1CA 3NPVA 4GWEA 3TXZA 4JTGA 1L6YA 3C2RA 4BFAA 1T0OA 3NL6A 2Y7FA 1JUBA 1IGSA 3QPYA 4PL2A 1Q3NA 4WXZA 5LNSA 4FO4A 3TKFA 1OJXA 5D37A 4N9EA 3FEMA 1RR2A 4M7TA 1SFJA 5KZEA 4GXMA 4TIMA 4BF9A 5F4XA 1L6SA 4NJJA 3L0NA 4N9DA 1OFAA 3I65A 3W7JA 1RV8A 3S1UA 2QJGA 2NWRA 5DXYA 1XI3A 1OX4A 4G1KA 2Y62A 4N9CA 4IWWA 3INPA 4RV8A 3LRMA 4RZ6A 5HULA 3H53A 2V2CA 1FCBA 3LHWA 4ZQPA 4LS1A 3KVKA 3IGUA 3SGZA 2ATMA 3CM4A 3DFNA 1MEWA 3TSBA 4HPXA 1YTEA 3HPSA 1QO2A 2EKCA 3B05A 4IMFA 2CLLA 2V0TA 1SZGA 2Q8LA 2YW3A 3QMTA 1OFDA 4X3ZA 2ZRVA 1PHWA 4UTMA 3TFXA 1H62A 3NEVA 1C29A 3IIPA 4ZL1A 3IVUA 3MHFA 1JRCA 1IIHA 4MY1A 2CLHA 2VFEA 4RK8A 1H7OA 2C13A 3GB6A 5CGQA 4N6FA 1NVMA 2FJKA 3G0SA 4O12A 5LSMA 2TYSA 1Q45A 4MZ8A 4UTWA 2X1RA 1H7NA 5CZJA 4OHQA 5IM51 2FLIA 5G5IA 1TYGA 4BI5A 3NL2A 3LCWA 1A5AA 4UFMA 4CQ9A 1B4KA 4DXVA 2DJXA 2P10A 5C55A 5DN1A 4Z1BA 3P80A 3BW4A 4BI7A 4LY8A 1PV8A 2Y61A 1B57A 1I45A 3UXAA 2Y7EA 3P61A 4LTSA 1XUZA 3GNNA 3W84A 4UNKA 2WPBA 4YL2A 3W1MA 1ZCOA 1Q6LA 2G96A 5G1YA 4PCFA 5I3HA 3C8FA 3CEUA 5FF0A 5F2GA 1W31A 4JTKA 2DZTA 4WJEA 4O1CA 3L0KA 1TPDA 4O16A 6ALDA 2ZQ0A 2R14A 3WK3A 2DZWA 4H3DA 3TUUA 2DP3A 3R12A 2WSYA 3EX1A 1ZENA 4O18A 1W3TA 5F4WA 3O1NA 3BLFA 2QCMA 3S1WA 3HF3A 3WK0A 4CNNA 1A5BA 1VZWA 4B5NA 4UTIA 3OVQA 4ORIA 2VEMA 4LU0A 5K2ZA 4O10A 3MMTA 2CLIA 5CPNA 4M5PA 2BX7A 3W1PA 2ALDA 5F4SA 3W76A 5DCEA 5AYXA 2Q8ZA 3L0GA 4FIQA 3P84A 1G67A 3QPZA 2Z6JA 1BWLA 3LHTA 5HWJA 3AJXA 6TIMA 4Z1DA 1DHPA 5J5RA 1J2WA 3IIOA 3NL5A 4C1LA 4ZQRA 4DO5A 1EA0A 4LRTA 5DELA 2DZPA 1LDCA 2LLEA 3NM1A 1W3IA 4QIUA 1WX0A 1PHQA 3NQ6A 4LUIA 1GTEA 7TIMA 1I2RA 4FIRA 4FHAA 3RK8A 3WJYA 4XKYB 2PRMA 3GDTA 4X2RA 2GJLA 3DI0A 3LCLA 5H2ZA 1WQ5A 4Q33A 1IXNA 1X6UA 3CB8A 5BMWA 3KRZA 4BK9A 1KM4A 3FJLA 3W1AA 1KFKA 4GUFA 3EX2A 1KA9F 4L4MA 5LKYA 2RHGA 3S42A 1QPRA 5F2IA 2QUUA 5GVJA 4Z08A 4GC4A 5HNRA 4QJ1A 3L68A 4OWGA 4IMGA 3L5AA 4DO4A 1U83A 3U8GA 3LTPA 4CCDA 3SY5A 4GRSA 4NZFA 5D04C 1I2PA 2H6RA 1JVNA 1W54A 3FKRA 2ZZ2A 1TJPA 4RZ5A 2WJZA 2H3BA 1JCXA 3SI9A 5FF4A 3HPXA 4EWND 3KOFA 1KV8A 3L66A 5HMSA 3W1XA 3O05A 4O50A 3ABSA 1QPNA 4A22A 1H1ZA 3HG5A 2GVLA 3TNOA 1L9WA 1OF6A 2RDUA 2NX1A 3EWXA 1QCWA 4WOQA 1HUVA 3OEXA 1VLIA 3LRKA 4LVBA 1F6KA 3EB2A 2FTPA 1IXPA 4I7VA 1JUEA 1SO3A 1QFEA 3WK2A 3TMQA 1TPB1 4QSHA 3W7EA 3QMSA 1X1OA 1DL3A 2JKAA 4HKPA 3UY8A 3KRUA 5LNWA 5F2LA 3DHFA 3VI2A 2ZRYA 4JIPA 3K30A 2V5BA 4X22A 3NZ1A 1JRBA 3TXVA 2VFDA 2G5WA 3P5ZA 3C0JA 5U7SA 1OX6A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3N14A

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