1R85 | Genus

Total Genus 151

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	151
sequence length	371
structure length	371
Chain Sequence	KPHISALNAPQLDQRYKNEFTIGAAVEPYQLQNEKDVQMLKRHFNSIVAENVMKPISIQPEEGKFNFEQADRIVKFAKANGMDIRFHTLVWHSQVPQWFFLDKEGKPMVNETDPVKREQNKQLLLKRLETHIKTIVERYKDDIKYWDVVNEVVGDDGKLRNSPWYQIAGIDYIKVAFQAARKYGGDNIKLYMNDYNTEVEPKRTALYNLVKQLKEEGVPIDGIGHQSHIQIGWPSEAEIEKTINMFAALGLDNQITELDVSMYGWPPRAYPTYDAIPKQKFLDQAARYDRLFKLYEKLSDKISNVTFWGIADNHTWLDSRADVYYDANGNVVVDPNAPYAKVEKGKGKDAPFVFGPDYKVKPAYWAIIDHK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
source organism	Geobacillus stearothermophilus
publication title	Mapping glycoside hydrolase substrate subsites by isothermal titration calorimetry. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Endo-1,4-beta-xylanase
total genus	151
structure length	371
sequence length	371
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2003-10-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1r85A00

1GOOA 3ARVA 4PTVA 1QI5A 3WDPP 1OT2A 1WDQA 3CHDA 4QAWA 4AD5A 2DGAA 1M03A 1E5NA 2YDQA 2VX6A 4PMDA 2G3MA 1QOXA 1VB9A 1CLVA 2VX5A 1AQ0A 1C7TA 2DSVA 4IUGA 1SR0A 5E0FA 4BQ4A 4P8VA 1KWKA 3WEMA 3A47A 1CIUA 1JXKA 1LWJA 2VC9A 4MDPA 4P8WA 1WP6A 4QLJA 1B90A 3HN3A 4L4OA 3AMKA 1ODZA 2ZX5A 4M29A 3LPFA 4CD5A 1UH4A 4J27A 3AYRA 1BG4A 4JIEA 3UETA 5E9AA 2WCGA 3GNOA 2WXDM 4HU8A 2CKRA 2XIBA 1R86A 1K9TA 2XGBA 1ZJAA 3M46A 1O6IA 3KE0A 3A4AA 1AVAA 2VQUA 5CPSA 1C8QA 3UEQA 1CWYA 2IXVA 4MB1A 4W5ZA 1NOFA 1OGBA 1JNEA 4UFHA 3VX0A 5DFAA 3AOFA 1QNPA 5BXPA 4KH2A 4DUXA 2AOSA 3O9NA 2J25A 4AZ6A 3GXFA 2G3JA 4H04A 3DYOA 2XGIA 3CUJA 1W9DM 1JZ5A 1C90A 2VR4A 1XHGA 3PZGA 1BAGA 3QHNA 2NW0A 2DT0A 3AIBA 1QVBA 2ZXDA 3FHQA 3ZSSA 4IPLA 4D6CA 5M17A 2D3NA 5ABEA 2BY2A 1EO5A 4W89A 1J0HA 1E56A 4UFMA 1BTCA 3AXXA 3EDDA 2WWCA 4AISA 4HMEA 2VRKA 2ZX8A 1PJ9A 4WSJA 1EQCA 2C0HA 1W1TA 2C7FA 1C7SA 1CEOA 1H1NA 1UZ4A 2WHLA 3KWXA 3WNKA 3WNLA 4ML4A 1CXEA 4B9ZA 1FHDA 2E9BA 3PHAA 1HX0A 4OJYA 3ARXA 3AZTA 2UY3A 2GDVA 2WBKA 4KRTA 5KEZA 2VOTA 3GBDA 3T2OA 1UR2A 4F66A 5JIWA 2XYLA 5D8ZA 1DWIM 3VKKA 3NYDA 4XB3A 4PSRA 3KL5A 1DWAM 3PN8A 3ALGA 1MXGA 3VOCA 4FMVA 4Q7NA 1UR4A 5A2AA 1TG7A 1I75A 5JUVA 5CQ1A 2WCAA 1UZ1A 3DYMA 2FHCA 2O9OA 4P7RA 1BGAA 2CXGA 4M80A 2BVYA 4AC1X 1PEZA 4UCFA 1V03A 3WF4A 2J62A 1X6NA 4TUFA 1MYRA 1C93A 1YQ2A 4AZGA 1JYVA 2X0YA 1EGZA 2BVDA 1C92A 3RMEA 3OZPA 1E6SM 2XVPA 2CCRA 3WH7A 1KQYA 4JKLA 3F5JA 1DWFM 2G3IA 2PWGA 4Y7EA 1J01A 1OB0A 2CHNA 4P7QA 1CYGA 1B3ZA 1RP9A 3WELA 1CGWA 4P7NA 3WD2A 1KXHA 4FLSA 3D5HA 4PEEA 7A3HA 5CLTA 1HL8A 2FH6A 5JBDA 3VIOA 3ECQA 1GUVA 1XH2A 1V6VA 2YL8A 1WZMA 3CUFA 3ARWA 3M07A 1UA3A 2CEQA 7TAAA 1W1PA 4PTXA 1GCYA 2XVNA 1HVQA 1Q6GA 1B30A 1UHVA 3HMCA 1E5JA 1PIGA 4UFJA 2GJXA 4B9YA 2UY2A 3L2LA 3RM4A 3BAWA 1NH6A 3PZUA 4MNKA 1OBAA 1GOQA 2XM1A 3VU2A 1FFQA 1HKKA 2ZIDA 3VINA 4JFTA 3VO0A 3FW6A 3DECA 3PZOA 3NSMA 2BHZA 2D0FA 1ODUA 2ZUNA 4ZE5A 1LG2A 2OLHA 3AMGA 1QW8A 1H3GA 3CIVA 2JALA 5HPCA 1JAEA 1LLOA 1KXVA 3ARTA 2W91A 1TVNA 4D6IA 4S3JA 3MKKA 3SCNA 2NT0A 1E6NA 4Q22A 1JZ2A 3U5YA 5AC5A 4B3LA 2F8QA 1W2PA 4JFUA 2VL4A 1V3MA 1UD4A 5A2BA 3AS3A 3OGSA 3ZT7A 2DSWA 1TFVA 3CZ8A 4N0RA 2WKGA 3W6MA 1DP0A 5A6JA 1CXLA 5JIPA 3GM8A 3DYPA 2CBVA 1XGZA 4JFWA 1J11A 2NSXA 2YBTA 1C3FA 3VD7A 2C8NA 3MO4A 2EBNA 4PMNA 2X05A 5A2CA 1W9VA 4H2CA 1V6UA 1JZ6A 3WD1A 1GJWA 2CESA 1CXHA 3BXWA 3WQWA 2CIPA 2PWFA 2BHYA 3BAYA 3CZJA 3AS0A 3RO8A 2V3DA 1XD1A 2YL9A 1HJQA 2OYMA 5FIPA 3OLGA 3AS1A 2EXOA 3ZM8A 1RD6A 2XG9A 1H49A 5AYIA 3BMVA 2A3AA 5I6SA 2WVVA 3CHEA 3UCQA 5GPRA 4CUCA 4ACZA 3W25A 2GJXB 4HTYA 1KGWA 4UQBA 1DEDA 1LL4A 2G41A 1BYAA 2EPKX 3ZR5A 5LA1A 4DWSA 4TVUA 5JBEA 5CPTA 3B9EA 5FD0A 5BCAA 4ZXOA 4LGXA 4CD4A 1J0YA 4AW7A 1LL6A 1BFNA 1M04A 1Q6FA 2GJRA 2W61A 1QNQA 3ZIZA 2AAAA 4OBRA 3OB8A 1WNOA 4RE2A 2GJPA 1BG9A 3AISA 3RM9A 3APGA 4S3KA 1R7OA 1ZJBA 2J7GA 2QLYA 5I2UA 3T0AA 1LG1A 2ZX9A 1NOWA 1MWOA 1X1NA 3UESA 1BHGA 3J7HA 1V3LA 4WKHA 2DSKA 4AMCA 4YN5A 1H41A 1OD0A 5ABHA 3W37A 4TOQA 3KZSA 4DM1A 1W32A 4JFVA 3T2PA 3AHYA 3DHPA 5CLWA 4HOWA 2WLZA 1HJVA 1KGXA 2XFFA 4D71A 3PZQA 1SMAA 3VGHA 2DEPA 4BF7A 3B9DA 1B3VA 1SYTA 4Z2IA 1C91A 4PCTA 1W1VA 5ABFA 1QBBA 3BAKA 1JG9A 3L4WA 1W2VA 1Q6CA 1UD2A 1E1FA 3WUFA 2VVSA 4HOXA 2VR5A 4AD0A 2YIHA 1XC6A 4P7LA 3AXHA 1EIBA 2BNJA 2VX7A 4DM2A 5EFDA 1JI2A 2HVMA 3VD9A 4H7VA 2O9TA 1OIMA 3BMWA 5EFFA 3WH6A 3MV01 4AZIA 2VO5A 4UTFA 2RGLA 2GK1B 5E6ZA 3ARQA 4X0NA 3UG4A 3ZJ8A 4AZHA 3CHFA 1AQHA 4UZUA 4PUEA 1TUXA 2WVVB 4U5IA 4CD6A 4ACZB 3SCRA 3A4XA 2ZXBA 3BCDA 1ZS2A 1HT6A 5CXPA 1H5VA 1OINA 4DWSB 4M81A 1M01A 4CD8A 1GVYA 4D6JA 4GO9A 3GXDA 4W87A 4FLRA 3VX1A 1WDPA 1TZ7A 4PMUA 5D9PA 1K9EA 4QCFA 4U5KA 2QF8A 3AMLA 1HN1A 1JIBA 1JDDA 4MNJA 3W29A 2PWEA 2V3EA 4PMRA 3WDRA 2ZX7A 3WKZA 2BS9A 1HP4A 3MUZ1 2VZTA 1MQQA 3AIVA 1EDQA 1ZU8A 3WBAA 5I77A 3G6LA 1UYQA 3WF0A 1CPUA 4ATWA 1GNXA 2WC4A 1JF6A 3K4AA 3L4VA 1JFXA 1XH1A 3VTRA 5IDIA 5ECUA 1GOWA 1UR8A 1OM0A 3FHAA 2VRQA 3W27A 1HNYA 2WMFA 4U31A 3ZJ6A 5E6YA 5ABFB 1KCLA 4W8LA 2WB5A 9CGTA 2Y4SA 3WN6A 4K68A 1BVNP 4PMVA 4XZBA 2A3EA 4PSPA 4GQRA 3W81A 5I24A 2Y2WA 1OT1A 5C70A 3WNOA 5A8PA 1UD3A 2Z1SA 1HKIA 1VRXA 4B15A 4TXEA 3L4UA 3T0BA 3GNPA 2JFEX 4UOQA 3MV11 1HKMA 3I3BA 4BS0A 1KB3A 5A6SA 5D9MA 2VJXA 3PZMA 1W9UA 2UY4A 3ZO9A 2WHKA 4HMCA 3WFLA 3VGFA 2WSKA 2J7FA 1B3WA 1LL7A 1BLIA 2WAGA 3T0DA 1CXFA 1GHRA 5LYRA 1H0GA 2XUCA 3NSXA 1E0VA 3WNNA 3IANA 4JFSA 3MMWA 1HJXA 4AIUA 1UH2A 4JHZA 1V6YA 1G94A 4DUWA 2CBUA 1QNRA 3N18A 3WL1A 3VNYA 1E4MM 2XJ7A 2Z1KA 3ARUA 1E9LA 3QHMA 1YHTA 1V0MA 1FFRA 1HIZA 4JCMA 2J79A 4OIFA 1ISVA 4UQ9A 1J10A 4D6GA 4HU0A 2J7EA 4U2YA 4RL3A 2A3BA 3T08A 1G1YA 1QI0A 3VIKA 4BZYA 1F4AA 5HBFA 1E70M 3WEOA 2BV9A 2WKLA 3ZT5A 2D24A 4ATDA 3ARZA 1ZBKA 2BVTA 2ZUWA 4GZIA 2ZUTA 2ZUVA 3EMZA 3M6DA 5IFTA 1E6QM 2O9RA 3CZLA 1Q6DA 1J9YA 1QW9A 4LYRA 3O2LA 2VMFA 1EOKA 4JHOA 3WBEA 2D22A 3GDBA 4H8UA 3S2CA 3LPPA 2BXYA 2XVLA 4XV0A 5A8MA 2EEXA 2EPMX 2YA0A 4WKFA 4CN4A 2WMHA 1UWTA 1UD5A 2X09A 3PZ9A 4W5UA 1CXIA 2FH8A 5GNXA 3WQ6A 4BQ3A 4UR9A 1E72M 1FH8A 4W85A 1B3XA 2YLLA 4P8UA 1EH9A 2EPLX 1WB0A 1XV8A 3AS2A 3FXYA 1G5AA 3ARSA 1E6XM 1B9ZA 1J18A 5CSYA 4IISA 2J7BA 2VZSA 5AC4A 5I0DA 2D0GA 1B31A 1KGUA 3G6MA 3SCTA 5HNNA 4U3CA 1KWGA 4UNIA 3EBVA 2XSAA 3SCPA 4Z2GA 1QI4A 2IUZA 1B2YA 4AZCA 3K8LA 3N04A 3WDIA 3VM7A 1GVIA 3UR8A 1TCMA 4AIEA 3VPLA 3VMOA 3U7BA 2ZUMA 4BQ2A 2YLAA 2PWHA 1RPKA 2A3CA 4GIAA 3VIHA 3ZSTA 3OLEA 2VX4A 3W53A 3B9AA 3A4WA 4E8CA 3SUTA 4Z2JA 3PTQA 5A8NA 2OYKA 3AYSA 3KEHA 2J8GA 1BF2A 2W67A 3UERA 3OGRA 4GI6A 3A3HA 3S6TA 3MU7A 4KGJA 2EJ1A 1KXQA 4TTUA 4HZ7A 2OWWA 5FKYA 4D6FA 3ZQ9A 1A3HA 4BQ5A 3BGAA 5LA0A 1KQZA 4AZ5A 4M8UA 2Y5EA 1H2JA 3IAQA 4P7OA 3O6AA 1A47A 1VBUA 3AHZA 2X0HA 1JI1A 1H11A 3CMGA 4H8VA 1AQMA 3WD3A 3CH9A 5GNZA 4UOZA 2W66A 2JF6A 4LYQA 3PBGA 2V5CA 5EMYA 2VT0A 2ESCA 1NM9A 3CUGA 4TX8A 5DMYA 3MUIA 3EYPA 4LQ1A 3GBEA 4FLQA 4J3SA 2WLYA 1TVPA 4J3WA 2WC7A 4GINA 4CCEA 2WBGA 4CN6A 4JZ5A 4ZEPA 1H4PA 2ZUUA 3CZEA 3TTYA 4W7UA 4CCCA 2QV4A 4JL2A 3SCWA 2VI0A 4KGLA 3CPUA 3GYCA 5KZ6A 3WD0A 4AZCB 4UQAA 2CBJA 1BVZA 4AEEA 3W38A 1WE5A 2CNCA 3TONA 3WF3A 2WZIA 5F7UA 3SCVA 4J3XA 4WKAA 4W84A 3E1F1 3IJ7A 2J7HA 4TX6A 4W7WA 2ZE0A 4LX4A 1VEPA 4F9DA 3W26A 2XSBA 1PX8A 4PTMA 2CKSA 1ISXA 4GPNA 4W88A 2BHUA 3WDJA 4UFLA 3ARRA 3AIUA 1K9DA 1E43A 1ESWA 1FHLA 1WZKA 6CGTA 1ZB5A 1E6ZA 4AD4A 3CTTA 2MANA 2VTFA 3EDJA 3VDCA 1SMDA 1FH7A 1LF1A 1VIWA 1MQRA 1VFFA 2A3HA 4MAZA 5E0CA 3EDKA 5CGTA 1V0NA 1WCGA 5A1AA 1CGVA 3VDBA 4PBGA 4HA4A 2WCSA 2CPUA 5FL1A 3MS8A 1GQLA 4LXFA 3WEZA 2W4XA 4HMDA 5A3HA 4L4PA 4PMYA 1V0LA 1E6RA 1XCWA 4F8XA 1KCKA 3W0KA 2WZHA 5E09A 3BLPX 4ZXLA 1XRVA 4DWSD 2GK1A 4AZBA 1Q4NX 5BXRA 1OD8A 1WDSA 1DHKA 1UR1A 3PZVA 4KRUA 3EMCA 5I78A 1GPFA 4M82A 2EPOA 3QHOA 2CHOA 1NWTA 1S46A 3BCFA 3MSDA 1CNVA 2E3ZA 2G3NA 1WZLA 3K1DA 1V3KA 2E8ZA 3WUBA 3VUPA 1W3JA 2XFRA 4AWEA 1VEOA 4W86A 1TA3A 3AFBA 1CECA 1IT0A 1NP0A 1E1EA 1MW3A 4ACYA 1E55A 1HKJA 4GQQA 1XSJA 5CZKA 3WQ5A 4YHEA 3SURA 2CITA 3ZMRA 3QR3A 2X8RA 2VRJA 1CGUA 1J0IA 2ZWZA 1EOMA 5M5DA 2BFGA 1MQPA 4A3HA 1B1YA 2WMJA 4GI8A 2DH3A 1V02E 2X2YA 3CBWA 4V27A 1B3YA 1R7AA 1W3KA 1XH0A 4NRRA 2IXUA 3AZRA 3M7SA 4EANA 5CG0A 2PB1A 2D3LA 3RDKA 4U33A 1ZBVA 2W92A 3SUUA 3TP4A 3NDYA 3SCOA 3CHCA 4HP5A 3IJ8A 5AY7A 4XX6A 4GKLA 4J3UA 4U3AA 2XIIA 1QI2A 2D1ZA 3MSGA 3BSHA 4CU7A 1CXKA 1F4HA 2FGZA 5BRPA 1E15A 4NI3A 4X9YA 1WPCA 4TVDA 3POHA 4AEFA 2W62A 3OLIA 4EAMA 1KXTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1R85A

Total Genus

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