2XTK | Genus

Total Genus 100

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	100
sequence length	310
structure length	310
Chain Sequence	FSNLAIYWGQGPNQLRLSHFCQETSLDIINIGFINYFPDMSPGHWPGSNFGNQCDGSVYVTNDGVVTKLLSGCHQIMEDIPICQAAGKKVLLSIGGAYPPDQSILSEDSAVAFATFLWGAFGPVAEGWEGPRPFGDVVVDGFDFDIEHNGGFGYATMVNTFRQYFNQVPERKFYLSAAPQCIIPDAQLSDAIFNAAFDFIWIQYYNTAACSAKSFIDTSLGTFNFDAWVTVLKASASKDAKLYVGLPASETAANQGYYLTPDEVESLVSTYMDRYPDTFGGIMLWEATASENNQIDGAPYADHMKDILLH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Aspergillus fumigatus
publication title	Acetazolamide-Based Fungal Chitinase Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	CLASS III CHITINASE CHIA1
total genus	100
structure length	310
sequence length	310
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date	2010-10-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00704	Glyco_hydro_18	Glycosyl hydrolases family 18

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2xtkA00

1VEOA 1G1YA 3SCRA 1U2YA 1G9HA 1ITXA 1VEPA 3SIMA 2OSXA 2D0GA 3ZR5A 4AIOA 1J12A 3AIWA 4GQQA 2G3NA 3WF4A 1OIMA 1HL9A 2ZX7A 3RMEA 3MSDA 5JIWA 5E0FA 3LPGA 1MWOA 4H2CA 1DWAM 2IXUA 1UKPA 1V3IA 4WIWA 3VIGA 5LA0A 3PZGA 1MFUA 2VZTA 2ZOXA 2ZX5A 4PUDA 4DM2A 2YL9A 1CIUA 3AMDA 4AIEA 1YQ2A 3WUFA 3BH4A 3WL1A 2DEPA 1E15A 1UQYA 1UD6A 1K6AA 2XGIA 1U33A 5E6ZA 4QLJA 4AC1X 5A6BD 1H4PA 1ZBCA 4Q22A 2EPLX 2XVKA 1UR4A 3BCDA 3GXDA 4CCDA 3WDRA 4PYSA 5GNXA 1LQ0A 2YL8A 3PBGA 3WSUA 1JZ8A 4QFUA 1V3MA 8A3HA 2PI6A 4M82A 1R7OA 5JBEA 3BGAA 3FHAA 1J0IA 2O9OA 4MDOA 1MW1A 3AXIA 1MFVA 3L4VA 3M7SA 3SCTA 3VM7A 1DWFM 1KXVA 2WMGA 1TCMA 5E09A 1VIWA 1C8XA 4W88A 1Q6GA 1K9DA 3ZT5A 1E4LA 1CGYA 2E8YA 3VOCA 4HP5A 2HVMA 4UFMA 5A94A 5AC4A 4HA1A 4MAZA 4X0VA 3AYSA 4HPHA 4R5EA 4UZUA 2FH8A 2BS9A 3O2LA 3KEHA 3GXMA 2J75A 3B9EA 1PBGA 2ZUMA 2VZSA 4OIFA 1MW3A 3WNPA 3KZSA 1EOMA 5A6LA 4AD2A 1JFHA 3VM5A 1KR0A 2ZUSA 5D8ZA 1JGIA 3CMGA 5ABFB 4Z2LA 3T2OA 4AXNA 2CEQA 1ODUA 2X1IA 1UH4A 1L0PA 1VJSA 3A4WA 3AZRA 4PBGA 3WNMA 3ALFA 3AHXA 3FAWA 4Z2JA 4JFWA 2WKGA 5ABFA 5D4YA 3AZSA 1E40A 4PEEA 5DMYA 1GVYA 5I6SA 2CBIA 2VZUA 1UKOA 1JDCA 4CD8A 4GKLA 4U2YA 4TTGA 4UQAA 1QPKA 3UG3A 1CGWA 1Q6CA 4QCFA 3K1DA 1WNOA 4ACYA 1GJUA 2D2OA 1V6YA 1GOOA 3KWXA 1M03A 2NT0A 1DWGM 1D2KA 1V02E 5IHSA 3APGA 2D0FA 5DEZA 1CXLA 4LYRA 1KBKA 1V3HA 2F61A 3I3BA 5I77A 2J7HA 2NSXA 1WE5A 3G6LA 2WLZA 5BXSA 3MANA 1PZ3A 4HOXA 3T09A 1HIZA 2XFFA 3VD5A 3CHEA 3U57A 1KR1A 3DHPA 3VTRA 4NZCA 3POCA 1ZBWA 2V3EA 5A2AA 1HN1A 3U7VA 2VTFA 3S2CA 5DT5A 2WPGA 5CJ5A 2VT0A 1HVQA 3CZ8A 1E71M 1G01A 1OIFA 1UR0A 4UFIA 4BQ3A 1VFOA 1Q4NX 3AHZA 2WBGA 2NT1A 2VJXA 1WCGA 3BC9A 3SCWA 2YDSA 3CUIA 3VD3A 4BQ4A 1JG9A 1LL6A 1RP9A 8CGTA 1SMAA 3WBEA 3NDZA 4AD3A 2C0HA 1F4AA 4BQ2A 2CBJA 1W9UA 4AWEA 1PZ2A 1BVZA 2Y8KA 2BY3A 4ZXOA 4J3WA 4X9YA 2JE8A 3VD4A 3RM8A 1R85A 2VCAA 5CZKA 2J62A 1W3KA 4EKJA 3VGHA 1E6NA 2Z1SA 5EFDA 1GOKA 3ALGA 1GONA 4P8XA 2VVNA 1QNSA 4X0NA 2ZXAA 3FY1A 4W7VA 2V5CA 3WEZA 2DIJA 2OYMA 1G0CA 5E0CA 1W3HA 4CKQA 2VX4A 3SCNA 1ZL1A 4HZ6A 1E5JA 2A3HA 3AZTA 1V3KA 3SUVA 1ISWA 3RDKA 3MSGA 5GQBA 1KQZA 3WD4A 1C92A 5A6AA 1X6NA 1DP0A 4CU6A 3W24A 1HJQA 1LWHA 2BXZA 1WDRA 2J79A 4ACZB 4AZ5A 4OOUA 3K4AA 1N82A 1WDSA 3BCFA 1WO2A 3SURA 6TAAA 3F5JA 1QOXA 3WEOA 3OLIA 1PX3A 4ACZA 4WJXA 2XVNA 3W82A 2WLYA 1XC6A 2EPOA 2XIBA 4UQBA 2F8QA 3AHYA 3PZIA 1TR1A 1XH1A 3A3HA 3MUY1 3ZM8A 1BHGA 3CUFA 4W5ZA 2DSZA 1QW9A 4V28A 3N17A 1MQRA 4P8VA 4TX8A 1EXPA 2A3EA 1LF1A 1JZ7A 5IFTA 1OD8A 4MPKA 2W66A 1E6ZA 3ZT6A 3T0AA 2WC7A 3VDHA 1UWQA 3VMPA 4LPCA 2CPUA 3AJ7A 3PZUA 1J9YA 4HU8A 1NOUA 5CXPA 4BF7A 1PAMA 2W67A 1WKYA 4W8BA 4XV0A 2WAGA 5BXRA 1US3A 4AIUA 1CEOA 3TONA 5A6BA 5IDIA 1FP8A 1VJZA 1LWJA 3TTSA 5JBFA 2JF7A 2WK2A 2Y8VA 4AMCA 5IHRA 3CH9A 2W92A 3UG4A 3AS3A 1M04A 5M5DA 3QHOA 2WMJA 4Q7NA 2ZXBA 2YL6A 4MJ2A 5FOOA 2WHLA 4W5UA 3WNOA 4IPLA 4GO9A 3MU7A 1K9EA 2FGZA 2FHBA 4OJYA 3TOPA 3NCOA 4TUFA 5ABHA 1SFSA 1SMDA 1FFRA 4WK9A 1EIBA 5CPSA 1DTUA 3FN9A 3N15A 2FGLA 3K8MA 2J74A 4P7RA 2V3FA 3LPFA 1JYVA 2DQXA 2BVTA 4OBRA 1KWKA 1NWSA 2OWXA 3WMCA 1HKIA 3HJEA 4D6FA 7CGTA 1O6IA 1CLXA 1V08A 3VGFA 1UD4A 1CPUA 3WN6A 4UFHA 3VINA 4CCEA 1PX8A 2PWEA 2C8NA 3W25A 3ARWA 1KGXA 4F79A 1LL7A 4P8UA 1JYXA 1I1WA 1XD1A 1C90A 3T2PA 3AISA 5D9NA 4LGXA 1SYTA 3OLGA 3VIKA 4QLLA 3BAWA 2HISA 4B9YA 1CGVA 1JZ4A 1B9ZA 4RL3A 2A3CA 5GNZA 1JXJA 3BAYA 7A3HA 2ESCA 1GQIA 4NI3A 2VO5A 1E4MM 1AQMA 1VEMA 2O9RA 4Z2KA 4EAMA 3QOMA 3U5YA 1PEZA 4D71A 2BVDA 1MW2A 3KL3A 3SCOA 3ZJ8A 2XM1A 5BROA 3T2QA 4MNMA 4KGLA 3VGGA 1W2PA 3WD1A 4GI6A 6CGTA 1BPLB 4GZJA 3VDBA 1AMYA 1M7XA 1EHNA 6A3HA 2ZUTA 1VB9A 3VD9A 2DSUA 5KEZA 4N0RA 2JALA 2XVLA 1C3FA 3I3DA 4UCFA 4AY1A 2QV4A 3L4UA 3OZPA 3POHA 1Q6DA 3GXIA 3W26A 4FF5A 2XGBA 1BF2A 3T0DA 4NSBA 2J25A 1E1FA 3OGVA 1VAHA 3B8SA 1CGTA 2E3ZA 4MTVA 2WANA 3DYMA 1KXTA 2W61A 3N04A 4AD4A 2VQUA 1FH9A 1GPFA 4PMXA 4LXFA 4S3JA 4JFTA 2QPSA 1CGUA 2CXGA 3GYCA 1HVXA 2DSVA 2CESA 3WUEA 3VPLA 2D1ZA 3AXHA 3ARXA 3AS1A 1H09A 1UWSA 1WDQA 1EHAA 1OINA 5FL0A 3MUZ1 3W6MA 4BA0A 3DECA 1BG9A 1FP9A 3E1F1 4TVCA 1KGUA 2Y5EA 3W37A 3L2LA 2QMJA 2CETA 1UHVA 3TP4A 3CGTA 1FA2A 2PBGA 4PTXA 1UA3A 5BRPA 1H0IA 2CERA 3UG5A 4NF7A 5HPOA 2ZE0A 1JZ6A 1KQYA 3HU7A 4D6CA 3RJYA 1FH7A 1UKQA 1BFNA 1MQQA 2CKSA 5A6JA 4XB3A 4U3AA 3GDBA 3F5LA 2ZWZA 4QAWA 4U2ZA 3GNOA 4CU8A 2WCAA 4P7OA 3MUAA 3IK2A 3CO4A 2XHYA 1CLVA 2B31A 3ZJKA 4GI9A 4EANA 5E70A 1R8LA 3TA9A 1KCKA 2DIEA 5EB8A 1DEDA 2EPMX 4PSRA 4JAWA 3CHDA 3QGVA 4D1JA 1UYQA 1Y7VA 2VRJA 2DGAA 3CUHA 3PZNA 2WCSA 4ATWA 4QLKA 4CVWA 3BAIA 1J11A 1KXHA 2A3AA 1BYAA 2WCGA 3WELA 1MW0A 4JFVA 3MMUA 5JUVA 3ARVA 2OYLA 2W63A 1JF6A 4FLRA 2XFRA 1OGSA 3WQ8A 3AIQA 3U5UA 1JDDA 1E5NA 3QR3A 3ZT7A 1L8NA 4M8UA 4J27A 4J3UA 5LA1A 5FIPA 3ZIZA 4D6IA 1ISXA 1E1EA 1HP4A 4ATDA 4DUVA 2IUZA 2D20A 3AMGA 3VGDA 1IZJA 3AYRA 1EDTA 4E4PA 3J7HA 1V0NA 1OSEA 5FCZA 5TD4A 2BXYA 1CBGA 3VNYA 3MMWA 2DT3A 3WFLA 2ZX8A 5FKYA 2ZUVA 3WDHA 2UY5A 3AXXA 2J8GA 1EO5A 2WMKA 4C7DA 4CCCA 1JL8A 1D3CA 1J0HA 3ARRA 3BSHA 4K68A 2D0HA 1UD5A 4CD6A 2GDVA 3PZQA 5I79A 3WY1A 2YOCA 3BSGA 1UZ1A 3AOFA 4LQ1A 4WSJA 4P7LA 2CITA 3CUJA 4U3CA 5C71A 2BHZA 4J3TA 2ZUNA 2VR4A 5BRQA 2EQDA 4URIA 1A47A 3L4ZA 3D3AA 4UOQA 5C8BB 4U33A 1GJWA 2X09A 1H2JA 4W7UA 3IJ7A 5ABEA 1RPKA 2WC3A 1OD0A 1BYDA 1C8QA 4V2XA 1EOKA 2XVPA 1CXIA 4HOZA 4XX6A 1GQLA 2W62A 4KH2A 4FMVA 2VCBA 4MB4A 1XCXA 4GZIA 3NSMA 2J77A 3VIMA 3MO4A 2WYSA 4PCSA 2FHFA 2WKLA 1QI2A 3OLEA 1GHRA 3VMOA 4AEFA 5AC5A 1ZB5A 5HXMA 3II1A 1ODZA 3FHQA 4AISA 1B3XA 1S46A 4MDPA 4PTMA 1GOQA 5CLTA 1GOIA 1TUXA 5CSYA 1IZKA 4UQEA 1KFWA 5CPQA 2BY1A 2PWFA 4CU7A 1E43A 2YBTA 2GUYA 3HN3A 4JHOA 2O9PA 4W89A 4UR9A 3VGEA 2EEXA 3F5KA 1BGGA 1GZJA 1QI0A 4L4PA 1W2VA 3W81A 4CN1A 1VENA 2ZUUA 2G8ZA 1PJ9A 4JCMA 5M3WA 3CIVA 1TVNA 4UFKA 2YL5A 4KGJA 1H11A 3ARYA 4J3VA 2UY3A 4UOJA 2JEPA 2E8ZA 3PZMA 1UOKA 1UH3A 1I1XA 5HDRA 3RCNA 2WWDA 1NARA 1HT6A 3KL0A 4W87A 3W38A 1NH6A 2AMGA 2ZICA 3VGBA 4AEEA 3SUTA 1HJSA 3ARUA 1E0VA 4GXPA 1P6WA 4OBSA 3SUWA 3WDJA 3ZSTA 3OG2A 4AZCB 2XUCA 3ZR6A 3W27A 1AQHA 1I75A 3THDA 5I2UA 5AYIA 1GQJA 2WHMA 1GOWA 4RE3A 2GK1B 4WKAA 3SCSA 4AZCA 2VOTA 3AICA 5CGMA 3VU2A 3QHNA 1NOFA 4W86A 1BSIA 2E9MA 3GXFA 2PF0A 2VX7A 2GJXB 4WLCA 3UEQA 2GK1A 5I24A 4M29A 3EMQA 1JD7A 3IAPA 2RGLA 1MYRA 3SCPA 4GIAA 1V03A 4AD0A 3WH6A 3IJ9A 1ZU8A 2GJXA 3PN8A 1XYFA 4TX6A 1W1TA 1XH0A 1K9TA 4Y7EA 5A8PA 3WQ4A 2WNWA 3ZO9A 1UR8A 1V6UA 2CBVA 1E3XA 4GINA 4MNKA 1M01A 4XUYA 1NWUA 1H3GA 3N9KA 3VIHA 1VFUA 4UFJA 4TTUA 4H8UA 1HF6A 1C7SA 1JXKA 1E9LA 5A6SA 4M1RA 1B30A 2YIHA 4IPNB 1UQZA 1HJWA 5F7UA 4MB1A 2V3DA 3WUBA 2YA2A 1EO7A 2GJPA 1V0KA 1WZLA 3K8LA 5I5RA 2BY2A 1JYWA 1KXQA 1UUQA 3NJ3A 2VI0A 2WMIB 1JI2A 5ABGA 3BLPX 4JFUA 1UH2A 4D6DA 4AYSA 2PWHA 4KRUA 4PMZA 3WNKA 1NWRA 3A4AA 3EDEA 4U5IA 3LPOA 3BAKA 4PTVA 4S3KA 1W9VA 2WMIA 1B3ZA 1US2A 3ARZA 4JHZA 3CZEA 2W5FA 3T0BA 1R86A 2CKRA 2XSAA 4B15A 4PTWA 1KBBA 2FDMA 3CBWA 1CNVA 3AIEA 3WD2A 2Y2WA 1FHDA 1ZBKA 2WWCA 1V6XA 3BMWA 4UQDA 3WQ6A 4ZXLA 4L4OA 5AY7A 4ZFMA 2WHKA 5D8WA 4GZEA 1W3LA 4UNIA 3OZOA 3AS0A 2XWEA 1AQ0A 2QMKA 4PCTA 1BVNP 1B1YA 2BHUA 1CZ1A 3VIFA 2X05A 1JZ3A 1SR0A 2XTKA 3RM4A 2UY2A 4RE4A 4D6EA 1UD2A 2V38A 1E55A 1UR1A 3IJ8A 3RO8A 3THCA 3CLWA 3B9DA 3AMKA 3U7BA 2WZIA 3N11A 1W1PA 1KWGA 3MUIA 4U5KA 3A47A 1B3YA 4ATLA 4TOQA 1MXGA 2GDUA 2OWWA 2E9LA 4JZ5A 3EDJA 3L4XA 3QOKA 2YLLA 2OWCA 1UG6A 3MV01 2EO7A 1VFMA 4HMDA 5EBAA 4AZGA 4JIEA 1PIFA 1TG7A 4MADA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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Chord Diagram

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