2X30A

Crystal structure of the r139n mutant of a bifunctional enzyme pria
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
240
structure length
233
Chain Sequence
MSKLELLPAVDVRDGQAVRLVHGESGTETSYGSPLEAALAWQRSGAEWLHLVDLDAAFGTGDNRALIAEVAQAMDIKVELSGGIRDDDTLAAALATGCTRVNLGTAALETPEWVAKVIAEHGDKIAVGLDVRGTTLRGNGWTRDGGDLYETLDRLNKEGCARYVVTDIAPNLELLKNVCAATDRPVVASGGVSSLDDLRAIAGLVPAGVEGAIVGKALYAKAFTLEEALEATS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Streptomyces coelicolor
publication title Identification and Analysis of Residues Contained on Beta --> Alpha Loops of the Dual-Substrate (Betaalpha)(8) Phosphoribosyl Isomerase a (Pria) Specific for its Phosphoribosyl Anthranilate Isomerase Activity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHORIBOSYL ISOMERASE A
total genus 83
structure length 233
sequence length 240
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2010-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2x30A00
3GLCA 3N73A 4I7UA 2KZHA 5CSRA 1LM1A 1KFBA 3LHTA 3TH6A 4AVFA 1U5JA 4CQ9A 5J5DA 1C29A 5FF3A 2V9DA 1OX4A 2BSLA 1H5YA 1LLWA 3KOFA 2YW3A 4GC4A 5D33A 5C55A 3W1MA 2V5BA 3UWUA 5FF0A 4NJJA 5J5RA 1KV5A 5FF7A 4D2JA 3DKJA 4JN6A 4JX5A 2ZZ1A 3ZR4A 1H1YA 3MBFA 3E9AA 3OVPA 3W1TA 2I1OA 3AJXA 2VC6A 4RK8A 1FWSA 1M5WA 1W54A 3L0GA 3C3NA 4UR8A 1JRBA 3WJYA 5DCEA 3GKAA 1S5TA 2CZDA 4WZHA 1PHWA 3KVMA 3CEPA 3TIMA 4BWLA 2CWNA 2NLIA 1R46A 1UASA 3CTLA 1YXYA 1R30A 3T44A 1BWKA 5K4XA 3SGUA 5HQEA 3IIVA 3M47A 1T96A 3B03A 4O18A 3W85A 1A5BA 2NV2A 4LV4A 1TPB1 3ANYA 3LI1A 3NVTA 4JR5A 1VC4A 3BLFA 3LM7A 1AW5A 3B05A 1QO5A 4XWUA 1I4NA 1IXQA 5LGXA 3RMJA 4AB4A 1M6JA 1WDWA 3UZ5A 4UFKA 4MIMA 4LVBA 1KV8A 2RFGA 1KM0A 4JTTA 5CSSA 1Z41A 3TXVA 4H6KA 4O13A 4E38A 3WJWA 3WK2A 3IIZA 3EKZA 1OHLA 2P0OA 4TU1A 2ZRWA 1OFRA 2CW6A 1R47A 1W1ZA 3ATYA 1SZFA 4O0KA 3T7VA 4RXFA 1A5SA 1UB3A 3DFNA 3EWYA 3P74A 1UUMA 3FKRA 3MW7A 1PHQA 4JEQA 3GDKA 3M0ZA 1VH7A 4NXSA 4ONVA 1Y0EA 3IIOA 4AF0B 5FF2A 2Y7FA 3BK0A 5G2IA 1MEIA 5CKSA 4O52A 4UMBA 1O4UA 1A5AA 3PR2A 3JRKA 2NZLA 4XQ6A 5CZ0A 3QYQA 1SU5A 1TPDA 5DCDA 2EPHA 2ZRYA 4MVAA 1LCOA 1YTEA 2XN2A 3BO9A 3W7QA 1TV8A 1EA0A 1RPXA 2VEKA 3C8FA 1SSDA 5D2TA 2B7NA 5EA9A 4GE8A 5AHNA 4JY9A 4IXHA 4JTSA 3GNNA 3V1PA 1JUEA 1ME9A 4JICA 4YL2A 3UWYA 3S5YA 3EWUA 2LLEA 4JTIA 1LBMA 1LYXA 1DHPA 1Q6QA 3O6YX 3QSRA 3I68A 4UCGA 3PBYA 3W71A 4DXVA 3N19B 1ZAJA 1JCLA 3IVSA 3ATZA 3H54A 3DFTA 3LRLA 4DPQA 3KHJA 4O11A 4ORMA 3SIZA 4KWVA 1KLYA 4UC5A 4TR9A 4WJEA 2GQ9A 3ABQA 1JUBA 3W86A 1RVGA 3PB2A 4FX7A 3DENA 2TRSA 1XL9A 3C2RA 4PFMA 4LRSA 2DZWA 3W7DA 2PCQA 5A5WA 4FHAA 5DXXA 2QF7A 1WYIA 3CLMA 4NZFA 3RF9A 4LY8A 2FPYA 3VFLA 2CZFA 3DI1A 3IV3A 3S1XA 5HWNA 1P5BA 3QJAA 3OIXA 3KVJA 3EXSA 4UNLA 1AL8A 3BVJA 1VYPX 1K8XA 2ZFAA 3S1WA 3EWWA 1LDCA 3R12A 1DJQA 1FDJA 3RLUA 4LVGA 2DP3A 2QAFA 4A21A 1SPQA 3IGUA 4O12A 3DZ1A 4MOZA 5D09A 2XN0A 5K9DA 1JCYA 1YTKA 2J88A 3DI0A 3NQAA 3LTPA 3NQGA 4UFJA 1VR6A 1IGSA 3HGJA 4A29A 4YLWA 1XCFA 4O57A 1EX5A 3N9RA 1GT8A 4OHQA 2BTMA 5DCBA 4HNTA 2VKZG 2FQIA 2G5WA 4E2DA 4WY0B 3BLIA 3G1HA 1ICQA 4UTWC 4IMEA 1H60A 3EX6A 4KFNA 3SGZA 3W9ZA 5LNSA 2Y61A 3W6YA 5CPOA 5CG7A 1K03A 4OV9A 4DBDA 2Q3OA 1QOQA 1ZJIA 2GQ8A 5F1VA 5C2XA 1VHCA 5BRBA 4UTIA 2X1TA 2FPVA 1ZENA 3DKLA 4MZYA 3G1AA 1VLIA 7TIMA 3CHVA 4DF0A 5D2XA 4IPIA 1YDNA 2F84A 4XZ9A 3ZWTA 3BW2A 2VEPA 4DBEA 5BNKA 3MHGA 3PAJA 3M5VA 4R7JA 1L6WA 3QW4B 3PUOA 4H3DA 5G1YA 4JGDA 4MY8A 1KTCA 2A1YA 2CZ5A 4N9CA 3A21A 2OX1A 1GZGA 1QNVA 3HQ1A 3GXTA 2NX1A 3CT7A 4Q33A 1XBYA 5K4ZA 5F2LA 1GTEA 3PUEA 2ZBTA 4CCDA 1QR7A 1P1XA 1OFQA 4N6FA 3W1XA 1IIGA 2FTPA 1JVNA 4RX0A 4IMFA 2ZTJA 1AG1O 3GR7A 1F76A 1DOSA 1GPWA 2TPSA 3GR8A 3PSWA 1AW1A 1JULA 1QWGA 1TPFA 1ICPA 3R5EA 3S1UA 3O6DA 5U7SA 1VCGA 5K9CA 3BW4A 4UUIA 3ABSA 3FJLA 4FNPA 1SSGA 5GVJA 1SO3A 1FDYA 1TRIA 2WSQA 1FXPA 1TTQA 1E51A 4W9TA 3PBUA 1OYCA 2CLOA 1K02A 1R2TA 3W7PA 2C1HA 4BFAA 4UNKA 3BW3A 5F2GA 3IVTA 3A24A 3KRUA 3G1YA 3L68A 3EX1A 4P61A 4M7TA 1QPNA 3L0NA 3W2UA 1UBSA 1VLWA 2RDUA 2Y7GA 1N7KA 2WSRA 3B4UA 3W76A 3TSBA 4JIQA 4ICNA 4Y6GA 1I8JA 5HWMA 4WUIA 1KTBA 5LHFA 1TQXA 4TMCA 2FJKA 2CLLA 2QDHA 2ZA1A 4U4MA 4NJIA 3A5FA 3DGRA 4EVZA 3NNTA 3G8RA 3MYOA 4MZ1A 5AHLA 3BG3A 2RDTA 3N2MA 3L5LA 1DKWA 2PC4A 5H91A 3WFAA 5MHBA 2P1FA 3QH2A 4C1LA 2Y63A 1FWNA 1W56A 4UTWA 1JR1A 3EX3A 1XKYA 3W7EA 3W7HA 3LV5A 4JTGA 4MLJA 3W7RA 5FI8A 2CLFA 2ZDRA 1SZEA 2EF9A 3NAVA 2WKJA 2WO5A 3MUXA 5EBUA 3UWWA 3VCRA 3BLEA 3PBWA 3GKFA 3FJ6A 4IMCA 4EOUA 3S5ZA 1XDMA 1ZFJA 2QCDB 4NNBA 4M6VA 2GPTA 1F7BA 2AQWA 1KLZA 4UTLA 3G1DA 1QOPA 4LNYA 4JYDA 1SO5A 5HR7A 4O1BA 1O60A 4UTMA 3TFCA 5KTLA 3V75A 3STFA 3TJXA 4RXGA 4RZ6A 1VYRA 4IXXA 2Y62A 4S1FA 3M1ZA 4GNJA 5G1TA 4QAIA 5AHEA 3I7RA 5CZTA 2C14A 2CU0A 4BI5A 1X6UA 3R2GA 3PM6A 2QCCA 3TSMA 3TXZA 4UFIA 4I9AA 1OFEA 5D38A 2R8WA 3PF3A 3W7KA 1B3OA 1H50A 1KFLA 1XBVA 3W07A 1K7FA 3TDFA 2QAPA 1VQTA 1W3NA 4QITA 4MUZA 3U8GA 4O1AA 3NM3A 4DQWA 3R89A 2ABAA 1G69A 4RLIA 1FWWA 1VPXA 5SWUA 3PVFA 1RQEA 3W7IA 4ADUA 3TX9A 1P0NA 3TROA 1H7PA 3SSJA 3O07A 4AAJA 1FUYA 2R91A 3UWZA 5AOUA 1TO3A 5E0KA 1VRDA 1SUXA 3VNDA 2Z2UA 1H63A 2GVGA 5FEZA 3W88A 1P0KA 2VELA 3QRHA 2Y89A 1MO0A 1H7NA 3W3OA 4RKAA 2FDSA 2H3BA 1TTJA 1H61A 2E5DA 3W7MA 2EGZA 1D3GA 4JS3A 2QJHA 2GQAA 1TSIA 3PUDA 5TIMA 2QCGA 3CWNA 1LBFA 3BG9A 1JQXA 4GFSA 4Z1CA 4XBKA 1FCQA 3EEGA 4XTIA 5DY2A 2QCMA 4IUOA 3M9YA 1VS1A 4CLMA 3FFSA 1LORA 1B57A 1L9WA 2Y7EA 3G1FA 4IX0A 1N8FA 1W31A 1D3HA 1O95A 3LLDA 2YCEA 1TV5A 1ZY9A 3LDVA 4S2BA 2FB2A 2ISWA 3TU9A 5A8GA 3UYCA 2OCZA 1JCJA 1ZHAA 3O63A 3NL2A 3NPVA 3LERA 1GYNA 5C5YA 4UFMA 1TPUA 2H8ZA 3W7LA 4PTNA 4AMAA 1WAUA 3HPSA 4N9DA 4Z0SA 1HUVA 1S3HA 3M44A 3W2JA 3OVQA 2F7FA 4K7VA 2YYUA 5CZSA 4XTDA 2NX9A 1XBZA 2PRHA 4HSNA 3RU6A 3FA5A 1FCBA 3HGSA 1IIHA 2V30A 1DVJA 3MI6A 5HR6A 3W7JA 1PV8A 5LNRA 4CQAA 1VHNA 1L6YA 3CQ0A 3GYEA 3P60A 1FCUA 4OE7A 1XBXA 4DO4A 1MZHA 3R13A 3H53A 1H7OA 3O05A 3JR2A 4GUFA 4XKYB 2C15A 4ORIA 1W5OA 4K6AA 4JTKA 4K7YA 2C18A 3DBPA 3DHDA 3W22A 3T78A 2JGQA 3QSTA 4LW7A 1SZNA 1XI3A 2CLKA 2NUWA 2ZTKA 5T26A 3GDLA 1R2RA 1J4EA 4JDBA 4FNUA 4RR4A 6TIMA 4TIMA 1NEYA 1GTHA 2NWRA 1S5WA 4UFLA 3NPXA 1K8ZA 1J2WA 1NVMA 4LVDA 4O16A 4JD4A 4Y96A 2E6YA 4DO5A 2V81A 2ZZ4A 1R2SA 1W3IA 1CW2A 2Z1BA 1NF0A 4O28A 1EPXA 3S5OA 1F5ZA 2B7PA 2Q3RA 4UMAA 2ZZ6A 5D02A 3G3DA 4HSOA 3HG4A 2DZPA 3E02A 4OV4A 3NQMA 2JKAA 4Z1DA 5U4NA 2EHHA 2NX3A 1W3TA 4AWTA 2RDWA 1TV7A 1X7FA 4GJ1A 1ZALA 5F2IA 3W73A 5AC6A 4KKXA 4QIUA 3HOJA 3M43A 1NSJA 2PRLA 5D04C 1D9EA 3LCIA 1QFEA 4RJEA 2ZA3A 4UTTC 2ABBA 3LI0A 3W7CA 2A6NA 1FBAA 3PSVA 4NX0A 1AW2A 1OFAA 1DQXA 2HS8A 3OEXA 1TPWA 3TE9A 2O7SA 3LCLA 1ICSA 2ZA2A 1TTPA 2QUTA 1H62A 3W2NA 3M41A 1W5PA 1TTIA 4AH7A 2QCLA 1L2UA 1PL9A 2B0MA 3E0IA 3MP3A 1FQ0A 1GVQA 4UTUA 1WOBA 5G2HA 3TJLA 1LRQA 2QDGA 4LV9A 3NO5A 2B7OA 4JTJA 4K36A 2ISSA 1O94A 1AMKA 4M6PA 4ZQNA 3EWXA 2DZVA 1BKSA 1H1ZA 4DEFA 1EIXA 3B8DA 1PCWA 4EWND 2GVLA 3QW3A 3BGJA 2QR6A 4KFOA 4Y90A 3DHFA 1I2NA 3NDOA 1KW1A 1XDLA 1YYAA 3C61A 4QNWA 1PE1A 2VENA 2Q8LA 1NF7A 3HBLA 4E2BA 3GIYA 4JX6A 1KM6A 4MKNA 1XUZA 2QCFA 4LS1A 4KWWA 4LVFA 3PG9A 4GUJA 5L6UA 5I3IA 2I9EA 2C19A 4L4MA 1SFJA 5DLCA 1QDSA 2YYTA 3DFQA 5AYZA 1RR2A 3I7SA 3LHWA 3NQEA 2YPIA 1X1OA 2OMAA 2Z6JA 1W8SA 1L6SA 3KRSA 3W87A 4K8EA 5LZLA 3B0UX 3MWAA 3MBDA 3UZJA 4HT3A 3Q2DA 1RZMA 2DJXA 3EB2A 5AC8A 1KM5A 4FF7A 1OX4B 5LHEA 3U2OA 5E1QA 4OGZA 5EY5A 3W7GA 1GG1A 4QSHA 1EUAA 4IWWA 2WSYA 5DBUA 2YGYA 3MHUA 2ZZ5A 5D05A 2GJLA 3OA3A 3NZ1A 4N2YA 3SR7A 3B0VC 2A0NA 4R34A 1RD5A 3TSDA 4IPJA 5EKYA 1LTDA 2OZ0A 8TIMA 5KZEA 3W70A 1P4CA 2CLHA 1M7OA 2W6RA 3L2IA 3TMLA 1I2RA 4FB7A 3BPWA 1OYAA 5AB3A 5I3JA 1FY6A 4OBTA 3G22A 4ZVJA 1S5VA 3GK0A 1C9DA 5K3VA 2QKFA 4NXKA 1F6PA 4HIBA 4O1CA 4AWSA 2YSWA 3HO8A 4G1KA 3UWQA 4HKPA 3UY8A 2NUXA 4FNTA 1JCNA 3E49A 1I2QA 2VOMA 4TMBA 5G4WA 1GWJA 4FX8A 4DF1A 3VI2A 3W23A 3NQDA 4LS2A 1K3UA 4UTTA 3LX9A 1YADA 4CCCA 3C6CA 3LBCA 3O1NA 3S5NA 1OK4A 1YDVA 2C16A 2ZZ3A 3UD6A 1OX5A 2QJIA 2RHGA 2ATSA 1AL7A 3PY2A 1C8VA 5G5IA 3HB9A 4A22A 4AHPA 2E6DA 3IEBA 4R33A 3SECA 3O6CA 5I3HA 4M6QA 4XUGA 3LCFA 3KVKA 4L4LA 3ZFHA 1RV8A 3EX2A 1KTNA 1BEUA 1LOSA 5C54A 1Z48A 4CCEA 4YXGA 5HULA 3C56A 4N4QA 4ADSA 4FNSA 2D73A 3R8RA 4Z08A 1H51A 3GDRA 2ATMA 4CQ8A 1HL2A 1V7YA 1WOAA 1YTDA 1QPOA 4HPJA 5IM51 4UTKA 2QUUA 4LS0A 4OT7A 3HMJG 5LNVA 1GVOA 2CZEA 3HGOA 4YMZA 1Q3NA 4BI7A 1LOQA 4I7VA 1LOLA 1UCWA 1Q45A 3HPZA 3A23A 4PEKA 3UY7A 3FOKA 3L21A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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