1UWIA

Crystal structure of mutated beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus, working at moderate temperature
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
489
structure length
489
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDLNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHNNAQKMGLKIARLNSEWSRQFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFIQNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYTAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITRGNEKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTGKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSSLVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Sulfolobus solfataricus
publication title Comparative Study and Mutational Analysis of Distinctive Structural Elements of Hyperthermophilic Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
total genus 195
structure length 489
sequence length 489
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwiA00
1VF8A 3VMNA 1ZL1A 1LJYA 3L4VA 5E0FA 4B16A 1KCKA 5IFPA 1MVYA 1K9EA 1WKYA 4ZE5A 2D3NA 5HPOA 2WYSA 3AHXA 1LL6A 4BCEA 4BQ3A 2W66A 3E1F1 1H11A 3ECQA 3AISA 3U5YA 1TZ7A 3IAQA 5DO8A 1E55A 1G5AA 3DYPA 1OIMA 1EQCA 2TAAA 4NRRA 4W88A 4P7RA 2BVYA 2YA0A 1KBBA 1LG1A 1I1XA 4R27A 3UEQA 1BLIA 1KXVA 2OSXA 2G3JA 5BXSA 1WZLA 4PN2A 2VR4A 2XG9A 3BSGA 1WNOA 2JF6A 4QLJA 4CU8A 1ESWA 2V38A 1JZ4A 4RE2A 5LYRA 1PX4A 4R5EA 5JUVA 3AMGA 2BNJA 3EMQA 2VI0A 1S46A 3WSUA 1XCXA 3M6DA 3AIUA 5A2AA 3BMVA 4UFKA 5I77A 4AYSA 1E6XM 3DYMA 4F79A 4QLLA 1GPFA 1PBGA 4OOUA 4CN6A 1XD1A 1GCYA 5FCZA 2PWDA 5M17A 3JUGA 3RDKA 1ZBWA 1CGXA 3B9DA 1ODZA 5M5DA 2ZXAA 2XJ7A 3QR3A 2JIWA 3WD0A 3WQ8A 2V3EA 5FL1A 2VTFA 1E43A 1EO5A 3WH6A 4J7RA 3EDFA 4XX6A 5D8WA 2Z1SA 3ZSSA 1JNEA 2YDQA 3CUGA 2EXOA 4H41A 4W7WA 1UH3A 1E1EA 2E3ZA 2V5CA 5BRPA 2F8QA 1UWUA 1R87A 2VX4A 3BLPX 3K4DA 3AZSA 1ITCA 1RD6A 5BWFA 1J10A 5IHRA 4CKQA 5A8QA 4FF5A 1BG9A 1UH2A 3UG3A 2XGBA 5IFTA 1V3KA 1HVXA 1UR9A 2Y24A 3I3DA 4KRTA 3AIWA 3CHDA 4OJYA 1VB9A 3UG4A 2BHZA 4WKHA 2GJXA 5FOOA 1J0YA 3VIKA 4WKAA 1DWGM 3EDJA 3GDBA 3BAYA 1J0HA 4TVDA 1BTCA 1EOMA 4NSBA 3B9AA 2YJQA 2WVUA 3VGGA 3OGSA 1B9ZA 2C7FA 2VZUA 5BCAA 3QGVA 4J3UA 3WBAA 4D6GA 4PTWA 3VD3A 1J18A 2E0PA 2FHCA 2QV4A 3WDPP 2WHJA 4CUCA 3CTTA 1U2YA 3AHZA 2CCRA 3WBEA 4MTVA 1E70M 2XIIA 4W8AA 1G0CA 1UR8A 3ZT7A 2EEXA 1H2JA 1C7TA 3WD4A 4CGTA 3UG5A 4ZEPA 5HNNA 5BRQA 4V27A 1C7SA 3GXFA 4GQRA 4UCFA 4E8DA 1H5VA 2OSYA 1TFVA 3AHYA 3VD7A 1B3WA 3T0BA 4HZ6A 2BXZA 4W5UA 1OD0A 3UR7A 4HPGA 2D0GA 1ZB5A 3WUEA 4FMVA 2D2OA 3AMLA 3QOMA 5DMYA 4PTXA 4D6DA 4JL2A 2YIHA 3ZR5A 3WEZA 3WF2A 1DWJM 6TAAA 5A6KA 3HU7A 4LYQA 3U7BA 3W28A 1Q6EA 3AHTA 5EBAA 3AIEA 5LA2A 3BLKA 1GOQA 3BSHA 8A3HA 3NSMA 2F2HA 5D9PA 1FH9A 1ECEA 1QBAA 1TA3B 2VNCA 4MNMA 4TOQA 3VDAA 1QHZA 3FNDA 4WF7A 3G6MA 1HJQA 3GH4A 1KCLA 3TTSA 2WNWA 1E0VA 2YBUA 3UESA 3CUHA 2ZUSA 1XV8A 3WNOA 4LQ1A 3CLWA 4UFLA 1CYGA 2VX5A 1GOOA 2WW5A 5BROA 1J0JA 4WSJA 3L4WA 4S3KA 3LPPA 3F4VA 5A94A 3ZM8A 2J8FA 1UKSA 1M01A 4W84A 4D1IA 1NP2A 4JFTA 4W5ZA 3CZGA 5I6SA 1AQMA 3TA9A 1NOUA 3NYDA 5D8ZA 2A3CA 3WUFA 3EDDA 2BVDA 3ZO9A 3VGEA 3RJYA 1MW1A 2V3DA 3K8KA 5LA1A 1E71M 2BY0A 4AMCA 3ZJ8A 4C7DA 2FGLA 1V3JA 2X1IA 2E8YA 1V0LA 2WM0A 1LWHA 1V6YA 1QNOA 4CCEA 1SMAA 3WF3A 5JBEA 1W1PA 4MNKA 3K1DA 3CPUA 4AD2A 2AAAA 2DT2A 1V6WA 1JF5A 4ATLA 2C8NA 4H7VA 3ZIZA 6CGTA 3WIJA 3VUPA 1FFQA 1YQ2A 4WK9A 4PMNA 1GOKA 1JXJA 6A3HA 1ZBCA 3RM9A 1QW8A 2O9TA 4ZXOA 3VU2A 4XZBA 2E8ZA 5A1AA 1Q6FA 3GH7A 1TR1A 1EO7A 1VJZA 2J79A 5ABGA 3EDEA 4HU0A 2ZXQA 4AZBA 3NDZA 1M03A 5A2CA 1E6ZA 2Y5EA 1H41A 2ZE0A 3MKKA 3N17A 2WKGA 4Z2HA 4B9ZA 1UHVA 2GDUA 4J3SA 4PTMA 2GK1B 3CH9A 1EA9C 3EBVA 4OKDA 2WBKA 1FP8A 3ZOAA 3IJ8A 4HP5A 4J28A 1E4IA 2DEPA 2FDMA 3VDCA 2J47A 4GZIA 1UR0A 4RE4A 2V5DA 2G8ZA 3AYSA 1GQIA 1M53A 4GXPA 5I3DA 1A47A 2PF0A 4RL3A 1BFNA 3WF0A 1LQ0A 1ISYA 1TA3A 1E4MM 2WCGA 5DEZA 3AI0A 3WNNA 1EHAA 2WZHA 4AC1X 3N9KA 2V3GA 5CGMA 3KL3A 4GI9A 3GBEA 2RGLA 5ECUA 1W2PA 3GNOA 2DIJA 3MSGA 1JD7A 4YHGA 5GNZA 5CZKA 4PCSA 4QCEA 4WLCA 2DT0A 4Y7EA 3WUGA 2ZUTA 5AC5A 1AVAA 3SUUA 2PWGA 2X2YA 3RCNA 4DUXA 3WMBA 1V0KA 1QNRA 5HXMA 3L4ZA 4WIWA 2IXUA 1HL9A 1HJXA 2XVNA 2D0HA 3WELA 1B31A 5CLWA 5I79A 1JL8A 1CNVA 5C71A 1K6AA 2O9RA 3SUVA 3A3HA 4GIAA 1HP5A 1UYQA 4BQ2A 2EPLX 1BAGA 2VCCA 1H09A 2J77A 1B3YA 2GVYA 3ZJKA 4GO8A 1BGAA 4UFJA 2WAGA 4Z2JA 2Y4SA 3OA5A 1JYNA 1CXIA 1E73M 1JAKA 1UD3A 2PBGA 1FA2A 1Q6DA 3PZOA 5A6AA 3AMKA 3AQUA 2CERA 1BHGA 1NWTA 4Q22A 1G94A 4ZXLA 1QI5A 4XB3A 1V6XA 3PN8A 3AFBA 4FLQA 3WH9A 4D1JA 3WFLA 1UWTA 2EBNA 1JI2A 2OLHA 2FH8A 1WDRA 2ZUVA 1W32A 4AXNA 5LA0A 2J7FA 2J78A 3MMUA 1V3MA 4AD4A 1UR2A 3CZLA 4XV0A 3GXDA 1PEZA 4CVWA 4IM4A 1XSKA 3A6OA 2CEQA 3ZR6A 1Q4NX 4BA0A 1JZ6A 1JDAA 1KXHA 3EDKA 3GH5A 3VDBA 3AS1A 2VCBA 4AZGA 1B30A 2Y8VA 2VZTA 5A8PA 2XIBA 3RILA 3W0KA 4EANA 2JF7A 1L0PA 4EKJA 1ISZA 1OSEA 2E9BA 2GK1A 1AQ0A 3WF4A 3BAXA 2WLYA 1UH4A 5KZ6A 2WHLA 3OLGA 1F4HA 1XH1A 4M1RA 2XVLA 2WVSA 4AD1A 2BXYA 3BH4A 1ZS2A 4D6CA 4GI8A 1EDGA 1HJWA 4OUEA 2G3NA 1RP8A 1US2A 3N12A 3VDHA 3HN3A 2VCAA 4JHZA 3OGRA 1U33A 1JZ8A 1ISWA 3SUTA 1ZJAA 2VVSA 5IXEA 2W92A 3GXIA 1UG6A 2ZICA 5CLTA 1D7FA 2ZUWA 2XWDA 2Y8KA 2WB5A 1B3ZA 3WQVA 5A8NA 2J7CA 3A4XA 1VFFA 3AMDA 4PCTA 5FKYA 3OLIA 1FHLA 1ISVA 4W85A 3DHUA 1CDGA 2D22A 2XVGA 1VBUA 2J7EA 3D5HA 1H1NA 1DHKA 1J0KA 2O9OA 2C0HA 4PMUA 1UWQA 3AJ7A 2W67A 3ARWA 1BYCA 5CPQA 2NW0A 2CPUA 1M04A 2FGZA 1BYDA 4UNIA 5A8OA 4PSRA 1JI1A 1XYZA 2J4GA 2UY4A 4F8XA 1ODUA 1WP6A 3VINA 1HX0A 4LGXA 1V3LA 4JFSA 4D6FA 2WHMA 2F61A 1HXJA 1HJUA 1C8XA 4B9YA 1SMDA 2CBIA 4TUFA 3WDJA 4ATDA 1KFWA 1LF1A 1WO2A 5A6BD 3WNMA 4W93A 3N11A 1OT2A 2G3MA 3LMYA 1XD0A 3J7HA 1ITXA 1QBBA 3ALFA 3W27A 3TTQA 1R86A 2XVPA 4IUGA 3AZTA 4TX8A 1H4PA 4UFHA 3VTRA 3AHVA 4BS0A 3IJ7A 5HOSA 3WENA 4MB3A 2YDSA 2WK2A 2QF8A 1O6IA 1CEOA 2FH6A 1MW2A 1ZJBA 2W5FA 2WC3A 3N15A 2CBVA 3CUFA 1UD5A 1UUQA 1JAEA 4P7OA 4QAWA 4ACYA 2ZX9A 4PMQA 4LYPA 3VGDA 2W62A 4OBSA 3OG2A 1OGBA 1AMYA 4ZE4A 1R7AA 1CIUA 1PJ9A 4N42A 1JNDA 1KXTA 5JIWA 1E6RA 4WKFA 1G9HA 2VUYA 4TTUA 1CECA 5A6JA 1UKOA 3W26A 1W9BM 1VENA 4AIUA 1QPKA 1XH2A 3AS0A 2XFRA 3K8MA 3W37A 3L4XA 1HF6A 1VEMA 1J0ZA 5ABFB 4MDPA 1BG4A 1MW3A 1BYBA 1JDCA 3VD5A 1PAMA 2NT1A 2D1ZA 3PTMA 1EOKA 4LXFA 5A6SA 4B15A 3AS2A 2WZEA 2YDRA 4AZ7A 3TP4A 3MO4A 1U30A 1JGIA 3RJXA 1PIFA 1W2VA 4AISA 4AD3A 4UQBA 2AMGA 4D6JA 2W91A 4F9JA 5E9AA 3GNPA 4DWSD 2DSZA 3CMGA 4PMXA 3WQWA 2YOCA 1I75A 3VIMA 4GI6A 1D3CA 1OBAA 4RE3A 4JKKA 2ZXDA 3VOCA 2CHOA 3KL5A 1E3XA 1J9YA 3PZGA 5I23A 1OINA 3U57A 2GJRA 4HMCA 1WAWA 3AOFA 3GM8A 2PI6A 4A4AA 4KWUA 1EH9A 1JZ3A 3ZT6A 1GW1A 1YHTA 5AC4A 1JZ2A 3T2PA 5A69A 1MQQA 4JKLA 1UWRA 3VMOA 4H8UA 4D6IA 5CGTA 4UQDA 3KL0A 1VIWA 1DWIM 2J75A 3WNPA 3CIVA 2WC4A 3THCA 1GVIA 3VPLA 3OZPA 3VNZA 2QLYA 4JFUA 2WCSA 3VX0A 3QHMA 1UWSA 3SURA 4HOZA 2E40A 1GOWA 4NI3A 5D9NA 3RPMA 4AWEA 3WMSA 4GINA 3ZSTA 2YLLA 3T0AA 2EQDA 7CGTA 1I1WA 4HA1A 2WXDM 3CZJA 5EB8A 2QPSA 4MADA 3WH7A 5A3HA 3CHFA 4LPCA 5CPTA 3K8LA 4PMDA 1VEOA 5E6YA 1FH8A 5IDIA 3RMEA 2NSXA 2WWCA 4PMZA 1UWIA 3MMDA 5CJ5A 2VOTA 4AZIA 3ZMRA 5ABFA 3CZ8A 2YL6A 1XH0A 2PB1A 1GQJA 1E0WA 1VEPA 4UFMA 2GUYA 3WUBA 2DSWA 4UZUA 5IHSA 1UZ4A 1WDQA 3CBWA 3MUY1 2DDXA 1E3ZA 3M7SA 1CTNA 4OZOA 2DSUA 4ATWA 4OOZA 5ABHA 4X0NA 5FD0A 4BQ5A 3K46A 3SCNA 1D2KA 4YHEA 5GNXA 3QHNA 1K9TA 1NWUA 1DWAM 1JYWA 1HL8A 1CGVA 4W8LA 1GHRA 2J62A 2XSAA 1UD4A 1W91A 2WZIA 3LPOA 1MXDA 1UKTA 4PMVA 5EFDA 4E2OA 1UR1A 2YKKA 3VGFA 1JZ7A 2V3FA 3GZAA 2WMIB 1QNSA 4AZCB 4OIFA 3SUSA 3W6MA 4PRWA 3AXHA 1EXPA 3K4AA 3DHPA 1E40A 7TAAA 4W87A 1X1NA 4PTVA 1NARA 4HA3A 2PWFA 4CD5A 1UOKA 1WDPA 4M80A 5TD4A 5JBDA 4EAMA 4J3XA 1GJUA 2PWHA 4JCMA 4X0VA 4U5IA 2VMFA 4W7VA 1BPLB 2G41A 2DH3A 2EO7A 2J7GA 3AIRA 4H04A 4KH2A 4W86A 4PSPA 1DEDA 1QVBA 3BXWA 4HA4A 3ARRA 3OIHA 4ZENA 2BHUA 1Q6CA 4JCLA 3BC9A 3WMCA 3ARQA 3VO0A 1MW0A 1GUVA 1QHPA 3O6AA 1UA7A 1PZ3A 1QOXA 2XTKA 2YL8A 2CBUA 3NUKA 1V6VA 4DUWA 3L4TA 4CU7A 5AYIA 1LG2A 3N13A 4U5KA 2WMJA 4H2CA 2ZX8A 1PX3A 1BYAA 5A6LA 5CSYA 1OIFA 3WL1A 4QP0A 1VFMA 1CLXA 1J12A 2WLZA 4P7QA 1ZBKA 3AS3A 2VJXA 2XSBA 1JFHA 3N18A 3SCVA 3WKZA 4CN1A 2BY1A 1KB3A 4ZFMA 2UY3A 1BVZA 4D72A 1HIZA 2BV9A 1JYVA 1NH6A 2DQXA 3T2OA 3W81A 3LPGA 4XUYA 1MYRA 3VNYA 4MNLA 5JBFA 3ARSA 3NIYA 5JIPA 1OGGA 3WEMA 4MAVA 1BF2A 5CG0A 1IV8A 1OGSA 5DFAA 1JYXA 4QDMA 2GFTA 2D20A 4E8CA 3VM5A 1Q6GA 2CKRA 3SIMA 3MV11 1UZ1A 2MANA 3PBGA 5AY7A 3UETA 2EPMX 2VRJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VF8 A;  3VMN A;  1ZL1 A;  1LJY A;  3L4V A;  5E0F A;  4B16 A;  1KCK A;  5IFP A;  1MVY A;  1K9E A;  1WKY A;  4ZE5 A;  2D3N A;  5HPO A;  2WYS A;  3AHX A;  1LL6 A;  4BCE A;  4BQ3 A;  2W66 A;  3E1F 1;  1H11 A;  3ECQ A;  3AIS A;  3U5Y A;  1TZ7 A;  3IAQ A;  5DO8 A;  1E55 A;  1G5A A;  3DYP A;  1OIM A;  1EQC A;  2TAA A;  4NRR A;  4W88 A;  4P7R A;  2BVY A;  2YA0 A;  1KBB A;  1LG1 A;  1I1X A;  4R27 A;  3UEQ A;  1BLI A;  1KXV A;  2OSX A;  2G3J A;  5BXS A;  1WZL A;  4PN2 A;  2VR4 A;  2XG9 A;  3BSG A;  1WNO A;  2JF6 A;  4QLJ A;  4CU8 A;  1ESW A;  2V38 A;  1JZ4 A;  4RE2 A;  5LYR A;  1PX4 A;  4R5E A;  5JUV A;  3AMG A;  2BNJ A;  3EMQ A;  2VI0 A;  1S46 A;  3WSU A;  1XCX A;  3M6D A;  3AIU A;  5A2A A;  3BMV A;  4UFK A;  5I77 A;  4AYS A;  1E6X M;  3DYM A;  4F79 A;  4QLL A;  1GPF A;  1PBG A;  4OOU A;  4CN6 A;  1XD1 A;  1GCY A;  5FCZ A;  2PWD A;  5M17 A;  3JUG A;  3RDK A;  1ZBW A;  1CGX A;  3B9D A;  1ODZ A;  5M5D A;  2ZXA A;  2XJ7 A;  3QR3 A;  2JIW A;  3WD0 A;  3WQ8 A;  2V3E A;  5FL1 A;  2VTF A;  1E43 A;  1EO5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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